Apuntes Genética Molecular
Apuntes Genética Molecular
Apuntes Genética Molecular
Genética Molecular
El ácido desoxirribonucleico (ADN), es un ácido nucleico formado por la unión de
muchísimos desoxirribonucleótidos de A, G, C y T; cuya función principal es contener la
información genética del organismo y transmitirla de generación en generación.
*El descubridor de lo que hoy se conoce como ADN fue el médico británico Frederick Griffith; quien
aisló dos cepas de neumococo, la cepa lisa (S), dañina (recubierta por una cápsula), y otra cepa rugosa
(R), no virulenta (no recubierta por una cápsula). Descubrió que, si inyectaba bacterias S a los ratones,
morían; mientras que, si inyectaba bacterias R o bacterias S inactivadas por calor a los ratones,
sobrevivían. inactivadas
Después, inyectó una mezcla de
bacterias R con S inactivadas por calor, y el
ratón moría. Además, se encontraron bacterias
S vivas. Posteriormente Avery, MacLeod, y
McCarty fueron capaces de explicarlo: Las
bacterias S muertas por calentamiento tenían
intacto el ADN, que cuando se liberaba, podía
entrar en contacto con la pared bacteriana de
las R e introducirse en su ADN bacteriano de
modo que se fabricaba una cápsula de
polisacáridos que las hacía virulentas.*
Genes
Partes de un Gen
*Algunas bacterias presentan plásmidos (pequeños fragmentos de ADN), que pueden replicarse
independientemente.*
Reglas de Chargaff
Para comprender la molécula de ADN, Watson y Crick se basaron en estudios de rayos
X de Rosalind Franklin y en las reglas de Chargaff, que defienden que en un ADN
bicatenario:
Características
- Es universal (todos los seres vivos tienen el mismo código genético), lo que prueba el
origen común de las especies del planeta.
*Hay 20 aminoácidos distintos que codificar para lo que disponemos de 4 bases nitrogenadas diferentes.
Mediante una técnica conocida como variación por repetición, que consiste en elevar el número de bases
nitrogenadas que forman un codón al número de bases nitrogenadas distintas que puedan codificarlo
(34=64) observamos que podemos codificar de sobra los 20 aminoácidos, quedando un amplio margen de
error (si tuviéramos que hacer un ejercicio suponiendo otros números distintos, el resultado no podría ser
menor a 20 y, cuanto menor sea el número más posibilidad de error/mutaciones existirá).*
*Si en un ejercicio se dispone del número de aminoácidos y te preguntan por los ribonucleótidos del ARNm
original, multiplicas el número provisto por 3 y le sumas 3 (codón de fin). En el caso de que te pida
codones, lo multiplicas por 1 y le sumas 1 (codón de fin). Al contrario; si en un ejercicio se dispone del
número de ribonucleótidos y te preguntan por los aminoácidos que codificarán, divides el número provisto
por 3 y le restas 3 (codón de fin). En caso de que te pidan anticodones, hay 1 por cada codón.*
- Replicación/Duplicación del ARN: proceso mediante el cual nuevas copias de ARN son
sintetizadas a partir de otras preexistentes. Sucede en el citoplasma de las células infectadas
y es llevado a cabo por ARN-replicasas víricas.
Fase de Iniciación
La replicación comienza en una secuencia de nucleótidos del ADN bacteriano llamada
origen de la replicación (Ori C), que es distinta según la especie, pero destaca por la
abundancia de timina (T) y adenina (A). A partir de este punto, la doble hélice de ADN
se abre por acción de un enzima conocido como Helicasa, que rompe los puentes de
hidrógeno entre las bases nitrogenadas complementarias originando, así, una burbuja/ojo
de replicación, formada por dos horquillas de replicación. El desenrollamiento de la doble
hélice da lugar a tensiones entre las dos cadenas, por lo que otros enzimas conocidos
como topoisomerasas (la más conocida es la topoisomerasa II o ADN-girasa) se encargan
de hacer cortes en las cadenas para liberarlas de las tensiones; mientras que unas proteínas
estabilizadoras, conocidas como SSB, se acoplan a cada cadena para impedir que se
vuelvan a unir. *En realidad actúan dos Helicasas, lo que hará que posteriormente el proceso sea
bidireccional.*
Fase de Elongación
Los protagonistas de esta fase son unos enzimas de vital importancia conocidos como
ADN-polimerasas, que serán los encargados de iniciar la síntesis de las cadenas hijas
complementarias. Se distinguen tres tipos:
- ADN-polimerasa III (pol III): sintetiza las nuevas hebras. Lee en sentido 3’-5’
y sintetiza en sentido 5’-3’.
Sin embargo, el ADN-polimerasa III no puede sintetizar desde cero, por lo que necesita
disponer de un cebador/primer (fragmento de unos diez nucleótidos de ARN) que le
aporte un extremo 3’OH libre al que poder añadir los nucleótidos de ADN, el cual es
generado por el ARN-polimerasa/Primasa. Como el proceso es bidireccional y
semidiscontinuo, cada horquilla de replicación se lee y replica de diferente manera, dando
lugar a dos hebras complementarias y antiparalelas entre sí. Una será conocida como la
hebra líder/conductora/adelantada o de síntesis continua (complementaria a la cadena
3'→5') y la otra como hebra retardada/atrasada o de síntesis discontinua (complementaria
a la cadena 5'→3'), cuya síntesis es más lenta y se produce a través de pequeños
fragmentos de ADN, separados por cebadores, conocidos como fragmentos de Okazaki.
Por último, el ADN-polimerasa I elimina los cebadores y los sustituye por los fragmentos
de ADN correspondientes. *La energía que se necesita para este proceso la aportan los
nucleótidos, que pierden uno de sus grupos fosfato.*
Fase de Terminación
Los fragmentos de Okazaki se unen por medio de enlaces fosfodiéster gracias a un enzima
conocido como ADN-ligasa; mientras que, paralelamente, el ADN-polimerasa II analiza las
hebras en busca de posibles errores que reparar. Finalmente cada hebra recién sintetizada y la que
ha servido de patrón (cadenas molde o parentales) se disponen enrolladas originando una doble
hélice.
ADN bicatenario, circular y desnudo (sin histonas, pero ADN bicatenario, lineal y asociado a histonas (las antiguas
con un pequeño número de proteínas análogas llamadas histonas se quedan con la hebra adelantada y las de nueva
NAP) síntesis con la retardada)
Un único punto de replicación (un único replicón) Múltiples puntos de replicación (varios replicones)
Los fragmentos de Okazaki son de mayor tamaño Los fragmentos de Okazaki son de menor tamaño
Las proteínas estabilizadoras son del tipo SSB Las proteínas estabilizadoras son del tipo RPA
Mayor velocidad de replicación (por ser mucho más Menor velocidad de replicación (por ser mucho más largo y
corto y no estar asociado a histonas) estar asociado a histonas)
Fase de Iniciación
La transcripción comienza cuando el enzima
ARN-polimerasa (en células procariotas solo
existe un tipo, que se encarga de sintetizar
todos los ARN), protagonista de este proceso,
reconoce una región del ADN, llamada centro
promotor, a la que se asocia. Los centros
promotores son señales con una determinada
secuencia corta de bases nitrogenadas
(secuencias de consenso más frecuentes en
células procariotas: TTGACA y TATAAT)
próximas al inicio de transcripción. Una vez
que se ha unido el ARN-polimerasa, el
enzima cambia su configuración y desenrolla
el ADN, formando una burbuja de
transcripción. *Para localizar el promotor, el ARN-
polimerasa se ayuda del factor σ, que al iniciar su
tarea será liberado.*
Fase de Elongación
Una vez creada la burbuja de transcripción, el ARN-polimerasa se desplazará por la
cadena molde de ADN leyendo en sentido 3'→5', a la vez que, mediante enlaces éster,
añade ribonucleótidos a la nueva cadena de ARN en sentido 5'→3', cuyas bases
nitrogenadas sean complementarias a las de los desoxirribonucleótidos correspondientes;
siendo, así, ambas cadenas complementarias y antiparalelas entre sí. *El ARN-polimerasa no
requiere de cebadores para iniciar su tarea y, mientras se va desplazando sobre la cadena de ADN, esta
recupera su configuración inicial de doble hélice.**El transcrito de ARN tiene una secuencia casi idéntica
a la hebra de ADN no molde (informativa), teniendo el ARN bases uracilo (U) en lugar de timina (T), así
como ribosas en lugar de desoxirribosas.*
Fase de Terminación
El ARN-polimerasa sigue añadiendo nucleótidos hasta que llega a una zona del ADN,
llamada secuencia terminadora (terminador). En procariotas, esta zona se caracteriza por
tener una secuencia palindrómica (secuencias que se leen de la misma forma de izquierda
a derecha que de derecha a izquierda) que presenta abundancia de nucleótidos con
guanina (G) y citosina (C), seguidos de varios con adenina (A). A partir de aquí, se
distinguen dos estrategias principales:
Tras la terminación concluye la transcripción. Un transcrito de ARN que está listo para
su traducción se conoce como ARN mensajero (ARNm). En las células procariotas, los
transcritos de ARNm están listos para su traducción inmediatamente después de la
transcripción, a diferencia de en las células eucariotas, que requieren de un proceso de
maduración.*Cuando un ARNm está siendo traducido por varios ribosomas, se dice que el
ARNm junto con los ribosomas, forman un polirribosoma.*
Transcripción del ADN en Células Eucariotas
En células eucariotas, el proceso de transcripción del ADN es más complejo. Al igual que en
células procariotas, el protagonista de este proceso es el ARN-polimerasa; sin embargo, en células
eucariotas existen tres tipos principales (ARN-polimerasa I: interviene en la transcripción del
ARN ribosómico, excepto del 5 S; ARN-polimerasa II: interviene en la transcripción del ARN
mensajero; y ARN-polimerasa III: interviene en la transcripción del ARN de transferencia, del
ARN ribosómico 5 S y de los genes que contienen la información para las histonas); así como dos
tipos más exclusivos de plantas (ARN-polimerasa IV y ARN-polimerasa V: intervienen en la
transcripción de ciertos ARN de pequeño tamaño) y otros dos, uno exclusivo de mitocondrias y
otro de cloroplastos. El proceso de transcripción en células eucariotas sucede en el núcleo, así
como en el interior de mitocondrias y cloroplastos, y se divide en las siguientes fases:
Fase de Iniciación
La transcripción del ARNm comienza cuando el enzima ARN-polimerasa II reconoce una
región del ADN, llamada centro promotor, a la que se asocia. Los centros promotores son
señales con una determinada secuencia corta de bases nitrogenadas (las secuencias de
consenso más frecuente en células eucariotas son los compartimentos/cajas TATA y
CAAT) próximas al inicio de transcripción. Una vez que se ha unido el ARN-polimerasa
II, el enzima cambia su configuración y desenrolla el ADN (previamente habiendo
suprimido el bloqueo de las histonas), formando una burbuja de transcripción. *En
eucariotas, el ADN se tiene que unir a unas proteínas llamadas factores de inicio de la transcripción para
que se una el ARN-polimerasa II e inicie la transcripción.*
Fase de Elongación
Una vez creada la burbuja de transcripción, el ARN-polimerasa se desplazará por la
cadena molde de ADN leyendo en sentido 3'→5', a la vez que, mediante enlaces éster,
añade ribonucleótidos a la nueva cadena de ARN en sentido 5'→3', cuyas bases
nitrogenadas sean complementarias a las de los desoxirribonucleótidos correspondientes;
siendo, así, ambas cadenas complementarias y antiparalelas entre sí. En células eucariotas
se transcriben tanto exones como intrones y, después de haber unido los 30 primeros
nucleótidos transcritos, en el extremo 5' se añade una caperuza de metilguanosina
trifosfato, que servirá como señal de inicio en el proceso de traducción. *El ARN-polimerasa
no requiere de cebadores para iniciar su tarea y, mientras se va desplazando sobre la cadena de ADN, esta
recupera su configuración inicial de doble hélice.**El transcrito de ARN tiene una secuencia casi idéntica
a la hebra de ADN no molde (informativa), teniendo el ARN bases uracilo (U) en lugar de timina (T), así
como ribosas en lugar de desoxirribosas.*
Fase de Terminación
El ARN-polimerasa sigue añadiendo nucleótidos hasta que llega a una zona del ADN,
llamada secuencia terminadora (terminador) que, en eucariotas, es rica en timinas
(TTATTT) y se transcribe formando una horquilla en el ARN (AAUAAA). De esta manera
se separa el ARN y, posteriormente, un enzima (poli-A-polimerasa) añade al extremo
final 3' una secuencia de unos 200 ribonucleótidos de adenina, la llamada cola de poli-A,
que interviene en el proceso de maduración protegiendo al ARN, hasta que sea traducido,
frente a la degradación de las ribonucleasas.
Fase de Maduración
El ARNm transcrito consta de secuencias con
sentido (exones) y sin sentido (intrones). Los
intrones se transcriben, pero no se traducen, y los
exones son los que quedan en el ARN maduro.
Antes de salir al citoplasma a través de los poros
nucleares, sufre un proceso de maduración,
llamado splicing (corte y empalme), eliminando
los intrones y uniendo los exones restantes. De
esta manera el ARNm está listo para salir al
citoplasma y ser leído por los ribosomas, llevando
así a cabo la traducción. *La explicación se centra
en el ARNm porque es el que se va a traducir, pero lo
mismo ocurre con cualquier otro tipo de ARN.*
Anabolismo Heterótrofo (Traducción)
Proceso mediante el que, a partir de la información codificada en el ARN mensajero
(ARNm), se realiza la síntesis de proteínas. Sucede en los ribosomas de células eucariotas
y procariotas (libres en el citoplasma en el caso de ambas; así como adheridos a las
paredes del retículo endoplasmático rugoso y de la envoltura nuclear, en eucariotas).
También se da lugar en el interior de mitocondrias y cloroplastos, pues son orgánulos
pseudoautónomos. El proceso se divide en las siguientes fases:
ARN Transferente
Se encuentran en el citoplasma, así como en el interior de mitocondrias y cloroplastos, y su función es la de
transportar los aminoácidos específicos hasta los ribosomas. Además, es monocatenario, pero presentan algunas
zonas con bases complementarias que forman horquillas, dando así lugar a 3 bucles o brazos que reflejan la imagen
de una hoja de trébol (). En la estructura secundaria de los ARNt se distinguen las siguientes características:
- El sitio peptidil/sitio P: que en esta fase está ocupado por el primer aminoacil-ARNt, el
ARNt-metionina.
- El sitio aminoacil/sitio A: que en esta fase está libre y preparado para recibir al segundo
aminoacil-ARNt.
- El sitio exit/sitio E: que en esta fase está libre y preparado para recibir al ARNt vacío
resultante de la translocación de la siguiente fase, para su expulsión del ribosoma.
Fase de Elongación
La fase de elongación es un proceso repetitivo consistente en la adición de aminoácidos
al extremo carboxilo de la cadena peptídica. El proceso se iniciará cuando un segundo
aminoacil-ARNt, cuyo anticodón es complementario al siguiente codón del codón inicio
(AUG), ocupa el sitio A. Tras romper el enlace éster que une el aminoácido al ARNt del
sitio P, la energía liberada se empleará para formar un enlace peptídico entre el
aminoácido del sitio P y el del sitio A gracias a la acción de un enzima conocido como
peptidil-transferasa, localizado en la subunidad grande del ribosoma. El sitio P estará
entonces ocupado por un ARNt sin aminoácido, ya que se habrá unido al que transportaba
el ARNt que ocupa el sitio A. Posteriormente se produce la translocación ribosomal,
desplazándose el ribosoma tres nucleótidos en sentido 5’→3’ y trasladando el ARNt que
ocupaba el sitio P al sitio E, listo para su expulsión del ribosoma. El ARNt con el
dipéptido recién formado que ocupaba el sitio A, pasará a ocupar el sitio P, quedando
vació el sitio A. Este sitio A volverá a ser ocupado por otro aminoacil-ARNt con
anticodón complementario al codón a traducir, y así sucesivamente.
Fase de Terminación
La terminación de la cadena tiene lugar cuando el ribosoma llega a un lugar del ARNm
donde se encuentra un codón de terminación (UAA, UAG, UGA) que no es reconocido
por ningún ARNt, y sí por los factores de liberación de naturaleza proteica que se sitúan
en el sitio A y que hacen que la peptidil-transferasa separe, por hidrólisis, la cadena
polipeptídica del ARNt, liberando además una molécula de agua. Como consecuencia del
proceso de traducción se liberan:
*Normalmente, las cadenas de ARNm son traducidas por más de un ribosoma a la vez, y forman los
polirribosomas o polisomas, lo que permite que la traducción sea mucho más rápida y eficiente.** En
células procariotas, como no existe membrana nuclear, la transcripción y traducción se producen
simultáneamente. El ARNm comienza a traducirse antes de estar completamente transcrito.*
Mutaciones
Una mutación es un cambio en el material genético de una célula. Los cambios en el
material genético se traducen en cambios en las proteínas, por lo que las mutaciones
pueden afectar a la supervivencia del organismo (junto a la recombinación meiótica son
el principal motor evolutivo). Las mutaciones se pueden clasificar según varios criterios:
• Mutágenos químicos:
- Ácido nitroso (HNO2): provoca la desaminación de bases nitrogenadas.
- Agentes alquilantes: añaden grupos etilo o metilo (ejemplo: gas mostaza).
- Sustancias análogas a bases nitrogenadas
Cáncer
El cáncer es una enfermedad que se caracteriza por la división incontrolada de algunas células del
organismo. A diferencia de las células normales, que envejecen y mueren tras un número limitado de
divisiones, las células terminales comienzan a dividirse indefinidamente, formando una masa de células
que se denomina tumor (primer tumor). A partir del primer tumor algunas células pueden capilarizarse
(angiogénesis) y escapar a través del sistema linfático y circulatorio para llegar a implantarse en otros
tejidos, desarrollando así tumores secundarios en un proceso invasivo denominado metástasis. El
cáncer se puede originar por:
- Mutaciones en los protooncogenes (genes presentes en todas las células implicadas en los mecanismos de
control del crecimiento y proliferación celular. Generalmente están reprimidos), que se transforman en
oncogenes. Por ejemplo, el cáncer humano de vejiga y el sarcoma de Rous.
- Mutaciones en genes supresores de tumores.
- Invasión por virus oncogénicos, por ejemplo, el virus del papiloma humano (VPH), que da lugar en mujeres
a cáncer de cuello de útero.
Mutaciones Genéticas
Son aquellas mutaciones que provocan cambios en la secuencia de nucleótidos de un gen
determinado. Se distinguen dos tipos:
• Mutaciones por sustitución de bases: se producen por cambios de una base del
ADN por otra, por lo que se modifican los tripletes. Se distinguen a su vez dos tipos:
Mutaciones Cromosómicas
Son aquellas mutaciones que provocan cambios en la disposición de los genes de un
cromosoma, es decir, en su estructura. Se pueden clasificar según dos criterios:
*En animales, la poliploidía suele ser incompatible con la vida; mientras que, en plantas,
es frecuente.*
*La haploidía es normal en seres vivos con ciclos haplontes o haplodiplontes; mientras
que, en animales es más rara.*