Manual Laboratorio Genética Finalizado Editorial
Manual Laboratorio Genética Finalizado Editorial
Manual Laboratorio Genética Finalizado Editorial
Sc
Revisión: Mayra Elizabeth Servellón, M. Sc.
PRÁCTICA 1
BIOINFORMÁTICA
Introducción
La bioinformática es una disciplina multi e interdisciplinaria que surge de la
necesidad de interacción entre la biología, la matemática, la informática y
computación aplicada. Se origina a partir de los primeros análisis de secuencias
de ácidos nucleicos y proteínas utilizando computadoras. Las nuevas tecnologías
como la biología molecular, la genómica, la proteómica, y la metabólica que han
revolucionado la forma de estudio del genoma, son fuente de grandes volúmenes
de información.
La bioinformática desarrolla nuevos métodos computacionales, algoritmos y
software para el análisis de la información. En corto, la bioinformática es una
caja de herramientas que los investigadores en biología, microbiología y
medicina tienen para manejar la información que generen con sus
investigaciones (Gómez Merino, Silva Rojas, & Pérez Rodríguez, 2010).
Según National Center for Biotecnology Information (NCBI) la
bioinformática “consiste en el acercamiento computacional al manejo y análisis
de la información biomédica.” La bioinformática se ha convertido en un
componente importante de la investigación académica a nivel de pregrado y
postgrado (National Center for Biotecnology Information (US), 2002).
El desarrollo de la bioinformática y a la integración de las diferentes
disciplinas y tecnologías ha desarrollado herramientas útiles para el análisis de
información: alineamiento múltiple de secuencias, diseño de árboles
filogéneticos, análisis tridimensional de moléculas, inferencia de filogenias por
diferentes métodos de parsimonia, distancia matriz de probabilidad utilizando
distintos tipos de algoritmos. Además, se ha simplificado el análisis de genomas,
transcriptomas, proteomas y metabolomas (Gómez Merino, Silva Rojas, & Pérez
Rodríguez, 2010).
Ahora más que nunca la bioinformática es esencial para la integración
efectiva de la información genética y genómica, así como otra información
biológica. En un sentido más amplio la bioinformática desarrolla los siguientes
aspectos en la investigación genética:
Expansión y manejo del conocimiento,
búsqueda, integración y manejo de información,
manejo de genes, genomas e información de variancia genética,
diseño y análisis de estudios genéticos
análisis de información genética y genómica (Barnes, 2007)
Bases de Datos
Objetivos
Conocer las herramientas informáticas disponibles en línea.
Identificar las herramientas y servicios disponibles en la página web de NCBI.
Materiales y Equipo
Manual de Laboratorio
Computadora con acceso a Internet
Bibliografía
Barnes, M. R. (2007). Bioinformatics for geneticists : a bioinformatics primer for the
analysis of genetic data. Harlow: Wiley.
Gómez Merino, F. C., Silva Rojas, H. V., & Pérez Rodríguez, P. (2010). Bioinformática
Aplicaciones a la genómica y proteómica. Montecillo: Colegio de
Postgraduados.
National Center for Biotecnology Information (US). (2002). The NCBI Handbook.
Bethesda: Jo McEntyre & Jim Ostell.
Zou, D., Ma, L., Yu, J., & Zhang, Z. (2015). Biological Databases for Human Research.
Genomics Proeomics Bioinformatics, 55 - 63.
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Práctica 1:
Bioinformática
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Sección de Laboratorio:
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Sección de Teoría:
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Fecha:
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VI. Conclusiones
Escriba un mínimo de tres (3) conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1.
2.
3.
VIII. Cuestionario
1. ¿Qué es bioinformática, y cuál es su importancia para la genética y biología
molecular?
2. ¿Cuál es la importancia del Proyecto Genoma Humano y qué relación tiene con
la bioinformática?
4. ¿En qué año fue fundado el National Center for Biotecnology Information y con
qué propósito?
Introducción
Existen dos tipos distintivos de células sin ningún tipo intermedio conocido en
los seres vivos. Las células estructuralmente más simples, procariotas, que
incluyen las bacterias y las más complejas, eucariotas, que incluyen protistas,
hongos, plantas y animales. El material genético de las células procariotas se
encuentra en el nucleoide, una región muy poco definida de la célula que no posee
una membrana definida que la separe del citoplasma que la rodea. Las células
eucariotas, al contrario, poseen un núcleo que se define como una región aislada
por una estructura membranosa compleja que se llama envoltura nuclear. La
diferencia que presenta la envoltura nuclear es lo que demarca los términos
procariotas (pro – antes, karyon – cuerpo) y eucariotas (eu – verdadero, karyon –
cuerpo) (Karp, 2013).
Un poco de historia
Un gran descubrimiento en el área de genética molecular fue hecho en 1953
por James Watson y Francis Crick. Antes de su descubrimiento ya se conocía que
el ADN está compuesto de nucleótidos. Sin embargo, lo que no se conocía era
como están enlazados entre sí para formar la estructura del ADN. Las
investigaciones en esa época se basaban en descubrir la estructura del ADN ya
que para ellos era importante conocerla para entender el funcionamiento de los
genes. Investigadores como Rosalind Franklin compartían ésta idea. Se debe
considerar los importantes aportes hechos por ella, los cuales apoyaron a Watson
y Crick en su descubrimiento, la famosa fotografía 51 (Anexo 1).
Desarrollo de la técnica de difracción de rayos X: Cuando una sustancia
purificada, como el ADN, un patrón definido de difracción se observa si la
molécula tiene un patrón estructural regular. Utilizando fórmulas matemáticas la
interpretación de los patrones de difracción puede revelar información de la
estructura de la molécula. Rosalind Franklin trabajando junto a Maurice Wilkins
utilizó la difracción de rayos X para estudiar fibras de ADN.
Otra información importante fue el descubrimiento de Erwin Chargaff. Durante
los 1940 y 1950 fue pionero de muchas técnicas bioquímicas para el aislamiento,
purificación y cuantificación de ácidos nucleicos de células vivas. La observación
de Chargaff fue que la cantidad de adenina es similar a la de timina y la cantidad
de guanina es similar a la de citosina, lo que se conoció más adelante como la
Regla de Chargaff.
La contribución de Franklin fue conocida hasta mucho tiempo después, pero
desafortunadamente murió en 1958 y los premios Nobel no se entregan
póstumamente. (Brooker, 2012)
Composición de Ácidos Nucleicos
En las macromoléculas de los ácidos nucleicos se encuentran unidades
estructurales repetitivas llamadas nucleótidos. Un nucleótido tiene tres
componentes: al menos un grupo fosfato, una azúcar pentosa, y una base
nitrogenada. Estos nucleótidos pueden variar en su pentosa y su base nitrogenada.
Existen dos tipos de azucares: desoxirribosa y ribosa las cuales se encuentran en
ADN y ARN respetivamente. Se encuentran cinco tipos de bases nitrogenadas
dividas en dos grupos: las purinas – adenina (A) y guanina (G) que contienen una
estructura de doble anillo y las pirimidinas – timina (T), citosina (C) y uracilo (U)
que contienen una estructura de un solo anillo. La base timina no se encuentra en
ARN, sin embargo se encuentra uracilo en sustitución (Brooker, 2012).
El ADN consiste de dos hebras de polinucleótidos enlazados para formar una
doble hélice. Las dos columnas pentosa-fosfato se encuentran por fuera de la
hélice y las bases se proyectan hacia el interior. La orientación de las dos hebras
es antiparalela, esto es, que la dirección 5’ > 3’ es opuesta. Las hebras están
dispuestas en un registro preciso por las pares de bases entre las dos hebras. La
complementariedad de las bases es consecuencia del tamaño, forma y
composición química. La presencia de enlaces de hidrogeno contribuye a la
estabilidad de la doble hélice (Lodish, y otros, 2013). Se puede observar la
estructura del ADN en la Figura 1.
Objetivos
1. Identificar las características físicas y químicas de los ácidos nucleicos de los
seres vivos.
2. Extraer DNA y RNA de tejidos animales o vegetales.
3. Conocer los fundamentos de las técnicas de extracción de ácidos nucleicos de
diferentes tipos de tejidos.
Materiales y Equipo
Material biológico:
1. Cultivo Bacteriano
2. 5 mL de sangre venosa heparinizada.
3. Tejido Foliar
Material de laboratorio:
1. Jeringa desechable estéril de 5 mL.
2. Microtubos de 1.5 mL.
3. Puntas para micropipetas
4. Micropistilos
Reactivos:
1. Solución de Lisis fuerte (Tween 20)
2. Solución de Lisis suave
3. CTAB 2%
4. SDS al 10%
5. TEG/lisozima
a. 25 mM Tris/HCl, p H 8.0
b. 10 mM EDTA
c. 50 mM Glucosa
d. Agregar 2 mg/ml lisozima antes de utilizar
6. Proteinasa K, 10 mg/ml
7. NaOAc 3M, pH 5.3
8. Etanol al 95%
9. Etanol 70%
10. Isopropanol
11. Cloroformo:octanol (24:1)
12. Agua destilada
Equipo:
Microcentrífuga
Micropipetas
Vortex.
Plato Caliente
Baño María
Incubadora
Procedimiento
Tejido procedente de cultivos bacterianos:
1. Cultivar una bacteria en 10 ml de un medio líquido de cultivo apropiado toda la
noche.
2. Centrifugar el cultivo 10 min a 6000 rpm.
3. Resuspender el botón bacteriano en 2 ml de TEG/lisozima.
4. Incubar a temperatura ambiente por 10 min.
5. Agregar 100 µl de SDS al 10 % e incube 10 min a temperatura ambiente.
6. Agregar 40 µl de Proteinasa K e incube a 55 ºC hasta que la solución esté
completamente clara; si es necesario incube toda la noche.
7. Precipitar el ADN adicionando 1/10 del volumen anterior (214 µl) de NaOAc 3M
y 2.5 ml de isopropanol a temperatura de congelación. Mezclar las dos fases por
inversión suave del tubo de ensayo. El ADN se tornará visible en forma de
filamentos largos en la interface. Cuando las fases son mezcladas completamente,
el ADN será visible como un coagulo blanco.
8. Remover el ADN de la mezcla con la punta doblada de una pipeta Pasteur.
9. Colocar el ADN en 100 µl de TE o agua destilada estéril.
Bibliografía
Brooker, R. J. (2012). Genetics Analysis and Principles. New York: McGraw-
Hill.
Karp, G. (2013). Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments (7 ed.).
Wiley.
Lodish, H., Berk, A., Kaiser, C., Krieger, M., Bretscher, A., Ploegh, H., Scott, M.
(2013). Molecular Cell Biology. New York: W.H. Freeman and Company.
Franklin, R. (1953). Molecular Configuration in Sodium Thymonuclease. Nature.
Vol. 151. 740- 741
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Práctica 2:
Extracción de Ácidos Nucleicos
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Sección de Teoría:
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I. Introducción
Investigue un artículo científico publicado en revistas indexadas, donde se realice
extracción de ácidos nucleicos.
II. Materiales y equipo
Enliste e ilustre el equipo, los reactivos y materiales utilizados durante la práctica.
Describa la función de cada uno.
III. Método
1. Describa con sus propias palabras el protocolo para extracción de ADN
utilizado en esta práctica.
V. DISCUSIÓN
Haga una breve comparación entre los protocolos que se le presentan en el manual
y los que ha investigado.
Utilice las siguientes preguntas como una guía para estructurar su discusión
¿Qué diferencias y similitudes hay?
¿De qué depende la selección de un protocolo en particular?
¿Cómo escogería un protocolo para su propia investigación?
VI. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres (3) conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
VIII. CUESTIONARIO
1. ¿Cuál es la función biológica del ADN?
2. ¿Cuál es la función biológica del ARN?
3. ¿En dónde se encuentran los ácidos Nucleicos dentro de las células procariotas y
eucariotas?
4. ¿Qué es la nucleína?
5. ¿Qué aplicaciones tiene la extracción de ADN?
6. ¿Quién fue Rosalind Franklin?
7. ¿Qué son las bases nitrogenadas? ¿Cómo se enlazan?
8. ¿Qué significa la orientación antiparalela del ADN?
9. ¿Qué diferencias moleculares hay entre ARN y ADN?
10. ¿Cuál es la función de las ADNasas y las ARNasas?
Objetivos
1. Describir el fundamento de la técnica de electroforesis de ácidos nucleicos en gel
de agarosa.
2. Identificar otros métodos empleados en la cuantificación de ADN.
3. Calcular el peso molecular de un ADN presente en una preparación,
comparándolo con marcadores de concentración conocida.
4. Describir el fundamento de la técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction)
Materiales y Equipo
1. Tanque electroforético para geles, se utiliza un tanque horizontal para gel
sumergido.
2. Generador de electricidad con capacidad de 500 v
3. Iluminador ultravioleta o transiluminador
4. Bandeja plástica formadora del gel con su respectivo peine.
5. Gel de agarosa al 1.5% en TBE 0.5X
6. TBE buffer, 10X: Tris 108g , ácido bórico 55g y EDTA 0.5M con un pH= 8.0
7. 1 litro de agua destilada
8. Bromuro de etidio, 10mg/ml
9. Buffer de carga del gel, 6X
10. Marcador de peso molecular 100pb
11. Muestras de E. coli extraídas
12. Micropipeta
13. Puntas para Micropipeta
Procedimiento
1. Tape los extremos de la bandeja con cinta aislante, colóquela en una superficie
plana y horizontal.
2. Prepare suficiente Tampón TBE 0.5X (150ml) para llenar el tanque
electroforético, asegúrese que sea el mismo utilizado para preparar el gel.
3. Lleve la agarosa a ebullición; dejar enfriar a 60°C posteriormente agregar el
bromuro de etidio (Concentración final de 0.5µg/ml) y mezcle bien.
4. Colocar el peine 0.5-1.0 mm arriba del fondo de la bandeja y vierta la agarosa.
Dejar solidificar a temperatura ambiente. El gel debe tener de 3 a 5 mm de grosor.
5. Una vez solidificado retire la cinta aislante y sumergir el gel en el tanque
electroforético y retirar el peine.
6. Agregue suficiente Tampón TBE 0.5X para cubrir el gel aproximadamente 1 mm.
7. Prepare las muestras de ADN a analizar agregándoles buffer de carga.
8. Utilizando una micropipeta, aplique despacio en cada uno de los diferentes
pocillos del gel sumergido 10 µl de las muestras preparadas y en los extremos
colocar los marcadores de peso molecular y de concentración.
9. Tape el tanque electroforético y conectar los electrodos de manera que el ADN
migre hacia el ánodo (polo positivo, terminal roja) seguidamente aplique un
voltaje de 1-5 V/cm, para los minigeles se aplican 100V por 30 minutos. El azul
de bromofenol en la solución de cargada marca el frente de la electroforesis.
10. Desconecte la fuente de tensión, y saque el gel de la bandeja, visualícelo con el
transiluminador de UV (Utilizando gafas protectoras) (ANEXO 2).
Bibliografía
Angulo, S. (22 de Octubre de 2011). Producción Biotecnologica de Agarosa. Recuperado el 08
de Mayo de 2017, de Electroforesis: Origen, Uso y Aplicaciones con gel de agarosa :
http://agarosabiotecnologia.blogspot.com/
Tamay de Díos, L., Ibarra, C., & Velasquillo, C. (2013). Fundamentos de la reacción en cadena
de la polimerasa (PCR) y de la PCR en tiempo real. Tecnologia en salud, medigraphic,
2(2); 70-78.
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Práctica 3:
Técnicas para el análisis y determinación de ácidos nucleicos
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Enliste e ilustre el equipo, los reactivos y materiales utilizados durante la práctica. Describa
la función de cada uno.
III. Método
En un flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que realizó durante la práctica.
IV. ACTIVIDADES
a) Describa con sus propias palabras la importancia del uso y empleo de técnicas
moleculares como herramientas en su campo laboral.
b) Cálculos:
Escriba los cálculos realizados durante la práctica para preparar los reactivos
utilizados
c) Calcule el tamaño del ADN desconocido (pb) comparándolo con el marcador de peso
molecular (100 pb).
a)
b)
2
c)
a)
b)
3
c)
a)
b)
4
c)
d) Esquematice cada uno de las fases para llevar a cabo los ciclos de la PCR e indique lo
más importante en cada etapa, y el aparato utilizado para realizarla.
Paso Fase Descripción
V. DISCUSIÓN
Haga una breve comparación entre los protocolos que se le presentan en el manual
y los que ha investigado (Electroforesis en gel de poliacrilamida).
Utilice las siguientes preguntas como una guía para estructurar su discusión
¿Qué diferencias y similitudes hay?
¿De qué depende la selección de un protocolo en particular?
¿Cómo escogería un protocolo para su propia investigación?
VI. CONCLUSIONES
1
VII. CUESTIONARIO
1. ¿A qué se denomina técnicas de biología molecular?
2. ¿Describa los principales tipos de electroforesis?
3. ¿Qué nuevas técnicas de aplicación existen para la determinación de ácidos
nucleicos?
Introducción
Los genomas procariotas formados por ADN prácticamente carecen de exceso de ADN,
casi todo el ADN codifica ARN o proteínas tiene un espaciamiento mínimo entre las
unidades de transcripción. Además, genes que intervienen en los mismos procesos
biológicos por lo general se agrupan en un solo conjunto para permitir la regulación
coordinada de su expresión. Por lo que los genes que codifican las enzimas de una vía
metabólica suelen agruparse formando un complejo funcional conocido como Operón
(Karp, 2003). Los genes que integran esta unidad se controlan de manera coordinada
mediante un mecanismo que Francois Jacob y Jacques Monod, del Instituto Pasteur en
París, describieron por primera vez en 1961. Un operón bacteriano típico consta de genes
estructurales, un promotor, una región operadora y un gen regulador (Anexo 3) (Karp,
2003).
Gen regulador: codifica la proteína reguladora (Represor o Inductor)
Región promotora: es el sitio donde la ARN polimerasa se une al ADN antes de iniciar
la transcripción.
Región operadora: Sirve como sitio de unión para una proteína llamada represor. Esta
es un ejemplo de proteína reguladora de genes (un polipéptido que reconoce una
secuencia específica dentro del ADN se une a esta con gran afinidad).
Genes estructurales: Codifican proteínas con función específica, estos suelen yacer uno
junto al otro, la ARN polimerasa se mueve de un gen estructural al siguiente,
transcribiéndolos en un solo ARNm policistrónico, el cual es luego traducido en
múltiples enzimas individuales
La capacidad del represor para unirse con el operador e inhibir la transcripción depende de
su conformación, que es regulada de manera alostérica por un compuesto clave en la vía
metabólica, la concentración de este componente metabólico es la que determina si el
operador se encuentra activo o inactivo en un momento dado(Karp, 2003).
En bacterias se conocen diferentes mecanismos de regulación de la transcripción y todos
ellos se ven afectados por el medio ambiente en el que el microorganismo está creciendo.
En el mecanismo llamado control negativo, la acción de represores inhibe la síntesis de
ARN mensajero (ARNm). Dentro de este mecanismo puede haber una inducción o
represión enzimática (Moreno & Gorriti, 2014).
Si el producto de la catálisis de una enzima está presente en el medio y la enzima no es
sintetizada se habla de represión enzimática. Es el caso de las enzimas implicadas en la
síntesis de aminoácidos (aa), purinas y pirimidinas. El fenómeno de inducción enzimática es
aquel en el cual la síntesis de una enzima sólo tiene lugar cuando su sustrato está presente.
Por ejemplo, la enzima β-galactosidasa, implicada en la utilización de lactosa, no se
sintetiza si la lactosa está ausente. Las enzimas implicadas en el catabolismo de fuentes de
carbono y energía son a menudo inducibles (Moreno & Gorriti, 2014).
La molécula que inicia la inducción de la síntesis de una enzima se llama inductor, y una
molécula que reprime la síntesis se llama correpresor. No todos los inductores y
correpresores son sustratos o productos finales (Moreno & Gorriti, 2014).
En el mecanismo llamado control positivo, una proteína reguladora promueve la unión de la
ARN polimerasa, lo que incrementa la síntesis de ARNm (Moreno & Gorriti, 2014).
Operón Lactosa
Es un grupo de genes que regula la producción de enzimas necesarias para degradar lactosa
en las células bacterianas. Éste es un ejemplo de operón inducible (Karp, 2003).
Este operón está compuesto por los típicos genes y regiones reguladoras. Los genes
estructurales del operón lactosa son los siguientes:
Este fenómeno es conocido como represión por catabolito, la cual consiste en una
activación de la transcripción debido a los bajos niveles de glucosa, este control es regulado
por los niveles intracelulares de AMP cíclico (AMPc), un subproducto del catabolismo de la
glucosa. En E. coli los niveles de AMPc son bajos cuando los niveles intracelulares de
glucosa son altos (Mathews, et. al, 2000).
Cuando los niveles de glucosa decaen, los niveles de AMPc aumentan desencadenando la
activación del operón lactosa, debido a la interacción de este con la proteína activadora de
catabolitos (CAP). Cuando esta se une al AMPc, CAP sufre un cambio conformacional que
incrementa su afinidad por ciertos sitios de ADN, esta unión facilita la transcripción del
operón lactosa estimulando la unión entre a ARN Polimerasa y el sitio promotor (Mathews,
et. al, 2000).
Objetivos
Conocer los elementos que integran el operón de la lactosa.
Conocer la función de los elementos que integran el operón lactosa
Entender el funcionamiento del operón de la lactosa en presencia y ausencia de
lactosa mediante un ensayo con E. coli.
Comprender el concepto de represión catabólica y el proceso mediante el cual se
lleva a cabo.
Material y equipo
Inducción Operón Lactosa en medio líquido
Cultivo de E. coli W3110 en medio M9-glicerol.
5 Tubos para microcentrifuga de 1.5 mL (estériles)
Gradilla para microtubos
Mechero
Micropipeta con capacidad de 200-1000 L
Micropipeta con capacidad de 50-200 L
Micropipeta con capacidad de 10 a 50 L
Caja de puntas para micropipeta de 200 L
Caja de puntas para micropipeta de 1000 L
Centrífuga clínica
Incubadora a 37ºC
1 tubo con medio M9-glicerol estéril
Solución de glucosa al 2% estéril
Solución de lactosa al 2% estéril
Solución de glucosa 2% + lactosa 2% estéril
Amortiguador Z (Na2HPO4-7H2O 60 mM, NaH2PO4-H2O 40 mM, KCl 10
mM, MgSO4-7H2O 1mM, -mercaptoetanol 50 mM, pH 7.0).
Reactivo ONPG (Orto-Nitrofenil Galactosa). El reactivo es incoloro y
debe prepararse justo antes de usarse para mejores resultados.
SDS al 0.1%
Na2CO3 1M
Cloroformo
Colocar 1 mL / Tubo
Decantar el sobrenadante
Interpretación de resultados
Pico alcalino/fondo ácido (pico rojo/fondo amarillo): el microorganismo solamente
fermenta la glucosa.
Pico ácido/fondo ácido (pico amarillo/fondo amarillo): el microorganismo fermenta
glucosa, y lactosa.
Pico alcalino/fondo alcalino (pico rojo/fondo rojo): el microorganismo es no
fermentador de azúcares.
La presencia de burbujas, o ruptura del medio de cultivo, indica que el microorganismo
produce gas.
El ennegrecimiento del medio indica que el microorganismo produce ácido sulfhídrico.
Bibliografía
Karp, G. (2003). Biología Celular y Molecular: Conceptos y experimentos. Séptima
edición. McGraw-Hill Interamericana. 432- 434 ISBN: 978-1118-20673-7
Mathews, C., Holde, K., Ahern, K. (2000). Biochemistry. Tercera edición.
Benjamin/Cummings Publishing. Canadá. 997-1003. ISBN 0-8053-3066-6
Weaver, R. (1999). Molecular Biology. McGraw-Hill Interamericana.180-191 ISBN: 0-
07-115641-0
Moreno, J.; Gorriti, M. (2014). Transcriptómica Procariota: mecanismos de expresión y su
regulación. Serie Bioquímica y Biología Molecular. 7 (5): 1-14
Nieto, S. (2013). Manual de prácticas de laboratorio Bioquímica Experimental.
Regulación genética en el Operón Lac. Facultad de Química, UNAM. Ciudad
Universitaria. México. 59-63
Ramos, J., García-Salamanca, A., Molina-Santiago, C., and Udaondo, Z. (2013). Operón.
Brenner’s Encyclopedia of Genetics, 2 (5). 176-180
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Práctica 4:
Regulación Génica
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III. MÉTODO
En un flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que realizó durante la práctica.
IV. ACTIVIDADES
a) Interpretación de resultados
Describa los resultados obtenidos, indicando cambios de coloración y reacción
bioquímica surgida en los tubos de ensayo.
- Operón histidina
- Profago λ:
V. DISCUSIÓN
Haga una comparación entre Operón Lactosa y Operón Triptófano.
Utilice las siguientes preguntas como una guía para estructurar su discusión
VI. CONCLUSIONES
1
3
VII. CUESTIONARIO
Objetivos
1. Describir cada una de las fases de la mitosis
2. Describir cada una de las fases de la meiosis
3. Reconocer la importancia de la recombinación genética
Materiales y equipo
Elaboración de placas Mitosis
Cebolla mediana
Placa Petri
Papel toalla
Fijador Carnoy (Metanol: ácido acético 3:1)
Orceína acética 1.5%
Porta objetos
Cubre objetos
Mechero de alcohol
Vidrio de reloj
Beaker
Microscopio
Estilete
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Instructor:
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Sección de Laboratorio:
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Sección de Teoría:
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Fecha:
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III. Método
En forma de flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que
realizó durante la práctica
IV. Actividades
a) Cálculos
Escriba los cálculos realizados durante la práctica para preparar los
reactivos utilizados
b) Registro de Observaciones
Dibuje y coloree lo que se pide a continuación. Agregar una pequeña
descripción de cada etapa.
Actividad 1. Esquema del Ciclo celular
Actividad 2. Placas Mitosis
PROFASE ANAFASE
METAFASE TELOFASE
PROFASE I ANAFASE I
METAFASE I TELOFASE I
METAFASE II TELOFASE II
Número de Células
Total
Grupo Interfase Profase Metafase Anafase Telofase TOTAL
Mitosis
1
2
3
Promedio
VII. CUESTIONARIO
1. Explique la importancia biológica de la mitosis y la meiosis
2. Elabore un cuadro sobre diferencias entre mitosis y meiosis.
3. ¿Explique qué es el núcleo, su importancia para la célula y su constitución?
4. ¿Cuáles serían las células del organismo humano que tendrían una mitosis frecuente?
5. ¿Qué es la recombinación meiótica y cuál es su importancia biológica?
6. ¿Cuál es la función de las proteínas Cinasas durante el ciclo celular?
7. ¿Cuál es la función de las proteínas Ciclinas durante el ciclo celular?
8. Mencione cuatro mecanismos distintos por los que una Cdk puede desactivarse
9. En humanos existen tipos celulares especializados que no se dividen en condiciones
normales, pero al recibir un estímulo adecuado inician síntesis de ADN y división celular.
¿Cuáles son esas células y cuál es el estímulo necesario?
10. ¿En qué patologías indicaría usted un estudio citogenético?
Introducción
El término mutación se define como una alteración permanente en la estructura del ADN
que produce una copia errónea de información durante la replicación del ADN, generando
así productos genéticos anormales. El daño producido en el ADN, y su consecuente efecto
mutagénico, es considerado un inductor de la pérdida de control de crecimiento celular,
generando así tumores. Sin embargo, el simple daño al ADN es considerado necesario, pero
no suficiente para generar tumorogénesis. Esto se debe a que además del daño al ADN, la
proliferación celular descontrolada es necesaria para el inicio del proceso de tumorogénesis.
Los agentes que provocan daños en el ADN pueden ser de naturaleza exógena o endógena.
Los mecanismos endógenos de daño más frecuentes incluyen la desanimación y
despurinación del ADN, la formación de radicales libres de oxígeno como subproductos de
procesos bioquímicos del cuerpo (Poirier & Weston, 2002).
Entre los mecanismos de daño exógenos son comunes la exposición a radiación
(Ultravioleta, rayos X), exposición a Radón, nitroaminas, ureas, óxidos de etileno,
Aromáticos de hidrocarburos policíclicos y ozono. La mayoría de los reactivos exógenos
son inertes y requieren de una activación metabólica para reaccionar con el ADN mediante
metabolitos intermedios y reaccionar con bases específicas del ADN (Poirier & Weston,
2002).
El efecto de estos agentes va desde crear entrecruzamientos de enlaces químicos entre
diferentes moléculas, rupturas de hebras de ADN hasta aberraciones cromosómicas (Poirier
& Weston, 2002).
Las mutaciones solo son heredables cuando afecten a las células germinales; si
afectan a las células somáticas se extinguen, por lo general con el individuo, a
menos de que se trate de un organismo con reproducción asexual. Se distinguen tres
tipos de mutaciones según la extensión del material genético afectado (Ramil,
2010):
La capacidad inherente del ADN de reparar y remover el daño producido en sí, esta
capacidad es de mucha importancia en el mantenimiento de la integridad y estabilidad
génica. La disminución en l capacidad de reparación del ADN es asociada con
carcinogénesis, defectos de nacimiento, envejecimiento celular prematuro y escaza
esperanza de vida (Poirier & Weston, 2002).
Los mecanismos de reparación de ADN se clasifican en dos grandes grupos:
a) Mecanismo Por Reversión de la Lesión o Reparación Directa: esta es realizada por
la acción de una única enzima capaz de reparar la lesión, sin necesidad de substituir
la base dañada. De esta manera se revierte la lesión de la estructura original de la
molécula del ADN. Entre los mecanismos de reparación directa más conocidos se
encuentra:
La fotorreactivación: La radiación UV puede ocasionar la formación de
dímeros de pirimidinas ciclobutano, pirimidina y pirimidonina. Alterando
así el proceso de replicación, transcripción y traducción del ADN, el
aumento en la aparición de mutaciones, la detención del ciclo celular y la
muerte celular. Estos efectos son invertidos por fotorreactivación, proceso
que es catalizado por una enzima fotoliasa, que posee dos cromóforos que
captan un fotón, cuya energía es utilizada para revertir el dímero, es decir
quiebra el enlace covalente entre las pirimidinas reparando el daño en el
ADN. Las fotoliasas han sido encontradas en bacterias, hongos, plantas y
vertebrados, excepto en mamíferos placentarios (Tafurt & Marín, 2014).
b) Mecanismo por Sistemas de Reparación Indirecta
Son aquellos que intervienen sobre el ADN, durante la replicación, transcripción o
sobre hebras de ADN fragmentadas. La ADN polimerasa y algunos de los
componentes moleculares del mecanismo de replicación, llevan a cabo la
supervisión de la copia recién sintetizada. Entre los principales mecanismos de
reparación directa tenemos:
Reparación por Escisión de Bases (BER): Es una vía de reparación del ADN
que corrige daños oxidativos, derivados de la alquilación celular y
despurinizaciones espontáneas. Es utilizada por la célula para la protección
contra daños y pérdidas de bases generando sitios apurínicos o
apirimidínicos. la base alterada es retirada del ADN por enzimas llamadas
glicosilasas, en células de mamíferos existen 11 diferentes tipos de
glicosilasas que presentan características y modos de acción diferentes.
Reparación por escisión de nucleótidos (NER): Repara daños en el ADN
causados por la radiación UV, agentes mutagénico y quimioterapia. En este
mecanismo de reparación participan diferentes proteínas, 4 en procariotas
(UvrA, UvrB, UvrC y UvrD) y más de 30 en mamíferos. El complejo de
polipéptidos (UvrABC) actúa como endonucleasa, localizando la lesión y
removiendo los nucleótidos con daño, la polimerasa agrega los nucleótidos
correctos que luego son unidos por la ligasa.
Reparación por apareamiento erróneo (MMR): es responsable de remover
las bases desapareadas, causadas por daños espontáneos, desaminación de
bases, oxidación, metilación y daños en los procesos de replicación o
recombinación. Los individuos con mutaciones relacionadas al MMR,
presentan una alta predisposición de tumores, síndromes y cáncer. El MMR
en eucariotas y en la mayoría de las bacterias dirige la reparación de la hebra
con error, mediante el reconocimiento de las discontinuidades de cadena
(Tafurt & Marín, 2014)
Materiales y Equipo
Inducción de Mutación en Cepas de Escherichia coli
Frotis de Micronúcleos
Muestra de mucosa bucal
Cubreobjetos
Portaobjetos
Etanol al 70%
Metanol absoluto
Buffer Sorensen 1:1
Agua Pura
Agua destilada
Giemsa
Pipeta
Papel toalla
Viñetas
Palillo de madera estéril
Vaso Coplin
Entellán
Aceite de Inmersión
Microscopio
Procedimiento
Inducción de Mutación en Cepas de Escherichia coli
1. Suspender 50 gramos del medio de agar en 1 litro de agua destilada.
2. Agitar y llevar a autoclave a 121 °C durante 15 minutos.
3. Dejar enfriar a 45 ºC y distribuir en las placas Petri estériles con 20ml en
cada una de ellas.
4. Dejar solidificar las placas parcialmente destapadas.
5. Proceder a realizar la siembra de la bacteria a utilizar (E.coli), colocar frente
al mechero la muestra y el resto del material necesario (tubos, placas, etc.) de
manera que sea fácilmente accesible.
6. Tomar el asa de siembra y flamear hasta que el filamento alcance un rojo
incandescente y dejar enfriar unos 10 segundos en la proximidad de la llama.
7. Sembrar la bacteria utilizando el método de Frobisher.
8. Una vez realizada la transferencia, tapar las placas y rotularla, incubarlas en
posición invertida a 37 ºC de 18 a 24 horas.
9. Verificar el crecimiento adecuado de la bacteria.
10. Posteriormente someter a la bacterias a la radiación ultravioleta generada por
la cámara de flujo laminar variando el tiempo entre 5 a 15 minutos.
11. Luego de exponerla a rayos UV, durante ese periodo exponer a luz visible
para activar el mecanismo de reparación y observar levemente el aumento de
recuperación de la población.
Frotis de Micronúcleos
1. Limpiar el portaobjetos con etanol al 70% y papel toalla
2. Rotular con lápiz grafito y viñetas
3. Con un palillo estéril, tomar muestra de mucosa bocal y dispersarlo sobre el
porta objetos
4. Sumergir en Vaso Coplin con metanol absoluto, durante 10 minutos,
asegurarse que la muestra quede completamente cubierta
5. Sacar la placa y esperar unos minutos a que se seque
6. Preparar el tinte Giemsa al 4% diluyéndolo en buffer Sorensen
7. Sumergir en solución Giemsa 4% durante 20 minutos
8. Sumergir en agua pura durante 10 segundos, haciendo movimientos
circulares
9. Sumergir en agua estéril durante 10 segundos, haciendo movimientos
circulares
10. Dejar secar durante un día y luego sellar la placa con cubreobjetos
11. Observar al microscopio
Bibliografía
Poirier, M.; Weston, A. (2002). DNA Damage, DNA Repair, and Mutagenesis.
Encyclopedia of Cancer. 2(2). 79–87
Ramil, J. (2010). Mutación. Colegio Tirso de Molina. [En línea]. Recuperado de:
http://www.tirsoferrol.org/ciencias/pdf/a10_mutacion.pdf
Universidad Nacional Autónoma de Honduras
Facultad de Ciencias
Escuela de Biología
Laboratorio de Genética
(BI – 223)
Práctica 6:
Mutagénesis
Nombre:
____________________________
Número de Cuenta:
____________________________
Instructor:
___________________________
Sección de Laboratorio:
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Sección de Teoría:
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Fecha:
___________________________
III. MÉTODO
En forma de flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que
realizó durante la práctica
IV. ACTIVIDADES
a) Cálculos
Escriba los cálculos realizados durante la práctica para preparar los
reactivos utilizados
Crecimiento normal Exp. Luz UV 2-5 min Luz UV 2 min + Luz visible
Interpretación:
c) Registro de Observaciones
Dibuje y coloree lo que se pide a continuación. Agregar una pequeña
descripción de cada una.
Placa micronúcleos
Aumento: ________________
Aumento: ________________
Palabras:
1. Mutación 7. Aniridia 13. Aborto
2. Anencefalia 8. Lanugo 14. Óbito
3. Onfalocele 9. Epicanto 15. NOVO
4. Teratógeno 10. Rubéola 16. Hipospadia
5. Ptosis 11. Somática 17. FDA
6. Genotóxico 12. ADN
VI. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres (3) conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1
3
VIII. CUESTIONARIO
1. ¿Qué son los micronúcleos y cómo se forman?
2. ¿qué es una mutación de NOVO?
3. ¿Explique en qué consiste la herencia multifactorial, de ejemplos?
4. Explique el mecanismo de reparación de ADN por fotoreactivación
5. Explique el mecanismo de reparación de ADN por escisión de Bases
6. Explique el mecanismo de reparación de ADN por escisión de Nucleótidos
7. Enumere los mecanismos de teratogénesis
8. Enumere los principios básicos de la teratogenia
9. ¿Cuál es el período más crítico del desarrollo intrauterino, explique?
10. Enumere 5 agentes farmacológicos, compuestos químicos e infecciosos causantes
de malformaciones congénitas
11. ¿Qué son los agentes Carcinogénicos endógenos, de ejemplos?
12. ¿Qué son los agentes Carcinogénicos exógenos, de ejemplos?
13. Investigue 5 pictogramas de uso común en el laboratorio, de una pequeña
descripción de cada uno.
IX. REFERENCIAS
PRÁCTICA 7
GENOMAS: ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL
MATERIAL GENÉTICO
Introducción
El último cuarto de siglo se ha caracterizado por los avances en la secuenciación
de genomas completos y sobre esto, el descubrimiento de la disposición y función
de genes específicos. En esta última década se ha producido un progreso notable
en el conocimiento comprensión de la estructura y comprensión de la estructura
del genoma humano principalmente gracias al desarrollo del Proyecto Genoma
Humano (PGH). Este proyecto internacional comenzó oficialmente en 1990 y ya
en Junio del 2000, cinco años antes del plazo fijado inicialmente, la meta principal
del Proyecto se había cumplido ya que el 90% de los 3.000 millones de pares de
bases nucleótidos que componen el genoma humano estaba secuenciado (IHGSC,
2001).
Actualmente se continua trabajando para terminar la secuenciación y se están
realizando comparaciones con otros genomas ya conocidos (Genómica
Comparada).Entre los principales hallazgos realizados por el PGH se encuentran
los siguientes hallazgos: a) la distribución cromosómica de los genes que codifican
para proteínas o RNA, es altamente heterogénea; b) la proporción del DNA total
que contiene genes codificantes es extraordinariamente baja (menos del 2% del
DNA total); c) el DNA que se encuentra localizado entre los genes es muy diverso
(IHGSC, 2001).El primero de los aportes mencionados implica que las regiones
del genoma con características similares de densidad génica, replicación o
expresión, no están repartidas de manera aleatoria en el genoma sino que tienden a
agruparse en sectores específicos de este. Esta organización funcional del genoma
se correlaciona directamente con la organización que adquiere para la división
celular, como lo relevan los patrones de bandas claras (G-) y oscuras (G+) de los
cromosomas metafásicos, donde estas bandas representan compartimentos
genómicos con propiedades estructurales y funcionales distintas (Universidad de
Chile, 2001).
Paralelamente al Proyecto Genoma Humano se están llevando a cabo otros
Proyectos Genomas en una serie de organismos procariotes y eucariotes, los que se
encuentran en distintas etapas de avance. El análisis del conjunto de los resultados
que están emergiendo de los distintos Proyectos Genomas es de gran importancia
para el desarrollo futuro de la genómica, disponer de bases de datos importantes
sobre la localización de genes y segmentos de DNA no codificantes y comprender
como el genoma de los distintos organismos está siendo remodelado en el
transcurso de la evolución.
Objetivos
1. Establecer la variación del tamaño del genoma y su relación con el número
de genes codificantes y la complejidad de los organismos, en procariotes y
distintos grupos de eucariotas, incluido el hombre.
2. Reconocer patrones de distribución de: secuencias codificantes, pares de
bases nucleótidas G-C y A-T e islas CpG, en diferentes compartimientos
cromosómicos humanos.
3. Manejar la terminología utilizada en el mapeo genético y citogenético.
Materiales y equipo
1. Tablas del número de genes codificantes estimados y tamaños genómicos en
procariotas y eucariotas.
2. Poster: mapa cromosómico y molecular del cromosoma 21 humano.
3. Regla
4. Calculadora
5. Papel Milimetrado
Procedimiento
1. Tamaño Genómico: La paradoja del valor de cDNA
El tamaño del genoma nuclear es un rasgo generalmente constante para la
especie, en células que tengan el mismo nivel de ploidia y que estén en la
misma etapa del ciclo celular. Este carácter presenta un espectacular rango
de variación entre los organismos, de aproximadamente seis órdenes de
magnitud, si se consideran virus, bacterias, vegetales y animales.
Actualmente y como consecuencia del desarrollo de los distintos Proyectos
Genomas, se ha estimado el número de genes codificantes para proteínas, de
distintos organismos procariotes y eucariotes de tamaño genómico conocido
(Tabla 1 y 2). El número de genes codificantes por genoma puede
considerarse como un estimador adecuado del grado de complejidad de los
organismos involucrados.
1-. A continuación se le presentan las tablas con la información de número
de genes y tamaño genómico, de ciertos grupos tanto de procariotas como
eucariotas, revise cuidadosamente la información y luego establezca
comparaciones entre el tamaño genómico de grupos procariotas y eucariotas.
2-. Determine el grado de variabilidad de los tamaños genómicos y número
de genes entre estos grupos, cuáles aparecen más conservados y establezca la
relación que existe entre la cantidad de ADN y el grado de complejidad de
estos organismos.
TABLA 1. Número de genes codificantes estimados y tamaños
genómicos en procariotas
Procariotas cDNA* Nº de
genes
(estimados)
Buchnera species 640.681 564
Chlamydia pneumoniae 1.230.230 1.052
Haemophilus influenzae 1.830.138 1.709
Helicobacter pylori 1.667.867 1.566
Mycobacterium tuberculosis 4.411.529 3.918
Mycoplasma pneumonia 816.394 677
Neisseria meningitidis 2.272.351 2.025
Staphylococcus aureus 2.813.641 2.595
Streptococcus pneumoniae 2.160.837 2.094
Xilella fastidiosa 2.679.306 2.766
2. Heterogeneidad genómica
1-. Actualmente se conocen los mapas genéticos y citogeneticos de la
mayoría de los cromosomas humanos. Para la realización de esta actividad
se utilizará el mapa del cromosoma 21 humano, el que se ha reproducido en
un poster. (Este mapa está disponible en la red en la siguiente dirección:
http://www.nature.com/ nature/journal/v405/n6784/pdf/405311_figure1).
En el poster, aparecen representados los siguientes componentes del
cromosoma 21 humano:
las bandas G+ y G-
la localización de los genes conocidos en las dos hebras del DNA (+) y (-)
la localización de las islas CpG a lo largo del cromosoma
Analice la estructura del cromosoma 21 (Anexo 6). Identifique las bandas
claras y oscuras que lo conforman; determine el tamaño en Mb del
cromosoma y de cada uno de sus brazos. Reconozca la localización de los
genes y de las islas CpG del cromosoma y calcule la densidad promedio de
éstas, según estén localizadas en bandas G+ o G-.
2-. Utilizando la figura (Anexo 7), en la que se representan los mapas
genéticos y citogenéticos de todos los cromosomas humanos, calcule la
densidad génica de cada uno de ellos, considerando para esto sólo los genes
conocidos.
Bibliografía
1.- International Human Genome Sequencing Consortium.(2001) “Initial
sequencing and analysis of the human genome”. Nature. Vol. 409. 860 - 921.
2.- Universidad de Chile. (2011). Manual de Prácticas de Laboratorio de
Genética Médica. Facultad de Medicina.
3.- Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii
K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien
S, Blechschmidt K, Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson
D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal
A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine
K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer
K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser
J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer
S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo
ML;.(2000). The DNA sequence of human chromosome 21. Nature ; 405: 311-319.
4.- Ensembl. Human Chromosomes. http://www.ensemble.org/
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(BI – 223)
Práctica 7:
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Número de Cuenta:
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Sección de Laboratorio:
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Sección de Teoría:
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Fecha:
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IV. ACTIVIDADES
b) Según sus respuestas anteriores, ¿Qué se entiende entonces por paradoja del
valor cDNA? Explique y fundamente.
2. Heterogeneidad genómica
2.1 Según la información en el mapa ¿Cuántos Mb de DNA tiene el brazo
largo (brazo q) del cromosoma 21 humano?
2.5 ¿Qué relación general puede establecer entre la densidad de los genes y la de
las islas CpG? Dé una explicación funcional para la relación encontrada.
IV. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres (3) conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1.
2.
3.
V. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
PRÁCTICA 8
CULTIVO CELULAR
Introducción
Materiales y equipo
Autoclave
Tubos heparinizados
4 Tubos de cultivo de 15 ml
Micropipetas
Puntas para micropipetas
Incubadora
Cámara de flujo laminar
Medio de cultivo RPMI-1640
Suero fetal bovino 20%
Fitohemaglutinina 2%
Antibiótico (Penicilina/Estreptomicina) 0,5%
Jeringa
Nombre:
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Número de Cuenta:
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Instructor:
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Sección de Laboratorio:
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Sección de Teoría:
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Fecha:
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III. MÉTODO
En forma de flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que
realizó durante la práctica
IV. ACTIVIDADES
a) Mediante dibujo e ilustraciones explique la reacción que sucede dentro de
los tubos en los pasos seguidos durante el establecimiento del cultivo celular
de linfocitos.
Enfermedad Locus
V. DISCUSIÓN
Haga una breve comparación sobre las cultivo de células animales y
cultivo de células vegetales.
VI. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres (3) conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1.
2.
3.
VII. CUESTIONARIO
1.¿Qué son las células totipotenciales?
2.¿Qué son las células pluripotenciales?
3.¿Qué órganos humanos poseen células madres?
4.¿Qué es la senescencia celular?
5.¿Qué son las líneas celulares continuas?
6.¿Qué son los cultivos histotípicos?
7. ¿Qué son los cultivos organotípicos?
8.¿Qué es la morfogénesis celular?
9.¿Qué es la ecología celular?
10. Explique la micropropagación vegetal
11. ¿Qué es la criopreservación celular?
12. Explique el mecanismo de clonación exvivo
Introducción
En 1880 el biólogo Alemán Wather Flemming y otros biólogos Europeos llegaron a la
concusión que cualquier factor que gobernara las características de la herencia debía pasar
de una célula a otra y de una generación a otra, ya que durante la división celular el
material del núcleo se organizaba en “Filamentos” visibles que posteriormente fueron
llamados Cromosomas (Karp, 2010).
Las células humanas promedio tienen 6400 millones de pares de bases, divididos entre 46
cromosomas (Ver anexo 4), los cromosomas se componen de ADN y proteínas
relacionadas, que en conjunto se conocen como cromatina. El empaquetamiento de este
ADN depende de proteínas que poseen un contenido inusualmente alto de arginina y lisina,
estas proteínas reciben el nombre de histonas. Estas empaquetan al ADN en varios niveles
siendo el máximo los cromosomas mitóticos (Karp, 2010).
Los extremos de los cromosomas se denominan telómeros, estos desempeñan una función
importante en el mantenimiento de la integridad cromosómica Cada cromosoma posee una
hendidura llamada centrómero, (Karp, 2010).
Una vez terminada la mitosis la mayor parte de la cromatina regresa a su condición de
interfase difusa. Pero cerca del 10% de la cromatina permanece condensada durante esta
etapa, esta recibe el nombre de heterocromatina, para distinguirla de la eucromatina, la cual
retorna a un estado disperso. La heterocromatina se divide en dos clases:
Heterocromatina constitutiva, esta permanece en estado compactado en todas las células
durante todo el tiempo y representa al ADN que no se transcribe. En mamíferos la mayoría
de la heterocromatina constitutiva se encuentra en los telómeros y centrómero, así como en
la parte distal del brazo del cromosoma Y (Karp, 2010).
La heterocromatina facultativa es cromatina que se ha inactivado de manera específica
durante la formación de ciertas fases de la vida de un organismo o en ciertos tipos de
células diferenciadas. Un ejemplo de esta puede observarse al comparar células de
mamíferos hembras con células de machos. La células de machos poseen un par de
cromosomas sexuales XY, en el cual el cromosoma Y es mucho más pequeño y con menor
densidad génica que el X, Es por ello que los machos poseen solo una copia de la mayoría
de los genes que portan en el par sexual. Las hembras en cambio poseen dos copias, al
poseer dos cromosomas X, sim embargo sólo uno de ellos tiene actividad transcripcional.
El otro cromosoma X permanece condensado como un cúmulo de heterocromatina llamada
corpúsculo de Barr. La formación de este asegura que las células de hembras y machos
tengan la misma cantidad de cromosomas X activos y sinteticen cantidades equivalentes de
producto génico. En 1961, Mary Lyon estudió más a fondo este fenómeno y propuso los
siguientes preceptos sobre su inactivación:
1. La heterocromatización del cromosoma X en mamíferos ocurre durante la fase
temprana del desarrollo embrionario (día 16) y conduce a la inactivación e los genes
en ese cromosoma.
2. La heterocromatización en el embrión es un proceso aleatorio, los cromosomas
maternos y paternos tienen la misma probabilidad de inactivarse en cualquier
células determinada. Una vez que se inactiva un cromosoma X, su estado
heterocromático se transmite a través de muchas generaciones de división celular.
3. La reactivación del cromosoma X heterocromático tiene lugar en células germinales
antes del inicio de la meiosis
El mecanismo que ocasiona la inactivación del cromosoma X se produce gracias a un ARN
no codificador que se transmite desde uno de los genes (XIST en humanos) en el
cromosoma X que se inactiva. Este gen es necesario para iniciar la inactivación, pero se
cree que la inactivación se mantiene debido a la metilación del ADN y las modificaciones
de Histonas (Karp, 2010).
Los cromosomas mitóticos pueden visualizarse al degradar células que se detuvieron en la
mitosis y después teñirlas para identificar cromosomas con patrones de bandas predecibles.
Si se fotografían y organizan a los cromosomas de una célula, en pares homólogos, y se
ordenan según su tamaño de mayor a menor se obtiene una preparación denominada
Cariograma (Karp, 2010).
Las células de la glándula salival de la larva Drosophila contienen cromosomas casi 100
veces más gruesos que los observados en la mayoría del resto de células del organismo.
Durante el desarrollo larvario estas células dejan de dividirse, pero mantienen su
crecimiento. La replicación del ADN continúa y provee el material genético necesario para
mantener los altos niveles de activad de las células gigantes. Las hebras de ADN
permanecen unidas y crean un cromosoma gigante llamado cromosoma politénico, este
contiene hasta 1024 veces el número de cadenas de ADN que los cromosomas normales
(Karp, 2010).
Objetivos
Identificar células metafásicas animales a partir de técnicas de tinción.
Identificar células metafásicas vegetales a partir de técnicas de tinción.
Identificar las características de los cromosomas gigantes a partir de técnicas
de tinción y placas fijas
Reconocer la importancia médica de la identificación del Corpúsculo de
Barr
Identificar cromosomas humanos mediante el desarrollo de ideogramas a
partir de grupos de cromosomas humanos
Materiales y equipo
Beaker
Termómetro
Porta objetos
Cubre objetos
Mechero
Papel filtro
Aceite de inmersión
Ápice radicular de Allium cepa o Allium sativum
8-Hidroxiquinoleína
Fijador Farmer (Etanol 96%:Ácido acético 3:1)
Ácido clorhídrico 1N
Reactivo de Schiff
Ácido acético 45%
Entellán
1. Tres horas antes de finalizar el ciclo de incubación del cultivo celular de linfocitos
(48 o 72 horas), agregar a cada tubo 100µl de Colcemide a concentración de
10µg/ml (Realizar este procedimiento en la cámara de flujo laminar).
2. Llevar a la incubadora a 37 °C durante 3 horas
3. Centrifugar el cultivo a 800 rpm por 6 minutos
4. Utilizando pipeta Pasteur estéril, eliminar el sobrenadante, dejando 0,3 a 0,5 ml del
mismo sobre el botón.
5. Agregar 5 ml de KCl 0,075M, resuspender el botón utilizado el vortex
6. Dejar reposar el cultivo 6 minutos a 37°C.
7. Centrifugar a 800 rpm por 12 minutos, eliminar el sobrenadante dejando
aproximadamente 0,3 ml del mismo sobre el botón.
8. Resuspender el botón con el vórtex, y agregar Metanol - Ácido acético (3:1) 1 ml
por vez, hasta llegar al total de 5 ml para fijar las células, agitando simultáneamente
con el vórtex.
9. Dejar fijando la muestra a 4°C durante la noche (overnight).
10. Al día siguiente centrifugar a 800 rpm por 6 minutos y lavar con el fijador (se
recomienda hacer este procedimiento un par de veces más, hasta que la muestra esté
clara).
11. Gotear la muestra en portaobjetos previamente limpios y rotulados.
12. Teñir con Giemsa al 4% en tampón fosfato pH 6,8 (buffer Sörensen), durante 15 –
20 minutos, dejando secar por 1 día más.
13. Cubrir las muestras de forma permanente con cubre objetos, utilizando Entellan
diluido en Xilol, como adhesivo.
14. Dejar secar las placas por 24 horas. Observar al microscopio.
Bibliografía
1. Bedoya, G.; Barrera, L. (1980). Estudio de algunos aspectos morfológicos en
cromosomas politénicos. Revista de Actualidades Biológicas. 9(31): 16-24
2. García, A. (1990) Técnicas y procedimientos de citogenética vegetal. Colegio de
Postgraduados. Montecillos. Tercera edición. Pp. 57-65, 85-86
3. Karp, G. (2010). Biología Celular y Molecular Conceptos y Experimento.
Séptima edición. McGraw-Hill Interamericana Editores. México D.F. (388-394,
498-499, 542-543)
4. Ferrera, A., Rodríguez, I & Fontecha, G. (2010). Manual de laboratorio de
Genética. UNAH, Facultad de Ciencias, Escuelas de Microbiología y Biología.
Tegucigalpa, Honduras
5. Erazo, A. 2014. Manual de Laboratorio de Genética Médica. UNAH,
Facultad de Ciencias, Escuela de Biología. Tegucigalpa, Honduras
Universidad Nacional Autónoma de Honduras
Facultad de Ciencias
Escuela de Biología
Laboratorio de Genética
(BI – 223)
Práctica 9:
Técnicas citogenéticas
Nombre:
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Número de Cuenta:
____________________________
Instructor:
___________________________
Sección de Laboratorio:
___________________________
Sección de Teoría:
___________________________
Fecha:
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III. MÉTODO
En forma de flujograma dibuje y describa los pasos fundamentales que
realizó durante la práctica
IV. ACTIVIDADES
a) Registro de Observaciones
Dibuje y coloree lo que se pide a continuación.
Agregar una pequeña descripción de cada una.
Aumento: ____________
Aumento: ____________ Especie: _____________
Especie: _____________
b) Cálculo de índice mitótico
Establezca el recuento de células observadas en la placa en el
microscopio
Metafases Apoptosis No proliferantes
Campo 1 Campo 2 Campo 3 Campo 1 Campo 2 Campo 3 Campo 1 Campo 2 Campo 3
Grupo 1
Grupo 2
Grupo 3
Promedio
CORPÚSCULO DE BARR
Aumento: __________________
c) Cuadro sinóptico de aberraciones cromosómicas
d) Análisis de Idiograma
VI. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1
3
VII. CUESTIONARIO
Introducción
Cualquier característica en los organismos es resultado de una interacción de
grado variable entre la información genética contenida en el ADN y los
factores ambientales que actúan sobre el organismo, es decir el fenotipo la
interacción del genotipo con el ambiente. Características de tipo cualitativas
como forma de lóbulo de oreja y pico de viuda poseen fenotipos fácilmente
identificables, el ambiente tiene poco o ninguna influencia en su expresión y
por lo general son controladas por un solo gen. Las características de tipo
cuantitativo como altura y peso son aquellas que muestran un rango continuo
de variación fenotípica y su expresión es altamente influenciada por el
ambiente, con frecuencia están determinadas por la interacción de varios
genes a la vez.
El conocimiento de los principios en los que se basa la transmisión de las
características biológicas se debe a los experimentos de Gregorio Mendel
con plantas de guisantes, Mendel seleccionó 14 variedades de plantas
homocigotas, uniformes y constantes en las características, cada una de ellas
mostraba dos formas alternativas distintas y perfectamente distinguibles
determinada por factores abstractos “genes” que podían existir en estados
alternativos “alelos”. Los resultados de su trabajo revelaron que básicamente
hay dos alelos para un gen, el normal o silvestre y el anormal o mutado.
Mendel también denominó como fenotipo dominante a la forma del carácter
que aparecía en la F1 y fenotipo recesivo aquel que no se manifestaba en la
F1, pero que volvía aparecer en la F2. Las características que expresan este
tipo de patrón presentan herencia mendeliana, donde el alelo dominante
manifiesta su carácter sea en estado homocigoto o en estado heterocigoto,
impidiendo en este último la expresión correspondiente al alelo recesivo,
manifestando una interacción de dominancia completa; por lo que también
se le domina herencia con dominancia completa. La clasificación de la
herencia mendeliana dependerá de dos factores, el primero se refiere al
cromosoma donde se encuentre localizado el gen estudiado y segundo por su
expresión fenotípica, tomando en cuenta estos factores pueden ser
clasificadas en
a. Autosómicas dominantes y recesivas
b. Ligadas al sexo dominantes y recesivas.
Objetivos
1. Conocer conceptos básicos de transmisión de características hereditarias
2. Determinar el patrón de herencia de algunas características en una muestra
poblacional humana
3. Estimar las frecuencias fenotípica, alélica y genotípica de los sistemas
ABO y Rh basado en la ecuación Hardy-Weinberg
Materiales y equipo
1. Tiras de papel para detectar PTC
2. 10 lupas
3. Caja de hisopos
4. portaobjetos
5. Lancetas desechables estériles
6. Algodón
7. Alcohol antiséptico
8. Palillos
9. Sueros: Anti-A, Anti-B y Anti-D
10. Calculadora
11. Lápiz grafito
Procedimiento
Parte I.
Usando la información descrita en el siguiente cuadro y con la explicación
brindada por el instructor, determine entre sus compañeros de sección de
laboratorio la frecuencia de los fenotipos dominantes y recesivos de cada una
de las características y los genotipos.
Parte II.
La determinación del equilibrio Hardy-Weinberg se evaluará con los dos
sistemas de tipeaje sanguíneo más utilizados en humanos; el sistema ABO y
el sistema Rh. El sistema ABO se caracteriza por la existencia de dos
antígenos llamados A y B en la superficie de los glóbulos rojos, la herencia
de los fenotipos depende de tres alelos LA, LB y l. Los alelos LA, LB son
responsables de la producción de los antígenos A y B respectivamente y son
codominantes entre ellos. El alelo l es incapaz de producir antígeno y se
comporta como recesivo frente a los otros dos.
El sistema Rh es genéticamente complejo, los genes responsables de la
producción de antígenos Rh son dos y presentan alelismo múltiple. A pesar
de ello se puede describir con base a la presencia de un solo antígeno,
codificado por el gen RhD que posee alelos D y d.
Para desarrollar esta parte de la práctica, primero debemos determinar el tipo
sanguíneo de todos los estudiantes de la sección de laboratorio. Si usted
conoce su tipo sanguíneo repórtelo a su instructor para realizar el conteo, si
no lo conoce o no tiene certeza absoluta deberá realizar el siguiente
procedimiento:
1. Limpie con alcohol el dedo
2. Luego pinchar con una lanceta estéril.
3. Descartar la primera gota y recoger las tres siguientes en una lámina
porta-objetos, por separado.
4. Agregar una gota de suero anti-A, a la primera gota, anti-B a la
segunda y anti Rh a la tercera.
5. Utilizando un palillo diferente mezclar cada gota de sangre con su
respectivo reactivo haciendo movimientos laterales suaves.
6. Observar si se produce o no aglutinación y registrar los resultados
7. Registrar los fenotipos de la muestra poblacional (estudiantes sección
de laboratorio) en el cuadro correspondiente.
p+q+r=1
Al existir tres alelos para el sistema ABO las posibilidades de combinaciones
para estos alelos en la población se extiende al trinomio (p + q + r) 2 = p2 +
2pq + q2 + r2 + 2pr + 2qr.
Para calcular las frecuencias alélicas de los alelos LA, Lb y l el análisis inicia
con el cálculo del alelo “l”, responsable de la expresión del tipo sanguíneo
“O”
Entonces r = ˅ FF O
Los individuos que tienen tipo A y O en la población están representados por
las combinaciones de los alelos p y r en el binomio
p = 1- r
Entonces si p + q + r = 1
q = 1- p - r
Para calcular las frecuencias genotípicas del sistema ABO, utilice la fórmula
p2 + 2pq + q2 + r2 + 2pr + 2qr.
Para el cálculo de las frecuencias fenotípicas, alélicas y genotípicas del
sistema Rh utilice las formulas según el binomio cuadrado perfecto
Recuerde que los individuos con Rh-, cuyo genotipo es dd, corresponde a q2
Despeje q = ˅ FF Rh- y esta será la frecuencia del alelo “d”
Bibliografía
1. Baptista Gonzales H. (2004). Actualidades en el sistema Rh-Hr.
Gac.Med. Mex. Vol 140, 37-40. Recuperado de
http://www.medigraphic.com/pdfs/gaceta/gm-2004/gms043k.pdf.
2. Jímenez C. B. Espino Nuño F.J. (2012). Genética: conceptos
esenciales. Madrid, España. Médica Panamericana..
3. Lantigua Cruz A. ed. (2006). Introducción a la genética médica. La
Habana, Cuba. Editorial Ciencias Médicas.
4. Solari A. (2004). Genética humana, fundamentos y aplicaciones en
medicina. Buenos Aires, Argentina. Médica Panamericana.
5. Stephen Wooding S. Kim U. Bamshad M. J. Larsen J. Jorde L.B. and
Drayna D. (2004). Natural selection and molecular evolution in PTC, a
bitter-taste receptor gene. Am. J. Hum. Genet. 74:637–646.
Universidad Nacional Autónoma de Honduras
Facultad de Ciencias
Escuela de Biología
Laboratorio de Genética
(BI – 223)
Práctica 10:
Patrones de herencia y análisis de poblaciones
Nombre:
____________________________
Número de Cuenta:
____________________________
Instructor:
___________________________
Sección de Laboratorio:
___________________________
Sección de Teoría:
___________________________
Fecha:
___________________________
III. MÉTODO
Dibuje y describa la estructura molecular del sistema ABO y Rh, así
como la reacción bioquímica generada al contacto con los sueros
utilizados en la práctica.
IV. ACTIVIDADES
a) Registro de Observaciones
Registre el número de individuos que presentan el fenotipo dominante y recesivo de cada una de
las características estudiadas, calcule la frecuencia de los fenotipos dominantes y recesivos y
establezca los genotipos,
3 Enrollamiento de la
lengua
4 Pelos en la segunda
falange de los dedos de la
mano
5 Dedos entrelazados
6 Camptodactilia
7 Hiperextensibilidad del
dedo pulgar
8 Consistencia de cerumen
9 Hoyuelo en el mentón
10 Pico de viuda
Sistema Rh
Fenotipo 1 Fenotipo 2
Frecuencia
fenotípica
Frecuencia
genotípica
Frecuencia
alélica
V. DISCUSIÓN
Haga una breve comparación entre Fenotipo sanguíneo O y Fenotipo
Bombay
VI. CONCLUSIONES
Escriba un mínimo de tres conclusiones que puede realizar al finalizar la
práctica.
1
VII. CUESTIONARIO
Metacéntrico y
Submetacéntrico. Son las
A Grandes
tres primeras parejas de
cromosomas homólogos
1 y 3 metacéntricos, 2 submetacéntrico.
Submetacéntrico. Son
grandes, pero algo más
B Grandes
pequeños que los del
grupo A
Submetacéntrico. Este
grupo presenta dificultad
para distinguir
C Medianos cromosomas entre sí, por
ejemplo, el cromosoma X
es muy parecido al
cromosoma 6.
Acrocéntricos. El
cromosoma 13 tiene un
notorio satélite en el brazo
D Medianos
corto y el 14 tiene un
satélite muy pequeño en
su brazo corto.
Submetacéntricos. Son
E Pequeños algo más cortos que los
del grupo D.
Tamaño: 248,956,422 pb Tamaño: 242,193,529 pb Tamaño: 198,295,559 pb Tamaño: 190,214,555 pb Tamaño: 181,538,259 pb
Genes Codificantes: 2,050 Genes Codificantes: 1,301 Genes Codificantes: 1,079 Genes Codificantes: 753 Genes Codificantes: 884
Genes no Codificantes: 1,949 Genes no Codificantes: 1,578 Genes no Codificantes: 1,147 Genes no Codificantes: 963 Genes no Codificantes: 1,187
Pseudogenes: 1,285 Pseudogenes: 1,075 Pseudogenes: 796 Pseudogenes: 756 Pseudogenes: 734
Tamaño: 170,805,979 pb Tamaño: 159,345,973 pb Tamaño: 145,138,636 pb Tamaño: 138,394,717 pb Tamaño: 133,797,422 pb
Genes codificantes: 1,045 Genes codificantes: 992 Genes codificantes: 685 Genes codificantes: 778 Genes codificantes: 731
Genes no codificantes: 997 Genes no codificantes: 970 Genes no codificantes: 1,021 Genes no codificantes: 780 Genes no codificantes: 881
Pseudogenes: 828 Pseudogenes: 916 Pseudogenes: 649 Pseudogenes: 697 Pseudogenes: 597
Tamaño: 135,086,622 pb Tamaño: 133,275,309 pb Tamaño: 114,364,328 pb Tamaño: 107,043,718 pb Tamaño: 101,991,189 pb
Genes codificantes: 1,316 Genes codificantes: 1,036 Genes codificantes: 321 Genes codificantes: 820 Genes codificantes: 616
Genes no codificantes: 1,057 Genes no codificantes: 1,181 Genes no codificantes: 591 Genes no codificantes: 861 Genes no codificantes: 990
Pseudogenes: 835 Pseudogenes: 653 Pseudogenes: 395 Pseudogenes: 529 Pseudogenes: 525
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Genes codificantes: 862 Genes codificantes: 1,188 Genes codificantes: 269 Genes codificantes: 1,474 Genes codificantes: 543
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Pseudogenes: 503 Pseudogenes: 546 Pseudogenes: 259 Pseudogenes: 528 Pseudogenes: 264
Tamaño: 46,709,983 pb Tamaño: 50,818,468 pb Tamaño: 156,040,895 pb Tamaño: 57,227,415 pb Tamaño: 16,569 pb
Genes Codificantes: 232 Genes Codificantes: 492 Genes Codificantes: 846 Genes Codificantes: 63 Genes Codificantes: 13
Genes No Codificantes: 398 Genes No Codificantes: 512 Genes No Codificantes: 621 Genes No Codificantes: 100 Genes No Codificantes: 24
Pseudogenes: 188 Pseudogenes: 339 Pseudogenes: 892 Pseudogenes: 400