Le document contient plusieurs exercices sur les propriétés des macromolécules et leur comportement sous centrifugation ou électrophorèse. Les exercices portent sur le calcul de mobilité électrocinétique, vitesse de sédimentation, constante de sédimentation, masse molaire et séparation de protéines par électrophorèse.
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TD5 Biophysique
TD 5 BIOPHYSIQUE Les Macromolécules (VS, Centrifugation, Electrophorese)
Exercice N°1 : Soit une solution macromoléculaire constituée de particules sphériques de rayon 3 nm et de pHi =6.3 placée dans un milieu tampon de pH=5.6 et de viscosité η=2.10-4 poiseuille. 1- Si la charge prise par une macromolécule est de 85.10- 20 C, calculer sa mobilité électrocinétique. 2- Sachant que la macromolécule se déplace de 6mm en 80 secondes dans une cuve à électrolyse, Quelle tension faut-il appliquer entre les électrodes distantes de 10 cm ? 3- Si la permitivité du milieu ε = 5.10-10 s.A2/kg.m3, calculer la valeur du potentiel électrocinétique ξ ?
Exercice N°2: Une biomacromolécule de masse volumique ρ = 1300 Kg/m3 mesurée à 37 °C dans un solvant de viscosité η = 0.01 poise et de masse volumique ρo =1g/cm3, à un coefficient de diffusion à 4,5.10-7cm2/s. 1- Calculer le rayon de cette biomacromolécule supposée sphérique. 2- Calculer la vitesse de sédimentation de cette particule sous l'influence de la pesanteur. 3- Sous l'effet d'une ultracentrifugation de 50000 trs/mn avec un rayon de giration de 10 cm une mesure de sa constante de sédimentation donne S=12 Sv. a- Calculer sa vitesse de sédimentation à cette distance et sa masse molaire moléculaire. b- Calculer la distance parcourue par cette biomacromolécule en une heure. On donne : N=6,02.1023, R=8.31 J/°K.mol. g=10 m/s2 Exercice N°3: On effectue l’ultracentrifugation à 20000 tr/mn d’une macromoléculaire sphérique en solution, sa position x1= 59.59 mm à un instant t et x2 = 62.42 mm , 48 minutes plus tard. 1- Calculer sa constante de Svedberg et sa vitesse limite. 2- Si sa masse molaire M= 50000 g, et si un agrégat sphérique de masse M’ et de même masse volumique présente une constante de 50 Sv dans cette solution, calculer M’. Exercice N°4: Dans une ultracentrifugeuse tournant à 150000 tours/mn, on observe à un certain moment deux frontières à 10 cm et 13 cm de l’axe ; au bout de 28 mn 20 s, ces frontières sont passées à 12 cm et 19.5 cm de l’axe. Calculer en unité svedberg les constantes de sédimentation des protéines présentes dans cette solution à 20°C .
Chargés de TD : M.DJOUIMA, H. SMAIL 2018-2019
TD5 Biophysique
Exercice N°5:
On compose à des fins expérimentales, une goutte de solution comportant deux fractions protéiques A et B dont les mobilités électrophorétiques sont respectivement μA= 5,9 10-9ms-1/v.m-1 et μB=2,1 10-9ms-1/v.m-1. Une fois l’électrophorèse sur bande de papier filtre imprégné d’une solution tampon est effectuée sous 1000 V/m, on observe deux taches distinctes distantes de 3.8 mm. 1- Au bout de combien de temps les deux fractions seront séparées ? En déduire les distances parcourues par chacune d’elles. 2- En admettant que le pH de la solution tampon égal au pHi de la fraction protéique B. Quelle sera la mobilité de la fraction protéique A pour laquelle les deux fractions protéiques se trouvent séparées aux mêmes distances et temps que dans le cas précédent ?
