Lectureantibiogramme Desc2017 Jcaillon
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l’antibiogramme
2
Méthode d’étude de la sensibilité
des bactéries
Antibiogramme: milieu gélosé
(diffusion) avec mesure des diamètres
3
Lecture interprétative
Obligatoire
Phénotype
observé
Biologiste Rendu des
Système expert résultats
Connaissances
des mécanismes
de résistance
Cohérence entre
- l’identification de la souche
- l’antibiogramme par Famille d’antibiotiques
Détection de phénotypes de résistance impossibles
4
Recherche de résistance insuffisamment exprimées
Résistance naturelle
Amox
Ticar
Klebsielle Achromobacter
• Intrinsèque, innée
• Affecte toutes les souches d’une même espèce
• Chromosomique et constante
« Phénotype sauvage » 5
Résistance acquise
P. aeruginosa
7
Résistances associées
8
Staphylocoques
9
Staphylocoques
Résistances naturelles
• Aztréonam PLP non reconnue
• Fosfomycine et S.saprophyticus
10
Bêta-lactamines : Que pensez vous de
cet antibiogramme de S.aureus?
• Pénicilline G R
• Oxacilline S
• Amoxcilline S
• Amox.+ac. clavulanique S
• Oracilline S
• Céfazoline S
Antibiogramme correct ?
Quel Phénotype évoquez-vous? 11
Réponse : NON
• Pénicilline G R
• Oxacilline R
• Amox.+ac. clavulanique R
• Imipénème S
• Vancomycine S
• Linézolide S
Antibiogramme correct ?
Quel Phénotype évoquez-vous? 13
P OXA
Réponse : NON
14
Mécanismes de résistance et
Phénotypes de S.aureus/bêtalactamines
Mécanisme Péniciline Amox/clavu Oxacilline Hopital
G,V, A, U Pip/Tazo
aucun S S S 15%*
Pénicillinase R S S 85%*
PLP2a R R R 14%*
15
* Données réseau REUSSIR 2015
Aminosides / S.aureus
Que pensez vous de cet antibiogramme ?
• Pénicilline G R
• Oxacilline R
• Kanamycine S
• Tobramycine R
• Gentamicine S
• Ofloxacine R
• Vancomycine S
16
Réponses aux aminosides
• Phénotype impossible : Kana S Tobra R Genta S :
Sauvage S S S
K APH 3’ R S S
KT ANT 4’ R R S
KTG APH 2 ’’ R R R
- AAC 6’
Et l’amikacine ?
17
IN VITRO
S.aureus Kana Amika Tobra Genta
26 mm S 26 mm S 26 mm S 27 mm S
Sensible
1 mg/L 1 mg/L 0.5 mg/L 0.5 mg/L
6 mm R 24 mm S 25 mm S 26 mm S
K
16 mg/L 2 mg/L 0.25 mg/L 0.25 mg/L
6 mm R 23 mm S 6 mm R 22 mm S
KT
64 mg/L 8 mg/L 16 mg/L 0.5 mg/L
6 mm R 21 mm S 6 mm R 6 mm R
KTG
>64 mg/L 8 mg/L 64 mg/L 64 mg/L
18
IN VITRO
Activité bactériostatique conservée de l’amikacine
malgré la présence d’enzymes
Mais Perte de l’activité bactéricide
19
Quinolones/S.aureus
Que pensez vous de cet antibiogramme?
• Pénicilline G R
• Oxacilline R
• Kanamycine R
• Tobramycine R
• Gentamicine S
• Ofloxacine R
• Levofloxacine S
• Vancomycine S 20
Quinolones : Phénotype impossible
Quinolones
21
E test
1 mg/l 1 mg/l
22
S. aureus : Sensibilité aux glycopeptides (1)
Macrolides/S.aureus
Qu’en pensez-vous?
• Pénicilline G R
• Oxacilline R
• Ofloxacine R
• Erythromycine R
• Lincomycine S
• Pristinamycine R
Phénotype impossible 23
S.aureus et macrolides
Principaux phénotypes
Inactivation L, LSA
S I/R I
24
Streptocoques et Entérocoques
25
Patient avec une bactériémie et une
pneumonie à Streptococcus pneumoniae
Antibiogramme
•Pénicilline G CMI = 1 mg/L
•Amoxicilline CMI = 1 mg/L
•Céfotaxime CMI = 0,5 mg/L
•Levofloxacine S
•Erythromycine R
•Pristinamycine R
29
Enterococcus faecalis
30
Entérocoque
31
Isolement d’un Enterococcus faecium
dans une hémoculture
• Amoxicilline R
• Cefotaxime R
• Vancomycine S
• Erythromycine R
• Gentamicine absence de résistance de haut niveau
• Linézolide S
33
Parmi les propositions suivantes concernant
S.aureus, entourez la ou les réponses
exactes?
A) résistante à l’amoxicilline et à la ticarcilline
mais sensible à la pipéracilline
VRAI B) sensible aux associations bêtalactamines plus
inhibiteurs
C) sensible à l’oracilline
VRAI D) sensible aux céphalosporines de première
génération
VRAI E) résistante aux pénicillines par sécrétion de
bêtalactamase 34
Parmi les propositions suivantes
concernant S.aureus entourez la ou les
réponses exactes?
A) Toutes les beta-lactamines (sauf C5G) sont inactives
VRAI sur les souches de S.aureus résistantes à l’oxacilline
B) Si S.aureus résistante à la tobramycine et à la
gentamicine alors l’amikacine pourrait être associée à la
vancomycine
C) Si S.aureus résistant à l’ofloxacine alors il est
VRAI résistant à la levofloxacine
D) Si S.aureus résistant à l’érythromycine, alors il ne
faut jamais utiliser les autres macrolides et apparentés
E) S.aureus est résistant à l’oxacilline par sécrétion de
bêtalactamase 35
Parmi les propositions suivantes
concernant Streptococcus pneumoniae
entourez la ou les réponses exactes?
A) Si Streptococcus pneumoniae résistant à la pénicilline
G alors il ne faut jamais prescrire l’amoxicilline
B) Si Streptococcus pneumoniae résistant à la pénicilline
VRAI G, les C3G sont très souvent actives sur le pneumocoque
C) Si Streptococcus pneumoniae résistant à
l’érythromycine alors la souche est résistante à la
VRAI
clindamycine
VRAI D) La norfloxacine est un antibiotique marqueur de la
sensibilité aux fluoroquinolones
E) la détermination des CMI vis à vis de la pénicilline G et
des C3G est obligatoire 36
Bacille à Gram Négatif
37
Isolement d’un E.coli dans un ECBU
/contexte de pyélonéphrite
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique S
• Ticarcilline R
• Pipéracilline S
• Pipéracilline+tazobactam S
• Céfoxitine S
• Céfotaxime S
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
Que pensez vous de cet antibiogramme? Correct?
Quel est le phénotype à votre avis? 38
Réponse : NON
• Amoxicilline R Pénicillinase
• Amoxicilline+ac clavulanique S Amox
• Ticarcilline R Ticar
• Pipéracilline
Pipéracilline S I Pipera
• Pipéracilline+tazobactam S hydrolysées
• Céfoxitine S
• Céfotaxime S
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
39
E.coli /Hémoculture et urines
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique S
• Ticarcilline R
• Pipéracilline R Quel Phénotype
• Pipéracilline+tazobactam S observez-vous ?
• Céfoxitine S
• Céfotaxime R
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
• Gentamicine R
• Amkacine S
• Fosfomycine S 40
E.coli /Hémoculture et urines
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique S
• Ticarcilline R
• Pipéracilline R BLSE
• Pipéracilline+tazobactam S
• Céfoxitine S
• Céfotaxime R
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
• Gentamicine R
• Amkacine S 41
• Fosfomycine S
Phénotype BSLE
42
Pénicillinase ?
AMX TIC PIP Mec
oui
CF TCC TZP MA
BLSE
MOX IP
AZT
FEP
43
E.coli /Hémoculture et urines
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline R
• Pipéracilline R Quel Phénotype
• Pipéracilline+tazobactam R observez-vous ?
• Céfoxitine R Pénicillinase?
• Céfotaxime R BLSE?
• Ceftazidime R
• Ertapénème S
• Gentamicine R
• Amkacine S
• Fosfomycine S 44
E.coli /Hémoculture et urines
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline R
• Pipéracilline R Céphalosporinase
• Pipéracilline+tazobactam R Haut niveau
• Céfoxitine R
• Céfotaxime R
• Ceftazidime R
• Ertapénème S
• Gentamicine R
• Amkacine S 45
• Fosfomycine S
K.pneumoniae /urines
Que pensez vous de cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique S
• Ticarcilline S Vrai ou Faux ?
• Pipéracilline S
• Pipéracilline+tazobactam S
• Céfoxitine S
• Céfotaxime S
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
46
Réponse : Faux
47
E.cloacae /Hémoculture
Que pensez vous de cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline S
Correct?
• Pipéracilline S
• Pipéracilline+tazobactam S
• Céfoxitine R
• Céfotaxime S
• Ceftazidime S
• Ertapénème S
Amoxicilline R
FOS AMOX TICAR CEPHALO I
Amox+AC =Augmentin
R
Ticarcilline S MOX CIIIG MA CEFOX II
C IG R
Cefoxitine (CIIG) R IPM
TCC PIP
AMOX
+AC
C 3G S (pas en monothérapie)
C4G S ++++
TZP CIIIG ATM CIP
Phénotype sauvage 49
E.cloacae /ECBU
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline R Vrai ou Faux ?
• Pipéracilline R
• Pipéracilline+tazobactam I
• Céfoxitine R
• Céfotaxime R
• Ceftazidime R
• Ertapénème S
50
E.cloacae /ECBU
Et cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline R
• Pipéracilline+tazobactam R
Céphalosporinase
• Céfoxitine R
Haut niveau
• Céfotaxime R
• Ceftazidime R
• Ertapénème S Céphalosporinase
• Gentamicine R Haut niveau
• Amkacine S +
• Ac nalidixique R BLSE
• Ciprofloxacine S 51
Enterobactéries et Quinolones
52
K.pneumoniae /urines
Que pensez vous de cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R
• Ticarcilline R
• Pipéracilline R
• Pipéracilline+tazobactam R
• Céfoxitine S
• Céfotaxime R
• Ceftazidime R
• Ertapénème I
• Imipénème S
53
K.pneumoniae /urines
Que pensez vous de cet antibiogramme?
• Amoxicilline R
• Amoxicilline+ac clavulanique R BLSE OUI
• Ticarcilline R mais
• Pipéracilline R
• Pipéracilline+tazobactam R
• Céfoxitine S
• Céfotaxime R Carbapénémase
• Ceftazidime R Type OXA-48
• Ertapénème I
• Imipénème S
54
Carbapénémase : EPC
55
Parmi les propositions suivantes concernant
l’antibiogramme d’Escherichia coli entourez la ou
les réponses exactes? ECBU (Pyélonéphrite)
• S céfoxitine R céfotaxime S imipénème
Quel est le mécanisme de résistance le plus probable ?
A1) Pénicillinase haut niveau
VRAI A2) BLSE
A3) Céphalosporinase de Haut niveau
57
CAZ AM
X
AMC
P. aeruginosa
Résistance naturelle
ATM TCC TIC - Amoxicilline (AMX)
- Augmentin (AMC)
- C IG, CIIG
- Céfotaxime (CTX)
IPM CTX PIP - Ceftriaxone
- Bactrim (SXT)
SXT FOX
Souche sauvage 58
Isolement dans un lavage alvéolaire
d’un Pseudomonas aeruginosa (PVAM)
Voici l’antibiogramme :
•Ticarcilline R
•Ticar+ac clavulanique R Quel phénotype
•Pipéracilline S évoquez-vous?
•Pipe+tazobactam S
•Ceftazidime S Pénicillinase?
•Aztréonam I Céphalosporinase?
•Imipénème S Efflux
•Tobramycine S
•Ciprofloxacine I
59
RÉPONSE : EFFLUX
60
Antibiogramme d’un Pseudomonas
aeruginosa isolé dans un prélèvement
respiratoire
•Ticarcilline R
•Ticar+ac clavulanique R
•Pipéracilline R Quel phénotype
•Pipe+tazobactam R évoquez-vous?
•Ceftazidime R
•Aztréonam I
•Imipénème S
•Tobramycine S
•Ciprofloxacine S
61
RÉPONSE
• Ceftazidime R
• Hyperproduction de céphalosporinase
(10%en France)
• Céfépime ?
62
Pseudomonas aeruginosa
principaux phénotypes
Ticarcilline Aztréonam Ceftazidime Imipenem
Sauvage S S S S
Céphalospo R I R S
rinase HN
Efflux I/R I/R S S
Porine D2 S S S R
(mutation)
63
TIC TCC PIP TZP
non
TM NET GM AN Pase ??
Case ??
non
64
P. aeruginosa : résistance par efflux actif
TIC TCC PIP TZP Pase ?? NON
non
Efflux ?? NON
TM NET GM AN
Case ?? OUI
CAZ AT
CTX FEP CMI AT
(aztreonam) <
CMI CAZ
(ceftazidime)
CIP PEF CS
IPM
65
P. aeruginosa hyperproducteur de céphalosporinase
Take home
66
Résistances naturelles : " liaisons fatales "
Gram positif et Aztréonam Ou.. Gram positif et Colistine
Entérocoque et Listeria et Céphalosporines.
Entérocoque et Sulfamides.
Listeria et Fluoroquinolones
Streptocoques et Aminosides seuls
Céfamycines céfoxitine
Carbapénème 68
BONUS
69
Entérobactéries
Groupe Espèces Enzyme chromosomique
70
Entérobactéries: Résistances naturelles
Gpe O Gpe 1 Gpe 2 Gpe 3 Gpe 4 Gpe 5
P.mirabilis E.coli Klebsielle Enterobacter
Amox S S R R R R
Amox+a R S
S S S R
c clav.
Ticar S S R S R S
Pipéra S S I S R S
C1G S S/I S R R R
71
Groupe 1: E.coli
Résistances acquises
AMX AMC TIC PIP TZP IMP C1G FOX C3G C4G
Sauvage S S S S S S S S S S
Pase
R S/I/R R I/R S S S/I/R S S S
acquise
Pase TRI R R R R R S S S S S
BLSE R I/R R R I/R S R S I/R I/R
Case bas
R R S S S S R S S S
niveau
Case haut
R R R R R S R R R S
niveau
Phénotype
AT FEP MOX
IPM
sauvage
75
AMX TIC CF fox
E coli
producteur de
pénicillinase
CTX AMC CAZ IPM
Amoxicilline (AMX) R
Augmentin (AMC) I
GM CS
Ticarcilline (TIC) R
AN FOS
Céphalosporine (CF) I
Cefoxitine (fox) S
76
AMX AMC TCC
TIC
Escherichia coli
Amoxicilline (Amx)R
Augmentin (Amc) R
CTX CAZ TZP
Ticarcilline (TIC) R
CF
Claventin (TCC) R
C1G (CF) S
TRI
Pénicillinase
résistante aux
inhibiteurs
77
E.coli
image en bouchon de champagne
AMOX TICAR CEPHALO I
FOS
Amoxicilline R
Ticarcilline R
IPM
CIII MA CEFOX II
CIG R
Cefoxitine (II) S
AMOX+ PI
CIIIG R AC P
Amox+AC
=Augmentin I//R
CIII ATM
BLSE 78
E. coli
Céphalosporinase de haut niveau
AMOX TICAR CEPHALO
I
Amoxicilline R
Ticarcilline R
CIII CEFOX II
CIG R
Cefoxitine (II) R
IPM
AMOX+
Céphalosporine III R AC
Amox+AC
=Augmentin R CIII ATM CIP
Imipenem S
79
Groupe II: Klebsiella pneumoniae
Amox+AC
=Augmentin
IPM AMOX+ TCC PIP
AC
Phénotype sauvage 80
AMX TIC PIP Mec
Enterobacter
CT TCC MA
TZP
CTX CASE HN
AMC CAZ FOX
81
ENTEROCOQUE
Vancomycine
* SENSIBLES
* < 5 % E.faecium et E.faecalis résistants
Phénotype vanA==> R Vanco et Teico (inductible)
Phénotype vanB ==>R Vanco, S Teico (inductible)
Phénotype vanD ==>RVanco, S Teico(constitutive)
82