Tema 8 - Bioenergética
Tema 8 - Bioenergética
Tema 8 - Bioenergética
Es el estudio de las transformaciones de energía que tienen lugar en las células, así como la naturaleza y
la función de los procesos químicos sobre los que se basan. La materia viva desarrollan trabajo para el
mantenimiento de su estructura: síntesis de macromoléculas, movimiento, gradientes, generación de calor,
etc. Esto supone transformar la energía de los combustibles y luz solar para adecuarla a la generación de
estos diversos tipos de trabajo.
Las leyes de la termodinámica se relacionan en la expresión de la energía libre de Gibbs (ΔG), siendo
sus unidades kJ/mol.
ΔH: variación de entalpía (calor interno del sistema).
T: temperatura absoluta
ΔS: variación de entropía (desorden del sistema)
ΔG = ΔH - TΔS
La composición del sistema reaccionante cambia hasta encontrar el equilibrio (reacción espontánea). La
constante de equilibrio en el que la velocidad directa y la reversa son iguales (sin cambio neto en el
sistema) viene definida por la concentración y proporción de los reactivos y productos:
[𝐶]𝑐 [𝐷]𝑑
aA + bB ⇋ cC + dD Keq = [𝐴]𝑎[𝐵]𝑏
Sin embargo, esta tendencia al cambio no quiere decir que sea una reacción rápida. Las enzimas ayudan
a que ocurran a una velocidad adecuada y compatible con la vida sin modificar las constantes de
equilibrio ni hacer favorables reacciones desfavorables.
La tendencia a alcanzar el equilibrio es una fuerza motriz cuya magnitud se expresa como la variación
de energía libre de la reacción (ΔG).
Las condiciones estándar de reacción son: una temperatura de 298K (25ºC), concentraciones de reactivos
y productos de 1M y, en el caso de que los reaccionantes fueran gases, su presión debería ser de 1atm.
Se trataría de una ΔGº estándar.
Una concentración 1M de protones (muy implicados en las reacciones biológicas) supondrían un
pH= - log [H+] = - log 1 → pH = 0, valor muy alejado de las condiciones biológicas. Además, muchas
de las reacciones son acuosas (diluídas en agua). En muchas reacciones también interviene el Mg2+(se
encuentra en el ATP). Debido a estas tres características especiales de las reacciones biológicas, se
establecen unas condiciones estándar transformadas: el pH=7 ( [H+] = 10-7 ), la [H2O] = 55’5M y la [Mg2+]
= 1mM (las condiciones de Tª y p se mantienen iguales que en las generales). Hablaríamos en este caso
de ΔG’º y de K’eq, que se relacionan mediante la expresión:
R : 8’315 J/molK
ΔG’º = -RT lnK’eq
[𝐶]𝑐 [𝐷]𝑑
ΔG = ΔG’º + RT ln[𝐴]𝑎[𝐵]𝑏
, siendo las concentraciones las del inicio de la reacción y en condiciones estándar transformadas.
Si los reactivos están en mayor cantidad que los productos (dando cociente < 1), el logaritmo sería < 0.
Si su valor multiplicado por RT es el suficiente como para compensar la positividad de ΔG’º, entonces
ΔG < 0 (reacción en condiciones reales es espontánea). A esto se le denomina efecto de acción de masas.
- Los cambios de ΔG (tanto estándar como reales) son aditivos cuando hay intermediario común (el
producto de una reacción sea el reactivo de otra):
A→B ΔG’º1
B→C ΔG’º2
Suma: A→C ΔG’º1 + ΔG’º2
De esta forma, si el proceso A→B es endergónico (ΔG1 > 0) puede ser compensado con B→C
exergónico (ΔG’º2 < 0) si|𝛥𝐺′º1|>|𝛥𝐺′º2|, resultando en una ΔG’ºtotal < 0 (exergónico). La K’eq de la
reacción acoplada es resultado del producto de las K’eq de los dos procesos.
Un ejemplo son las reacciones acopladas: la síntesis de glucosa-6-fosfato a partir de fosfato libre es un
proceso endergónico (tanto en condiciones estándar como en reales), por lo que no ocurriría nunca en la
célula. La hidrólisis del ATP para dar ADP y fosfato libre es un proceso exergónico, y la célula acopla
los dos procesos para obtener un proceso exergónico. En lugar de usar el fosfato libre se usa el transferido
desde el ATP.
TRANSFERENCIA DE GRUPO Pi
Normalmente cuando participa en un proceso acoplado se divide en dos partes. La primera en la que se
transfiere algún grupo del ATP a la molécula sustrato y luego posteriormente una segunda en la que se
elimina el grupo transferido. Por ejemplo: el glutamato recibe el grupo Pi en su carbono 5, lo que activa
el grupo carboxilo y le permite unirse al grupo amino, desplazando el Pi, y dar lugar a la glutamina. Otro
ejemplo de proceso en el que sucede esto es la bomba del Na-K.
HIDRÓLISIS DIRECTA
En algunos de casos si que se lleva a cabo por una simple hidrólisis. Serían la contracción muscular, el
cambio conformacional de proteínas, el movimiento de moléculas a lo largo del ADN o ARN, etc.
UNIÓN AL Mg+2
El ATP se encuentra normalmente interaccionando con Mg+2 que apantalla parcialmente su carga
negativa, de modo que pueden existir diferentes formas de ATP y de ADP. El ATP puede estar unido a un
Mg+2 y tener dos cargas negativas (MgATP-2) o estar unido a dos y ser neutro (Mg2ATP) entre otras
formas diferentes, al igual que el ADP. En las ecuaciones del equilibrio se considera al ATP como una
especie única.
Por eso cuando las células están en un estado energético adecuado, [ATP] >> [ADP] + [AMP] . Así
cuando se consume mucho ATP es una señal para activar las rutas productoras de energía de la célula y
al contrario cuando el ATP aumenta. Supone una regulación del metabolismo energético en las células.
Las dos primeras moléculas son intermediarios de la glucólisis y de energía súper elevada. Transfieren
su grupo Pi al ADP para la síntesis de ATP (molécula de energía intermedia).
FOSFOENOLPIRUVATO
La estabilización por tautomerización del piruvato de su forma enol a la ceto (incremento de entropía al
pasar de poder estar en solo una forma a poder estar en dos) y por resonancia del Pi, hacen que el
fosfoenolpiruvato libere el doble de energía que el ATP.
FOSFOCREATINA
Funciona como reservorio de energía en el músculo. Su hidrólisis libera una gran cantidad de energía.
Además, se estabilizan por resonancia tanto el Pi como la creatina (los tres grupos amino que lo forman).
Esto permite que cuando se consume el ATP celular, el grupo Pi de esta molécula se transfiera al ADP
para que pueda volver a ser usado en la contracción muscular.
1,3-BIFOSFOGLICERATO
En la hidrólisis del enlace fosfoanhidro se estabilizan por resonancia tanto el Pi como el grupo carboxilo
del 3-fosfoglicerato.
ACETIL-COA
Molécula con enlaces tioéster que es intermediario en rutas del metabolismo de los ácidos grasos.
En ciertas bacterias y levaduras el polyP también funciona como reservorio de energía. Tiene las enzimas
necesarias para su síntesis y para transferir Pi al ADP para la formación del ATP. Las moléculas capaces
de realizar esta función son llamadas fosfágenos. En las plantas hay una enzima adaptada a la
fosforilación a partir de PPi, lo que puede ser un vestigio de la función de los polyP como reservorios.
REACCIONES DE OXIDACIÓN-REDUCCIÓN
La energía conservada en los enlaces del ATP procede de este tipo de mecanismos. En estas reacciones
el flujo de electrones de moléculas con menor afinidad a moléculas con mayor afinidad genera una fuerza
electromotriz que se canaliza a la síntesis de ATP.
Reacción inorgánica: el Fe2+ está más reducido que el Fe2+, y le transfiere un electrón al Cu2+. Se oxida
el Fe y se reduce el Cu.
Fe2+ + Cu2+ ⇋ Fe3+ + Cu+
EQUIVALENTES DE REDUCCIÓN
En bioquímica para simplificar se habla de transferencias de uno, dos o tres equivalentes de reducción.
Pueden ser transferidos por cualquiera de las cuatro vías anteriores. La mayor parte se conducen por dos
equivalentes de reducción (como en el caso de la reducción del oxígeno y la oxidación enzimática de los
combustibles biológicos).
Cuando comparte un par de e-, es desigual hacia el átomo más electronegativo. En orden creciente están
el H < C < S < N < O. La forma metano (CH4) sería la más reducida (8 e-) y la del CO2 la más oxidada
(pérdida efectiva de todos los e-). Hay estados de oxidación intermedios a estos dos (alqueno, alcohol,
alquino, aldehído, cetona y ácido carboxílico). Cuando un C reacciona con otro, los electrones quedan
compartidos entre los dos, “perdiendo” cada uno de ellos un e-. Muchas de las reacciones de oxidación
consisten en pérdidas de H por parte del carbono, llevado a cabo por las deshidrogenasas.
Si en una disolución se encuentran dos pares redox conjugados, se puede producir de forma espontánea
la transferencia de electrones del donador al aceptor. La tendencia depende de la afinidad relativa por los
electrones de cada aceptor en cada uno de los pares (E’0). Experimentalmente se toma un par de referencia
para observar la dirección del flujo de e-. El par de referencia elegido es el H+ + e- ⇋ ½H2. Para él se
determina un E0 = 0 V en condiciones estándar. Cuando se conecta a la semirreacción de estudio (en
condiciones biológicas) mediante un circuito externo que nos permite conocer el movimiento de e-. Éstos
tienden a fluir desde la semicelda con el E0 más bajo a la del más elevado.
El O2 es el que tiene más afinidad que el resto de las moléculas participantes en las reacciones
bioquímicas.
ECUACIÓN DE NERNST
Las concentraciones diferentes a las estandar afectan al E0. La siguiente reacción relaciona los E0 con
las concentraciones reales para el aceptor y donador de electrones (SABER).
F: cte. de Faraday = 96480 J/Vmol
R: cte. de los gases = 8’315 J/molK
n: número de e- transferidos
𝑅𝑇 [𝑎𝑐𝑒𝑝𝑡𝑜𝑟]
E = E0 + ln
𝑛𝐹 [𝑟𝑒𝑐𝑒𝑝𝑡𝑜𝑟]
El conocimiento del E0 permite comparar los pares redox y predecir hacia dónde fluirán los e- si los
ponemos en contacto. El movimiento de e- genera energía cuantificable en forma de ΔG0.
La ΔE0 entre las dos semirreacciones que están en contacto se expresa por convención como la diferencia
del E0 del aceptor de electrones menos el del donante. Este valor se puede relacionar con ΔG0:
n: número de e- transferidos en la reacción
ΔG0= -nFΔE0
En condiciones no estándar se calcula primero el potencial de reducción (E) de cada uno de los pares
redox, se determina ΔE, y se calcula la energía libre de Gibbs.
FLUJOS DE ELECTRONES Y ENERGÍA EN LAS CÉLULAS
En un organismo heterotrófico se produce la combustión de nutrientes, con lo que los reducen y pasan a
productos de tamaño mucho menor. Se transfieren los electrones de los nutrientes que contienen energía
hacia el oxígeno. Si fuese una combustión directa, la cantidad de energía liberada no sería asumible por
el organismo, por lo que se realizan mediante múltiples pasos (catabolismo), de los que muchos son
oxidaciones, que conllevan la transferencia de sus electrones a transportadores con carácter de enzima
(dinucleótidos de adenina y nicotinamida o los de flavina). Los e- transferidos al NAD+, NADP+ y FAD+
son usados en la síntesis del ATP durante la fosforilación oxidativa (se acopla al proceso de ADP +
HPO42- → ATP). También se usan en los procesos metabólicos, con los que se consiguen macromoléculas
a partir de moléculas muy simples (en vegetales incluso inorgánicas).
COENZIMAS DE OXIDO-REDUCCIÓN
El dinucleótido de nicotinamida y adenina (NAD+) y su versión fosforilada (NADP+) son solubles y
difunden de unas enzimas a otras. Consisten en un nucleótido de adenina unido por un enlace
fosfoanhidro a otro de nicotinamida. El NADP+ presenta el C2’ de la ribosa de la adenina fosforilada, lo
que le confiere diferencias funcionales. La nicotinamida puede sufrir reducciones reversibles. Cuando
está oxidado (NAD+ o NADP+) presenta una carga positiva en el grupo amino del anillo, y al reducirse
capta un ión hidruro (H-) a partir de dos H (dos e-, un H+ lo mantiene y otro lo libera al agua). Es un
proceso reversible, cuando se oxida transfiere eses dos e- y H+ (más uno del medio) en forma de dos H a
la molécula que va a reducir. El + indicado en la forma oxidada no indica la carga neta de la molécula, si
no que está en su forma oxidada. Una vez reducidos pasan a ser NADH o NADPH y transportan dos
equivalentes reductores (2 e-). El par NAD+/NADPH interviene en enzimas deshidrogenasas relacionadas
con procesos oxidativos de sustratos mientras que el NADP+/NADPH participa en reacciones anabólicas
reductoras. Pocas enzimas las usan de forma indistinta.
Los nucleótidos de flavina puede ser de dos tipos:
- FAD: dinucleótido de flavina (con el azúcar abierto) y adenina (con el azúcar cíclico), unidos por un
enlace fosfoanhidro.
- FMN: mononucleótido de flavina con en azúcar abierto.
El anillo de la flavina (procediente de la vitamina riboflavina) es el que experimenta la redox cíclica.
Puede captar un H (1H+ y 1e-) o dos (2H+ y 2e-), por lo que tenemos una forma semiquinona (parcialmente
reducida) de FADH+ o FMNH+ y otra completamente reducida de FADH2 o FMNH2. Esto les confiere
una gran versatilidad al poder participar en transferencias de uno o dos equivalentes reducciones. No son
coenzimas hidrosolubles y las enzimas a las que pertenecen son denominadas flavoproteínas (coenzima
fuertemente unida al centro activo). Son usadas como centro de almacenamiento temporal de los e- y las
flavoproteínas usan dos sustratos: uno que será oxidado (sus e- se transfieren a la coenzima) y otro que
entra en el centro activo para ser reducido por los e- almacenados.