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MCMCに関するma_koのブックマーク (7)

  • マルコフ連鎖モンテカルロ法入門-1

    ※ここで解説しているお天気推移モデルはオリジナルなものですので、数値・計算等にミスがある可能性が否めませんので、もし間違いを見かけた方は優しく教えていただけると助かります。 お天気推移モデルで理解するマルコフ連鎖モンテカルロ法。2状態離散モデルの解説を中心に、メトロポリス法の解説まで行った。 次は連続モデルや熱浴法・メトロポリスヘイスティング法の解説資料も作成したい⇒完成。以下のLINKを参照下さい。http://www.slideshare.net/teramonagi/ss-5344006 誤字を修正(2010/11/01)Read less

    マルコフ連鎖モンテカルロ法入門-1
    ma_ko
    ma_ko 2010/09/14
  • MCMCの勉強(1): Taglibro de H

    今さら感はあるが、MCMC (Markov Chain Monte Carlo; マルコフ連鎖モンテカルロ)を使えるようになろうと、まずは簡単な例から試してみた。 手始めに、正規乱数から生成した標の平均と標準偏差を推定してみる。 やはりRを使用。MCMCpackパッケージを あらかじめインストールしておいて、呼び出す。MCMCpack中のMCMCmetrop1R()関数を利用して、メトロポリス法によるMCMC推定をおこなう。 library(MCMCpack) 乱数系列を初期化。 set.seed(1) 平均10、標準偏差3の乱数を1000個生成して、xに入れる。 m <- 10 s <- 3 x <- rnorm(1000, m, s) MCMC推定に使用する関数を用意する。betaは要素数2のベクトル。beta[1]が平均、beta[2]が標準偏差で、betaを推定する。関数の返り値

    MCMCの勉強(1): Taglibro de H
    ma_ko
    ma_ko 2007/01/10
    コードあり
  • ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

    列挙してみる 遺伝生殖関係 メンデル メンデルの遺伝の法則 集団遺伝学 木村資生 進化解析 系統樹 連鎖不平衡 遺伝的多様性 家系解析 連鎖解析 ゲノム特化事項 オミックス マルチオミックス 時空間離散化(個人・細胞) 量的生物学 統計関係 フィッシャー 離散変数 カテゴリカル変数 連続変数 多変量解析 離散確率過程 多重検定 多段階解析 統合解析 QC 量子確率論 尤度 ベイズ流 ゲノム疫学 データサイエンス関係 大規模データ解析 機械学習 深層学習 ゲーム理論 量子計算 量子計算機 情報関係 マルチバンディット ボルツマンマシン エントロピー 個人情報 数学関係 微分積分学 線形代数学 グラフ理論 情報幾何 多様体 確率微分方程式 物理学関係 波動関数 量子力学 医療関係 臨床ゲノム学 リスク遺伝子 責任遺伝子 リスクコミュニケーション 遺伝子診断 予防医学 出生前診断 個別化医療 倫

    ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ
    ma_ko
    ma_ko 2007/01/10
    MCMCpack
  • 生態学データ解析 - ベイズ統計 & MCMC

    ここはベイズ推定と MCMC 法 (Markov Chain Monte Carlo method; マルコフ連鎖モンテカルロ法) 関連についてのペイジです 特に階層ベイズモデルについて [もくじ] ネット上の Bayes 推定・MCMC 計算の解説 「ベイズ推定を MCMC 計算で」なソフトウェアたち ベイズ推定と R ベイズファクターなど 書籍 べいじあんな生態学研究者 Ben Bolker Ottar N. Bjørnstad James S. Clark Kiona Ogle John Silader Christopher K. Wikle ネット上の Bayes 推定・MCMC 計算の解説 講義とか:統計学授業 や 出張統計学授業 解説記事: 岩波DS01 2016 階層ベイズモデルの解説記事 信学会誌ベイズ解説: 電子情報通信学会誌に書いた階層ベイズ解説 (2009 年 10

    ma_ko
    ma_ko 2007/01/10
    久保さん
  • モンテカルロ法とは - IT用語辞典

    モンテカルロ法 【Monte Carlo method】 モンテカルロシミュレーション / Monte Carlo simulation 概要 モンテカルロ法(Monte Carlo method)とは、数値計算手法の一つで、乱数を用いた試行を繰り返すことにより近似解を求める手法。確率論的な事象についての推定値を得る場合を特に「モンテカルロシミュレーション」と呼ぶ。名称の由来はカジノで有名なモナコ公国のモンテカルロ地区である。 ある事象をモデル化した数式や関数があるとき、その定義域に含まれる値をランダムにたくさん生成して実際に計算を行い、得られた結果を統計的に処理することで推定値を得ることができる。数式を解析的に解くのが困難あるいは不可能な場合でも数値的に近似解を求めることができる。 例えば、円周率を求める場合、-1から1までの間に含まれるランダムな値を2つ生成し、これを平面上の点の座標に

    モンテカルロ法とは - IT用語辞典
    ma_ko
    ma_ko 2007/01/10
    手法を「モンテカルロ」という暗号名で呼んだそうだが、これはギャンブルの国モナコの首都モンテカルロから取ったと言われている。
  • マルコフ連鎖モンテカルロとは

    マルコフ連鎖モンテカルロとは
    ma_ko
    ma_ko 2007/01/10
  • ベイズ統計と統計物理(統計科学のフロンティア12 計算統計II マルコフ連鎖モンテカルロ法の基礎)

    サポートページ (ベイズ統計 & マルコフ連鎖モンテカルロ) 2008年度より,新シリーズ「確率と情報の科学」が刊行開始となりました. 伊庭は編集のみで執筆の予定はありませんが,それとは別に新作の計画も練っております. 「統計科学のフロンティア」12巻『計算統計II』は好評6刷りとなりました. 伊庭は,第I部「マルコフ連鎖モンテカルロ法の基礎」,補論A「逐次モンテカルロ法 入門」を執筆しております. また,おかげさまで「ベイズ統計と統計物理」も5800部以上(7刷り)を超えました.フロンティア,確率と情報の科学ともどもよろしくお願いします. ― 伊庭幸人 店頭にない書店も多いので,ご友人やご同僚の方にお勧めの場合,ご購入はアマゾンまたは岩波書店の直売を利用していただくのが確実な旨,お伝えくださると幸いです. 統計科学のフロンティア12 計算統計II マルコフ連鎖モンテカルロ法の基礎 アマゾ

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