Bioquimica Unidad I
Bioquimica Unidad I
Bioquimica Unidad I
No hacen factibles las reacciones imposibles, sino que solamente aceleran las
reacciones que espontáneamente podrían producirse.
Esto hace posible que tengan lugar reacciones que sin catalizador requerirían
condiciones extremas de presión, temperatura o pH.
ENZIMA
𝑅𝐸𝐴𝐶𝑇𝐼𝑉𝑂𝑆 − − − −→ 𝑃𝑅𝑂𝐷𝑈𝐶𝑇𝑂𝑆
(SUSTRATOS)
Aprovechamiento de la energía.
ARN ribosomal (ARNr): es el tipo de ARN más abundante (80-85% del ARN
total) en las células y constituye, en parte, los ribosomas.
Las ribozimas son ARN con actividad catalítica. El término "ribozima" es una
contracción de las palabras "ácido ribonucleico" y "enzima". Los sustratos de
las ribozimas son con frecuencia ARN.
IMPORTANCIA MÉDICA
Son especificas no solo para el tipo de reaccion catalizada, sino tambien para
un unico sustrato o un pequeño conjunto de sustratos muy relacionados.
Algunos nombres de enzimas descritas por primera vez, persisten hasta el día
de hoy. Ejemplo: pepsina, tripsina y amilasa.
Cada enzima tiene un nombre único y un numero de código que identifica el tipo
de reacción catalizada y los sustratos involucrados.
TRANSFERASAS
HIDROLASAS
LIASAS
ISOMERASAS
LIGASAS
OXIDORREDUCTASAS
Enzimas que catalizan oxidaciones y reducciones, es decir transferencia de
hidrogeno(H) o electrones (e).
TRANSFERASAS
Enzimas que catalizan la transferencia de restos o grupos químicos, diferentes
al hidrogeno, tales como grupos glucósido, metilo o fosforilo.
HIDROLASAS
Catalizan la escisión hidrolítica de c-c.
C-o, c-n y otros enlaces covalentes.
Escisión es dividir.
LIASAS
Catalizan la escisión de C-C, C-O, C-N y otros enlaces covalentes por
eliminación de átomos, generando dobles enlaces.
LIGASAS
Catalizan la unión de dos moléculas en reacciones acopladas a la hidrolisis del
ATP.
“hexosa -6” indica que el alcohol fosforilado está en carbono 6 de una hexosa.
GRUPOS PROSTETICOS
Amplían el repertorio de capacidades catalíticas más allá de las proporcionadas
por los grupos funcionales presentes en las cadenas laterales.
COFACTORES
Un cofactor es un componente no proteico que complementa a
una enzima (que es una sustancia proteica). El cofactor tiene que
estar presente en cantidades adecuadas para que la enzima pueda
actuar, catalizando una reacción bioquímica.
Las enzimas que requieren los iones metálicos como grupos prostéticos se
llaman metaloenzimas
Estas moléculas orgánicas, forman parte de los sitios activos de sus enzimas
proteicas. Dado que la coenzima forma parte del sitio activo de la enzima, la
enzima no puede trabajar en el sustrato sin ella.
Hay coenzimas que mantienen una relación permanente con la enzima. Otras, en
cambio, solo experimentan una unión temporal.
Es importante tener en cuenta que no todas las coenzimas aceptan los mismos
tipos de átomos. Pueden recibir grupos acetilos, hidrógenos, aminos u otras
clases según cada caso.
En cuanto a las enzimas a las que cuales se adhieren, no existen restricciones:
una misma coenzima se puede unir a distintas enzimas.
Ápoenzima: es catalíticamente
inactiva
Fischer comparo la presicion de una enzima para elegir sus sustratos con la
manera en que una cerradura distingue la llave adecuada, de tal manera que la
“cerradura” está formada por una bolsa en la superficie de la enzima llamada
“sitio activo”.
Dentro del sitio activo, los sustratos se acercan entre si en una alineación
optima con los cofactores, grupos prostéticos y cadenas laterales de
aminoácido que participan en la catalizacion de la transformación de sustratos
en productos.
Catálisis covalente
Catálisis acido-base
Para que las moléculas interactúen, deben estar dentro de la distancia de
formación de enlaces entre sí.
Los dos aspartatos del sitio activo pueden actuar simultáneamente como una
base general o como un ácido general porque su entorno inmediato favorece la
ionización de uno, pero no del otro.
⑥ Producto Final.
Las enzimas catalizan las reacciones químicas que hacen posible la vida en la tierra,
participan en la descomposición de los nutrientes para suministrar energía y componentes
químicos lograr el ensamblaje de esos bloques en proteínas, DNA, membranas, celulas y
tejidos, y posibilitar aprovechamiento de la energía para potenciar la motilidad celular, la
función neuronal y contracción muscular.
La lactasa, se emplea para eliminar lactosa de la leche para beneficiar a los individuos
intolerantes a la lactosa.
Las proteasas y amilasas aumentan la capacidad de los detergentes para eliminar la suciedad
y las manchas, mientras que otras enzimas pueden participar en la síntesis estereoespecífica
de fármacos complejos o antibióticos.
Las enzimas que catalizan la conversión de uno o más compuestos (sustratos) en uno o más
compuestos diferentes (productos) generalmente aumentan las velocidades de la reacción no
catalizada correspondiente por factores de 106 (un millón) o más.
Las enzimas pueden sufrir modificación transitoria durante la catálisis, pero no se consumen
ni se alteran permanentemente. Las enzimas también son en extremo selectivas.
Los sustratos se unión a través de “tres puntos de unión” las enzimas también pueden
producir productos quirales a partir de sustratos no quirales.
Algunos de los nombres de las enzimas descritas por primera vez en los primeros días de la
bioquímica persisten en uso hasta el día de hoy. Los ejemplos incluyen pepsina, tripsina y
amilasa. Los primeros bioquímicos generalmente llamaban a las enzimas recién descubiertas
añadiendo el sufijo asa a un descriptor para el tipo de reacción catalizada.
• Xantina oxidasa
• Ribonucleasa pancreática (su fuente)
• Lipasa sensible a hormona (modo de regulación)
• Cisteína proteasa (mecanismo de acción)
Unión Internacional de Bioquímica (IUB, International Union of Biochemestry)
desarrollo un sistema de nomenclatura enzimático en el que cada enzima tiene un nombre
único y un numero de código que identifica el tipo de reacción catalizada y los sustratos
involucrados.
• Oxidorreductasas
• Transferasas
• Hidrolasas
• Liasas
• Isomerasas
• Ligasas
• Clase 2 (transferasas)
• Subclase 7 (transferencia de un grupo fosforilo)
• Subclase 1 (alcohol es el aceptor de fosforilo)
Hexosa-6 indica que el alcohol fosforilado esta en carbono seis de una hexosa.
la catálisis
• Fosfato de piridoxal
• Mononucleótido de flavina
• Dinucleótido de flavina adenina
• Pirofosfato de tiamina
• Ácido lipoico
• Biotina
• Hierro (Fe)
• Cobalto (Co)
• Cobre (Cu)
• Magnesio (Mg)
• Manganeso (Mn)
• Cinc (Zn)
BIOQUÍMICA
IMPORTANCIA BIOMEDICA:
El análisis cinético puede revelar el orden y el número de los pasos individuales a
través de los cuales las enzimas transforman sustratos en productos, y junto con la
mutagénesis dirigida al sitio, los análisis cinéticos pueden revelar detalles del
mecanismo catalítico de una enzima determinada.
infartos de miocardio
cáncer de próstata
lesiones en el hígado.
Las flechas dobles indican reversibilidad, una propiedad intrínseca de todas las
reacciones químicas.
Los productos son a menudo utilizados para designar a los reactantes cuya formación
esta favorecida de modo termodinámico.
Las reacciones para las cuales los factores termodinámicos favorecen fuertemente
la formación de los productos a los que apunta la flecha a menudo se representan con
una sola flecha como si fueran “irreversibles”.
Las flechas unidireccionales también se usan para describir reacciones en células
vivas donde los productos de la reacción son inmediatamente consumidos por una
reacción posterior catalizada por enzimas o rápidamente escapan de la célula.
de reacción.
Dado que la AG0 es una función exclusiva de los estados inicial y final de las especies
que reaccionan, puede proporcionar información solo sobre la dirección y el estado
de equilibrio de la reacción. AG0 es independiente del mecanismo de la reacción y no
proporciona información sobre las velocidades de las reacciones.
Los parámetros termodinámicos que determinan que tan rápido una reacción avanza
son los valores de AGF para la formación de los estados de transición.
Temperatura:
Para una reacción química que procede a una temperatura constante que comprende
una molécula, cada una, de A y B, el número de moléculas que poseen energía cinética
suficiente para superar la barrera de energía de activación será una constante. Por
ende, el número de choques con suficiente energía para producir el producto P será
directamente proporcional al número de choques entre A y B.
- Todas las enzimas aceleran los índices de reacción al disminuir la ΔGF para la
formación de estados de transición.
- La proteasa del VIH ilustra la catálisis por una enzima que disminuye la barrera
de activación al estabilizar un intermediario de estado de transición
- Dado que la enzima a ambos lados de las dobles flechas está presente en igual
cantidad y forma idéntica, la expresión para un equilibrio constante, reduce a
uno idéntico al de la reacción en ausencia de la enzima. Por tanto, las enzimas
no tienen efecto sobre Keq.
Para las enzimas cuyo mecanismo involucra la catálisis ácido-base, los residuos
involucrados deben estar en el estado apropiado de protonación para que la reacción
continúe.
Los grupos cargados más frecuentes son grupos carboxilato (negativos) y aminas
protonadas (positivos). La ganancia o pérdida de grupos cargados cruciales afecta
de manera adversa la unión a sustrato y, así, retrasará o anulará la catálisis.
1. Cuando [S] es mucho menor que Km, el término Km + [S] es en esencia igual
a la Km. El remplazo de Km + [S] con Km reduce la ecuación donde ≈
significa “aproximadamente igual a”. Dado que tanto Vmáx como Km son
constantes, su proporción es una constante. cuando [S] está muy por debajo
de Km, vi es proporcional a k[S]. Por ende, la velocidad de reacción inicial es
directamente proporcional a [S].
Cuando [S] es mucho mayor que Km, el término Km + [S] es en esencia igual a
[S]. Reemplazar Km + [S] por [S] reduce la ecuación, cuando [S] excede con
mucho a Km, la velocidad de reacción es máxima (Vmáx) y no está afectada
por aumentos adicionales de la concentración de sustrato.
2. Cuando [S] = K La ecuación declara que cuando [S] es igual a Km, la
velocidad inicial es de la mitad del máximo. La ecuación también revela que
Km es —y puede determinarse la manera experimental a partir de— la
concentración de sustrato a la cual la velocidad inicial es de la mitad del
máximo.
Para ciertas enzimas, una vez que el sustrato se une al sitio activo, se convierte en
producto y se libera con tanta rapidez como para hacer a estos eventos
efectivamente instantáneos. Para estos catalíticos tan eficientes, el paso limitante
es la formación del complejo ES, Esas enzimas están limitadas por difusión.
Para ciertas enzimas, una vez que el sustrato se une al sitio activo, se convierte en
producto y se libera con tanta rapidez como para hacer a estos eventos
efectivamente instantáneos. Para estos catalíticos tan eficientes, el paso limitante
es la formación del complejo ES. Se dice que esas enzimas están limitadas por
difusión.
El ácido graso sintetasa extiende este concepto un paso más allá al fijar de manera
covalente la cadena de ácido graso sustrato en crecimiento a una cadena de biotina
que rota de un sitio activo a otro dentro del complejo hasta que se completa la
síntesis de una molécula de ácido palmítico.
La ecuación establece que cuando [S] es bajo en relación con k´, la velocidad inicial
de reacción aumenta como la enésima potencia [S].
La pendiente de la línea, n, es el coeficiente de Hill, un parámetro empírico cuyo
valor es una función del número, el tipo y la fuerza de las interacciones de los sitios
del sustrato múltiple en la enzima. Cuando n= 1, todos los sitios de unión se
comportan de manera independiente y se observa el comportamiento cinético simple
de Michaelis-Menten. Si n es mayor que 1, se dice que la enzima exhibe
cooperatividad positiva. La unión del sustrato por tanto, a un sitio potencia la
afinidad de los sitios restantes para enlazar el sustrato adicional. Cuanto mayor es
el valor de n, mayor es el grado de cooperatividad y mas marcadamente sigmoidal
será el diagrama de Vi versus [S].
Inhibidores competitivos
Inhibidores no competitivos
La enzima por completo activa puede recuperarse con tan sólo eliminar el inhibidor
del medio circundante. Varios otros inhibidores actúan de manera irreversible al
producir modificación química de la enzima. Estas modificaciones por lo general
comprenden hacer o romper enlaces covalentes con residuos aminoacilo esenciales
para la unión a sustrato, catálisis o mantenimiento de la conformación funcional de la
enzima.
Una enzima que ha sido “envenenada” por un inhibidor irreversible, permanece
inhibida incluso después de la eliminación del inhibidor remanente del medio
circundante Inhibición basada en mecanismos:
Sus diversos roles fisiológicos y alto grado de selectividad de sustrato, las enzimas
constituyen blancos naturales para la creación de fármacos que son tanto potentes
como específicos.
Las reducen
estatinas:la producción de colesterol inhibiendo la enzima HMG-CoA reducta.
Las vitaminas son un grupo de nutrientes orgánicos necesarios en pequeñas cantidades para
una variedad de funciones bioquímicas, que por lo general no pueden ser sintetizadas por el
cuerpo y deben de ser aportadas por la dieta.
Excepciones a este concepto:
Vitamina D: por sintetizarse a partir de 7-dehidrocolesterol por exposición a la luz solar
Niacina: porque se puede formar a partir del aminoácido esencial Triptófano.
VITAMINAS LIPOSOLUBLES
Compuestos hidrófobos que se pueden absorber de manera eficiente solo cuando hay una
absorción normal de grasas.
Se transportan en la sangre en lipoproteínas (quilomicrones) o se fusionan a proteínas
específicas de unión.
Condiciones que afectan la absorción de estas vitaminas:
Dieta baja en grasas
Esteatorrea
Trastornos del sistema biliar
DATO CURIOSO: por exposición al sol no se puede llegar a una intoxicación por esta
vitamina debido a la capacidad limitada de producir 7-dehidrocolesterol, al contrario la
exposición prolongada lleva a la producción de compuestos inactivos.
VITAMINA E: Está constituida por dos familias de compuestos: los tocoferoles y
tocotrienoles. El más activo es el D-α-tocoferol
No tiene una función metabólica precisamente definida
Actúa como un antioxidante liposoluble en las membranas celulares
Es importante para mantener la fluidez de la membrana celular
Papel poco definido en la señalización celular
Función principal de la Vitamina E: romper la cadena y atrapar radicales libres de las
membranas celulares y las lipoproteínas del plasma, reaccionando con los radicales del peróxido
lipídico formados por la peroxidación de los ácidos grasos poliinsaturados.
Radical Tocoferoxil:
Es relativamente no reactivo y forma compuestos no radicales
Se reduce de nuevo a tocoferol por la reacción con la vitamina C del plasma
De la reacción con la vitamina C resulta: el radical monodiescobato de estaño que
mediante una reacción enzimática o no enzimática forma ascorbato y
deshidroascorbato de los cuales ninguno es radical.
DEFICIENCIA DE VITAMINA E: Se presenta en pacientes con malformaciones de la grasa,
fibrosis quística y algunas formas de enfermedades hepáticas crónicas. Causando:
Daño en las membranas nerviosas y musculares extremadamente rara y grave
En bebes prematuros las reservas de esta vitamina son inadecuadas produciendo
eritrocitos anormalmente frágiles por la peroxidación de los lípidos lo que conduce a
una anemia hemolítica
VITAMINA K:
Se descubrió como resultado de las investigaciones sobre la causa de un trastorno de la
coagulación en el ganado y los pollos.
Necesaria para la síntesis de proteínas de la coagulación sanguínea
El antagonista más utilizado para reducir la coagulación sanguínea en pacientes con
riesgo de trombosis es: Warfarina
Existen tres compuestos con actividad biológica de la vitamina K:
Filoquinona: se encuentra en los vegetales verdes
Menaquinona: se sintetiza por bacterias intestinales
Menadiona: también el menadiol diacetato, ambos compuestos son sintéticos y pueden
metabolizarse a Filoquinona.
La vitamina K funciona como coenzima en la formación del γ-carboxiglutamato de la siguiente
forma:
La vitamina K hidroquinona se oxida mediante la
enzima Vitamina k epoxidasa formando
lOMoARcPSD|7326106
La FAD se sintetiza por la reacción adicional con el ATP en el que el reto de AMP se
transfiere al FMN
Las flavinoxidasas contribuyen de manera significativa al estrés oxidante total.
DEFICIENCIA DE NIACINA:
La deficiencia de triptófano y niacina producen Pelagra, que se caracteriza por:
dermatitis fotosensible, psicosis depresiva y diarrea.
Deficiencias de riboflavina o vitamina B6 pueden contribuir a la pelagra por ser
necesarias para la síntesis de la nicotinamida a partir del triptófano.
Las mujeres suelen ser más susceptibles a estas deficiencias por la inhibición del
metabolismo del triptófano por parte de los estrógenos.
ENFERMEDADES QUE PEDEN PRODUCIR PELAGRA:
DEFICIENCIA DE BIOTINA:
En personas mantenidas por muchos meses con nutrición parenteral total
Personas que consumen claras de huevo sin cocer, por la presencia de Avidina, una
proteína que se une a la biotina y la deja inactiva para la absorción
ÁCIDO PANTOTENICO:
Tiene un papel central en el metabolismo del grupo acilo cuando actúa como la fracción
funcional de la panteteína de la CoA o la proteína transportadora del acilo ACP
La CoA participa en las reacciones del ciclo del ácido cítrico, la oxidación de los ácidos
grasos, las acetilaciones y la síntesis del colesterol
La ACP participa en la síntesis de los ácidos grasos
ÁCIDO ASCORBICO VITAMINA C
Antioxidante
Vitamina para los seres humanos y otros primates pero no para otras especies
Otros animales lo sintetizan como un intermediario en la vida del ácido urónico en el
metabolismo de la glucosa
Tiene funciones específicas en las hidroxilasas que contienen cobre y las hidroxilasas que
contienen hierro ligadas a α-cetoglutarato
La dopamina β-hidroxilasa es una enzima que contiene cobre involucrado en la síntesis
catecolaminas (norepinefrina y epinefrina)
Funciona como coenzima en la hidroxilación de prolina y lisina es síntesis de colágeno,
antioxidantes
Mejora la absorción del hierro
DEFICIENCIA DE VITAMINA C
Escorbuto: cambios en la piel, fragilidad en los capilares sanguíneos, deterioro de las
encías, perdida de dientes y fracturas óseas que se atribuye a la alteración de la síntesis
del colágeno
BENEFICIOS DE MAYORES INGESTAS DE VITAMINA C
Mejora la absorción del hierro
Se incluye en la dieta para tratar la anemia por mejorar la absorción de hierro
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
BIOQUÍMICA
CAPÍTULO 44
Son un grupo de nutrientes orgánicos necesarios en pequeñas cantidades para diversas funciones
bioquímica?
• Vitaminas
Son compuestos hidrofóbicos que sólo pueden absorberse con eficiencia cuando hay absorción
normal de grasa?
• Vitaminas liposolubles
Se define como un compuesto orgánico que se necesita en la dieta en pequeñas cantidades para el
mantenimiento de la integridad metabólica normal?
• Vitamina
• Vitamina D
Cuál es la vitamina que puede formarse a partir del aminoácido esencial triptófano?
• Niacina
• Ceguera nocturna
• Xeroftalmia
• Queratinización de la piel
• Raquitismo
• Osteomalacia
1
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
• Trastornos neurológicos
• Anemia hemolítica en el recién nacido
• Beriberi
• Síndrome de Wernicke-Korsakoff
• Pelagra
o Dermatitis fotosensible
o Psicosis depresiva
2
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
• Anemia megaloblástica
• Anemia perniciosa
• Deficiencia de vitamina A
• Xeroftalmia
Cuáles son los problemas que causa el exceso de vitamina A en el sistema nervioso central?
• Cefalalgia
• Náuseas
3
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
• Ataxia
• Hepatomegalia
Cuáles son los mecanismos por el cual el calcitriol (vitamina D) regula la concentración plasmática
de calcio?
• Calcinosis
• Tocoferol
• Tocotrienol
• Warfarina
Cuáles son los compuestos que tienen la misma actividad biológica de la vitamina K?
• Filoquinona
• Menaquinonas
• Menadiona
• Osteocalcina
• Proteína Gla de matriz ósea
• Difosfato de tiamina
• Beriberi
• Insuficiencia cardiaca
• Edema
• Queilosis
4
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
Cuáles son los dos compuestos que tienen la misma actividad biológica de la niacina?
• Ácido nicotínico
• Nicotinamida
• Enfermedad de Hartnup
• Fosfato de piridoxal
Es una pequeña glucoproteína secretada por las células parietales de la mucosa gástrica?
• Factor intrínseco
• Seres humanos
• Conejillos de Indias
• Murciélagos
• Aves paseriformes
Es una enzima que contiene cobre, que participa en la síntesis de las catecolaminas, a partir de
tirosina en la médula suprarrenal y el sistema nervioso central?
• Dopamina beta-hidroxilasa
5
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
BIOQUÍMICA
CAPÍTULO 9
• Vibrio cholerae
• Yersinia pestis
En qué parte de la célula se encuentran las enzimas que degradan las proteínas y polisacáridos?
• Lisosoma
Proceso en el que las proteínas se encuentran en un equilibrio dinámico debido a que se están
sintetizando y degradando de manera continua?
• Recambio de proteínas
Son típicamente sustratos o compuestos relacionados desde el punto de vista estructural que
inician la síntesis de enzimas?
• Inductores
• Triptófano pirrolasa
• Treonina deshidratasa
• Tirosina-alfa-cetoglutarato aminotransferasa
• Citocromo P450
Se refiere a la inhibición de una enzima en una vía biosintética por un producto terminal de esa
vía?
Son aquellas enzimas para las cuales la catálisis en el sitio activo puede modularse por la
presencia de efectores en un sitio alostérico?
• Enzimas alostéricas
Cuáles son las formas más frecuentes de modificación covalente en las células del mamífero?
• Proteólisis parcial
• Fosforilación
Cómo se llaman las proteínas que son sintetizadas y secretadas como proteínas precursoras
inactivas?
• Proproteínas
• Hormona insulina
• Enzimas digestivas
• Pepsina
Señor te suplico FE para creer que puedo vencer en esta dura batalla… En tu Santísimo Nombre todo es posible ☺ Te amo Jesús
• Tripsina
• Quimotripsina
• Fosforilación-desfosforilación
Capítulo 7
ENZIMAS
ENZIMA
Definición e importancia
Otras características
Importancia médica
HOLOENZIMA=APOENZIMA +COENZIMA
Grupos prostéticos
✓ AMPLIAN EL REPERTORIO DE CAPACIDADES CATALÍTICAS MAS ALLA DE
LAS PROPORCIONADAS POR LOS GRUPOS FUNCIONALES PRESENTES EN
LA CADENAS LATERALES.
✓ LOS GRUPOS PROSTETICOS SE INCORPORAN DE MANERA FIRME Y
ESTABLE EN LA ESTRUCTURA DE UNA PROTEINA MEDIANTE FUERZAS
COVALENTES O NO COVALENTES, ES DECIR TIENEN UNA UNION FUERTE
CON LA ENZIMA.
✓ EJEMPLO: FOSFATO DE PIRIDOXAL, MONONUCLEOTIDO DE FLAVINA,
DINUCLEOTIDO DE FLAVINA, PIROFOSFATO DE TIAMINA, ACIDO LIPOICO,
Y METALES DE TRANSICION COMO FE, Co, Cu, Mg, Mn Y Zn.
Cofactor
Coenzima
Cosustrato
✓ ES UN ACOENZIMA QUE SE ALTERA DURANTE LA REACCIÓN Y SE DISOCIA
DEL SITIO ACTIVO. SE REGENERA POR OTRA ENZIMA.
Coenzima Fuente vitamìnica Principales funciones metabòlicas Funciòn
mecanicista
Trifosfato de adenosina - Transferencia de grupos fosforilo o Cosustrato
(ATP) nucleotidilo
S-Adenosilmetionina - Transferencia de grupos metilo Cosustrato
Pirosfato de tiamina (TPP) Tiamina (B1) Transferencia de fragmentos de dos Grupo prostètico
carbonos que contengan un grupo
carbonilo
Fosfato de piridoxal (PLP) Piridoxina (B6) Transferencia de grupos desde Grupo prostètico
aminoácidos y hacia estos
Sistema de nomenclatura
Oxidorreductasas
Hidrolasas
✓ CATALIZAN LA ESCISION HIDROLITICA DE C-C. C-O, C-N Y OTROS ENLACES
COVALENTES POR ADICION DE AGUA.
✓ ESCISION ES DIVIDIR.
Liasas
Ligasas
• CATALIZAN LA UNION DE DOS MOLECULAS EN REACCIONES ACOPLADAS
A LA HIDROLISIS DEL ATP.
Nomenclatura
✓ SINTETASA: SE REQUIERE ATP.
Proximidad y
orientación desfavorable
Catálisis ácido-base
✓ LA CATÁLISIS ESPECÍFICA DE ÁCIDO O BASE: LOS ÚNICOS ÁCIDOS O BASES
QUE PARTICIPAN SON PROTONES O IONES DE HIDRÓXIDO. ES
INDEPENDIENTE DE LAS CONCENTRACIONES DE OTROS ÁCIDOS O BASES
PRESENTES EN LA SOLUCIÓN O EN EL SITIO ACTIVO.
✓ CATÁLISIS ÁCIDA GENERAL O A CATÁLISIS BÁSICA GENERAL SE REFIERE A
LAS REACCIONES CUYAS VELOCIDADES RESPONDEN A TODOS LOS ÁCIDOS
O BASES PRESENTES.
Catálisis por tensión
✓ PARA LAS REACCIONES LÍTICAS, QUE IMPLICA ROMPER UN ENLACE
COVALENTE, LAS ENZIMAS NORMALMENTE SE UNEN A SUS SUSTRATOS EN
UNA CONFORMACIÓN TENSADA QUE DEBILITA EL ENLACE A TRAVÉS DE
LA DISTORSIÓN FÍSICA Y LA POLARIZACIÓN ELECTRÓNICA. ESTA
CONFORMACIÓN TENSADA IMITA A LA DEL ESTADO INTERMEDIO DE
TRANSICIÓN.
Catálisis covalente
✓ IMPLICA LA FORMACIÓN DE UN ENLACE COVALENTE ENTRE LA ENZIMA Y
UNO O MÁS SUSTRATOS. LA ENZIMA MODIFICADA SE CONVIERTE ASÍ EN
UN REACTIVO.
✓ EL ESTADO QUÍMICAMENTE MODIFICADO DE LA ENZIMA ES
TRANSITORIO. LA FINALIZACIÓN DE LA REACCIÓN DEVUELVE LA ENZIMA
A SU ESTADO ORIGINAL NO MODIFICADO. POR TANTO, SU PAPEL SIGUE
SIENDO CATALÍTICO.
Importancia biomédica
Ejemplos
Ecuaciones equilibradas
Energía de activación
Sistema en equilibrio
Temperatura:
Velocidad inicial
La ecuación de Michaelis-Menten
Eficiencia catalítica
Constante de disociación
LA CONSTANTE DE DISOCIACION (KD) ES INVERSAMENTE
PROPORCIONAL A LA AFINIDAD DE UNA ENZIMA POR SU SUSTRATO.
Inhibidores
Inhibidores no competitivos
EN ESTE CASO LA UNION DEL INHIBIDOR NO AFECTA LA UNION DEL
SUSTRATO, SIMPLEMENTE BLOQUEA LA CATALISIS AL UNIRSE EN OTRO
LUGAR DE LA ENZIMA.
ESTE TIPO DE INHIBIDORES PROVOCA QUE LA ENZIMA JAMÁS LLEGUE A
SU VELOCIDAD NORMAL, INCLUSO EN PRESENCIA DE MUCHO SUSTRATO.
ESTO SE DEBE A QUE LAS MOLÉCULAS DE ENZIMA QUE ESTÁN UNIDAS AL
INHIBIDOR NO COMPETITIVO ESTÁN "ENVENENADAS" Y NO PUEDEN
HACER SU FUNCIÓN.
Enzimas “venenosas”
SON AQUELLAS ENZIMAS DONDE LOS INHIBIDORES ACTUARON
IRREVERSIBLEMENTE MODIFICANDO A LA MISMA DESDE EL PUNTO DE
VISTA QUIMICO.
Desarrollo de fármacos
ACTIVIDADES ENZIMATICAS
Homeostasis
Importancia biomédica
Compartimentación
POR EJEMPLO:
SIN EMBARGO, CASI TODAS LAS VIAS METABOLICAS POSEEN PASOS PARA LOS
CUALES ΔG ES SIGNIFICATIVA.
POR EJEMPLO:
Cantidad de enzima
La síntesis enzimática
EJEMPLO:
Degradación de enzimas
ESTA VIA PUEDE DEGRADAR LAS PROTEINAS QUE HAN TENIDO PERDIDA O DAÑO
A UN GRUPO PROSTETICO, OXIDACION DE RESIDUOS DE CISTEINA O HISTIDINA,
DESPLIEGUE PARCIAL O DESAMIDACION DE RESIDUOS DE ASPARAGINA O
GLUTAMINA.
Regulación catalítica
Regulación alostérica
La aspartato transcarbamilasa
Es un modelo de enzima alostérica
ES EL CATALIZADOR PARA LA PRIMERA REACCIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE
PIRIMIDINA (PARTICIPA EN FUNCIONES BIOLÓGICAS ESENCIALES, YA QUE
FORMAN PARTE DE LA ESTRUCTURA DEL ADN).
Sitios alostéricos
LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS SON AQUELLAS PARA LAS CUALES EL SITIO ACTIVO
PUEDE MODIFICARSE EN UN SITIO ALOSTÉRICO, ES DECIR QUE PUEDEN
INDUCIRSE A CAMBIOS CONFORMACIONALES.
Efectos alostéricos K y V
Retroalimentación
Hormonas
LOS CAMBIOS EN LA CROMATINA PUEDEN HACER QUE LOS GENES SEAN MÁS
ACCESIBLES A LA TRANSCRIPCIÓN, LO QUE MEJORA LA EXPRESIÓN GÉNETICA.
El código de histonas
REPRESENTA UN EJEMPLO CLÁSICO DE EPIGENÉTICA, Y SE REFERIE A LA
TRANSMISIÓN HEREDITARIA DE INFORMACIÓN POR UN MEDIO DISTINTO A LOS
NUCLEÓTIDOS QUE COMPONEN EL GENOMA.
EN ESTE CASO, LA EXPRESIÓN GÉNETICA DENTRO DE UNA CÉLULA RECIÉN
FORMADA SE DETERMINARÁ, POR EL CONJUNTO DE MODIFICACIONES DE
HISTONAS HEREDADAS DE LA CÉLULA "PARENTAL".
Proenzimas
Fosforilación Covalente
Acetilación de proteínas