4月4 h-index 最近は、仕事でいろいろな先生方の業績を調べる機会が多くあります。研究者の評価の指標にはいろいろな種類があるわけですが、やはり論文をよいジャーナルに載せること、またそれがどのくらい他研究者に引用されているかは重要な指標になります。 よく知られているのはインパクトファクター（IF）で、あるジャーナルに載った論文が、平均何回くらい引用されたかを示す数値です。ただしこれはその雑誌に対する評価であり、ある論文の評価、研究者の評価を示すものではありません。IFの高い雑誌に載った論文＝よい論文、載せた研究者＝優れた研究者、と単純には直結しないわけです。 ある研究者の評価として、論文の引用回数の総計は重要な指標になりえます。しかしやってみればわかりますが、正確な総引用回数を出すのは非常に大変です。論文に名前が載る際には「K. Sato」などとイニシャルだけのジャーナルが多いので、本
3月8 論文の表紙などの話題 さて先日お伝えした萌えグラフィカルアブストラクトの論文、みごと表紙絵もゲットしたようです。エントロピーたんとエンタルピーたんに続き、ニューキャラが続々投入されています。GやHは察するにギブスたん、ヘルムホルツたんなのでしょうか。実に侮りがたい手腕といわざるを得ません。 日本勢も対抗すべきではないかと前回書きましたが、東大灯台もと暗しというもので、東大工学部の水野哲孝教授グループがキュートな表紙をAngewandte Chemie誌に発表しておられました。内容の方も、一級アルコールとアンモニア、酸素から一挙にニトリルを作ってしまうという優れた反応です。 ユニークなGAとしては、こんなのもあります。なんでまたC3POが、という感じもありますが、ちゃんとルーカスフィルムに許諾は得ているのでしょうか。日本勢もぜひドラえもんなりガンダムなりASIMOなりで反撃していただ
Impact Factor: Can a Scientific Retraction Change Public Opinion? A month after the keystone paper proposing a link between a common childhood vaccine series and autism was retracted, the debate rages on On supporting science journalismIf you're enjoying this article, consider supporting our award-winning journalism by subscribing. By purchasing a subscription you are helping to ensure the future
幸せなバイオインフォマティクス研究生活を送るために、論文誌の傾向と対策です。 バイオインフォマティクス（生命情報学、生物情報学）分野は幅広い生命科学分野をカバーしているので雑誌によって傾向があります。その傾向をまとめてみました。円の大きさは、その雑誌に載ったときの社会的なインパクトの大きさです。バイオインフォ関係の論文が掲載される雑誌は数多ありますが、ここで選択したのは以下の基準で選びました。 生物実験無しでコンピュータ及び数式的な解析だけで載る可能性が有る 種や現象に偏りすぎていない（そのため遺伝学系の雑誌や植物など種を特定したものを省いてあります） ざっくりとした傾向として、 一般的なキャッチーさが求められる雑誌 Nature, Science, Nature系列(Biotechnology, Genetics, Methods), Cell(上記図に忘れています), PNAS 生物学
物理学分野を中心とするプレプリントサーバarXivを運営するコーネル大学が、資金面での協力を募ることを発表しましたね。 プレスリリース Cornell University Library ビジネスモデル等の詳細について（ホワイトペーパー） arXiv.org help - arXiv Business Model White Paper 日本語記事 コーネル大学図書館、プレプリントサーバ“arXiv”への資金協力を求める | カレントアウェアネス・ポータル すでにいくつもの分野にとってなくてはならないものであり、最も成功したプレプリントサーバ／分野別リポジトリの例とも見られているarXivについて「今のビジネスモデルじゃきつい」というメッセージが出されたことで、すでに海外のネット上では色々と議論がかわされています。 ちなみにホワイトペーパーによれば、現在arXivの運営にコーネル大学は年
大学で研究活動をしていて、欧米系の学術雑誌に依存している人間にとっては、学術雑誌にアクセスできるかどうかは、極端に言うと研究生命を左右するほどの重大事です。今日のニュースで電子学術雑誌の購読料が高等を続けていることが取り上げられています。 (C) photoXpress 学術雑誌：ネット購読料高騰に悲鳴 ３年で２．５倍 科学や医療などの学術雑誌がネット上で閲覧できる「電子ジャーナル」の購読料が高騰を続け、各大学の図書館が悲鳴を上げている。国内の大学全体の購読料は０４年度の約６２億円が０７年度には約１５５億円に急増。 ・・・ 文部科学省は０４年度から購読料調査を行っている。同年度の国公私立大全体の購読料は６１億９８００万円（１校平均８６５万円）だったが、０７年度は１５５億２６００万円（同２０６４万円）に膨れた。国大図協の事務局でもある東京大は国内の大学では最高額の年間約１０億円の購読料を支払
「明日から通常営業に戻ります」と言ったそばから１週間以上放置してしまいましたが・・・（汗） こ、更新するつもりがないのと、するつもりはあるんだけど更新する時間がないのでは全然違うよね！？ 閑話休題。 当ブログでも再三とりあげてきたオープンアクセス雑誌、PLoS ONEのWeb of Scienceへの収録が決まりましたね。 元ニュース（英語） 日本語記事 johokanri.jp PLoS ONE関連の過去のエントリ 世界最加速カビの論文見てて気づいたが"PLoS ONE"何気にすごいな - かたつむりは電子図書館の夢をみるか 学術論文における"rating"ってなんだ？ - かたつむりは電子図書館の夢をみるか ジャーナリズムはPLoS ONEがお好き？ -朝日新聞編- - かたつむりは電子図書館の夢をみるか PLoS ONEは掲載料を著者が支払う代わりに読者はただで閲覧できる、いわゆる「
(07/18)私はいかにしてニセ科学批判者と呼ばれるに至ったか (07/17)産総研がバイオインフォマティクスのワークショップを開催するようです (07/12)IBMがゲノムビジネスに本格参入するらしい (07/11)ホメオパシー助産師のビタミンK2の問題が裁判になった (07/04)日本トンデモ本大賞2010オープニングムービー (07/03)トゥーリオ・シモンチーニのがん治療についてのまとめ (03/29)『「トンデモ」批判の政治性と政治の未来』にコメントしてみる (03/24)ニセ科学商品バイオラバーについてのまとめ (03/23)正しい目薬のさし方 (03/21)科学なポッドキャストをまとめて紹介してみる はじめにお読みください(1) サイエンスニュース(122) 宇宙開発・天文ニュース(78) サイエンストピックス(57) バイオニュース(155) バイオインフォマティクス(17
NatureとScienceだけは、雑誌を購読していない読者には決して記事を読ませないというポリシーを貫き続けていたのですが、その一角であるNatureがくずれることになったかもしれません。最初の発表は、読者向けに出されたメールであったようです。 NPG's annual letter to customers (2009) Nature出版グループからお客様へのお知らせIn April 2010 we will introduce Nature Communications, an online-only peer-reviewed journal offering rapid publication for high-quality research across the biological, chemical and physical sciences. Nature Commun
CiteULike organises scholarly (or academic) papers or literature and provides bibliographic (which means it makes bibliographies) for universities and higher education establishments. It helps undergraduates and postgraduates. People studying for PhDs or in postdoctoral (postdoc) positions. The service is similar in scope to EndNote or RefWorks or any other reference manager like BibTeX, but it is
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Published online 12 June 2009 | Nature | doi:10.1038/news.2009.563 News Tantalizing clues to the chemical origins of life A synthetic molecule can reshuffle itself to match a DNA template. Katharine Sanderson The new molecule can adapt its sequence to a DNA template.Science / AAAS Chemists in the United States have made an artificial DNA-like molecule that can change its sequence to bind to a DNA
RSSってなんぞ・・・って人はうちのブログ読んでいるような人の中にはあまりいないのではないかと思いますが、一応なんのことかわからない方はこちらを参照：RSS - Wikipedia。 凄い端的に言うとwebサイトの更新情報とか内容とかを配信してくれる仕組みというかフォーマットというかです。 前置きはさておき。 最近、電子ジャーナル関係の統計の話が出るたびにずっと気になっているのですが、あんまり表に出てこない話として「RSSフィードから電子ジャーナルを読んでいる人間はどれくらいいるのか？」、あるいは「研究者にRSSの利用はどのくらい浸透しているのか？」という話があります。 国内に限定するとそもそも雑誌の電子化自体進んでいないのであれですが、海外の電子ジャーナルの場合大手はどこも新着記事をRSSで配信していて*1、いちいち最新号が出るたびにチェックしたり、あるいはeメールのアラートサービス等を
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本家/.の記事（Merck Created Phony Peer-Review Medical Journal）より。「Australasian Journal of Bone and Joint Medicine」という、自称ピア・レビュー（査読）付きジャーナルがある。骨や関節の医療に関する医学の専門学術論文誌のように聞こえるが、なんとこれは、世界的な医薬品メーカーとして知られるメルク（Merck）社が、自社の製品に都合の良いデータを発表して箔をつけるためにわざわざ設立したもの。実質的に査読は存在しなかったそうだ。 元のThe Scientistの記事（Merck published fake journal）は登録者しか読めないが、The American Journal of Bioethicsのブログblog.bioethics.netに出たSummar Johnson博士による記
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Cold Spring Harbor Laboratory のミーティングシリーズの一つ、Systems Biology: Networksに行ってきました。基本的にClosedなミーティングなので、ここでは、論文として公開されている情報にポインタが張れるレベルの内容を記載します。（興味がある方は、私が理解した＆覚えている範囲でお伝えしますので、個人的に連絡ください。CSHのミーティングでは、personal communicationでの伝達は認められています） 私自身は主として生命科学に応用を持つアルゴリズムやソフトウエアの開発が主な研究対象なので、Systems Biologyを専門にしているわけではありません。そういう意味で、今回のミーティングは、私の研究にぴったり合っている内容ではありませんでした。それでも、自分が開発した手法がどのように活かせるか、どのような手法を開発するのが良
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