Genetique s5
Genetique s5
Genetique s5
SVI /Semestre 5
2
a) Neurofibromatose………………………………………………………………………………………… 30
b) Le syndrome de Marfan……………………………………………………………………………….. 31
1.4.3. Mutations récentes……………………………………………………………………………………… 31
1.4.4. Mosaïques germinales…………………………………………………………………………………. 32
1.4.5. Anticipation…………………………………………………………………………………………………. 33
1.4.6. Pléïotropie…………………………………………………………………………………………………… 34
2. L’hérédité autosomique récessive (AR)…………………………………………………………………….. 35
2.1. Définition…………………………………………………………………………………………………………. 35
2.2. Caractéristiques généalogiques des maladies AR………………………………………………. 35
2.3. Risque de récurrence………………………………………………………………………………………… 36
2.4. Risques de transmission…………………………………………………………………………………… 37
2.4.1. Rappels de génétique de population : Fréquence génique et fréquence
génotypique………………………………………………………………………………………………………… 38
2.4.2. Fréquence des hétérozygotes parmi la population générale……………………… 38
2.5. La consanguinité et parenté……………………………………………………………………………… 40
2.5.1. Coefficient de relation et degré de parenté………………………………………………. 41
2.5.2. Calcul du coefficient de consanguinité (FI)………………………………………………… 45
2.6. Particularité : Pseudodominance………………………………………………………………………. 48
2.6.1. Définition………………………………………………………………………………………………….. 48
2.6.2. L'hétérogénéité génétique………………………………………………………………………… 49
2.6.3. Empreinte parentale ou Empreinte génomique (EG)………………………………….. 51
3. Hérédité liée au sexe………………………………………………………………………………………………… 55
3.1. Définitions………………………………………………………………………………………………………… 55
3.2. Les chromosomes sexuels ou gonosomes …………………………………………………………. 56
3.3. Particularités de l'hérédité liée au chromosome X……………………………………………. 57
3.4. L’inactivation du chromosome X (Théorie de Mary Lyon, 1961)………………………….. 58
4. Hérédité récessive liée à l’X (RLX)……………………………………………………………………………… 59
4.1. Définition………………………………………………………………………………………………………….. 59
4.1.1. Transmission par la mère…………………………………………………………………………… 59
4.1.2. Transmission par le père……………………………………………………………………………. 59
4.2. Critères de reconnaissance d’une maladie RLX…………………………………………………… 60
4.3. Particularités de l'hérédité récessive liée à l’X (RLX)…………………………………………. 60
4.3.1. Inactivation de l'X = Lyonnisation de l’X (Théorie de Mary Lyon, 1961)……… 60
4.3.2. Les biais d’inactivation…………………………………………………………………………….. 62
3
4.3.3. Consanguinité…………………………………………………………………………………………. 63
4.3.4. Fréquence……………………………………………………………………………………………….. 64
4.3.5. Détection des femmes conductrices (hétérozygotes)……………………………… 64
5. Hérédité dominante liée à l’X……………………………………………………………………………………. 66
5.1. Caractéristiques des maladies dominantes liées à l’X (DLX) et risque de
récurrence…………………………………………………………………………………………………………………. 66
5.2. Particularité : Létalité pour les fœtus de sexe masculin………………………………………. 68
6. Hérédité liée au chromosome Y: hérédité holandrique……………………………………………… 70
7. Conclusion générale………………………………………………………………………………………………….. 71
III. Hérédité multifactorielle………………………………………………………………………………………. 72
1. Combinaison de multiples facteurs génétiques (polygéniques) et environnementaux.. 72
2. Maladies multifactorielles de l’adulte………………………………………………………………………. 73
IV. Maladies mitochondriales……………………………………………………………………………………. 74
V. Maladies génétique des cellules somatiques………………………………………………………… 77
VI. Le caryotype humain et ses anomalies…………………………………………………………………. 78
1. Introduction……………………………………………………………………………………………………………… 78
2. La structure et organisation des chromosomes………………………………………………………….. 79
2.1. La chromatine…………………………………………………………………………………………………… 80
2.1.1. La composition de la chromatine……………………………………………………………… 80
2.1.2. La régulation de l’expression des gènes…………………………………………………… 82
2.2. Les chromosomes……………………………………………………………………………………………… 83
2.2.1. Description morphologique des chromosomes humains en métaphase…… 83
3. Le caryotype humain…………………………………………………………………………………………………. 85
3.1. Principe et technique de caryotype…………………………………………………………………… 86
3.1.1 Les modalités techniques : cytogénétique classique………………………………….. 86
3.1.2. Critères de classement des chromosomes……………………………………………….. 86
3.2. Avantages et limites du caryotype……………………………………………………………………… 87
3.3 Les techniques de cytogénétique moléculaire FISH…………………………………………….. 87
4. Les anomalies chromosomiques………………………………………………………………………………… 88
4.1. Anomalies de nombre…………………………………………………………………………………………. 88
4.1.1. Aneuploïdies autosomiques………………………………………………………………………. 90
4.1.2. Aneuploïdies des gonosomes…………………………………………………………………… 91
4.1.3. Les polyploïdies…………………………………………………………………………………………. 92
4.2. Anomalies de structure……………………………………………………………………………………… 93
4
4.2.1. Les mécanismes des changements…………………………………………………………….. 94
4.2.2. Aberrations portant sur un chromosome…………………………………………………… 95
a. Les délétions (Del)……………………………………………………………………………………. 95
b. Inversion (inv)…………………………………………………………………………………………… 97
c. Duplications (dup)…………………………………………………………………………………….. 98
d. L’isochromosome (i)…………………………………………………………………………………. 98
e. Chromosomes en anneau (r)…………………………………………………………………… 99
4.2.3. Les anomalies portant sur les 2 chromosomes……………………………………………. 100
a. Les translocations Robertsoniennes (rob)…………………………………………………. 100
b. Les translocations réciproques (t)……………………………………………………………… 101
c. Les insertions (ins)…………………………………………………………………………………….. 102
5. Conclusion………………………………………………………………………………………………………………… 103
CHAPITRE II : Génétique Moléculaire…………………………………………………………………………. 104
I. Les mutations et leurs conséquences en pathologie humaine………………………………… 105
1. Introduction……………………………………………………………………………………………………………… 105
2. Mutations géniques : altérations de l’information génétique…………………………………….. 106
2.1. Principaux types de microlésions…………………………………………………………………….. 106
2.1.1. Substitutions…………………………………………………………………………………………… 106
2.1.2. Insertions et/ou de délétions de 1 ou quelques nucléotides……………………… 107
2.1.3. Insertions et/ou délétions de quelques 10aines à 100aines de nucléotides. 107
2.1.4. Mutations instables…………………………………………………………………………………. 108
2.2. Conséquence des insertions et/ou délétions de nucléotides……………………………. 109
2.3. Conséquences des mutations sur la fonction de la protéine des effets
phénotypiques……………………………………………………………………………………………………….. 110
2.3.1. Perte de fonction……………………………………………………………………………………… 110
2.3.2. Gain de fonction………………………………………………………………………………………. 111
2.3.3. Effet dominant négatif……………………………………………………………………………… 111
2.4. L’origine ou les causes des mutations………………………………………………………………. 111
2.4.1. Erreurs de fidélité de l’ADN polymérase lors de la réplication…………………. 111
2.4.2. Tautomérisation………………………………………………………………………………………. 112
2.4.3. Les lésions spontanées…………………………………………………………………………….. 114
a. La dépurination……………………………………………………………………………………….. 114
b. La désamination……………………………………………………………………………………… 114
c. Bases endommagées par oxydation…………………………………………………………. 115
5
2.4.4. Erreurs de méthylation…………………………………………………………………………….. 116
2.4.5. Mutations induites…………………………………………………………………………………… 116
a. Les lésions dues à des mutagènes physiques……………………………………………. 116
b. Mutagènes chimiques…………………………………………………………………………….. 118
II. Mécanismes biologiques de la réparation……………………………………………………………… 120
1. Réponses à un défaut de blocage du cycle cellulaire et de réparation de l'ADN……………. 120
2. Mécanismes de réparation………………………………………………………………………………………… 121
2.1. Mécanismes Préventifs de Réparation……………………………………………………………….. 121
2.2. Réparation par réversions des lésions………………………………………………………………… 122
2.3. Réparation des Mésappariements (Mismatch Repair, MR)……………………………...... 122
2.4. Les systèmes de réparation par excision……………………………………………………………… 123
2.4.1. Réparation par excision de bases BER………………………………………………………. 123
2.4.2. Réparation par excision de nucléotides (système NER)……………………………… 124
2.5. Réparation des cassures double brin……………………………………………………………....... 125
2.5.1. Recombinaison homologue (HR) ………………………………………………………........ 126
2.5.2. Recombinaison entre extrémités non homologues (NHEJ)……………………….. 126
2.6. Conclusion…………………………………………………………………………………………………………. 127
III. Recombinaison génétique de l’ADN………………………………………………………………………. 128
1. Introduction………………………………………………………………………………………………………………. 128
2. Recombinaison homologue (RH)………………………………………………………………………………… 129
2.1. Les mécanismes moléculaires de la recombinaison……………………………………………. 130
2.2. Les éléments t r a n s p o s a b l e s …………………………………………. ……………………. 131
2.3. Conversion génique……………………………………………………………………………………………. 133
6
CHAPITRE I :
Génétique Humaine
7
I- Introduction
1. Disciplines de la génétique
8
2. Le génome humain
Le génome humain est l'ensemble de l'information génétique portée par l'ADN sur les 23
paires de chromosomes présent dans le noyau plus l'ADN mitochondrial (hérité de la mère
principalement). Il porte l'ensemble de l'information génétique humaine qui s'est révélée
contenir de 20.000 à 25.000 gènes.
Le séquençage complet de l'ADN du génome humain a été annoncé le 14 avril 2003. Par la
suite, la recherche sur le génome humain continue à produire, en ce début de siècle, une
quantité impressionnante de connaissances dans le domaine de la génétique humaine,
médicale et moléculaire. Ces avancées technologiques ont bien permis de mieux connaître la
localisation et la fonction des gènes, en particulier ceux impliqués dans des maladies
humaines.
2.1. Organisation du génome humain
Le corps humain est constitué de milliards de ”cellules” (1013) comportant chacune un noyau.
Ce noyau renferme toute notre information génétique. Celle-ci est contenue dans nos
chromosomes (46 chromosomes) qui contiennent eux-mêmes notre ADN.
Dans chaque cellule humaine, un noyau contenant 46 chromosomes (25.000 à 30.000 gènes
codants) constituant le génome nucléaire.
- ≈ 100 à 1000 mitochondries avec environ 5-10 molécules d’ADN/mitochondrie. La molécule
d’ADN mitochondrial est un ADN double brin et circulaire constitué de 16.569 pb chez
l’homme (37 gènes) constituant le génome mitochondrial. Ce génome a une transmission
principalement maternelle sauf quelques rares exceptions ou la transmission est aussi
paternelle. Ce génome est organisé en nucléoside et non associé à des histones et constituant
1 à 2% de la masse totale d ’ADN de la cellule.
- Le génome nucléaire est composé de 3.272 millions de nucléotides. 2% utilisés pour la
synthèse des protéines. L’ADN codant constitue 25.000 à 30.000 gènes actifs codant pour un
ou plusieurs protéines (Figure 1).
9
2.2. Types de séquences d’ADN dans le génome humain nucléaire
L'ADN en chaque chromosome est constitué de beaucoup de gènes (Figure 2). L'ADN contient
également les grandes séquences qui ne codent pour aucune protéine et leur fonctionnement
n'est pas connu. Le gène de la région codante code pour les directives qui permettent à une
cellule de produire une protéine ou une enzyme spécifique.
En dehors des gènes, on trouve l’ADN qui intervient dans des fonctions biologiques et qui est
essentiel à la vie. Ce type d’ADN a un rôle majeur dans la régulation de l’expression des gènes.
Le reste de l’ADN a été considéré comme de l’ADN poubelle nommé Junk DNA (1972) où des
mutations dans ces régions pourraient induire des maladies.
Cette population de gènes non codants pourrait aujourd'hui, selon certaines estimations,
approcher les 100.000 génes. Le rôle des gènes non codants se dévoile peu à peu. Il se situerait
au niveau de la régulation fine des protéines. Par ailleurs, leur activité est très dépendante du
type de cellule : ils ont tendance à fonctionner de manière on/off selon l'organe auquel les
cellules sont rattachées.
2.3. ADN génomique et gènes
Un gène est l’unité d’information génétique qui peut être transmise par un individu à sa
descendance et qui correspond à une séquence d’acide nucléique permettant de spécifier la
synthèse d’un ARN (ARNm, ARNt, ARNr..) ou d’une chaine polypeptidique par traduction d’un
ARNm. Les gènes ont des tailles variables :
Le gène de l’insuline est de 1.400 pb ;
Le géne CFTR est de 250.000pb;
Le géne de la dystrophine (2.400.000 pb).
10
On distingue :
- Gènes uniques avec 2 copies d’allèles par cellule.
- Gènes multicopies : c’est le cas des génes codant pour l’ARNt, ARNr, génes des histones
environ 2000 génes ARNr 5s sur le chromosome 1 ; et 280 copies des ARNr 28s, 5s, 8s, 18s en
5 groupes sur chromosomes 13, 14, 15, 21, 22.
- Familles multigéniques complexes : c’est une famille des génes de l’α-globine (5 gènes sur le
chromosomes 11). Plusieurs gènes existent pour exprimer les chaînes d’acides aminés qui
constituent l’hémoglobine : α-globines sur le chromosome 16 et β-globines sur le chromosome 11.
Sur le chromosome 11, il existe cinq gènes exprimés successivement au cours du développement
de l’individu dans les hémoglobines embryonnaires, fœtales et adultes. L’ensemble des cinq gènes
constitue un groupe de gènes (cluster). De nombreux gènes sont dupliqués et constituent une
famille multigénique : gènes différents mais qui donnent des polypeptides très proches (qui
exercent fonction voisines au cours de la vie cellulaire mais pas au même moment.
2.4. Structure d’un gène
11
On distingue :
- Exons : séquences représentées dans l’ARN mature
- Introns : séquences intermédiaires, enlevées lors de la maturation du transcrit
primaire et délaitées lors de l’épissage de l’ARNm.
L’épissage est dit constitutif (Figure 4, a): lorsqu’un exon est systématiquement inséré dans le
transcrit mature. A l’inverse, on parle d’épissage alternatif (Figure 4, b) quand un exon peut
être soit inclus soit exclu de l’ARN mature.
(a) (b)
Durant l'épissage de l'ARN, les exons sont soit conservés dans l'ARNm, soit ciblés en vue de
leur élimination suivant diverses combinaisons qui mèneront à la création d'un réseau varié
d'ARNm à partir d'un seul pré-ARNm. Ce processus s'appelle épissage alternatif de l'ARN qui
est un processus post-transcriptionnel essentiel et réglé avec précision (Figure 4).
En effet, il n’est pas obligatoire que tous les exons d’un gène soient inclus dans l’ARN messager
mature. Certains exons sont donc considérés comme « alternatifs ». Ainsi un seul gène peut
produire différents ARNm matures et par conséquent, plusieurs isoformes protéiques ayant
des fonctions biologiques différentes, voire opposées (Figure 4).
Un gène doit plutôt être considéré comme une succession d’exons sélectionnés
alternativement et permettant la production d’un ensemble de transcrits matures codant
autant d'isoformes protéiques.
12
Ainsi un gène est un message qui peut être interprété par la cellule de différentes manières
pour assurer différentes fonctions biologiques selon ses conditions environnementales, son
stade de développement et sa spécialisation.
Au moins 70 % des quelques 25.000 gènes qui composent le génome humain subissent un
épissage alternatif et que, en moyenne, un gène donne naissance à 4 variants issus d'un tel
épissage, pouvant donner naissance à environ 100.000 protéines différentes de par leur
séquence et leurs activités.
En Conclusion, le gène est composé d'une séquence transcrite et séquence organisée en
mosaïque : alternance d'exons et d'introns.
Les introns : sont environ 100 à 10.000 paires de bases : séquences intercalées entre
les exons, interrompent le gène (= gènes discontinus dans les cellules eucaryotes différent
pour les procaryotes), séquences transcrites en ARN mais non traduites en protéine :
présentes dans le transcrit primaire puis éliminées au cours de la maturation, rôle mal connu.
Les exons : séquences de gènes exprimées, transcrites et traduites constitué d’environ
50 à 500 paires de bases.
Les gènes représentent une information très morcelée avec des exons constituant 1% et des
introns constituant 25% du génome. Ainsi que les gènes sont noyés dans une quantité
considérable de séquences non codantes au sein du génome : séquences intergènes
constituant 75% du génome ont une taille sans relation avec celle de la protéine pour laquelle
ils codent.
3. Notions fondamentales
- Le noyau des cellules humaines non sexuelles (somatiques) comportent 46
chromosomes (2x23 paires).
- Les autosomes sont les 22 paires de chromosomes qui sont identiques dans les deux
sexes.
- Les gonosomes ou chromosomes sexuels sont les chromosomes X et Y.
- Le gène est l'unité d'information génétique. Le site physique où se situe un gène sur le
chromosome est dénommé locus.
- Les allèles sont les différentes formes que peut prendre un même gène, à un locus
donné. Les allèles diffèrent entre eux par des mutations.
- Allèle dominant : allèle s’exprimant indépendamment du 2ème allèle.
- Allèle récessif : allèle exprimé uniquement à l’état homozygote.
- Une mutation n'est pas synonyme de pathologie. Une mutation peut n'avoir aucune
conséquence sur le phénotype (mutation silencieuse ou polymorphisme).
- Quand la mutation du gène entraîne une maladie, on parle d'allèle morbide.
- Un Homozygote est un individu qui possède deux allèles identiques à un même locus.
- Un Hétérozygote est un individu qui possède deux allèles différents à un locus.
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- Le génotype décrit, au sens strict, la constitution génétique de la cellule ou de
l'individu. Par simplification, ce terme désigne la configuration des allèles à un locus donné.
AA, Aa et aa sont des exemples de génotypes possibles pour les allèles A et a.
- Le phénotype désigne les caractères observés; en génétique humaine, il peut s'agir
aussi bien d'un caractère non pathologique (groupes sanguins) que d'une maladie. Par
exemple, une graine ayant le phénotype [lisse] =[ L ] peut avoir le génotype LL ou Ll.
- Monohybridisme: croisement deux lignées pures ne différant que par un seul
caractère (croisement à un seul facteur).
- Dihybridisme: cas d'un croisement faisant intervenir des parents différant par deux
caractères héréditaires (deux couples d'allèles).
- Transmission autosomique: Caractéristiques des gènes situés sur les autosomes. Chez
l’homme, on a 22 paires d’autosomes. Les 2 sexes sont atteints avec une fréquence égale.
- Transmission liée au sexe: Gènes situés sur les chromosomes sexuels X ou Y
- Gènes indépendants: se sont des gènes portés par deux paires de chromosomes
différents A et a sur une paire, B et b sur une autre paire de chromosomes.
- Gènes dépendants ou liés : se sont des gènes portés par la même paire de
chromosomes.
- Caryotype : Le caryotype correspond à l'analyse morphologique (nombre et structure)
des chromosomes. L'analyse du caryotype a pour objet de dépister des anomalies
chromosomiques qui sont présentes dans toutes les cellules de l'organisme dès la naissance.
- Arbre généalogique ou pedigree : La généalogie ou pedigree est l’histoire génétique
d’une famille. Le premier membre de la famille qui attire l’attention sur une maladie génétique
est appelé : Propositus, Probant, Indicateur ou cas index. L’établissement d’un arbre
généalogique de maladie génétique ou à hérédité mendélienne est fondé sur la généalogie de
la famille qui vient consulter. Lorsqu’il s’agit de cas familiaux, l’arbre généalogique permettra
de définir le mode de transmission de la maladie.
- Une maladie génétique résulte du dysfonctionnement d'un ou plusieurs gènes. Une
maladie génétique peut ne pas être héréditaire. C’est le cas de la plupart des cancers qui résultent
de mutations affectant des gènes dans les cellules tumorales, cellules somatiques qui ne
participent pas à la reproduction sexuée.
- Une maladie congénitale est présente à la naissance; elle peut être génétique ou non
(la rubéole contactée au cours de la grossesse peut engendrer des anomalies congénitales). A
l'inverse, beaucoup de maladies génétiques ne sont pas congénitales et ne s'expriment qu'au
cours de la vie; on estime, par exemple, que 10% des maladies monogéniques ne sont
découvertes qu'à l'âge adulte.
- L'hérédité monogénique, l'hérédité monofactorielle ou l'hérédité mendélienne sont
employés indifféremment pour caractériser la transmission des maladies génétiques
occasionnées par des mutations dans un seul gène.
- Une prédisposition génétique est la configuration génétique d'un organisme qui le
rend vulnérable à un problème de santé, l'environnement et les relations de l'organisme avec
celui-ci ayant également une influence plus ou moins importante sur l'apparition ou non du
14
problème de santé. En tant que maladie génétique, le cancer est une maladie pouvant
apparaître chez des organismes prédisposés s'ils sont dans un environnement particulier. Chez
la femme, c'est notamment le cas du cancer du sein dans 5 à 10 % des cas.
- Le Dépistage : Ensemble d'examens et de tests effectués au sein d'une population
apparemment saine afin de dépister une affection latente à un stade précoce. C’est
notamment la Recherche de signes décelables d’une maladie qui ne s’est pas encore
manifestée.
- Le Diagnostic : Identification d’une maladie par ses symptômes relevés par des
observations, des contrôles ou des tests.
Les maladies génétiques sont des maladies dues à une ou plusieurs anomalies sur un ou
plusieurs chromosomes qui sont transmises à la descendance et qui entrainent un défaut de
fonctionnement de cellules précises de l'organisme. Les cellules biologiques fabriquent des
protéines. L'activité et la structure de chaque protéine est déterminée par l'information
génétique contenue dans un gène. Si le gène est altéré, il entraîne la cellule dans un
dysfonctionnement, qui peut se révéler, à tout âge de la vie, avec l'expression d'une maladie.
15
rapide et significative des connaissances, à la fois sur l’étiologie (qui est l'étude des causes et
des facteurs d'une maladie) de plusieurs maladies héréditaires et sur le fonctionnement du
vivant, au sens très large.
C’est ainsi que la mission de la génétique humaine est de comprendre, d’expliquer la survenue
d’anomalies génétiques chez les nouveau-nés à risque, de les diagnostiquer le plus tôt possible
afin de permettre un éventuel traitement précoce et actuellement même de les dépister avant
la naissance.
Pendant très longtemps seules des études statistiques reposant sur la collecte d’informations
au sein de familles touchées par telle ou telle anomalie génétique permettaient au mieux
d’évaluer un risque de voir naître un enfant malade. Depuis que les analyses moléculaires et
surtout l’analyse directe de l’ADN se pratiquent couramment, le dépistage est venu
transformer la probabilité en certitude en se basant sur plusieurs techniques et tests de
dépistage.
Le choix des maladies susceptibles de donner lieu à un dépistage néonatal généralisé obéit à
des règles précises :
- La maladie doit être grave,
- La maladie doit être d'apparition précoce,
- La maladie doit être d'une fréquence suffisante,
- La maladie doit être accessible à un traitement efficace,
- La maladie doit être détectable par un test fiable. Le test doit être peu coûteux et
applicable à grande échelle de la population.
Tout résultat positif du dépistage doit être suivi de la prise en charge du nouveau-né. De plus,
tout programme de dépistage instauré à l’échelle populationnelle doit être régulièrement
évalué.
En France, un programme national de dépistage néonatal existe depuis 1978. Il est confié à
une association privée, l'Association française pour le dépistage et la prévention des
handicaps de l'enfant sous la tutelle de la Caisse Nationale d'Assurance Maladie et de la
Direction générale de la Santé. Actuellement, cinq maladies font l'objet d'un dépistage
organisé en France : la phénylcétonurie, l'hypothyroïdie, l'hyperplasie congénitale des
surrénales, la mucoviscidose et la drépanocytose dont le dépistage est limité aux nouveau-nés
à risque.
Au Maroc, pas de programme de dépistage de maladie génétique chez le nouveau-né est mis
en place par le ministère de la santé marocain. Cependant, le dépistage peut être réalisé à
titre individuel sous la demande des parents à risque.
16
4.2. Le diagnostic génétique
Environ 3 % de toutes les grossesses aboutissent à la naissance d’un enfant ayant une maladie
génétique significative ou une anomalie congénitale responsable d’un handicap de retard
mental ou de mort précoce.
Des études concernant les causes de mortalité, chez des enfants hospitalisés, ont attribué à
des maladies génétiques la responsabilité de 38 % et 42 % de la mortalité totale. Dans la
population adulte, la fréquence des maladies ayant un support génétique est moins bien
évaluée, mais on estime que 10 % environ des hospitalisations à l’âge adulte sont liées à des
maladies génétiques.
17
L’appellation «non génétique» d’une maladie peut être erronée, car on conçoit difficilement
qu’une maladie soit entièrement non génétique. Le développement d’un individu dépend,
d’interactions génétiques et environnementales. Etant donné que chaque modification au
cours de l’histoire de l’homme, qu’il s’agisse de maladie ou non, a d’une certaine façon une
origine génétique, toute affection a un support génétique (reconnu que la plupart des facteurs
de défense de l’individu sont génétiquement déterminés.)
On a assisté au cours des 20 dernières années à une explosion des connaissances concernant
le rôle des gènes dans la santé du moment de la conception de l’être humain jusqu’à celui de
sa mort. Il est désormais universellement reconnu que l’ADN détermine non seulement les
malformations congénitales qui tuent des millions d’enfants, mais prédispose également à des
maladies mentales et à des maladies cardio-vasculaires, l’hypertension, l’asthme, le diabète et
la polyarthrite rhumatoïde.
4.4. Classifications des maladies génétiques
18
Figure 5 : Un enfant présentant la Trisomie 21.
Remarque: Les aberrations chromosomiques sont des maladies génétiques mais (avec des
rares exceptions) ne sont pas héréditaires.
4.4.2. Maladies monogéniques
Ces maladies sont dues à des mutations sur un seul gène et ont des conséquences sévères sur
la santé du sujet parfois. Parmi les maladies génétiques, on trouve aussi bien des affections
bénignes ou faiblement handicapantes (par exemple, le daltonisme) que des affections
extrêmement graves (par exemple, la mucoviscidose).
Pour ces anomalies géniques, le caryotype est normal et le problème se situe au niveau d’un
gène. L'altération au niveau d'un gène est nécessaire et suffisante pour s'accompagner de
l'apparition de la maladie génétique. On note que certaines variations au niveau d’un seul
gène ne sont pas pathologiques. On parle de polymorphisme.
Ces maladies sont héréditaires et sont transmises sur un mode mendélien. De ce faite sont
appelées également maladies mendéliennes. L'hérédité mendélienne classique ou
monogénique est basée sur la transmission d'un seul gène sous un mode dominant, récessif
ou lié au chromosome sexuel X (ou Y).
Par la suite les maladies monogéniques sont dominantes ou récessives. On peut aussi les
classer en fonction de la position du gène responsable de l’anomalie. S’il est situé sur la paire
de chromosomes sexuels, la maladie est dite gonosomale (ou liée au sexe).
Exemple: myopathie de Duchenne, l’hémophilie… .
Si le gène est localisé sur des chromosomes autosomes, la maladie est dite autosomale.
Exemple: Chorée de Hungtington; Drépanocytose; mucoviscidose ; thalassémie…
Les découvertes sur la structure de l'ADN, le code génétique, le génome et l'observation de
caractères et maladies génétiques ne répondant pas aux lois de la génétique formelle
19
(hérédité mendélienne) ont orienté les chercheurs vers la définition d'autres modes de
transmission dont ceux reliés à l'hérédité multifactorielle et l'hérédité mitochondriale.
4.4.3. Maladies polygéniques ou multifactorielles
Ces maladies sont le résultat de l’interaction de plusieurs gènes, chacun d’entre eux, pris
isolément, pouvant n’avoir qu’un effet relativement mineur.
C’est ainsi que L'hérédité multifactorielle fait appel à la synergie de gènes et facteurs
environnementaux. Se sont les maladies génétiques complexes.
Ces maladies possèdent un déterminisme génétique mais dont la transmission ne correspond
à aucun des modes mendéliens classiques de transmission, ni à un mode de transmission de
type mitochondrial. Il s'agit d'un déterminisme génétique polygénique: de nombreuses
altérations aux niveaux de nombreux gènes sont les déterminants multiples de la maladie de
plus des facteurs de l’environnement agissant sur ces gènes.
Exemples : La quasi totalité des cancers et des maladies chroniques (asthme, diabète, maladie
de Crohn…) sont des maladies multifactorielles.
- Maladies cardiovasculaires ;
- Diabète ;
- Cancers ;
- Maladies mentales ;
- Maladie d’alzheimer.
On recherche actuellement les gènes de prédisposition à ces maladies fréquentes qui
représentent des problèmes de santé publique.
4.4.4. Maladies mitochondriales
Les mitochondries, les «usines énergétiques» des cellules, sont indispensables au bon
fonctionnement de l'organisme. Alors que la majeure partie du génome se trouve dans le
noyau cellulaire, les mitochondries disposent, elles aussi, d'un peu d'ADN.
L’ADN mitochondrial constitue une entité autonome, physiquement distincte de l’ADN
nucléaire. Le génome mitochondrial est constitué par DNA circulaire, double brin de presque
17 kb où figure 37 gènes dépourvus d’introns, (13 gènes d’enzymes ; 2 gènes d’ARNr et 22
d’ARNt).
La génétique mitochondriale n’est pas mendélienne. Elle se distingue de la génétique
nucléaire par un certain nombre d’éléments :
- Il y a plusieurs milliers de copies de l’ADN mitochondrial par cellule (plusieurs centaines
de mitochondries par cellule).
- La pathologie de l’ADN mitochondrial est hérédité principalement de la mère, car lors
de la formation du zygote, les mitochondries sont essentiellement apportées par l’ovocyte.
20
- Le taux de mutations de l’ADN mitochondrial est 17 fois plus élevé que celui de l’ADN
nucléaire. Les conséquences phénotypiques des mutations sont ainsi variables d’une cellule à
l’autre, d’un tissu à l’autre, d’un individu à l’autre.
- La répartition des mitochondries est au hasard pendant la mitose dans chaque cellule-
fille. Cette ségrégation mitotique engendre une distribution aléatoire dans la descendance
cellulaire.
On considère habituellement que seul l'ADN mitochondrial maternel se transmet d'une
génération à la suivante. Cependant, Lors de la fécondation, des mitochondries du
spermatozoïde peuvent entrer dans l'ovule, mais il existe des mécanismes pour détruire ces
mitochondries paternelles.
Mais une nouvelle étude parue en 2018 vient de bouleverser ces concepts : des chercheurs
ont trouvé des familles dans lesquelles l'ADN mitochondrial paternel n'a pas été détruit lors
de la fécondation. Les chercheurs ont étudié dix-sept personnes appartenant à trois familles
indépendantes chez qui étaient suspectées des maladies mitochondriales. Dans ces familles,
l'analyse génétique a révélé une transmission des ADN mitochondriaux maternels et
paternels.
Cependant, cela ne signifie pas pour autant que la transmission de l'ADN mitochondrial
paternel soit un phénomène fréquent : il est peut-être associé à une situation pathologique.
Cette recherche pourrait aider à mieux comprendre certaines maladies mitochondriales, dont
certaines sont des pathologies particulièrement graves, voire fatales.
4.4.5. Maladies génétiques des cellules somatiques
Contrairement aux autres catégories de maladies génétiques précitées où l’anomalie
génétique est retrouvée dans l’ADN de toutes les cellules de l’organisme y compris les cellules
germinales (spermatozoïdes et ovocytes), et peut être transmise aux générations suivantes (=
maladies héréditaires). Ces maladies génétiques ne surviennent que dans les cellules
somatiques spécifiques.
En fait, une maladie génétique ne sera héréditaire que si elle intéresse les cellules germinales,
c'est-à-dire si le gène modifié se retrouve dans les gamètes, ovules et spermatozoïdes. Le
modèle de ce type de maladies génétiques est le cancer, état dans lequel le développement
de la malignité est la conséquence de mutations dans les gènes contrôlant la croissance
cellulaire.
4.5. L’arbre généalogique
Chez la souris, une génération peut s’accomplir en l’espace de deux mois, chez la drosophile,
elle dure deux semaines, chez les microorganismes, 20 minutes. Mais chez l’homme, il faut au
moins 20 ans pour achever une génération.
Lorsqu’il s’agit d’organismes moins évalués, on peut procéder à des accouplements
expérimentaux pour obtenir des informations ou vérifier l’exactitude d’une hypothèse. Mais
21
le cas de l’homme, c’est la nature qui entreprend l’expérience, le chercheur ne pouvant qu’en
constater les résultats.
De toute évidence l’union ne peut s’y pratiquer sous la contrainte de telle sorte que les
généticiens doivent recourir à l’examen minutieux de progénitures existantes dans l’espoir
que les unions les plus informatives se soient produites plus au moins au hasard. Cet examen
est appelé analyse généalogique. Le premier membre d’une famille à retenir l’attention d’un
généticien est appelé le propositus. Dans la plupart des cas le phénotype du propositus est
exceptionnel. L’investigateur retrace alors le cheminement de ce trait au long de l’histoire de
la famille et établit un arbre généalogique en utilisant des symboles conventionnels repris
dans la Figure 6.
L’explosion de la biologie moléculaire au cours des dernières années a ouvert des perspectives
entièrement nouvelles dans la recherche des déterminismes génétiques des maladies
humaines. De nombreuses maladies humaines et autres anomalies exceptionnelles sont
déterminées par de simples allèles mendéliens récessifs. Certains indices doivent en être
recherchés dans la généalogie.
Très souvent de tels allèles récessifs sont révélés par des unions consanguines (des mariages
entre cousins). Par exemple on a pu estimer que les mariages entre cousins germains sont la
cause de 18 à 24 % des enfants albinos et de 27 à 53 % des enfants atteints de la maladie de
Tay-Sachs ; dans les deux cas il s’agit d’anomalies récessives.
L’arbre généalogique est une représentation graphique, qui résume en un seul schéma un
grand nombre d’informations sur la composition d’une famille et sur l’état de santé de ses
membres. Il doit être reproduit sur au moins trois générations. La prise de l’arbre
généalogique est un temps capital dans l’enquête génétique. Bien pris, il permet d’interpréter
rapidement le mode de transmission d’un trait phénotypique ou d’un état pathologique.
22
Figure 6 : Symboles utilisés pour construire un arbre généalogique
23
II. hérédité mendélienne monogénique
Les maladies monogéniques ou monofactorielles sont une cause importante de maladies mortelles ou
entraînantes des incapacités chroniques notamment pendant l’enfance. Ils sont dus à la mutation d’un
gène (= maladies héréditaires monogéniques). Le mode de transmission d'une maladie génétique
monogénique suit les lois de Mendel, ce qui explique l'usage du terme maladie mendélienne.
La transmission des caractères monofactoriels varie selon que le gène est dominant ou
récessif. La généalogie standard peut être altérée par divers facteurs, tels que l’hétérogénéité,
la pléiotropie (protéine qui détermine plusieurs caractères phénotypiques); la réduction de la
pénétrance, la variabilité d’expression, la variabilité de l’âge d’apparition, la limitation à un
sexe, l’interaction de deux ou plusieurs paires de gènes et l’influence du milieu.
On peut classer les maladies monogénétiques en fonction de leur transmission des parents
aux enfants. 4 principaux modes de transmission autosomique ou lié au sexe, selon que le
gène impliqué est localisé sur un autosome (22 paires d’autosomes) ou sur les chromosomes
sexuels X ou Y et selon que la maladie est dominante ou récessive. Il s’agie de :
1. Hérédité autosomique dominant (AD) ;
2. Hérédité autosomique récessive (AR) ;
3. Hérédité récessive liée à l’X (RLX) ;
4. Hérédité dominante liées à l’X (DLX) .
Plus de 6.000 maladies sont transmises sur un mode monogénique dont 85% à gène connu.
On estime, que 10% des maladies monogéniques ne sont découvertes qu'à l'âge adulte
(maladies non congénitales).
1.1. Définition
Une maladie est transmise selon le mode autosomique dominant si le gène en cause est porté
par un autosome et si la présence d'un seul allèle muté suffit pour que la maladie se manifeste.
Les individus hétérozygotes (M/m) pour le gène en cause sont malades. Généralement, les
individus homozygotes (M/M), s'ils sont viables, sont plus sévèrement atteints par la maladie.
Ils sont si rares qu'on peut considérer que tous les atteints sont, sauf exception,
hétérozygotes.
24
Figure 7 : Mode de transmission autosomique dominant.
A chaque grossesse, le risque que l'enfant soit malade est de 50%
1.2. Caractéristiques
- Il y a autant de filles que de garçons atteints parce que le gène impliqué est sur un
autosome qui peut aussi bien se trouver chez un garçon que chez une fille.
- Une personne malade a un de ses deux parents atteint.
- Une personne malade a un risque de 50% de transmettre la maladie à chacun de ses
enfants. Le fait d'avoir un premier enfant sain ne signifie pas que le deuxième enfant sera
malade.
- A chaque grossesse, le risque que l'enfant soit malade est de 50%, parce qu'à chaque
fois, l'individu atteint a un risque sur deux de transmettre l'allèle muté (M) et une chance sur
deux de transmettre l'allèle normal (m).
- La transmission des maladies autosomiques dominantes s'effectue sans saut de
génération : c’est une transmission verticale si la pénétrance est complète.
- Une personne qui n'a pas l'allèle pathologique ne peut pas transmettre la maladie à
ses enfants.
Remarque : Les arbres généalogiques des maladies dominantes autosomiques à transmission
mendélienne comportent des individus, hommes et femmes, atteints dans chaque
génération. En outre les hommes et les femmes affectés transmettent la maladie à leurs fils
et à leurs filles dans des proportions égales.
1.3. Exemples de maladie AD
25
Neurofibromatose de type I (NF1 ou maladie de Recklinghausen) : association variable
de signes cutanés, un retard des acquisitions, de tumeurs nerveuses, de signes
osseux...
Polydactylie
Très souvent, une maladie connue pour sa transmission autosomique dominante, apparaît
chez un individu alors que ses parents sont indemnes.
1.4.1. Pénétrance incomplète
Un gène dominant se manifeste chez le porteur hétérozygote. Dans certaines conditions, un
porteur sûr du gène peut ne pas manifester la maladie en question. C’est ainsi que le sujet
apparemment sain peut donc être porteur du gène muté et transmettre la maladie à sa
descendance donnant lieu ainsi à un "saut de génération" (Figure 9). On dit que la pénétrance
de la maladie est incomplète.
26
La pénétrance peut varier en fonction de l’âge (exemple de la maladie de Huntington) et/ou
du sexe (exemple du syndrome de prédisposition héréditaire au cancer du sein).
La pénétrance est un concept statistique qui illustre le pourcentage de porteurs du gène et
qui expriment la maladie (le gène morbide). En effet on définit la pénétrance d'un gène (P)
par le rapport entre le nombre d'individus atteints comparé au nombre d'individus porteurs
du gène :
P = nb atteints / nb porteurs x 100 (%)
Remarque : la pénétrance d'un gène morbide peut aussi varier en fonction d'autres
paramètres notamment l'âge ou le sexe.
- La pénétrance de la mutation responsable de la chorée de Huntington est de 0 à la
naissance, de 50% vers 40 ans et de 100% vers 70 ans.
- Le calvitie : trait mendélien autosomique dominant chez l’homme ; récessif chez la
femme influencé par les hormones.
a) Le Rétinoblastome
La figure montre que plusieurs membres de la famille ci-dessous ont développé un
rétinoblastome qu’est une tumeur embryonnaire de la rétine. Il s'agit d'une maladie
autosomique dominante dont la pénétrance est de 90%.
27
Figure 10: Arbre généalogique du rétinoblastome
L’individu II-3 est décédé de la maladie. Sa sœur (II2) est atteinte et a eu un fils (III2) malade.
Son frère (II4) est sain mais a eu une fille (III4) atteinte; il est donc porteur obligatoire de l'allèle
pathologique.
On note un saut de génération bien que l'allèle pathologique soit présent à toutes les
générations. Ces observations sont conformes au mode autosomique dominant avec
pénétrance incomplète.
b) Maladie de Huntington
La maladie de Huntington est une maladie neuro-dégénérative dont la pénétrance dépend de
l'âge des hétérozygotes. A la naissance, la pénétrance est nulle; elle est de 50% environ à 40
ans, et elle est totale à 70 ans.
Il s'agit d'une dégénérescence du système nerveux entraînant des convulsions et une mort
prématurée avec des troubles du comportement, modification du caractère, problèmes de
concentration, troubles de l’humeur, dépression, difficultés dans le milieu professionnel. De
plus, on note altération des fonctions supérieures évoluant vers une démence et des
mouvements involontaires choréiques de la face et des membres (chorée).
Cependant, c’est une maladie qui se déclare tardivement, les symptômes n'apparaissant
généralement pas avant que l'individu soit en âge de procréer.
La mutation consiste en une expansion anormale d’une répétition de triplets CAG dans le
premier exon de ce gène qui code l’acide aminé glutamine (situé sur le chromosome 4, code
pour une protéine, la Huntington). Ce triplet est répété jusqu’à 250 fois au lieu de 35
normalement et rend toxique la protéine Huntington mutée.
Chaque enfant d'un porteur de l'allèle anormal a une probabilité de 50 % d'en hériter et de
contracter la maladie qui lui est associée. L'application de techniques moléculaires a permis
de mettre au point une méthode prometteuse de dépistage afin de détecter les porteurs de
l'allèle anormal avant que la maladie ne se déclare.
28
Figure 11 : Gène humain HTT
L'extrémité 5' du gène HTT (Figure 11) a une séquence (CAG)n répétitions. Le seuil
pathologique est défini par au moins 41 répétitions CAG. HTT est situé sur le bras court (p) du
chromosome 4 à la position 16,3.
Dans cette famille, le père (I-1) est mort à 78 ans après avoir débuté sa maladie à 68 ans. Son
petit-fils (III-2) est atteint à l'âge de 50 ans. Sa fille (II-2) est décédée accidentellement à l'âge
de 42 ans. Du fait de l'apparition tardive de la maladie elle n'a pas développé de signes
cliniques, mais elle portait l'allèle muté puisqu'elle l'a transmis à son fils.
Ces observations sont conformes au mode autosomique dominant avec pénétrance
incomplète.
Dans une même famille, des personnes ayant hérité de la même mutation peuvent parfois
présenter des symptômes cliniques différents, touchant éventuellement des organes ou des
tissus différents. On dit alors que la maladie a une expressivité variable. Ce phénomène est
surtout observable dans les maladies dominantes.
29
Certains porteurs de l'allèle muté peuvent n'avoir que des signes bénins. Ils ne sont pas
considérés comme cliniquement malades et la transmission semble alors sauter une
génération.
a) Neurofibromatose
La neurofibromatose est une maladie dont les signes cliniques sont de nature et de gravité
variables. Presque tous les patients présentent des tâches cutanées café au lait. Associées à
ces tâches, les patients présentent selon les cas des tumeurs de la peau bénignes, des tumeurs
des nerfs (neurofibromes, gliome du nerf optique) et des malformations du squelette.
(a)
(b)
Figure 13: Mode de transmission de la Neurofibromatose (a) et manifestation de différents
symptômes (b).
Dans cette famille, le père (I-1) a transmis l'allèle muté à 4 de ses 5 enfants alors que deux
seulement semblent atteints. Sa fille (II-4) et son fils (II-7) ont "transmis" la maladie à leur
30
descendance bien qu'ils ne présentent que des symptômes bénins. La maladie semble ainsi
sauter une génération. Ces observations sont conformes au mode autosomique dominant
avec expressivité variable de la maladie.
Dans la neurofibromatose, un ou plusieurs symptômes (tumeurs cutanées, taches café au lait,
manifestations systémiques..) peuvent être absents chez le malade.
b) Le syndrome de Marfan
Cette maladie touche les tissus conjonctifs, notamment ceux du squelette (membres et doigts
longs et fins, hyperlaxité articulaire, déformations osseuses de la colonne vertébrale et du
sternum), des yeux (myopie sévère, luxation du cristallin) et du cœur (insuffisance valvulaire,
quelquefois dissection aortique et mort subite). Un individu porteur d’un syndrome de Marfan
peut présenter une atteinte de l’un ou de ces trois systèmes dont la sévérité peut notablement
varier.
De plus, cette variabilité phénotypique peut être retrouvée parmi les sujets atteints issus
d’une même famille, sujets pourtant nécessairement porteurs du même allèle muté. Des
facteurs liés à l’environnement ou à d’autres gènes pourraient être à l’origine de cette
variabilité, et agiraient en modulant l’expression du gène muté responsable du syndrome de
Marfan.
Ce syndrome est contrôlé par le gène de la Fibrilline-1 → Gène FBN1 qui est situé sur le
chromosome 15:(15q21), gène = 110 kb avec 65 exons, transcrit de 10 kb.
Il arrive qu'un sujet malade naisse de deux parents sains et non porteurs de la mutation. Ce
phénomène est expliqué par l'apparition de l'allèle muté dans l'un des gamètes parentaux; il
s'agit d'une mutation de novo ou néomutation. Pour certaines maladies, la proportion de
31
néomutations est très élevée; c'est le cas, par exemple, pour l'achondroplasie (80%) et pour
la maladie de Marfan (50%).
+/+ +/+
La Figure 15 montre que les parents de III4 ne présentent aucun signe de la maladie. Les
grands-parents, oncles, tantes, fratrie sont tous bien-portants. On en déduit qu'une
néomutation s'est produite dans les cellules sexuelles du père (II-5) ou de la mère (II-6).
L’achondroplasie est la forme de nanisme la plus courante dans le monde. Elle est causée par
une mutation du gène FGFR3 porté sur le chromosome 4 et entraîne la production excessive
de protéines qui ralentissent la croissance osseuse.
Le phénotype de l’achondroplasie humaine est déterminé par un allèle dominant D(D/d) tous
les individus atteints sont hétérozygotes. L'achondroplasie homozygote (D/D) est une
condition létale.
Dans le cas de l’achondroplasie, les mutations spontanées sont relativement fréquentes: il
s'agit d'une mutation de novo dans 80% des cas chez les enfants dont les parents ont une taille
normale.
Dans ce cas, le nanisme n’est pas familial et un seul enfant de la famille sera probablement
touché par le nanisme car cette mutation est un fait isolé et souvent unique. Par contre, il se
peut que les enfants de cet individu touché héritent plus tard du gène muté. À la deuxième
génération, le nanisme sera alors familial.
1.4.4. Mosaïques germinales
Le mosaïcisme germinal est défini par la présence d'une double population de cellules
germinales, certaines étant porteuses d'une mutation, d'autres étant sauvages. Par définition,
le parent porteur d'une mutation germinale en mosaïque peut la transmettre à sa
descendance. Si cette mutation est absente dans les cellules somatiques, la maladie ne
s'exprimera pas chez le parent porteur mais pourra être transmise à sa descendance.
32
Exemples: L'ostéogenèse imparfaite.
+/+ +/+
m/+ +/+
Figure 16: Individu portant une mutation à l’état mosaïque : présence de deux
populations de cellules, l’une étant porteuse d’une mutation, l’autre non.
1.4.5. Anticipation
Il y a anticipation quand l'âge d'apparition de la maladie est de plus en plus précoce au cours
des générations successives; à l'anticipation réfère à un phénomène d'apparition plus précoce
d'une maladie d'une génération à l'autre accompagnée de manifestations plus sévères (Figure
17).
Le phénomène est observé surtout, mais non exclusivement, dans les maladies autosomiques
dominantes, en présence d'une répétition plus marquée de triplets d'une génération à l'autre,
comme dans la dystrophie myotonique (CTG) et la maladie de Huntington (CAG).
La maladie de la dystrophie myotonique de Steinert représente l'exemple classique d'un tel
phénomène. C’est une myopathie héréditaire autosomique dominante touchant les deux
sexes. La maladie de Steinert est une maladie dominante avec anticipation.
L’anomalie génétique est transmise par l’un des parents: la transmission est dite verticale, sa
fréquence est d'environ 1/8.000 personnes, son gène se situe sur le chromosome 19.
Dans la forme classique, on observe des signes :
Musculaires (myotonie et dystrophie musculaire) ;
Cardiaques : atteinte du myocarde par mauvaise vascularisation ;
Oculaires (cataracte) ;
Neurologiques (troubles du sommeil, dépression, ralentissement intellectuel) ;
Calvitie précoce.
Le gène MTPK responsable de la maladie est situé dans le chromosome 19 est une région
instable composée de triplet (CTG).
33
La forme néonatale :
Forme gravissime ;
Début néonatal ;
Hypotonie importante ;
Décès fréquent ;
Retard psychomoteur ;
Transmission mère-enfant uniquement.
La forme adulte :
Insuffisance respiratoire ;
Troubles du rythme ;
Une atteinte musculaire faible ;
Troubles du rythme cardiaque ;
Une atteinte oculaire : cataracte ;
Troubles neurologiques : un retard intellectuel ;
Perte des cheveux.
La forme tardive
Début après 50 ans ;
Clinique peu symptomatique ;
Souvent, on retrouve une cataracte ;
Une calvitie.
La forme congénitale (la forme néonatale) ne s’observe que lorsque la mutation est transmise
par la mère. Sa survenue est totalement indépendante du degré de sévérité de l’atteinte
maternelle (la maladie est d’ailleurs souvent méconnue chez la maman).
Figure 17: La femme présente une cataracte à l'âge de 70 ans. Sa fille présente une maladie
de Steinert typique avec début dans la trentaine et son enfant présente la forme néonatale.
Noter le nombre de répétition de la séquence CTG augmente avec l’anticipation de la maladie.
34
1.4.6. Pléïotropie
L'expression de certains gènes peut se limiter à un seul organe (ex : les rétinites pigmentaires
AD qui comportent uniquement des anomalies ophtalmologiques). D’autres maladies
touchent de nombreux organes c’est le cas du Syndrome de Marfan (Figure 18) qu’est du à
des mutations du gène de la fibrilline (protéine de la matrice extracellulaire). On appelle ce
phénomène l'effet pléiotropique du gène. Mutation pléiotropique c’est une mutation qui
affecte plusieurs caractères différents.
2.1. Définition
Les gènes concernés sont localisés sur les autosomes. L'allèle muté responsable de la maladie
est récessif par rapport à l'allèle sauvage : les hétérozygotes sont sains et la maladie ne
s'exprime que chez les homozygotes.
35
Exemples :
La Figure 19 montre que dans cette famille, III-7 et III-8 sont atteints de mucoviscidose, la
maladie autosomique récessive la plus fréquente en Europe avec une fréquence de un
nouveau-né sur 3.000 environ. Ils sont porteurs de deux allèles pathologiques, et leurs parents
II-5 et II-6 sont hétérozygotes porteurs sains.
Dans la plupart des cas, on observe très rarement d'autres individus atteints parmi les
ascendants (comme ici II-2), aussi bien pour la mucoviscidose que pour toutes les autres
maladies récessives qui sont encore plus rares.
36
Figure 20 : Un couple d'hétérozygotes a un risque de 25% (1/4) d'avoir un enfant atteint
(homozygote atteint) à chaque nouvelle conception.
Le risque pour un couple d'avoir un enfant atteint d'une maladie récessive dépend du risque
pour chaque conjoint d'être hétérozygote, ce qui est lié à la fréquence des hétérozygotes dans
la population (ou dans la famille s'il s'agit d'apparentés du malade).
Sauf le cas des unions entre apparentés, les unions entre non apparentés sont aléatoires pour
la plupart des gènes, notamment ceux impliqués dans les maladies mendéliennes.
Il faut noter que la Loi de HARDY-WEINBERG permet de calculer la fréquence d’un gène
récessif dans une population en équilibre.
37
2.4.1. Rappels de génétique de population : Fréquence génique et fréquence génotypique
- Soit un locus avec un système à deux allèles A et a à qui correspond 3 génotypes: AA,
Aa et aa.
- Soit p la fréquence dans la population de l’allèle A et q la fréquence de l’allèle a ;
p+q=1
Les fréquences géniques (alléliques) peuvent être déduites des fréquences génotypiques. En
effet, la fréquence d’un allèle dans une population est égale à la fréquence des homozygotes
plus la moitié de la fréquence des hétérozygotes: p(A) = P + ½ H & q(a) = Q + ½ H
Loi de Hardy-Weinberg :
La loi de Hardy-Weinberg permet de donner la fréquence d’un allèle récessif autosomique par
le développement de l’équation (p + q)2=p2+ 2pq + q2 ; p2 pour A/A ; 2pq pour A/a et q2 pour
a/a.
La fréquence des porteurs sains (= hétérozygotes) est égale à 2pq, soit 2q (1 - q).
Noter que les hétérozygotes sont nombreux: 1/50, deux cent fois plus que les malades.
38
Remarque : Pour une maladie rare, p est très peu différent de 1, et la fréquence des
hétérozygotes = 2q Si (q <<< p) 2 pq ≈ 2q.
Si les parents ne sont pas apparentés : Union de deux sujets non apparentés
Parents non apparentés, le risque d’être hétérozygote est celui de la population générale :
Exemple 2 : La mucoviscidose est une maladie qui frappe un enfant sur 2000 dans la
population. L’étude de sa transmission a montré qu'elle est due à l’état homozygote d'un
certain gène, que l'on désigne par a et A désigne l'allèle normal.
39
En présence d’antécédent familiale :
Le risque d’avoir un enfant malade si les parents sont apparentés (Figure 22) : Risque pour III1
et III2 d'avoir un enfant atteint.
Les mariages entre sujets apparentés, appelé mariages consanguins, unissent des individus
ayant au moins un ancêtre commun. En effet, ce sont les enfants nés de ces unions qui sont
consanguins. On doit parler d'union entre sujets apparentés.
Les époux apparentés peuvent partager des gènes identiques venant de cet ou de ces
ancêtres, ce qui favorise l'homozygotie chez leurs enfants et partant l'apparition de maladie
récessive, si le ou les ancêtres communs étaient porteurs d'une mutation délétère récessive.
On dit que deux gènes sont identiques par descendance s'ils sont copiés d'un même gène
ancestral.
La consanguinité augmente le risque de maladie récessive. Donc, le mariage apparenté a
comme risque d'augmenter la fréquence de l'apparition des maladies récessives. Par la suite,
le calcul de risque est en fonction du coefficient de consanguinité.
40
Le coefficient de consanguinité définit par la suite la probabilité que les enfants de cette union
reçoivent effectivement deux fois le même allèle.
41
On distingue deux notions légèrement différentes :
- Deux individus sont apparentés : s’ils ont au moins un ancêtre en commun (lien entre
deux individus) ;
- Un individu est dit consanguin : si ses deux parents sont apparentés (propre à un seul
individu).
Le niveau de consanguinité découle donc du degré de parenté. Statistiquement, plus deux
individus sont apparentés, plus ils auront de gènes en commun, et plus leurs enfants seront
consanguins. On peut relier plus ou moins directement le nombre de gènes en commun et le
degré de parenté.
Remarque: On parle de consanguinité pour un seul gène, mais aussi pour un génotype
complet.
La parenté entre deux individus a pour conséquence la possibilité que ces individus aient
chacun reçu, en un locus quelconque, une copie du même gène présent chez l'ancêtre
commun.
Dans le schéma ci-dessous (Figure 24), Irène et Jules ont reçu chacun une copie du gène
"rouge" que possédait Amédée.
Le coefficient de parenté entre deux individus, i et j, est désigné par rij Le coefficient de
parenté entre deux individus, i et j, est égal à la probabilité pour que deux gènes tirés au
42
hasard au même locus, l'un chez i et l'autre chez j, soient identiques par descendance. Le
coefficient de parenté mesure avec quelle probabilité deux individus peuvent transmettre
chacun dans un de leurs gamètes la copie d'un même gène ancêtre.
r = Pr ( un gène tiré au hasard chez Irène = un gène tiré au hasard chez Jules)
Irène et Jules ne peuvent avoir reçu de copie d'un même gène qu'en provenance d'Amédée,
qui est leur unique ancêtre commun.
On appelle coefficient de consanguinité d’un individu I (FI), la probabilité pour que deux gènes
homologues, soient identiques par descendance mendélienne (hérités d’un même ancêtre
commun) (Figure 25).
r
FI
Figure 25 : Coefficient de parenté (r) entre Irène et Jules et coefficient de consanguinité de
Zoé(FI)
43
Figure 26: Schématisation de l’obtention d’un individu consanguin
On dit que les deux individus A et B sont apparentés car ils possèdent un ancêtre commun Z
(Figure 26). L’individu I, produit de l’accouplement entre A et B, est consanguin car ses deux
parents son apparentés.
Le coefficient de consanguinité de l’individu I (FI), est égal 1/2 coefficient de parenté entre ses
parents A et B (Figure 26).
C’est donc la probabilité que les deux exemplaires d’un gène tiré au hasard chez cet individu
soient identiques par ascendance.
44
2.5.2. Calcul du coefficient de consanguinité (FI)
Si les parents ne sont pas apparentés FI = 0
Dans les autres cas FI est calculé en fonction des degrés de liens entre l’individu et le ou les
ancêtres communs (Figure 28).
1. dessiner l’arbre généalogique
• Les 2 personnes à évaluer (X et Y)
• Les ancêtres communs
• Les intermédiaires
2. Identifier les ancêtres communs
3. Identifier chaque chemin permettant de joindre X à Y via 1 ancêtre commun et
compter le nombre n de sauts.
Coefficient de parenté r:
- Chemin A-P-GP-T-C: Contribution P1 = (1/2)4
- Chemin A-P-GM-T-C: Contribution P2 = (1/2)
4
F=½r
45
Exemple : Nous allons calculer dans le cas où les deux parents sont cousins germains:
Demi-cousins germains
m=2; p=2 , n=1
Le coefficient de parenté r=(1/2)4= 1/16
En cas de mariage entre cousins germains, la probabilité d'avoir un enfant atteint dans le cas
d'une maladie autosomique récessive dans un mariage apparenté :
46
1) En l'absence d'antécédent familial pour cette pathologie :
47
Exemples:
Dans la phénylcétonurie, la fréquence des hétérozygotes est : 1/50
Le risque d’avoir un enfant malade si les parents ne sont pas apparentés est :
1/50 x 1/50 x 1/4 = 1/10000 (fréquence de la maladie)
En cas de mariage entre cousins germains le risque est :
1/50 x 1/8 x 1/4 = 1/1600
Si un hétérozygote épouse sa cousine germaine.
1 x 1/8 x 1/4 = 1/32
Si le frère sain d’un malade épouse sa cousine germaine
2/3 x 1/8 x 1/4 = 1/48
En général, un mariage consanguin est jugé dangereux si : le coefficient de consanguinité
dépasse 1/16 avec coexistence de maladies autosomiques récessives.
48
Figure 29 : Arbre généalogique montrant une pseudodominance de la Drepanocytose.
49
- L'hétérogénéité allélique ou intralocus qui rend compte du fait qu'une maladie peut
être due à des mutations différentes (alléliques) dans le même gène (une maladie / plusieurs
allèles morbides). C'est ainsi que l'on connaît plus de 1900 mutations différentes du gène CFTR
impliqué dans la mucoviscidose.
50
Probabilité que II-3 soit hétérozygote = 1/2
Probabilité que II-4 soit hétérozygote = 1/22
Probabilité que III-3 soit atteint =
1/2 X 1/22 X 1/4= 1/176,
alors que couple population générale
1/2 000
51
C’est ainsi que pour les gènes soumis à l'empreinte (inactivation) paternelle, seul l'allèle
maternel est exprimé. Pour les gènes soumis à l'empreinte (inactivation) maternelle, seul
l'allèle paternel est exprimé.
L'empreinte a lieu au cours de la formation des cellules sexuelles. Elle est donc refaite avant
chaque fécondation. La séquence des bases de son ADN n’est pas modifiée, mais son
épigénome (ce qui est au-dessus du génome) peut l’être. Cette inactivation correspond à une
modification épigénétiques qui ne modifie pas la séquence nucléotidique mais entraine une
modification du comportement de cette séquence.
Les mécanismes de l’empreinte peuvent être :
Méthylation
Compaction de la chromatine
Fixation de facteurs protéiques
Acétylation des histones
L'empreinte parentale est caractérisée par une absence d'altération de la séquence des gènes
et par une réversibilité à chaque génération. Lorsqu'un homme transmet à ses enfants un
gène soumis à empreinte paternelle (EG), ce gène sera inactif quel que soit le sexe de cet
enfant. Si ce gène est transmis par son fils, il continuera à être inactif puisque soumis à
nouveau à une empreinte paternelle. Par contre, s'il est transmis par sa fille, il sera à nouveau
actif puisque l'empreinte sera reconfigurée selon le sexe féminin.
52
Une région du chromosome 15, soumise à empreinte parentale, contient :
- le gène PW, impliqué dans le syndrome de Prader-Willi, soumis à empreinte maternelle. Ce
gène n'est donc exprimé que sur le chromosome d'origine paternelle.
Le de Syndrome de Prader-Willi 1/10000 : Causes : perte de fonction des gènes PW
(expression paternelle). Retard psychomoteur, retard de langage et d’apprentissage,
comportement alimentaire impulsif, hypotonie, hypogonadisme.
- le gène A, impliqué dans le syndrome d'Angelman, soumis à empreinte paternelle. Ce gène
n'est donc exprimé que sur le chromosome d'origine maternelle.
Syndrome d’Angelman 1/20000 : Cause : perte de fonction du gène UBE3A (expression
maternelle). Déficit mental sévère, langage absent, aspect joyeux, rires immotivés, ataxie,
motricité saccadée, épilepsie.
Le mode de transmission des phénotypes dépendant de gènes sous empreintes parentales est
particulier car, bien qu'il soit autosomique, il dépend aussi du sexe.
53
La Figure 33 montre que les deux sœurs porteuses de la délétion de la région du chromosome
15 impliquée dans le syndrome d'Angelman (II-2 et II-4) ont la moitié de leurs enfants
malades. Leur frère (II-5) n'a que des enfants sains puisqu'il a transmis un gène à empreinte
paternelle mais que son épouse a transmis un gène actif. Leur plus jeune sœur (II-8), ayant
hérité d'un chromosome maternel non délété (et donc actif), n'aura elle aussi, que des enfants
sains. Ces observations sont conformes au mode autosomique avec empreinte paternelle.
54
3. Hérédité liée au sexe
3.1. Définitions
Un caractère lié au sexe est déterminé par un gène porté par un gonosome. En plus des 22
paires d’autosomes, la femme possède deux chromosomes X, elle est dite homogamétique
(produit un seul type de gamètes). L’homme a un chromosome X et un chromosome Y, il est
dit hétérogamétique (produit deux types de gamètes).
La plupart des maladies liées au sexe sont transmises par le chromosome X. Les chromosomes
X et Y n’ont qu’une très petite partie commune. Les maladies dont le gène est localisé sur le
chromosome X se transmettent le plus souvent sur le mode récessif lié à l'X. Certaines
maladies sont transmises sur le mode dominant lié à l'X.
Figure 34 : Chromosomes X et Y
Les caractères déterminés par des allèles portés par cette portion homologue: pseudo-
autosomique (PAR 1 et PAR 2) sont indirectement liés au sexe et ils se comportent comme
les caractères autosomiques. Par contre, les caractères portés par les portions non
homologues sont directement liés au sexe et leur génétique est particulière.
Etant donné que le chromosome X est nettement plus grand que le chromosome Y, les
caractères liés au sexe sont presque toujours portés par le gonosome X. Une mutation sur le
chromosome Y sera automatiquement transmise du père à son fils et ne sera jamais retrouvée
chez une femme.
55
Les chromosomes X et Y ont en commun des petites régions dites séquences homologues
PAR1 et PAR2, au niveau des extrémités distales des bras court (p) et au niveau des bras long
(q). Les gènes de ces régions se comportent comme des gènes autosomiques: on parle de
transmission pseudo-autosomique.
Un phénotype influencé par le sexe se dit d’une maladie autosomique qui s’exprime chez les
deux sexes, mais avec des fréquences inégales. La calvitie par exemple est plus fréquente chez
les hommes que chez les femmes.
Un phénotype limité au sexe concerne des maladies autosomiques mais qui ne se manifestent
que chez un seul sexe. Exemple les mutations du gène AURKC, en particulier l’anomalie
entrainent chez les hommes une infertilité avec un profil particulier au spermogramme
(spermatozoïdes macrocéphales et multiflagellés). Le phénotype des femmes est normal.
56
Pour sa part, le chromosome X humain, séquencé en 2005, est un grand chromosome de 155
Mb qui contient environ 2000 gènes . Chez les femmes, le chromosome X représente presque
5% de tout l’ADN et chez les hommes, qui ont seulement un chromosome X, il représente
environ 2,5% de tout l’ADN.
Les individus de sexe masculin n'ont qu'un seul chromosome X : ils sont hémizygotes et ne
possèdent qu'un seul exemplaire des gènes du chromosome X. Par contre, les femmes
possèdent deux chromosome X et deux exemplaires de chacun des gènes localisés sur le
chromosome X.
Ceci présente des conséquences pour les maladies liées à un gène du chromosome X. C’est le
cas de la question de la dominance ou de la récessivité ne se pose pas chez les individus de
sexe masculin. C’est ainsi soit le gène est muté et les individus sont atteints, soit le gène est
normal et ils sont sains.
On contrepartie, la question de la dominance ou de la récessivité se pose chez les individus de
sexe féminin. C’est ainsi si la maladie survient quand un seul gène est muté, elle est
dominante. Par contre si la maladie survient seulement quand les deux exemplaires sont
mutés, elle est récessive.
57
3.4. L’inactivation du chromosome X (Théorie de Mary Lyon, 1961)
L’un des deux chromosomes X des cellules somatiques d’une femme (46, XX) est inactivé
(Processus d’extinction transcriptionnelle). Cette inactivation se produit au hasard et porte
soit sur le chromosome X d’origine maternelle (Xm), soit sur le chromosome X d’origine
paternelle (Xp).
L’inactivation survient à un stade précoce du développement embryonnaire et se transmet de
façon stable et irréversible au cours des divisions cellulaires. Quel que soit le nombre de
chromosomes X dans les cellules somatiques, un seul chromosome X est actif.
Les femmes hétérozygotes Aa pour un gène récessif lié au chromosome X sont habituellement
asymptomatiques. Cependant dans certains cas, en particulier lorsqu'il existe une inactivation
préférentielle du chromosome X normal, la maladie s'exprimera avec une sévérité variable en
fonction du degré d'inactivation de l’X normal.
58
4. Hérédité récessive liée à l’X (RLX)
4.1. Définition
Un gène récessif lié à l’X se manifeste presque exclusivement chez le garçon hémizygote qui
ne possède qu’un seul chromosome X. Un allèle morbide récessif porté par le chromosome X
ne sera pas exprimé à l’état hétérozygote chez une femme XMXm (XM = allèle sain dominant
et Xm = allèle morbide récessif), on parle d’une femme porteuse saine, alors qu’un homme
ne pourra qu’être sain (XMY) ou atteint (XmY), mais jamais porteur sain.
Dans le cas de ces maladies, les hommes sont donc beaucoup plus fréquemment touchés que
les femmes (pour lesquelles il faut que les deux parents soient porteurs de l’allèle malade).
Remarque : Chez la fille le gène ne se manifesterait que dans certaines situations rares
(homozygotie, inactivation préférentielle du chromosome porteur du gène normal).
La transmission des maladies liées à l'X est différente suivant que le parent atteint est le père
ou la mère
4.1.1. Transmission par la mère
Une femme hétérozygote conductrice a un risque de 50% de transmettre son chromosome X
portant l'allèle qui cause la maladie à chacun de ses enfants.
- Ses filles ont un risque de 50% d'être conductrices : les filles pouvant être homozygotes
saines (XA/XA) ou hétérozygotes (XA/Xa).
- Ses fils ont un risque de 50% d'être atteints : la présence d’un seul de ces allèles (Xa)
suffira à déclencher la maladie chez l’homme (Xa/Y).
59
Figure 39 : Mode de transmission de l’hémophilie
Exemple : Hémophilie (Figure 39)
Certains membres de la famille suivante sont atteints de l'hémophilie, une maladie
caractérisée par une absence de coagulation sanguine due à la mutation d'un gène codant
pour un facteur de coagulation.
Dans cette famille, on constate que seuls les hommes sont atteints. Il n'y a aucune
transmission père-fils. Toutes les filles d'un homme malade sont conductrices. La moitié
environ des fils d'une femme conductrice sont malades. Toutes les filles d'une femme
conductrice ne sont pas conductrices.
4.2. Critères de reconnaissance d’une maladie RLX
60
Cette inactivation (lyonisation) se produit au hasard et porte soit sur le chromosome X
d’origine maternelle (Xm), soit sur le chromosome X d’origine paternelle (Xp). L’inactivation
de l’un des X intervient très tôt au cours de l’embryogenèse 7-10 j post fécondation.
- Le choix de l’X se fait au hasard dans chaque cellule, on a donc une chance sur deux que ce
soit l’X paternel ou l’X maternel qui soit inactivé.
- Transmission clonale d’une cellule à l’autre (irréversible dans les cellules somatiques).
- Réversible : uniquement dans les cellules germinales, au cours de la gamétogenèse chaque
ovule reçoit une copie active du chromosome.
L’inactivation d’un des X chez la femme permet une égalisation entre l’homme et la femme
de la transcription des protéines au niveau des chromosomes X.
61
La femme est une véritable MOSAIQUE PHYSIOLOGIQUE, ce qui veut dire qu’elle a:
- Une certaine proportions de cellules (50%) dans lesquelles son chromosome X d’origine
paternel est fonctionnel.
- Une certaine proportion de cellules (50%) dans lesquelles son chromosome X d’origine
maternelle est fonctionnel ; le ratio d’inactivation est proche de 50/50.
Chez les femmes porteuses d’une mutation liée à l’X, la proportion de cellules
fonctionnellement normales est généralement suffisante pour les protéger des effets
cliniques de cette mutation.
4.3.2. Les biais d’inactivation
Parfois, l’un des chromosomes est préférentiellement inactivé (le X maternel, Xm). La
majorité des cellules expriment alors les gènes de l’autre X (paternel, Xp) et l’on parle ici d’un
biais d’inactivation du chromosome X.
On parle de biais d’inactivation lorsque le même chromosome est actif dans 70% des cellules
ou plus à biais d’inactivation favorable ou défavorable. Si le biais est défavorable alors on peut
avoir une manifestation chez la femme. Ce mécanisme d'inactivation explique que certaines
conductrices expriment des signes, d'autres non.
62
Exemple: La Myopathie de Duchenne
La myopathie de Duchenne touche 1 garçon sur 3000. Le gène en cause est le gène de la
dystrophine qui est très long (2,3 méga bases), le locus concerné est sur le chromosome
(Xp21). Il est organisé en 79 exons séparés par des introns de taille très variable. Il est transcrit
en un ARNm de 14 kb qui code pour une protéine : la dystrophine.
La myopathie de Duchenne (MD) correspond à une inactivation totale du gène donc la
protéine est absente. La dystrophie musculaire de Duchenne est une maladie génétiquement
létale = maladie dans laquelle les individus atteints n’ont pas de descendance donc pas de
transmission. Particularités de cette maladie : il y a taux très élevé de mutations de novo et
on peut aussi voir des cas de mosaïques germinales.
Schéma des chromosomes d'une femme atteinte de dystrophie musculaire de Duchenne,
hétérozygote pour une translocation réciproque entre le chromosome X et le chromosome
21. Le point de cassure de la translocation a fragmenté un allèle DMD+, le rendant ainsi non
fonctionnel. L’inactivation du chromosome X normal a également rendu non fonctionnel
1'allele D: MD+ intact.
Un biais d’inactivation en faveur de l’X anormal, la population ayant l’X normal subissant une
pression de sélection négative. C’est le chromosome X normal qui va s’inactiver.
4.3.3. Consanguinité
Les mariages entre apparentés donne des enfants consanguins, plus souvent homozygotes
qu'un enfant non consanguin. Cela augmente le risque que les filles soient atteintes d'une
maladie récessive liée à l'X.
Exemple : Maladie de Fabry : La maladie de Fabry est une maladie qui associe des atteintes
dermatologiques et cardiaques dues à un déficit en alpha-galactosidase A.
63
4.3.4. Fréquence
L’équation de Hardy-Weinberg est aussi applicable à l’hérédité récessive liée à l’X :
La fréquence des hommes atteints est donnée par la fréquence du gène q ;
La fréquence des femmes conductrices est de 2pq (fréquence des hétérozygotes)
La fréquence des femmes bien portantes est de p2 + 2pq (homozygotes saines et
hétérozygotes).
Distribution: [AA] = p2 [Aa] = 2 pq [aa] = q2
Si la fréquence de l’allèle Xa = q ; alors la fréquence des hommes atteints sera q (XaY)
Et la fréquence des femmes atteintes sera q2 (XaXa).
Exemple 1 : Hémophilie A.
Un homme sur 10.000 est touché dans une collection de 10.000 chromosomes X masculins,
un seul chromosome contiendra la mutation responsable de la maladie q= 0,0001.
Les femmes homozygotes affectées se rencontrent de manière exceptionnelle, dans la mesure
où q2 = 0,00000001, soit 1/100 000 000.
D’une manière générale, les hommes sont plus fréquemment affectés par des maladies
récessives liées au sexe que les femmes.
Exemple 2 : Daltonisme.
1 homme / 30 ; fréquence de l’allèle malade : q = 1/30 ; p = 29/30
La fréquence des Femmes :
• Homozygote Normales est (29/30)2
• Homozygotes atteintes est (1/30)2 = 1/900
• Conductrices est 2pq ≈ 2q = 1/15
La fréquence des hommes atteints est donnée par la fréquence du gène q ; la fréquence des
femmes conductrices est de 2pq (fréquence des hétérozygotes) et la fréquence des femmes
bien portantes est de p2 +2pq (homozygotes saines et hétérozygotes).
4.3.5. Détection des femmes conductrices (hétérozygotes)
Dans une famille touchée par une maladie RLX, le dépistage des conductrices est essentiel en
raison du risque de transmission et des possibilités éventuelles de diagnostic prénatal. Cette
détection peut se faire:
- En recherchant des signes cliniques ou biologiques mineurs de l'affection en cause
(dosage sanguin des enzymes musculaires dans la dystrophie musculaire de Duchenne ou
dosage de l’activité du facteur VIII dans l'hémophilie A). Ce type de détection n’est possible
que pour certaines maladies et toutes les conductrices n’expriment pas d’anomalie.
- Par la biologie moléculaire quand le gène ou sa localisation sont connus.
64
Remarque: Comme pour l'hérédité dominante, il y a aussi des mutations de novo. Une femme
qui a un enfant avec une maladie liée à l'X n'est pas forcément porteuse de la mutation
Conductrices obligatoires :
Il y a des situations où ce n'est pas la peine de faire de la biologie moléculaire pour savoir que
ces femmes sont conductrices obligatoire. Il suffit d'étudier l'arbre généalogique.
Trois exemples de femmes conductrices obligatoires :
1. Une femme qui a deux garçons atteints.
2. Une femme qui a sur 2 générations un frère atteint et un enfant atteint.
3. La fille d'un homme atteint.
65
Mutations de novo:
Comme pour les maladies dominantes, la mutation DE NOVO sur le chromosome X se passe
très tôt au niveau du développement embryonnaire, et le plus souvent dans un gamète
parental (maternel dans ce cas) totalement sain et non porteur de la mutation.
Une mutation survenue au cours de la méiose masculine peut donner naissance à une fille
conductrice; une mutation survenue au cours de la méiose féminine peut donner soit une fille
conductrice soit un garçon atteint.
Mosaïques germinales :
Se sont une exception à la règle de l'hérédité récessive liée à l'X. C’est ainsi une femme non
conductrice peut être porteuse d'une mosaïque germinale. Il peut y avoir une mutation DE
NOVO qui soit survenu tôt au cours de la formation des gamètes maternelles (parents
cliniquement sains). Théoriquement si la mutation est apparue au niveau d’un gamète
primordial, il peut y avoir une mosaïque germinale.
La mère d’un enfant atteint d’une maladie liée au chromosome X n’est pas obligatoirement
hétérozygote. La maladie peut alors réapparaître chez un deuxième enfant de la fratrie alors
que l’absence d’antécédent familial était en faveur d’une néomutation.
Chez la personne atteinte, on ne peut pas évaluer le risque réellement pour ses frères et
sœurs, ce risque va donc de 0 à 50%.
En conclusion : Dans les maladies récessives liée à l’X, le dépistage des femmes conductrices
est très important pour le conseil génétique, on retrouve 2 situations majoritaires :
- Un couple ayant déjà eu un garçon atteint : Il faut donc déterminer si la mère est conductrice
ou pas
• Soit la mère n’est pas conductrice, il s’agit d’une mutation de novo, le risque d’avoir
un second enfant malade est très faible quasiment négligeable.
• Soit la mère n’est pas conductrice mais porteuse d’une mosaïque germinale ; on ne
peut pas évaluer le risque réellement, il va donc de 0 à 50%.
• Soit la mère est conductrice, son risque d’avoir un second enfant malade est donc
d’1/2.
66
- Un couple qui n’a pas eu d’enfant atteint mais où la maladie existe dans la famille: on
dépiste par un calcul du risque à priori par rapport à l'arbre généalogique puis on réalise une
analyse moléculaire.
- Femmes atteintes deux fois plus fréquentes que les hommes atteints, sévérité en fonction
du biais d'inactivation.
- Les deux sexes peuvent être touchés par la maladie.
- En général, les filles hétérozygotes sont moins sévèrement malades que les garçons.
- Les femmes atteintes peuvent transmettre leur maladie aux enfants des deux sexes avec
un risque de 1/2.
- Dans la descendance d’un homme atteint toutes les filles reçoivent le gène muté ; en
revanche, il n’y a jamais de garçon atteint (pas de transmission père-fils).
- Comme pour l'hérédité AD, la pénétrance peut être incomplète et l'expressivité variable.
Exemple 1 : Rachitisme vitamino-dépendant (Figure 46) est une maladie qui se traduit par
un déficit en phosphate à l'origine de fragilités osseuses
On constate que toutes les filles d'un homme atteint sont atteintes, mais qu'il n'y a pas de
transmission père-fils. Par contre, tous les enfants d'une femme atteinte ne sont pas malades.
Il y a plus de femmes atteintes que d'hommes atteints. Ces observations sont conformes au
mode dominant lié à l'X.
A chaque grossesse d'une mère atteinte, le risque que l'enfant, fille ou garçon, soit malade
est de 50%. Les enfants sains ne "transmettent" pas la maladie.
67
Exemple 2 : Déficit en ornithine carbamyl transférase (Figure 48).
Le déficit en ornithine carbamyl transférase est un déficit enzymatique.
Sur cet arbre, les filles faiblement atteintes (I-2, II-2 et III-4) ont été représentées par un
symbole de couleur plus claire que les filles souffrant de symptômes graves (II-4 et III-2). La
transmission est verticale et il n'y a pas de transmission père-fils. Ces observations sont
conformes au mode dominant lié à l'X, avec mosaïcisme somatique dû à l'inactivation de l'X.
5.2.1. Définition
Pour quelques maladies dominantes liées à l'X, l'absence d'un allèle normal est létal avant la
naissance. Le développement du fœtus exige la protéine fonctionnelle que le gène muté ne
peut fournir. Pour cette raison, il n'y a aucune naissance de garçon atteint, et la maladie
affecte seulement les femmes, qui ont un risque de 50% de la transmettre à chacune de leurs
filles mais ne peuvent la transmettre à aucun de leurs fils.
Il y a théoriquement moitié moins de naissances de garçons et plus de fausses couches dans
ces familles, mais la taille des fratries humaines permet rarement de le mettre en évidence.
68
Exemple 3 : Syndrome Incontinentia Pigmenti
On constate qu'il n'y a que des femmes qui sont malades. Il y a moins de garçons que de filles
dans la descendance des femmes atteintes : le syndrome Incontinentia Pigmenti n'est donc
pas viable pour les fœtus mâles.
Ces observations sont conformes au mode lié à l'X dominant avec létalité pour les fœtus de
sexe masculin
Exemple 4: Syndrome de l’X-fragile
Le syndrome de l’X-fragile est la cause la plus fréquente du retard mental héréditaire. Elle
représente la deuxième cause du retard mental après la trisomie 21; son incidence est estimée
à environ 1/4000 chez les hommes, mais il est également responsable d’un retard mental léger
à modéré chez une femme sur 7000 environ.
Il s’agit d’une affection dominante liée à l’X dont les manifestations et l’hérédité sont
inhabituelles : en effet, des hommes normaux peuvent être porteurs et transmetteurs et des
femmes peuvent exprimer la maladie.
Le gène FMR1 (Fragile X Mental Retardation 1), localisé au locus FRAXA en Xq27.3 est formé
de plusieurs exons dont le premier contient une répétition de triplets CGG. Ce gène est
précédé en 5’ par un « ilôt CPG » normalement non méthylé sur le chromosome X de l’homme
et méthylé uniquement sur l’X inactivé de la femme.
L’anomalie moléculaire consiste en une expansion instable de la répétition de trinucléotides
(CGG) pouvant augmenter au fil des générations. La zone des triplets CGG à amplification
variable est située dans la région 5’ non codante du premier exon du gène FMR-1. Celui-ci se
trouve immédiatement en aval du site anormalement méthylé chez les malades. Le gène
FMR1 comporte 17 exons et s’étend sur 38 kb.
Le gène FMR1 et les îlots CpG en amont sont alors méthylés. Ces modifications épigénétiques
empêchent la transcription du gène, d’une part à travers un défaut de liaison de facteurs de
transcription, et d’autre part à travers une condensation de la chromatine en amont du gène.
En fonction du nombre de répétitions, on peut décrire trois types de situations :
- Entre 6 et 50 : il s’agit de variations normales, l’allèle le plus répandu dans la population
étant de 30 répétitions. Cet état est stable d’une génération à l’autre.
- De 51 à 199, on parle de prémutation; lorsque la mère la transmet, l’expansion
augmente de taille alors que le père transmet la prémutation sans modification
notable de la taille de l'expansion.
- De 200 à plus de 1000, l’expansion s’associe à une méthylation de l’ilôt cpg (mutation
complète) conduisant à une absence de transcription du gène fmr1 avec absence de
production de la protéine fmrp.
69
Mode de transmission de la maladie
Les études familiales ont montré que la transmission des allèles prémutés en allèles mutés ne
se fait que par transmission maternelle. Cette transmission maternelle s’explique par
l’instabilité des prémutations et des mutations au moment d’ovogenèse. Le risque de
transition à un allèle muté est délicat à définir, puisqu’il va dépendre de la taille initiale de
l’allèle prémuté.
L’absence de transmission paternelle pourrait s’expliquer par l’existence d’un processus de
réversion limitant la taille de l’expansion dans la lignée germinale mâle.
- Tous les garçons porteurs de cette maladie ont forcément une mère porteuse de la
mutation.
- Les femmes porteuses d’une prémutation et transmettant cette prémutation
entraînent un risque accru de mutation chez les descendants.
- Les hommes porteurs d’une prémutation et transmettant cette prémutation
n’entraînent pas de risque accru de mutation chez les descendants.
70
7. Conclusion générale
71
III. Hérédité multifactorielle
1. Combinaison de multiples facteurs génétiques (polygéniques) et
environnementaux
Une maladie multifactorielle n'est pas mendélienne parce qu'elle dépend à la fois de plusieurs
gènes simultanément et de facteurs de l'environnement. Sa transmission ne présente donc
pas les probabilités de risque observables chez les maladies mendéliennes. De plus,
contrairement aux maladies mendéliennes où il y a dysfonctionnement d'un gène, il n'y a pas,
à proprement parler de dysfonctionnement des gènes impliqués dans une maladie
multifactorielle (il n'y a pas de mutation délétère ou pathologique).
Dans une maladie multifactorielle, c'est la combinaison particulière d'allèles « normaux » de
certains gènes qui est pathologique (comme peut être pathologique l'association de plusieurs
médicaments, sans danger pris isolément).
Des maladies communes (le diabète, l’obésité, l’hypertension artérielle, les allergies, les
malformations congénitales et certains cancers) sont plus fréquemment observées dans
certaines familles que dans d’autres. Mais la transmission de ces maladies n’est compatible
avec aucune ségrégation mendélienne. On explique cette concentration familiale par un
déterminisme multifactoriel de la maladie avec une contribution de facteurs génétiques et
environnementaux.
On suppose dans ces conditions l’existence d’une variable «non mesurable» qui est «la
susceptibilité» de l’individu à la maladie. Cette variable dépendrait de plusieurs gènes
(polygénie) et de facteurs apportés par le milieu.
Les apparentés d’un patient partagent avec lui un certain nombre de gènes de susceptibilité,
on y trouve parmi eux une proportion plus grande de personnes malades.
Tableau 4: Différences entre les maladies monogéniques et les maladies multifactorielles
72
2. Maladies multifactorielles de l’adulte
Exemple : Cancer du sein
Facteurs génétiques :
- Le risque est augmenté par 2 si la femme présente un parent du 1er degré affecté
- Le risque augmente encore si plusieurs parents sont affectés ou si les parents ont développé
un cancer avant 45 ans.
- Gènes majeurs de prédisposition : BRCA1 et BRCA2
Facteurs environnementaux aggravant le risque:
- 1ère grossesse après 30 ans, alcool et oestrogénothérapie substitutive.
73
IV. Maladies mitochondriales
Les cellules possèdent, outre le génome nucléaire, un deuxième système génétique constitué
par les génomes mitochondriaux. Les mitochondries sont des petits compartiments cellulaires
où la consommation d'oxygène permet à la cellule de trouver sa source d'énergie.
74
Tous les enfants d'une femme atteinte sont malades. En revanche, les hommes ne
transmettent pas du tout la maladie à leur descendance. Ces observations sont conformes au
mode de transmission d'une maladie mitochondriale.
Risques pour la descendance :
Tous les enfants d'une femme malade seront atteints.
Tous les enfants d'un homme malade seront sains.
Homoplasmie – Hétéroplasmie
Le terme d’homoplasmie désigne la présence de molécules d’ADNmt identiques chez un
individu ou dans un tissu. Lorsqu’une altération génomique survient, la cellule contient un
mélange d’ADNmt sauvage et muté : on parle d’hétéroplasmie. Le phénotype d’une cellule
est fonction de la proportion de l’ADNmt muté et les degrés de dépendance de la cellule vis à
vis de la fonction mitochondriale. Cependant, les manifestations de la maladie peuvent être
très variables d'un sujet à l'autre, et il est difficile de connaître le risque exact pour un sujet
donné.
Figure 51 : Hétéroplasmie.
75
Une femme dont seulement 10% des mitochondries ont la mutation causant la maladie peut
être asymptomatique, et avoir un enfant dont 80% des mitochondries seront non-
fonctionnelles et qui sera sévèrement atteint, comme avoir un enfant dont 5% des
mitochondries seront non-fonctionnelles et qui sera également asymptomatique.
Exemple : Syndrome de MELAS
Dans la famille suivante, plusieurs personnes ont le syndrome de MELAS, une maladie qui
associe une atteinte musculaire, cérébrale et une acidose lactique.
La mère (I-2) n'est pas symptomatique, et seuls deux de ses enfants sont malades. Sa fille
malade (II-4) a tous ses enfants malades. Son autre fille (II-6) qui ne manifeste pas le syndrome
a certains de ses enfants malades. Cela signifie qu'elle a hérité de mitochondries mutées, en
quantité insuffisante pour avoir elle-même la maladie, mais suffisante pour pouvoir
transmettre une proportion pathologique de mitochondries mutées à deux de ses enfants, en
fonction de la proportion de mitochondries pathogènes contenues dans l'ovule fécondé. On
remarque l'absence de transmission père-enfants.
Ces observations sont conformes au mode mitochondrial avec hétéroplasmie variable.
76
V. Maladies génétique des cellules somatiques
Contrairement aux trois catégories de maladies génétiques exposées, où l’anomalie génétique
est retrouvée dans l’ADN de toutes les cellules de l’organisme, y compris les cellules
germinales, et peut être transmise aux générations suivantes, ces maladies génétiques ne
surviennent que dans les cellules somatiques spécifiques.
Le modèle en est le cancer, état dans lequel le développement de la malignité est la
conséquence de mutations dans les gènes contrôlant la croissance cellulaire. Le cancer (ou
tumeur maligne) est lié à la prolifération anarchique et incontrôlée des cellules résultant d’une
perturbation de l’homéostasie tissulaire qui est un fragile équilibre entre la prolifération
cellulaire ; la différenciation ou la spécialisation irréversible des cellules et l’élimination par
sénescence ou par apoptose. La transformation néoplasique résulte d’une perturbation de ce
fragile équilibre.
77
VI. Le caryotype humain et ses anomalies
1. Introduction
Depuis 1959 date de la mise en évidence de la première anomalie chromosomique chez
l’homme, la trisomie 21, l’étude des chromosomes humains a permis de mettre en évidence
de très nombreux remaniements chromosomiques.
Ces remaniements chromosomiques peuvent être constitutionnels ou acquis. Les
remaniements constitutionnels sont présents dès la conception ou se forment lors des
premières divisions du zygote. Les remaniements acquis, sont des remaniements qui vont
apparaître au sein d’une cellule au cours de la vie. Dans la majorité des cas, ces remaniements
acquis sont trouvés dans les cellules tumorales.
Les remaniements chromosomiques sont très nombreux, peuvent toucher tous les
chromosomes et être équilibrés ou déséquilibrés. Il est classique de distinguer les anomalies
de nombre qui résultent d’une mauvaise répartition des chromosomes lors d’une division
cellulaire ou d’une anomalie de la fécondation et les anomalies de structure qui impliquent
une ou plusieurs cassures chromosomiques suivies d’un recollement anormal.
78
- Les anomalies de structure qui impliquent une ou plusieurs cassures chromosomiques suivies
d’un recollement anormal :
Les délétions
Les translocations
Les inversions
Les duplications
Une anomalie chromosomique peut être :
- Homogène: présente dans toutes les cellules d’un individu.
- En mosaïque: présente dans une sous population cellulaire. C’est une anomalie
postzygotique : mos 45, X/46, XX mos 45, X/47, XXX/46, XX
79
Cellule humaine : 2m d’ADN, pour un noyau de 6 μm de diamètre ; Equivalent : 40 km d’un
fil très fin dans une balle de tennis.
Empaquetage de l’ADN est réalisé par des protéines spécifiques qui la plient en une pelote
très bien organisée (chromatine, chromosome).
Génome humain = 3.2×109 nucléotides, 24 chromosomes ; Exp: chromosome 22 (2 μm) :
48 millions de paires de nucléotides = 1.5 cm d’ADN.
Les chromosomes, visibles seulement pendant la division cellulaire, sont composés de
fibres de chromatine étroitement empaquetées.
L’ADN est enroulée autour des histones (protéines).
La combinaison d’ADN et d’histones s’appelle la chromatine.
La chromatine se condense pour former les chromosomes.
Le complexe « ADN-Protéines » s’enroule en une spirale plus au moins serrée selon le stade du
cycle cellulaire.
Pendant l’interphase : la spirale est relâchés, les chromosomes ne peuvent pas être distingués car
ils sont étirés et emmêlés ressemblant à une pelote de laine: la chromatine
Pendant la division cellulaire : la spirale se condense encore plus pour atteindre un degré maximum
de compaction de chromosomes qui seront visibles.
Les chromosomes, visibles seulement pendant la division cellulaire, sont composés de fibres de
chromatine étroitement empaquetées.
Le nombre de gènes localisés dans l'hétérochromatine est faible par rapport à celui contenu
dans l’euchromatine.
On distingue:
-L'hétérochromatine constitutive qui contient peu de gènes, formée principalement de
séquences répétées et dont les plus grandes régions sont situées à proximité des centromères
et des télomères.
-L'hétérochromatine facultative qui contient des régions codantes pouvant adopter les
caractéristiques structurale et fonctionnelle de l'hétérochromatine, comme le chromosome
X inactif chez la femelle des mammifères.
Dans la chromatine eucaryote, une quantité importante de protéines est associée à l’ADN
chromosomique pendant toutes les phases du cycle cellulaire. Ces protéines sont d’une part
les histones, basiques et chargées positivement, et d’autre part des protéines de charge
positive plus faible appelées protéines non histones.
Les histones jouent un rôle structural prépondérant, et un rôle important dans la
condensation de l’ADN en nucléosomes composant la chromatine. L'unité fondamentale de la
chromatine est appelée le nucléosome qui est composé d'ADN et d'histones. Il constitue le
81
premier niveau de compaction de l'ADN dans le noyau. Cette structure est ensuite
régulièrement répétée pour former le nucléofilament qui peut, lui-même, adopter des
niveaux d'organisation plus compacts, le niveau de condensation le plus élevé étant atteint au
sein du chromosome métaphasique.
82
2.2. Les chromosomes
83
Les centromères sont indispensables à la ségrégation des chromosomes. La position du
centromère définit l’indice centromérique IC :
84
Marques du chromosome : Les structures stables et importantes qui peuvent être
utilisées pour identifier les différentes régions du chromosome individuel, inclut les
centromères ; les télomères et les bandes évidentes.
Donc pour la précision d’une zone sur un chromosome, on utilise : le numéro du chromosome,
bras court ou bras long, région, bande, sous bande.
Exemple : 3q 1, 3, 1 : bras long du ch. 3, région 1, bande 3, sous bande 1 (Figure 61).
3. Le caryotype humain
Le caryotype est l’identification et le classement des chromosomes d’un individu. C’est donc
la configuration chromosomique d’un sujet. Les chromosomes sont la forme de regroupement
que prend la chromatine nucléaire lors de la mitose, afin d’être facilement distribué aux 2
cellules filles et de façon équitable. La morphologie et le nombre de chromosomes sont
constants et caractéristiques de l’espèce considérée. Notre espèce possède 46 chromosomes
disposés en 23 paires.
Le caryotype révèle un grand intérêt notamment en cytogénétique dont il est l’examen clef.
Son étude permet de diagnostiquer les anomalies ou aberrations chromosomiques. Il s’agit
d’une analyse relativement lourde et onéreuse. En conséquence, les indications doivent être
soigneusement réfléchies.
Le CARYOTYPE est l’équipement chromosomique (nombre et forme des chromosomes)
caractéristique d’une espèce.
85
3.1. Principe et technique de caryotype
Les chromosomes ne sont visibles que dans les cellules en division, au stade de la métaphase.
On fait donc appel à :
- Soit à des cellules à haute indice de division : cellules cancéreuses, cellules de la moelle
hématogène.
- Soit à des cellules en culture (bas indice de division) : on utilise en routine : les lymphocytes
sanguins.
On peut aussi utiliser des fibroblastes cutanés, cellules amniotiques chez le fœtus ou cellules
tumorales.
3.1.1 Les modalités techniques : cytogénétique classique
- Mise en culture (après prélèvement veineux) de 5 à 10 gouttes + sérum + un mitogène
(PHA) + antibiotique.
- Blocage des cellules en métaphase par la colchicine, après 2 – 3 jours de culture à 37°C.
- Choc hypotonique : pour disperser les chromosomes (KCl).
- Fixation par un mélange Alcool – Acide. acétique.
- Etalement sur une lame.
- Observation au microscope optique après marquage en bandes (=coloration).
- Les meilleures mitoses sont photographiées et les chromosomes sont alors découpés et
classés par paires.
- Les techniques de marquage par bandes : permettent de mettre en évidence 400 à 500
bandes de topographie constante et caractéristiques d’une paire chromosomique
donnée.
3.1.2. Critères de classement des chromosomes
Les chromosomes humains sont classés en fonction de leur taille et de la position du
centromère qui définit l’indice centromérique IC: p/(p+q). De plus, présence ou l’absence de
satellite et la position des différentes bandes.
Les chromosomes humains sont classés en 7 groupes :
Tableau 5: Groupes de classification des chromosomes humains
86
3.2. Avantages et limites du caryotype
87
4. Les anomalies chromosomiques
• Les anomalies constitutionnelles : Elles sont présentes dès la conception ou se forment
lors des premières divisions du zygote. Les différents organes (l'ensemble de l'individu) ont la
même anomalie. On distingue classiquement :
Les anomalies de nombre qui résultent d’une anomalie de la fécondation ou d’une
mauvaise répartition des chromosomes lors d’une division cellulaire, le caryotype
est toujours déséquilibré lors d'une anomalie de nombre
Les anomalies de structure qui impliquent une ou plusieurs cassures
chromosomiques suivies d’un recollement anormal.
Equilibrée : s’il n'y a ni perte ni gain de matériel génétique
Déséquilibrée : s’il en résulte une délétion et/ou une duplication d'un fragment.
• Les anomalies acquises : Un seul organe est touché, les autres organes sont normaux.
L'accident chromosomique s'est produit au cours de la vie de l'individu. Le sujet est porteur
d'un processus cancéreux sur l'organe impliqué
Une anomalie chromosomique peut être aussi:
• Homogène: si toutes les cellules du tissu examiné portent la même anomalie.
Exemple 1: Une anomalie constitutionnelle survenue chez un gamète parental (ex: + 21) se
retrouvera chez toutes les cellules de l'enfant descendant (ex: trisomie 21 homogène).
• En mosaïque: si certaines cellules du tissu examiné portent l'anomalie alors que d'autres
sont normales (notion de clone).
Exemple 1: une anomalie constitutionnelle survenue chez le zygote après plusieurs divisions
cellulaires (ex: +21) ne touchera qu'une partie des cellules de l'embryon puis de l'enfant (ex:
46, XY/47, XY, +21).
Exemple 2: une anomalie acquise, dans une leucémie, peut n'être présente que sur une partie
des mitoses si des cellules normales entrent en division; un clone supplémentaire peut porter
des anomalies additionnelles.
4.1. Anomalies de nombre
Par définition, les anomalies de nombre affectent le nombre des chromosomes et non leur
structure qui demeure normale. Elles peuvent être homogènes, présentes dans toutes les
cellules de l’organisme, ou en mosaïque.
Lorsqu’elles sont homogènes elles résultent le plus souvent d'une non-disjonction méiotique
et peuvent se traduire par une trisomie (présence d’un chromosome normal surnuméraire)
ou une monosomie (perte d’un chromosome).
88
On parle alors de :
- Aneuploïdie: anomalies portant sur un seul chromosome ;
- Polyploïdies ou Euploïdies: celles impliquant un changement dans l’ensemble de la
garniture chromosomique, exemple triploïdies (3n = 69), tétraploïdies (4n = 92).
Les aneuploïdies sont dues à une non disjonction chromosomique, soit durant la méiose de la
gamétogenèse, soit lors des 1ères divisions zygotiques (mitoses).
Figure 62 : Lors de la méiose peuvent se produire des accidents dont certains sont à l’origine
de l’anomalie du nombre.
Les chromatides sœurs d'un membre d'un pair des chromosomes homologues ne réussissent
pas à la disjonction pendant l'anaphase mitotique formant ainsi un mosaïque
trisomique/monosomique.
Les différents types d’aneuploïdie chez les individus diploïdes :
La nullisomie est la perte des deux exemplaires d'une paire de chromosomes
homologues, elle se représente par 2n-2, donc, chez l’homme, qui a normalement 2n=46
chromosomes, un individu nullisomique possède 44 chromosomes.
La monosomie est la perte d'un seul chromosome, représentée par 2n-l. Un individu
monosomique a 45 chromosomes.
La trisomie est le gain d'un chromosome (2n + 1). Un individu trisomique a 47
chromosomes avec trois exemplaires homologues d'un chromosome.
La tétrasomie est le gain de deux chromosomes homologues (2n + 2). Une personne
tétrasomique a 48 chromosomes. La tétrasomie ne consiste pas en un gain de deux
chromosomes quelconques, mais bien d'une paire d'homologues. Il y aura donc quatre
exemplaires homologues d'un chromosome particulier.
89
4.1.1. Aneuploïdies autosomiques
C’est le cas de la trisomie 21 ou syndrome de Down constitue la maladie chromosomique
viable la plus fréquente. Le syndrome de Down se traduit par grave handicap. Les individus
concernés sont retardés mentalement et environ un tiers d’entre eux meurent avant l’âge de
10 ans. Des progrès récents dans la cartographie du génome humain ont permis
l’identification des gènes situés sur le bras long du chromosome 21 qui doivent être
trisomiques pour provoquer ce syndrome.
Les individus atteints par cette maladie présentent un ensemble d’anomalie : Q.I. très bas, des
anomalies cardiaques, dans 35 %des cas, une langue saillante et sillonnée de plis, des mains
et pieds larges.
90
4.1.2. Aneuploïdies des gonosomes
Les trisomies des chromosomes sexuels sont très fréquentes, et portent aussi bien sur l’X que
sur l’Y.
Exemple :
47, XXY : Syndrome de klinfelter.
47, XYY : Syndrome de Jacob, homme de grande taille, agressif, Fertilité normale.
47, XXX Trisomie X: Femme normale physiquement et mentalement (on peut voir deux
corpuscules de Barr dans le noyau de ses cellules, donc, comme toute femme normale,
un seul X est actif).
On peut également voir des anomalies de nombre plus importantes : 48, XXXX, etc…
- Les tetrasomies et les pentasomies correspondent respectivement à des caryotypes
à 48 et 49 chromosomes. Elles ne sont viables que pour les chromosomes sexuels.
- Pour les chromosomes sexuels, seule la monosomie 45, X est viable (syndrome de
Turner).
Figure 64: Diagramme montrant la non-disjonction méiotique des chromosomes sexuels dans
la 1ère méiose. XO = Femme affligée du syndrome de Turner. La plupart des cas sont causés
par un spermatozoïde anormal Un embryon YO ne se développerait pas puisque le
chromosome X contient d'importants gènes qui n'ont pas d'allèles sur le Y.
a. Syndrome de Klinefelter
- Bras et jambes généralement allongés de façon disproportionnée.
- Testicules peu développés ne produisant pas de spermatozoïdes.
- Parfois, présence de caractères sexuels secondaires féminins (les seins peuvent être
apparents, les hanches larges, environ 20 % des cas).
91
- On peut observer un corpuscule de Barr dans le noyau.
- Intelligence généralement normale, mais on note parfois des difficultés d'apprentissage.
b. Syndrome de Turner
- Un cas sur 5.000 environ. La plupart des embryons présentant cette erreur ne parviennent
pas à terme.
- La plupart des cas sont causés par un spermatozoïde anormal (22 chromosomes, pas de
X ni de Y).
- Petite stature, cou court.
- Seins peu développés et très écartés l'un de l'autre.
- Deux replis de peau joignent les épaules à la tête donnant au cou un aspect triangulaire.
- Stérile et intelligence normale, mais on note parfois des troubles d'apprentissage et
d'orientation.
c. Les mosaïques sexuelles humaines
Les individus dont le corps est un mélange de tissu mâle et de tissu femelle en sont de bons
exemples. L'un de ces types de mosaïque sexuelle, (XO) (XYY) peut s'expliquer en supposant
l'existence d'un zygote XY chez lequel les chromatides Y ne se disjoignent pas lors d'une des
premières divisions mitotiques et gagnent ainsi toutes les deux le même pôle.
L'origine d’une mosaïque sexuelle humaine (XY)(XO) est la perte du chromosome Y lors de la
première division mitotique du zygote.
4.1.3. Les polyploïdies
Elles sont dues à des accidents de la fécondation. La plus fréquente des polyploïdies est la
triploïdie caractérisée par la présence de 3 lots haploïdes. 69, XXX; 69, XYY; 69, XXY. Les
triploïdies sont rares chez l’enfant vivant, et fréquentes dans les avortements spontanés
(20%).
92
Les triploïdies sont dues à deux mécanismes la digynie et la diandrie.
La digynie est la fécondation d’un ovule diploïde par un spermatozoïde normal (non
expulsion du 2ème globule polaire).La digynie peut être divisée en digynie I et en digynie
II selon qu’elle est due à une non disjonction lors de la première ou de la seconde division
méiotique.
La diandrie: comprend deux mécanismes différents
La dispermie ou fécondation d’un ovule normal avec 2 spermatozoïdes haploïdes
normaux.
La diplospermie ou fécondation d’un ovule normal par un spermatozoïde diploïde.
4.2. Anomalies de structure
93
(a)
(b)
Figure 67: Les mécanismes des changements ; (a)réarrangement chromosomiques par cassure
puis réunion ; (b) réarrangement chromosomique par crossingover.
4.2.1. Les mécanismes des changements
Les chromosomes peuvent subir des cassures suivies de recollement des extrémités libres, ou
bien le chromosome se recolle comme il a été. Si il existe plusieurs cassures et le recollement
est erroné, il aura apparition d'une aberration. L ’ADN étant en permanence agressé par les
UV ou les produits chimiques ou autres, ces accidents chromosomiques qui arriveraient en
permanence et toucheraient toutes les cellules peuvent aboutir à des anomalies
chromosomiques. Les anomalies de structures peuvent toucher un chromosome, deux
chromosomes (homologues ou non) ou plus. Les principales anomalies de structure sont :
- Les anomalies portant sur un chromosome :
Délétion (del),
Inversion (inv),
Duplication (dup),
Isochromosome (i),
Anneau (r pour « ring »)
- Les anomalies portant sur les 2 chromosomes ( Figure 68) :
Translocations réciproques,
Translocations Robertsoniennes
94
Figure 68 : Translocations Robertsoniennes : une personne sur 1.300 a un chromosome rob
composé de bras longs du 13 et du 14.
4.2.2. Aberrations portant sur un chromosome
a. Les délétions (Del)
Une délétion peut avoir lieu dans n'importe quel chromosome et peut atteindre n'importe
quelle grandeur. Les conséquences d'une délétion dépendent de sa longueur et des gènes qui
sont amputés.
Une délétion est une anomalie chromosomique déséquilibrée qui entraîne une monosomie
partielle. La délétion est le plus souvent « de novo » c’est-à-dire, absente chez le parent, et se
produit au moment de la méiose chez l’un des parents.
Une délétion résulte d’une cassure chromosomique avec perte du segment distal (délétion
terminale) ou de deux cassures sur un même bras avec perte du segment intercalaire (délétion
interstitielle ou intercalaire).
Exemples :
Syndrome du cri de chat : 5p-
Syndrome de wolf : 4p-
Rétinoblastome : del 13q 1.4
Les délétions existant dans plusieurs types de tumeurs solides chez l'homme.
95
Figure 69 : Résultat d’une délétion terminale sur le chromosome
On distingue :
- Délétion terminale (Figure 69): supposent un mécanisme de restitution d’un télomère
pour assurer la stabilisation du chromosome.
- Délétion interstitielle ou intercalaire (Figure 70).
96
Les symptômes majeurs ont l'air de causer par une délétion d'un très petit segment sur la
bande 5p14-5p15, mosaïcismes, translocations non équilibrée et r(5) observés de temps en
temps. Dans les cas majeurs, la délétion apparaît de novo.
Figure 71: Visage à différents âges d'un même patient atteint de la maladie du cri du chat : à
l'âge de 8 mois (A), 2 ans (B), 4 ans (C) et 9 ans (D)
b. Inversion (inv)
Une inversion résulte de deux cassures sur un même chromosome suivi de recollement après
inversion avec une rotation de 180° du segment intermédiaire. L’inversion est une anomalie
équilibrée mais entraine des difficultés d’appariement à la méiose. L’inversion peut être
(Figure 72) paracentrique si les points de cassure sont localisés sur un même bras
chromosomique où péricentrique si les points de cassure sont localisés de part et d’autre du
centromère.
c. Duplications (dup)
Une duplication désigne un fragment chromosomique dédoublé. La duplication est parfois
décrite comme une "trisomie partielle". Lorsqu'il y a duplication, la personne possède 3 copies
du gène qui se trouve dans le segment touché. Cela signifie qu'il y a un surplus d'information
(gènes) qui peut conduire à des malformations congénitales ou à des problèmes durant le
développement. Une duplication est une anomalie chromosomique déséquilibrée.
Le segment dupliqué peut être (Figure 73) :
- Dans la même orientation que le segment d’origine : c’est une duplication directe (en
tandem),
- Inversé à 180° par rapport au segment d’origine : c’est une duplication indirecte (en
miroir).
d. L’isochromosome (i)
Un isochromosome (Figure 74) est un chromosome anormal formé de deux bras longs ou de
deux bras courts d’un même chromosome avec perte de l’autre bras. Il peut avoir un
centromère (monocentrique) ou deux centromères (dicentrique) selon le mécanisme de sa
formation. Un isochromosome est une anomalie chromosomique déséquilibrée.
L’isochromosome du bras long du chromosome X : 46,X,i(Xq) est une anomalie fréquente dans
le syndrome de Turner.
98
Figure 74 : Mécanisme de formation d’un isochromosome.
Remarque:
Lorsqu’il existe un remaniement de structure d’un X on observe une modification du corps de
Barr : délétion du bras long de l’X = pas de corpuscule ; isochromosome pour le bras long de
l’X = présence de corpuscule plus volumineux que normalement. C’est un phénomène stable
qui se transmet aux cellules filles. Ce phénomène est réversible à l’occasion de la méiose.
(a) (b)
Figure 75: (a) Mécanisme de formation d’un anneau chromosomique ; (b) Caryotype avec
un chromosome X en anneau chez une fille polymalformée 46, X, r(X).
99
4.2.3. Les anomalies portant sur les 2 chromosomes
a. Les translocations Robertsoniennes (rob)
C’est la fusion de 2 chromosomes acrocentriques, soit directement par leurs centromères, soit
après cassure près du centromère, suivi de recollement aberrant, donnant un caryotype à 45
chromosomes ( Figure 76).
Elles sont équilibrées : sans retentissement phénotypique. Mais les gamètes sont anormaux,
avec risque de monosomie ou de trisomie pouvant avoir un caractère familial. Ce qui justifie
la recherche de translocation chez les apparentés du porteur, et le diagnostic prénatal à
chaque grossesse, pour les couples dont l’un des membres est porteur. La perte du bras court
des chromosomes transloqués n'a pas d'effet phénotypique.
- Les plus fréquentes : t (13,14) et t (14,21).
- Cas particulier : translocation entre homologues t (21,21) : tous les enfants sont viables,
trisomiques 21 (les monosomies donnent une fausse couche).
(a) (b)
Figure 76: (a) Mécanisme de formation d’une translocation robertsonienne entre un
chromosome 13 et un chromosome 14 ; (b) Caryotype masculin en bandes: un caryotype à
45 chromosomes
100
Exemple : Trisomie 21 par translocation à forme familiale.
101
Figure 78: Mécanisme de formation d’une translocation réciproque entre le bras court d’un
chromosome 6 et le bras long d’un chromosome 18.
c. Les insertions (ins)
Elles se traduisent par le transfert d’un segment intercalaire à l’intérieur d’un autre bras
chromosomique (Figure 79). Elles résultent d’un mécanisme à 3 cassures :
- Deux sur le chromosome donneur
- Une sur le chromosome receveur
Les chromosomes donneurs et receveur peuvent être un seul et même chromosome. C’est
une insertion intrachromosomique. Le segment inséré peut conserver son orientation par
rapport au centromère ou prendre une orientation inverse.
Lors de la méiose on peut observer la formation de gamètes monosomiques ou trisomiques
pour le segment inséré.
102
5. Conclusion
La cytogénétique classique reste la technique de première intention, permettant d’analyser
l’ensemble des chromosomes. La cytogénétique moléculaire lui est complémentaire, car elle
est réalisée avec des sondes ciblées, à la recherche d’une anomalie attendue. Elle est
particulièrement importante dans la détection de la maladie résiduelle. La biologie
moléculaire permet en outre de conforter, préciser ou quantifier une anomalie donnée.
A l'origine des anomalies congénitales ou des avortements spontanés existent fréquemment
des anomalies du caryotype. A l'heure actuelle, seuls quelques syndromes sont clairement
isolés et il reste encore un grand nombre d'anomalies chromosomiques à individualiser.
D'une manière générale sont susceptibles d'être porteurs d'une anomalie chromosomique
autosomique tous les enfants malformés présentant un retard psychomoteur, ainsi que tous
les enfants mort-nés ou les avortons spontanés (selon les différentes statistiques 25 à 40 %
des avortements spontanés ont à leur origine des anomalies chromosomiques).
103
CHAPITRE II
Génétique Moléculaire
104
I. Les mutations et leurs conséquences en pathologie humaine
1. Introduction
Pour survivre et se reproduire, les organismes vivants doivent répliquer fidèlement leur ADN et le
protéger des détériorations physico-chimiques. En effet, des mutations chez l’homme peuvent par
exemple dérégler le contrôle strict de la division cellulaire, entraîner la prolifération continue de
certaines cellules et former une tumeur cancéreuse.
De la même manière si les mutations concernent l’ADN du spermatozoïde ou de l’ovule des parents,
des maladies génétiques peuvent en résulter chez l’enfant. Des mécanismes moléculaires de
correction et de réparation des défauts de l’ADN minimisent ces risques et agissent à l’instar de
filtres, certes imparfaits, pour éliminer les dommages causés à l’ADN par les erreurs de réplication
ou les agents mutagènes apportés par les nuisances environnementales.
Les mutations peuvent être dues à des erreurs de copie des bases puriques ou pyrimidiques qui se
produisent le plus souvent lors de la réplication de l’ADN. Ces mutations, lorsqu’elles n’affectent
qu’une seule base, sont dites ponctuelles. La conséquence est donc que le brin fils nouvellement
synthétisé n’est plus la copie exacte du brin matriciel parental.
Le terme mutation géniques désigne n’importe quel changement intervenu dans la séquence de
l’ADN, sans préjuger de sa pathogénicité à l’échelle du gène ou du chromosome. On parle aussi de
variant. Les variations non pathogènes de l’ADN sont appelées polymorphismes.
Les mutations sont le moteur de l’évolution, et source de la diversité entre individus. Mais elles sont
aussi à l’origine des maladies génétiques monogéniques et des prédispositions génétiques aux
maladies polyfactorielles. Le caractère pathogène d’une mutation pourra être précis en parlant de
mutation délétère ou mutation pathogène.
L’ADN est en permanence exposé à différents types d’agression :
Exogènes : radiations et agents génotoxiques de l’environnement.
Endogènes : radicaux libres.
Erreurs de réplication.
Accidents de recombinaison.
La fréquence des mutations est faible. Elle est liée d'une part à la taille du gène (plus sa séquence
est longue plus la probabilité de mutation est grande) et d'autre part, à l'existence dans le gène de
séquences fortement mutagènes.
Chez l'Homme cette fréquence varie entre 10-4 et 10-8 par gène et par génération, pour une valeur
moyenne de 10-6. La fréquence des mutations peut cependant être augmentée par l'action d'agents
mutagènes (substances chimiques ou radiations) qui altèrent la structure de l'ADN, ce qui provoque
des mutations.
La position d'une mutation est aléatoire, elle peut se produire n'importe où et n'importe quand. Le
devenir d'une mutation est variable. Une mutation est rarement réversible après mais, le plus
souvent, l'erreur est réparée avant la première mitose par des systèmes enzymatiques.
105
2. Mutations géniques : altérations de l’information génétique
Les mutations peuvent être transmises à la descendance si elles se réalisent dans des génomes de
cellules germinales ou précurseurs de cellules germinales. Les mutations de cellules somatiques
entraînent des modifications au sein même de l’individu. Le plus souvent ces modifications sont des
mutations ponctuelles :
Substitutions, qui consistent en le remplacement d’un nucléotide par un autre.
Insertions et/ou de délétions de 1 ou quelques nucléotides.
Insertions et/ou délétions de quelques 10aines a 100aines de nucléotides.
Mutations instables
D’autres événements mutationnels plus rares existent, inversions, mutagenèse induite par des
éléments mobiles,…
Selon si les changements affectent une ou plusieurs paires de bases, on parle de:
Mutations ponctuelles: qui ne concernent qu’un ou quelques nucléotides
Mutations étendues : mutations de grandes tailles.
2.1. Principaux types de microlésions
Les microlésions ou mutations ponctuelle affectant une seule base ou d’un petit nombre de bases.
On distingue : (Figure 80)
La mutation par insertion
La mutation par délétion
La mutation par substitution
107
Figure 82 : Délétion de plusieurs exons et introns. A : Protéine normale (dystrophine) ; B : Absence
de protéine, C : Protéine altérée.
2.1.4. Mutations instables
Les séquences instables sont formées par la répétition successive et homogène d’un motif de
quelques nucléotides (dinucleotides comme (TG)n, trinucleotides comme (CAG)n ...).
4 classes de maladies
Expansion massive de CGG en région non codante: (syndrome de X fragile);
Expansion modérée de CAG (= glutamine) dans la séquence codant (chorée de Huntington);
Expansion massive de CTG en région 3’ non codante : (maladie de Steinert);
Expansion massive de GAA intronique (l’ataxie de Friedreich).
108
2.2. Conséquence des insertions et/ou délétions de nucléotides
Une mutation peut avoir un effet détectable si elle concerne une séquence d’ADN transcrite, un
gène de structure par exemple, mais également si elle touche un des sites de l’ADN qui jouent un
rôle dans l’expression génétique.
Les conséquences de ces mutations géniques sont les suivantes:
• La substitution silencieuse : la mutation change un codon correspondant à un acide aminé en un
autre codon du même acide aminé.
• La mutation faux-sens : le codon d'un acide aminé est remplacé par le codon d'un autre acide
aminé. La conséquence de cette mutation est variable selon la nature du changement et son
emplacement.
• La mutation non-sens : le codon d'un acide aminé est remplacé par un codon de terminaison de
la traduction (codon stop). Les substitutions silencieuses ne modifient jamais la séquence d'acides
aminés de la chaîne polypeptidique.
La gravité des conséquences des mutations faux-sens et non-sens sur le polypeptide sera différente
dans chaque cas.
Si l’addition ou la délétion de nucléotides n’est pas un multiple de 3, il y aura décalage du cadre de
lecture (frame-shift) (Figure 83).
5’ AUG CCA UCA GUU UGA CGC UUC CCA UAU AUU AG- 3’
Met-Pro-Ser-Val Stop
5’ AUG CCA UCA*AGU UUG ACG CUU CCC AUA UAU UAG 3’
Met-Pro-Ser-Ser-Leu-Thr-Leu-Pro-Ile-Tyr Stop
109
2.3. Conséquences des mutations sur la fonction de la protéine des effets
phénotypiques
Pour toute microlésion, il faut prendre en compte l’impact fonctionnel éventuel au niveau de l’ARN
messager et/ou de la protéine codée (Figure 84).
110
Aussi, lorsqu’une seule des deux copies d’un gène est mutée chez un individu, la synthèse d’une
protéine normale par l’allèle non muté suffit habituellement pour maintenir la fonction cellulaire
correspondante.
2.3.2. Gain de fonction
C’est un effet délétère dû à l’acquisition d’une nouvelle fonction qui est délétère pour la cellule. Il
s’agit de la cause majoritaire des maladies dominantes. Le gain de fonction résulte habituellement
d’un effet délétère au niveau de la protéine. Il provoque une augmentation de la quantité ou de
l’activité du produit du gène = protéine (ou activité non régulée) qui a un effet toxique. Ceci est à la
suite d’une nouvelle fonction cellulaire délétère, ou suite à un excès de fonctionnement.
Généralement, une seule mutation à l’origine de la maladie, ça touche:
- Modification des propriétés structurales de la protéine : Exp: Maladie de Huntington;
Drépanocytose
- Modification des propriétés fonctionnelles de la protéine : Exp : Achondroplasie
- Augmentation de l’expression du gène
Dans cette situation, plus rare, il faut distinguer :
Les allèles hypermorphes un allèle qui correspond à une surexpression du gène sauvage ou
qui code une forme hyperactive de son produit.
La dénomination d’allèle néomorphe est attribuée à un allèle codant pour une protéine dont
la fonction est différente de celle du produit sauvage.
2.3.3. Effet dominant négatif
La protéine interfère avec la protéine sauvage. Cette situation correspond à la frontière entre les
mutations entraînant une perte de fonction et celles entraînant un gain de fonction.
Exemple: L’ostéogenèse imparfaite (caractérisée par une fragilité osseuse), qui touchent les gènes
codant pour le collagène de type I : une mutation affectant la structure d’une chaîne de collagène
(délétion d’un ou de plusieurs exons) exerce à l’état hétérozygote un effet plus délétère
(dominant) qu’une perte totale d’expression. La protéine codée par le gène muté, dénommé allèle
antimorphe, non seulement perd sa fonction, mais interfère aussi avec la fonction de l’allèle normal
chez les hétérozygotes.
2.4. L’origine ou les causes des mutations
On distingue les mutations spontanées qui sont des variations génétiques naturelles. Et aussi des
mutations induites par des agents de l’environnement qui augmentent le taux de mutations
2.4.1. Erreurs de fidélité de l’ADN polymérase lors de la réplication
Une erreur lors de la réplication peut se produire lorsqu’une paire de bases non complémentaire
(ex ; T-G) se forme pendant la synthèse du nouveau brin d’ADN (Figure 85). La substitution peut être
une transition ou une transversion.
111
L'activité de l'ADN polymérase peut entraîner des erreurs de réplication (mésappariements) (Figure
85) avec mise en place d’un nucléotide incorrect (1). Cela entraîne une mutation lors de la
réplication suivante (2) qui sera ensuite reproduite (3) au cours des cycles cellulaires successifs.
112
Figure 86 : Appariement : cas des formes tautomères
(a) (b)
Figure 87 : (a)Tautomères de la thymine (et U) et de la guanine ; (b) Tautomères de la cytosine et
de l’adénine
113
2.4.3. Les lésions spontanées
En dehors des processus de réplication, l’ADN peut subir des dégradations spontanées comme la
dépurination ou des modifications biochimiques par ajout de groupements. Ainsi, des processus de
désamination sont fréquemment observés.
a. La dépurination
La dépurination se produit lorsqu’un résidu guanine ou adénine est perdu par la chaîne d’ADN suite
à la rupture du lien entre le désoxyribose et la base : interruption d’une liaison glycosidique. La
présence d’un site apurinique (AP) rend l’ADN plus fragile et favorise les cassures simples brin au
niveau de ce trou (Figure 87). La dépuration (la perte d’une base purique par un nucléotide) produit
un site apurinique (AP) = site vacant.
114
Figure 88 : Désamination de la cytosine en uracile (a) et cytosine méthylée en Thymine (b).
Lors de désamination accidentelle, la Cytosine non méthylée donne Uracile (Figure 88), reconnue
comme une erreur et soumise à réparation. La Cytosine méthylée donnera Thymine (Figure 88) qui
n’est pas reconnue comme erreur et est lue comme telle sans réparation.
c. Bases endommagées par oxydation
C’est une mutation spontanée qui est constitué par les dégâts causés par les radicaux libres de
l’oxygène. Ceux ci, dans la cellule, proviennent du métabolisme oxydatif. Le résultat peut être la
production de 8-hydroxyguanine qui s’apparie à tort avec A induisant une transversion de G-C en T-
A.
Les formes d’oxygène actif, telles que les radicaux superoxyde (O2-), le peroxyde d’hydrogène
(H2O2) et les radicaux hydroxyle (OH) sont des espèces réactives de l’oxygène qui sont des sous-
produits de la chaîne respiratoire sont des sous-produits du métabolisme aérobique normal. Ces
molécules peuvent provoquer des lésions oxydatives dans l’ADN, ainsi que dans les précurseurs de
l’ADN (tels que le GTP), ce qui crée des mutations.
Les sources des espèces réactives oxygénées = ERO peuvent être endogènes ou exogènes. La
production des radicaux libres est sous contrôle physiologique par le biais de moyens endogènes
bien précis. Les radicaux libres attaquent les cellules et en particulier lèsent rapidement la
membrane cellulaire. C’est le stress oxydatif. Il y a aussi des sources exogènes de productions de
radicaux libres comme montre la Figure 89.
115
2.4.4. Erreurs de méthylation
La méthylation de l’ADN est une modification de l'une des quatre bases azotées (la cytosine le plus
souvent) de l'ADN. Cette modification consiste en l'ajout d'un groupement méthyle (-CH3) à la place
d'un atome d'hydrogène. Ceci est un phénomène épigénétique normal et indispensable au
fonctionnement cellulaire. Cependant une erreur de méthylation, également appelée méthylation
adduit, peut entrainer une distorsion de la double hélice voire une cassure de l'ADN.
Les erreurs de méthylations donnent des alkylations sur le carbone C6 au lieu du carbone C5
entraînant des absences de formation de liaisons H entre bases.
2.4.5. Mutations induites
Les mutations induites sont des lésions provoquées par des agents mutagènes. Lésions qui résultent
de l’exposition à des agents génotoxiques qui sont dans notre environnement :
Atmosphère (UVs, HAPs)
Alimentation (nitrosamines, amines aromatiques, mycotoxines)
Médicaments (agents anticancéreux)
Produits cosmétiques (nanoparticules, filtres photosensibles)
Les virus- Etc…
Agents physiques
Il existe trois types de conséquences :
Les lésions qui bloquent la transcription
Les lésions qui bloquent la fourche de réplication
La modification structurelle de la chromatine.
Il existe deux types d’effets des lésions notamment les effets immédiats avec l’arrêt du cycle
cellulaire ou mort cellulaire et apoptose. Et des effets à long terme notamment des mutations et
des cancers.
a. Les lésions dues à des mutagènes physiques
Les mutagènes physiques comme la chaleur, rayonnement cosmique, radioactivité, UV ...
Formation de dimères de Thymine (TpT)
La formation des dimères de Thymine (Figure 90) correspondent à la formation de liaisons
covalentes entre deux Thymine (les pontages intrabrins). Ces dimères de Thymine créent des
distorsions de l’hélice d’ADN et peuvent être fixés par action de l’UV. La plupart des lésions létales
sont des dimères entre bases pyrimidiques (T-T ou T-C) dans l'ADN. Ces dimères bloquent la
transcription et la réplication. Elles sont létales si elles ne sont pas réparées. Elles génèrent aussi des
mutations et des réarrangements chromosomiques.
Les UV ne sont pas ionisants mais peuvent réagir avec l'ADN ou d'autres molécules biologiques.
116
Figure 90: Formation de dimères de Thymine suite à l’action mutagènes des rayons UV
Les radiations
Les radiations ionisantes constituent le principal agent mutagène. C’est le cas des rayons X et
gamma qui sont assez énergétiques pour produire des ions réactifs quand ils interagissent avec les
molécules biologiques.
C’est ainsi que lorsque les rayons X pénètrent dans la cellule, des électrons sont éjectés sur des
atomes des molécules rencontrées sur le passage du rayonnement. Des molécules et des atomes
stables sont alors transformés en radicaux libres et en ions réactifs.
Ces réactions (1) (Figure 91) peuvent directement ou indirectement affecter le matériel génétique
en altérant les bases puriques ou pyrimidiques de l'ADN, ce qui génère des mutations ponctuelles
et des pertes de base (2). Elles peuvent aussi rompre les liaisons phosphodiester dans l'un (3) ou les
deux brins (4) altérant l'intégrité des chromosomes et produisant ainsi des anomalies
chromosomiques comme des délétions, des translocations ou des cassures simples ou doubles
brins.
117
Remarques: La chaleur (Température corporelle 37°C) est probablement l'agent mutagène le plus
répondu dans la nature. Son effet sur l'ADN se traduit par l'élimination de la liaison N-glycosidique.
Il en résulte un site apurinique (AP) au niveau de l'ADN. Plus de 10.000 sites apurinique sont produits
chaque jour dans chaque cellule. En effet les excès de chaleur peuvent également avoir une origine
exogène.
b. Mutagènes chimiques
Certains agents chimiques possèdent une structure semblable ou assez semblable à celle des bases
azotées pour pouvoir être incorporé dans l’ADN à leur place. C’est le cas par exemple de l’acide
nitreux, analogues de base, agents alkylants, agents intercallants …ect.
La formation de lésions oxydatives par des ERO (Espèces Réactives Oxygénées) qui peuvent être
exogène ou endogène. Elles correspondent à des oxydations de bases provoquées par des agents
super-oxyde (°O2-, H2O2 et °OH). Les produits de cette peroxydation réagissent avec les bases en
produisant des adduits. Lorsque ces diverses lésions persistent dans l’ADN, leurs propriétés font
qu’elles sont impliquées dans la mutagenèse, la cancérogenèse, le vieillissement et l’arrêt de la
réplication dans la létalité cellulaire.
Addition de molécules exogènes :
L’addition de molécules exogènes crée des distorsions de l’ADN. On compte les aflatoxines
(mycotoxine ), les benzantracènes, les agents alkylants, les agents intercalants, le cis-platine ; les
agents intercalants comme le cas d’Acridine, proflavine, bromure d’ethidium sont des molécules qui
s’insèrent entre les bases de l’ADN. Ceci entraîne un étirement de l’ADN. La polymérase insère alors
une base surnuméraire en face de la molécule étrangère. Les agents intercalant provoquent des
changements de cadre de lecture.
Les agents intercalants en créant de ce fait une nouvelle base sur le brin en formation ou une
délétion. Si les agents intercalants s’intercalent dans le brin en formation vont empêcher l’insertion
d’une base.
Un autre type de l’addition de molécules exogènes est l’addition de groupes alkyl tels que methyl,
ethyl ou propyl sur des bases ou le squelette de l’ADN (Figure 92). On parle de l’alkylation. On note
que diverses molécules d’origine endogène ou exogène ont la faculté d’alkyler l’ADN.
Le N-méthyle-N-nitrosoamine contenu dans la fumée de tabac en est un exemple. Il peut en résulter
la formation de complexes par exemple S-adenosyl-methionine avec l’ADN.
Les bases alkylées peuvent être des points de rupture ou de mauvais appariements. Le groupement
méthyl déforme la double hélice ce qui conduit à des distorsions et cassures de l’ADN.
118
Figure 92 : Alkylations, l’addition d’une chaîne carbonée (radical alkyle=C2H5 ) ou (=CnH2n+1) sur une
des positions de la base
Les analogues de base :
Une molécule ayant une structure similaire à une base est incorporée durant la réplication.
Exemple : l’ADN peut incorporer le 5-BromoUracile à la place de la Thymine (Figure 93).
119
II. Mécanismes biologiques de la réparation
De nombreuses menaces potentielles pèsent sur la fidélité de la réplication de l'ADN. Les mutagènes
de l'environnement peuvent endommager l'ADN et augmenter fortement le taux de mutation.
Les lésions sont soit endogènes sans agents exogènes, soit provoquées par des agents pathogènes
ou des agents mutagènes qui peuvent être physiques ou chimiques. Les agents mutagènes sont des
agents capables de produire des lésions de l’ADN par effet direct ou indirect.
Les agents mutagènes physiques correspondent aux rayonnements X ou γ, aux rayonnements UV et
à la chaleur. Les agents mutagènes chimiques sont essentiellement sous la forme de radicaux super-
oxydes (O2-) qui peuvent oxyder de manière non catalytique les molécules biologiques et les
engager dans des réactions chimiques incontrôlées.
Les lésions de l'ADN créent une instabilité génomique et les réponses cellulaires seront différentes
selon que le cycle cellulaire est bloqué ou non et selon l'importance de la lésion.
Soit l'ADN est peu endommagé: il est réparé. Il y a ensuite une reprise du cycle cellulaire (cas le
plus fréquent). Cependant la molécule peut être mal réparée. Ceci confère à la cellule un avantage
prolifératif et apparition de cellule cancéreuse.
Quand l'ADN est très endommagé, telles que les cassures des deux brins de l’ADN, la molécule n’est pas
réparé et la cellule induit le programme d'apoptose.
1. Réponses à un défaut de blocage du cycle cellulaire et de réparation de l'ADN
En situation saine, lors de dommages sur l’ADN, les détecteurs de dommages de l’ADN activent les
systèmes de réparation de l’ADN ainsi que p53 qui arrête le cycle cellulaire (Figure 94). Après la
réparation de l’ADN, la signalisation des dommages de l’ADN n’est plus active et le cycle cellulaire
reprend.
120
p53 provoque la mort programmée de la cellule par apoptose qui est un mécanisme complexe de
suicide de la cellule.
C’est ainsi que l'apoptose permet de se débarrasser des cellules endommagées ou fortement
mutées afin d'éviter l'émergence d'un état pathologique (inflammation, cancer) qui peut menacer
le tissu ou même l'organisme tout entier. Quand la cellule déclenche l’apoptose, son noyau se
fragmente et la cellule se fractionne en petites vésicules qui seront captées et éliminées par des
macrophages.
Pour la situation anormale, les lésions sont transmises et des mutations apparaissent, entraînant
une instabilité génomique une cascade de défauts notamment des défauts de transcription, de
réplication, de ségrégation chromosomique, de structure de la chromatine...ect. Puis on a
l’apparition de mutations et d'aberrations chromosomiques. Finalement le processus de
tumorigenèse se met en place.
C’est ainsi que les cellules vivantes ont élaboré une série de systèmes enzymatiques qui réparent
les lésions de l'ADN de différentes façons. La déficience de l'un de ces systèmes peut conduire à un
taux de mutation plus élevé que la moyenne. Les erreurs ayant échappé à la vigilance de la
polymérase sont réparées par les nombreux enzymes de réparation de la cellule : environ 130 chez
l’humain.
Nous pouvons séparer les systèmes de réparation en plusieurs catégories. Il existe cinq grands
mécanismes de correction des dommages. Chacun d’eux est « spécialisé » dans la prise en charge
d’un ou de plusieurs types de lésion de l’ADN, mais une même lésion peut être réparée par
différents mécanismes, ce qui permet à la cellule de compenser une éventuelle défaillance de l’un
de ces systèmes.
- Réparation directe par réversion du mécanisme chimique
- Base Excision Repair (BER)
- Nucleotide Excision Repair (NER)
- Correction des mésappariements / Mismatch Repair (MMR)
- Réparation Cassure simple / double brins
2. Mécanismes de réparation
Les erreurs produites par les polymérases durant la réplication sont réparé en premier temps par
l’ADN polymérase qui répare les erreurs de réplication. Les ADN polymérases vérifient leurs copies,
si un mauvais nucléotide s’incorpore à la chaîne, la polymérase recule et utilise son activité
exonucléase de 3’ vers 5’ pour le retirer (hydrolyse) et le corriger.
121
2.2. Réparation par réversions des lésions
La façon la plus directe de réparer une lésion est de l'inverser en régénérant la base normale. Cette
inversion n'est pas toujours possible car certains types de lésions sont quasiment irréversibles.
Dans quelques cas cependant, les lésions peuvent être réparées de cette façon. Les alkyltransférases
sont des enzymes qui inversent les lésions (Figure 95). Elles enlèvent les groupements alkyles.
Les mésappariements peuvent être dus à des erreurs de polymérases (juste après la réplication)
ou à la formation des tautomères de bases (en cours de réplication). Une partie de ces erreurs
est corrigée par l’activité de relecture 3’-5’ des polymérases, le reste est pris en charge par le
système MMR.
Chez l’homme, 4 gènes ont été identifiés : hMSH2, hMLH1, hPMS1 et hPMS2 qui reconnait
l’anomalie et déclenche le mécanisme de MMR. Des mutations dans l’un de ces gènes (= les
gènes des enzymes de réparation des erreurs d’appariements) prédisposent à des formes
héréditaires du cancer du colon appelées cancer du colon héréditaire sans polypose (HNPCC).
Le système de réparation par mésappariement est réalisé via plusieurs étapes comme montre
la Figure 96.
122
1. Reconnaissance du
mésappariement par MSH2 et
GTBP. La méthylation est réalisé
pour distinguer le brin parental et
le brin néoformé et recrutement
de MLH1 et PMS2 et ouverture du
brin lésé.
2. Déplacement du complexe et
recrutement de l’exonucléase 1 et
coupure au niveau du site de coupure.
3. Digestion et élimination 3’-5’ par exo 1
et protection du simple brin.
4. Resynthèse du brin complémentaire
par ADN polymérase puis finition par
ADN ligase.
123
Dans ce cas, ce mécanisme est induit par l’action d’ADN glycosylases, dont la spécificité varie en
fonction de la nature du dommage. La base est alors excisée et une nouvelle base est insérée par la
polymérase en utilisant le deuxième brin comme matrice.
Aussi, on trouve pour ce système BER la réparation des cassures simple brin induites par les
rayonnements ionisants (notamment dus aux sites AP).
Plusieurs étapes sont identifiées pour le système de réparation BER (Figure 97):
- La reconnaissance : c’est l’excision de la base par une glycosylase spécifique avec la formation
d’un site AP (apurique/apyrimidique) ;
- La coupure du brin d ’ADN après reconnaissance du site AP par AP endonucléases ;
- La réparation par la polymérase β (Polβ), la Flap endonucléase 1 (FEN1) ;
- Ligation par DNA ligase pour liaison.
Il faut noter que le système BER est essentiel à la survie cellulaire puisque l’absence de la polymérase
β nécessaire à ce mécanisme est létale. Un seul brin qui est modifié, l’autre brin sert de matrice pour
re-synthétiser la molécule d’ADN.
125
2.5.1. Recombinaison homologue (HR)
La cassure double brin est réparée à partir de chromatide homologue. Elle est privilégiée au
cours du cycle cellulaire (phases S, G2) et permet la restauration de l’ADN. C’est un mécanisme
assez lent du fait qu’il utilise le chromosome homologue non endommagé pour assurer une
réparation fidèle de la lésion (Figure 99).
Exemple : Anémie de Fanconi, ataxie télangiectasie, syndrome de Bloom…)
126
Figure 100 : Dommage à l’ADN et mécanismes de réparation
2.6. Conclusion
Les dommages à l’ADN (Figure 100) font ainsi partie de la vie d’une cellule et peuvent être à
l’origine de nombreux problèmes délétères, d’où l’importance pour celle-ci d’avoir des
mécanismes de réparation puissants, spécialisés et efficaces.
Lorsque des mutations ponctuelles non réparées surviennent dans les lignées germinales, elles
sont alors transmises à la descendance et sont à l’origine des maladies génétiques, parfois
graves. La dérégulation des mécanismes de réparation et de signalisation est la source de
l’instabilité génétique observée dans les cancers, et participe ainsi à la carcinogénèse.
Pourtant, toutes les mutations ne sont pas délétères : certaines n’ont pas d’effet, et d’autres
sont la source de la variabilité génétique entre individus. Certaines de ces mutations peuvent
même être plus favorables à la survie de l’individu dans son environnement donné, ce qui
favorisera alors la transmission de la mutation favorable à sa descendance par la sélection
naturelle. Il y a ainsi une concurrence permanente entre le risque encouru par l’individu et le
gain potentiel pour l’espèce. Les dommages à l’ADN réparés avec des erreurs sont donc un
moteur essentiel à l’évolution des espèces.
127
III. Recombinaison génétique de l’ADN
1. Introduction
Le remodelage du génome, crossing-over entre chromosomes, programmé dans certaines
circonstances notamment la Méiose permet le brassage de l’information génétique au cours de la
gamétogenèse. C’est ainsi que la méiose par le brassage intrachromosomique et
interchromosomique permet la création de nouvelles combinaisons d’allèles (Figure 101 ; 102).
Par la suite, la fécondation, en rétablissant la diploïdie, amplifie le brassage des allèles réalisés au
cours de la méiose. Cette création de variabilité génétique par la reproduction sexuée devra être
replacée dans un cadre évolutif.
128
génétiquement différentes les uns des autres et différents de celles provenant de toutes les autres
méioses.
On distingue trois types de recombinaison :
– Recombinaison homologue : réaction entre des séquences homologues d’ADN pendant la
méiose.
– Recombinaison site-spécifique : réactions impliquent des séquences spécifiques
– Recombinaison hétérologue, non homologue ou illégitime: ce type de recombinaison a lieu
entre des séquences non homologues.
Figure 103 : Modèle simplifié de recombinaison homologue entre deux molécules d’ADN
similaires. Les lettres A et a représentent deux allèles du même gène. De même pour B/b et C/c.
129
2.1. Les mécanismes moléculaires de la recombinaison homologue
Figure 104 : Mécanisme de la recombinaison homologue selon le modèle de Holliday. Les lettres
ABC et abc désignent des régions homologues des ADN (allèles) où les séquences sont cependant
légèrement différentes. Les duplex hybrides (duplex commutés) résultant de la résolution de la
jonction diffèrent selon le type de clivage.
130
Coupure par une endonucléase de deux brins de même polarité, appartenant à des
chromatides différents et à des positions homologues.
Migration des extrémités 5’ libres à la recherche d’homologie sur le brin intact de l’autre
chromatide et ligature ; il y a donc rupture de liaisons d’Hydrogène et réassociation par hybridation
avec migration du point de branchement.
Rotation de l’un des chromosomes à 180°, les centromères s’écartent en donnant une
structure en croix visible au microscope électronique.
La résolution de la jonction se fait par deux nouvelles coupures de simples brins ; suivant la
position de ces coupures on aura ou non échange de marqueurs.
2.2. Les él éments t r a n s p o s a b l e s
La transposition est une forme de recombinaison dans laquelle des fragments de séquences d’ADN
se déplacent d’un site à un autre. Ces éléments mobiles sont appelés transposons. Au sein des
génomes, la transposition est un événement fréquent. Par exemple, le génome humain et celui du
maïs, sont composés à plus de 50 % d’éléments mobiles. De ce fait les transposons constituent une
source majeure de mutations.
Les principales classes d'éléments transposables sont (Figure 105):
- Les transposons à ADN qui possèdent des répétitions inversées caractéristiques et qui
transposent grâce à une transposase qui utilise un mécanisme couper-coller.
- Les éléments rétrotransposables à LTR (longues séquences répétées) qui ont de longues
répétitions directes ou inversées et qui transposent grâce à une transcriptase inverse.
- Les éléments rétrotransposables sans LTR qui transposent aussi grâce à une transcriptase
inverse mais qui n'ont ni répétitions directes, ni répétitions indirectes.
Figure 105: Les deux types des éléments transposables à ARN (rétrotransposables) et à transposons à
ADN.
131
La transposition simple ou transposition non réplicative, implique l’excision du transposon du site
occupé dans l’ADN hôte, suivie de son intégration à un nouveau site de ce même ADN (Figure 106). Il
s’agit donc d’un mécanisme réactionnel du type couper-coller.
Dans la transposition réplicative, l’élément d’ADN à chaque cycle de transposition est répliqué avant
d’être inséré. Ici, le mécanisme du couper-coller, bien que plus complexe, est similaire à celui de la
transposition simple. Au final, deux transposons identiques sont associés à l’ADN, en des sites différents.
L’un est le site d’origine (ancien site) et l’autre, le nouveau site d’insertion.
Certains éléments transposables transposent par un intermédiaire ADN, d'autres par un intermédiaire
ARN. Les éléments transposables peuvent provoquer des mutations par insertion ou par
recombinaison.
Les SINE et les LINE sont des rétrotransposons retrouvés chez l’humain :
LINE : Longues séquences intercalés 5 000 à 7 000 pb.
SINE : courte séquence intercalée 300 pb.
La recombinaison par transposition qui est définie comme la jointure entre les extrémités d'un élément
transposable et celles d’un nouveau site cible. Ce déplacement des éléments transposables d’un point
à un autre du génome peut engendrer des mutations :
- Soit directement par leur insertion à côté ou à l’intérieur d’un gène, ce qui peut en altérer la
séquence codante et/ou l’expression,
- Soit indirectement par la recombinaison homologue entre deux copies d’éléments
transposables de séquences similaires, ce qui peut amener à des délétions ou des duplications.
132
Les événements de recombinaison au niveau de séquences répétées (ex. transposons, LINEs, SINEs)
conduisent à des réarrangements chromosomiques : insertions, délétions, inversions, duplications
en tandem, translocations en faveur de la dynamique et évolution des génomes.
A la différence de la recombinaison classique, ce phénomène ne consiste pas en l'échange de
matériel génétique mais en l'addition pure et simple d'ADN au sein de l'ADN receveur. Ce processus
a été qualifié de recombinaison illégitime.
2.3. Conversion génique
Figure 107: Conversion génique entre deux chromosomes homologues. Les séquences des brins du
duplex accepteur ont été modifiées au profit des séquences donneuses.
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