Sequencingに関するsoh3914のブックマーク (26)
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soh3914 2014/09/30
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Quartz-Seqの名前由来
Quartz-Seqは2013/4/23現在、最も感度が高く最も再現性の高い1細胞RNA-Seq法です。実験手法の開発では、定量性を上げることを主目的に、問題となるパラメータを全てあぶりだし、改善をはかりました。刀鍛冶が刀を鍛えるイメージです。ひたすら切れ味＝定量性を求めました。データ解析のプロとがっちり組んで開発したことで総合的に完成度の高い方法になったと思います。実験研究者として、実験手法を開発し世に送り出せたことは非常に喜ばしいことです。 Quartz-Seqの名前の由来の話ですが、Quantitative amplification for RNAzの略がQuarzで、英語でのQuartzのドイツ語表記となります。zはギークでsをzという場合があるから置換して使っています。Quartzは水晶やクオーツ時計といった意味合いがあり、正確性をイメージさせる名前となっています。 正直、かっ
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高速塩基配列解読技術をSuperSAGE法に活用した網羅的遺伝子発現解析法 | 農研機構
高速塩基配列解読技術をSuperSAGE法に活用した網羅的遺伝子発現解析法 ※アーカイブの成果情報は、発表されてから年数が経っており、情報が古くなっております。 同一分野の研究については、なるべく新しい情報を検索ください。 要約 SuperSAGE法に高速塩基配列解読技術を活用することにより開発した大量発現タグ取得技術により、24塩基の発現タグを1度に400万個程度取得できる。発現タグは発現遺伝子と厳格に対応付けることができるため、網羅的な遺伝子発現解析が可能である。 キーワード:SuperSAGE、高速塩基配列解読技術、遺伝子発現解析 担当:野菜茶研・野菜ゲノム研究チーム 代表連絡先:電話050-3533-3863 区分:野菜茶業・野菜育種 分類:研究・普及 背景・ねらい 発現遺伝子の配列を代表する「発現タグ(以下タグ)」のカウント数により発現量を評価するSereal Analysis
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Moleculo technology: synthetic long reads for genome phasing, de novo sequencing
Moleculo, acquired by Illumina in late 2012, has developed an innovative technology for generating long reads that combines a new sample prep method and genome analysis tools. The technology breaks DNA into large fragments that are sequenced on standard Illumina sequencing systems for subsequent assembly into synthetic long reads using proprietary informatics. The Moleculo sample prep is a full en
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リアルタイムPCRアッセイ | Thermo Fisher Scientific - JP
年末年始の製品発送手続きについて 下記期間中のオンラインオーダー製品のお届けはございません。 2024年12月28日（土）～2025年1月6日（月） ※上記発送停止期間中で納品希望日がございましたらご注文時にご連絡ください。ただし、状況によりましてはご希望に添えない場合もございますのでご了承ください。 ※ご注文済み製品の納期につきましては、受注伝票番号をご記載の上 JP.Admin@thermofisher.com までお問い合せください。 オンラインオーダーアカウントについて 一定期間ご利用がないThermofisher.comアカウントにつきましては、ご利用できなくなる場合があります。 お客さまのアカウントを不正アクセスからお守りし、安全にご利用いただくための措置となりますので、ご了承くださいますようよろしくお願い申し上げます。 Applied Biosystems TaqMan As
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exonerate sequencing alignment
About exonerate is a generic tool for pairwise sequence comparison. It allows you to align sequences using a many alignment models, using either exhaustive dynamic programming, or a variety of heuristics. If you have questions, you can email guy@ebi.ac.uk Documentation See the beginner's, advanced, and NEW:server user guides. For further details about using exonerate and examples, see man pages fo
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Wikispaces
We are sorry, but the site you are looking for no longer exists Wikispaces was founded in 2005 and has since been used by educators, companies and individuals across the globe. Unfortunately, the time has come where we have had to make the difficult business decision to end the Wikispaces service. We first announced the site closure in January 2018, through a site-wide banner that appeared to all
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Generation of high-affinity DNA aptamers using an expanded genetic alphabet : Nature Biotechnology : Nature Publishing Group
Thank you for visiting nature.com. You are using a browser version with limited support for CSS. To obtain the best experience, we recommend you use a more up to date browser (or turn off compatibility mode in Internet Explorer). In the meantime, to ensure continued support, we are displaying the site without styles and JavaScript.
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Sequence-specific error profile of Illumina sequencers
1 Graduate School of Information Science, 2 Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science and Technology, 8916-5 Takayama-cho, Ikoma, Nara 630-0192, Japan, 3 Biological Science Laboratories, Kao Corporation, 2606 Akabane, Ichikai, Haga, Tochigi 321-3497, 4 Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, 5 Genome Research Center, NODAI Research Institute, Tokyo Univer
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Download Guide - SRA Handbook - NCBI Bookshelf
The purpose of this document is to review to users types of data that are available for download from the SRA, how to download datasets of interest, and how to transform the download components into final usable form. 1. 1 Important Notes on Download FacilitiesA number of users have the question: Why can’t I get SRA data in my favorite format ?The SRA is an archive of data and does not have the re
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