Microbiología

“CICLOS BIOGEOQUIMICOS Y LOS MICROORGANISMOS”

La paz, B.C.S. lunes 11 de junio del 2018

Índice:
Introducción:………………………………………………………………………3
Ciclo del carbono: ………………………………………………………………...3
Ciclo del nitrógeno: ……………………………………………………………….5

Ciclo del azufre: ……………………………………………………………………8

Ciclo del hierro: ……………………………………………………………….10

Bibliografía: ……………………………………………………………………12

Ciclo biogeoquímico:
La biogeoquímica es la disciplina que se esfuerza por comprender procesos
intrincados, a menudo microbianamente mediados, que transforman y reciclan
sustancias orgánicas e inorgánicas en suelos, sedimentos y aguas. Estos
procesos, manifestaciones de diversos y altamente evolucionados mecanismos
celulares catalizados por Bacteria y Archaea, mantienen la biosfera. El progreso
en la biogeoquímica se basa en la ciencia subyacente de la microbiología
ambiental. En los últimos 2 años, descubrimientos importantes han avanzado las
bases ecológicas, fisiológicas, bioquímicas y genómicas para una variedad de
procesos microbiológicos incluyendo oxidación anaeróbica de metano,
fotosíntesis, absorción de fósforo, biodegradación de contaminantes orgánicos y
numerosos aspectos de los ciclos de nitrógeno y azufre(Castillo,2005).
Los microbios son vitales para todos los ecosistemas de la Tierra y son
particularmente importantes en zonas donde la luz no puede acercarse (es decir,
donde la fotosíntesis no puede ser el medio básico para recolectar energía). Los
microorganismos participan en una serie de procesos ecológicos fundamentales
que incluyen producción, descomposición y fijación. También pueden tener
efectos indirectos adicionales sobre el ecosistema a través de relaciones
simbióticas con otros organismos. Además, los procesos microbianos pueden
ser cooptados para la biodegradación o biorremediación de desechos
domésticos, agrícolas e industriales, haciendo que el estudio de la ecología
microbiana sea particularmente importante para aplicaciones biotecnológicas y
ambientales(Mellado,1999).
Ciclo del carbono
El carbono es uno de los elementos más importantes para los organismos vivos,
como lo demuestra su abundancia y presencia en todas las moléculas
orgánicas. El ciclo del carbono ejemplifica la conexión entre organismos en varios
ecosistemas. El carbono se intercambia entre heterótrofos y autótrofos dentro y
entre los ecosistemas principalmente a través del CO 2 atmosférico, una versión
totalmente oxidada de carbono que sirve como el bloque de construcción básico
que utilizan los autótrofos para construir moléculas orgánicas multicarbónicas y de
alta energía, como la glucosa. Los fotoautótrofos y quimioautótrofos aprovechan la
energía del sol y de compuestos químicos inorgánicos, respectivamente, para unir
covalentemente átomos de carbono en compuestos orgán

icos reducidos cuya energía se puede acceder más tarde a través de los procesos
de respiración y fermentación

En general, hay un intercambio constante de CO 2 entre los heterótrofos (que

3
producen CO 2 como resultado de la respiración o la fermentación) y los autótrofos
(que usan el CO 2 para la fijación). Los autótrofos también respiran o fermentan,
consumiendo las moléculas orgánicas que forman; no fijan carbono para
heterótrofos, sino que lo utilizan para sus propias necesidades metabólicas.

Las bacterias y arqueas que usan metano como fuente de carbono se

llaman metanótrofos . Compuestos de un carbono reducidos como el metano se
acumulan en ciertos ambientes anaeróbicos cuando el CO 2 se utiliza como aceptor
terminal de electrones en la respiración anaeróbica por arqueas
llamado metanógenos. Algunos metanógenos también fermentan acetato (dos
carbonos) para producir metano y CO2. Acumulación de metano
por metanogénesis ocurre tanto en suelo anaeróbico natural como en ambientes
acuáticos; la acumulación de metano también ocurre como resultado de la cría de
animales porque los metanógenos son miembros de la microbiota normal de los
rumiantes. La acumulación de metano ambiental debido a la metanogénesis es una
consecuencia porque es un gas de efecto invernadero fuerte, y los metanótrofos
ayudan a reducir los niveles de metano en la atmósfera.

Figura 1. Ciclo del carbono

Ciclo del nitrógeno

4
Muchas macromoléculas biológicas, que incluyen proteínas y ácidos nucleicos,
contienen nitrógeno; sin embargo, es difícil obtener nitrógeno en los organismos
vivos. Los procariotas desempeñan papeles esenciales en
el ciclo del nitrógeno , transformando el nitrógeno entre varias formas para sus
propias necesidades, beneficiando a otros organismos indirectamente. Plantas
y fitoplancton no pueden incorporar nitrógeno de la atmósfera (en la que existe
como fuertemente unida, covalente triple de N 2 ), a pesar de que esta molécula
compone aproximadamente el 78% de la atmósfera. El nitrógeno ingresa al
mundo de los seres vivos a través de bacterias simbióticas y de vida libre, que
incorporan nitrógeno en sus macromoléculas a través de vías bioquímicas
especializadas llamadas fijación de nitrógeno. Las cianobacterias en los
ecosistemas acuáticos fijan el nitrógeno inorgánico (del gas nitrógeno) en
amoníaco (NH 3 ) que puede incorporarse fácilmente a las macromoléculas
biológicas. La bacteria Rhizobium también fija el nitrógeno y vive
simbióticamente en los nódulos de las raíces de las leguminosas (como frijoles,
cacahuetes y guisantes), proporcionándoles el nitrógeno orgánico necesario
mientras recibe carbono fijo como azúcar a cambio. Las bacterias de vida libre,
como los miembros del género Azotobacter , también pueden fijar nitrógeno.

Figura 2. Ciclo del nitrógeno

El nitrógeno que entra en los sistemas vivos mediante la fijación de nitrógeno se

convierte eventualmente de nitrógeno orgánico en nitrógeno gaseoso por los
microbios a través de tres pasos:
amonificación, nitrificación y desnitrificación. En los sistemas terrestres, el
primer paso es el proceso de amonificación, en el que ciertas bacterias y
hongos convierten los residuos nitrogenados de animales vivos o de los restos
de organismos muertos en amoníaco (NH 3 ). Este amoníaco se oxida a nitrito (
NO - 2 )(NO2-), luego a nitrato ( NO - 3 )(NO3-), mediante la nitrificación de
bacterias del suelo como miembros del género Nitrosomonas , a través del
proceso de nitrificación. Por último, se produce el proceso de desnitrificación,
mediante el cual las bacterias del suelo, como los miembros de los
géneros Pseudomonas y Clostridium , usan nitrato como aceptor de
electrones terminal en la respiración anaeróbica , convirtiéndolo en gas
nitrógeno que vuelve a entrar en la atmósfera. Un proceso similar ocurre en el
ciclo del nitrógeno marino, donde estos tres procesos son realizados por
bacterias marinas y arqueas.

Los aminoácidos liberados durante la proteolisis sufren desaminación en la que

se elimina el grupo amino que contiene nitrógeno (-NH2). Por lo tanto, el proceso
de desaminación que conduce a la producción de amoníaco se denomina
"amonificación". El proceso de amonificación está mediado por varios
microorganismos del suelo. La amonificación generalmente ocurre bajo
condiciones aeróbicas (conocida como desaminación oxidativa) con la liberación
de amoníaco (NH3) o iones de amonio (NH4) que son liberados a la atmósfera
o utilizados por plantas (arroz) y microorganismos o aún en condiciones
favorables del suelo oxidadas a forma nitritos y luego a nitratos.

Los procesos de amonificación se producen comúnmente

por Clostridium sp, Micrococcus sp, Proteus sp. etc. y se representa de la
siguiente manera.

Alanina
CH3 CHNH2 COOH + 1/2 O2 -----------------> C H3COCOOH + NH3
Alanina desaminasa Ácido pirúvico amoníaco

Nitrificación: el nitrógeno / amoníaco amónico liberado durante la amonificación

se oxida a nitratos y el proceso se denomina "nitrificación". Las condiciones del
suelo tales como suelos bien aireados ricos en carbonato de calcio, una
temperatura inferior a 30 ° C, pH neutro y menos materia orgánica son favorables
para la nitrificación en el suelo.
6
La nitrificación es un proceso de dos etapas y cada etapa es realizada por un
grupo diferente de bacterias de la siguiente manera.

Etapa I : la oxidación del amoníaco de nitrito es causada por bacterias oxidantes

de amoniaco. Nitrosomnonas europaea, Nitrosococcus nitrosus, Nitrosospira
briensis, Nitrosovibrio y Nitrocystis y el proceso se conoce como
nitrosificación. La reacción se presenta de la siguiente manera.
2 NH3 + 1 / 2O2 -------------------> NO2 + 2 H + H2 O
Nitrito amónico

Etapa II: el nitrito es oxidado a nitrato por bacterias oxidantes de nitrito tales
como Nitrobacter winogradsky. Nitrospira gracilis, Nirosococcus mobiiis , etc., y
varios hongos (por ejemplo, Penicillium, Aspergillus) y actinomicetos (por
ejemplo, Streptomyces, Nocardia).

NO2 (-) + ½ O2 ----------------------> NO3

Nitrito iones Nitrato iones

El nitrato así formado puede ser utilizado por los microorganismos, asimilado por
las plantas, reducido a nitrito y amoníaco o nitrógeno gaseoso o perdido por
lixiviación dependiendo de las condiciones del suelo. Las bacterias nitrificantes
(oxidante de amoníaco y oxidante de nitrito) son aerobias gramnegativas y
quimioautótrofas y son los habitantes comunes del suelo, las aguas residuales y
el medio ambiente acuático.

Reducción de nitrato:
varias bacterias heterótrofas (E. coli, Azospirillum) son capaces de convertir los
nitratos en nitritos y nitritos en amoníaco. Por lo tanto, el proceso de nitrificación
se invierte por completo, lo que se conoce como reducción de nitrato. La
reducción de nitratos normalmente se produce en condiciones de suelo
anaeróbico (suelos con registro de agua) y el proceso general es el siguiente:
Nitrato
HNO3 + 4 H2 --------------------> NH4 + 3 H20
nitrato reductasa amonio

La reducción de nitrato que conduce a la producción de amoníaco se denomina

"reducción asimilable de nitrato" ya que algunos de los microorganismos
asimilan el amonio para la síntesis de proteínas y aminoácidos

7
Ciclo del azufre:

En el planeta, los compuestos azufrados circulan entre el suelo, los océanos, la

atmósfera y la materia viva, a través de reacciones descritas en el llamado ciclo
biogeoquímico del azufre. El azufre experimenta transformaciones cíclicas en su
estado de oxidación de -2 (HS- ) a +6 (SO4 2- ), debido a procesos químicos,
geológicos y biológicos.
 Figura 3. Ciclo del azufre

Una parte importante de la movilidad de los compuestos de azufre se debe a que

pueden encontrarse como gases o disueltos en líquidos y así transportarse en
la naturaleza. Siendo las sales mucho más solubles que el H2S, la cantidad
disuelta en agua puede variar según el pH de la solución. De esta forma, una
solución a pH=10 puede contener 1000 veces más de sulfuros totales que a
pH=4,

Las bacterias del ciclo del azufre, en particular las bacterias reductoras de
sulfatos y las que oxidan sulfuros desempeñan un importante papel en este ciclo,
tanto en su parte reductiva como en su parte oxidativa. Las bacterias oxidantes
de azufre y sulfuros producen SO4 2- mientras que las bacterias sulfato-
reductoras lo consumen utilizándolo como aceptor de electrones en su
respiración anaerobia y produciendo H2S.Ademas son de inmensa importancia
desde el punto de vista industrial y medioambiental. Mientras que la producción
biogénica de H 2S por bacterias reductoras de sulfato crea severo procesamiento
y problemas ambientales para la industria petrolera y el sector agrícola, cuando
se usa en un biorreactor diseñado y controlado adecuadamente, las bacterias
reductoras de sulfato podrían jugar un papel instrumental en el tratamiento del
drenaje ácido de la mina, un desafío ambiental para la industria minera.
8
Distintos grupos de bacterias realizan transformaciones (oxidaciones y
reducciones), por las que el azufre puede encontrarse en forma de sulfatos,
sulfuros o azufre elemental, dependiendo de las condiciones (aerobias,
anaerobias, con o sin luz) que se presenten en el medio, generalmente acuático,
y según se trate de depósitos en superficie o en profundidad.
En resumen, los principales grupos de bacterias implicados en el ciclo del azufre
son:

 Bacterias fotosintéticas verdes y púrpuras del azufre, que oxidan el H2S

(sulfuro de hidrógeno) y lo descomponen en H2 (hidrógeno) y S (azufre
elemental) en lugar de hacer la fotolisis del H2O, pues hacen fotosíntesis
anoxigénica. La fotosíntesis anoxigénica es aquella en la que no se desprende
oxígeno, pues los electrones necesarios para reducir el CO2 y por lo tanto
fijarlo, no proceden del agua sino de otros compuestos, en este caso del
sulfuro de hidrógeno.
 Bacterias quimiosintéticas del azufre, que utilizan la oxidación de H2S a
SO4 2- hasta S para obtener energía necesaria para fabricar su propia materia
orgánica. Las más importantes son las del género Beggiaota, como B. alba.
Estas mismas en ausencia de oxígeno y otras, oxidan el azufre a sulfatos para
obtener energía.
 Bacterias heterótrofas anaerobias, que en su respiración emplean sulfatos,
en vez del O2, como aceptor de electrones, y lo reducen a H2S.

En su gran mayoría estas bacterias pertenecen a la clase de las

Gammaproteobacterias. Las fuentes de donadores de electrones inorgánicos son
diversas y abundantes en la naturaleza; pueden ser de origen geológico,
biológico y antropogénico. La actividad volcánica es una importante fuente de
compuestos inorgánicos reducidos de azufre al igual que la sulfatoreducción. Las
actividades derivadas de la agricultura y minería, así como la quema de
combustibles fósiles y otras actividades industriales liberan compuestos
inorgánicos reducidos de azufre al medio ambiente, los cuales pueden ser
utilizados como donadores de electrones por las bacterias quimiolitoautótrofas
sulfoxidantes.
Los géneros bacterianos reductores de sulfatos predominantes en el suelo
son Desulfovibrio, Desulfatomaculum y Desulfomonas. (Todos los anaerobios
obligados). Entre estas especies, Desulfovibrio desulfuricans es el más ubicuo,
no formador de esporas, anaerobios obligados que reducen los sulfatos a un
ritmo rápido en suelos anegados / inundados. Mientras que las especies
de Desulfatomaculum forman esporas, son anaerobios obligados termófilos que
reducen los sulfatos en suelos de tierras secas. Todas las bacterias reductoras
de sulfato excretan una enzima llamada "desulfurasas" o "bisulfato
reductasa”. La tasa de reducción de sulfato en la naturaleza aumenta al
aumentar los niveles de agua (inundación), el alto contenido de materia orgánica
y el aumento de la temperatura.
9
Ciclo del hierro:

El hierro existe como iones ferrosos (Fe ++) o férricos (Fe +++). El hierro ferroso
se oxida espontáneamente al estado férrico, formando hidróxido férrico
altamente insoluble. Las plantas y los microorganismos requieren trazas de
hierro, manganeso, cobre, zinc, molibdeno, boro cálcico, cobalto, etc. El hierro
siempre es abundante en los hábitats terrestres, y a menudo está en una forma
no disponible para su utilización por las plantas y conduce a la grave deficiencia
de plantas.

Figura 4. Ciclo del hierro

Los microorganismos tienen un papel importante en las transformaciones del

hierro en un número de formas claramente diferentes, tales como:

A. Algunas bacterias oxidan el hierro ferroso a un estado férrico que se

precipita como hidróxido férrico alrededor de las células
B. Muchas especies heterotróficas atacan en sales de hierro orgánicas
solubles y las convierten en sales inorgánicas
C. El potencial de oxidación-reducción disminuye con el crecimiento
microbiano y conduce a la formación de hierro ferroso más soluble a partir
de iones férricos altamente insolubles.
D. El número de bacterias y hongos produce ácidos tales como ácidos
carbónico, nítrico, sulfúrico y orgánico que aporta hierro a la solución
10
E. En condiciones anaerobias, los sulfuros formados a partir de sulfato y
compuestos orgánicos de azufre 9eliminan el hierro de la solución en forma
de sulfuro ferroso
F. A medida que los microbios liberan ácidos orgánicos y otros productos
carbonosos del metabolismo que da como resultado la formación de
 complejo de hierro orgánico soluble. Por lo tanto, el hierro puede
precipitarse en la naturaleza e inmovilizarse mediante la oxidación del
hierro de las bacterias bajo la reacción del suelo alcalino y, por otro lado,
la solubilización del hierro puede ocurrir a través de la formación de ácido.

Algunas bacterias son capaces de reducir el hierro férrico a ferroso, lo que

reduce el potencial de oxidación-reducción del medio ambiente (p. Ej., Bacillus,
Clostridium, Klebsiella, etc.). Sin embargo, algunas bacterias quimioautótrofas
de hierro y azufre como Thiobacillus ferroxldans y Ferrobacitlus
ferrooxidans pueden oxidar el hierro ferroso a hidróxido férrico que se acumula
alrededor de las células.

Por ejemplo, thiobacillus ferroxidans utiliza el gradiente de protones naturales

en su entorno de pH bajo para generar ATP a través de la ATP sintasa, a
continuación, elimina el exceso de protones citoplasmáticos por reducción de
oxígeno en presencia de hierro mediante la oxidación, estando implicados el
citocromo C y el citocromo A1, todos en la membrana citoplasmática). También
hay bacterias que realizan la operación contraria y son bacterias reductoras de
hierro (Pseudomonas, entre otros) a través de un proceso anaerobio en la cual
el hierro es usado como un “sumidero de electrones (aceptor terminal de
electrones).

BIBLIOGRAFIA:
11
0

Manahan, S. E. (2006). Introducción a la química ambiental.

Reverté.
Mellado, J. M. R., & Galvín, R. M. (1999). Fisicoquímica de
aguas. Ediciones Díaz de Santos.
Urzúa, H. (2005). Beneficios de la fijación simbiótica de
nitrógeno en Chile. Cien. Inv. Agr, 32(2), 133-150.
Tortora, G. J., Funke, B. R., & Case, C. L.
(2007). Introducción a la microbiología. Ed. Médica
Panamericana.
Miller, Jr.(G. Tyler), & Rodriguez, I. D. L. (1994). Ecología y
medio ambiente. Grupo Editorial Iberoamericana.
Edel Navarro, R. (2003). El rendimiento académico:
concepto, investigación y desarrollo. REICE. Revista
Iberoamericana sobre Calidad, Eficacia y Cambio en
Educación, 1(2).
Cheftel, J. C., & Cheftel, H. (1989). Introducción a la
bioquímica y tecnología de los alimentos.
Castillo Rodríguez, F. (2005). Biotecnología ambiental (No.
660.6 B616b). Madrid, ES: Edit. Tébar.

12

11