Metodologa

GenomeNet Ejercicio 1 y 2
Acceder a la pgina del buscador correspondient, Acceder al buscador del lado derecho se pone la palabra
Genome y del lado izquierdo el reino, seleccin a palabra GO
Se ver como se desplaza la lista de todos los genomas que el buscador tiene (o acceder dese google)
Ejercicio 3: Colocar en google el numero de la secuencia y a un lado la palabra Genome Net y se dar entre
Se deprender el link de la secuencia deseada y se dar enter
Se ver toda la secuencia y en el lado derecho se ver el botn de fasta se dar clik y la secuencia cambiara a
tipo fasta

Broad Institute Ejercicio 1 y 2: Acceder a la pgina del buscador correspondiente , Ir al buscador escribir un
reino y se desprendern mucho links pero se puede ver al lado derecho un men donde dice genomas , Se
seleccionara y se pondr el nombre del reino (en seguida se vern la lista de todos los genomas)
Ejercicio 3. Buscar en internet la secuencia para poder identificar a que clase pertenece
Ingresar al buscar e ingresar a al reino donde pertenece y colocar el numero de la secuencia
Una vez cuando se est en la secuencia dar clik al botn de Secuencing y cambiara a formato fasta

National Center of Biotechnology information (NCBI) y European Bioinformatics Institute (EBI) Ejercicio 1 y
2: Acceder a la pgina del buscador correspondiente, ir al men en la parte superior seleccionar la opcin
genoma y se escribir el reino que se desea buscar, se desplazara toda la lista de los genomas y en la parte
superior se ver el numero de genomas correspondientes
Ejercicio 3 : Seleccionar la opcin Nucleotide y de lado derecha se pondr en nmero de secuencia y se
presionara enter
En la parte superior se ver la palabra fasta para poder cambiar el formato

Craig Venter Institute: seleccionar en el listado, PLANT GENOMICS, seleccionar Medicago truncatula Genome
Project, ir a la parte superior en el buscador, escribir el reino y se observaran los organismos completamente
secuenciados Ejericio 3 Colocar en google el numero de la secuencia identificar a que reino pertenece ingresar
al buscador y teclear el numero de la secuencia











Existe un gran cantidad de secuencias genmicas que a lo largo de los aos se
han ido anexado a las diferentes bases de datos, aun que todas son bases de
datos su forma de manejo varia ya que, cada una de ellas cuenta con
herramientas diferentes o con un formato de manejo distinto, por eso es
importante conocer todas las bases de datos posibles y saberlas manejar esta
prctica se enfoco en el manejo de: GenomeNet, BroadInstitute, National Center
of Biotechnologyinformation, J. Craig VenterInstitute, EBI.

Se busco informacin similar en las bases de datos anterior mente mencionadas y
se pudo observar como en bases de datos como el NCBI y el EBI no fue muy
difcil encontrar las secuencias y genomas que se buscaba ya que cuentan con un
modo de manejo muy sencillo, si tienen las herramientas a fcil comprensin y
acceso cabe resaltar que la base de datos NCBI cuenta con un tutorial que
explica paso a paso el manejo del mismo, tambin es fcil acceder desde google a
la secuencia buscada ya que estas son bases de datos pblicas, en contraste a lo
que son la bases de datos de BroadInstitute y la de Craig Vneter que son bases de
datos privadas con un manejo un poco ms complicado ya que las herramientas
no se observaban a simple vista ni cuenta con un herramienta que te ayude a
orientarte y es necesaria una bsqueda ms especializada , Mientras que en el
caso de la base de datos EBI no es muy complicada de utilizar aun que las
herramientas no estn tan visibles con en el caso de el NCBI o de GenomeNet
que si lo estn, cuenta con accesos directos desde google lo que facilita el manejo
de la base de datos y una vez dentro del link que te lleva a la secuencia deseada
se observa el men con todas las herramientas para poder continuar una
bsqueda diferente.
Es comn encontrar informacin similar en la bases de datos que entre NCBI
EBI DDBJ = forman la triada de bases de datos que consiste en un acuerdo de
compartir toda la informacin que se obtenga y queda en criterio de la persona
cual base de datos desea utilizar















Las bases de datos ms fciles de manejar y donde se encuentra ms fcil
secuencias genmicas son las pblicas que son el NCBI, EBI y Genoma
NET

las bases privadas como Board Institue y Craig Venter se necesita una
bsqueda ms especializada

En las 5 bases se tiene ms genomas secuenciados del reino bacteria que
cualquier otro reino