Decifrando o panorama regulatório transcricional em Trichoderma reesei através de ChIP-Seq e ATAC-Seq

Resumo

Trichoderma reesei é um fungo saprofítico amplamente conhecido por sua capacidade de produzir grandes quantidades de celulases. Essas enzimas são críticas para a produção de bioprodutos de alto valor a partir da biomassa lignocelulósica (BLC), como o etanol. O sistema celulolítico de T. reesei é finamente regulado ao nível transcricional, e vários fatores de transcrição (FTs) coordenam a expressão de enzimas, transportadores e outras proteínas associadas à desconstrução de BLC. Estudos do nosso laboratório (Projeto FAPESP número 2021/01580-7) identificaram quatro FTs potencialmente envolvidos na regulação da expressão de celulase em T. reesei: Nsd3, Srr1, Atf1 e Hsf1. A caracterização destes FTs revelou que eles estão envolvidos em diversos processos fisiológicos em T. reesei: produção de celulase, resposta ao estresse, metabolismo do cálcio, manutenção da integridade da parede celular, conidiação e produção de metabólitos secundários. Este projeto visa utilizar técnicas high-throughput para obter novos insights sobre o papel desses TFs na fisiologia de T. reesei. Para isso, realizaremos Imunoprecipitação de Cromatina seguida de Sequenciamento (ChIP-Seq) para identificar alvos diretos desses FTs. Além disso, Assay for Tranposase-Acessible Chromatin Sequencing (ATAC-Seq) será usado para analisar o impacto desses FTs na acessibilidade da cromatina e na expressão gênica. Os dados obtidos utilizando estas abordagens podem ser usados para identificar novos genes e vias envolvidas na produção de celulase e na resposta ao estresse. Nossos resultados podem contribuir para uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na regulação da produção de holocelulase e na biologia e fisiologia do fungo industrial T. reesei.