| dbo:abstract
|
- Pseudouridin (Ψ, systematicky 5-β-D-ribofuranosyluracil či 5-ribosyluracil) je neobvyklý nukleosid tvořený ribózou a uracilem, jenž je připojen na ribózu C-glykosidickou vazbou. Od uridinu se liší konkrétní pozicí cyklu, jímž je uracil k ribóze připojen (u uridinu je to 1' dusík, u pseudouridinu 5' uhlík uracilu). Syntéza pseudouridinu z uridinu Jedná se o vzácnější nukleosid, který však je součástí například molekul transferové RNA (tRNA, zejména v T-raménku) i v ribozomální RNA (rRNA) a v malé jaderné RNA (snRNA). Pokud se vyskytuje v antikodonu, pak páruje s adeninem. Pseudouridin vzniká z uridinu až po transkripci, tedy modifikací existující RNA, a to pomocí . K celé řadě úprav dochází v jadérku a na řízení celého procesu mají zásadní roli malé molekuly (snoRNA). Při modifikaci rRNA v jadérku je uridin určený k modifikaci rozpoznán třídy , která se přesně váže v bezprostřední blízkosti nukleotidu určeného k modifikaci, ale samotný uridin vystavuje k úpravě enzymem . Mutace jedné z těchto syntáz může vyústit až v onemocnění , jiné zase v a anemické onemocnění , takže je zřejmé, že pseudouridin v různých RNA plní závažné role. Po degradaci RNA se uvolňuje volný pseudouridin a protože neexistuje enzym, jenž by ho rozložil, je vylučován v intaktním stavu močí. (cs)
- السودويوريدين (بالإنجليزية: Pseudouridine ) ويختصر بالرمز الإغريقي بسي Ψ هو مماكب نوكليوسيد اليوريدين تكون فيه قاعدة اليوراسيل مرتبطة بالريبوز عن طريق رابطة كربون-كربون بدل الرابطة الغليكوسيدية نيتروجين-كربون (يسمى أحيانا اليوراسيل في هذا التركيب سودويوراسيل) وهو أكثر النوكليوسيدات المعدلة انتشارا من بين المئات الموجودة في الحمض النووي الريبوزي. يوجد Ψ في جميع الأجناس وفي العديد من أنواع الرنا ويتم إنتاجه بواسطة إنزيم يسمى Ψ سينثاز الذي يماكب نوكليوسيدات يوريدين محددة أثناء تعديلات ما بعد النسخ في عملية تسمى السودويوريدينلة (pseudouridylation). تم حتى الآن تحديد حوالي 9500 تعديل سودويوريدين (Ψ) لدى الثديات والخميرة وتم وضعها في قاعدة بيانات RMBase. يتواجد عادة في الرنا الناقل مرتبطا مع الثيميدين والسايتوسين في الذراه TΨC وهو أحد مناطق الرنا الناقل غير المتغيرة، وظيفته غير واضحة تماما لكن يُتوقع لعبه دورا مع أمينوسيكل ترانسفيراز أثناء تفاعلهما مع الرنا الناقل ومنه ابتداء الترجمة، تقترح دراسات حديثة أنه يمنح حماية ضد الإشعاعات. (ar)
- Pseudouridin (abgekürzt nach dem griechischen Buchstaben Psi, Ψ) ist ein natürlich vorkommendes Nukleosid. Es besteht aus der β-D-Ribose (Zucker) und der Nukleinbase Uracil. Pseudouridin ist ein Isomer des Uridins; Ψ-Synthasen katalysieren die Umlagerung. (de)
- La pseudouridine (notée ψ) est un ribonucléoside dérivé de l'uridine. On la trouve dans certains ARN non codants, comme les ARN de transfert ou les ARN ribosomiques. La pseudouridine n'est pas incorporée lors du processus de transcription, mais résulte d'une modification post-transcriptionnelle de certains résidus d'uridine. C'est la modification de base la plus fréquente dans l'ARN, elle est retrouvée chez l'ensemble des organismes vivants. (fr)
- Pseudouridine (abbreviated by the Greek letter psi- Ψ) is an isomer of the nucleoside uridine in which the uracil is attached via a carbon-carbon instead of a nitrogen-carbon glycosidic bond. (In this configuration, uracil is sometimes referred to as 'pseudouracil'.) Pseudouridine is the most abundant RNA modification in cellular RNA. After transcription and following synthesis, RNA can be modified with over 100 chemically distinct modifications. These can potentially regulate RNA expression post-transcriptionally, in addition to the four standard nucleotides and play a variety of roles in the cell including translation, localization and stabilization of RNA. Pseudouridine, being one of them, is the C5-glycoside isomer of uridine that contains a C-C bond between C1 of the ribose sugar and C5 of uracil, rather than usual C1-N1 bond found in uridine. The C-C bond gives it more rotational freedom and conformational flexibility. In addition, pseudouridine has an extra hydrogen bond donor at the N1 position. Also known as 5-ribosyluracil, pseudouridine is a ubiquitous yet enigmatic constituent of structural RNAs (transfer, ribosomal, small nuclear (snRNA) and small nucleolar). Recently it has also been discovered in coding RNA. Being the most abundant, it is found in all 3 phylogenetic domains of life and was the first to be discovered. Pseudouridine accounts for 4% of the nucleotides in the yeast tRNA. This base modification is able to stabilize RNA and improve base-stacking by forming additional hydrogen bonds with water through its extra imino group. There are 11 pseudouridines in the Escherichia coli rRNA, 30 in yeast cytoplasmic rRNA and a single modification in mitochondrial 21S rRNA and about 100 pseudouridines in human rRNA indicating that the extent of pseudouridylation increases with the complexity of an organism. Pseudouridine in rRNA and tRNA has been shown to fine-tune and stabilize the regional structure and help maintain their functions in mRNA decoding, ribosome assembly, processing and translation. Pseudouridine in snRNA has been shown to enhance spliceosomal RNA-pre-mRNA interaction to facilitate splicing regulation. (en)
- シュードウリジン (英: pseudouridine、ギリシャ文字のΨや英文字のQで略記される) は、ヌクレオシドであるウリジンの異性体。リボース環とウラシルの間のグリコシド結合のN-C結合がC-C結合に置き換わっている。RNAに知られている100を超える修飾塩基としては最も一般的で、Ψはすべての生物種、ほとんどのRNAに見出されている。 転写やその後の合成過程の後、RNAは化学的に異なる100以上の修飾を受ける。こうした修飾は転写後の段階でRNAの発現を調節している可能性があり、RNAの翻訳、局在、安定化などさまざまな役割を果たしている可能性がある。シュードウリジル化もそうした修飾の1つであり、ウリジンがC5-グリコシド結合型異性体であるシュードウリジンへ変換される。ウリジンには一般的なリボースのC1位とウラシルのN1位の間のC-N結合が存在するのに対し、シュードウリジンではリボースのC1位とウラシルのC5位がC-C結合を形成している。C-C結合は、より大きな回転自由度と立体配座の柔軟性を与える。さらに、シュードウリジンにはN1位に余分な水素結合供与体が存在する。シュードウリジンは5-リボシルウラシルとしても知られ、tRNA、rRNA、snRNA、snoRNAなどの構造的RNAの構成要素として普遍的に存在している。近年では、タンパク質をコードするmRNAにも発見されている。シュードウリジンは最も豊富に存在する修飾塩基であり、生物の3つのドメインすべてに存在し、最初に発見された修飾塩基である。このヌクレオチドは「5番目のヌクレオチド」であると見なされており、酵母のtRNAの4%を占めている。この塩基修飾はRNAを安定化し、余分なイミノ基を介して水分子と水素結合を形成することで塩基のスタッキングを強化する。大腸菌Escherichia coliのrRNAにはシュードウリジンが11個存在し、酵母の細胞質のrRNAには30個、ミトコンドリアの21S rRNAには1つ、ヒトのrRNAには約100個存在する。これらからは、生物の複雑さとともにシュードウリジル化の程度が増大していることが示唆される。rRNAやtRNA中のシュードウリジンは局所的な構造を微調整して安定化し、mRNAの解読、リボソームの組み立てとプロセシング、そして翻訳に関する機能の維持を助けることが示されている。snRNA中のシュードウリジンは、スプライソソームRNAとpre-mRNAとの相互作用を高め、スプライシングの調節を促進することが示されている。 (ja)
- Псевдоуридин (сокращённо обозначается греческой буквой Ψ) — это C-гликозид, изомер нуклеозида уридина. Это наиболее часто встречающееся модифицированное основание из более чем сотни различных модифицированных оснований, которые встречаются в РНК. Псевдоуридин встречается во всех видах и многих классах РНК. Он синтезируется ферментом псевдоуридинсинтазой, который посттранскрипционно изомеризует определённые остатки уридина в РНК. Такой процесс называют псевдоуридинилирование. Широко распространён в тРНК, где находится в комплексе с тимидином и цитозином в так называемом TΨC-плече. Относится к консервативной, инвариантной части тРНК. Функция псевдоуридина в РНК остаётся неясной, но как предполагают, он играет роль во взаимодействии с аминоацилтрансферазами и, следовательно, в инициации трансляции. Недавние исследования показали, что он возможно обеспечивает защиту от радиации. (ru)
- 假尿嘧啶核苷（Pseudouridine，簡稱Ψ或Q）或稱5-核糖尿嘧啶（5-ribosyluracil）、假尿苷，是尿苷（U）的一種同分異構物，有別於尿苷中尿嘧啶以碳－氮鍵（C1-N1）與核糖相連，假尿嘧啶核苷中尿嘧啶和核糖是以碳－碳鍵（C1-C5）連接，故其結構較有彈性，比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點，且在RNA中產生的重疊效應高於尿苷。假尿嘧啶核苷最早於1951年發現，為細胞RNA中最常見的修飾，在三域生物中皆有，有A、U、C、G之外的「第五種核苷」之稱。 假尿嘧啶核苷是細胞中最常見的RNA修飾，是轉錄後修飾的機制之一，在轉錄結束後由（PUS）自尿苷轉化而來，此修飾可能影響RNA的結構、功能、位置與半衰期。mRNA、tRNA、rRNA、snRNA與snoRNA中均有發現假尿嘧啶核苷修飾，在tRNA與rRNA中可穩定RNA的結構，與其轉譯的功能相關；在snRNA中則可促進剪接體對的切割；在mRNA中的功能仍不清楚，有研究顯示終止密碼子中的假尿嘧啶核苷可能會造成（translation readthrough）。假尿嘧啶核苷還可能被細胞用作識別自身與外來RNA的機制，即RIG-I和等先天免疫蛋白可識別不含有假尿嘧啶核苷的病毒RNA而啟動免疫反應。 (zh)
- Псевдоуридин, ψ (від грецької літери «псі») — 5'рибозил-урацил, ізомер уридину (1'рибозил урацилу) — піримідин, найпоширеніший вид модифікацій РНК, які виникають після її синтезу з ДНК-матриці під час процесингу та модифікації. Присутність псевдоуридину в молекулах РНК надає більшої жорсткості фосфодіестеразному «хребту» молекули, та додає міцності комплементарній парі ψ-А (замість У-А), звідси псевдоуридинова модифікація грає роль у функціонуванні мяРНК у складі сплайсосом та трансляції у складі рРНК та тРНК. Нещодавно було відкрито присутність ψ у мРНК.. (uk)
|
| rdfs:comment
|
- Pseudouridin (abgekürzt nach dem griechischen Buchstaben Psi, Ψ) ist ein natürlich vorkommendes Nukleosid. Es besteht aus der β-D-Ribose (Zucker) und der Nukleinbase Uracil. Pseudouridin ist ein Isomer des Uridins; Ψ-Synthasen katalysieren die Umlagerung. (de)
- La pseudouridine (notée ψ) est un ribonucléoside dérivé de l'uridine. On la trouve dans certains ARN non codants, comme les ARN de transfert ou les ARN ribosomiques. La pseudouridine n'est pas incorporée lors du processus de transcription, mais résulte d'une modification post-transcriptionnelle de certains résidus d'uridine. C'est la modification de base la plus fréquente dans l'ARN, elle est retrouvée chez l'ensemble des organismes vivants. (fr)
- 假尿嘧啶核苷（Pseudouridine，簡稱Ψ或Q）或稱5-核糖尿嘧啶（5-ribosyluracil）、假尿苷，是尿苷（U）的一種同分異構物，有別於尿苷中尿嘧啶以碳－氮鍵（C1-N1）與核糖相連，假尿嘧啶核苷中尿嘧啶和核糖是以碳－碳鍵（C1-C5）連接，故其結構較有彈性，比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點，且在RNA中產生的重疊效應高於尿苷。假尿嘧啶核苷最早於1951年發現，為細胞RNA中最常見的修飾，在三域生物中皆有，有A、U、C、G之外的「第五種核苷」之稱。 假尿嘧啶核苷是細胞中最常見的RNA修飾，是轉錄後修飾的機制之一，在轉錄結束後由（PUS）自尿苷轉化而來，此修飾可能影響RNA的結構、功能、位置與半衰期。mRNA、tRNA、rRNA、snRNA與snoRNA中均有發現假尿嘧啶核苷修飾，在tRNA與rRNA中可穩定RNA的結構，與其轉譯的功能相關；在snRNA中則可促進剪接體對的切割；在mRNA中的功能仍不清楚，有研究顯示終止密碼子中的假尿嘧啶核苷可能會造成（translation readthrough）。假尿嘧啶核苷還可能被細胞用作識別自身與外來RNA的機制，即RIG-I和等先天免疫蛋白可識別不含有假尿嘧啶核苷的病毒RNA而啟動免疫反應。 (zh)
- Псевдоуридин, ψ (від грецької літери «псі») — 5'рибозил-урацил, ізомер уридину (1'рибозил урацилу) — піримідин, найпоширеніший вид модифікацій РНК, які виникають після її синтезу з ДНК-матриці під час процесингу та модифікації. Присутність псевдоуридину в молекулах РНК надає більшої жорсткості фосфодіестеразному «хребту» молекули, та додає міцності комплементарній парі ψ-А (замість У-А), звідси псевдоуридинова модифікація грає роль у функціонуванні мяРНК у складі сплайсосом та трансляції у складі рРНК та тРНК. Нещодавно було відкрито присутність ψ у мРНК.. (uk)
- السودويوريدين (بالإنجليزية: Pseudouridine ) ويختصر بالرمز الإغريقي بسي Ψ هو مماكب نوكليوسيد اليوريدين تكون فيه قاعدة اليوراسيل مرتبطة بالريبوز عن طريق رابطة كربون-كربون بدل الرابطة الغليكوسيدية نيتروجين-كربون (يسمى أحيانا اليوراسيل في هذا التركيب سودويوراسيل) وهو أكثر النوكليوسيدات المعدلة انتشارا من بين المئات الموجودة في الحمض النووي الريبوزي. يوجد Ψ في جميع الأجناس وفي العديد من أنواع الرنا ويتم إنتاجه بواسطة إنزيم يسمى Ψ سينثاز الذي يماكب نوكليوسيدات يوريدين محددة أثناء تعديلات ما بعد النسخ في عملية تسمى السودويوريدينلة (pseudouridylation). تم حتى الآن تحديد حوالي 9500 تعديل سودويوريدين (Ψ) لدى الثديات والخميرة وتم وضعها في قاعدة بيانات RMBase. (ar)
- Pseudouridin (Ψ, systematicky 5-β-D-ribofuranosyluracil či 5-ribosyluracil) je neobvyklý nukleosid tvořený ribózou a uracilem, jenž je připojen na ribózu C-glykosidickou vazbou. Od uridinu se liší konkrétní pozicí cyklu, jímž je uracil k ribóze připojen (u uridinu je to 1' dusík, u pseudouridinu 5' uhlík uracilu). Syntéza pseudouridinu z uridinu (cs)
- Pseudouridine (abbreviated by the Greek letter psi- Ψ) is an isomer of the nucleoside uridine in which the uracil is attached via a carbon-carbon instead of a nitrogen-carbon glycosidic bond. (In this configuration, uracil is sometimes referred to as 'pseudouracil'.) Pseudouridine in rRNA and tRNA has been shown to fine-tune and stabilize the regional structure and help maintain their functions in mRNA decoding, ribosome assembly, processing and translation. Pseudouridine in snRNA has been shown to enhance spliceosomal RNA-pre-mRNA interaction to facilitate splicing regulation. (en)
- シュードウリジン (英: pseudouridine、ギリシャ文字のΨや英文字のQで略記される) は、ヌクレオシドであるウリジンの異性体。リボース環とウラシルの間のグリコシド結合のN-C結合がC-C結合に置き換わっている。RNAに知られている100を超える修飾塩基としては最も一般的で、Ψはすべての生物種、ほとんどのRNAに見出されている。 転写やその後の合成過程の後、RNAは化学的に異なる100以上の修飾を受ける。こうした修飾は転写後の段階でRNAの発現を調節している可能性があり、RNAの翻訳、局在、安定化などさまざまな役割を果たしている可能性がある。シュードウリジル化もそうした修飾の1つであり、ウリジンがC5-グリコシド結合型異性体であるシュードウリジンへ変換される。ウリジンには一般的なリボースのC1位とウラシルのN1位の間のC-N結合が存在するのに対し、シュードウリジンではリボースのC1位とウラシルのC5位がC-C結合を形成している。C-C結合は、より大きな回転自由度と立体配座の柔軟性を与える。さらに、シュードウリジンにはN1位に余分な水素結合供与体が存在する。シュードウリジンは5-リボシルウラシルとしても知られ、tRNA、rRNA、snRNA、snoRNAなどの構造的RNAの構成要素として普遍的に存在している。近年では、タンパク質をコードするmRNAにも発見されている。シュードウリジンは最も豊富に存在する修飾塩基であり、生物の3つのドメインすべてに存在し、最初に発見された修飾塩基である。このヌクレオチドは「5番目のヌクレオチド」であると見なされており、酵母のtRNAの4%を占めている。この塩基修飾はRNAを安定化し、余分なイミノ基を介して水分子と水素結合を形成することで塩基のスタッキングを強化する。大腸菌Escherichia coliのrRNAにはシュードウリジンが (ja)
- Псевдоуридин (сокращённо обозначается греческой буквой Ψ) — это C-гликозид, изомер нуклеозида уридина. Это наиболее часто встречающееся модифицированное основание из более чем сотни различных модифицированных оснований, которые встречаются в РНК. Псевдоуридин встречается во всех видах и многих классах РНК. Он синтезируется ферментом псевдоуридинсинтазой, который посттранскрипционно изомеризует определённые остатки уридина в РНК. Такой процесс называют псевдоуридинилирование. (ru)
|
