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Biologia Molecular Ii - 2022-S2

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VICERRECTORADO ACADÉMICO

“...Nosotros somos el cambio que buscamos”

SÍLABO VIRTUAL

I. ASIGNATURA: BIOLOGÍA MOLECULAR II CÓDIGO: 4A0048

II. DATOS GENERALES

1.1. DEPARTAMENTO ACADÉMICO : Biología


1.2. ESCUELA PROFESIONAL : Biología
1.3. CARRERA PROFESIONAL : Biología
1.4. CICLO DE ESTUDIOS : Octavo
1.5. CRÉDITOS 2
1.6. DURACION : 17 semanas
1.7. HORAS SEMANALES 03
1.7.1. Horas de teoría 01
1.7.2. Horas de práctica 02
1.8. MODALIDAD : No presencial (virtual)
1.9. PLAN DE ESTUDIOS 2004
1.10. INICIO DE CLASES : 13 de diciembre del 2021
1.11. FINALIZACIÓN DE CLASES : 09 de abril del 2022
1.12. REQUISITO : Biología Molecular I Código: 4A0064
1.13. DOCENTE : Alfredo Berrocal Huallpa
1.14. SEMESTRE ACADÉMICO : 2022-II

III. SUMILLA
La asignatura es obligatoria de la Carrera de Biología. El objetivo principal de la asignatura es
proporcionar al estudiante los fundamentos básicos de las técnicas para el análisis de Biología
Molecular, además de los procesos de la regulación de la expresión de genes.
La asignatura está dividida en cuatro unidades temáticas: 1. Técnicas de Biología Molecular para
la detección y amplificación de ADN, 2. Técnicas de Biología Molecular para mapeo y análisis de
la variabilidad genética, 3. Regulación de la expresión genética y 4. Regulación epigenética.
A nivel práctico se desarrollarán talleres de discusión donde los alumnos afianzaran sus
conceptos teóricos e incrementaran sus capacidades de análisis y debate científico.

IV. COMPETENCIA DE LA ASIGNATURA


Define los conceptos teóricos del dogma de la biología molecular y los procesos de preservación
y el flujo de la información genética para el desarrollo de los seres vivos.
Define los conceptos teóricos de las técnicas de análisis en Biología molecular para la expresión
y variabilidad genética, asi como también define los conceptos de la regulación de la información
genética de los seres vivos y como pueden aplicarse en la salud pública, agricultura e industria.
VICERRECTORADO ACADÉMICO
“...Nosotros somos el cambio que buscamos”

V. CAPACIDADES
UNIDAD I: Explica la aplicación de Técnicas de Biología Molecular para la detección y
amplificación de ADN
C1: Explica los alcances de las técnicas de Biología Molecular para la detección y amplificación
de ADN.

UNIDAD II: Explica la aplicación de las Técnicas de Biología Molecular para mapeo y análisis de
la variabilidad genética
C2 Explica los alcances de las técnicas de Biología Molecular para el mapeo y análisis de
variabilidad genética.

UNIDAD III: Explica la Regulación de la expresión genética


C3 Explica los procesos de la Regulación de la expresión genética.

UNIDAD IV: Explica la Regulación epigenética


C4 Explica los procesos de la Regulación epigenética.

V. PROGRAMACIÓN DE CONTENIDOS
(*)
Los tipos de sesiones para el desarrollo de los contenidos podrán ser Síncrona (S) o
Asíncrona (A)
VICERRECTORADO ACADÉMICO
“...Nosotros somos el cambio que buscamos”

UNIDAD I
Técnicas de Biología Molecular para la detección y amplificación de ADN
C1: Explica los alcances de las técnicas de Biología Molecular para el mapeo y análisis de variabilidad genética
CONTENIDOS
CONTENIDOS CONTENIDOS CRITERIOS DE EVALUACIÓN INSTRUMENTOS
SEMANA PROCEDIMENTALES TIPO (*)
CONCEPTUALES ACTITUDINALES (**) DE EVALUACIÓN (***)
(actividades)
N°01 Clase Inaugural. Se informa las actividades del Adopta actitud S Participa activamente en clase y Lista de cotejo
curso de Biología Molecular II diligente de los trabajos asignados
Formación de grupos de trabajo al sistematizar la demostrando capacidad para
información trabajar en equipo.
relacionada al uso
de las técnicas y
N°02 Nucleasas y clonación Selecciona información sobre el herramientas de S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
uso de las enzimas y sistemas de Biología Molecular de los trabajos asignados con prueba objetiva y
clonación como técnicas y para la detección y demostrando capacidad para respuestas cortas
herramientas de Biología amplificación de trabajar en equipo.
molecular. ADN.
Asume actitud A Redacta Informe sobre técnicas Rubrica
crítica. y herramientas de Biología
Respeta la opinión molecular.
N°03 Amplificación de ADN: Identifica información sobre la de sus compañeros Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
Reacción en cadena de la importancia de la técnica de S de los trabajos asignados con prueba objetiva y
Polimerasa y técnicas de amplificación de ácidos demostrando capacidad para respuestas cortas
amplificación isotérmica. nucleicos para la identificación trabajar en equipo.
de los seres vivos.
A Redacta informe sobre métodos Rubrica
de amplificación de ADN
N°04 PCR cuantitativo: Sintetiza información sobre Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
Cuantificación absoluta y aplicaciones del PCR S de los trabajos asignados con prueba objetiva y
cuantificación relativa cuantitativo en el diagnostico demostrando capacidad para respuestas cortas
molecular trabajar en equipo.

A Redacta informe sobre PCR Rubrica


cuantitativo
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Logro de aprendizaje (Trabajo académico): Portafolio que incluye evaluaciones de pruebas objetivas y cortas, cumplimiento de listas de cotejo semanales y rubricas de la unidad I
Fuentes de información:
 Chambers, A. C., Aksular, M., Graves, L. P., Irons, S. L., Possee, R. D., & King, L. A. (2018). Overview of the baculovirus expression system. Current Protocols in Protein Science, 91,
5.4.1–5.4.6. doi: 10.1002/cpps.47
 Jocelyn E. Krebs.; Elliott S. Goldstein.;Stephen T. Kilpatrick. LEWIN´S GENES XII. 2018. Ed. Jones & Bartlett Learning.
 Kozera, B., & Rapacz, M. (2013). Reference genes in real-time PCR. Journal of applied genetics, 54(4), 391–406. https://doi.org/10.1007/s13353-013-0173-x
 Kuypers, J., & Jerome, K. R. (2017). Applications of Digital PCR for Clinical Microbiology. Journal of clinical microbiology, 55(6), 1621–1628. https://doi.org/10.1128/JCM.00211-17
 Navarro, E., Serrano-Heras, G., Castaño, M. J., & Solera, J. (2015). Real-time PCR detection chemistry. Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry, 439, 231–250.
https://doi.org/10.1016/j.cca.2014.10.017
 Sambrook, Joseph. (2001). Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press
 Rutsaert, S., Bosman, K., Trypsteen, W., Nijhuis, M., & Vandekerckhove, L. (2018). Digital PCR as a tool to measure HIV persistence. Retrovirology, 15(1), 16.
https://doi.org/10.1186/s12977-018-0399-0
 Zhao, Y., Chen, F., Li, Q., Wang, L., & Fan, C. (2015). Isothermal Amplification of Nucleic Acids. Chemical reviews, 115(22), 12491–12545.
https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.5b00428

UNIDAD II
Técnicas de Biología Molecular para mapeo y análisis de la variabilidad genética
C2: Explica los alcances de las técnicas de Biología Molecular para el mapeo y análisis de variabilidad genética.
CONTENIDOS
SEMANA CONTENIDOS CRITERIOS DE EVALUACIÓN INSTRUMENTOS
CONTENIDOS CONCEPTUALES PROCEDIMENTALES TIPO (*)
ACTITUDINALES (**) DE EVALUACIÓN (***)
(actividades)
N°05 Secuenciamiento de ADN. Selecciona información en Adopta actitud Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
relación la importancia de la diligente S de los trabajos asignados con prueba objetiva y
obtención de una secuencia al sistematizar la demostrando capacidad para respuestas cortas
informativa de ADN información trabajar en equipo.
relacionada a la
duplicación de la A Redacta Informe sobre Rubrica
molécula de ADN, los secuenciamiento de ADN
N°06 Mapeo genético Selecciona información en procesos de S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
relación a las técnicas de variabilidad genética de los trabajos asignados con prueba objetiva y
mapeo genético y búsqueda de y los sistemas de demostrando capacidad para respuestas cortas
genes mantenimiento del trabajar en equipo.
ADN.
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A Redacta Informe sobre técnicas Rubrica


de mapeo genético.
N°07 Métodos para la modificación Identifica información sobre Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
genética. aplicación de técnicas para la S de los trabajos asignados con prueba objetiva y
modificación genética demostrando capacidad para respuestas cortas
trabajar en equipo.

A Redacta informe sobre técnicas Rubrica


para la modificación genética
Semana N°08 : Examen Parcial correspondiente a las unidades I y II.
Logro de aprendizaje (Trabajo académico): Portafolio que incluye evaluaciones de pruebas objetivas y cortas, cumplimiento de listas de cotejo semanales y rubricas de la unidad II
Fuentes de información:
 Garrido-Cardenas, J. A., Garcia-Maroto, F., Alvarez-Bermejo, J. A., & Manzano-Agugliaro, F. (2017). DNA Sequencing Sensors: An Overview. Sensors (Basel, Switzerland), 17(3), 588.
https://doi.org/10.3390/s17030588
 Jocelyn E. Krebs.; Elliott S. Goldstein.;Stephen T. Kilpatrick. LEWIN´S GENES XII. 2018. Ed. Jones & Bartlett Learning.
 Laudadio, I., Fulci, V., Palone, F., Stronati, L., Cucchiara, S., & Carissimi, C. (2018). Quantitative Assessment of Shotgun Metagenomics and 16S rDNA Amplicon Sequencing in the
Study of Human Gut Microbiome. Omics : a journal of integrative biology, 22(4), 248–254. https://doi.org/10.1089/omi.2018.0013
 Pan, Y., Wang, X., Liu, L., Wang, H., & Luo, M. (2016). Whole Genome Mapping with Feature Sets from High-Throughput Sequencing Data. PloS one, 11(9), e0161583.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0161583
 Sambrook, Joseph. (2001). Molecular cloning : a laboratory manual. Cold Spring Harbor, N.Y. :Cold Spring Harbor Laboratory Press
 Yoshinaga, Y., Daum, C., He, G., & O'Malley, R. (2018). Genome Sequencing. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1775, 37–52. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7804-
5_4.

UNIDAD III
Regulación de la expresión genética
C3: Explica los procesos de la Regulación de la expresión genética
SEMANA CONTENIDOS PROCEDIMENTALES CONTENIDOS CRITERIOS DE EVALUACIÓN INSTRUMENTOS
CONTENIDOS CONCEPTUALES TIPO (*)
(actividades) ACTITUDINALES (**) DE EVALUACIÓN (***)
N°09 El operon Lactosa Selecciona información en relación S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
la regulación por operones en la Adopta actitud de los trabajos asignados con prueba objetiva y
expresión de genes en procariotas diligente demostrando capacidad para respuestas cortas
al sistematizar la trabajar en equipo.
información
Rubrica
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relacionada a A Redacta Informe sobre el


los procesos de operon lactosa
N°10 Fase lítica y lisogénica en el Selecciona información en relación la regulación S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
modelo de infección del a la regulación de la transcripción en genética. de los trabajos asignados con prueba objetiva y
bacteriófago lambda la fase lítica y lisogénica de la demostrando capacidad para respuestas cortas
infección del bacteriófago lambda trabajar en equipo.

A Redacta Informe sobre el Rubrica


bacteriofago lambda.
N°11 Mecanismos de acción de los Selecciona información a los S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
activadores y represores de la mecanismo de la acción de los de los trabajos asignados con prueba objetiva y
transcripción en eucariotas. activadores y represores en la demostrando capacidad para respuestas cortas
regulación de la transcripción en trabajar en equipo.
eucariotas
A Redacta informe sobre Rubrica
mecanismo de activadores y
represores.
N°12 Remodelación de la cromatina Selecciona información sobre los S Participa activamente en clase y Lista de cotejo y evaluación
en el proceso de la activación de procesos de la activación y de los trabajos asignados con prueba objetiva y
la transcripción remodelación de la cromatina. demostrando capacidad para respuestas cortas
trabajar en equipo.

A
Redacta informe sobre procesos Rubrica
que activan la remodelación de
la cromatina.
Logro de aprendizaje (Trabajo académico): Portafolio que incluye evaluaciones de pruebas objetivas y cortas, cumplimiento de listas de cotejo semanales y rubricas de la unidad III
Fuentes de información:
 Gann A. (2010). Jacob and Monod: from operons to EvoDevo. Current biology : CB, 20(17), R718–R723. https://doi.org/10.1016/j.cub.2010.06.027
 Jocelyn E. Krebs.; Elliott S. Goldstein.;Stephen T. Kilpatrick. LEWIN´S GENES XII. 2018. Ed. Jones & Bartlett Learning.
 Miller, J., & Stagljar, I. (2004). Using the yeast two-hybrid system to identify interacting proteins. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 261, 247–262.
https://doi.org/10.1385/1-59259-762-9:247
 Luo, Z., Lin, C., & Shilatifard, A. (2012). The super elongation complex (SEC) family in transcriptional control. Nature reviews. Molecular cell biology, 13(9), 543–547.
https://doi.org/10.1038/nrm3417
 Osbourn, A. E., & Field, B. (2009). Operons. Cellular and molecular life sciences : CMLS, 66(23), 3755–3775. https://doi.org/10.1007/s00018-009-0114-3
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“...Nosotros somos el cambio que buscamos”

 Ptashne M. (2006). Lambda's switch: lessons from a module swap. Current biology : CB, 16(12), R459–R462. https://doi.org/10.1016/j.cub.2006.05.037
 Rodríguez-Negrete, E., Bejarano, E. R., & Castillo, A. G. (2014). Using the yeast two-hybrid system to identify protein-protein interactions. Methods in molecular biology (Clifton,
N.J.), 1072, 241–258. https://doi.org/10.1007/978-1-62703-631-3_18
 Wang, X., Bai, L., Bryant, G. O., & Ptashne, M. (2011). Nucleosomes and the accessibility problem. Trends in genetics : TIG, 27(12), 487–492. https://doi.org/10.1016/j.tig.2011.09.001

UNIDAD IV
Regulación epigenética
C4: Explica los procesos de la Regulación epigenética
CONTENIDOS
SEMANA CONTENIDOS CRITERIOS DE EVALUACIÓN INSTRUMENTO
CONTENIDOS CONCEPTUALES PROCEDIMENTALES TIPO (*)
ACTITUDINALES (**) DE EVALUACIÓN
(actividades)
N°13 Heterocromatina Selecciona información en Participa activamente en clase Lista de cotejo y evaluación
relación al efecto de la Adopta actitud S y de los trabajos asignados con prueba objetiva y
heterocromatina, su diligente demostrando capacidad para respuestas cortas
propagación e interacción con al sistematizar la trabajar en equipo.
los nucleosomas información
relacionada a la Redacta Informe sobre la Rubrica
decodificación de A propagación de la
ARN a proteínas. heterocromatina
N°14 Herencia epigenética Selecciona información en Participa activamente en clase Lista de cotejo y evaluación
relación a las formas de S y de los trabajos asignados con prueba objetiva y
herencia epigenética demostrando capacidad para respuestas cortas
trabajar en equipo.

Redacta Informe sobre Rubrica


A herencia epigenética
N°15 Cambios cromosómicos y Selecciona información de los S Participa activamente en clase Lista de cotejo y evaluación
epigenéticos procesos sobre la impronta y de los trabajos asignados con prueba objetiva y
respuestas cortas
VICERRECTORADO ACADÉMICO
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genómica incluyendo la demostrando capacidad para


inactivación del cromosoma X trabajar en equipo.
A Redacta informe sobre la Rubrica
impronta genomica
Semana N°16 : Examen Final correspondiente a las unidades III y IV.
Semana N°17 : Examen de aplazado
Logro de aprendizaje (Trabajo académico): Portafolio que incluye evaluaciones de pruebas objetivas y cortas, cumplimiento de listas de cotejo semanales y rubricas de la unidad IV
Fuentes de información:
 Goldberg, A. D., Allis, C. D., & Bernstein, E. (2007). Epigenetics: a landscape takes shape. Cell, 128(4), 635–638. https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.006
 Gottschling D. E. (2004). Summary: epigenetics--from phenomenon to field. Cold Spring Harbor symposia on quantitative biology, 69, 507–519.
https://doi.org/10.1101/sqb.2004.69.507
 Harvey, Z. H., Chen, Y., & Jarosz, D. F. (2018). Protein-Based Inheritance: Epigenetics beyond the Chromosome. Molecular cell, 69(2), 195–202.
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2017.10.030
 Jocelyn E. Krebs.; Elliott S. Goldstein.;Stephen T. Kilpatrick. LEWIN´S GENES XII. 2018. Ed. Jones & Bartlett Learning
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VI. METODOLOGÍA
6.1. Estrategias centradas en el aprendizaje
 Técnica de estudio individual
 Búsqueda y análisis de la información
 Exposiciones y debates
6.2. Estrategias centradas en la enseñanza
 Estrategia de planificación
 De regulación, dirección y monitoreo
 Organización de la información
 Elaboración de la información
 Control de la comprensión
 Exposición didáctica

VII. RECURSOS PARA EL APRENDIZAJE

 Materiales de apoyo metodológico: textos, separatas y revistas.


 Utilización de las tecnologías de la información y comunicación: Aula virtual,
internet y plataforma Microsoft Teams

VIII. EVALUACIÓN
La evaluación es permanente pro criterios y por productos. Cada unidad es evaluada en base al
logro de aprendizaje (Trabajo Académico 40%) previsto en el silabo. La naturaleza de las
evaluaciones, parcial y final, es de un sesgo demostrativo, de desempeño y de ejecución.

Evaluación Parcial – EP (30%): será una situación de desempeño de mediana o compleja dificultad,
por ejemplo, la sustentación de un producto académico (evidencias de aprendizaje de los
estudiantes de manera progresiva, según los logros de las unidades para asegurar el alcance de la
competencia que desarrolla el curso virtualizado)

Evaluación Final – EF (30%): será una situación de desempeño de mediana o compleja dificultad,
por ejemplo, la sustentación de un producto académico.

 Las formas de evaluación se califican en escala vigesimal (de 1 a 20)


 La nota mínima aprobatoria es once (11)
 El medio punto (0.5) es a favor del estudiante en el promedio final.
 Para ser evaluado el estudiante debe registrar un mínimo de 70 % de asistencia a
clases.
 Elaboración de un informe académico, la cual será expuesta según los criterios
técnicos.
 Se elaborarán informes académicos según el desarrollo de los contenidos
 Se aplicarán prácticas calificadas según el desarrollo de la asignatura.
 Instrumentos para emplear: lista de cotejo, y de control y pruebas objetivas, y de
ensayo.
 La evaluación de los estudiantes se realizará de acuerdo con las siguientes
ponderaciones:
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N° CÓDIGO NOMBRE DE LA EVALUACIÓN PORCENTAJE


02 EP EVALUACIÓN PARCIAL 30%
04 EF EVALUACIÓN FINAL 30%
05 TA TRABAJOS ACADÉMICOS 40%
TOTAL 100%

La Nota Final (NF) de la asignatura se determinará de acuerdo con la siguiente


fórmula:

NF = (EP * 30%) + (EF * 30%) + (TA * 40%)


100

(**)
Criterios de evaluación.
Es un parámetro de referencia que funciona como base de comparación para interpretar el
desempeño del estudiante respecto a su aprendizaje.
 Procesa data académica.
 Recrea y sintetiza información personalizada.
 Jerarquiza conceptos y argumentos.
 Evidencia sistematización y creatividad en el tema tratado.
 Incorpora criterios de diseño gráfico en las guías de comprensión de lectura.
 Muestra tolerancia y asertividad frente a la crítica.
 Aplica criterios técnicos de la especialidad.

(***)
Instrumentos de evaluación.
Conjunto de herramientas y prácticas diseñadas para que los docentes puedan obtener
información precisa sobre la calidad del aprendizaje de sus estudiantes.
a. Tradicionales:
 Pruebas objetivas (V o F, preguntas intercaladas, preguntas de elección múltiple,
preguntas de emparejamiento de elementos)
 Pruebas de respuestas cortas y abiertas.
 Trabajos prácticos y tareas elementales.
b. Con metodologías de indagación:
 Informes y memorias de prácticas
 Rúbricas, listas de cotejo y guías de observación.
c. Basados en las TIC´s:
 Portafolio
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IX. FUENTES DE INFORMACIÓN

9.1. Bibliográficas
 Darnell J., Lodish H., Baltimore D. 1999. Molecular Cell Biology. Freeman.
 Jocelyn E. Krebs.; Elliott S. Goldstein.;Stephen T. Kilpatrick. LEWIN´S GENES XII. 2018.
Ed. Jones & Bartlett Learning.
 Karp, G. “Biología Celular y Molecular, Conceptos y Experimentos”. 2009. Ed.
McGraw-Hill - Interamericana. México.
 Sambrook, Joseph. (2001). Molecular cloning : a laboratory manual. Cold Spring
Harbor, N.Y. :Cold Spring Harbor Laboratory Press
 Watson, James D., and Francis Crick. 1953 "Molecular Structure of Nucleic Acids: A
Structure for Deoxyribose Nucleic Acid." Nature 171, 4356: 737-738.

9.2. Electrónicas
 Ambry genetics: Illumina Sequencing Overview: Library Prep to Data Analysis
https://www.youtube.com/watch?v=6jf_6STEnI4
 Biomedical and Biological Sciences: The principle of Real Time PCR, Reverse
Transcription, quantitative rt-PCR
https://www.youtube.com/watch?v=DH7o9Df5_50

Lima, 02 agosto del 2021

Mg. Yupanqui Siccha Gisela Francisca Mg. Alfredo Berrocal Huallpa


Código: 0077168 Código:
Directora del Dpto. Académico de Biología Docente (Categoría/Dedicación): DCB1/32
Correo electrónico: gyupanqui@unfv.edu.pe Correo electrónico: aberrocalh@unfv.edu.pe

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