Tipos de PCR
Tipos de PCR
Tipos de PCR
dNTPs Cebadores Cofactores ADN polimerasas Agua T° T° Anillamiento T° Número de ciclos Detección Aplicación
Desnaturalización / hibridación Elongación
2 (forward – reverse) • Electroforesis • Arqueología
PCR • Concentración Oligonucleótidos cortos Mg++ 0.5 - 2.5 mM Taq polimerasa obtenida Agua ultrapura 94°C por 1 54° C por 45 72°C por 2 30 -40 ciclos en gel agarosa • Medicina forense
convencional inicial en (varían entre 18 y 30 a partir de Thermus calidad tipo I. minuto segundos minutos bajo un buffer o • Medicina clínica
solución stock nucleótidos) aquaticus (mQ) Libre de tampón TAE o • Diagnóstico de enfermedades infecciosas
(2,5 mM) Forward Y Reverse: DNAsas, TBE. • Demostración de genes indicadores de
• Concentración RNAsas, patología
final en la • Concentración Proteasas • Oncogenes
reacción (0,25 inicial en solución Máxima pureza: • Genes supresores de tumor
mM) stock (10 uM (10 Estéril para
• Estudio y pronóstico de tumores.
• Volumen para pmol/uL) PCR (A0103)
20 uL (2) • Concentración
final en la
reacción (10 uM (
10 pmol / uL)
• Volumen para 20
uL (0,2)
• 100 µl de • Primer oligo(dT) • La transcriptasa 90 °C – 94 °C por 50° C – 60 °C 72 °C por 7 30 – 40 ciclos • Sondas • Diagnóstico de tumores
mezcla de (12 -18 • MgCl2 (1,5 inversa del virus 2 minutos por 15 minutos minutos. fluorescentes. • Respuesta a medicamentos en cuanto a
dNTP, 10 mM deoxitimidinas) mM) de la Agua de grado • Electroforesis cáncer humano
de cada uno de • Primers • Mg ++ 0.5 - mieloblastosis RT-PCR, no en gel de • Genotipado de muestras a partir de la
dATP,, dCTP, específicos (SSPs, 2.5 mM aviar (AMV), tratada con agarosa o cuantificación y diferenciación de alelos
RTPCR o dGTP y dTTP Sample Specific posee actividad DEPC. El agua poliacrilamida. • Detección de polimorfismos llegando
retrotrancriptasa Primers) (RT - ARNasa H de calidad RT- incluso a detectar polimorfismos
inversa PCR PCR de un solo PCR está nucleotídicos (SNP)
paso ) • Transcriptasa certificada
• Random primers inversa originada como carente
(aproximadamente del virus de de
6 nucleotidos) leucemia murina endonucleasas
Moloney (M- y de
MLV)que carece contaminación
sustancialmente con ácidos
de actividad de nucleicos que
ARNasa H puede causar
falsas señales
• Transcriptasa positivas en la
inversa, RT-PCR
retrotranscriptasa
rTth ADN
polimerasa de
Thermus
thermophilu
• 2 cebadores • MgCl2 ADN polimerasa Agua ultrapura no son necesarios • Fluorescencia. • Diagnostico de carga viral
dNTPs de 10 mM en externos de (100mM) desplazamiento de calidad tipo I. ciclos de cambio (en tiempo real • Análisis serológicos
un volumen de 3.5 uL protuberancia cadena generalmente (mQ) Libre de • Utiliza temperatura constante de 60 °C de temperatura usando tintas o • Detección de variables genéticas de virus
(1.4 mM final) • 2 cebadores Concentración DNAsas, para la separación sondas con alta tasa de mutación
Amplificación de internos con final recomendada • Bst ADN RNAsas, de las hebras intercalantes)
desplazamiento regiones de cola de 3 – 3,5 mM polimerasa Proteasas como sucede en la
de hebra (SDA) 5´ que contienen Máxima pureza: PCR
sitio de • Fragmento Estéril para
reconocimiento de grande o PCR (A0103)
la enzima fragmento klenow
melladora (3’ – 5´exo)
Mg++ • ADN polimerasa l no son necesarios • Flujo lateral • Detección de marcadores de seguimiento
Amplificación Como la PCR solo (100 mM) E. coli UvrD Agua ultrapura ciclos de cambio • Fluorescencia en fuentes microbiana.
dependiente de dNTPs de 10 mM en requiere 2 cebadores. • ADN polimerasa calidad tipo I. • Utiliza una temperatura constante de 65 °C de temperatura (sondas marcadas • Detección rápida de patógenos
helicasa (HDA) un volumen de 3.5 uL • Biotinilados Concentración ll E. coli UvrD (mQ) Libre de para la separación con un extintor y un • Empleada en varios dispositivos de
(1.4 mM final) • Específcos final recomendada DNAsas, de las hebras
(75 – 100 nM) de 1,5 – 3,0 mM • Helicasa RNAsas, como sucede en la
fluorocromo) diagnóstico y pruebas aprobadas por la
FDA.
termoestable Tte Proteasas PCR
– UvrD de Máxima pureza:
Estéril para
Thermoanaerobacter
PCR (A0103)
tengcongenesis
• RPA utiliza 2 • Bsu ADN Agua ultrapura no son necesarios • Fluorescencia • Detección de patógenos en humanos y
Amplificación oligonucleótidos • Mg polimerasa calidad tipo I. ciclos de cambio • Flujo lateral animales y recientemente para
de la dNTPs de 10 mM en como cebadores (CH3COO) obtenida a partir (mQ) Libre de • Utiliza una temperatura constante de 37 °C de temperatura enfermedades en plantas y la detección
recombinasa un volumen de 3.5 uL inversos • Mg++ (100 de Bacillus DNAsas, para la separación de begomovirus
polimerasa (1.4 mM final) • SIBA incluye un mM) subtilis RNAsas, de las hebras • Aplicación de amplificación de
(RPA) y la oligo de invasión Concentración Proteasas como sucede en la recombinasa polimerasa con flujo lateral
amplificación mas largo final recomendada Máxima pureza: PCR para una detección a simple vista de
basada en la de 1,5 – 3,0 mM Estéril para Lysteria monocytogenes en superficies
amplificación PCR (A0103) de procesamientos de alimentos.
de cadena • Amplificación de recombinasa polimerasa
(SIBA) (RPA) combinada con inmunoensayo de
flujo lateral para la detección rápida de v
Salmonella en alimentos.
•
Amplificación • Uno de los • Mg++ (100 • RNasas H de E. Agua ultrapura no son necesarios • Fluorescencia • Evaluación de la seguridad
basada en dNTPs de 10 mM en cebadores debe mM) coli calidad tipo I. • Utiliza una temperatura constante de 40° C ciclos de cambio (Molecular microbiológica y la autenticidad de
secuencia de un volumen de 3.5 uL incluir una Concentración • Transcriptasa (mQ) Libre de – 55 °C de temperatura Beacon o sonda productos cárnicos
ácidos (1.4 mM final) secuencia final recomendada inversa del virus DNAsas, para la separación de hibridación) • Usadas en variedad de diagnósticos
nucleicos promotora de la de 1,5 – 3,0 mM de la RNAsas, de las hebras clínicos
(NASBA) y ARN polimerasa mieloblastosis Proteasas como sucede en la
amplificación de T7 en el aviar (AMV) Máxima pureza: PCR
mediada por extremo 5´ • ARN polimerasa Estéril para
transcripción • Cebador a+: del fago de T7 PCR (A0103)
(TMA) presenta una
secuencia
complementaria al
extremo 5´ de la
molécula de ARN
• Cebador b-: este
cebador es
complementario al
extremos 3´ del
ARN y además
presenta una
secuencia
promotora de t7
en 5´,
INTEGRANTES.