Lenarviricota

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Lenarviricota

Phylum Lenarviricota: TEM-Aufnahmen von Virionen des Ourmia melon virus (OuMV, links) und Bakteriophagen Qβ an einem Pilus von E. coli (unten); Narna- und Mitoviren haben kein Kapsid oder gar Virushülle (rechts)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Lenarviricota
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA
Wissenschaftlicher Name
Lenarviricota
Links

Lenarviricota ist ein Phylum von RNA-Viren, das alle Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität umfasst, die Prokaryoten infizieren; einige Mitglieder infizieren aber auch Eukaryoten.[3]

Der Name des Phylums ist eine Zusammenziehung aus den Namen der Gründungsmitgliederfamilien Leviviridae (jetzt Fiersviridae bw. Klasse Leviviricetes) und Narnaviridae, zusammen mit dem Suffix -viricota, das ein Virenphylum bezeichnet.[4]

Es wird vermutet, dass der Ursprung der Lenarviricota bereits vor dem des letzten universellen gemeinsamen Vorfahren (LUCA) aller zellulären Organismen liegen könnte.[5]

Kapsidaufbau des Bakteriophagen MS2 (Spezies Emesvirus zinderi, Familie Fiersviridae)
Phylogenetischer Baum der Lenarviricota (oben), Genom­karte ver­schie­dener Mit­glieder mit den wichtigsten konservierten Proteinen (unten)

Die vom ICTV bestätigte Taxonomie der Lenarviricota ist mit Stand 18. Juni 2021 wie folgt:[6][1]

Phylum Lenarviricota

  • Klasse Amabiliviricetes mit einziger
  • Klasse Howeltoviricetes mit einziger
    • Ordnung Cryppavirales, darin einzige
  • Gattung Mahrahovirus
  • Gattung Nicedsevirus
  • Gattung Nordovirus
  • Gattung Skrubnovirus
  • Gattung „Hohglivirus“ mit einziger Spezies „Hohglivirus simiicola(ssRNA-Phage AVE007) ist nicht mehr offiziell anerkannt
  • Gattung „Meihzavirus“ mit einziger Spezies „Meihzavirus luticola(ssRNA-Phage SRR7976325_6),
  • Gattung „Sculuvirus“ mit einziger Spezies „Sculuvirus humenecus(ssRNA-Phage Zoerhiza.1_24),
  • Gattung „Tetipavirus“ mit einziger Spezies „Tetipavirus asiadaptatum(ssRNA-Phage SRR6960799_31),
  • Gattung „Winunavirus“ mit einziger Spezies „Winunavirus asiadaptatum(ssRNA-Phage SRR7976310_9) alle ebenso.
  • Klasse Miaviricetes mit einziger

Das NCBI listet darüber hinaus mehr als 860 weitere bisher noch nicht weiter zugeordnete Vorschläge/Kandidaten als Mitgliedsspezies der Lenarviricota auf (Stand 18. Juni 2021).[7]

Molekulargenetische Analysen haben die folgenden phylogenetischen Beziehungen zwischen den Familien ergeben:[8][9]

 Lenarviricota 
 Norzivirales 

Atkinsviridae


   

Solspiviridae


   

Fiersviridae (früher Leviviridae)


   

Duinviridae





   
 Timlovirales 

Blumeviridae


   

Steitzviridae



   

Howeltoviricetes > Mitoviridae


   

Miaviricetes > Botourmiaviridae


   

Amabiliviricetes > Narnaviridae






Vorlage:Klade/Wartung/Style

Anmerkung: Im Gegensatz zur ICTV-Taxonomie clustern hier die Timlovirales mit den Botourmiaviridae/Mitoviridae/Narnaviridae und nicht mit den Norzivirales, so dass die Leviviricetes (Norzivirales/Timlovirales/…) nicht als Klade (monophyletische Gruppe) erscheinen.

Einzelnachweise

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  1. a b ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019.
  3. Yuri I. Wolf, Darius Kazlauskas, Jaime Iranzo, Adriana Lucía-Sanz, Jens H. Kuhn, Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: Origins and Evolution of the Global RNA Virome. In: mBio. 9. Jahrgang, Nr. 6, 21. Dezember 2018, ISSN 2150-7511, doi:10.1128/mBio.02329-18, PMID 30482837 (englisch, mbio.asm.org (Memento des Originals vom 14. August 2020 im Internet Archive) [abgerufen am 7. Juli 2020]).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/mbio.asm.org
  4. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, M. Zerbini, J. H. Kuhn: Proposal: Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria. In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). (englisch).
  5. Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: The LUCA and its complex virome. In: Nature Reviews Microbiology. 14. Juli 2020, doi:10.1038/s41579-020-0408-x, PMID 32665595 (englisch).
  6. Virus Taxonomy: 2020 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), März 2021, abgerufen am 16. Mai 2021 (englisch).
  7. NCBI unclassified Lenarviricota (list)
  8. Yuri I. Wolf, Sukrit Silas, Yongjie Wang, Shuang Wu, Michael Bocek, Darius Kazlauskas, Mart Krupovic, Andrew Fire, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome. In: Nature, Band 5, S. 1262–1270, 20. Juli 2020, doi:10.1038/s41564-020-0755-4
  9. Dann Turner, Andrew M. Kropinski. Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 506, 18. März 2021, doi:10.3390/v13030506