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Bioquimica Unidad I

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 Una enzima es un catalizador biológico. Por lo general es una proteína, pero


podría ser también ARN en algunos casos.

 El objetivo de un catalizador es aumentar la velocidad con que ocurre una


reacción, sin afectar el equilibrio de la misma.

 No hacen factibles las reacciones imposibles, sino que solamente aceleran las
reacciones que espontáneamente podrían producirse.

 Esto hace posible que tengan lugar reacciones que sin catalizador requerirían
condiciones extremas de presión, temperatura o pH.

ENZIMA

𝑅𝐸𝐴𝐶𝑇𝐼𝑉𝑂𝑆 − − − −→ 𝑃𝑅𝑂𝐷𝑈𝐶𝑇𝑂𝑆
(SUSTRATOS)

1. Tenemos una enzima con un sustrato especifico,


2. El sustrato entra al sitio activo para formar la enzima-sustrato y de
esta manera la reacción se acelera.
3. La enzima libera los productos.
 Catalizan las reacciones químicas.

 Participan en la descomposición de nutrientes.

 Descomposición de componentes químicos.

 Ensamble de proteínas, ADN, membranas, células y tejidos.

 Aprovechamiento de la energía.

 Cumple funciones únicas en la salud y el bienestar humano. Casi todas las


enzimas son proteínas

 ARN ribosomal (ARNr): es el tipo de ARN más abundante (80-85% del ARN
total) en las células y constituye, en parte, los ribosomas.

 Un puñado de moléculas de ARN imbuidas con actividad endonucleasa o


nucleótido ligasa conocidas colectivamente como ribozimas.

 Las ribozimas son ARN con actividad catalítica. El término "ribozima" es una
contracción de las palabras "ácido ribonucleico" y "enzima". Los sustratos de
las ribozimas son con frecuencia ARN.

IMPORTANCIA MÉDICA

 La capacidad de detectar y cuantificar la actividad enzimática en la sangre


proporciona información valiosa para el médico y esto permite diagnosticar
varias enfermedades.

 Muchas condiciones patológicas son consecuencia directa de cambios en la


cantidad o en la actividad catalítica de enzimas claves que resultan de efectos
genéticos, déficit nutricional, toxinas, entre otros.

 Generalmente aumentan la velocidad de la reacción no catalizada en un factor


de 10^6 o más.

 Las enzimas pueden sufrir modificaciones transitorias durante la catálisis,


pero no se consumen ni se alteran permanentemente.
 Son muy selectivas.

 Son especificas no solo para el tipo de reaccion catalizada, sino tambien para
un unico sustrato o un pequeño conjunto de sustratos muy relacionados.

 La mayoria de enzimas son catalizadores estereoespecificos que solo actuan


sobre un solo estereoisomero ya sea “D” o “L”.

 Se unen a sustratos por medio de al menos “tres puntos de fijación” Ello


significa que las enzimas pueden catalizar la transformación de apenas un
sustrato o varios relacionados estructuralmente, catalizando solo una de las
posibles reacciones que ese sustrato puede experimentar.

 Catalizan la conversión de uno o más compuestos (sustratos) hacia uno o más


compuestos diferentes (productos).

 Algunos nombres de enzimas descritas por primera vez, persisten hasta el día
de hoy. Ejemplo: pepsina, tripsina y amilasa.

 Los primeros bioquímicos agregaban el sufijo “asa” a las enzimas recién


descubiertas + tipo de reacción. Por ejemplo:

Deshidrogenasa: elimina los elementos de hidrogeno.

Proteasa: hidrolizan proteínas.

 En muchos casos los nombres de las proteínas se complementan con términos


que indiquen el sustrato particular en el que actúa la enzima, su fuente, su
modo de regulación o un rasgo característico de su mecanismo de acción.

 Pueden agregarse designadores alfanuméricos para indicar múltiples formas o


isozimas, de una enzima.

 Ejemplo: ARN polimerasa iii, proteina cinasa cb.

 Cada enzima tiene un nombre único y un numero de código que identifica el tipo
de reacción catalizada y los sustratos involucrados.

 Las enzimas se agrupan en las siguientes seis clases:


 OXIDORREDUCTASAS

 TRANSFERASAS

 HIDROLASAS

 LIASAS

 ISOMERASAS

 LIGASAS

OXIDORREDUCTASAS
 Enzimas que catalizan oxidaciones y reducciones, es decir transferencia de
hidrogeno(H) o electrones (e).

TRANSFERASAS
 Enzimas que catalizan la transferencia de restos o grupos químicos, diferentes
al hidrogeno, tales como grupos glucósido, metilo o fosforilo.

HIDROLASAS
 Catalizan la escisión hidrolítica de c-c.
C-o, c-n y otros enlaces covalentes.

 Escisión es dividir.

LIASAS
 Catalizan la escisión de C-C, C-O, C-N y otros enlaces covalentes por
eliminación de átomos, generando dobles enlaces.

 Son reacciones de eliminación, no hidrolíticas y no oxidantes.

 La piruvato descarboxilasa pertenece a esta clase de enzimas ya que


descompone al piruvato en acetaldehído y dióxido de carbono.
ISOMERASAS
 catalizan cambios estructurales dentro de una misma molécula. Como estas
reacciones solo tienen un sustrato y un producto son de las reacciones
enzimáticas más simples.

 La alanina racemasa es una isomerasa que cataliza la interconversión de L-


alanina y D-alanina.

LIGASAS
 Catalizan la unión de dos moléculas en reacciones acopladas a la hidrolisis del
ATP.

 Catalizan la ligadura o unión de dos sustratos. Estas reacciones necesitan


un suministro de energía potencial químico de un nucleósido trifosfato, como el
ATP. Las ligasas son usualmente llamadas sintetasas.
EJEMPLO DE LA NOMENCLATURA IUB
HEXOCINASA:
ATP: D-hexosa 6-fosfotransferasa E.C. 2.7.1.1.

El “2” la identifica como miembro de la clase 2 (transferasa).

El “7” identifica la subclase 7 (trasferencia de un grupo fosforilo)

El “1” identifica la subclase 1 (alcohol es el aceptor de fosforilo)

“hexosa -6” indica que el alcohol fosforilado está en carbono 6 de una hexosa.

GRUPOS PROSTETICOS
 Amplían el repertorio de capacidades catalíticas más allá de las proporcionadas
por los grupos funcionales presentes en las cadenas laterales.

 Los grupos prostéticos se incorporan de manera firme y estable en la


estructura de una proteína mediante fuerzas covalentes o no covalentes, es
decir tienen una unión fuerte con la enzima.

 Ejemplo: fosfato de piridoxal, mononucleotido de flavina, dinucleotido de


flavina, pirofosfato de tiamina, ácido lipoíco, y metales de transición como Fe,
Co, Cu, Mg, Mn y Zn.

Los metales pueden facilitar la unión y orientación de los sustratos, la formación


de enlaces covalentes o actuando como acido o base de Lewis para hacer sustratos
más electrofílicos (pobres en electrones) o nucleofílicos (ricos en electrones) y
por tanto más reactivos

COFACTORES
 Un cofactor es un componente no proteico que complementa a
una enzima (que es una sustancia proteica). El cofactor tiene que
estar presente en cantidades adecuadas para que la enzima pueda
actuar, catalizando una reacción bioquímica.

 Tienen funciones similares a los grupos prostéticos, su diferencia


es operacional no química.

 Los cofactores se unen débilmente y transitoriamente a sus


enzimas o sustratos afines, formando complejos disociables.
 Deben estar presentes en el ambiente circundante para promover la formación
de complejos, a fin que ocurra la catálisis.

 Los cofactores son iones metálicos inorgánicos como Manganeso, Magnesio,


Molibdeno, Cobalto, Zinc, Hierro, Niquel, Potasio o Cobre.

 Las enzimas que requieren un cofactor de ion metálico se denominan enzimas


activadas por metal.

Las enzimas que requieren los iones metálicos como grupos prostéticos se
llaman metaloenzimas

COENZIMAS: SIRVEN COMO TRASBORDADORES DE SUSTRATO


 Son moléculas orgánicas que no son proteínas y, en su mayoría, derivados de
vitaminas solubles en agua por fosforilación.

 Estas moléculas orgánicas, forman parte de los sitios activos de sus enzimas
proteicas. Dado que la coenzima forma parte del sitio activo de la enzima, la
enzima no puede trabajar en el sustrato sin ella.

 Las coenzimas sirven como medios reciclables que transportan muchos


sustratos desde un punto dentro de la célula a otro.

 Su función es doble: en primer lugar, estabilizan los átomos de hidrogeno o los


iones de hidruro que son demasiado reactivos para persistir en el agua.

En segundo lugar: aumentan el número de puntos de contacto entre el sustrato


y la enzima, lo que aumenta la afinidad y especificidad con la que los grupos
químicos pequeños están unidos

 Las coenzimas experimentan modificaciones en el marco de las reacciones


químicas. Pueden ceder o aceptar grupos funcionales o electrones.

 Hay coenzimas que mantienen una relación permanente con la enzima. Otras, en
cambio, solo experimentan una unión temporal.

 El vínculo comienza cuando una coenzima se acopla a una enzima, la cual se


encarga de captar su sustrato. La enzima transfiere electrones que recibe la
coenzima. Finalmente, la coenzima, ya reducida, puede desprenderse de la
enzima y cede sus electrones, retornando a su estado inicial.

 Es importante tener en cuenta que no todas las coenzimas aceptan los mismos
tipos de átomos. Pueden recibir grupos acetilos, hidrógenos, aminos u otras
clases según cada caso.
 En cuanto a las enzimas a las que cuales se adhieren, no existen restricciones:
una misma coenzima se puede unir a distintas enzimas.

Muchas coenzimas, cofactores y grupos prostéticos son derivados de las


vitaminas B

 Las vitaminas b solubles en agua suministran componentes importantes de


numerosas coenzimas.

 Ejemplo: la nicotinamida es un componente de las coenzimas redox NAD y


NADP.

 La riboflavina es un componente de las coenzimas redox FMN y FAD.

 El ácido pantoténico es un componente de la coenzima a.

Holoenzima: Ápoenzima mas


cofactor.

Ápoenzima: es catalíticamente
inactiva

LA CATALISIS OCURRE EN EL SITIO ACTIVO


 Emil Fischer propuso que las enzimas y sus sustratos interactúan para formar
un complejo “enzima-sustrato” cuya estabilidad térmica es mayor que la de la
propia enzima.

 Fischer comparo la presicion de una enzima para elegir sus sustratos con la
manera en que una cerradura distingue la llave adecuada, de tal manera que la
“cerradura” está formada por una bolsa en la superficie de la enzima llamada
“sitio activo”.

 Como su nombre lo indica es mucho más que un sitio de reconocimiento de


sustratos, proporciona el entorno en el que tiene lugar la transformación
química.

 Dentro del sitio activo, los sustratos se acercan entre si en una alineación
optima con los cofactores, grupos prostéticos y cadenas laterales de
aminoácido que participan en la catalizacion de la transformación de sustratos
en productos.

LAS ENZIMAS EMPLEAN MULTIPLES MECANISMOS PARA


FACILITAR LA CATALISIS.
 Las enzimas usan cuatro mecanismos generales para lograr mejoras en las tasas
de reacciones químicas.

 Catálisis por proximidad

 Catálisis por tensión

 Catálisis covalente

 Catálisis acido-base
 Para que las moléculas interactúen, deben estar dentro de la distancia de
formación de enlaces entre sí.

 Cuanto mayor sea su concentración, más frecuentemente se encontrarán entre


sí, y mayor será la velocidad a la que reaccionan.

 Las moléculas de sustrato se orientan en una posición ideal para que


interactúen químicamente. Esto da como resultado mejoras de velocidad de al
menos mil veces sobre la misma reacción no catalizada por enzimas.

Proximidad y Proximidad favorable y Proximidad y orientación


orientación orientación desfavorable favorable
desfavorable

 Contribuye a la capacidad del sitio activo para unir sustratos.

 Distinguimos dos tipos de catálisis ácido-base:

La catálisis específica de ácido o base: los únicos ácidos o bases que


participan son protones o iones de hidróxido. Es independiente de las
concentraciones de otros ácidos o bases presentes en la solución o en el sitio
activo.

 catálisis ácida general o a catálisis básica general se refiere a las


reacciones cuyas velocidades responden a todos los ácidos o bases presentes.
 Para las reacciones líticas, que implica romper un enlace covalente, las enzimas
normalmente se unen a sus sustratos en una conformación tensada que debilita
el enlace a través de la distorsión física y la polarización electrónica. Esta
conformación tensada imita a la del estado intermedio de transición, el punto
intermedio en la transformación de sustratos a productos.

 Polarización electrónica: modificación de las cargas en los futuros productos.

 Implica la formación de un enlace covalente entre la enzima y uno o más


sustratos. La enzima modificada se convierte así en un reactivo.

 La catálisis covalente proporciona una nueva vía de reacción cuya energía de


activación es más baja (y la velocidad de reacción es, por tanto, más rápida).

 El estado químicamente modificado de la enzima es transitorio. La finalización


de la reacción devuelve la enzima a su estado original no modificado. Por tanto,
su papel sigue siendo catalítico.
 La catálisis covalente es particularmente común entre las enzimas que
catalizan reacciones de transferencia grupales.

LOS SUSTRATOS INDUCEN CAMBIOS CONFORMACIONALES EN LAS


ENZIMAS
 El modelo de ajuste inducido de Daniel Koshland, establece que a medida que
los sustratos se unen a una enzima, inducen un cambio conformacional que es
análogo a colocar una mano (sustrato) en un guante (enzima).

 La enzima a su vez induce cambios recíprocos en sus sustratos, aprovechando la


energía de unión para facilitar la transformación de sustratos en productos.

Representación bidimensional del modelo de ajuste inducido de


Koshland del sitio activo de una liasa.

La unión del sustrato A —B induce cambios conformacionales en


la enzima que tensan el enlace entre A y B, facilitando su
separación.
LA PROTEASA DEL VIH ILUSTRA LA CATÁLISIS ÁCIDO-BASE
 Las enzimas de la familia de las proteasas aspárticas, que incluyen la enzima
digestiva pepsina, las catepsinas lisosómicas y la proteasa son producidas por el
virus del VIH, comparten un mecanismo común que emplea dos residuos de
aspartilo como catalizadores ácido-base.

 Un aspartato funciona como una base general, formando un intermedio de


estado de transición tetraédrico. Un segundo aspartato facilita luego la
descomposición de este intermedio tetraédrico.

 Los dos aspartatos del sitio activo pueden actuar simultáneamente como una
base general o como un ácido general porque su entorno inmediato favorece la
ionización de uno, pero no del otro.

① El aspartato X actúa como una base para activar una molécula


de agua mediante la abstracción de un protón.

② La molécula de agua activada ataca el enlace peptídico,


formando un intermediario tetraédrico transitorio.

③ El aspartato Y actúa como un ácido para facilitar la


descomposición del intermedio tetraédrico y la liberación de los
productos fraccionados mediante la donación de un protón al
grupo amino recién formado. El desplazamiento posterior del
protón en Asp X a Asp Y restaura la proteasa a su estado inicial.

LA QUIMOTRIPSINA Y LA FRUCTOSA-2,6-BISFOSFATASA ILUSTRAN LA


CATÁLISIS COVALENTE
 La catálisis por la serina proteasa quimotripsina implica la formación de un
intermediario covalente de acilo-enzima.
 Un residuo de seril conservado, serina 195, se activa a través de interacciones
con histidina 57 y aspartato 102. Si bien estos tres residuos están muy
separados en la estructura primaria, en el sitio activo de la proteína madura
plegada residen dentro de la distancia de formación de enlaces entre sí. Al
estar alineado el Asp 102-His 57-Ser 195, este trío forma una red enlazada de
carga que actúa como “transbordador de protones”.
① El sistema regulador de carga elimina un protón de Ser 195, lo
que lo convierte en un nucleófilo más fuerte.

② El Ser 195 activado ataca el enlace peptídico, formando un


intermediario tetraédrico transitorio.

③ La liberación de péptido del amino terminal se ve facilitada por


la donación de un protón al grupo amino recién formado por His
57 del sistema de carga y retransmisión, produciendo un
intermediario acilo-Ser 195.

④ El His 57 y el Asp 102 colaboran para activar una molécula de


agua, que ataca al acilo-Ser 195, formando un segundo intermedio
tetraédrico.

⑤ El sistema de regulación de carga dona un protón a Ser 195, lo


que facilita la descomposición del intermedio tetraédrico para
liberar el péptido carboxilo terminal.

⑥ Producto Final.

Es una enzima reguladora del gluconeogénesis, cataliza la liberación hidrolítica del


fosfato en el carbono 2 de la fructosa-2,6-bisfosfato

1. Lys 356 y Arg 257, 307 y 352 estabilizan la carga cuádruple


negativa del sustrato mediante interacciones carga-carga.

2. Glu 327 estabiliza la carga positiva en His 392.

3. El nucleófilo His 392 ataca al grupo fosforilo C-2 y lo


transfiere a His 258, formando un intermedio fosforil-enzima.
La fructosa-6-fosfato ahora deja la enzima.

4. El ataque nucleofílico por una molécula de agua, posiblemente


asistida por Glu 327 que actúa como una base, forma fosfato
inorgánico.

5. El ortofosfato inorgánico se libera


Enzimas: Mecanismo de acción
Importancia Biomédica

Las enzimas catalizan las reacciones químicas que hacen posible la vida en la tierra,
participan en la descomposición de los nutrientes para suministrar energía y componentes
químicos lograr el ensamblaje de esos bloques en proteínas, DNA, membranas, celulas y
tejidos, y posibilitar aprovechamiento de la energía para potenciar la motilidad celular, la
función neuronal y contracción muscular.

Casi todas las enzimas son proteínas.

Algunas incluyen RNA ribosomales y un puñado de moléculas de RNA imbuidas con


actividad de endonucleasa o nucleótido ligasa conocidas colectivamente como ribozimas.

Tienen la capacidad de detectar y cuantificar la actividad de enzimas especificas en sangre,


otros fluidos tisulares o extractos tisulares proporciona información que complementa la
capacidad del medico para diagnosticar enfermedades. Muchas condiciones patológicas son
consecuencia directa de cambios en la cantidad o en la actividad catalítica de enzimas claves
que resultan de defectos genéticos, déficits nutricionales, daño tisular, toxinas o infección
por patógenos virales o bacterianos (por ej., Vibrio Cholerae).

La proteasa renina, por ejemplo, se utiliza en la producción de quesos.

La lactasa, se emplea para eliminar lactosa de la leche para beneficiar a los individuos
intolerantes a la lactosa.

Las proteasas y amilasas aumentan la capacidad de los detergentes para eliminar la suciedad
y las manchas, mientras que otras enzimas pueden participar en la síntesis estereoespecífica
de fármacos complejos o antibióticos.

Las enzimas son catalizadores altamente específicos y efectivos

Las enzimas que catalizan la conversión de uno o más compuestos (sustratos) en uno o más
compuestos diferentes (productos) generalmente aumentan las velocidades de la reacción no
catalizada correspondiente por factores de 106 (un millón) o más.
Las enzimas pueden sufrir modificación transitoria durante la catálisis, pero no se consumen
ni se alteran permanentemente. Las enzimas también son en extremo selectivas.

A diferencia de la mayoría de los catalizadores utilizados en la química sintética, las enzimas


son especificas no solo para el tipo de reacción catalizada, sino también para un único
sustrato o un pequeño conjunto de sustratos muy relacionados.

Los sustratos se unión a través de “tres puntos de unión” las enzimas también pueden
producir productos quirales a partir de sustratos no quirales.

La reacción catalizada por enzimas del piruvato de sustrato no quiral produce


exclusivamente:

• L-lactato, no una mezcla racémica de D- y L-lactato.

Las enzimas están clasificadas por tipo de reacción

Algunos de los nombres de las enzimas descritas por primera vez en los primeros días de la
bioquímica persisten en uso hasta el día de hoy. Los ejemplos incluyen pepsina, tripsina y
amilasa. Los primeros bioquímicos generalmente llamaban a las enzimas recién descubiertas
añadiendo el sufijo asa a un descriptor para el tipo de reacción catalizada.

• Las enzimas que eliminan a los elementos de hidrógeno generalmente se denominan


deshidrogenasas.
• Las que enzimas que hidrolizan proteínas se denominan proteasas.
• Las enzimas que catalizan reordenamientos en la configuración de denominan
isomerasa.

Estos descriptores generales se complementaron con términos que indican el sustrato


particular en el que actúa la enzima:

• Xantina oxidasa
• Ribonucleasa pancreática (su fuente)
• Lipasa sensible a hormona (modo de regulación)
• Cisteína proteasa (mecanismo de acción)
Unión Internacional de Bioquímica (IUB, International Union of Biochemestry)
desarrollo un sistema de nomenclatura enzimático en el que cada enzima tiene un nombre
único y un numero de código que identifica el tipo de reacción catalizada y los sustratos
involucrados.

Las enzimas se agrupan en las siguientes clases:

• Oxidorreductasas
• Transferasas
• Hidrolasas
• Liasas
• Isomerasas
• Ligasas

El nombre IUB de hexocinasa es ATP:D-Hexosa 6-fosfotransferasa E.C. 2.7.1.1. Este


nombre se identifica como miembro:

• Clase 2 (transferasas)
• Subclase 7 (transferencia de un grupo fosforilo)
• Subclase 1 (alcohol es el aceptor de fosforilo)

Hexosa-6 indica que el alcohol fosforilado esta en carbono seis de una hexosa.

Grupos prostéticos, cofactores y coenzimas juegan importantes funciones en

la catálisis

Los grupos prostéticos denominados, cofactores y coenzimas, amplían el repertorio de


capacidades catalíticas más allá de las proteínas proporcionadas por los grupos funcionales
presentes en las cadenas laterales de aminoacilo de los péptidos.

Grupos prostéticos: Los grupos prostéticos se incorporan de manera firme y estable en la


estructura de una proteína mediante fuerzas covalentes o no covalentes.

Los ejemplos incluyen:

• Fosfato de piridoxal
• Mononucleótido de flavina
• Dinucleótido de flavina adenina
• Pirofosfato de tiamina
• Ácido lipoico
• Biotina

Metales de transición tales como:

• Hierro (Fe)
• Cobalto (Co)
• Cobre (Cu)
• Magnesio (Mg)
• Manganeso (Mn)
• Cinc (Zn)
BIOQUÍMICA
IMPORTANCIA BIOMEDICA:
El análisis cinético puede revelar el orden y el número de los pasos individuales a
través de los cuales las enzimas transforman sustratos en productos, y junto con la
mutagénesis dirigida al sitio, los análisis cinéticos pueden revelar detalles del
mecanismo catalítico de una enzima determinada.

En la sangre la aparición o la elevación de los niveles de enzimas particulares sirven


como indicadores clínicos para patologías como:

 infartos de miocardio
 cáncer de próstata
 lesiones en el hígado.

La cinética enzimática aplicada representa la herramienta principal a través de la


cual los cientificos identifican y caracterizan a los agentes terapéuticos que
inhiben selectivamente las velocidades de los procesos catalizados por enzimas
específicas.

LAS REACCIONES CATALITICAS QUIMICAS SON DESCRITAS


UTILIZANDO ECUACIONES EQUILIBRADAS:
Una ecuación química equilibrada enumera las especies químicas iniciales (sustratos)
presentes y las nuevas especies químicas (productos) formadas para una reacción
química particular, todo en sus respectivas proporciones o estequiometria.

Las flechas dobles indican reversibilidad, una propiedad intrínseca de todas las
reacciones químicas.

Los productos son a menudo utilizados para designar a los reactantes cuya formación
esta favorecida de modo termodinámico.

Las reacciones para las cuales los factores termodinámicos favorecen fuertemente
la formación de los productos a los que apunta la flecha a menudo se representan con
una sola flecha como si fueran “irreversibles”.
Las flechas unidireccionales también se usan para describir reacciones en células
vivas donde los productos de la reacción son inmediatamente consumidos por una
reacción posterior catalizada por enzimas o rápidamente escapan de la célula.

LOS CAMBIOS EN LA ENERGIA LIBRE DETERMINAN LA DIRECCION Y EL ESTADO DE


EQUILIBRIO DE LAS REACCIONES QUIMICAS:
El cambio de energía libre

Describe en forma cuantitativa tanto la dirección en la cual una reacción química


tendera a proceder como las concentraciones de reactantes y productos que
estarán presentes en equilibrio.
La reacción química es igual a la suma de las energías libres de formación de los productos de
reacción menos la suma de las energías libres de formación de sustratos.

Si la energía libre de la formación de los productos es mas baja que la de los


sustratos, los signos de energía libre serán negativos, indicando que la reacción tal
como esta escrita es favorecida en dirección de izquierda a derecha. Tales
reacciones se conocen como: espontaneas.

El signo y la magnitud del cambio de energía determinan cuanto avanzara la

reacción. Keq es igual al producto de las concentraciones de los productos

de reacción.

Si la energía libre es un numero negativo, keq será mayor que la unidad, y la


concentración de los productos en equilibrio excederá la de los sustratos.

Si la energía libre es un positivo, la Keq será menor que la unidad, y se favorecerá la


formación de sustratos.

Dado que la AG0 es una función exclusiva de los estados inicial y final de las especies
que reaccionan, puede proporcionar información solo sobre la dirección y el estado
de equilibrio de la reacción. AG0 es independiente del mecanismo de la reacción y no
proporciona información sobre las velocidades de las reacciones.

LAS VELOCIDADES DE LAS REACCIONES ESTAN DETERMINADAS POR SU ENERGIA


DE ACTIVACION
El estado de transición:

Intermedio transitorio, en el que no hay sustrato libre, ni el producto existe

AGF define la energía de activación:

Independientemente del signo o magnitud de AG, AGF para la mayoría de las


reacciones químicas tiene un signo positivo lo que indica que la formación del estado
de transición requiere superar una o mas barreras de energía.

AGF para alcanzar un estado de transición a menudo se denomina energía de


activación Eact.

Los parámetros termodinámicos que determinan que tan rápido una reacción avanza
son los valores de AGF para la formación de los estados de transición.

NUMEROSOS FACTORES AFECTAN LA VELOCIDAD DE LA REACCIÓN


La teoría cinética también llamada teoría de colisión, establece que para que dos
moléculas reaccionen:

1. deben acercarse dentro de una distancia de formación de enlaces entre si o


colisionar
2. deben poseer suficiente energía cinética para superar la barrera de
energía para alcanzar el estado de transición.
Las condiciones que tienden a aumentar la frecuencia o energía de la colisión entre
sustratos tenderán a aumentar la velocidad de la reacción en la que participan.

Temperatura:

Elevar la temperatura ambiente aumenta la energía cinética.

Aumentar la energía cinética de las moléculas también aumenta su rapidez de


movimiento y por tanto la frecuencia con la cual colisionan.

Concentración del reactante:

Para dos moléculas diferentes, A y B, la frecuencia con la cual chocan se duplicará


si se duplica la concentración de A o de B. Si las concentraciones tanto de A como
de B se duplican, la probabilidad de choque aumentará cuatro veces.

Para una reacción química que procede a una temperatura constante que comprende
una molécula, cada una, de A y B, el número de moléculas que poseen energía cinética
suficiente para superar la barrera de energía de activación será una constante. Por
ende, el número de choques con suficiente energía para producir el producto P será
directamente proporcional al número de choques entre A y B.

Remplazar el signo de proporcionalidad con signos de igual al introducir una

constante de índice k. La suma de las proporciones molares de los reactivos define el


orden cinético de la reacción.
Considere la reacción. El coeficiente estequiométrico para el reactivo único, A, es
dos. Por ende, el índice de producción de P es proporcional al cuadrado de [A], y se
dice que la reacción es de segundo orden respecto al reactivo A. En este caso, la
reacción general también es de segundo orden. Por ende, k1 se denomina una
constante de índice de segundo orden. En la reacción se describe una reacción de
segundo orden simple entre dos reactivos diferentes, A y B. El coeficiente
estequiométrico para cada reactivo es uno. Por ende, mientras que el orden general
de la reacción es dos, se dice que es de primer orden respecto de A, y de primer
orden respecto de B.

condiciones de pseudoprimer orden, la concentración del o los reactivos fijos


permanece casi constante. De este modo, el índice de reacción dependerá de
manera exclusiva de la concentración del reactivo variable, a veces también llamado
el reactivo limitante.

Keq es una reacción de constantes de velocidad:

La proporción de k1 a k–1 se denomina la constante de equilibrio K, propiedades


importantes de un sistema en equilibrio:

1. la constante de equilibrio es una relación de las constantes de velocidad de


reacción. (no a las velocidades de reacción).
2. En equilibrio las reacciones (no las constantes de velocidad) de las
reacciones hacia adelante y hacia atrás son iguales.
3. El equilibrio es un estado dinámico. Aunque no hay cambio neto de la
concentración de sustratos o productos, moléculas individuales de sustrato
y producto continuamente se están interconvertidos. La interconvertibilidad
puede ser probada añadiendo a un sistema en equilibrio un rastro de
producto radioisotópico.

CINETICA DE LA CATALISIS ENZIMATICA:


Las enzimas reducen la barrera de la energía de la activación para una reacción:

- Todas las enzimas aceleran los índices de reacción al disminuir la ΔGF para la
formación de estados de transición.

- la enzima puede imaginarse como unida al intermediario de estado de transición


de manera más estrecha que a sustratos o productos.

- La proteasa del VIH ilustra la catálisis por una enzima que disminuye la barrera
de activación al estabilizar un intermediario de estado de transición

- La catálisis por enzimas que procede por medio de un mecanismo de reacción


única tipicamente ocurre cuando el intermediario de estado de transición
forma un enlace covalente con la enzima. El mecanismo catalítico de la serina
proteasa quimotripsina ilustra la manera en la cual una enzima utiliza catálisis
covalente para proporcionar una vía de reacción única que posee una Eact más
favorable.

LAS ENZIMAS NO AFECTAN A Keq:


- La presencia de una enzima no tiene efecto sobre la ΔG0 para la reacción
general, que está en función sólo de los estados inicial y final de los reactivos.

- Dado que la enzima a ambos lados de las dobles flechas está presente en igual
cantidad y forma idéntica, la expresión para un equilibrio constante, reduce a
uno idéntico al de la reacción en ausencia de la enzima. Por tanto, las enzimas
no tienen efecto sobre Keq.

MULTIPLES FACTORES AFECTAN LAS VELOCIDADES DE LAS REACCIONES


CATAIZADAS POR ENZIMAS:
- Incrementar la temperatura aumenta la velocidad tanto de las reacciones
catalizadas por enzimas como de las no catalizadas, al acrecentar la energía
cinética y la frecuencia de colisión de las moléculas que reaccionan. La energía
termina también puede aumentar la flexión conformacional de la enzima a un
punto que excede la barrera de energía para interrumpir las interacciones no
covalentes que mantienen su estructura tridimensional. La cadena polipeptidica
comienza a desplegarse o desnaturalizarse con una perdida acompañante de la
actividad catalítica.

- Las enzimas de los humanos por lo general muestran estabilidad a


temperaturas de hasta 45 a 55°C.

- El coeficiente de temperatura (Q10) es el factor por el cual la velocidad de un


proceso biológico aumenta por un incremento de 10°C en la temperatura.

- Para los mamíferos y otros organismos homeotérmicos, el cambio en las


velocidades de reacción de las enzimas con la temperatura asume una
importancia fisiológica solo en circunstancias como la fiebre o la hipotermia.

Concentración de los iones de hidrogeno:


Casi todas las reacciones catalizadas por enzima muestran una dependencia
importante de la concentración de ion hidrógeno. La mayoría de las enzimas
intracelulares exhiben una actividad optima en los valores.

Para las enzimas cuyo mecanismo involucra la catálisis ácido-base, los residuos
involucrados deben estar en el estado apropiado de protonación para que la reacción
continúe.

Los grupos cargados más frecuentes son grupos carboxilato (negativos) y aminas
protonadas (positivos). La ganancia o pérdida de grupos cargados cruciales afecta
de manera adversa la unión a sustrato y, así, retrasará o anulará la catálisis.

LOS ANALISIS DE LAS REACCIONES CTALIZADAS POR ENZIMAS MIDEN


TIPICAMENTE LA VELOCIDAD INICIAL:
La velocidad inicial (Vi) de la reacción esencialmente la de la velocidad de la
reacción directa, es proporcional a la concentración de enzima, es decir es
pseudoprimer orden con respecto a la enzima. La medición de la inicial, por tanto,
permite estimar la cantidad de enzima presente en una muestra biológica.

LA CONCENTRACION DEL SUSTRATO AFECTA LA VELOCIDAD D REACCION:


En condiciones de pseudoprimer orden, la conducta de una enzima con múltiples
sustratos imitará a la de una que cuenta sólo con un solo sustrato.

Para una enzima tipica, a medida que la concentración de sustrato aumenta, vi se


incrementa hasta que alcanza un valor máximo Vmáx. Cuando los aumentos
adicionales de la concentración de sustrato no aumentan más la vi, se dice que la
enzima está “saturada” con sustrato. La forma de la curva que relaciona la
actividad con la concentración de sustrato es hiperbólica. sólo las moléculas de
sustrato que se combinan con la enzima como un complejo de enzima-sustrato
(ES) pueden transformarse en producto. Ya que la constante de equilibrio para la
formación del complejo de enzima-sustrato no es infinitamente grande, sólo una
fracción de la enzima puede estar presente como un complejo ES, aun cuando el
sustrato está presente en exceso.

LAS ECUACIONES DE MICHAELS- MENTEN Y HILL MODELAN LOS EFECTOS DE LA


CONCENTRACION DE SUSTRATOS:
La constante Km de Michaelis es la concentración de sustrato a la cual vi es la
mitad de la velocidad máxima (Vmáx/2) alcanzable a una concentración particular
de enzima. De este modo, Km tiene las dimensiones de la concentración de sustrato.
La dependencia de la velocidad de reacción inicial de [S] y Km puede ilustrarse al
evaluar la ecuación de MichaelisMenten en tres condiciones:

1. Cuando [S] es mucho menor que Km, el término Km + [S] es en esencia igual
a la Km. El remplazo de Km + [S] con Km reduce la ecuación donde ≈
significa “aproximadamente igual a”. Dado que tanto Vmáx como Km son
constantes, su proporción es una constante. cuando [S] está muy por debajo
de Km, vi es proporcional a k[S]. Por ende, la velocidad de reacción inicial es
directamente proporcional a [S].
Cuando [S] es mucho mayor que Km, el término Km + [S] es en esencia igual a
[S]. Reemplazar Km + [S] por [S] reduce la ecuación, cuando [S] excede con
mucho a Km, la velocidad de reacción es máxima (Vmáx) y no está afectada
por aumentos adicionales de la concentración de sustrato.
2. Cuando [S] = K La ecuación declara que cuando [S] es igual a Km, la
velocidad inicial es de la mitad del máximo. La ecuación también revela que
Km es —y puede determinarse la manera experimental a partir de— la
concentración de sustrato a la cual la velocidad inicial es de la mitad del
máximo.

Una forma lineal de la ecuación de michaelinis- menten se emplea para


determinar Km y Vmax.

La medición directa del valor numérico de Vmáx, y, por consiguiente, el cálculo de


Km, a menudo requiere concentraciones altas poco prácticas de sustrato. Una forma
lineal de la ecuación de MichaelisMenten evita esta dificultad y permite extrapolar
Vmáx y Km desde datos de velocidad inicial obtenidos a concentraciones de sustrato
menores que las que producen saturación.

Usar un gráfico del doble recíproco para determinar constantes cinéticas, es


importante evitar la introducción de sesgo por la agrupación de datos a valores bajos
de 1/[S].

La constante catalítica, Kcat:

La actividad de preparaciones de enzima im puras por lo general se expresa como


actividad específica (Vmáx dividida por la concentración de proteína). Para una
enzima homogénea es posible calcular su número de recambio (Vmáx dividida por los
mol de enzima presentes). Si se conoce el número de sitios activos presentes, la
actividad cata lítica de una enzima homogénea se expresa mejor como su constante
catalítica, kcat (Vmáx dividida por el número de sitios activos, St).
Eficiencia catalítica, Kcat/Km:

la capacidad máxima de una enzima dada para convertir sustrato en producto es


importante, los beneficios de una kcat alta sólo pueden obtenerse si la Km es
suficientemente baja. La eficiencia catalítica de enzimas se expresa mejor en
términos de la proporción de estas dos constantes cinéticas, kcat/Km.

Para ciertas enzimas, una vez que el sustrato se une al sitio activo, se convierte en
producto y se libera con tanta rapidez como para hacer a estos eventos
efectivamente instantáneos. Para estos catalíticos tan eficientes, el paso limitante
es la formación del complejo ES, Esas enzimas están limitadas por difusión.

Para ciertas enzimas, una vez que el sustrato se une al sitio activo, se convierte en
producto y se libera con tanta rapidez como para hacer a estos eventos
efectivamente instantáneos. Para estos catalíticos tan eficientes, el paso limitante
es la formación del complejo ES. Se dice que esas enzimas están limitadas por
difusión.

El ácido graso sintetasa extiende este concepto un paso más allá al fijar de manera
covalente la cadena de ácido graso sustrato en crecimiento a una cadena de biotina
que rota de un sitio activo a otro dentro del complejo hasta que se completa la
síntesis de una molécula de ácido palmítico.

Km puede aproximarse a una constante de unión:


La afinidad de una enzima por su sustrato es la inversa de la constante de
disociación Kd para la disociación del complejo de enzimasustrato ES.

Mientras menor es la tendencia a disociarse de la enzima y su sustrato, mayor es la


afinidad de la enzima por su sustrato.

La ecuación de Hill descrie el comportamiento de las enzimas que exhiben unión


cooperativa de sustrato:

algunas se unen a sus sustratos de una manera cooperativa, análoga a la unión de


oxígeno por la hemoglobina. La conducta cooperativa es una propiedad exclusiva de
enzimas multiméricas que unen sustrato en múltiples sitios.

Ni la expresión de MichaelisMenten ni sus gráficos derivados pueden usarse para


evaluar cinética cooperativa. Por ende, los enzimólogos emplean una representación
gráfica de la ecuación de Hill que en su origen fue obtenida para describir la unión
cooperativa de O2 por la hemoglobina.

La ecuación establece que cuando [S] es bajo en relación con k´, la velocidad inicial
de reacción aumenta como la enésima potencia [S].
La pendiente de la línea, n, es el coeficiente de Hill, un parámetro empírico cuyo
valor es una función del número, el tipo y la fuerza de las interacciones de los sitios
del sustrato múltiple en la enzima. Cuando n= 1, todos los sitios de unión se
comportan de manera independiente y se observa el comportamiento cinético simple
de Michaelis-Menten. Si n es mayor que 1, se dice que la enzima exhibe
cooperatividad positiva. La unión del sustrato por tanto, a un sitio potencia la
afinidad de los sitios restantes para enlazar el sustrato adicional. Cuanto mayor es
el valor de n, mayor es el grado de cooperatividad y mas marcadamente sigmoidal
será el diagrama de Vi versus [S].

EL ANALISIS CINETICO DISTINGUE LA INHIBICION COMPETITIVA DE LA NO


COMPETITIVA:
Los inhibidores de las actividades catalíticas de enzimas proporcionan tanto
agentes farmacológicos como recursos de investigación para estudiar el mecanismo
de acción de las enzimas. La fuerza de la interacción entre un inhibidor y una
enzima depende de las fuerzas importantes en la estructura de proteína y la unión
de ligando (enlaces de hidrógeno, interacciones electrostáticas, interacciones
hidrofóbicas y fuerzas de van der Waals; Los inhibidores pueden clasificarse con
base en su sitio de acción en la enzima, en si producen modificación química de la
enzima, o en los parámetros de cinética sobre los cuales influyen. Los compuestos
que imitan el estado de transición de una reacción catalizada por enzima (análogos
de estado de transición) o que aprovechan la maquinaria catalítica de una enzima
(inhibidores basados en mecanismo) pueden ser inhibidores en particular potentes.

Se distinguen dos clases de inhibidores con base en si el aumento de la concentración


de sustrato supera o no la inhibición.

Inhibidores competitivos
Inhibidores no competitivos

Los inhibidores competitivos tipicamente se asemejan a los sustratos:


Los efectos de los inhibidores competitivos pueden superarse al aumentar la
concentración de sustrato. La inhibición competitiva del inhibidor (I) se une a la
porción de unión a sustrato del sitio activo, lo que bloquea el acceso por el sustrato.

las estructuras de casi todos los inhibidores competitivos clásicos tienden a


asemejarse a las estructuras de un sustrato y, así, se llaman análogos de
sustrato. La inhibición de la enzima succinato deshidrogenasa por el malonato
ilustra la inhibición competitiva por un análogo de sustrato. La succinato
deshidrogenasa cataliza la eliminación de un átomo de hidrógeno de cada uno de
los dos carbonos metileno del succinato. Tanto el succinato como su análogo
estructural malonato (−OOC—CH2 —COO−) pueden unirse al sitio activo de la
succinato deshidrogenasa, lo que forma un complejo ES o uno EI,
respectivamente. Sin embargo, dado que el malonato sólo contiene un átomo de
metileno, no puede pasar por deshidrogenación.

Un inhibidor competitivo actúa al disminuir el número de moléculas de enzima libres


disponibles para unión a sustrato, esto es, para formar ES y, así, finalmente para
formar producto.

Un inhibidor competitivo y sustrato ejercen efectos recíprocos sobre la


concentración de los complejos EI y ES. Dado que la formación de complejos ES
elimina enzima libre disponible para combinarse con el inhibidor, el aumento de [S]
disminuye la concentración del complejo EI y aumenta la velocidad de reacción.

Los diagramas dobles recíprocos facilitan la evaluación de los inhibidores:

Los diagramas dobles recíprocos se usan tipicamente para distinguir entre


inhibidores competitivos y no competitivos y la simplificar la evaluación de las
constantes de inhibición.

Los inhibidores no competitivos simples disminuyen Vmax pero no afecta Km:

En la inhibición no competitiva estricta, la unión del inhibidor no afecta la unión de


sustrato; mientras que el complejo enzima inhibidor puede unir todavía el sustrato,
su eficacia en la transformación del sustrato al producto, reflejado por Vmax, se
reduce. Los inhibidores no competitivos se unen a las enzimas en sitios distintos del
sitio de unión al sustrato.

La inhibición no competitiva simple, E y EI poseen idéntica afinidad por el sustrato,


y por el complejo EIS genera producto a una velocidad insignificante.

La inhibición no competitiva compleja, se produce cuando la unión del inhibidor


afecta la aprente afinidad de la enzima por el sustrato, causando que las líneas se
intercepten en el tercero o cuarto cuadrante de un diagrama doble recíproco.

Enzimas venenosas de inhibidores irreversibles:

La enzima por completo activa puede recuperarse con tan sólo eliminar el inhibidor
del medio circundante. Varios otros inhibidores actúan de manera irreversible al
producir modificación química de la enzima. Estas modificaciones por lo general
comprenden hacer o romper enlaces covalentes con residuos aminoacilo esenciales
para la unión a sustrato, catálisis o mantenimiento de la conformación funcional de la
enzima.
Una enzima que ha sido “envenenada” por un inhibidor irreversible, permanece
inhibida incluso después de la eliminación del inhibidor remanente del medio
circundante Inhibición basada en mecanismos:

Los inhibidores “basados en mecanismo” o “suicidas” son análogos de sustrato


especializados que contienen un grupo químico que puede transformarse mediante la
maquinaria catalítica de la enzima blanco. Después de la unión al sitio activo, la
catálisis por la enzima genera un grupo muy reactivo que forma un enlace covalente
y bloquea la función de un residuo catalíticamente esencial.

EL CONOCIMIENTO DE LA CINETICA ENZIMATICA, SU MECANISMO E INHIBICION


FAVORECE EL DESARROLLO DE FARMACOS:
Muchos fármacos actúan como inhibidores enzimáticos:

El objetivo de la farmacología es identificar agentes que pueden

1. Destruir o impedir el crecimiento, la invasividad o el desarrollo de


agentes patógenos invasores.
2. Estimular mecanismos de defensa endógenos.
3. Detener o impedir procesos moleculares aberrantes desencadenados por
estimulos genéticos, ambientales o biológicos, con perturbación mínima de
las funciones celulares normales del huésped.

Sus diversos roles fisiológicos y alto grado de selectividad de sustrato, las enzimas
constituyen blancos naturales para la creación de fármacos que son tanto potentes
como específicos.

Las reducen
estatinas:la producción de colesterol inhibiendo la enzima HMG-CoA reducta.

bloquean la replicación del VIH inhibiendo la


Emtricitabina y tenofovir disoproxil fumarato:
transcriptasa inversa viral.

El tratamiento farmacológico de la hipertensión incluye la administración de un


inhibidor de la enzima convertidora de la angiotensina, lo que reduce el nivel de
angiotensina I, un vasoconstrictor.

La cinética enzimática define las condiciones de análisis apropiadas:

El conocimiento del comportamiento cinético de la enzima de interés es necesario,


ante todo, para seleccionar las condiciones de análisis apropiadas para detectar la
presencia de un inhibidor.

La cinética enzimática proporciona los medios para cuantificar y comparar la


potencia de diferentes inhibidores y definir su modo de acción.

La mayoría de os fármacos están metabolizados in vivo:


Con el fin de minimizar su dosis efectiva, y por tanto, la posibilidad de efectos
secundarios nocivos, un fármaco debe ser resistente a la degradación por las
enzimas presentes en el paciente o por patógenos, un proceso denominado
metabolismo de fármacos.

La penicilina y otros antibioticos betalactámicos bloquean la síntesis de la pared


celular en bacterias inactivando irreversiblemente la enzima alanil alanina
carboxipeptidasa-transpeptidasa.
Muchas bacterias sin embargo producen betalactamasas que hidrolizan la función de
betalactama critica en la penicilina y fármacos relacionados. Una estrategia para
superar la resistencia a los antibióticos es administrar simultáneamente un inhibidor
de betalactamasa con un antibiótico betalactámico.

La transformación metabólica a veces se requiere para convertir un precursor de


fármaco inactivo o profármaco en su forma biológicamente activa.

L diseño efectivo y la administración de profármacos requiere el conocimiento de la


cinética y los mecanismos de las enzimas responsables de su transformación en
formas biológicamente activas.

NOTA: revisar imágenes del libro y las formulas.


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Las vitaminas son un grupo de nutrientes orgánicos necesarios en pequeñas cantidades para
una variedad de funciones bioquímicas, que por lo general no pueden ser sintetizadas por el
cuerpo y deben de ser aportadas por la dieta.
 Excepciones a este concepto:
Vitamina D: por sintetizarse a partir de 7-dehidrocolesterol por exposición a la luz solar
Niacina: porque se puede formar a partir del aminoácido esencial Triptófano.

VITAMINAS LIPOSOLUBLES
Compuestos hidrófobos que se pueden absorber de manera eficiente solo cuando hay una
absorción normal de grasas.
Se transportan en la sangre en lipoproteínas (quilomicrones) o se fusionan a proteínas
específicas de unión.
Condiciones que afectan la absorción de estas vitaminas:
 Dieta baja en grasas
 Esteatorrea
 Trastornos del sistema biliar

VITAMINA A: Dos compuestos tienen actividad de vitamina A:


 RETINOIDES: Retinol, retinaldehído y ácido retinoico (Vitamina A preformada que se
encuentra solo en alimentos de origen animal)

 CAROTENOIDES: α, β, y γ-carotenos y la criptoxantina (provitamina A de origen


vegetal)
 El β-caroteno se escinde en la mucosa intestinal por acción de la Caroteno
Dioxigenasa produciendo retinaldehído que se reduce a Retinol y se secreta en
quilomicrones.
 La actividad intestinal de la caroteno Dioxigenasa es baja pudiendo observar β-
carotenos sin ningún cambio en la circulación.
 6μg de β-caroteno equivale a 1μg de Retinol preformado.
 Equivalente de actividad del Retinol RAE: tiene en cuenta la absorción incompleta y el
metabolismo de los carotenoides. 1 RAE= 1μg de todo-trans-retinol, 12μg de β-
caroteno y 24μg de α-caroteno o β-criptoxantina.
Función en la Vista:
En la retina, el retinaldehído funciona como un grupo prostético de la proteína Opsina,
formando en los bastones Rodopsina y en los conos Yodopsina. Que reaccionan de la siguiente
manera:
El todo-trans-retinol se isomeriza a  11-cis-retinol luego se oxida a  11-cis-
retinaldehído  Reacciona con un residuo de lisina en la proteína Opsina formando  la
Holoproteina Rodopsina La absorción de la luz crea una isomerización del retinaldehído de
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 11-cis a todo-trans y un cambio conformacional en la Opsina resultando en  liberación del


retinaldehído de la proteína y el inicio de un impulso nervioso.
 La forma excitada de la Rodopsina es la Batorodopsina
 La clave para iniciar el ciclo visual es la disponibilidad del 11-cis-retinaldehído
El ácido Retinoico tiene un papel en la regulación de la expresión genética y la
diferenciación tisular: Una función principal de la vitamina A es el control de la diferenciación
celular y la renovación.
 El ácido todo-trans-retinoico y el ácido 9-cis-retinoico, regulan el crecimiento, el
desarrollo y la diferenciación tisular.
 Al igual que las hormonas tiroides, esteroides y vitamina D, el ácido Retinoico se fusiona a
los receptores nucleares que se unen a los elementos de respuestas del ADN y regulan la
transcripción de genes específicos.
 Receptores del ácido retinoico RAR: se unen al todo-trans-retinoico o al 9-cis- retinoico.
 Receptores de retinoides X RXR: se combinan al ácido 9-cis-retinol. Estos también forman
dímeros con la vitamina D, la hormona de la tiroides y otros receptores de acción nuclear.
DEFICIENCIA DE VITAMINA A:
 Es la causa preventiva más importante de ceguera. Empieza con una pérdida de sensibilidad
a la luz verde, luego deterioro para adaptarse a la luz tenue y por ultimo una ceguera
nocturna. Si esta se prolonga puede llegar a una Xeroftalmia: queratinización de la córnea y
la ceguera.
 Deterioro de la respuesta inmune
 Disminuye la función de la vitamina D y de la hormona tiroidea debido a la falta del
ácido 9-cis-retinoico para formar dímeros de receptores activos. No se activa la
expresión genética debido a que tanto la vitamina D como la hormona tiroides se
desvían a unirse a los RXR.
EXCESO DE LA VITAMINA A:
 La vitamina A no ligada causa lisis de la membrana y daño tisular.
 Afecta el sistema nervioso central
 Causa hepatomegalia e hiperlipemia
 Altera la homeostasis del calcio produciendo un engrosamiento de los huesos,
hipercalcemia y calificación de los tejidos blandos.
 En la piel causa sequedad, descamación y alopecia.
 Altera la vitamina D y hormona tiroidea por la formación de homodímeros RXR, no
habrán suficientes RXR para formar heterodímeros con la vitamina D y la hormona
tiroidea.
VITAMINA D: No es estrictamente una vitamina por sintetizarse
en la piel. Las ingestas altas de esta vitamina reducen
el riesgo de resistencia a la insulina, la
 La función principal de esta vitamina es la regulación de
obesidad, síndrome metabólico y distintos
la absorción del calcio y la homeostasis. canceres como el de próstata y el
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 Regula la proliferación y diferenciación celular.


La vitamina D se sintetiza en la piel a partir de un intermediario de la síntesis del colesterol
llamado 7-dehidrocolesterol. Que experimenta una reacción no enzimática al exponerse la luz
ultravioleta produciendo previtamina D, este se somete a una reacción adicional por un
periodo de horas para formar Colecalciferol que se absorbe en el torrente sanguíneo.
Proceso pata llegar al metabolito activo Calcitriol: El Colecalciferol se somete a dos
hidroxilaciones para producir el metabolito activo 1,25- dihidroxivitamina D o Calcitriol. El
proceso es el siguiente:
En el hígado el Colecalciferol se hidroxila para formar el derivado 25-hidroxicolecalciferol o
calcidiol  Se libera a la circulación unido a una globulina que se una a la vitamina D  en el
riñón se somete a otra hidroxilación para producir el metabolito activo 1,25-
Dihidroxicolecalciferol o Calcitriol.
 La enzima encargada de producir el metabolito inactivo de la vitamina D es calcidiol-
24-hidroxilasa
 El Calcitriol actúa para reducir su propia síntesis al inducir la 24-hidroxilasa y reprimir
la 1-hidroxilasa en el riñón.
La función principal de la vitamina D es mantener la concentración de calcio en el plasma y lo
logra de tres maneras:
 Aumentando la absorción intestinal del calcio.
 Reducir la excreción del calcio (estimulando la reabsorción de los túbulos renales
distales)
 Moviliza el mineral óseo.
El Calcitriol está involucrado en:
 Secreción de insulina
 Síntesis y secreción de hormonas parotídeas y tiroideas
 Inhibición de la producción de interleuquina por los linfocitos T En la mayoría actúa como
activados y de la inmunoglobulina por los linfocitos B activados una hormona esteroidea
 Diferenciación de la células precursoras de los monocitos
 Modulación de la proliferación celular
DEFICIENCIA DE VITAMINA D:
 Raquitismo: los huesos de los niños no se mineralizan como consecuencia de la mala
absorción del calcio.
 Osteomalacia: en adultos resulta de la desmineralización del hueso
IMPORTANTE: No hay pruebas de que la vitamina D sea beneficiosa en el tratamiento de la
Osteoporosis pero si en el tratamiento de la osteomalacia.
EXCESO DE VITAMINA D:
 Calcinosis: calificación de los tejidos blandos
 Hipercalcemia: aumento de la concentración del calcio en la sangre, pueda ser por
defectos genéticos en la calcidiol 24-hidrosilasa
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 DATO CURIOSO: por exposición al sol no se puede llegar a una intoxicación por esta
vitamina debido a la capacidad limitada de producir 7-dehidrocolesterol, al contrario la
exposición prolongada lleva a la producción de compuestos inactivos.
VITAMINA E: Está constituida por dos familias de compuestos: los tocoferoles y
tocotrienoles. El más activo es el D-α-tocoferol
 No tiene una función metabólica precisamente definida
 Actúa como un antioxidante liposoluble en las membranas celulares
 Es importante para mantener la fluidez de la membrana celular
 Papel poco definido en la señalización celular
Función principal de la Vitamina E: romper la cadena y atrapar radicales libres de las
membranas celulares y las lipoproteínas del plasma, reaccionando con los radicales del peróxido
lipídico formados por la peroxidación de los ácidos grasos poliinsaturados.
Radical Tocoferoxil:
 Es relativamente no reactivo y forma compuestos no radicales
 Se reduce de nuevo a tocoferol por la reacción con la vitamina C del plasma
 De la reacción con la vitamina C resulta: el radical monodiescobato de estaño que
mediante una reacción enzimática o no enzimática forma ascorbato y
deshidroascorbato de los cuales ninguno es radical.
DEFICIENCIA DE VITAMINA E: Se presenta en pacientes con malformaciones de la grasa,
fibrosis quística y algunas formas de enfermedades hepáticas crónicas. Causando:
 Daño en las membranas nerviosas y musculares extremadamente rara y grave
 En bebes prematuros las reservas de esta vitamina son inadecuadas produciendo
eritrocitos anormalmente frágiles por la peroxidación de los lípidos lo que conduce a
una anemia hemolítica
VITAMINA K:
 Se descubrió como resultado de las investigaciones sobre la causa de un trastorno de la
coagulación en el ganado y los pollos.
 Necesaria para la síntesis de proteínas de la coagulación sanguínea
 El antagonista más utilizado para reducir la coagulación sanguínea en pacientes con
riesgo de trombosis es: Warfarina
Existen tres compuestos con actividad biológica de la vitamina K:
 Filoquinona: se encuentra en los vegetales verdes
 Menaquinona: se sintetiza por bacterias intestinales
 Menadiona: también el menadiol diacetato, ambos compuestos son sintéticos y pueden
metabolizarse a Filoquinona.
La vitamina K funciona como coenzima en la formación del γ-carboxiglutamato de la siguiente
forma:
La vitamina K hidroquinona se oxida mediante la
enzima Vitamina k epoxidasa formando 



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Vitamina K epóxido, en el proceso activa un residuo de glutamato en el sustrato de la proteína a


un Carbanión  reacciona por una acción no enzimática con el CO2 a γ-carboxiglutamato.

El epóxido de la vitamina K se reduce a la Vitamina K quinona mediante la enzima Vitamina K


epóxido reductasa que es sensible a la Warfarina (en este puntos es que actúa la Warfarina
para detener la producción de componentes de la coagulación) luego la quinona se reduce a
hidroquinona por la misma enzima sensible a la Warfarina para volver a producir el ciclo.
 El epóxido de la vitamina K no se reduce en presencia de Warfarina
 Una dosis alta de vitamina K es el antídoto para una sobredosis de Warfarina
 El γ-carboxiglutamato quelata los iones de calcio y así permite la unión de las proteínas que
coagulan la sangre a la membrana.
 La vitamina K es importante en la síntesis de proteínas óseas y otras proteínas de unión al
calcio
 Proteínas que experimentan la misma carbonización del glutamato dependiente de la
vitamina K: osteocalcina y proteína Gla en la matriz del hueso, la nefrocalcina en el riñón y el
producto del gen Gas6
 El producto del gen Gas6 está involucrado tanto en la regulación de la diferenciación y
desarrollo en el sistema nervioso y el control de la apoptosis en otros tejidos.
VITAMINAS HIDROSOLUBLES. Funcionan principalmente como cofactores enzimáticos.
VITAMINA B₁ (TIAMINA):
 Tiene un papel central en el metabolismo que produce energía y especialmente en el
metabolismo de los carbohidratos
 Su forma actica es el difosfato de tiamina que cataliza reacciones de descarboxilación
oxidativa en: la piruvato deshidrogenasa, la α-cetoglutarato deshidrogenasa y la
cetoácido deshidrogenasa. También es la coenzima para la transcetolasa en la via de las
pentosas fosfato.
 Tiene un papel en la conducción nerviosa, fosforila y activa un canal de cloruro en la
membrana nerviosa.
DEFICIENCIA DE TIAMINA:
 Neuritis periférica crónica (Beriberi): Asociado a la insuficiencia cardiaca y edema
 Beriberi agudo pernicioso (Fulminante)(Beriberi Shoshin): Predomina la insuficiencia
cardiaca y anomalías metabólicas sin neuritis periférica
 Encefalopatía de Wernicke: con la psicosis de Korsakoff que se asocia al abuso del
alcohol y los narcóticos
 Conversión alterada del piruvato a acetil-CoA, en pacientes con dietas altas en
carbohidratos lleva a concentraciones plásticas altas de lactato y piruvato conduciendo
a una acidosis láctica.
VITAMINA B₂ (RIBOFLAVINA):
 Proporciona los restos reactivos de la coenzimas FMN y FAD
 Se encuentra en la leche y productos lácteos
 Se usa ampliamente como aditivo alimenticio
 El FMN está formado por la fosforilación de la riboflavina dependiente del ATP
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 La FAD se sintetiza por la reacción adicional con el ATP en el que el reto de AMP se
transfiere al FMN
 Las flavinoxidasas contribuyen de manera significativa al estrés oxidante total.

Las coenzimas flavínicas son portadoras de electrones en las reacciones de oxidoredución:


Incluye la cadena respiratoria mitocondrial, las enzimas claves de la oxidación de los ácidos
grasos y los aminoácidos y el ciclo del ácido cítrico.
Es estado nutricional se evalúa mediante la activación de la glutatión reductasa en los
eritrocitos.
DEFICIENCIA DE RIBOFLAVINA:
 No es fatal, porque hay una conservación muy eficiente de la riboflavina tisular
 Queilosis
 Descamación e inflamación de la lengua
 Dermatitis seborreica
NIACINA:
No es estrictamente una vitamina porque se puede sintetizar a partir del aminoácido esencial
triptófano.
 Dos compuestos tienen actividad biológica de la niacina: ácido nicotínico y la
nicotinamida
 Se descubrió como un nutriente durante los estudios de la pelagra
 Su función metabólica es similar al anillo de la nicotinamida de las coenzima NAD y
NADP
 60μg de triptófano equivalen a 1mg de niacina
 El ácido nicotínico se usa para tratar la hiperlipemia de 1 a 6 g por día causando la
dilatación de los vasos sanguíneos, enrojecimiento e irritación de la piel.
El NAD es la fuente de ADP-ribosa
Es la fuente de ADP-ribosa para la ADP-ribosilación de proteínas y poliADP-ribosilación de
nucleoproteínas implicadas en el mecanismo de reparación del ADN.
El ADP-ribosa cíclica y el ácido nicotínico adenina dinucleótido actúan para aumentar el
calcio intracelular en respuesta a los neurotransmisores y las hormonas.

DEFICIENCIA DE NIACINA:
 La deficiencia de triptófano y niacina producen Pelagra, que se caracteriza por:
dermatitis fotosensible, psicosis depresiva y diarrea.
 Deficiencias de riboflavina o vitamina B6 pueden contribuir a la pelagra por ser
necesarias para la síntesis de la nicotinamida a partir del triptófano.
 Las mujeres suelen ser más susceptibles a estas deficiencias por la inhibición del
metabolismo del triptófano por parte de los estrógenos.
ENFERMEDADES QUE PEDEN PRODUCIR PELAGRA:

 Enfermedad de Hartnup: trastorno genético raro en el que existe un defecto en el


mecanismo de transporte de membrana para el triptófano
 Síndrome carcinoide: metástasis de un tumor hepático primario de células
enterocromafines que sintetizan 5-hidroxitriptamina, su exceso causa pelagra por el desvío de
la síntesis de NAD
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EL EXCESO DE NIACINA EN TOXICO:


 El exceso por encima de 500mg/día causa daño hepático
VITAMINA B6:
 Seis compuestos tienen actividad de esta vitamina: piridoxina, piridoxal,
piridoxamina y sus 5´-fosfatos.
 80% de la vitamina en el cuerpo está presente en forma de fosfato de piridoxal en el
musculo, principalmente asociado al glucógeno fosforilasa.
 El fosfato de piridoxal en una coenzima para muchas enzimas involucradas en el
metabolismo de los aminoácidos, especialmente en la transaminación y
descarboxilación. Y es cofactor de la glucosa fosforilasa.
 El fosfato piridoxal remueve el complejo hormona-receptor de la unión al ADN
DEFICIENCIA DE VITAMINA B6:
 Produce anormalidades en el metabolismo del triptófano y la metionina
 Aumento en la sensibilidad de la hormona tiroidea
 Mayor sensibilidad a las acciones de las bajas concentraciones de los estrógenos,
andrógenos, cortisol y vitamina D
 Trastorno en el metabolismo de los aminoácidos
 Convulsiones
EXCESO DE VITAMINA B6:
 Neuropatía sensorial
VITAMINA B12:
 Se encuentra únicamente en alimentos de origen animal
 Este término se emplea para referirse a las Cobalaminas, corrinoides(compuestos de
cobalto que poseen el anillo de corrina) que tienen actividad biológica de vitamina
La absorción de la vitamina B12 requiere dos proteínas de unión:
 Factor intrínseco: es una glicoproteína secretada por las células parietales de la
mucosa gástrica que se une a la vitamina B12 para su absorción. Esta se une a la
vitamina en el duodeno
 Cobalofilina: es una proteína de unión secretada en la saliva, que se una para proteger
a la vitamina del medio acido del estómago. En el duodeno esta se hidroliza y libera la
vitamina para su unión al factor intrínseco.
 El ácido gástrico y la pepsina liberan la vitamina de la unión con las proteínas en los
alimentos.
 La insuficiencia pancreática puede ser un factor que contribuya a la deficiencia de
vitamina B12 que resulta en la excreción de la vitamina unida a la Cobalofilina
 La vitamina B12 es absorbida en el tercio distal del íleon a través de los receptores que
se unen al factor intrínseco-complejo vitamina B12
Existen dos enzimas dependientes de la vitamina B12:
 Metilmalonil-CoA mutasa: se forma como un intermediario en el catabolismo de la valina
por la carbonización de la propionil-CoA que surge en el catabolismo de la isoleucina, el
colesterol y los ácidos grasos raros con un número impar de átomos de carbono o del
propionato.
 Metionina sintasa: la deficiencia de B12 conduce al deterioro de esta enzima, lo que resulta
en la acumulación de la homocisteína y la captura del folato como metiltetrahidrofolato
 La deficiencia de la vitamina B12 da lugar a una acumulación de Metilmalonil-CoA y la
excreción del ácido metilmalónico
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DEFICIENCIA DE VITAMINA B12:


 Anemia perniciosa, la deficiencia de B12 deteriora el metabolismo del ácido fólico
alterando la eritropoyesis.Anemia megaloblástica. Todo esto puede ser causado por
un fallo en de la secreción del factor intrínseco causado por una enfermedad
autoinmune.
 Degeneración irreversible de la medula espinal por la AP debido a un fallo en la
metilación de un residuo de arginina en la proteína de la mielina.
ÁCIDO FÓLICO:
 La forma activa de este es Tetrahidrofolato
 El Tetrahidrofolato es un portador de unidades de un solo carbono
 El 5-formil-tetrahidrofolato es utilizado farmacéuticamente por ser el más estable
(conocido como ácido folínico)
 Las fuentes de unidades de un carbono son: serina, glicina y colina. Siendo la serina la
más importante
Los inhibidores del metabolismo del folato proporcionan quimioterapia contra el cáncer
 La timidilato sintasa y la dihidrofolato reductasa son especialmente activas en los tejidos
con una alta tasa de división celular
 La metilación de desoxiuridina monofosfato (dUMP) a timidina monofosfato (TMP)
catalizada por la timilidato sintasa, es esencial para la sintetis del ADN
 El Metotrexato inhibe a la dihidrofolato reductasa usándose para quimioterapia del
cáncer
La deficiencia de vitamina B12 causa deficiencia funcional del folato, “la trampa del folato”: La
metionina sintasa dependiente de la vitamina B12 proporciona un vínculo entre las funciones del
ácido fólico y la vitamina B12. La deficiencia de esta última da como resultado la acumulación
de metiltetrahidrofolato y homocisteína.
Tanto la deficiencia de ácido fólico como la de vitamina B12 causan deficiencia funcional
del ácido fólico afectando las células en división porque estas tienen un gran
requerimiento de timidina para la síntesis de ADN, afectando esto a la medula ósea
produciendo anemia megaloblástica.
DEFICIENCIA DE FOLATO:
 Anemia megaloblástica
BENEFICIOS DE SUMPLEMENTOS DEL ÁCIDO FOLICO
 Reducción significativa en la incidencia de espina bífida y defectos del tubo neural
 Reduce la hiperhomocisteinemia que puede conllevar a la aterosclerosis, trombosis e hipertensión.
 El enriquecimiento de alimentos con ácido fólico puede enmascarar la deficiencia de vitamina B12,
además que puede aumentar el riesgo de desarrollar cáncer colorrectal en personas con pólipos
colorrectales preneoplásticos
VITAMINA H (BIOTINA):
 Puede encontrarse como Biotina, biocitina (se libera en la proteólisis) y carboxibiotina
 Se sintetiza por la flora intestinal en los excesos de requerimiento
 La biotina funciona para transferir CO2 en un pequeño número de reacciones: Acetil-
CoA carboxilasa, piruvato carboxilasa, propionil-CoA carboxilasa y el
metilcrotonil-CoA carboxilasa
 Tiene un papel en la regulación del ciclo celular, actuando para biotinilar proteínas
nucleares claves.
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DEFICIENCIA DE BIOTINA:
 En personas mantenidas por muchos meses con nutrición parenteral total
 Personas que consumen claras de huevo sin cocer, por la presencia de Avidina, una
proteína que se une a la biotina y la deja inactiva para la absorción
ÁCIDO PANTOTENICO:
 Tiene un papel central en el metabolismo del grupo acilo cuando actúa como la fracción
funcional de la panteteína de la CoA o la proteína transportadora del acilo ACP
 La CoA participa en las reacciones del ciclo del ácido cítrico, la oxidación de los ácidos
grasos, las acetilaciones y la síntesis del colesterol
 La ACP participa en la síntesis de los ácidos grasos
ÁCIDO ASCORBICO VITAMINA C
 Antioxidante
 Vitamina para los seres humanos y otros primates pero no para otras especies
 Otros animales lo sintetizan como un intermediario en la vida del ácido urónico en el
metabolismo de la glucosa
 Tiene funciones específicas en las hidroxilasas que contienen cobre y las hidroxilasas que
contienen hierro ligadas a α-cetoglutarato
 La dopamina β-hidroxilasa es una enzima que contiene cobre involucrado en la síntesis
catecolaminas (norepinefrina y epinefrina)
 Funciona como coenzima en la hidroxilación de prolina y lisina es síntesis de colágeno,
antioxidantes
 Mejora la absorción del hierro

DEFICIENCIA DE VITAMINA C
 Escorbuto: cambios en la piel, fragilidad en los capilares sanguíneos, deterioro de las
encías, perdida de dientes y fracturas óseas que se atribuye a la alteración de la síntesis
del colágeno
BENEFICIOS DE MAYORES INGESTAS DE VITAMINA C
 Mejora la absorción del hierro
 Se incluye en la dieta para tratar la anemia por mejorar la absorción de hierro
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús

BIOQUÍMICA

CAPÍTULO 44

Son un grupo de nutrientes orgánicos necesarios en pequeñas cantidades para diversas funciones
bioquímica?

• Vitaminas

Son compuestos hidrofóbicos que sólo pueden absorberse con eficiencia cuando hay absorción
normal de grasa?

• Vitaminas liposolubles

Cuál es la función principal de las vitaminas hidrosolubles?

• Actúan principalmente como cofactores de enzimas

Se define como un compuesto orgánico que se necesita en la dieta en pequeñas cantidades para el
mantenimiento de la integridad metabólica normal?

• Vitamina

Cuál es la vitamina que puede formarse en el momento de la exposición a la luz solar?

• Vitamina D

Cuál es la vitamina que puede formarse a partir del aminoácido esencial triptófano?

• Niacina

Cuáles son las funciones de la vitamina A?

• Pigmentos visuales en la retina


• Regulación de gen
• Diferenciación celular

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina A?

• Ceguera nocturna
• Xeroftalmia
• Queratinización de la piel

Cuáles son las funciones de la vitamina D?

• Mantenimiento del equilibrio del calcio


• Incrementa la absorción intestinal de Ca2+
• Moviliza mineral óseo
• Regulación de la expresión del gen
• Diferenciación celular

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina D?

• Raquitismo
• Osteomalacia

Qué funciones realiza la vitamina E?

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Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús

• Antioxidante, particularmente en las membranas celulares


• Funciones en la emisión de señales celulares

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina E?

• Trastornos neurológicos
• Anemia hemolítica en el recién nacido

Qué funciones realiza la vitamina K?

• Coenzima en la formación de y-carboxiglutamato en enzimas de la coagulación de la


sangre y la matriz ósea

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina K?

• Alteración de la coagulación de la sangre


• Enfermedad hemorrágica

Qué función realiza la vitamina B1 (tiamina)?

• Regula el canal de Cl- en la conducción nerviosa

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina B1?

• Beriberi
• Síndrome de Wernicke-Korsakoff

Qué función realiza la vitamina B2 (riboflavina)?

• Coenzima en reacciones de oxidación y reducción


• Grupo prostético de flavoproteínas

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina B2?

• Lesiones de los ángulos de la boca, los labios y la lengua


• Dermatitis seborreica

Qué función realiza la vitamina Niacina?

• Coenzima en reacciones de oxidación y reducción


• Parte funcional de NAD y NADP
• Función en la regulación del calcio intracelular

Qué enfermedades se producen por deficiencia de Niacina?

• Pelagra
o Dermatitis fotosensible
o Psicosis depresiva

Qué función realiza la vitamina B6 (piridoxina)?

• Coenzima en la transaminación y descarboxilación de aminoácidos


• Modulación de la acción de hormona esteroide

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina B6?

• Trastornos del metabolismo de aminoácidos


• Convulsiones

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Qué función realiza el ácido fólico?

• Coenzima en la transferencia de fragmentos de un carbono

Qué enfermedades se producen por deficiencia de ácido fólico?

• Anemia megaloblástica

Qué función realiza la vitamina B12 (cobalamina)?

• Coenzima en la transferencia de fragmentos de un carbono


• Metabolismo de ácido fólico

Qué enfermedades se producen por la deficiencia de vitamina B12?

• Anemia perniciosa

Qué función realiza la vitamina H (biotina)?

• Coenzima en reacciones de carboxilación


• Función en la regulación del ciclo celular

Qué enfermedades se producen por deficiencia de vitamina H?

• Alteración del metabolismo de grasa y carbohidrato


• Dermatitis

Qué función realiza el ácido pantoténico?

• Parte funcional de la CoA


• Síntesis y metabolismo de ácido graso

Qué enfermedades se producen por deficiencia de ácido pantoténico?

• Síndrome del pie urente

Qué función realiza la vitamina C (ácido ascórbico)?

• Coenzima en la hidroxilación de Prolina y lisina en la síntesis de colágeno


• Antioxidante
• Aumentar la absorción del hierro

Cuáles son las dos familias de receptores de retinoides nucleares?

• Los receptores de ácido retinoico


• Los receptores X retinoide

Es la causa prevenible más importante de ceguera?

• Deficiencia de vitamina A

Es la queratinización de la córnea y ceguera?

• Xeroftalmia

Cuáles son los problemas que causa el exceso de vitamina A en el sistema nervioso central?

• Cefalalgia
• Náuseas

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• Ataxia

Cuáles son los problemas que causa el exceso de vitamina A en el hígado?

• Hepatomegalia

Cuál es la función principal de la vitamina D?

• Su principal función es la regulación de la absorción y la homeostasis del calcio

Cuáles son los mecanismos por el cual el calcitriol (vitamina D) regula la concentración plasmática
de calcio?

• Incrementa la absorción intestinal de calcio


• Disminuye la excreción de calcio
• Moviliza mineral óseo

Cómo se le llama a la calcificación de los tejidos blandos?

• Calcinosis

Cuáles son las dos familias de compuestos de la vitamina E?

• Tocoferol
• Tocotrienol

Cuál es el uso en el organismo de los antagonistas de la vitamina K?

• Se usan para reducir la coagulación de la sangre en quienes tienen riesgo de trombosis

Cuál es el antagonista de la vitamina K más usado?

• Warfarina

Cuáles son los compuestos que tienen la misma actividad biológica de la vitamina K?

• Filoquinona
• Menaquinonas
• Menadiona

Cuáles son las proteínas que se encuentran en el hueso y contiene gamma-carboxiglutamato?

• Osteocalcina
• Proteína Gla de matriz ósea

Es la coenzima para tres complejos de múltiples enzimas que catalizan reacciones de


descarboxilación oxidativa?

• Difosfato de tiamina

Cuáles son los síntomas que provoca la deficiencia de tiamina?

• Beriberi
• Insuficiencia cardiaca
• Edema

Cómo se puede observar en un organismo que hay deficiencia de riboflavina?

• Queilosis

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• Descamación e inflamación de la lengua


• Dermatitis seborreica

Cuáles son los dos compuestos que tienen la misma actividad biológica de la niacina?

• Ácido nicotínico
• Nicotinamida

Es un padecimiento genético raro en el cual hay un defecto del mecanismo de transporte de


membrana para el triptófano?

• Enfermedad de Hartnup

Es una coenzima para muchas enzimas involucradas en el metabolismo de aminoácidos, en


particular transaminación y descarboxilación?

• Fosfato de piridoxal

Es una pequeña glucoproteína secretada por las células parietales de la mucosa gástrica?

• Factor intrínseco

Cuáles son las tres enzimas dependientes de vitamina B12?

• Metilmalonil CoA mutasa


• Leucina aminomutasa
• Metionina sintasa

En qué seres vivos se puede encontrar vitamina C?

• Seres humanos
• Conejillos de Indias
• Murciélagos
• Aves paseriformes

Es una enzima que contiene cobre, que participa en la síntesis de las catecolaminas, a partir de
tirosina en la médula suprarrenal y el sistema nervioso central?

• Dopamina beta-hidroxilasa

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BIOQUÍMICA

CAPÍTULO 9

Cómo se llama el agente causal del cólera?

• Vibrio cholerae

Cómo se llama el agente causal de la peste?

• Yersinia pestis

En qué parte de la célula se encuentran las enzimas que degradan las proteínas y polisacáridos?

• Lisosoma

Proceso en el que las proteínas se encuentran en un equilibrio dinámico debido a que se están
sintetizando y degradando de manera continua?

• Recambio de proteínas

Son típicamente sustratos o compuestos relacionados desde el punto de vista estructural que
inician la síntesis de enzimas?

• Inductores

Mencione las enzimas inducibles presentes en los seres humanos?

• Triptófano pirrolasa
• Treonina deshidratasa
• Tirosina-alfa-cetoglutarato aminotransferasa
• Citocromo P450

Se refiere a la inhibición de una enzima en una vía biosintética por un producto terminal de esa
vía?

• Inhibición por retroalimentación

Son aquellas enzimas para las cuales la catálisis en el sitio activo puede modularse por la
presencia de efectores en un sitio alostérico?

• Enzimas alostéricas

Cuáles son las formas más frecuentes de modificación covalente en las células del mamífero?

• Proteólisis parcial
• Fosforilación

Cómo se llaman las proteínas que son sintetizadas y secretadas como proteínas precursoras
inactivas?

• Proproteínas

Mencione ejemplos de proteínas sintetizadas como Proproteínas?

• Hormona insulina
• Enzimas digestivas
• Pepsina
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• Tripsina
• Quimotripsina

Cuál es la modificación covalente más frecuente en la regulación de la función de las proteínas?

• Fosforilación-desfosforilación
Capítulo 7

ENZIMAS
ENZIMA

Reactivos ---------> Productos (sustratos)

Definición e importancia

✓ SON BIOMOLECULAS QUE CATALIZAN LAS REACCIONES QUIMICAS.


✓ HACEN POSIBLE LA VIDA EN LA TIERRA.
✓ PARTICIPAN EN LA DESCOMPOSICION DE NUTRIENTES PARA PRODUCIR
ENERGIA Y COMPONENTES QUIMICOS.
✓ LAS ENZIMAS SON PROTEINAS.
✓ ALGUNAS SON MOLECULAS DE ARN RIBOZOMALES

Otras características

✓ LAS ENZIMAS AUMENTAN LAS VELOCIDADES DE LA REACCION EN UN


FACTOR DE 106 O MAS.
✓ PUEDEN SUFRIR MODIFICACIONES TRANSITORIAS DURANTE LA
CATALISIS, PERO NO SE ALTERAN PERMANENTEMENTE.
✓ SON EXTREMADAMENTE SELECTIVAS.
✓ NO SOLO PARA EL TIPO DE RACCION, SINO TAMBIEN PARA UN UNICO
SUSTRATO O PEQUEÑO GRUPO DE SUSTRATOS.
✓ SON ESTEREOESPECIFICAS, ES DECIR SOLO ACTUA SOBRE UNA SOLA
PROYECCION.

Importancia médica

✓ AL DETECTAR LA CANTIDAD ENZIMATICA EN LA SANGRE, PERMITE EL


DIAGNOSTICO DE VARIAS ENFERMEDADES.
✓ MUCHAS CONDICIONES PATOLOGICAS SON CONSECUENCIA DIRECTA EN
AL ACTIVIDAD CATALITICA. COMO LOS DEFECTOS GENETICOS.
✓ LAS ENZIMAS SON MUY ESPECIFICAS AL IGUAL QUE LOS SUSTRATOS Y
ESTO PERMITE QUE CUMPLAN FUNCIONES UNICAS EN LA SALUD Y EL
BIENESTAR HUMANO.
✓ LAS ENZIMAS PARTICIPAN EN LA SINTESIS DE FARMACOS COMPLEJOS Y
ANTIBIOTICOS.

Cuadro de enzima, tejido y diagnostico

Enzima Tejido Diagnostico


Aspartato Aminotransferasa Se encuentra en el corazón, el - Daño en el hígado.
(AST) hígado y el tejido muscular. - Problemas cardiacos.
Alanina Aminotransferasa Se encuentra principalmente - Hepatopatía
(ALT) en el hígado. (hepatitis)
Creatina Fosfoquinasa (CK) Musculo esquelético, - Distrofia muscular.
corazón, cerebro. - Infarto de miocardio.
Amilasa Páncreas, glándulas salivales. - Pancreatitis aguda.
- Obstrucción biliar.
Gamma Glutamil Hígado - Hepatitis
Transpeptidasa (GGT) - Cirrosis
Lactato Deshidrogenasa Corazón, hematíes, hígado. - Linfoma
(LDH) - Hepatitis
Lipasa Páncreas - Pancreatitis aguda.
- Obstrucción biliar.
Fosfatasa Alcalina Osteoblasto - Enfermedades óseas.
- Tumores óseos.
Fosfatasa Acida (PSA) Prostata - Cáncer de próstata
Isoenzimas

✓ SON FORMAS DE ENZIMAS DISTINTAS QUE CATALIZAN LA MISMA


REACCIÓN.
✓ LOS ORGANISMOS SUPERIORES A MENUDO ELABORAN VARIAS VERSIONES
FÍSICAMENTE DISTINTAS DE UNA ENZIMA DETERMINADA, CADA UNA DE
LAS CUALES CATALIZA LA MISMA REACCIÓN.
✓ PUEDEN SER VARIANTES GENETICAS DE UNA ENZIMA, ENZIMAS NO
RELACIONADAS QUE CATALIZAN LA MISMA REACCION, OTRA VERSION DE
UNA ENZIMA QUE SE ENCUENTRAN EN DIFERENTES AREAS O UNA COPIA
DE RESPALDO.

Partes de una enzima

HOLOENZIMA=APOENZIMA +COENZIMA
Grupos prostéticos
✓ AMPLIAN EL REPERTORIO DE CAPACIDADES CATALÍTICAS MAS ALLA DE
LAS PROPORCIONADAS POR LOS GRUPOS FUNCIONALES PRESENTES EN
LA CADENAS LATERALES.
✓ LOS GRUPOS PROSTETICOS SE INCORPORAN DE MANERA FIRME Y
ESTABLE EN LA ESTRUCTURA DE UNA PROTEINA MEDIANTE FUERZAS
COVALENTES O NO COVALENTES, ES DECIR TIENEN UNA UNION FUERTE
CON LA ENZIMA.
✓ EJEMPLO: FOSFATO DE PIRIDOXAL, MONONUCLEOTIDO DE FLAVINA,
DINUCLEOTIDO DE FLAVINA, PIROFOSFATO DE TIAMINA, ACIDO LIPOICO,
Y METALES DE TRANSICION COMO FE, Co, Cu, Mg, Mn Y Zn.

Cofactor

✓ UN COFACTOR ES UN COMPONENTE NO PROTEICO QUE COMPLEMENTA


A UNA ENZIMA (QUE ES UNA SUSTANCIA PROTEICA).
✓ EL COFACTOR TIENE QUE ESTAR PRESENTE EN CANTIDADES ADECUADAS
PARA QUE LA ENZIMA PUEDA ACTUAR, CATALIZANDO UNA REACCIÓN
BIOQUÍMICA.
✓ LOS COFACTORES SON IONES METÁLICOS INORGÁNICOS COMO
MANGANESO, MAGNESIO, MOLIBDENO, COBALTO, ZINC, HIERRO, NIQUEL,
POTASIO O COBRE.
✓ TIENEN FUNCIONES SIMILARES A LOS GRUPOS PROSTETICOS, SU
DIFERENCIA ES OPERACIONAL NO QUÍMICA.
✓ LOS COFACTORES SE UNEN DÉBILMENTE Y TRANSITORIAMENTE A SUS
ENZIMAS O SUSTRATOS AFINES, FORMANDO COMPLEJOS DISOCIABLES.

Coenzima

✓ SON MOLÉCULAS ORGÁNICAS QUE NO SON PROTEÍNAS Y, EN SU MAYORIA,


DERIVADOS DE VITAMINAS SOLUBLES EN AGUA POR FOSFORILACION.
✓ ESTAS MOLÉCULAS ORGÁNICAS, FORMAN PARTE DE LOS SITIOS ACTIVOS
DE SUS ENZIMAS PROTEICAS. DADO QUE LA COENZIMA FORMA PARTE DEL
SITIO ACTIVO DE LA ENZIMA, LA ENZIMA NO PUEDE TRABAJAR EN EL
SUSTRATO SIN ELLA.
✓ HAY COENZIMAS QUE MANTIENEN UNA RELACIÓN PERMANENTE CON LA
ENZIMA. OTRAS, EN CAMBIO, SOLO EXPERIMENTAN UNA UNIÓN
TEMPORAL.
✓ ES IMPORTANTE TENER EN CUENTA QUE NO TODAS LAS COENZIMAS
ACEPTAN LOS MISMOS TIPOS DE ÁTOMOS. PUEDEN RECIBIR GRUPOS
ACETILOS, HIDRÓGENOS, AMINOS U OTRAS CLASES SEGÚN CADA CASO.
✓ EN CUANTO A LAS ENZIMAS A LAS QUE CUALES SE ADHIEREN, NO EXISTEN
RESTRICCIONES: UNA MISMA COENZIMA SE PUEDE UNIR A DISTINTAS
ENZIMAS.

Las enzimas que requieren un cofactor de ion metálico


se denominan enzimas activadas por metal.
Las enzimas que requieren los iones metálicos como
grupos prostéticos se llaman metal enzimas.

Cosustrato
✓ ES UN ACOENZIMA QUE SE ALTERA DURANTE LA REACCIÓN Y SE DISOCIA
DEL SITIO ACTIVO. SE REGENERA POR OTRA ENZIMA.
Coenzima Fuente vitamìnica Principales funciones metabòlicas Funciòn
mecanicista
Trifosfato de adenosina - Transferencia de grupos fosforilo o Cosustrato
(ATP) nucleotidilo
S-Adenosilmetionina - Transferencia de grupos metilo Cosustrato

Uridina difosfato guclosa - Transferencia de grupos glicosilo Cosustrato

Nicotinamida adenina Niacina (C3) Reacciones de oxidación- reducción Cosustrato


dinocleòtido (NADH +) y donde haya dos transferencias de electrón
fosfato de nicotinamida
adenina dinocleòtido
(NADP +)

Flavina monucleòtido Riboflavina (B2) Reacciones de oxidación- reducción Grupo prostètico


(FMN) Y flavina adenina donde haya una o dos transferencias de
dinucleòtido (FAD) electrón

Coenzima A (CoA) Pantotenato Transferencia de grupos acilo Cosustrato

Pirosfato de tiamina (TPP) Tiamina (B1) Transferencia de fragmentos de dos Grupo prostètico
carbonos que contengan un grupo
carbonilo
Fosfato de piridoxal (PLP) Piridoxina (B6) Transferencia de grupos desde Grupo prostètico
aminoácidos y hacia estos

Bixina Biotina Carboxilaciòn de sustratos dependiente Grupo prostètico


de ATP o transferencia de grupo
carboxilo entre sustratos
Tetrahidrofolato Folato Transferencia de sustituyentes con un Cosustrato
carbono, en especial los grupos formilo e
hidroximetilo; suministra el grupo metilo
para la timina en el ADN
Adenosilcobalamina Cobalamina (B12) Reorganizaciones intramoleculares Grupo prostètico

Metilcobalamina Cobalamina (B12) Transferencia de grupos metilo Grupo prostètico

Lipoamida - Oxidaciòn de un grupo hidroxiacilo del Grupo prostètico


TPP y después transferencia como grupo
acilo
Retinal Vitamina A Visiòn Grupo prostètico

Vitamina K Vitamina K Carboxilaciòn de algunos residuos de Grupo prostètico


glutamato
Ubiquinona (Q) - Portador de electrones soluble en lìpidos Cosustrato
Las enzimas están clasificadas por tipo de reacción
✓ ALGUNOS NOMBRES DE ENZIMAS DESCRITAS POR PRIMERA VEZ,
PERSISTEN HASTA EL DIA DE HOY. EJEMPLO: PEPSINA, TRIPSINA Y
AMILASA.
✓ LOS PRIMEROS BIOQUIMICOS AGREGABAN EL SUFIJO “ASA” A LAS
ENZIMAS RECIEN DESCUBIERTAS + TIPO DE REACCION. POR EJEMPLO:
▪ DESHIDROGENASA: ELIMINA LOS ELEMENTOS DE
HIDROGENO.
▪ PROTEASA: HIDROLIZAN PROTEINAS.
▪ LIPASA: HIDROLIZA LIPIDOS.
✓ EN MUCHOS CASOS LOS NOMBRES DE LAS PROTEINAS SE COMPLEMENTAN
CON TERMINOS QUE INDIQUEN EL SUSTRATO PARTICULAR EN EL QUE
ACTUA LA ENZIMA, SU FUENTE, SU MODO DE REGULACION O UN RASGO
CARACTERISTICO DE SU MECANISMO DE ACCION.
✓ PUEDEN AGREGARSE DESIGNADORES ALFANUMERICOS PARA INDICAR
MULTIPLES FORMAS O ISOZIMAS, DE UNA ENZIMA.
✓ EJEMPLO: ARN POLIMERASA III, PROTEINA CINASA CB.

Sistema de nomenclatura

✓ LAS ENZIMAS SE AGRUPAN EN LAS SIGUIENTES SEIS CLASES:


o OXIDORREDUCTASAS
o TRANSFERASAS
o HIDROLASAS
o LIASAS
o ISOMERASAS
o LIGASAS

Oxidorreductasas

ENZIMA QUE CATALIZAN OXIDACIONES Y REDUCCIONES, ES DECIR


TRANSFERENCIA DE HIDROGENO (H) O ELESCTRONES (e).
Transferasas

ENZIMAS QUE CATALIZAN LA TRANSFERENCIA DE RESTOS O GRUPOS QUIMICOS,


DIFERENTES AL HIDROGENO, TALES COMO GRUPOS GLUCOSILO, METILO O
FOSFORILO.

Hidrolasas
✓ CATALIZAN LA ESCISION HIDROLITICA DE C-C. C-O, C-N Y OTROS ENLACES
COVALENTES POR ADICION DE AGUA.
✓ ESCISION ES DIVIDIR.

Liasas

✓ CATALIZAN LA ESCISION DE C-C, C-O, C-N Y OTROS ENLACES COVALENTES


POR ELIMINACION DE ÁTOMOS, GENERANDO DOBLES ENLACES.
Isomerasas
✓ Catalizan cambios estructurales dentro de una misma molécula. Como estas
reacciones solo tienen un sustrato y un producto son de las reacciones enzimáticas
más simples.

Ligasas
• CATALIZAN LA UNION DE DOS MOLECULAS EN REACCIONES ACOPLADAS
A LA HIDROLISIS DEL ATP.

• LAS LIGASAS SON USUALMENTE LLAMADAS SINTETASAS.

Nomenclatura
✓ SINTETASA: SE REQUIERE ATP.

✓ SINTASA: NO REQUIERE ATP.

✓ FOSFATASA: SE REQUIERE AGUA PARA REMOVER EL GRUPO FOSFATO.

✓ FOSFORILASA: USA FOSFATO INORGANICO PARA ROMPER UN ENLACE Y


GENERAR UN PRODUCTO FOSFORILADO.

✓ DESHIDROGENASA: NAD Y FAD ACEPTADORES DE ELECTRONES EN


REDOX.

✓ OXIDASA:𝑂2 ACEPTADOR Y LOS ÁTOMOS NO SE INCORPORAN EN EL


SUSTRATO.
✓ OXIGENASA: UNO O AMBOS ÁTOMOS DE 𝑂2 SE INCORPORAN AL SUSTRATO.

La catálisis ocurre en el sitio activo


✓ EMIL FISCHER PROPUSO QUE LAS ENZIMAS Y SUS SUSTRATOS
INTERACTUAN PARA FORMAR UN COMPLEJO “ENZIMA-SUSTRATO”.

✓ FISCHER COMPARO LA PRECISIÓN DE UNA ENZIMA PARA ELEGIR SUS


SUSTRATOS CON LA MANERA EN QUE UNA CERRADURA DISTINGUE LA
LLAVE ADECUADA, DE TAL MANERA QUE LA “CERRADURA” ESTA
FORMADA POR UNA BOLSA EN LA SUPERFICIE DE LA ENZIMA LLAMDA
“SITIO ACTIVO”.

Los sustratos inducen cambios conformacionales en las enzimas


✓ EL MODELO DE AJUSTE INDUCIDO DE DANIEL KOSHLAND, ESTABLECE
QUE A MEDIDA QUE LOS SUSTRATOS SE UNEN A UNA ENZIMA, INDUCEN
UN CAMBIO CONFORMACIONAL QUE ES ANÁLOGO A COLOCAR UNA MANO
(SUSTRATO) EN UN GUANTE (ENZIMA).
Catálisis por proximidad
✓ LAS MOLÉCULAS DE SUSTRATO SE ORIENTAN EN UNA POSICIÓN IDEAL
PARA QUE INTERACTÚEN QUÍMICAMENTE. ESTO DA COMO RESULTADO
MEJORAS DE VELOCIDAD DE AL MENOS MIL VECES SOBRE LA MISMA
REACCIÓN NO CATALIZADA POR ENZIMAS.

✓ CUANTO MAYOR SEA SU CONCENTRACIÓN, MÁS FRECUENTEMENTE SE


ENCONTRARÁN ENTRE SÍ, Y MAYOR SERÁ LA VELOCIDAD A LA QUE
REACCIONAN.

Proximidad y
orientación desfavorable

Catálisis ácido-base
✓ LA CATÁLISIS ESPECÍFICA DE ÁCIDO O BASE: LOS ÚNICOS ÁCIDOS O BASES
QUE PARTICIPAN SON PROTONES O IONES DE HIDRÓXIDO. ES
INDEPENDIENTE DE LAS CONCENTRACIONES DE OTROS ÁCIDOS O BASES
PRESENTES EN LA SOLUCIÓN O EN EL SITIO ACTIVO.
✓ CATÁLISIS ÁCIDA GENERAL O A CATÁLISIS BÁSICA GENERAL SE REFIERE A
LAS REACCIONES CUYAS VELOCIDADES RESPONDEN A TODOS LOS ÁCIDOS
O BASES PRESENTES.
Catálisis por tensión
✓ PARA LAS REACCIONES LÍTICAS, QUE IMPLICA ROMPER UN ENLACE
COVALENTE, LAS ENZIMAS NORMALMENTE SE UNEN A SUS SUSTRATOS EN
UNA CONFORMACIÓN TENSADA QUE DEBILITA EL ENLACE A TRAVÉS DE
LA DISTORSIÓN FÍSICA Y LA POLARIZACIÓN ELECTRÓNICA. ESTA
CONFORMACIÓN TENSADA IMITA A LA DEL ESTADO INTERMEDIO DE
TRANSICIÓN.

Catálisis covalente
✓ IMPLICA LA FORMACIÓN DE UN ENLACE COVALENTE ENTRE LA ENZIMA Y
UNO O MÁS SUSTRATOS. LA ENZIMA MODIFICADA SE CONVIERTE ASÍ EN
UN REACTIVO.
✓ EL ESTADO QUÍMICAMENTE MODIFICADO DE LA ENZIMA ES
TRANSITORIO. LA FINALIZACIÓN DE LA REACCIÓN DEVUELVE LA ENZIMA
A SU ESTADO ORIGINAL NO MODIFICADO. POR TANTO, SU PAPEL SIGUE
SIENDO CATALÍTICO.

Otros datos de la enzima


✓ LA CANTIDAD DE ENZIMA ES DIFÍCIL DETERMINAR, PERO TRANSFORMA
CON RAPIDEZ A LOS SUSTRATOS.
✓ LA VELOCIDAD (I) CATALÍTICA ES PROPORCIONAL A LA CANTIDAD DE
ENZIMAS PRESENTES O CONCENTRACION.
✓ ENZIMAS ESTÁN EN ORGANELOS ESPECÍFICOS, POR EJEMPLO: EN LAS
CELULAS HEPÁTICAS, LA ENZIMA DE LA GLUCÒLISIS ESTÀ EN EL
CITOPLASMA.
Capítulo 8
CINÉTICA DE LA ENZIMA

Importancia biomédica

 SE REQUIERE UN CONJUNTO EQUILIBRADO DE ACTIVIDADES


ENZIMÁTICAS PARA MANTENER LA HOMEOSTASIS.

 LA CINÉTICA ENZIMÁTICA CONSTITUYE UNA HERRAMIENTA CENTRAL


PARA DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO DE LOS DESEQUILIBRIOS
ENZIMÁTICOS EN LAS ENFERMEDADES HUMANAS.

Ejemplos

 EL ANÁLISIS CINÉTICO PUEDE REVELAR LOS PASOS A TRAVÉS DE LOS


CUALES LAS ENZIMAS TRANSFORMAN SUSTRATOS EN PRODUCTOS.

 EN LA SANGRE, LA ELEVACIÓN DE LOS NIVELES DE ENZIMAS


PARTICULARES SIRVEN COMO INDICADORES CLÍNICOS PARA PATOLOGÍAS
COMO INFARTOS DE MIOCARDIO, CÁNCER DE PRÓSTATA Y LESIONES EN
EL HÍGADO.

 LA PARTICIPACIÓN DE LAS ENZIMAS EN PRÁCTICAMENTE TODOS LOS


PROCESOS FISIOLÓGICOS LAS CONVIERTE EN LOS OBJETIVOS DE
ELECCIÓN PARA FÁRMACOS QUE CURAN ENFERMEDADES.

Ecuaciones equilibradas

 ES LA DENOMINACIÓN QUE SE HACE A CUALQUIER REACCIÓN


REVERSIBLE.

 POR EJEMPLO, LA SIGUIENTE REACCIÓN, SI A Y B PUEDEN FORMAR P Y Q,


ENTONCES P Y Q TAMBIÉN PUEDEN FORMAR A Y B.
Reacciones irreversibles

 EN ESTAS REACCIONES LOS FACTORES TERMODINÁMICOS FAVORECEN


FUERTEMENTE LA FORMACIÓN DE LOS PRODUCTOS A LOS QUE APUNTA
LA FLECHA.

 TAMBIÉN SE USAN PARA DESCRIBIR REACCIONES EN CÉLULAS VIVAS


DONDE LOS PRODUCTOS DE LA REACCIÓN SON INMEDIATAMENTE
CONSUMIDOS POR UNA REACCIÓN POSTERIOR CATALIZADA POR ENZIMAS
O RÁPIDAMENTE ESCAPAN DE LA CÉLULA.

Energía libre de GIBBS

 EL CAMBIO DE ENERGÍA LIBRE DE GIBBS ΔG DESCRIBE TANTO LA


DIRECCIÓN COMO LAS CONCENTRACIONES QUE ESTARÁN PRESENTES EN
EQUILIBRIO.

 PERO NO PROPORCIONA INFORMACIÓN SOBRE LAS VELOCIDADES DE LAS


REACCIONES.

 ΔG PARA UNA REACCIÓN QUÍMICA ES IGUAL A LAS ENERGÍAS LIBRES DE


LOS PRODUCTOS MENOS LAS ENERGÍAS LIBRES DE LOS SUSTRATOS.

 UN TÉRMINO BIOQUÍMICO MÁS ÚTIL ES 𝛥𝐺 0 ′, ES UN ESTADO ESTÁNDAR


DE PROTONES 10−7 M, PH= 7.0.

 SI 𝛥𝐺 0 ES UN NÚMERO NEGATIVO, LA CONCENTRACIÓN DE LOS


PRODUCTOS EXCEDERÁ LA DE LOS SUSTRATOS Y POR TANTO SERA UNA
REACCION IRREVERSIBLE.

 SI 𝛥𝐺 0 ES POSITIVO SE FAVORECERÁ LA FORMACIÓN DE SUSTRATOS POR


LO QUE SERA UNA REACCION REVERSIBLE.
Estado de transición

 EL ESTADO DE TRANSICION ES UN INSTANTE EN EL QUE NO HAY SUSTRATO


NI PRODUCTO.

 MUCHAS REACCIONES INVOLUCRAN VARIOS ESTADOS DE TRANSICIÓN


SUCESIVOS, CADA UNO CON UN CAMBIO EN LA ENERGÍA LIBRE.

 PARA ESTAS REACCIONES, EL ΔG GLOBAL REPRESENTA LA SUMA DE


TODOS LOS CAMBIOS DE LA ENERGÍA LIBRE ASOCIADOS A LOS ESTADOS
DE TRANSICIÓN.

Energía de activación

 ΔG PARA LA MAYORÍA DE LAS REACCIONES QUÍMICAS TIENE UN SIGNO


POSITIVO, POR LO TANTO, EL ESTADO DE TRANSICIÓN REQUIERE
SUPERAR UNA O MÁS BARRERAS DE ENERGÍA.

 POR ESTA RAZÓN, LA ENERGÍA DE FORMACIÓN (ΔGF) PARA ALCANZAR UN


ESTADO DE TRANSICIÓN A MENUDO SE DENOMINA ENERGÍA DE
ACTIVACIÓN

 LA FRECUENCIA CON LA CUAL SE SUPERA ESTA BARRERA ESTÁ


INVERSAMENTE RELACIONADA CON ENERGIA DE ACTIVACION.

La teoría cinética establece lo siguiente:

 LAS MOLÉCULAS DEBEN ACERCARSE DENTRO DE LA DISTANCIA DE


FORMACIÓN DE ENLACES ENTRE SÍ, O “COLISIONAR”.

 LAS MOLECULAS DEBEN POSEER SUFICIENTE ENERGÍA CINÉTICA PARA


SUPERAR LA BARRERA DE ENERGÍA PARA ALCANZAR EL ESTADO DE
TRANSICIÓN.
Factores afectan la velocidad de reacción

 TEMPERATURA: ELEVAR LA TEMPERATURA AMBIENTE AUMENTA LA


ENERGÍA CINÉTICA DE LAS MOLÉCULAS, POR TANTO, LA FRECUENCIA
CON LA QUE COLISIONAN.

 CONCENTRACIÓN DEL REACTANTE: LA VELOCIDAD CON LA QUE


COLISIONAN LAS MOLÉCULAS ES DIRECTAMENTE PROPORCIONAL A SUS
CONCENTRACIONES.

Sistema en equilibrio

 LA CONSTANTE DE EQUILIBRIO (K) ES UNA RELACIÓN DE LAS CONSTANTES


DE VELOCIDAD DE REACCIÓN.

 EN EQUILIBRIO, LAS VELOCIDADES DE REACCIÓN SON IGUALES HACIA


ADELANTE Y HACIA ATRÁS.

 EL VALOR NUMÉRICO DE LA CONSTANTE DE EQUILIBRIO PUEDE SER


CALCULADO A PARTIR DE LAS CONCENTRACIONES DE SUSTRATOS Y
PRODUCTOS EN EQUILIBRIO.

 EL EQUILIBRIO ES UN ESTADO DINÁMICO, PRODUCTOS Y SUSTRATOS


ESTÁN CONTINUAMENTE INTERCONVERTIDOS.

 LAS ENZIMAS NO AFECTAN A LA CONSTANTE DE EQUILIBRIO.

Factores afectan las velocidades de las reacciones catalizadas

Temperatura:

 INCREMENTAR LA TEMPERATURA AUMENTA LA VELOCIDAD TANTO DE


LAS REACCIONES CATALIZADAS POR ENZIMAS COMO DE LAS NO
CATALIZADAS.

 SIN EMBARGO, LA ENERGÍA TÉRMICA TAMBIÉN PUEDE DAÑAR LA ENZIMA


A UN PUNTO QUE LA CADENA POLIPEPTÍDICA COMIENZA A
DESPLEGARSE, O DESNATURALIZARSE, CON UNA PÉRDIDA
ACOMPAÑANTE DE LA ACTIVIDAD CATALÍTICA.
 LAS ENZIMAS DE LOS HUMANOS POR LO GENERAL MUESTRAN
ESTABILIDAD A TEMPERATURAS DE HASTA 45 A 55 °C. POR EL CONTRARIO,
LAS ENZIMAS DE LOS MICROORGANISMOS TERMÓFILOS QUE RESIDEN EN
LAS FUENTES TERMALES VOLCÁNICAS O LOS RESPIRADEROS
HIDROTERMALES SUBMARINOS PUEDEN SER ESTABLES EN
TEMPERATURAS INCLUSO SUPERIORES A 100 °C.

Concentración de iones de hidrogeno

 LA VELOCIDAD LAS REACCIONES CATALIZADAS POR ENZIMAS TIENE UNA


DEPENDENCIA DE LA CONCENTRACIÓN DE IONES DE HIDRÓGENO.

 LA MAYORÍA DE LAS ENZIMAS INTRACELULARES TIENEN UNA ACTIVIDAD


ÓPTIMA EN LOS VALORES DE PH ENTRE 5 Y 9.

 LA CONCENTRACIÓN DE IONES DE HIDRÓGENO REFLEJA EL EQUILIBRIO


ENTRE LA DESNATURALIZACIÓN ENZIMÁTICA EN UN PH ALTO O BAJO.

Velocidad inicial

 LAS VELOCIDADES DE LAS REACCIONES CATALIZADAS POR ENZIMAS


EMPLEAN PERIODOS RELATIVAMENTE CORTOS, CONDICIONES QUE SE
CONSIDERAN PARTE DE LA VELOCIDAD INICIAL.

 BAJO ESTAS CONDICIONES, SÓLO SE ACUMULAN PRODUCTOS. LA


VELOCIDAD INICIAL, POR TANTO, ES LA VELOCIDAD DE LA REACCIÓN
DIRECTA.

 LA VELOCIDAD INICIAL ES PROPORCIONAL A LA CONCENTRACIÓN DE


ENZIMA, POR TANTO, PERMITE ESTIMAR LA CANTIDAD DE ENZIMA
PRESENTE EN UNA MUESTRA BIOLÓGICA.
La concentración del sustrato

 PARA ENZIMAS CON MÚLTIPLES SUSTRATOS, EL COMPORTAMIENTO


IMITARÁ A UNO QUE TIENE UN SUSTRATO ÚNICO.

 PARA UNA ENZIMA, A MEDIDA QUE AUMENTA LA CONCENTRACIÓN DEL


SUSTRATO, VELOCIDAD INICIAL AUMENTA HASTA QUE ALCANZA UN
VALOR MÁXIMO (VMÁX).

 CUANDO LOS INCREMENTOS ADICIONALES DE SUSTRATO NO AUMENTAN


la Velocidad inicial, SE DICE QUE LA ENZIMA ESTÁ “SATURADA” CON EL
SUSTRATO.

 LA VELOCIDAD INICIAL DEPENDE ÚNICAMENTE DE LA RAPIDEZ CON QUE


EL PRODUCTO SE DISOCIA DE LA ENZIMA PARA QUE PUEDA COMBINARSE
CON MÁS SUSTRATO.

La ecuación de Michaelis-Menten

 ILUSTRA LA RELACIÓN ENTRE LA VELOCIDAD INICIAL (VI) Y LA


CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO [S].

 LA CONSTANTE DE MICHAELIS (KM) ES LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO


EN LA CUAL LA VELOCIDAD INICIAL ES LA MITAD DE LA VELOCIDAD
MÁXIMA (VMÁX/2).
Forma lineal de la ecuación de Michaelis-Menten

 ESTA ECUACIÓN SE EMPLEA PARA DETERMINAR KM Y VMÁX DE UNA


FORMA MAS SENCILLA.

 LA GRAFICA QUE SE FORMA SE LLAMA DIAGRAMA DOBLE RECÍPROCO O


DE LINEWEAVER-BURK.

 EL DIAGRAMA PUEDE SER UTILIZADO PARA

DETERMINAR EL MECANISMO CINÉTICO DE UN INHIBIDOR ENZIMÁTICO.

La constante catalítica (KCAT)

 NOS SIRVE PARA COMPARAR LA ACTIVIDAD CATALITICA DE UNA ENZIMA.

 LA CONSTANTE CATALITICA SE PUEDE CALCULAR AL DIVIDIR LA


VELOCIDAD MÁXIMA (VMAX) CON EL NUMERO DE SITIOS ACTIVOS(ST):

Eficiencia catalítica

LOS BENEFICIOS DE UNA ALTA CONSTANTE CATALÍTICA (KCAT) SOLO PUEDEN


SER REALIZADOS SI KM ES SUFICIENTEMENTE BAJO.

LA EFICIENCIA CATALÍTICA ES EL COCIENTE ENTRE LA CONSTANTE CATALÍTICA


Y LA CONSTANTE DE MICHAELIS (KCAT/KM).

HAY CIERTAS ENZIMAS QUE SON PERFECTAS DESDE EL PUNTO DE VISTA


CATALÍTICO; EL SUSTRATO SE CONVIERTE EN PRODUCTO DE MANERA
INSTANTÁNEA, YA QUE LA VELOCIDAD DE CATALISIS ESTA DETERMINADA POR
LA VELOCIDAD A LA QUE LAS MOLÉCULAS SE MUEVEN A TRAVES DE LA
SOLUCIÓN.

EJEMPLOS DE ENZIMAS PARA LAS CUALES LA EFICIENCIA CATALITICA


(KCAT/KM) SE APROXIMA AL MÁXIMO (108 A 109 M–1S–1): TRIOSAFOSFATO
ISOMERASA, ANHIDRASA CARBONICA, ACETILCOLINESTERASA Y ADENOSINA
DESAMINASA.

 EN LAS CÉLULAS VIVAS, UN COMPLEJO MULTIPROTEICO CATALIZA


REACCIONES SUCESIVAS Y NO SE DIFUNDEN EN LA SOLUCIÓN HASTA QUE
SE COMPLETE EL ULTIMO PASO CATALÍTICOS.

Constante de disociación
 LA CONSTANTE DE DISOCIACION (KD) ES INVERSAMENTE
PROPORCIONAL A LA AFINIDAD DE UNA ENZIMA POR SU SUSTRATO.

 DICHO DE OTRA MANERA, MIENTRAS LA TENDENCIA DE LA ENZIMA Y


SU SUSTRATO PARA DISOCIARSE SEA MENOR, MAYOR ES LA AFINIDAD
DE LA ENZIMA POR SU SUSTRATO.

 LA CONSTANTE DE MICHAELIS KM A MENUDO SE APROXIMA A LA


CONSTANTE DE DISOCIACION (Kd), ESTO SUCEDE CUANDO EL ESTADO
DE TRANSICION OCURRE RÁPIDO. DE LO CONTRARIO NO SE
APROXIMARÁN.
Ecuación de Hill

 LA ECUACION DE HILL SE USA PARA EVALUAR LA CINETICA COOPERATIVA


DE LAS ENZIMAS.

 ALGUNAS ENZIMAS UNEN SUS SUSTRATOS DE MANERA COOPERATIVA.

 EL COMPORTAMIENTO COOPERATIVO ES UNA PROPIEDAD EXCLUSIVA DE


LOS COMPLEJOS MULTIPROTEICOS QUE SE UNEN AL SUSTRATO EN
MULTIPLES SITIOS.

 LOS ENZIMOLOGOS UTILIZAN LA GRAFICA DE ESTA ECUACION PARA


DETERMINAR SI LA ENZIMA TIENE COOPERATIVIDAD POSITIVA CON
OTRAS.

 PARA LAS ENZIMAS QUE MUESTRAN UNA COOPERATIVIDAD

POSITIVA EN LA UNION AL SUSTRATO, LA FORMA DE LA CURVA

QUE RELACIONA LOS CAMBIOS ES SIGMOIDAL.

Inhibidores

 PROPORCIONAN TANTO AGENTES FARMACOLÓGICOS COMO


HERRAMIENTAS DE INVESTIGACIÓN PARA EL ESTUDIO DE LA ENZIMA.

 INHIBIDOR ENZIMÁTICO ES QUIEN CAMBIA LA ACTIVIDAD CATALÍTICA DE


LA ENZIMA.
 LA FUERZA ENTRE UN INHIBIDOR Y UNA ENZIMA DEPENDE DE LAS
FUERZAS EN LA ESTRUCTURA DE LA PROTEINA Y LA UNIÓN ENTRE ELLOS
(ENLACES DE HIDROGENO, INTERACCIONES ELECTROSTATICAS, ENTRE
OTRAS).

 LOS COMPUESTOS QUE APROVECHAN LA MAQUINARIA CATALÍTICA DE


UNA ENZIMA PUEDEN SER INHIBIDORES POTENTES.

Los inhibidores competitivos


 EL INHIBIDOR COMPETITIVO (I) SE UNE AL SITIO ACTIVO BLOQUEANDO
ASÍ EL ACCESO DEL SUSTRATO.

 LA ESTRUCTURA DE LOS INHIBIDORES COMPETITIVOS SE PARECEN A LA


ESTRUCTURA DEL SUSTRATO COMPATIBLE, Y POR ELLO SE DENOMINAN
ANÁLOGOS DE SUSTRATO.

 UN INHIBIDOR COMPETITIVO DISMINUYE LAS ENZIMAS LIBRES


DISPONIBLES PARA UNIRSE CON EL SUSTRATO.
 PARA QUE EL SUSTRATO SUPERE AL INHIBIDOR COMPETITIVO, DEBERA
AUMENTAR Y SUPERAR LA CONCENTRACIÓN DEL INHIBIDOR Y POR TANTO
LA VELOCIDAD DE REACCIÓN.

Diagramas dobles recíprocos

Facilitan la evaluación de los inhibidores

Inhibidores no competitivos
 EN ESTE CASO LA UNION DEL INHIBIDOR NO AFECTA LA UNION DEL
SUSTRATO, SIMPLEMENTE BLOQUEA LA CATALISIS AL UNIRSE EN OTRO
LUGAR DE LA ENZIMA.
 ESTE TIPO DE INHIBIDORES PROVOCA QUE LA ENZIMA JAMÁS LLEGUE A
SU VELOCIDAD NORMAL, INCLUSO EN PRESENCIA DE MUCHO SUSTRATO.
 ESTO SE DEBE A QUE LAS MOLÉCULAS DE ENZIMA QUE ESTÁN UNIDAS AL
INHIBIDOR NO COMPETITIVO ESTÁN "ENVENENADAS" Y NO PUEDEN
HACER SU FUNCIÓN.
Enzimas “venenosas”
 SON AQUELLAS ENZIMAS DONDE LOS INHIBIDORES ACTUARON
IRREVERSIBLEMENTE MODIFICANDO A LA MISMA DESDE EL PUNTO DE
VISTA QUIMICO.

 ESTAS MODIFICACIONES IMPLICAN LA RUPTURA DE ENLACES


COVALENTES PARA LA UNION AL SUSTRATO, LA CATALISIS O EL
MANTENIMIENTO DE LA CONFORMACION FUNCIONAL DE LA ENZIMA.

 LOS INHIBIDORES QUE PUEDEN PROVOCAR ESTA MODIFICIACION SON


LOS METALES PESADOS O UN REACTIVO ACILANTE.

 ESTOS CAMBIOS SON ESTABLES, PROVACANDO MODIFICACIONES


PERMANENTES EN LA ENZIMA.

Desarrollo de fármacos

 LAS ENZIMAS CONSTITUYEN OBJETIVOS NATURALES PARA EL


DESARROLLO DE AGENTES FARMACOLOGICOS QUE SON TANTO
POTENTES COMO ESPECIFICOS.

 MUCHOS FÁRMACOS ACTÚAN COMO INHIBIDORES ENZIMÁTICOS.

EL OBJETIVO DE LA FARMACOLOGÍA ES IDENTIFICAR AGENTES QUE PUEDAN:

 1. DESTRUIR O IMPEDIR EL DESARROLLO DE INVASORES PATOGENOS.

 2. ESTIMULAR LOS MECANISMOS DE DEFENSA ENDÓGENOS.

 3. DETENER PROCESOS MOLECULARES ABERRANTES POR ESTIMULOS


GENETICOS, AMBIENTALES O BIOLÓGICOS.

Importancia de la cinética enzimática

 LA CINETICA ENZIMATICA DESEMPENA UN PAPEL CRUCIAL EN EL


DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS.
 PROPORCIONA LOS MEDIOS PARA CUANTIFICAR Y COMPARAR LA
POTENCIA DE DIFERENTES INHIBIDORES Y DEFINIR SU MODO DE ACCIÓN.

 EL DISEÑO EFECTIVO Y LA ADMINISTRACION DE PROFARMACOS


REQUIEREN EL CONOCIMIENTO DE LA CINETICA
Capítulo 9

ACTIVIDADES ENZIMATICAS
Homeostasis

CLAUDE BERNARD, ENUNCIO LAS BASES DE LA REGULACIÓN METABÓLICA.


OBSERVO QUE LOS SERES VIVOS RESPONDEN A ESTÍMULOS QUE LES PERMITEN
SOBREVIVIR.

POSTERIORMENTE, WALTER CANNON LO LLAMO CON EL TERMINO


"HOMEOSTASIS", DESCRIBIÓ LA CAPACIDAD DE LOS ANIMALES PARA MANTENER
UN ENTORNO INTERNO CONSTANTE, A PESAR DE LOS CAMBIOS EN SU ENTORNO
EXTERNO.

LA HOMEOSTASIS REGULA LA ACTIVIDAD ENZIMATICA PARA MANTENER UN


EQUILIBRIO.

Importancia biomédica

LOS PROBLEMAS EN EL EQUILIBRIO HOMEOSTATICO PUEDEN GENERAR EL


CANCER, LA DIABETES, LA FIBROSIS QUISTICA Y LA ENFERMEDAD DE
ALZHEIMER.

ESTAS ENFERMEDADES SE CARACTERIZAN POR LA INTERACCION ENTRE


AGENTES PATOGENOS, MUTACIONES GENETICAS, APORTE NUTRICIONAL Y
PRACTICAS DE ESTILO DE VIDA.

MUCHOS VIRUS CONTRIBUYEN AL CANCER MEDIANTE LA ELABORACION DE


PROTEINA-TIROSINA CINASAS QUE MODIFICAN LAS PROTEINAS DE LA
EXPRESION GENICA.
LA TOXINA DEL CÓLERA PRODUCIDA POR VIBRIO CHOLERAE DESACTIVA LOS
SENSORES DE LAS CELULAS EPITELIALES INTESTINALES, ESTO TRAE COMO
RESULTADO DIARREA MASIVA Y DESHIDRATACION.

YERSINIA PESTIS, LA PESTE, ELABORA UNA PROTEINA-TIROSINA FOSFATASA QUE


HIDROLIZA LOS GRUPOS FOSFORILO DE LAS PROTEINAS DEL CITOESQUELETO,
LO QUE DESACTIVA EL MECANISMO FAGOCITICO DE LOS MACROFAGOS
PROTECTORES.

LOS SISTEMAS PROTEOLITICOS, RESPONSABLES DE LA DEGRADACION DE


PROTEINAS DEFECTUOSAS DESEMPEÑAN UN PAPEL EN ENFERMEDADES
NEURODEGENERATIVAS COMO LAS DE ALZHEIMER Y DE PARKINSON.

Flujo metabólico pasivo

LAS ENZIMAS QUE OPERAN A SU VELOCIDAD MAXIMA NO PUEDEN AUMENTAR


SU CAPACIDAD EN CASO DE UN EXCESO DE SUSTRATOS, POR ELLO LOS VALORES
DE Km, SE MANTIENEN CERCA DE LA CONCENTRACIÓN INTRACELULAR
PROMEDIO DE SUS SUSTRATOS.

EL FLUJO METABOLICO PASIVO REPRESENTA LOS CAMBIOS LEVES EN LOS


NIVELES DEL SUSTRATO Y A LA VEZ VA GENERAR CAMBIOS LEVES EN EL FLUJO
DE METABOLITOS.

El flujo de metabólicos unidireccional

LAS CELULAS VIVAS EXISTEN EN UN ESTADO DINAMICO, EN EL CUAL LAS


CONCENTRACIONES DE METABOLITOS PERMANECEN CONSTANTES A LO LARGO
DEL TIEMPO.

EN LAS CÉLULAS VIVAS, LOS PRODUCTOS DE UNA REACCIÓN, SIRVEN COMO


SUSTRATOS Y SON ELIMINADOS POR OTRAS REACCIONES. BAJO ESTAS
CIRCUNSTANCIAS, MUCHAS REACCIONES REVERSIBLE OCURREN DE FORMA
UNIDIRECCIONAL.

Compartimentación

LAS CELULAS EUCARIOTAS, LAS VIAS ANABOLICAS Y CATABOLICAS QUE


SINTETIZAN Y DESCOMPONEN BIOMOLECULAS ESTAN SEPARADAS UNAS DE LA
OTRAS.

CIERTAS VIAS METABÓLICAS SE ENCUENTRAN EN CIERTOS TIPOS DE CÉLULAS O


EN COMPARTIMIENTOS SUBCELULARES SEPARADOS.

POR EJEMPLO:

✓ LA BIOSÍNTESIS SE PRODUCE EN EL CITOSOL.

✓ LA OXIDACION DE LOS ACIDOS GRASOS EN LAS MITOCONDRIAS.

✓ LAS ENZIMAS DEGRADATIVAS ESTAN EN LOS LISOSOMAS.

LAS ENZIMAS PUEDEN DISTINGUIR ENTRE LAS COENZIMAS NAD+ Y NADP+ ES


UNA FORMA DE COMPARTIMENTACION.

La energía libre y las reacciones bidireccionales

EL CAMBIO EN LA ENERGIA CUANDO EL FLUJO DEL METABOLITO VA EN


DIRECCION "HACIA ADELANTE" ES IGUAL, PERO EN SIGNO OPUESTO, AL
REQUERIDO EN LA DIRECCION "INVERSA".

ALGUNAS ENZIMAS CATALIZAN LAS ISOMERIZACIONES, DONDE LA DIFERENCIA


EN ENERGIA LIBRE ENTRE SUSTRATOS Y PRODUCTOS ESTA CERCANA A CERO.
ESTOS CATALIZADORES ACTUAN DE FORMA BIDIRECCIONAL.

SIN EMBARGO, CASI TODAS LAS VIAS METABOLICAS POSEEN PASOS PARA LOS
CUALES ΔG ES SIGNIFICATIVA.
POR EJEMPLO:

EN LA GLUCOLISIS, LA DESCOMPOSICION DE LA GLUCOSA PARA FORMAR DOS


MOLECULAS DE PIRUVATO, TIENE UN ΔG GLOBAL FAVORABLE DE —96 KJ/MOL,
UN VALOR DEMASIADO GRANDE PARA OPERAR SIMPLEMENTE EN "INVERSO “.

Enzimas que limitan la velocidad

LA ENZIMA QUE NECESITA UNA INTERVENCION REGULATORIA ES AQUELLA


CUYA EFICIENCIA CATALITICA ESTA LENTA EN RELACION CON EL RESTO DE
ENZIMAS EN LA VIA METABOLICA.

DISMINUIR LA EFICIENCIA CATALITICA REDUCIRÁ DE INMEDIATO EL FLUJO DE


METABOLITOS EN TODA LA VIA. POR EL CONTRARIO, UN AUMENTO PROVOCARA
UN INCREMENTO EN EL FLUJO A TRAVES DE LA VIA.

LAS ENZIMAS QUE LIMITAN LA VELOCIDAD SON OBJETIVOS FARMACOLOGICOS


PROMETEDORES.

POR EJEMPLO: LAS ESTATINAS REDUCEN LA SINTESIS DE COLESTEROL AL


INHIBIR HMG-COA REDUCTASA, (CATALIZADOR DE LA COLESTEROGENESIS).

Cantidad de enzima

LA CAPACIDAD CATALITICA TOTAL EN UNA VIA METABOLICA ES EL PRODUCTO


DE LA CONCENTRACION DE ENZIMAS Y SU EFICIENCIA.

POR TANTO, LA CAPACIDAD CATALITICA PUEDE CONTROLARSE CAMBIANDO LA


CANTIDAD DE ENZIMAS PRESENTES, ALTERANDO SU EFICIENCIA CATALITICA O
A TRAVES DE UNA COMBINACION DE AMBAS ACCIONES.
Las proteínas se sintetizan y degradan continuamente

SCHOENHEIMER DEDUJO QUE LAS PROTEINAS EXISTEN EN UN ESTADO DE


"EQUILIBRIO DINAMICO", DONDE SE SINTETIZAN Y DEGRADAN
CONTINUAMENTE, UN PROCESO CONOCIDO COMO RECAMBIO PROTEICO.

OTRAS ENZIMAS ESTÁN SUJETAS A CAMBIOS DINAMICOS POR FACTORES


HORMONALES, DIETETICOS, PATOLOGICOS, ASI COMO OTROS QUE AFECTAN LAS
CONSTANTES DE VELOCIDAD (KS), DEGRADACIÓN (KDEG) O AMBAS.

La síntesis enzimática

LA SINTESIS DEPENDE DE LA PRESENCIA DE INDUCTORES, SUSTRATOS


ESTRUCTURALMENTE RELACIONADOS QUE ESTIMULAN LA TRANSCRIPCION DEL
GEN QUE LOS CODIFICA.

EJEMPLO:

✓ ESCHERICHIA COLI SOLO CATABOLIZARA LA LACTOSA DESPUES DE LA


ADICION DEL INDUCTOR Β-GALACTOSIDO.

✓ LAS ENZIMAS INDUCIBLES DE LOS HUMANOS INCLUYEN TRIPTÓFANO


PIRROLASA, TREONINA DESHIDRATASA, TIROSINA-Α-CETOGLUTARATO
AMINOTRANSFERASA, ENZIMAS DEL CICLO DE LA UREA, HMG-COA
REDUCTASA, Δ-AMINOLEVULINATO SINTASA Y CITOCROMO P450.

Degradación de enzimas

MUCHAS PROTEINAS SE DEGRADAN POR LA VIA DE LA UBIQUITINA


PROTEOSOMA.
LA VIA DE LA UBIQUITINA PROTEOSOMA ES RESPONSABLE TANTO DE LA
DEGRADACION DE PROTEINAS CELULARES COMO DE LA ELIMINACION DE
ESPECIES DE PROTEINAS DEFECTUOSAS.

LA SELECTIVIDAD DEL SISTEMA UBIQUITINA-PROTEOSOMA RESIDE EN SU


CAPACIDAD PARA DISTINGUIR ENTRE LOS DIFERENTES ESTADOS FISICOS O
CONFORMACIONALES DE LAS PROTEINAS.

ESTA VIA PUEDE DEGRADAR LAS PROTEINAS QUE HAN TENIDO PERDIDA O DAÑO
A UN GRUPO PROSTETICO, OXIDACION DE RESIDUOS DE CISTEINA O HISTIDINA,
DESPLIEGUE PARCIAL O DESAMIDACION DE RESIDUOS DE ASPARAGINA O
GLUTAMINA.

EL MAL FUNCIONAMIENTO DE ESTA VIA, CONTRIBUYE A LA ACUMULACION DE


PROTEINAS MAL PLEGADAS, QUE GENERAN ENFERMEDADES
NEURODEGENERATIVAS.

Regulación catalítica

LA SINTESIS DE PROTEINAS ES UN PROCESO QUE REQUIERE HORAS PARA


PRODUCIR CAMBIOS SIGNIFICATIVOS EN LA ENZIMA.

POR LO CONTRARIO, LOS CAMBIOS EN LA EFICACIA CATALITICA OCURREN EN


FRACCIONES DE SEGUNDOS, PRODUCIDOS POR LA REGULARICION ALOSTERICA
O POR MODIFICACIÓN COVALENTE. ESTOS CAMBIOS SE FAVORECEN DE LAS
ALTERACIONES RAPIDAS Y TRANSITORIAS EN EL FLUJO DE METABOLITOS.

Regulación alostérica

ES UNA REGULACIÓN DE LAS ENZIMAS EN LA CUAL, LA UNIÓN DE


UNA MOLÉCULA EN UNA UBICACIÓN (SITIO ALOSTÉRICO) MODIFICA LAS
CONDICIONES DE UNIÓN DE OTRA MOLÉCULA, EN OTRA UBICACIÓN (SITIO
CATALÍTICO) DE LA ENZIMA.
Vía biosintética

ES UNA REGULACIÓN DE LAS ENZIMAS EN LA CUAL, LA UNIÓN DE


UNA MOLÉCULA EN UNA UBICACIÓN (SITIO ALOSTÉRICO) MODIFICA LAS
CONDICIONES DE UNIÓN DE OTRA MOLÉCULA, EN OTRA UBICACIÓN (SITIO
CATALÍTICO) DE LA ENZIMA.

Regulación por retroalimentación

EN ESTE PROCESO EL PRODUCTO FINAL DE UNA VIA BIOSINTETICA SE UNE A


UNA ENZIMA Y LA INHIBE CATALIZANDO UNO DE LOS PRIMEROS PASOS EN ESA
VÍA.

SI LA CELULA YA NO NECESITA EL METABOLITO D, CONTINUARA


ACUMULÁNDOLO, POR ELLO ESTA REGULACION PERMITE QUE LA VIA
RETROCEDA COMO UNA AUTOPISTA EN HORARIO DE CONGESTION, AL HACER
QUE “D” SE UNA A “ENZ1” E INHIBIR LA CONVERSION DE “A” A “B”.

UN INHIBIDOR POR RETROALIMENTACION COMO “D” SE UNE EN UN SITIO


ALOSTÉRICO, UN ESPACIO DISTINTO DEL SITIO CATALITICO DE LA ENZIMA.

LOS INHIBIDORES POR RETROALIMENTACION, POR LO GENERAL, NO TIENEN


NINGUNA SIMILITUD ESTRUCTURAL CON LOS SUSTRATO.

Vía biosintética ramificada

LAS REACCIONES INICIALES SE CONVIERTEN EN INTERMEDIARIOS PARA LA


CREACIÓN DE MÚLTIPLES PRODUCTOS FINALES.
LAS FLECHAS RECTAS REPRESENTAN ENZIMAS. LAS FLECHAS ROJAS
REPRESENTAN LOS CIRCUITOS DE RETROALIMENTACIÓN E INDICAN LOS SITIOS
DE INHIBICIÓN.

LA CINÉTICA POR RETROALIMENTACIÓN PUEDE SER COMPETITIVA, NO


COMPETITIVA, PARCIALMENTE COMPETITIVA O MIXTA.

EL ESTABLECIMIENTO DE MÚLTIPLES CIRCUITOS DE RETROALIMENTACIÓN


PUEDE APORTAR UN EXCELENTE CONTROL.

CADA PRODUCTO FINAL INHIBE PARCIALMENTE LA ACTIVIDAD CATALÍTICA. EL


EFECTO INHIBITORIO DE DOS O MÁS PRODUCTOS FINALES EN EXCESO TENDRÁ
MAYOR EFECTO QUE INDIVIDUAL.

La aspartato transcarbamilasa
Es un modelo de enzima alostérica
ES EL CATALIZADOR PARA LA PRIMERA REACCIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE
PIRIMIDINA (PARTICIPA EN FUNCIONES BIOLÓGICAS ESENCIALES, YA QUE
FORMAN PARTE DE LA ESTRUCTURA DEL ADN).

Sitios alostéricos

JACQUES MONOD PROPUSO LA EXISTENCIA DE SITIOS ALOSTÉRICOS QUE SON


DISTINTOS DEL SITIO CATALÍTICO.

LOS INHIBIDORES DE RETROALIMENTACION SON DIFERENTES A LOS SUSTRATOS


POR LO TANTO OCUPAN ESPACIOS DIFERENTES EN EL SITIO ACTIVO A LO QUE
SE LE LLAMA SITIO ALOSTÉRICO.

LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS SON AQUELLAS PARA LAS CUALES EL SITIO ACTIVO
PUEDE MODIFICARSE EN UN SITIO ALOSTÉRICO, ES DECIR QUE PUEDEN
INDUCIRSE A CAMBIOS CONFORMACIONALES.

Efectos alostéricos K y V

LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS DE LA SERIE K, LA CINETICA DEL SUSTRATO


AUMENTA EN EL SENTIDO DE QUE KM SE INCREMENTA Y NO TIENE EFECTOS
SOBRE LA VELOCIDAD.

LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS DE LA SERIE V, EL INHIBIDOR ALOSTÉRICO


DISMINUYE VMÁX, PERO NO AFECTA LA KM (SUSTRATOS).

LAS ALTERACIONES EN KM O VMÁX A MENUDO SON EL RESULTADO DE CAMBIOS


CONFORMACIONALES EN EL SITIO CATALÍTICO.

Retroalimentación

HAY DOS TIPOS DE RETROALIMENTACION: “REGULACIÓN POR


RETROALIMENTACIÓN” LA CUAL NO UTILIZA LOS PRODUCTOS DE LOS
METABOLITOS COMO INHIBIDORES PARA REGULAR A LAS ENZIMAS Y LA
“INHIBICIÓN POR RETROALIMENTACIÓN”, UN MECANISMO TAL Y COMO LO DICE
SU NOMBRE, UTILIZA INHIBIDORES OBTENIDOS DE LOS METABOLITOS.

POR EJEMPLO, MIENTRAS QUE EL COLESTEROL CONSUMIDO DISMINUYE LA


SÍNTESIS DE COLESTEROL EN EL CUERPO, ESTA REGULACIÓN POR
RETROALIMENTACIÓN NO IMPLICA LA INHIBICIÓN, SOLO AFECTA LA VELOCIDAD
DE LA ENZIMA HMG-COA RUDUCTASA Y EL COLESTEROL NO INHIBE A LA
ENZIMA.

POR EL CONTRARIO, LA REGULACIÓN DEL COLESTEROL CONSUMIDO EN


EXCESO IMPLICA LA REDUCCIÓN DEL METABOLITO DE COLESTEROL DE LA
EXPRESIÓN DEL GEN QUE CODIFICA HMG-COA REDUCTASA.

Hormonas

LOS IMPULSOS NERVIOSOS Y LA UNIÓN DE MUCHAS HORMONAS (MENSAJEROS


PRIMARIOS) A LA SUPERFICIE CELULAR PROVOCAN CAMBIOS EN LA VELOCIDAD
ENZIMÁTICA O INDUCEN CAMBIOS EN LOS EFECTORES ALOSTÉRICOS LLAMADOS
SEGUNDOS MENSAJEROS.

LA HORMONA (MENSAJERO PRIMARIO) ABRE CANALES DE IONES DE CALCIO Y


ACTIVA A LA ENZIMA ADENILIL CICLASA, LA CUAL VA CREAR AL AMP CICLICO
(SEGUNDO MENSAJERO) QUE VA ACTIVAR A OTRAS ENZIMAS DENTRO DE LA
CELULA.

EJEMPLO: LA DISMINUCIÓN DE LA MEMBRANA POR UN IMPULSO NERVIOSO


PROVACADO POR LA HORMONA EPINEFRINA, ABRE UN CANAL QUE LIBERA
IONES DE CALCIO EN EL CITOPLASMA, DONDE SE ACTIVAN LAS ENZIMAS DE LA
REGULACIÓN DE LA CONTRACCIÓN MUSCULAR Y LA MOVILIZACIÓN DE LA
GLUCOSA ALMACENADA DEL GLUCÓGENO, PARA ABASTECER LOS
INCREMENTOS DE ENERGÍA DE LA CONTRACCIÓN MUSCULAR.
Histonas
SON PROTEÍNAS CRÍTICAS EN EL EMPAQUETAMIENTO DEL ADN EN LA CÉLULA
EN FORMA DE CROMATINA Y CROMOSOMAS. TAMBIÉN SON MUY IMPORTANTES
PARA LA REGULACIÓN DE LOS GENES.

LOS CAMBIOS EN LA CROMATINA PUEDEN HACER QUE LOS GENES SEAN MÁS
ACCESIBLES A LA TRANSCRIPCIÓN, LO QUE MEJORA LA EXPRESIÓN GÉNETICA.

El código de histonas
REPRESENTA UN EJEMPLO CLÁSICO DE EPIGENÉTICA, Y SE REFERIE A LA
TRANSMISIÓN HEREDITARIA DE INFORMACIÓN POR UN MEDIO DISTINTO A LOS
NUCLEÓTIDOS QUE COMPONEN EL GENOMA.
EN ESTE CASO, LA EXPRESIÓN GÉNETICA DENTRO DE UNA CÉLULA RECIÉN
FORMADA SE DETERMINARÁ, POR EL CONJUNTO DE MODIFICACIONES DE
HISTONAS HEREDADAS DE LA CÉLULA "PARENTAL".

Modificación covalente reversible


EL TÉRMINO REVERSIBLE SE REFIERE A QUE LA PROTEÍNA SE PUEDE RESTAURAR
A SU ESTADO ORIGINAL.

LA ACETILACIÓN, LA ADP-RIBOSILACIÓN, LA METILACIÓN Y LA FOSFORILACIÓN


SON EJEMPLOS DE MODIFICACIONES COVALENTES "REVERSIBLES “.

LA FOSFORILACIÓN DE PROTEÍNAS SE FAVORECE TERMODINÁMICAMENTE


COMO CONSECUENCIA DE LA UTILIZACIÓN DEL GRUPO FOSFORILO QUE TIENE
ALTA ENERGÍA DE ATP.

Proenzimas

ALGUNAS PROTEÍNAS SE SINTETIZAN COMO INACTIVAS Y SE LES CONOCE COMO


PROPROTEÍNAS. LAS FORMAS PROPROTEÍNAS DE LAS ENZIMAS SE DENOMINAN
PROENZIMAS O ZIMÓGENOS.

SE INCLUYEN LA HORMONA INSULINA, LAS ENZIMAS DIGESTIVAS PEPSINA,


TRIPSINA Y QUIMOTRIPSINA VARIOS FACTORES DE LA COAGULACIÓN DE LA
SANGRE Y EL COLAGENO DEL TEJIDO CONECTIVO.

CUANDO SEA NECESARIA SU FUNCION, SE ACTIVARÁ UNA PROPROTEÍNA, ESTO


PARA PROTEGER LOS TEJIDOS A SU ALREDEDOR Y LLEVARA A CABO SUS
FUNCIONES CATALÍTICAS HASTA QUE SE ELIMINE POR DEGRADACIÓN U OTROS
MEDIOS.
Proteasa

LA DIGESTIÓN, LA FORMACIÓN DE LOS COÁGULOS SANGUÍNEOS Y LA


REMODELACIÓN TISULAR HACEN USO DE LAS PROTEASAS, QUE SON
PROENZIMAS (CATALÍTICAMENTE INACTIVAS) PARA PROTEGER LOS TEJIDOS DE
SUS EFECTOS DEGRADATIVOS.

EN LA PANCREATITIS, LA ACTIVACIÓN ANTICIPADA DE LAS PROTEASAS


DIGESTIVAS CONDUCE A LA AUTODIGESTIÓN DE TEJIDO SANO, EN VEZ DE LAS
PROTEÍNAS INGERIDAS.

LA FORMACIÓN DE COÁGULOS SANGUÍNEOS Y LA REPARACIÓN DEL TEJIDO SE


LLEVA A CABO SÓLO EN RESPUESTA A LA NECESIDAD FISIOLÓGICA.

Fosforilación Covalente

LAS CINASAS FOSFORILAN LAS PROTEÍNAS CATALIZANDO LA TRANSFERENCIA


DEL GRUPO FOSFORILO A LOS GRUPOS HIDROXILO. AL FOSFORILAR UNA
ENZIMA PASA A ESTAR INACTIVA.

LAS FOSFATASAS PERMITEN A LAS ENZIMAS REGENERARSE Y REGRESAR A SU


ESTADO ACTIVO AL ELIMINAR LOS GRUPOS FOSFORILO.
Fosforilación proteica es extremadamente versátil

LA FOSFORILACIÓN-DESFOSFORILACIÓN DE PROTEÍNAS ES UN PROCESO


ALTAMENTE SELECTIVO Y VERSÁTIL.

NO TODAS LAS PROTEÍNAS ESTÁN SUJETAS A LA FOSFORILACIÓN, Y DE LOS


MUCHOS GRUPOS HIDROXILO DE UNA PROTEÍNA, SÓLO UN PEQUEÑO
SUBCONJUNTO ES ELEGIDO.

MUCHAS PROTEÍNAS SE PUEDEN FOSFORILAR EN MÚLTIPLES SITIOS. PUEDEN


SER CATALIZADAS POR MÚLTIPLES PROTEÍNAS CINASAS O PROTEÍNAS
FOSFATASAS Y ACTÚAN SOBRE MÁS DE UNA PROTEÍNA CAMBIANDO SUS FORMAS
ACTIVAS E INACTIVAS.

Acetilación de proteínas

SE HA ASOCIADO DURANTE MUCHO TIEMPO CON LAS HISTONAS Y OTRAS


PROTEÍNAS NUCLEARES. SIN EMBARGO, LOS ESTUDIOS POSTERIORES HAN
REVELADO QUE ESTA PRESENTE EN CASI TODAS LAS ENZIMAS DE LAS VÍAS
METABÓLICAS COMO LA GLUCÓLISIS, LA SÍNTESIS DE GLUCÓGENO, LA
GLUCONEOGÉNESIS ENTRE OTRAS.

LA LISINA ACETILTRANSFERASA CATALIZA LA TRANSFERENCIA DEL GRUPO


ACETILO DE ACETIL-COA A LOS GRUPOS Ε-AMINO DE RESIDUOS LISILO,
FORMANDO N-ACETIL LISINA.

DOS CLASES DE PROTEÍNA DESACETILASAS SE HAN IDENTIFICADO: HISTONAS


DESACETILASAS (POR HIDROLISIS) Y SIRTUINAS (POR NAD).

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