CV Lattes
ORCID
Resumo
Aquisição de cluster HPC de computadores como EMU no âmbito do Centro de Pesquisa de Computação em Engenharia e Ciências (AU)
Busca avançada
Possui graduação em Física pela Universidade Estadual de Campinas (1984), doutorado (PhD) - State University of New York at Stony Brook (1991), pós-doutorado pela Colorado State University, EUA (1991-1993) e Livre Docente pela Universidade Estadual de Campinas (1999). Foi Professor Visitante do Institute for Theoretical Chemistry, Universidade do Texas, Austin-TX, EUA (2000-2001). Atualmente é Professor Titular do Instituto de Química da UNICAMP. Tem experiência nas áreas de Física e Química, com ênfase em Química Teórica, atuando principalmente nos seguintes temas: simulação por dinamica molecular, termodinâmica estatística, estrutura e dinâmica de líquidos, dinâmica de proteinas e outros sistemas biomoleculares, reações enzimáticas e simulações por QM/MM. Foi Pró-Reitor de Pesquisa da UNICAMP gestão 2017-2021 e é atualmente diretor do CEPID/FAPESP Center for Computing in Engineering and Sciences (https://cces.unicamp.br/). (Fonte: Currículo Lattes)
| Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o(a) pesquisador(a): |
| A era do exaflops |
| Frío por un hilo |
| Frío por un hilo |
| Reutilizar, reemplazar, degradar |
| El planeta plástico |
| El planeta plástico |
| Reutilizar, reemplazar, degradar |
| Un filtro distinto |
| Un filtro distinto |
| Sólidos bien maleables |
| Sólidos bem maleáveis |
| Matéria(s) publicada(s) no Pesquisa para Inovação FAPESP sobre o(a) pesquisador(a): |
| Voo de coruja inspira indústria aeronáutica a projetar aviões mais silenciosos |
| Workshop da Embrapii |
| Unicamp lança portal que conecta pesquisadores a equipamentos e serviços da universidade |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a) |
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| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total): |
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| VEICULO: TITULO (DATA) |
Auxílios à pesquisa
- EMU concedido no Proc. 2013/08293-7, KAHUNA upgrade - HPE Apollo Gen10 Supercomputer, AP.EMU
- CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
Resumo
Propõe-se a criação de um centro multidisciplinar de alto nível, dedicado ao desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais avançados e que venha solucionar problemas de fronteira nas ciências e engenharias, bem como promover avanços substantivos em inovação tecnológica e difusão desta área do conhecimento, a qual tem sido denominada e-Science. O "Centro de Engenharia e Ciências Co…
- In silico screening and understanding of advanced nano-materials for molecular capture related to clean energy applications, AP.R
Resumo
Muitas áreas das ciências e engenharia se beneficiam de simulações computacionais. Os exemplos mais comuns incluem, por exemplo, o desenho computacional de automóveis e aviões. No plano da nanotecnologia, a situação não é diferente, exceto que neste ramo as simulações se dão em escalas atômicas e moleculares. Simulações computacionais constituem ferramenta indispensável para se acessar de…
- 15.0 simposio brasileiro de quimica teorica | pocos de caldas - mg, AO.R
- Biofísica estrutural dos receptores nucleares e proteínas relacionadas, AP.TEM
Resumo
Os receptores nucleares estão dentre as mais importantes moléculas envolvidas na regulação intracelular, pois participam na transmissão de diferentes sinais internos e externos para a regulação de programas genéticos. A programação genética estabelecida ou modificada por essas proteínas afeta praticamente todos os aspectos da vida de organismos multicelulares. A regulação transcricional e…
Bolsas no país
- Modelagem molecular de enzimas ativas em substratos lignocelulósicos, BP.DR
Resumo
A biomassa lignocelulósica é uma fonte renovável extremamente importante de biomateriais e energia. Os polissacarídeos presentes nas plantas, compostos principalmente por fibras de celulose, são a maior fonte de carboidratos da Terra, enquanto a lignina, outro componente importante das paredes celulares das plantas, é a segunda maior fonte de compostos aromáticos, sendo superada apenas pe…
- Mecanismos de reação de enzimas e aprimoramento catalítico com base em estados de transição e algoritmos de aprendizado de máquina, BP.PD
Resumo
O tema desta pesquisa de pós-doutorado é o estudo de mecanismos de reação e eficiência catalítica de enzimas ativas em substratos lignocelulósicos usando técnicas avançadas de modelagem molecular. As enzimas de interesse são principalmente Esterases (por exemplo, Glucuronil Esterases - GEs, Feruloil Esterases - FAEs) e ²-glicosidases Glicosídeo Hidrolases (GHs). GEs/FAEs e GHs estão envol…
- Simulações de dinâmica molecular de enzimas de interesse biotecnológico, BP.PD
Resumo
Propomos a aplicação de extensas técnicas clássicas de simulação MD e QM/MM para projetar mutações que possam aumentar a estabilidade térmica e a eficiência catalítica de enzimas para aplicações industriais. O foco principal do projeto será em xilanases e outras hidrolases glicosídicas (GHs) para sacarificação de polissacarídeos lineares de biomassa lignocelulósica, mas outras enzimas de …
- Arquitetura mesoscópica de fibras lignocelulósicas, BP.PD
Resumo
Neste projeto, aplicaremos técnicas de otimização de topologia estrutural baseadas em métodos de elementos finitos (FEM) e descrições atomísticas ou de partículas (Molecular Dynamics - MD ou Discrete Element Method - DEM) dos diferentes constituintes poliméricos para estudar propriedades térmicas e mecânicas de fibras lignocelulósicas. O principal desafio é propor novas estratégias evolut…
- Modelagem de enzimas e complexos proteicos associados com a degradação de celulose, BP.PD
Resumo
Técnicas de metagenômica e de modelagem de proteínas por dinâmica molecular serão combinadas para identificar e estudar novas enzimas candidatas para a degradação de biomassa lignocelulósica com vistas à produção de etanol de segunda geração.
Bolsas no Exterior
- Estudos Computacionais da Biodegradação Enzimática do Tereftalato de Polietileno (PET): Explorando a Estabilidade e Eficiência das PETases, BE.EP.PD
Resumo
Os plásticos são materiais essenciais para a sociedade moderna devido às suas propriedades específicas, mas os níveis crescentes de poluição provenientes dos resíduos de plástico representam uma crise ambiental global. Recentemente, uma cepa de bactéria Ideonella sakaiensis 201-F6 foi isolada e demonstrou uma capacidade incomum de degradar o poli(tereftalato de etileno) (PET). A PETase da…
- Diagnose de osteoporose através de uma modelagem multiescala de fratura óssea usando o método dos elementos de contorno, dinâmica molecular e outros métodos computacionais, BE.EP.DD
Resumo
Fratura óssea induzida por osteoporose tem se tornado um grande problema de saúde. O aumento da expectativa de vida resulta em uma maior fração da população afetada por osteoporose, uma doença crônica que aumenta o risco de fratura óssea deteriorando a estrutura do tecido desde a escala molecular até a escala macro. Se as tecnologias atuais de diagnóstico médico não melhorarem, fraturas ó…
- Modelagem molecular da atividade da enzima GcoA sobre lignina, BE.EP.DR
Resumo
A lignina é um biopolímero heterogêneo presente nas paredes celulares das plantas e desempenha um papel estrutural importante. Dada a sua abundância (o segundo biopolímero mais abundante na Terra), a lignina é a principal fonte de carbono aromático do planeta, o que destaca a oportunidade de aproveitar esta fonte renovável de produtos químicos valiosos. Os monômeros de lignina podem ser f…
- Descoberta em larga escala dos perfis de energia de nanocorpos naturais e desenhados, BE.EP.PD
Resumo
Durante a evolução, somente uma pequena fração do espaço das sequências de proteínas foi amostrado. A área de design de proteínas de novo tem como objetivo explorar o espaço de sequências não visto durante a evolução para customizar proteínas com diversas aplicações em biologia e ciências de materiais. Por muitos anos, a área dependeu de testar experimentalmente uma proteína por vez com u…
- Paulo Cesar Telles de Souza
- Érica Teixeira Prates
- Rodrigo Leandro Silveira
- Lucimara Ramos Martins
- Leandro Martinez
- Tatiana Mello da Costa Faro
- Clarisse Gravina Ricci
- Caroline Simões Pereira
- Allan Jhonathan Ramos Ferrari
- Artur Hermano Sampaio Dias
- Amadeus Cavalcanti Salvador de Alcântara
- Clauber Henrique Souza da Costa
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Espectroscopia resolvida no tempo
Estrutura metal-orgânica
Eventos científicos e de divulgação
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Física
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Fraturas ósseas
Fungos mitospóricos
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Hidrólise enzimática
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Modelagem computacional
Modelagem molecular
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Monocamadas de Langmuir
Multimídia
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Nanotecnologia
Óptica não linear
Osteoporose
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Parede celular vegetal
Peptídeos
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Polissacarídeos
Propriedades dielétricas
Propriedades termodinâmicas
Proteínas de transporte
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Química computacional
Química quântica
Química teórica
Química
Receptores ativados por proliferador de peroxissomo
Receptores citoplasmáticos e nucleares
Receptores dos hormônios tireóideos
Receptores hormonais
Receptores toll-like
Sacarificação
Simulação de dinâmica molecular
Simulação por computador
Soluções aquosas
Solvatação
Tecnologia educacional
Teoria do funcional da densidade
Transcrição genética
Trichoderma