UNIDAD 6

Naomi Jimenez Benitez Num.Control:20091300

Introducción.
Un grupo de varias bases, llamado codón, es necesario para especificar un aminoácido
individual.
Un código de tripletes, es decir, uno de 3 bases por cada codón, es mas que suficiente para
especificar todos los aminoácidos, dado que hay 4^3 =64 tripletes de bases diferentes.
En un termino que se toma prestado de las matemáticas, se dice que este código este
degenerado.

Los codones son tripletes que se leen secuencialmente.

Francis Crick y Sídney Brenner, encontraron que una mutación que resultaba de la deleción
de un nucleótido podía anular la función de un gen especifico. Sin embargo, una segunda
mutación, en la cual un nucleótido se insertaba en una posición distinta pero cercana, podía
restituir la función génica, se dice que estas dos mutaciones son supresoras entre sí.
La inserción deleción de un nucleótido desplaza el marco de lectura en el cual los nucleótidos
sucesivos son leídos como codones. Por lo tanto, las inserciones o deleciones de nucleótidos
sucesivos se conocen como mutaciones del marco de lectura.

El código genético fue descifrado sistemáticamente.

Cada tRNA contiene una secuencia de trinucleotidos, su anticodón, complementario de un
codón de Mrna que especifica el aminoácido del tRNA. Empleaban la polinucleótida
fosforilasa, una enzima del Azotobacter vinelandii que une nucleótidos sin emplear un molde

El código genético este degenerado y no es al azar.

1. El código esta muy degenerado. Tres aminoácidos (Arg, Leu y Ser) son especificados
cada uno por seis codones distintos, y la mayoría del resto lo son por cuatro, tres o
dos codones. Solo Met y Trp, dos de los aminoácidos menos frecuentes en las
proteínas están representados por un único codón. Los codones que especifican el
mismo aminoácido se denominan sinónimos.
2. La disposición de la tabla de código es aleatoria.
3. UAG, UAA y UGA son codones de terminación. Estos tres codones (conocidos
también como codones sin sentido) no especifican aminoácidos sino que dan la señal
al ribosoma para terminar la elongación de la cadena polipeptídica.
 4. AUG y GUG son codones de iniciación. Los codones AUG, y con menor frecuencia
GUG, especifican el punto de iniciación de la síntesis de la cadena polipeptídica. Sin
embargo, también especifican los aminoácidos Met y Val, respectivamente, en
posiciones internas en las cadenas de polipéptidos.

ARN de transferencia y su amino acilación

En 1965, después de un esfuerzo que requirió siete años, Robert Holley dio a conocer la
primera secuencia de bases conocidas para un acido nucleico de importancia biológica,
el Trna de la alanina, 76 residuos, en las levaduras. Iniciando desde el extremo 5’, tienen
las siguientes características en común:
1. Un grupo de fosfato 5’- terminal.
2. Un tallo de 7pb que incluye el nucleótido 5’-terminal y que puede contener pares de
bases no Watson- Crick como la G.U.
3. Un tallo de 3 o 4 pb que termina en un bucle de 5 a 7 nt, que a menudo contiene la
base modificada dihidrouridina (D).
4. Un tallo de 5pb que termina en un bucle que contiene el anticodón.

Las aminoacil-Trna sintetasas unen los aminoácidos al Trna.

Hay dos clases de aminoacil- Trna sintetasas:
Clase I y clase II
• Motivos estructurales
• Reconocimiento del anticodón
• Sitio de la amino acilación
• Especifica del aminoácido

Las aminoacil-Trna sintetasas reconocen características estructurales

únicas del Trna.
En primer lugar, todos los Trna tienen estructuras similares, de modo que las características
que los diferencian deben ser variaciones sutiles en la secuencia o la estructura local. Por otra
parte, dado que el código genético este degenerado, más de un Trna puede portar un
determinado aminoácido. Los miembros de cada conjunto de los asi llamados Trna
isoaceptores deben ser todos reconocidos por sus aaRS relacionadas.

Las claves para comprender la especificación de las interacciones Trna sintetasa han sido
recabadas de estudios que emplearon fragmentos de Trna, Trna alterados por mutaciones,
agentes de entrecruzamiento químico, comparaciones de secuencias hechas mediante
ordenador y cristalografía de rayos X.
Las sintetasas que interactúan tanto como el anticodón como el tallo aceptor deben tener un
tamaño y una estructura adecuados para unirse a ambas patas del Trna con forma de L. Esto
es evidente en el complejo de la glutamil-trna sintetasa con el trnaGln y el ATP de la E.coli,
determinados por Thomas Seitz; dicho complejo fue el primero del que se conoció la
estructura. La GlnRS es una enzima clase I monomérica de 553 residuos; tiene una forma
alargada, de modo que se une al anticodón cerca de un extremo de la proteína y al tallo
aceptor cerca del otro.

Hipótesis del titubeo o balanceo (wobble).

Al combinar el conocimiento estructural con la deducción lógica, Crick propuso la hipótesis
del titubeo (también conocida como del balanceo, tambaleo o wobble) para explicar de que
modo un Trna puede reconocer varios codones degenerados.

Los Ribosomas
Los ribosomas, pequeños orgánulos que en una ocasión se pensó que eran artificios de la lisis
celular, fueron identificados como el sitio de la síntesis de proteínas en1955 por Paul
Zamecnik, quien demostró que los aminoácidos marcados con C14 se asocian de modo
transitorio con los ribosomas antes de aparecer en proteínas libres. El ribosoma es enorme y
complejo. Esta complejidad es necesaria para que el ribosoma lleve a cabo las siguientes
funciones vitales:
1. Se une al mRNA de modo tal que sus codones puedan ser leídos con alta fidelidad.
2. Incluye sitios de unión específicos para las moléculas de Trna.
3. Media las interacciones de factores proteicos no ribosómicos que promueven la
iniciación, la elongación y la terminación de la cadena polipeptídica.
4. Cataliza la formación de enlaces peptídicos.
5. Se mueve de modo tal que puede traducir codones secuenciales.

El ribosoma procarionte consiste en dos subunidades.

Tradicionalmente, los componentes ribosómicos se describen en términos de su velocidad de
sedimentación en una ultracentrífuga, lo que se correlaciona a grandes rasgos con su tamaño.
Así, el ribosoma intacto de E. coli tiene un coeficiente de sedimentación de 70S.
Traducción
Para apreciar el modo en el cual el ribosoma orquesta la traducción del Mrna para sintetizar
polipéptidos, resulta útil asimilar los siguientes puntos:
1. La síntesis de los polipéptidos procede desde el extremo N- terminal al C-terminal,
es decir, la actividad de peptidil transferasa une un aminoácido entrante al extremo
C-terminal del polipéptido creciente.
2. La elongación de la cadena ocurre por la unión al polipéptido creciente del residuo
de aminoácido de un Trna.
3. Los ribosomas leen el Mrna en la dirección 5’- 3. Esto se demostró mediante el uso
de un sistema de síntesis de proteínas libre de células, en el cual Mrna era poli (A)
con un C 3’-terminal:
5’ A-A-A-…-A-A-A-C 3’
4. La traducción activa ocurre en los polisomas.

La iniciación de la cadena requiere un Tarn iniciador y factores de

iniciación
La primera indicación del modo en que los ribosomas inician la síntesis de los polipéptidos
fue la observación de que casi la mitad de las proteínas de E. coli comienzan con el bastante
poco común residuo de aminoácido Met.

La iniciación requiere factores proteicos solubles.

La iniciación de la traducción en la E. coli es un proceso complejo en el cual las dos
subunidades del ribosoma y el fMet-TRNAfMet se ensamblan en un MRNA adecuadamente
alineado para formar un complejo que puede comenzar la elongación de la cadena.

El ribosoma decodifica el MRNA, cataliza la formación de enlaces

peptídicos y luego se traslada al codón siguiente.
Los ribosomas alargan las cadenas polipeptídicas en un ciclo de reacción de tres etapas:
1. Decodificación, en la cual el ribosoma selecciona y une un aminoacil- TRNA cuyo
anticodón es complementario con el codón de MRNA en el sitio A.
2. Transpeptidación, o formación de enlace peptídico, en el cual el grupo peptidilo del
sitio P del TRNA es transferido al grupo amino acilo del sitio A.
3. Translocación, en la cual los TRNA de los sitios P y A son transferidos,
respectivamente, a los sitios P y E acompañados de su MRNA unido; es decir, el
MRNA, junto con sus TRNA apareados por las bases, es desplazado a través del
ribosoma por un codón.
Los factores de liberación terminan la traducción
La síntesis polipeptídica bajo la dirección de un MRNA sintético, tal como un poli(U), resulta
en un peptidil-TRNA ´´atascado´´ en el ribosoma. Sin embargo, la traducción de los MRNA
naturales, que contienen codones de terminación UAA, UGA o UAG, produce polipéptidos
libres. En la E. coli, los codones de terminación, que normalmente carecen de TRNA
correspondientes son reconocidos por factores de liberación proteicos: el RF-1 reconoce
UAA y UAG, mientras que el RF-2 con una identidad de 39% con él anterior reconoce UAA
y UGA. En los eucariontes, un factor de liberación único, el Erf1, reconoce los tres codones
de terminación.

El RRF se une en el sitio A del ribosoma.

La estructura por difracción de rayos X del factor de reciclado de la eubacteria T.
thermophilus, determinada por Yoshikazu Nakamura, revela una estructura de dos dominios,
globalmente similar al TRNA. La comparación de esta estructura con la de los RRF de varias
otras bacterias indica que los dos nexos que conectan a los dominios de RRF son flexibles,
de modo tal que el dominio II puede rotar alrededor del eje de la triple hélice que forma el
dominio I.

Procesamiento postraduccional.
El túnel que lleva desde el sitio activo de la peptidil transferasa hasta el exterior del ribosoma
bacteriano tiene ~ 100 A° de longitud, lo suficiente para albergar un polipéptido de ~ 30
residuos. Una vez que sale el ribosoma, el polipéptido enfrenta dos desafíos: como plegarse
de modo adecuado y como llegar a su destino celular final. Ambos procesos ocurren con la
ayuda de otras proteínas. Además, un polipéptido naciente puede ser modificado
covalentemente antes de alcanzar su forma madura.

Las chaperonas asociadas al ribosoma ayudan a las proteínas a plegarse

El túnel de salida de polipéptidos de los ribosomas es demasiado estrecho para permitir la
formación de una estructura secundaria distinta de las hélices, de modo que un polipéptido
naciente no puede comenzar a plegarse antes de salir del ribosoma. Sin embargo, el
plegamiento se inicia mucho antes de que la traducción se haya completado. Las chaperonas
moleculares se unen al N-terminal de los polipéptidos nacientes para evitar su agregación,
facilitar su plegamiento y promover su adecuada asociación con otras subunidades.
Las proteínas recién sintetizadas pueden ser modificadas de modo
covalente.
La lista de modificaciones postraduccionales es larga e incluye la eliminación o derivación
de residuos específicos. Por ejemplo, habitualmente se elimina un residuo N-terminal Met o
Fmet. Otras modificaciones postraduccionales comunes son la hidroxilación de los residuos
Pro y Lys del colágeno, la glucosilación y la prenilación y acilación grasa de proteínas
ancladas en la membrana. Muchas modificaciones covalentes, como la fosforilación y el
palmito ilación, son reversibles. Se conocen mas de 150 tipos de modificaciones de las
cadenas laterales; estas implican a todas ellas, excepto las de la Ala, Ile, Leu y Val. Las
funciones de tales modificaciones son diversas y en muchos casos constituyen un enigma.
Cada vez son más las proteínas que se sabe se ubiquitina de 76 residuos etiqueta una proteína
para su degradación por la proteasoma. Una proteína homologa de 97 residuos denominada
modificador pequeño relacionado con la ubiquitina puede ligarse a un residuo Lys, como la
ubiquitina, para regular la función proteica. Pero mientras la ubiquitinación habitualmente se
asocia con la degradación proteica, la sumo ilación parece desempeñar un papel en la
determinación de la localización de la proteína dentro de las células. Las proteínas
sintetizadas como precursores inactivos, llamadas proproteinas o proenzimas, se activan por
proteólisis limitada. Los zimógenos de las proteasas de serina son convertidos en enzimas
activas de ese modo. Típicamente, las proteínas que se translocan al interior del retículo
endoplásmico para ser exportadas desde las células contienen un péptido señal que debe ser
eliminado. Las proteínas que llevan un péptido señal se conocen como preproteinas si sufren
proteólisis adicional durante su maduración.

Conclusión
El código genético es normalmente lo que nos define como persona, pero a nivel molecular
lo que nos define se convierte en una serie de cadena y codones hechos por aminoácidos que
nos complementan como tal. No solo habla sobre el código genético también sobre el ARN
de transferencia y su amino acilación la cual es un procedimiento meticuloso que incluye
muchos aminoácidos para lograr su prometido en el ARN. Otro de los puntos que lleva a
cabo este reporte son los ribosomas que forman al ARN y se dividen en subunidades. La
traducción se emplea en células procariontes y eucariontes, la lleva a cabo el ARN mensajero
conjunto con los aminoácidos requeridos y la postraducción es el procesamiento que la
proteólisis.

Referencias:
Voet, D., Voet, J. G.; & Pratt, C. W. (2011). Fundamentos de bioquímica: La vida a nivel molecular (4a. ed. --
.). Buenos Aires: Médica Panamericana.