1 Quimica General
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1 Quimica General
AREA DE BIOLOGIA
BIOQUIMICA
QUIMICA GENERAL
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Bioquímica
BIOQUIMICA
Estudios de los compuestos químicos que forman parte de los seres vivos, así como su comportamiento químico y su
participación en los procesos biológicos.
BIOQUÍMICA (Reseña)1
En el primer numero de la revista Zeitschriftfur physiologissche CEIME, en 1877, Hoppe-Seyler utilizo el nombre de
bioquímica con la intención indudable de que bajo el se amparasen todo estudio e interpretación de la biología desde el
punto de vista molecular. Esta fecha puede servir para trazar una gran divisoria en la ciencia y tecnología de las
transformaciones moleculares en el seno de los seres vivos. Cuando aparece, pues, el termino bioquímica, hace ya un siglo
de la época cumbre de Lavoisier y falta un solo año para la muerte de Claude Bernard; corren los años de los trabajos de
proust, Dumas y Von Liebig; y, paralelas en el tiempo transcurren las vidas de bernard, Pasteur Y Darwin.
Si puede confirmarse que la química orgánica y la fisiología nacen con la revolución científica que llevo a cabo Lavoisier;
en la misma época, y en virtud del mismo paradigma creado, se establecen relaciones estrechas entre la combustión, la
respiración animal y la producción de calor. El ultimo tercio de siglo XVIII comienza a examinarse la presencia en los seres
vivos de gran numero de compuestos del carbono. Rouelle investigo sobre la lactosa (1773), el almidón (1770) y la clorofila
(1773). Scheele descubrió los ácidos tartàrico(1770), múcico (1780), láctico (1780), ùrico (1780), oxálico (1776), cítrico
(1784), málico (1785), gàlico (1786), la glicerina (1783) y la caseína (1780).
Fourcroy y Vauquelin obtuvieron el ácido benzoico (1799). Berzelius obtuvo la fibrina (1813), la caseína (1814) y el ácido
cólico (1841). Robiquet aisló la asparagina (1805), la narcotina (1817) y la codeína (1832).
Cuando avanza el siglo XIX, la química orgánica y la fisiología, independientes conocen la química de los alimentos y de
los componentes del cuerpo humano; llevan a cabo la síntesis de numerosos compuestos orgánicos; Pasteur descubre la
asimetría molecular; se comienza a hablar de la digestión haciendo uso de los términos metabolismo, catálisis y enzima.
Pero la química orgánica y la fisiología continúan sujetas a los fenómenos, las leyes y las teorías de la valencia y la
estereoquímica, de un lado; de otro, a la teoría cromosomica de la herencia, al nacimiento de la endocrinología
experimental, a la extensión de las ideas de la fermentación al conocimiento de las bacterias, la asepsia y el origen
microbiológico de muchas de las enfermedades humanas y animales.
Mediado el siglo XIX, vuelve a establecerse la unión de las ramas, durante un siglo aisladas, de la química orgánica y la
fisiología. Y el estudio de los procesos fisiológicos en términos de la química, haciendo uso de las leyes, conceptos y
metodología de la química orgánica, ve nacer una nueva rama de la ciencia, la química fisiológica. Esta química logro, en
efecto, una yuxtaposición de conceptos, pero que enseguida se hizo inservible para asimilar todo lo que la ciencia ofrecía. Y
en la misma medida que la química, en su versión orgánica. Dejo de ser el único soporte de la química fisiológica, la
fenomenologia biológica amplio rápidamente su variedad, así como la posibilidad de sus tratamientos moleculares.
La nueva dimensión que la biología adquiere en el tratamiento del hombre, la necesidad que la biología siente de penetrar en
las situaciones patológicas, los factores sociales y económicos, promotores de un más rápido desarrollo, y, sin duda, la
influencia positivista de la época y su impulso de la observación, la medida y el hecho experimental, fueron factores que
promovieron esta transformación y que han hecho posible en el siglo presente el proceso de asimilación conceptuales que la
bioquímica moderna ha supuesto.
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Ángel Martín Municio. Diccionario Esencial de las Ciencias – Ed. ESPASA. (Real Academia de las Ciencias
Exactas, Físicas y Naturales) Madrid 2001
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Bioquímica
CONCEPTO DE QUIMICA
“La Química es la ciencia que tiene por objeto el estudio de la composición, estructura y propiedades de la materia que
existe en el universo, así como de las transformaciones que ésta experimenta en su estructura interna y de los cambios
energéticos involucrados en tales transformaciones”.
Materia. Es todo aquello que tiene masa o peso, que ocupa un lugar en el espacio y es capas de impresionar nuestros
sentidos. La composición de la materia está determinada por el tipo de elementos que contiene. La estructura de la materia
está determinada por la forma en que están dispuestos los átomos de los elementos que la constituyen. Una molécula es una
entidad compuesta por dos o más átomos que están unidos entre sí.
La materia se puede encontrar en la naturaleza en tres estados físicos: gas, líquido y sólido, los cuales se conocen como
estados de agregación de la materia.
Sustancia. Es una forma de materia que tiene una composición constante o definida y propiedades distintivas. Las
sustancias pueden ser elementos o compuestos. Cada sustancia posee un conjunto único de propiedades que la caracterizan
y que permiten reconocer y distinguir a una sustancia de otras. Las propiedades de la materia se clasifican en propiedades
físicas, químicas, organolépticas, intensivas y extensivas.
Propiedades Fisicas:
Son características que se pueden medir y observar sin modificar la composición o identidad de la sustancia (punto de
fusión, punto de ebullición, densidad, dureza, viscosidad, tensión superficial).
Punto de fusión. El punto de fusión de un sólido (o el punto de congelación de un líquido) es la temperatura a la cual las
fases sólida y líquida coexisten en equilibrio. El punto de fusión normal (o el punto de congelación normal) de una sustancia
es el punto de fusión (o punto de congelación) medio a 1 atm de presión.
Punto ebullición. Es la temperatura a la cual la presión de vapor de un líquido es igual a la presión externa. El punto de
ebullición normal de un líquido es el punto de ebullición cuando la presión externa es de 1 atm.
Densidad. Es la cantidad de masa en una unidad de volumen de la sustancia. Se expresa comúnmente en unidades de gramo
por centímetro cúbico (g/cm3) o en gramo por mililitro (g/mL): 1 mL = 1 cm3.
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Bioquímica
Dureza: Oposición que presentan los cuerpos al rayado, y se mide por la denominada escala de dureza de Mohs.
TA-YE-CA-FLU
APA-FEL-CU
TO-CO-DIA
Solubilidad. Es la cantidad de sustancia que se puede disolver en una cantidad dada de disolvente a una temperatura
específica. Se expresa comúnmente en unidades de gramos por cada 100 mL (g/100 mL) o moles por litro (mol/L). En este
último caso es denominada solubilidad molar. Por ejemplo, a 25 °C, la solubilidad molar del yoduro de plomo (PbI2) en
agua es de 1.2 x 10-3, lo cual significa que a esa temperatura se disuelven 1.2 x 10-3 moles de PbI2 en un litro de agua. La
solubilidad del cloruro de sodio (NaCl) en agua a 0 °C es de 35.7 g por 100 mL: esta es la cantidad máxima de NaCl que se
puede disolver en agua para generar una disolución estable a esta temperatura. El grado en que una sustancia se disuelve en
otra depende además de la temperatura, de la naturaleza tanto del soluto como del disolvente y, en el caso de los gases,
también de la presión.
Presión de vapor. Es la presión que ejercen las moléculas en la fase gaseosa que se generan cuando un líquido se evapora,
medida en equilibrio dinámico de condensación y evaporación (cuando la rapidez del proceso de condensación es igual a la
rapidez del proceso de evaporización). El término correcto es el de equilibrio de presión de vapor. Se expresa generalmente
en atmósferas (atm) o en milímetros de mercurio (mm de Hg.). 1 atm 0 760 mm de Hg. Es una propiedad que depende de la
temperatura a que sea determinada (la presión de vapor de un líquido siempre aumenta con la temperatura). Por ejemplo, la
presión de vapor del agua a 20 °C es de 17.5 mm de Hg y de 760 mm de Hg a 100 °C.
Viscosidad. Es la resistencia a fluir que presenta un líquido. A mayor viscosidad, el líquido fluye más lentamente. La
viscosidad es una propiedad que depende de la temperatura (la viscosidad de un líquido comúnmente disminuye con la
temperatura. La unidad SI para esta propiedad es newton-segundo por metro cuadrado (N s/m2).
Tensión superficial. Es la cantidad de energía requerida para aumentar la superficie de un líquido por unidad de área. Esta
propiedad depende de la temperatura (disminuye con la temperatura) y de las características de las fuerzas intermoleculares
de las sustancias (los líquidos formados por moléculas de fuerzas intermoleculares fuertes poseen tensiones superficiales
altas).
Conductividad Eléctrica y Calórico: Se refiere a los cuerpos buenos y/o malos conductores del calor y la electricidad.
Propiedades químicas:
Son características que describen la forma en que una sustancia puede cambiar o reaccionar para formar otras sustancias
(inflamabilidad).
Propiedades Organolepticas:
Son características que se pueden determinar utilizando los sentidos (color, olor, aspecto).
Propiedades extensivas:
son características en las que el valor medido depende de la cantidad de materia considerada Se refiere a todo tipo de
materia, por lo tanto no permite establecer diferencias entre los diferentes cuerpos o sustancias, a estas propiedades
pertenecen el peso, tamaño, forma, longitud, masa, volumen, temperatura.
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Bioquímica
Longitud. Es una característica que expresa la distancia entre un punto y otro. La unidad SI fundamental es el metro (m).
Masa. Es una medida de la cantidad de materia que está contenida en un objeto y es una propiedad constante. Es un
concepto distinto al de peso. La masa de un objeto se puede determinar empleando una balanza. La unidad SI fundamental
para expresar la masa es el kilogramo (kg)
Peso. Es la fuerza que la masa de un objeto ejerce debido a la gravedad. Es una propiedad variable de la materia pues
depende de la situación en que se encuentre. Por ejemplo, en la superficie de la Luna un objeto pesaría sólo la sexta parte de
lo que pesa en la Tierra, en virtud de que la fuerza de gravedad lunar representa sólo un sexto de la terrestre. Así mismo, en
el espacio un astronauta puede carecer de peso, pero no puede carecer de masa. De hecho, la masa del astronauta en el
espacio es la misma que en la Tierra.
Volumen. Es una característica que expresa el espacio que ocupa un cuerpo. La unidad SI fundamental es el metro cúbico
(m3), pero dado que se trata de un volumen muy grande es común utilizar unidades más pequeñas para la mayor parte de las
aplicaciones de la química, como por ejemplo, el centímetro cúbico (cc ó cm3) = mililitro (mL), el decímetro cúbico (dm3).
Este último se conoce más comúnmente como litro (L).
Temperatura. Es una propiedad que determina la dirección de flujo del calor. El calor siempre fluye espontáneamente de
una sustancia que está a una temperatura más alta hacia una que está a una temperatura más baja. Las escalas de temperatura
que comúnmente se emplean son las escalas Celsius y Kelvin. La escala Celsius se utiliza ampliamente en química y como
escala de temperatura cotidiana. En esta escala se asigna como 0 °C al punto de congelación del agua y 100 °C al punto de
ebullición en el nivel del mar. La escala Kelvin es la escala de temperatura SI, y la unidad SI de temperatura es el kelvin
(K). En este escala la temperatura más baja que puede alcanzarse es .273.15 °C (cero absoluto). La relación entre ambas
escalas es la siguiente: K = °C + 273.15
Calor. Es el flujo de energía de un cuerpo a temperatura más alta hacia uno a temperatura más baja cuando ambos se ponen
en contacto térmico. Es la forma de energía más comúnmente absorbida o liberada en las reacciones químicas. Este calor
liberado o absorbido por el sistema durante un proceso se representa como DH (cambio de entalpía) y se mide en kilo joules
(kJ). Cuando en una reacción se absorbe calor el valor de DH es positivo (proceso endotérmico) y cuando se libera calor el
valor de DH es negativo (proceso exotérmico).
La unidad de calor es la caloría = cantidad de calor equivalente a 4.1840 julios, antes sé definía como la cantidad de calor
requerida para elevar la temperatura de un gramo de agua de 14.5 grados s 15.5 grados centígrados.
Inercia: Tendencia que tienen los cuerpos a permanecer en estado de reposo o en movimiento, es directamente proporcional
a la masa.
Impenetrabilidad: El espacio ocupado por un cuerpo no puede ser ocupado por otro simultáneamente, es decir en el mismo
espacio y tiempo.
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Propiedades intensivas
son características cuya determinación no depende de la cantidad de muestra que se esté examinando (densidad, solubilidad,
punto de fusión, punto de ebullición, viscosidad, presión de vapor, viscosidad, tensión superficial). Son útiles para
identificar a una sustancia.
Maleabilidad: Facilidad que presentan algunos cuerpos para dejarse transformar en laminas
Ductibilidad: Facilidad que presentan algunos cuerpos para dejarse transformar en hilos
Estado Liquido: Presenta volumen determinado y se adaptan a la forma del recipiente que los contiene, la fuerza de
cohesión es igual que la fuerza de repulsión
Estado Gaseoso: Presentan forma y volumen indeterminado, la fuerza de cohesión es menor que la fuerza de repulsión.
Energía Potencial: Es la que un cuerpo posee en virtud de su posición, configuración (estructural), composición (cascada
(agua al caer), martillo al caer) la energía eléctrica es un tipo de energía resultante de la posición de las cargas, resorte
comprimido (configuración)
Energía Radiante: Es una radiación electromagnética que se propaga en forma de ondas a la velocidad de la luz.
Energía Térmica: Es una clase de energía íntimamente relacionada con la temperatura de un cuerpo.
TRANFORMACIONES DE LA MATERIA
Proceso o cambio Físico: Son cambios que sufren ciertas sustancias sin que se altere la naturaleza intima de la materia, es
decir, son transformaciones pasajeras que cesan cuando deja de actuar el fenómeno que causa la alteración, ejm: al calentar
un termómetro la columna de mercurio asciende, pero al retira el cuerpo que produce el calor la columna de mercurio
regresa a su estado inicial; son transformaciones en los que una sustancia varía en su apariencia física pero no en su
composición de la materia, también son ejemplos de procesos físicos los cambios de estado.
Proceso o cambio Químico: Son cambios definitivos que sé producen en la naturaleza intima de una sustancia, que aunque
deje de actuar el fenómeno que causa la alteración la sustancia no regresara a su estado inicial, son transformaciones en las
que una sustancia se convierte en una sustancia distinta químicamente, denominados también como reacciones químicas
Ejm.: la oxidación de los metales.
Las principales diferencias entre los procesos físicos y los químicos son los siguientes:
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Bioquímica
1-/ En los procesos físicos no hay verdaderas reacciones químicas; mientras que en los procesos químicos si se
forman verdaderas reacciones químicas.
2-/ Los procesos físicos son hechos reversibles, mientras que los procesos químicos son hechos irreversibles.
3-/ En los procesos físicos la naturaleza intima de la sustancia no se altera mientras que en los procesos químicos si
se altera.
4-/ En los procesos físicos tenemos como ejemplo los cambios de estado de la materia; mientras que ejemplo de los
procesos químicos son todas las reacciones químicas.
FORMAS DE LA MATERIA
Mezclas: Las mezclas son una combinación de dos o más sustancias en la cual éstas mantienen su identidad química. Las
mezclas tienen composiciones variables y pueden ser homogéneas o heterogéneas. Una mezcla homogénea es aquella cuya
composición, propiedades y aspecto son los mismos en todos los puntos que la forman. Una mezcla heterogénea es aquella
cuya composición, propiedades y aspecto no son los mismos en todos los puntos que la forman, las principales
características de una mezcla son:
B-/ Los componentes de una mezcla no cumplen la ley de proust, es decir sus cantidades son indeterminadas.
C-/ Los componentes de una mezcla generalmente son sustancias heterogéneas es decir sustancias de diferentes
naturalezas.
D-/ Los componentes de una mezcla al unirse generalmente lo hacen sin desprendimiento de calor.
E-/ Los componentes de una mezcla generalmente se separan mediante procesos mecánicos y físicos. Por ejemplo:
filtración, decantación, separación magnética, etc.
Sustancias Puras: Son todo lo contrario a las mezclas, es decir, están constituidas por una sola clase de materia o por
materias afines, tiene una composición constante o definida y propiedades distintivas. Las sustancias pueden ser elementos
o compuestos:
A-/ Elementos: Es una sustancia pura que no puede descomponerse en sustancias más simples. Cada elemento se
compone de un solo tipo de átomo. En la tabla periódica los elementos se encuentran organizados de manera sistemática,
representados mediante símbolos que son combinaciones de letras. Únicamente la primera letra del símbolo de un
elemento es siempre mayúscula.
B-/ Compuestos: Es una entidad constituida por dos o más átomos que están unidos entre sí de forma específica. Los
compuestos pueden estar constituidas por el mismo tipo de elementos (oxígeno, O2; hidrógeno, H2) o bien, por
elementos distintos (agua, H2O; dióxido de carbono, CO2)
.
Los compuestos químicos se agrupan formando las diferentes funciones químicas, siendo las principales: óxidos, bases,
ácidos, sales.
Las diferencias fundamentales entre los elementos y los compuestos son los siguientes.
A-/ La menor partícula que se puede dividir un elemento químico se denomina átomo, la menor partícula en que se
puede dividir un compuesto químico se denomina molécula.
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B-/ Los elementos químicos se representan por medio de símbolos mientras que los compuestos por medio de
formulas.
C-/ Los elementos químicos presentan pesos atómicos, mientras que los compuestos presentan masa o pesos
moleculares.
El peso molecular (PM) de una sustancia es la suma de los pesos atómicos de todos los átomos en una molécula de la
sustancia y se expresa en unidades de masa atómica. Por ejemplo, el peso molecular del agua, H2O, es 18.0 uma.
El peso fórmula (PF) de una sustancia es la suma de los pesos atómicos de todos los átomos en una unidad formular del
compuesto, sea molecular o no. Por ejemplo, el cloruro de sodio, NaCl, tiene un peso fórmula de 58.44 uma. Este
compuesto es iónico, así que estrictamente la expresión “peso molecular de NaCl” no tiene significado. El peso molecular y
el peso fórmula calculados a partir de la fórmula molecular de una sustancia son idénticos.
Un mol (símbolo mol) se define como la cantidad de una sustancia dada que contiene tantas moléculas o unidades
formulares como el número de átomos en exactamente 12 g de carbono- 12. El número de átomos en una muestra de 12 g de
carbono-12, se llama número de Avogadro (NA) y tiene un valor de 6.023 x 1023. Por lo tanto, un mol de moléculas, de
átomos, etcétera, contiene el número de Avogadro. Por ejemplo, una mol de etanol es igual a 6.023 x 1023. moléculas de
etanol.
La masa molar de una sustancia es la masa de una mol de la sustancia. El carbono-12 tiene, por definición, una masa molar
de exactamente 12 g/mol. Para todas las sustancias, la masa molar en gramos por mol es numéricamente igual al peso
fórmula en unidades de masa atómica.
La fórmula empírica (o la fórmula más sencilla) para un compuesto es la fórmula de una sustancia, escrita con los índices
con números enteros más pequeños. Para la mayor parte de las sustancias iónicas, la fórmula empírica es la fórmula del
compuesto, pero con frecuencia éste no es el caso de las sustancias moleculares. Por ejemplo, la fórmula del peróxido de
sodio, un compuesto iónico de Na+ y O22-, es Na2O2. Su fórmula empírica es NaO. Por lo tanto, la fórmula molecular de un
compuesto es un múltiplo de su fórmula empírica.
El reactivo limite es aquel que se encuentra en una proporción menor a la requerida estequiométricamente de acuerdo a la
reacción balanceada, por lo que es consumido completamente cuando se efectúa una reacción hasta ser completa. El
reactivo que no se consume completamente se denomina reactivo en exceso. Una vez que uno de los reactivos se agota, se
detiene la reacción, por lo que las moles de producto siempre son determinadas por las moles presentes del reactivo
limitante.
El rendimiento teórico de una reacción es la cantidad máxima de producto que se puede obtener por una reacción a partir
de cantidades dadas de reactivos y se calcula a partir de la estequiometría basada en el reactivo limitante. El porcentaje de
rendimiento de un producto es el rendimiento real (determinado experimentalmente) expresado como un porcentaje del
rendimiento teórico calculado.
Para el año 400 a. de C. Demócrito y Leucipo propusieron la primera teoría atómica llamada la "Discontinuidad de la
Materia". Esta consistió en que la materia se podía dividir indeterminadamente en partículas cada vez más pequeñas hasta
obtener unas diminutas e indivisibles, a las que Demócrito llamó átomos, las cuales constituyen a la materia. Así había
átomos de oro, de agua, aire, rocas, etc.
Aristóteles suponía que la materia era continua y que estaba formada por una sustancia única llamada materia, así
permanecieron estas ideas por mucho tiempo, prácticamente por más de 2000 años.
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Teoría atómica de John Dalton
John Dalton continuó con la hipótesis acerca de los átomos de Demócrito y Leucipo, y es así como el 21 de octubre de
1803 dio una conferencia en la "Sociedad Literaria y Filosófica de Manchester, Inglaterra" en la que expuso su Teoría
Atómica, así como algunas de sus leyes, pero, no es hasta 1808 en que aparece su obra Un nuevo Sistema de Filosofía
Química en la habló su teoría atómica; a lo que concluyó con la siguiente teoría atómica:
1-.La materia está formada por partículas muy pequeñas llamadas átomos, que son indivisibles y no se pueden destruir.
2-.Los átomos de un mismo elemento son iguales entre sí, tienen su propio peso y cualidades propias. Los átomos de los
diferentes elementos tienen pesos diferentes.
3.- Los átomos permanecen sin división, aún cuando se combinen en las reacciones químicas.
4.- Los átomos, al combinarse para formar compuestos guardan relaciones simples.
5.- Los átomos de elementos diferentes se pueden combinar en proporciones distintas y formar más de un compuesto.
6.-Los compuestos químicos se forman al unirse átomos de dos o más elementos distintos.
La hipótesis de Dalton, tuvo vigencia durante mucho tiempo, la cual manejó que el átomo era indivisible; sin embargo, los
átomos permanecen indivisibles en los fenómenos químicos simples.
El modelo atómico de Thomson (1856-1940) postula que el átomo se compone de una esfera cargada positivamente en la
que reside la mayor parte de la masa del átomo y sobre la cual se incrustan los electrones.
Según el modelo atómico de Rutherford (1831-1937), el átomo está formado por una esfera en la que se concentra casi toda
la masa del sistema (protones y neutrones) y en torno a la cual giran unas partículas (electrones) de la misma manera que lo
hacen los planetas en torno al Sol.
Los protones del núcleo se encuentran cargados positivamente y los electrones negativamente.
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En el centro del mismo se ubica el núcleo, pequeña región del átomo donde residen la casi totalidad de su masa y la
carga positiva. El número de cargas positivas del núcleo (protones) coincide con el número atómico del elemento.
En torno al núcleo giran los electrones (en número igual al de protones y al número atómico), portadores de la
carga negativa, describiendo órbitas circulares.
Los electrones mientras giran en su órbita no emiten radiaciones. Cuando saltan a una órbita más cercana al núcleo
emiten radiación energética, y cuando pasan a una órbita superior la absorben.
Hacia 1920, como consecuencia del estudio de los espectros de elementos con gran número de electrones, se dudó de la
bondad de la teoría de Bohr.
Sommerfeld (1868-1951) descubrió que la teoría de Bohr era incompleta, pues las órbitas electrónicas también podían ser
elípticas. Modificó los postulados de éste, afirmando que las órbitas descritas por los electrones dentro de un nivel
energético definido podían ser circulares o elípticas, lo que supone diferencias en los estados energéticos de los electrones
(subniveles energéticos).
Posteriormente se dedujo que el movimiento de los electrones no se desarrolla en órbitas bien definidas, sino que describe
un movimiento complejo.
El movimiento del electrón describe órbitas complejas, con lo cual existe la probabilidad de encontrarlo en una posición
determinada. Las zonas donde «probablemente» se encuentra el electrón reciben el nombre de orbitales.
Átomo. Es la unidad básica de un elemento que puede combinarse químicamente; son las partículas más pequeñas de un
elemento que conservan la identidad química del elemento. Está constituido fundamentalmente por protones, neutrones y
electrones. Por ejemplo, el átomo de nitrógeno neutro (N) está formado por siete protones, siete neutrones y siete electrones.
A-/ NUCLEO
B-/ PERIFERIA O CORTEZA
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Bioquímica
El núcleo es la parte mas interna, encargada de originar el peso atómico de todo elemento y en el se encuentran unas
partículas de carga eléctrica positiva denominadas protones y unas partículas de carga eléctrica neutra denominadas
neutrones.
La periferia la constituyen unos círculos concéntricos que giran alrededor del núcleo y que se denominan niveles u orbitales
de energía, en los cuales se encuentran unas partículas de carga eléctrica negativa, denominadas electrones.
Se dice que todo átomo es eléctricamente neutro por que la cantidad de protones es igual a la cantidad de electrones.
Una vez que fueron descubiertos los niveles del átomo y los niveles de energía estos fueron representados por las letras: k,
l, m, n, o, p, q. Y cada uno de ellos presenta una población electrónica máxima dada por la formula 2n2 lo cual significa los
números arábigos de 1 al 7 elevados al cuadrado y multiplicados por dos.
Pero se observa que a partir del nivel o existe una tendencia regresiva por parte de algunos elementos a ocupar la población
electrónica del anterior o anteriores niveles de energía y que si se suman los 50 electrones del nivel de energía O hasta allí
sé llevarían 110 electrones y un elemento químico que más electrones tiene es el lawrencio únicamente con 103.
En medio de los niveles de energía se encuentran los subniveles, los cuales también se representan por letras y presentan
una población electrónica máxima la cual es la siguiente: s-2 / p-6 / d-10 / f-14.
Pero estos subniveles presentan un orden de energía predeterminado y fijo de acuerdo a su proximidad al núcleo, ya que los
que se encuentran mas cerca de él liberan mas energía que los que se encuentran mas retirados, un nivel de energía mínimo
presenta un subnivel que es s-2 y máximo los cuatro subniveles,
Escribir la configuración electrónica de un átomo consiste en indicar cómo se distribuyen sus electrones entre los diferentes
orbitales en las capas principales y las subcapas. Muchas de las propiedades físicas y químicas de los elementos pueden
relacionarse con las configuraciones electrónicas.
Esta distribución se realiza apoyándonos en tres reglas: energía de los orbitales, principio de exclusión de Pauli y regla de
Hund
“En un átomo no puede haber dos electrones con los cuatro números cuánticos iguales”
Regla de Hund
En un mismo subnivel, los electrones no se aparean hasta que no haya un electrón en cada orbital.
Para escribir las configuraciones electrónicas se utiliza el principio Aufbau. Aufbau es una palabra alemana que significa
"construcción progresiva"; se utiliza este método para asignar las configuraciones electrónicas a los elementos por orden de
su número atómico creciente. El número atómico nos indica la cantidad de electrones y de protones que tiene un elemento.
La estructura electrónica o distribución de electrones en niveles indica cómo se distribuyen los electrones en los distintos
niveles de energía de un átomo.
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Bioquímica
Los electrones ocupan los orbitales de forma que se minimice la energía del átomo. El orden exacto de llenado de los
orbitales se estableció experimentalmente, principalmente mediante estudios espectroscópicos y magnéticos, y es el orden
que debemos seguir al asignar las configuraciones electrónicas a los elementos. El orden de llenado de orbitales es:
1s22s22p63s23p64s23d104p65s24d105p66s24f145d106p67s25f146d107p6 6f147d107f14
donde el coeficiente nos indica el nivel de energía, la letra el subnivel y el exponente la población electrónica del subnivel;
se debe tener en cuenta que al sumar los exponentes de un mismo coeficiente nos origina la población electrónica del nivel.
El método del Kernel, es una abreviación de la configuración electrónica de un gas noble. Los gases nobles son: helio (He),
neón (Ne), argón (Ar), kriptón (Kr), xenón (Xe) y radón (Rn).
Veamos por ejemplo como sería la configuración electrónica para Z=11-18, es decir, desde Na hasta el Ar:
Cada uno de estos elementos tiene las subcapas 1s, 2s y 2p llenas. Como la configuración 1s22s22p6 corresponde a la del
neón, la denominamos "configuración interna del neón" y la representamos con el símbolo químico del neón entre
corchetes, es decir, [Ne]. Los electrones que se sitúan en la capa electrónica del número cuántico principal más alto, los más
exteriores, se denominan electrones de valencia. La configuración electrónica del Na se escribe en la forma denominada
"configuración electrónica abreviada interna del gas noble" de la siguiente manera: Na: [Ne] 3s1 (consta de [Ne] para la
configuración interna del gas noble y 3s1 para la configuración del electrón de valencia.
Mg: [Ne]3s2
Al: [Ne]3s23p1
Si: [Ne]3s23p2
P: [Ne]3s23p3
S: [Ne]3s23p4
Cl: [Ne]3s23p5
Ar: [Ne]3s23p6
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Bioquímica
Molécula. Es una entidad constituida por dos o más átomos que están unidos entre sí de forma específica. Las moléculas
pueden estar constituidas por el mismo tipo de elementos (oxígeno, O2; hidrógeno, H2) o bien, por elementos distintos
(agua, H2O; dióxido de carbono, CO2), en cuyo caso se denominan compuestos. Los compuestos son sustancias puras.
Numero Atómico (Z): Es la cantidad de electrones o protones que tiene todo elemento químico y que en la tabla periódica
generalmente se encuentra en la parte superior derecha o izquierda de los diferentes símbolos.
Numero Masico (A): Es él numero entero mas próximo al peso atómico de todo elemento químico, el cual esta dado por la
suma de protones y neutrones que se encuentra en todo núcleo, para lo cual si el primer decimal del peso atómico es igual o
superior a cinco se aproxima al numero entero siguiente, pero si el primer decimal es igual o menor de cuatro la cantidad se
desprecia.
Grupo: Es la cantidad de electrones que tiene todo elemento químico en su ultimo nivel de energía, denominados electrones
de valencia.
Los grupos en la tabla periódica de los elementos químicos generalmente se encuentran en el extremo superior,
representados por números romanos y algunos de ellos reciben nombres especiales.
Periodo: Es la cantidad de niveles de energía que presenta todo elemento químico o el mayor coeficiente anotado en la
notación espectral de un elemento químico; en la tabla periódica los periodos se encuentran en la parte lateral, generalmente
representados en números arábigos del 1 al 7.
Entre las principales características de la tabla periódica merecen destacarse los siguientes hechos:
A-/ Los elementos químicos han sido clasificados en orden ascendente a su peso atómico, sin embargo se presentan las
siguientes anomalías: Ar Y K / Te Y I/ Ca – Ni
B-/ En el extremo superior de la tabla y generalmente en números romanos con subdivisiones de A y B, aparecen 8 grupos
los cuales se encuentran de acuerdo a la población electrónica del ultimo nivel de energía, es decir, los denominados
electrones de valencia.
Algunos grupos de la tabla periódica reciben nombres especiales entre los que se tienen:
El grupo IA lo constituye la familia de los alcalinos y a él pertenecen: Li, Na, K, Rb, Cs, Fr. En este primer grupo se
encuentra él hidrogeno H. Pero no se considera de la familia de los alcalinos, su ubicación dentro del grupo es por poseer un
solo electrón en su único nivel de energía.
El segundo grupo IIA lo constituye la familia de los “alcalino - térreos” y a él pertenecen Be, Mg, Ca, Sr, Ba, Ra.
Los del sexto grupo VIA lo constituye la familia de los “anfígenos” (terminología en desuso) y a él pertenecen O, S, Se,
Te, Po.
Los del séptimo grupo VIIA lo constituye la familia de los halógenos y a él pertenecen F, Cl, Br, I, At.
Los del octavo grupo VIIIA que en algunas tablas aparece con grupo 0 lo constituyen He, En, Ar, Kr, Xe, Rn, y se les
denominan gases raros, gases nobles, gases inertes, gases incombinables, o, gases nulivalentes.
En la parte lateral de la tabla generalmente en números arábigos del 1 al 7 aparecen los periodos originados por los niveles
de energía que presenta todo elemento químico; los tres primeros periodos sé denominan cortos y a él pertenecen los
niveles k, l y m, los restantes lo constituyen los periodos largos y a él pertenecen los niveles N, O, P Y Q.
En la mitad de la tabla se encuentran los denominados elementos de transición, constituyendo los llamados subgrupos y se
caracterizan por presentar una población electrónica incompleta en su penúltimo nivel de energía, ejemplo: Mn, Fe, Co.
13
Bioquímica
Los elementos de carácter metálico generalmente se encuentran en los tres primeros grupos, mientras que en los no metales
se encuentran entre los grupos VA Y VIIA
La serie de los lantánidos y actínidos ha sido forzada dentro de la tabla, por eso generalmente se encuentra en la parte final
de la tabla periódica.
Electronegatividad
Linus Pauling definió la electronegatividad como La capacidad que tienen los átomos de atraer y retener los electrones que
participan en un enlace químico. La electronegatividad se ha establecido en escala de 0 hasta 4. Pauling asignó de manera
arbitraria un valor de 4 al flúor que es el elemento con más capacidad para atraer electrones. En química los valores de
electronegatividad de los elementos se determinan midiendo las polaridades de los enlaces entre diversos átomos. La
polaridad del enlace depende de la diferencia entre los valores de electronegatividad de los átomos que lo forman.
La electronegatividad empieza por los no metálicos de abajo hacia arriba, por lo tanto el elemento químico más
electronegativo es el flúor y en los periodos la electronegatividad va de derecha a izquierda por lo tanto el segundo elemento
más electronegativo es él oxigeno.
ENLACE QUIMICO
Un concepto básico en química es el estudio de cómo los átomos forman compuestos. La mayoría de los elementos que
conocemos existen en la naturaleza formando agrupaciones de átomos iguales o de distintos tipos, enlazados entre sí.
El enlace químico son las fuerzas que mantienen unidos los átomos.
Los elementos químicos a excepción del grupo VIIIA tienen tendencia a tener 8 electrones en su último nivel de energía,
tendencia que recibe el nombre de la ley del octeto.
A inicios del siglo XX, en 1916, de manera independiente, los científicos Walter Kossel y Gilbert Lewis concluyeron que la
tendencia que poseen los átomos de lograr estructuras similares a las del gas noble más cercano explica la formación de los
enlaces químicos. Esta conclusión es mundialmente conocida como la Regla del Octeto y se enuncia de la siguiente manera:
“Cuando se forma un enlace químico los átomos reciben, ceden o comparten electrones de tal forma que la capa más externa
de cada átomo contenga ocho electrones, y así adquiere la estructura electrónica del gas noble más cercano en el sistema
periódico”.
No obstante, hay muchas excepciones a esta regla y hasta se han logrado sintetizar algunos compuestos de los gases nobles.
Cada átomo deberá cumplir con la regla del octeto. Excepto el hidrógeno que deberá tener solo 2 electrones para cumplir
con la regla del dueto.
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Bioquímica
Por lo tanto los elementos de carácter metálico tienen la tendencia de ceder electrones y los no metálicos de ganar los
electrones en él ultimo nivel de energía, es decir aquellos que originan el grupo se denominan electrones de valencia,
siendo valencia la capacidad de combinación que tiene todo elemento químico y el requisito fundamental para que exista un
compuesto químico o una formula química es que haya equilibrio de valencias.
Tipos de enlace
Sabemos que la manera en que los átomos se enlazan ejercen un efecto profundo sobre las propiedades físicas y químicas de
las sustancias. ¿Qué es un enlace químico? Aunque esta pregunta se puede responder de diversas formas, el enlace se define
como la fuerza que mantiene juntos a grupos de dos o más átomos y hace que funcionen como unidad. Por ejemplo en el
agua la unidad fundamental es la molécula H-O-H cuyos átomos se mantienen juntos por dos enlaces O-H. Se obtiene
información acerca de la fuerza del enlace midiendo la energía necesaria para romperlo, o sea la energía de enlace.
Veremos cómo los átomos interaccionan entre sí de diversas formas para formar agregados y se considerarán ejemplos
específicos para ilustrar los diversos tipos de enlace. Existen tres tipos importantes de enlaces que se forman entre los
átomos de un compuesto: iónico (o electrovalente), covalente (polar, no polar y el coordinado) y el enlace metálico.
El héroe, el Sr. Cloro arrebata a la Srta. Electrón de manos del Un átomo de Sodio dona un electrón a un átomo de
villano, Sr. Sodio. Cloro para formar los iones sodio y cloro.
En experiencias sencillas hemos podido ver que al disolver en agua cloruro de sodio sólido, la disolución resultante conduce
la electricidad; esto indica que el cloruro de sodio está compuesto por iones Na+ y Cl-. Así cuando el sodio y el cloro
reaccionan para formar cloruro de sodio, los átomos de sodio transfieren electrones a los átomos de cloro para formar los
iones Na+ y Cl- que se agregan a continuación para formar cloruro de sodio sólido. Esta sustancia sólida resultante es dura;
tiene punto de fusión de aproximadamente 800°C. La gran fuerza de enlace en el cloruro de sodio se debe a las atracciones
entre iones de carga opuesta que se encuentran muy cercanos entre sí. Este es un ejemplo de enlace iónico.
Cuando un átomo que pierde electrones con relativa facilidad reacciona con otro que tiene alta afinidad electrónica se
forman sustancias iónicas; en otras palabras la formación de un compuesto iónico se debe a la reacción entre un metal y un
no metal.
15
Bioquímica
El enlace iónico se forma cuando un átomo que pierde electrones relativamente fácil (metal) reacciona con otro que tiene
una gran tendencia a ganar electrones (no metal).
Los compuestos unidos por enlaces iónicos forman redes cristalinas de iones, que denominamos cristal. La red cristalina es
una estructura gigante que contiene un número indefinido de iones (las cargas positivas son iguales, en cantidad, a las
negativas), de manera que el conjunto sea eléctricamente neutro.
En la figura anterior se puede ver la estructura del cloruro de sodio. En la forma (A) se indican las posiciones (centros) de
los iones. En la forma (B) se representan los iones como esferas empacadas. Los iones esféricos están empacados de manera
que las atracciones iónicas se maximicen.
Es característico de los compuestos inorgánicos y se realiza fácilmente entre los elementos del primer y séptimo grupo,
segundo y sexto grupo, tercero y quinto grupo y también en forma intercalada.
Este se caracteriza por la formación de iones. siendo un Ion un átomo o grupo de átomos cargados eléctricamente, cuando la
carga es electronegativa recibe el nombre de anión y cuando es electropositiva recibe el nombre de catiòn ejemplos: NaCl /
MgF2
El enlace covalente
El modelo de enlace entre iones no se puede utilizar para explicar la unión entre cualquier pareja de átomos. Si dos átomos
son iguales, no existe ninguna razón que justifique que uno de estos átomos se transforme en ión. Para justificar estas
situaciones se utiliza otro modelo de enlace. Cuando los átomos que forman un enlace comparten sus electrones con la
finalidad de cumplir con la regla de los ocho, se forma un enlace. El tipo de enlace que se observa en la molécula de
hidrógeno y en otras moléculas en que los electrones son compartidos por los dos núcleos se llama enlace covalente. En la
molécula de H2 los electrones residen principalmente en el espacio entre los núcleos en donde son atraídos de manera
simultánea por ambos protones. El aumento de fuerzas de atracción en esta zona provoca la formación de la molécula de H2
a partir de dos átomos de hidrógeno separados. La formación de un enlace entre los átomos de hidrógeno implica que la
molécula H2 es más estable por determinada cantidad de energía, que dos átomos separados (energía de enlace).
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Bioquímica
Cuando dos átomos idénticos se acercan los dos electrones son atraídos de manera simultánea por ambos núcleos. Así se
forma el enlace.
Es característico de la química orgánica o química del carbono, por lo tanto cuando se comparte un par de electrones es
decir dos electrones el enlace se denomina simple o sencillo, cuando sé comparten dos pares es decir cuatro electrones el
enlace se denomina doble y cuando se comparten tres pares el enlace se denomina triple.
El enlace covalente en los compuestos inorgánicos es característico de los elementos químicos que se encuentran en estado
gaseoso (hidrogeno, oxigeno, nitrógeno, cloro, etc.). H2 sencillo, O2 doble, N2 triple
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Bioquímica
Enlace covalente múltiple
El hidrógeno, oxígeno y nitrógeno existen en su estado libre como moléculas diatómicas.
el oxígeno es un elemento que se encuentra en la sexta columna del sistema periódico por lo que tiene seis electrones de
valencia y le faltan dos para completar el octeto.
La formación de la molécula de O2, se puede explicar así por la compartición de dos electrones de valencia aportados por
cada átomo formándose un enlace covalente doble entre los átomos de oxígeno
El donador será siempre el elemento menos electronegativo, tal como se muestra en el ejemplo entre el oxígeno y el azufre,
que puede dar lugar a las moléculas correspondientes a distintos óxidos de azufre. Este enlace una vez formado no se
diferencia para nada del enlace covalente normal. Sin embargo debido a cómo se origina se le puede denominar enlace
covalente dativo o coordinado. Conviene tener en cuenta que no siempre las moléculas que teóricamente se podrían formar
utilizando este tipo de enlace, existen en la realidad, ya que en ello intervienen también otros factores que aquí no hemos
tenido en cuenta, como por ejemplo, el tamaño de los átomos que van a enlazarse y la propia geometría o forma de las
moléculas.
Enlace metálico
Por último estudiaremos el enlace metálico, su importancia la podemos ver en el hecho de que las 3/4 partes de elementos
del sistema periódico son metales. El papel que estas sustancias han tenido en el desarrollo de la humanidad es tan
importante que incluso se distingue entre la edad de piedra, la edad del bronce y la del hierro. De los 90 elementos que se
presentan en la naturaleza algunos metales como el sodio y el magnesio, pueden extraerse de los océanos donde se
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Bioquímica
encuentran disueltos. Los demás metales se suelen obtener a partir de depósitos minerales que se hallan encima o debajo de
la superficie terrestre. Algunos metales son tan poco reactivos que es posible encontrarlos directamente en forma elemental,
este es el caso del oro, la plata y el platino. Otros se encuentran formando parte de distintos compuestos químicos. En
general presentan propiedades muy peculiares que los han diferenciado desde hace siglos de las restantes sustancias, tales
como: ser excelentes conductores del calor y la electricidad en estado sólido, ser fácilmente deformables (lo que permite
trabajarlos y fabricar con ellos objetos de distintas formas). Por otra parte suelen presentarse como sólidos de dureza
variable, con muy diversos puntos de fusión y ebullición (el galio, por ejemplo, funde a 2978° mientras que otro metal, el
tantalio, lo hace a casi 3000°).
A partir del siglo XVIII el desarrollo de la máquina de vapor y de los motores de explosión, suponen un enorme desarrollo
de la industria siderúrgica, al tener que fabricar vías de ferrocarril, puentes, trenes, automóviles, barcos, monumentos, etc.
Otra propiedad general de los metales, como es su capacidad para conducir la corriente en estado sólido, permitió más tarde
transportar energía eléctrica de unos lugares a otros utilizando largos cables de cobre. Sin ello no hubiera sido posible la
electrificación de ciudades y pueblos. Otros metales muy importantes son los llamados metales preciosos como la plata y el
oro, usados desde la antigüedad en la fabricación de joyas y de monedas.
Tampoco podemos olvidar la utilización cada vez mayor de ciertos metales que tienen propiedades muy específicas, como
los ejemplos que, en orden aleatorio, se citan a continuación: El aluminio en la construcción de diversos vehículos y en la
industria de la construcción en general, por su baja densidad y resistencia a la corrosión. El calcio es un metal que forma
parte de los huesos y dientes. La luz emitida por algunos metales, como el sodio y el mercurio, en estado de vapor e
incandescentes se utiliza en iluminación de casa y ciudades. Metales como el cinc, el cadmio y el mercurio, se utilizan en la
fabricación de pilas eléctricas. Uno de los usos del plomo, es como barrera frente a radiaciones (así las personas que
trabajan con aparatos de rayos X se protegen con delantales y guantes de plomo), etc.
Desde el punto de vista electrónico los átomos de los metales se caracterizan por tener pocos electrones de valencia.
Además dichos electrones tienen mucha facilidad para moverse en el nivel de energía en el que se encuentran (nivel más
externo) lo cual podemos interpretar (en una primera aproximación) como una consecuencia de que éste se encuentre tan
vacío.
Si tomamos como ejemplo el átomo de sodio, podemos plantearnos el problema de cómo explicar la existencia de un cristal
de sodio metálico. Si intentamos aplicar el concepto de enlace covalente desarrollado en el punto anterior, nos encontramos
con una dificultad: cada átomo de sodio, en su nivel de energía más externo, sólo tiene un electrón por lo que le faltarían 7
más para completar su octeto.
Existen muchos metales para los que la resistencia al paso de la corriente es prácticamente nula por debajo de una
temperatura determinada (temperatura crítica). Este fenómeno se llama superconductividad y fue descubierto en 1911 por el
físico holandés H. Kamerling Onnes. Así, por ejemplo, la temperatura crítica del mercurio es de -268.8°C. De hecho se han
observado corrientes eléctricas en anillos metálicos superconductores que se han mantenido durante años sin pérdidas
aparentes. Naturalmente es preciso gastar energía en mantener el anillo a la temperatura adecuada. En la actualidad se está
investigando intensamente en la obtención de materiales que presenten superconductividad a temperaturas más altas. Una de
las líneas de investigación es trabajar con unos nuevos materiales que tienen óxido de cobre en su composición (cupratos).
De momento el récord se obtuvo en 1993 con una temperatura crítica de -138°C
Si se consiguiera fabricar materiales que presentaran el fenómeno de la superconductividad a temperatura ambiente ocurriría
una verdadera revolución ya que se podría transportar la corriente eléctrica sin sufrir apenas ninguna pérdida de energía, las
máquinas eléctricas trabajarían más rápido y sin calentarse con un consumo de energía mucho menor (casi el 15 % de la
factura de electricidad proviene de pérdidas debidas a la resistencia eléctrica), la contaminación atmosférica disminuiría, se
podrían crear campos magnéticos muy potentes.
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Bioquímica
(Comparación entre el comportamiento de un sólido metálico y otro iónico cuando se someten a una fuerza)
Análogamente el hecho de que los metales sean mucho mejor conductores del calor que materiales como la madera o el
corcho blanco, se puede explicar también por la facilidad con que en los primeros se pueden mover los electrones de
valencia y pueden vibrar los restos atómicos positivos. Todos hemos notado alguna vez lo bien que un metal transmite el
calor cuando, por ejemplo, tocamos un objeto metálico que ha estado expuesto un tiempo al sol. La sensación es muy
distinta que si tocamos un objeto de madera (igualmente expuesto) el cual nos parece que está a menor temperatura porque
transmite mucho peor el calor a nuestra piel. Es por eso que los metales son muy malos aislantes térmicos.
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Bioquímica
FUERZAS INTERMOLECULARES
En general, los medios biológicos son disoluciones acuosas muy complejas: sales, azúcares, aminoácidos, proteínas, ácidos
nucleicos etc. Obviamente, las posibles interacciones entre las diferentes moléculas revisten especial importancia en
bioquímica. Son precisamente estas interacciones las que definen la dinámica de los procesos vitales y son el objeto de
estudio de la bioquímica.
FUERZAS DE POLARIDAD
Una molécula es dipolar cuando sus cargas positivas y negativas no tienen el mismo centro. Este desplazamiento de los
centros de cargas hace que existan atracciones electrostáticas entre las diferentes moléculas. Esta distribución asimétrica de
los electrones es la responsable de la formación de un dipolo con exceso de carga negativa del lado del Cl, y exceso de carga
positiva del lado del H. (Figuras inferiores).
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Bioquímica
Los enlaces serán tanto más polares cuanto mayor sea la diferencia de electronegatividad entre los átomos enlazados. Así,
en el fluoruro de hidrógeno, por ejemplo, el F es más electronegativo que el H porque su núcleo, con 9 cargas positivas,
atrae a los e- compartidos con el H con más fuerza que el núcleo del H, con una sóla carga positiva (Figura de la izquierda).
Por lo tanto, los e- compartidos por covalencia estarán más próximos al F que al H.
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Bioquímica
FUERZAS ELECTROSTÁTICAS
Las interacciones electrostáticas se establecen entre grupos cargados total o parcialmente:
La fuerza de atracción disminuye rápidamente a medida que aumenta la distancia entre las cargas. Se establecen fuerzas
electrostáticas entre:
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Bioquímica
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Bioquímica
INTERACCIONES HIDROFÓBICAS
Las moléculas hidrofóbicas pueden asociarse con exclusión del agua y formar agregados supramoleculares. Es consecuencia
del efecto hidrofóbico, según el cual por razones termodinámicas las moléculas hidrofóbicas se asocian para minimizar el
número de moléculas de agua que puedan estar en contacto con ellas.
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Bioquímica
las que se establecen entre los fosfolípidos que forman las membranas celulares (forman bicapas)
las que se establecen en el interior de una micela durante la digestión de los lípidos
las que hacen que los aminoácidos hidrofóbicos se apiñen en el interior de las proteínas globulares
Apiñamiento de amioácidos
La membrana celular es una Micela formada por moléculas
apolares (azul) en el interior
bicapa lipídica anfipáticas
de una proteína globular
Estas fuerzas son mayores al aumentar el tamaño y la asimetría de las moléculas. Son mínimas en los gases nobles (He, Ne),
algo mayores para los gases diatómicos (H2, N2, O2) y mayores aún para los poliatómicos (O3, CO2)
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Bioquímica
PUENTES DE HIDRÓGENO
Cuando un átomo de hidrógeno está unido covalentemente a un elemento muy electronegativo y de pequeño tamaño (F, O,
N) el enlace formado es polar y el átomo de hidrógeno es un centro de cargas positivas.
Si este hidrógeno está próximo a otro átomo electronegativo de pequeño tamaño (F, O, N), se puede establecer una unión
electrostática que aproximará a los dos átomos negativos mediante el átomo de hidrógeno. Este enlace recibe el nombre de
puente de hidrógeno.
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Bioquímica
Para que los elementos puedan establecer enlaces por puentes de hidrógeno es necesario que reúnan dos condiciones:
Es un enlace débil. La fuerza de este enlace es menor que la de un enlace covalente o un enlace iónico. Su valor oscila entre
2 y 10 Kcal/mol. Sin embargo, como son muy abundantes, su contribución a la cohesión entre biomoléculas es grande.
La distancia entre los átomos electronegativos unidos mediante un puente de hidrógeno suele ser de unos 3 Å. El hidrógeno
se sitúa a 1Å del átomo al que está covalentemente unido y a 2 Å del que cede sus e- no apareados (Figura de la derecha).
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Bioquímica
condiciona en gran medida la estructura espacial de las proteínas y de los ácidos nucleicos.
está presente en gran parte de las interacciones que tienen lugar entre distintos tipos de biomoléculas en multitud de
procesos fundamentales para los seres vivos
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Bioquímica
FUNCIONES QUIMICAS
Se conoce como función química a un grupo de compuestos con propiedades y características comunes.
GRUPO FUNCIONAL
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Bioquímica
HIDROCARBUROS Y RADICALES
Los hidrocarburos son compuestos binarios de carbono e hidrógeno. Son sustancias muy apolares, y por lo tanto no son
miscibles con el agua y sí con disolventes orgánicos (cloroformo, éter). Son especialmente interesantes porque todos los
demás compuestos orgánicos se estructuran a partir de ellos. En función de su cadena carbonada, los hidrocarburos pueden
ser de cadena abierta (alifáticos) o cíclicos. Entre los abiertos, la cadena puede ser lineal o ramificada. Los cíclicos pueden
ser alicíclicos o aromáticos (si contienen anillos de benceno).
la primera alude al número de carbonos de la molécula. El número de carbonos viene indicado por distintos
prefijos (Figura de la derecha)
la segunda parte indica el tipo de enlaces presentes en la cadena carbonada: Si todos son sencillos se indica por -an-
; un doble enlace se indica por -en- y un triple enlace se indica por -in-. Si hay más de un doble o triple enlace, se
colocan los prefijos di, tri, tetra, etc.
la tercera parte del nombre hace referencia al carácter hidrocarburo del compuesto, y se indica por la terminación -o.
Al sustituir un hidrógeno de un hidrocarburo por una valencia libre se obtiene un radical. Los radicales se nombran como el
hidrocarburo de origen, sustituyendo la terminación -o por la terminación -il o -ilo. Si el hidrocarburo es saturado se omite
la partícula -an- (Figura de la izquierda).
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Bioquímica
Los hidrocarburos alicíclicos contienen una cadena carbonada cerrada (Figura 14). Los hidrocarburos alicíclicos y sus
radicales se nombran como los abiertos, anteponiendo el prefijo ciclo.
Los hidrocarburos aromáticos contienen al menos un anillo bencénico, con tres dobles enlaces conjugados estabilizados por
resonancia. La mayor parte de los hidrocarburos aromáticos y sus radicales tienen nombres consagrados por el uso.
ALCOHOLES - ÉTERES
Los alcoholes son compuestos ternarios de C, H y O. Pueden considerarse derivados de los hidrocarburos por sustitución de
un átomo de H por un hidroxilo (-OH). Al contener en su molécula un radical alquilo y un grupo hidroxilo tienen
propiedades físicas intermedias entre los hidrocarburos y el agua. Su carácter apolar aumenta con la longitud de la cadena
carbonada, mientras que su carácter polar o hidrofílico aumenta con el número de hidroxilos en la molécula.
Se nombran como los hidrocarburos, cambiando el sufijo -o por -ol. Si hay más de un grupo hidroxilo en la misma
molécula, se antepone el prefijo di, tri, tetra..., y se indica mediante un número a qué carbono está unido cada grupo -OH.
Los alcoholes pueden ser primarios, secundarios o terciarios según la naturaleza del carbono que sustenta la función. Por
condensación de dos funciones alcohol con pérdida de una molécula de agua se obtiene la función éter.
ALDEHÍDOS Y CETONAS
Los aldehídos y las cetonas son funciones en segundo grado de oxidación. Se consideran derivados de un hidrocarburo por
sustitución de dos átomos de hidrógeno en un mismo carbono por uno de oxígeno, dando lugar a un grupo oxo (=O). Si la
sustitución tiene lugar en un carbono primario, el compuesto resultante es un aldehído, y se nombra con la terminación -al.
Si la sustitución tiene lugar en un carbono secundario, se trata de una cetona, y se nombra con el sufijo -ona.
El grupo carbonilo (>C=O), común a aldehídos y cetonas, confiere polaridad a la moléculas, aunque en menor cuantía que
el grupo hidroxilo. Los aldehídos y cetonas pueden, por captación de un átomo de hidrógeno de un carbono contiguo, dar
lugar a una reacción intramolecular con formación de un doble enlace y una función hidroxilo, es decir, un enol. Este
proceso es fácilmente reversible y se conoce con el nombre de tautomería cetoenólica.
Una de las reacciones químicas más importantes del grupo carbonilo es la adición de una molécula de alcohol para dar
hemiacetales (hemicetales si son cetonas). En los monosacáridos se pueden formar hemiacetales o hemicetales internos que
dan lugar a la forma cerrada de la molécula. Éstos, a su vez, pueden condensar con otra molécula de alcohol, con pérdida de
una molécula de agua, para dar lugar a acetales o a cetales. Es lo que ocurre en el caso de los glicósidos.
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Bioquímica
hemiacetal acetal
hemicetal cetal
ÁCIDOS CARBOXÍLICOS
Los ácidos carboxílicos son funciones con grado de oxidación tres, es decir, en un mismo átomo de carbono se insertan un
grupo oxo (=O) y un grupo hidroxilo (-OH), formando un grupo carboxilo. Se nombran sistemáticamente sustituyendo la
terminación -o del hidrocarburo de procedencia por el sufijo -oico, pero la mayoría posee nombres vulgares consagrados por
el uso. El grupo carboxilo es el responsable de la polaridad de la molécula y de la posibilidad de establecer enlaces de
hidrógeno. El hidrógeno del hidroxilo puede disociarse y el compuesto se comporta como un ácido. Esta disociación se ve
favorecida por la resonancia del ión carboxilato, ya que el doble enlace se deslocaliza y la carga negativa se distribuye entre
los dos átomos de oxígeno.
En la misma molécula pueden existir varios grupos carboxilo. El número de estos grupos se indica con los prefijos di, tri,
tetra, etc. Los ácidos monocarboxílicos de cadena larga se llaman también ácidos grasos.
Los ácidos carboxílicos pueden reaccionar con álcalis para dar lugar a sales (jabones). Asímismo, cuando reaccionan con
alcoholes dan lugar a ésteres. Cuando el enlace éster se produce dentro de la misma molécula se origina una función lactona.
Dos grupos carboxilo o un grupo carboxilo y un ácido inorgánico pueden condensar (con pérdida de agua) para originar un
anhídrido.
FUNCIONES NITROGENADAS
Las aminas se originan cuando se sustituyen uno o más hidrógenos del amoníaco (NH3) por radicales alquilo. Según el
número de hidrógenos sustituídos se distinguen aminas primarias, secundarias o terciarias. El grupo amino confiere a la
molécula un carácter polar algo más atenuado que el grupo hidroxilo.
El grupo amino puede reaccionar con un ácido carboxílico, con pérdida de una molécula de agua, para formar una amida.
Uno de los enlaces más importantes en Biología es el enlace peptídico, que es un enlace amida formado al reaccionar el
grupo carboxilo terminal de un aminoácido con el grupo amino terminal de otro aminoácido. Cuando la amida se forma
dentro de una misma molécula se llama lactama.
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Bioquímica
FUNCIONES AZUFRADAS
Los tioles son semejantes a alcoholes, pero en lugar de oxígeno contienen azufre. Cuando el grupo -SH es la función
principal, la molécula se nombra con la terminación -tiol; cuando actúa como sustituyente, se utiliza el prefijo mercapto-.
Dos cadenas hidrocarbonadas pueden estar unidas por un puente de azufre, formando una función tioéter (o sulfuro). A
veces, este puente puede estar formado por dos azufres (R-S-S-R'), formando lo que se llama un puente disulfuro. Es el caso
de la cistina (dos cisteínas conectadas por un puente disulfuro). Los tioles también pueden reaccionar con los ácidos
carboxílicos para formar tioésteres. Los enlaces tioéster son enlaces ricos en energía e intervienen en multitud de procesos
del metabolismo, generalmente con la intervención de la acil-coenzima A (acil-CoA).
HETEROCICLOS
Los heterociclos son estructuras cíclicas que contienen átomos distintos del carbono (O, S, N), que se denominan
heteroátomos. En su nomenclatura predominan los nombres vulgares. Los heterociclos pueden ser alicíclicos o aromáticos,
y sus propiedades son similares a las de los hidrocarburos de estructura semejante.
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Bioquímica
SOLUCIONES
Una solución es una mezcla homogénea de dos o mas sustancias. La sustancia disuelta se denomina soluto y esta presente
generalmente en pequeña cantidad en comparación con la sustancia donde se disuelve denominada solvente. en cualquier
discusión de soluciones, el primer requisito consiste en poder especificar sus composiciones, esto es, las cantidades relativas
de los diversos componentes.
La concentración de una solución expresa la relación de la cantidad de soluto a la cantidad de solvente.
Las soluciones poseen una serie de propiedades que las caracterizan :
SOLUBILIDAD
La solubilidad es la cantidad máxima de un soluto que puede disolverse en una cantidad dada de solvente a una determinada
temperatura.
a) Superficie de contacto: La interacción soluto-solvente aumenta cuando hay mayor superficie de contacto y el cuerpo se
disuelve con más rapidez ( pulverizando el soluto).
b) Agitación: Al agitar la solución se van separando las capas de disolución que se forman del soluto y nuevas moléculas
del solvente continúan la disolución
c) Temperatura: Al aumentar la temperatura se favorece el movimiento de las moléculas y hace que la energía de las
partículas del sólido sea alta y puedan abandonar su superficie disolviéndose.
d) Presión: Esta influye en la solubilidad de gases y es directamente proporcional.
La concentración de las soluciones es la cantidad de soluto contenido en una cantidad determinada de solvente o solución.
Los términos diluida o concentrada expresan concentraciones relativas. Para expresar con exactitud la concentración de las
soluciones se usan sistemas como los siguientes:
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Bioquímica
Unidades comunes para expresar la concentración de una disolución:
Unidades Físicas
Porcentajes
La composición en por ciento indica cómo están los porcentajes de la masa de cada elemento en una cantidad dada de un
compuesto. (Masa en gramos y Volumen en mililitros)
a) Porcentaje peso/peso (% p/p O % m/m): indica el peso de soluto por cada 100 unidades de peso de la solución.
b) Porcentaje volumen/volumen (% v/v): se refiere al volumen de soluto por cada 100 unidades de volumen de la
solución.
c) Porcentaje peso/volumen (% m/v): indica el número de gramos de soluto que hay en cada 100 ml de solución.
En el caso de la primera fórmula debemos tener el peso del soluto y de la disolución en las mismas unidades (Kg)
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Bioquímica
Unidades Químicas
Molaridad
Normalidad
Para la expresión de la concentración como normalidad se tiene que definir el equivalente de soluto de acuerdo a la reacción
con la cual se trabaje.
Molalidad
Fracción molar (Xi): se define como la relación entre las moles de un componente y las moles totales presentes en la
solución
Xsto + Xste = 1
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Bioquímica
Se conocen unos 105 elementos químicos, de los que 90 son naturales y, por tanto, susceptibles de formar parte de la
materia viva. Sin embargo se observa que la composición cuantitativa de los seres vivos es muy diferente a la del Universo,
a la de la corteza terrestre y a la del agua de mar. Como se puede ver en la tabla, más del 99% de la composición de los seres
vivos es hidrógeno, oxígeno, carbono y nitrógeno, siendo los dos primeros mucho más abundantes. Tal distribución
responde a las primeras etapas de la evolución de la vida, en las que las moléculas sencillas sufrían constantes cambios y
transformaciones en un medio acuoso. Posteriormente se encapsularon determinadas sustancias en lo que se podría llamar
una protocelula, con una composición mayoritariamente acuosa, que ha llegado hasta hoy día. El agua es todavía el
disolvente básico en cualquier reacción que tenga lugar en un ser vivo.
Los elementos que no proceden del agua se han seleccionado en los seres vivos en función de los beneficios que pudieran
proporcionarles. Un caso notable es el del carbono, elemento prácticamente idéntico al silicio en comportamiento químico,
pero que ha sido escogido por los seres vivos a pesar de su escasez en la corteza terrestre. Ambos elementos pueden formar
cadenas largas y estables, enlaces múltiples consigo mismo y con otros átomos, pero el producto de la oxidación del
carbono, el CO2, es un gas ligero y soluble en agua, mientras que la oxidación del silicio origina sílice (SiO2) que es un
sólido altamente insoluble y del que las células encontrarían graves problemas para deshacerse.
El resto de los elementos que componen los seres vivos es muy escaso, dado que la selección se dio basándose en lo que
había, y descartando grupos de elementos según sus características. Ahora podemos, con los datos analíticos en la mano,
fabricar unos criterios más o menos rigurosos sobre la idoneidad de un elemento para formar parte de la materia viva según,
principalmente, el tamaño y la densidad de carga:
Los elementos muy pesados, a partir del número atómico 93, no están disponibles por su escasez.
Los elementos radiactivos se descartan por ser altamente inestables, a partir del número atómico 84.
Los gases nobles no reaccionan en condiciones normales.
Las tierras raras son muy escasas.
Algunos son elementos muy tóxicos, como el plomo o el mercurio. Suelen ser metales pesados de los grupos 13 a
17 (IIIA a VIIA).
Una vez hecha la selección queda un grupo de unos 50 elementos, de los que sólo tres de los presentes en los seres vivos
tienen números atómicos por encima de 34: molibdeno, estaño y yodo. Los más abundantes son los no metales de bajo peso
molecular, con números atómicos 1, 6, 7 y 8, es decir, el agua (H y O) y los elementos con más facilidades de realizar
enlaces covalentes (C y N), tanto simples como múltiples, y entre ellos y con ellos mismos, además de poder formar
cadenas largas y estables solos o combinados. Por otra parte, estos elementos son los que necesitan menos número de
electrones para llegar a una configuración electrónica estable.
La versatilidad de enlace del carbono, el nitrógeno y el oxígeno hay que buscarlo en la teoría de orbitales atómicos. Los tres
pueden hibridar los orbitales s y los p para formar orbitales híbridos sp3, sp2 y sp en enlaces simples, dobles o triples,
respectivamente. Esta característica es única de estos tres elementos, no hay otros que puedan hacerlo.
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Bioquímica
a) Bioelementos primarios, que aparecen en una proporción media del 96% en la materia viva, y son carbono, oxigeno,
hidrógeno, nitrógeno, fósforo y azufre. Estos elementos reúnen una serie de propiedades que los hacen adecuados para
la vida:
Forman entre ellos enlaces covalentes muy estables, compartiendo pares de electrones. El carbono, oxígeno y
nitrógeno pueden formar enlaces dobles o triples.
Facilitan la adaptación de los seres vivos al campo gravitatorio terrestre, ya que son los elementos más ligeros de la
naturaleza.
b) Bioelementos secundarios, aparecen en una proporción próxima al 3,3%. Son: calcio, sodio, potasio, magnesio y cloro,
desempeñando funciones de vital importancia en fisiología celular.
c) Oligoelementos, micro constituyentes, o elementos vestigiales, que aparecen en la materia viva en proporción inferior
al 0,1% siendo también esenciales para la vida: hierro, manganeso, cobre, zinc, flúor, yodo, boro, silicio, vanadio,
cobalto, selenio, molibdeno y estaño. Aún participando en cantidades infinitesimales, no por ello son menos
importantes, pues su carencia puede acarrear graves trastornos para los organismos.
Los cuatro elementos básicos descritos anteriormente, junto con el fósforo y el azufre, forman todas las estructuras básicas
de la materia orgánica: azúcares, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. Hidrógeno, oxígeno, carbono y nitrógeno forman
todas las estructuras plásticas de soporte, lo que se da en llamar el esqueleto o estructura de la molécula. El fósforo y el
azufre cumplen funciones muy importantes al formar parte de aminoácidos y coenzimas, aunque su cantidad esté muy por
debajo de la de los elementos estructurales de soporte.
Otros elementos esenciales para la vida son los iones, y más concretamente su proporción y distribución entre los distintos
compartimentos celulares o extracelulares. Los más importantes son:
Además, todas las células necesitan mantener su presión osmótica regulando la concentración de sales dentro y fuera del
citoplasma, además de mantener la neutralidad de los fluidos fisiológicos. Para esto se distribuyen los iones de una manera
concreta, estando Na +, Ca 2+ y Cl -. fuera de la célula, y K + y Mg 2+ dentro. De este modo se consigue el potencial negativo
dentro y ordenar la posición de los iones para una correcta actividad celular. Este hecho dio pie a la formulación de la teoría
quimiosmótica.
Los elementos más raramente encontrados en los seres vivos son los llamados oligoelementos. Suelen ser metales de gran
tamaño, generalmente de transición, que cumplen un número muy reducido de funciones importantes para el ser vivo.
Muchos, como el hierro o el manganeso, se asocian a proteínas y mantienen su estructura tridimensional, o cumplen
funciones esenciales en el centro activo de las enzimas como coenzimas de oxidorreducción. Uno de los trabajos más
importantes es en el transporte de oxígeno, donde el hierro se necesita en cantidades tan grandes que no parece correcto
hablar de oligoelemento. Algunos de estos elementos se sabe que son necesarios, pero no se sabe por qué. Por ejemplo, la
falta de selenio provoca distrofia, la falta de vanadio provoca necrosis hepática y la falta de flúor impide una osificación
correcta de las piezas dentales.
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