PROGRAMME MASTER Ecologie Fondamentale Et Appliquée

Université BADJI Mokhtar – Annaba
Faculté des Sciences

Département de Biologie
Master Ecologie fondamentale et appliquée
Année Universitaire 2017/2018

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Fondamentale Code : UEF 1.1
Intitulé de la matière : Stratégie d’échantillonnage en écologie et traitement des
données
Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme
compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).
-A l’issue des enseignements l’étudiant devrait avoir acquis les capacités de définir un
sujet de manière précise de fixer les limites d’une problématique, de formuler de
manière raisonnée des hypothèses et de déterminer les moyens méthodologiques de
répondre aux questions inhérentes à ces hypothèses.
Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).
-L’étudiant devra avoir suivi un minimum de cours de statistiques mais également sans
que cela soit indispensable, des cours de méthodologie d’échantillonnage.
Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)
- Notions de modèle et prémodèle

- le modèle écologique
- les descripteurs écologiques
- le choix des variables
- principes fondamentaux du plan d’échantillonnage
L’échantillonnage aléatoire simple (E.A.S) : principe, conditions d’application du plan
- situations propices à l’application du plan
- intérêts du plan
- inconvénients du plan
L’échantillonnage systématique (E.S) : principe, protocole de sélection des unités
d’échantillonnage
- conditions d’application du plan, situations propices à l’application du plan
- intérêts du plan, inconvénients du plan
L’échantillonnage stratifié (E.St) : principe, construction des strates
- effort d’échantillonnage dans chaque strate, choix d’un plan d’échantillonnage à
l’intérieur des strates.
- situations propice à l’application du plan
Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc… (La pondération est laissée à
l’appréciation de l’équipe de formation)
- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).
- « Stratégies d’échantillonnage en Ecologie » Frontier . MASSON ed.
Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Fondamentale code : UEF 1.1
Intitulé de la matière : Ecologie des sols
Crédits : 6
Coefficients : 3
Cet enseignement est destiné à procurer à l’étudiant les connaissances relatives à la

faune et la microflore édaphique qui participent à la dégradation et au recyclage de la
matière. Il insiste sur les techniques d’étude des biocénoses édaphiques et les méthodes
de diagnose de l’édatope.

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en Ecopédologie et en zoologie générale

- Interactions écologiques au sein de la biocénose du sol

- Associations plantes microorganismes,
- Rôle de la rhizosphère
- Cycles des nutriments dans le sol-
- Cycle du carbone
- Cycle de l’azote
- Cycle du soufre
- Répartition écologique des sols
- Sols forestiers, Sols hydromorphes, Sols salés, Sols fersialitiques

- « Ecology » Ricklefs . MASSON ed.
- « Ecologie fondamentale » Ramade F.
- « Biogéographie » Blondel J.

Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Fondamentale Code : UEF
1.1
Intitulé de la matière : Biodiversité et gestion durable des écosystèmes
Crédits : 6
Coefficients : 3
- Cet enseignement est destiné à procurer à l’étudiant les fondements de la

diversité biologique et son rôle dans les habitats naturels. Stabilité, complexité
des écosystèmes

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en biosystématique et en écologie

générale.

- Signification écologique de la diversité

- Circulation de l’information
- Caractère spatio-temporel de la diversité
- Perception de la diversité par les espèces
- La diversité d’un point de vue descriptif
- La diversité d’un point phylogénétique
- Notion d’espèce clé
- Les groupes fonctionnels et les espèces redondantes
- Diversité et fonctionnement des écosystèmes
- Notion d’espèce clé
- Les groupes fonctionnels et les espèces redondantes
- Diversité et fonctionnement des écosystèmes

« Ecology » Ricklefs . MASSON ed.
« Ecologie fondamentale » Ramade

Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Méthodologique code : UEM
1.1
Intitulé de la matière : Pollution et changements globaux
Crédits : 6
Coefficients : 3
- Identification des risques de dégradation des écosystèmes aquatiques sous
pression anthropiques, contribuer à son impact et proposer des solutions
adéquates de restauration des écosystèmes dégradés

- Les étudiants doivent avoir des connaissances dans le domaine de l’écologie
générale.

- Définitions
- Types de pollution
- Pollution atmosphérique,
- Pollution de l’eau
- Pollution du sol
- Classification des types pollutions
- Conséquences des pollutions
- Dégradation de l’environnement
- Les changements globaux
- Changements à l’échelle globale
- Changements à l’échelle locale
- Impact des changements climatiques (direct et indirect)

- Eléments d’écologie : Ecologie appliquée, F. RAMADE. Ed : McGraw-Hill
- Barbault et al., 2004. Biodiversité et changements globaux. Enjeux de société et

défis pour la recherche ; Ed : Broché

Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Méthodologique code : UEM 1.1
Intitulé de la matière : Biostatistiques
Crédits : 3
Coefficients : 2
Les statistiques jouent un rôle essentiel dans le domaine des sciences du vivant. Le
programme proposé dans ce module permettra aux étudiants et chercheurs de maîtriser
une grande partie des méthodes statistiques nécessaire à l’analyse et à l’interprétation
de leurs résultats expérimentaux et d’échantillonnage.

Les lois de la probabilité et la statistique descriptive à une et à deux critères.

Statistique descriptive (rappels)

Les méthodes statistiques relatives à la corrélation
Les méthodes statistiques relatives à la régression linéaire simple et multiple.
Les méthodes statistiques relatives aux moyennes
L’analyse de variance à un et deux critères de classification.
Les méthodes statistiques non paramétriques
Calculs statistiques sur ordinateurs (SAS, MINITAB, STATISTICA, ADE4)

- Dagnelie P. (2000). Statistique théorique et appliquée. Tome 1 et 2. Edition Université
de Boeck et Larcier.
- Baillargeon G. (2002). Méthodes statistiques. Edition SMG les trois rivières.
- Harvey J., Motulsky A. (2002). Biostatistiques : une approche intuitive. Ed de Boeck et
Larcier.
- Frontier S., Davout D., Gentilhomme U. et Lagadeuc Y. (2001). Statistique pour les
sciences de la vie et de l’environnement. Ed Dunod.

Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Découverte code : UED 1.1
Intitulé de la matière : Méthodologie de recherche
Crédits : 1
Coefficients : 1
Le but de cette matière est de fournir aux étudiants un cadre méthodologique général
des grandes étapes essentielles pour la réalisation d’un mémoire.

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en Ecologie générale et

particulièrement en stratégies d’échantillonnage

- Choix du thème de recherche

- Problématique de recherche
- Les hypothèses
- Les variables
- Choix de la méthode de recherche
- Choix des mesures
- Résultats
- Tests de significations
- Généralisation des résultats
- Méthodologie de la Recherche Bibliographique
- La Publication Scientifique
- L’Exposé Oral

- BEAUD Michel (1988), L'art de la thèse - Comment préparer et rédiger une thèse de
doctorat, un mémoire de DEA ou de maîtrise ou tout autre travail universitaire, La
Découverte (première édition 1985)
- CEFAÏ Daniel (2003), L’enquête de terrain, Paris, La Découverte (Recherches)
- CHAZEL F et al, (1970), L’analyse des processus sociaux, édition mouton
- LAGARDE J (1983), Initiation à l’analyse des données, Paris, Dunod.

Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Transversale code : UET 1.1
Intitulé de la matière : Techniques de communication
Crédits : 2
Coefficients : 2
L’objectif de cette matière est d’apprendre à l’étudiant, les nouvelles techniques de

communication et d’information. L’utilisation des TIC est devenue indispensable dans le
monde d’aujourd’hui.

L’étudiant devra avoir suivi des cours en informatique puisqu’il sera amené à l’utiliser
couramment dans cette matière.

Introduction
Définition des TIC
Utilisation des TIC
Exploiter le potentiel des TIC dans l’enseignement
Les avantages des TIC
Impact des TIC dans l’enseignement

- Marc Prensky, « Digital Natives, Digital Immigrants », On the Horizon, MCB University
Press, Vol. 9 No. 5, Octobre 2001
- Karsenti, T., Goyer, S., Villeneuve, S. & Raby, C. (2005), « L'impact des technologies de
l'information et de la communication (TIC) sur la réussite éducative.
https://papyrus.bib.umontreal.ca/xmlui/bitstream/handle/1866/8116/Cote_Stephane
_2008_memoire.pdf?sequence=1

Semestre : 2
Intitulé de l’UE : Fondamentale Code : UEF 2.1
Intitulé de la matière : Structure et Fonctionnement des communautés animales
Crédits : 10
Coefficients : 5
A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait maîtriser les méthodes de diagnose des
peuplements naturels d’animaux. D’en décrire la composition et la structure. De
modéliser la dynamique des peuplements en fonction de la dynamique des habitats et
ce, dans une perspective de gestion du milieu naturel et de contrôle

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale

- Paramètres de description des peuplements

- Indices de diversité indépendants d’une hypothèse de distribution
- Diagrammes rang-fréquences
- Evolution des peuplements
- Peuplements pionniers ou juvénile
- Maturation des peuplements
- Evolution régressive sous l’effet d’un stress
- Dynamique des peuplements
- Théorie de la niche écologique
- Peuplements guildes et populations
- Processus de colonisation et d’extinction des espèces
- Maturité et stabilité des peuplements

« Ecologie fondamentale » Ramade F.
« Ecologie fondamentale » Dajoz.

Semestre : 2
Intitulé de la matière : Cartographie écologique et photogrammétrie
Crédits : 8
Coefficients : 4
- A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait maîtriser les techniques de

cartographie générale et de cartographie écologique ; les méthodes de lecture
et de repérage cartographique.

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale et

cartographie

- Notions générales de cartographie
- Cartographie thématique
- Sources et types d’information
- Spécificité des cartes écologiques
- Techniques cartographiques
- Photos aériennes et écologiques
- Caractéristiques de la photo aérienne
- Méthodes d’interprétation
- Photographie aérienne et écologique
- Télédétection et application
- Appareils de mesure
- Traitement des données
- Application à l’aménagement du territoire et l’exploitation des ressources
biologiques

- « Ecologie fondamentale » Dajoz.
- « La cartographie » Que Sais-je.
Semestre : 2
Intitulé de l’UE : Méthodologique Code : UEM
2.1
Intitulé de la matière : Productivité, transfert de matière et d’énergie
Crédits : 4
Coefficients : 2
Cet enseignement est destiné à procurer à l’étudiant les connaissances de base sur les
fondements énergétiques du fonctionnement des écosystèmes. Origine, flux et transferts
d’énergie seront examinés et explicités durant ce cours.

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale.

- Flux d’énergie au sein des écosystèmes

- Radiations solaires de grandes longueurs d’onde
- Radiations solaires de courtes longueurs d’onde
- Détermination de la production primaire par la méthode des gaz respiratoires
- Détermination de la production primaire par la méthode des récoltes
- Détermination de la production primaire par la méthode des dimensions
- Détermination de la production secondaire par la méthode des cohortes
- Détermination de la production secondaire par la méthode graphique
- Détermination de la production secondaire par bilan nutritionnel
- Réseaux trophiques

« Ecologie fondamentale » Ramade

Semestre : 2
Intitulé de l’UE : Méthodologique code : UEM
2.1
Intitulé de la matière : Biogéographie générale et de l’Algérie
Crédits : 5
Coefficients : 3
Cet enseignement devrait permettre à l’étudiant de disposer d’un large éventail de

connaissances sur les différents concepts de la biogéographie structurale,
historique…ainsi qu’une connaissance approfondie sur l’identité et les limites des
différentes régions biogéographiques de l’Algérie.

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale.

- Biogéographie historique
- Systématique et spéciation
- Histoire évolutive des faunes
- Structure populationnelle des espèces
- Origine des faunes de vertébrés dans le bassin méditerranéen
- Biogéographique descriptive
- Différents types de processus biogéographiques
- Grandes subdivisions biogéographiques du globe
- Reconstitution des histoires phylogénétiques
- Paradigmes de dispersion et de vicariance
- Biogéographie régionale
- Régions biogéographiques de l’Algérie
- Zones biogéographiques du Tell et caractères floro-faunistiques
- Zones biogéographiques du sud et caractères floro-faunistiques

- Eléments d’écologie : Ecologie appliquée, F. RAMADE. Ed : »McGraw-Hill
- Ecologie fondamentale » Dajoz.
- Biogéographie , Blondel J.

Semestre : 2
Intitulé de l’UE : Découverte code : UED 2.1
Intitulé de la matière : Anglais scientifique
Crédits : 1
Coefficients : 1
- L’étudiant est censé apprendre à lire et à rédiger des articles et des documents en
anglais. Il devra être capable d’exposer ses données ainsi que ses travaux en
cette langue.

- Connaissances préalable de l’anglais

- Aperçu général
- Lexique scientifique
- Objectifs de la langue anglaise
- La lecture d'un article scientifique
- La rédaction d'un article scientifique
- Parler anglais
- Présentation orale des données
- Rechercher revue de la littérature
- Mise en place et préparation d’un sujet de recherche
-
-Documents scientifique (ouvrage, article, revue…)

Semestre : 2
Intitulé de l’UE : Transversale code : UET 2.1
Intitulé de la matière : Législation environnementale
Crédits : 2
Coefficients : 2
- Permettre à l’étudiant de maîtriser la législation algérienne et internationale

concernant l’environnement Connaissances préalables recommandées.

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en Ecologie générale.

présentiel et du travail personnel
- Eléments de définition
- Différentes sous-branches
- Chronologie générale du droit international de l'environnement
- Le premier sommet de la Terre
- Sommet de la terre à Rio
- Sommet de la terre Rio+20 (Rio, 20 ans après)
- Directive sur les émissions industrielles
- Principaux textes législatifs et réglementaires relatifs à la protection de
l’environnement
- Les normes du droit de l’environnement -Environnement, pollution, préservation et
protection de la nature (faune et flore)

- Beulier J-P. et Kiss A. (2000). Droit international de l’environnement. Edition
Pedone.
- Beaumais O. et Chiroleu-Assouline M. (2001). Economie de l’environnement.
Edition Bréal.
- Lamarque J. (1973). Droit de la protection de la nature et de l’environnement.
Edition LGDJ.
- Législation algérienne en droit de l’environnement

Semestre : 3
Intitulé de la matière : Interactions et réponses adaptatives
Crédits : 8
Coefficients : 4
A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait bénéficier de connaissances

approfondies sur les interactions entre organismes d’espèce différentes ou de même
espèce.

- Définition de la notion d’interaction

- L’effet de groupe
- Le mutualisme
- La coopération
- Définition de la notion d’interaction négative
- La compétition intraspécifique
- Le compétition interspécifique
- La prédation
- Le parasitisme
- Notion de coévolutuion
- Coévolution et prédation
- Coévolution et structure des peuplements
- Parasitisme et coévolution

« Ecologie des populations et des peuplements » Barbault R.

Semestre : 3
Intitulé de la matière : Gestion de la faune sauvage et de ses habitats
Crédits : 6
Coefficients : 3
A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait bénéficier des connaissances
approfondies sur les méthodes d’ajustement des effectifs des populations naturelles aux
capacités biotiques des habitats. Ils devraient pouvoir détecter à travers des indices
spécifiques (fécondité, taux de croissance, mortalité, déplacements de populations…) les
tendances démographiques de populations clés.


- Analyse des populations pour l’aménagement

- Investigation initiale
- Investigation secondaire
- Principes d’exploitation
- Exploitation sélective des âges
- Principe générale
- Etude de cas
- Exploitation sélective des espèces
- Principe générale
- Etude de cas


Semestre : 3
Intitulé de la matière : Connaissance des principaux habitats et de la faune
algérienne
Crédits : 4
Coefficients : 2
- A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait avoir une connaissance

approfondie de la nature des principaux biotopes algériens et de la faune
vertébrés qui les intègrent.

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en zoologie, botanique et

biogéographie

- Description des principaux habitats forestiers d’Algérie

- les milieux forestiers sensu lato
- les milieux aquatiques sensu lato
- Caractéristiques mésologiques de la steppe algérienne
- La faune mammalienne
- La faune aviaire
- Caractéristiques mésologiques du désert algérien
- La faune mammalienne
- La faune aviaire
- Différentes zones écologiques de la zone néritique algérienne
- L’ichthyofaune
- La faune aviaire


Semestre : 3
Intitulé de l’UE : Méthodologique code : UEF 3.1
Intitulé de la matière : Biologie de la conservation
Crédits : 9
Coefficients : 5
- A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait assimiler les concepts et

approches de conservation générale et de comprendre les enjeux globaux et
locaux de conservation de la biodiversité

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale, biodiversité,

gestion de la faune et environnement.

- Définition
- Les valeurs de la biodiversité
- Les menaces sur la biodiversité
- La conservation des espèces et des espaces
- Les espaces protégées
- La conservation hors des espaces protégés
- Les enjeux du développement soutenable
-

- « Ecologie fondamentale » Dajoz.
- « Biologie de la conservation » Primack et Sarrazin, Dunod ed.

Semestre : 3
Intitulé de l’UE : Découverte Code : UED 3.1
Intitulé de la matière : Dégradation et conservation des écosystèmes
Crédits : 1
Coefficients : 1
-Cette matière permet à l’étudiant de savoir Identifier les risques de dégradation des
écosystèmes sous pression anthropiques, de comprendre leur impact et de proposer des
solutions adéquates de restauration des écosystèmes dégradés.
L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale. Structure et

fonctionnement des écosystèmes, en pollution de l’environnement et Gestion des
ressources.

- Introduction
- Rappels sur les écosystèmes
- Historique
- Structure et fonctionnement
- Rôles et intérêts des écosystèmes dans la biosphère
- Dégradation des écosystèmes
- Concept de dégradation
- Facteurs et processus de dégradation
- Conservation et approches méthodologiques
- Moyens de conservation
- Moyens de restauration

-Angelier E. (2002). Introduction à l’écologie des écosystèmes naturels à l’écosystème
humain. Edition Lavoisier.
-Frontier S. Pichod-Viale D. (1998). Structure, fonctionnement et évolution des
écosystèmes. Edition Lavoisier.
-Faurie C., et al., 2002. Ecologie : approche scientifique et pratique. Edition TEC & DOC.
Semestre : 3
Intitulé de l’UE : transversale code : UET 3.1
Intitulé de la matière : Entreprenariat
Crédits : 2
Coefficients : 2
- A l’issue de cette matière nouvelle, l’étudiant est censé avoir appris comment
gérer et organiser des ressources humaines et matérielles en vue de la création
d’une entreprise, d’une startup ou d’un bureau d’étude spécialisé en
environnement.

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en informatique, en

biostatistiques et en environnement.

1. Définition
2. L’entreprise en tant qu’unité de production
3. L’entreprise en tant qu’unité de répartition
4. Les finalités ou missions de l’entreprise
5. La notion de finalité
6. Les différents types de finalités
7. Les finalités économiques
8. Les finalités humaines
9. Les finalités sociales
10. Classification des entreprises
11. Entreprise et environnement
12. Le micro-environnement de l’entreprise

- Nadim Ahmad et Anders-Hoffman. A Framework for Addressing and Measuring
Entrepreneurship (Paris : OCDE, 2007).
- Luc Bres et al., 2008. Développement durable et entreprenariat

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Université BADJI Mokhtar – Annaba

Faculté des Sciences

Master Ecologie fondamentale et appliquée

Année Universitaire 2017/2018

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Notions de modèle et prémodèle

- Contrôle continu et épreuve finale

Cet enseignement est destiné à procurer à l’étudiant les connaissances relatives à la

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en Ecopédologie et en zoologie générale

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Interactions écologiques au sein de la biocénose du sol

- Contrôle continu et épreuve finale

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

- Cet enseignement est destiné à procurer à l’étudiant les fondements de la

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en biosystématique et en écologie

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Signification écologique de la diversité

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Barbault et al., 2004. Biodiversité et changements globaux. Enjeux de société et

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

Les lois de la probabilité et la statistique descriptive à une et à deux critères.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

Statistique descriptive (rappels)

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en Ecologie générale et

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Choix du thème de recherche

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

L’objectif de cette matière est d’apprendre à l’étudiant, les nouvelles techniques de

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

- Paramètres de description des peuplements

- Contrôle continu et épreuve finale

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Ecologie fondamentale et appliquée

- A l’issue de cet enseignement l’étudiant devrait maîtriser les techniques de

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

- L’étudiant devra avoir suivi des enseignements en écologie générale et