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13 octobre 2020 : Examen écrit partiel SV101.

Partie Evolution - Cours de Pierre CAPY.
Durée conseillée de l'épreuve : 1 h. Toutes les questions sont obligatoires.
I – Histoire des idées
A. Attribuer un auteur à chacune des conceptions suivantes :
1. Nomenclature binaire des espèces :Carl von Linné

………………
Darwin
2. Origine des espèces au moyen de la sélection naturelle : ………………
Motoo Kimura ?
3. Théorie neutraliste de l’évolution : ………………
B. En termes d’évolution, pourquoi est-il important de distinguer les cellules de la lignée

somatique des cellules de la lignée germinale ?
Il est important de distinguer les cellules de la lignée somatique

des cellules de la lignée germinale car seul la lignée germinale
transmettent les caractéristiques aqcuises par l’individu à ses
descendants.
C. Les trajectoires évolutives d’une structure homologue et d’une structure analogue

sont-elles les mêmes ?
OUI NON
Argumentez : la structure homologue résulte d’un ancêtre commun alors que

la structure analogue résulte d’une convergence
Exemple d’homologie : Plume d’un perroquet et d’un aigle , homollogue car hérité d’un ancêtre commun
Exemple d’analogie : Ailes des oiseaux et des insectes , même fonction mais pas même ancêtre
II – Les phylogénies
A. Rappeler la différence entre un caractère et un état de caractère
Un caractère correspond à tout attribut observable su un groupe d’organisme présentant au moins 2 états de ce
caractère. Pour chaque caractère il existe diférents états de caractères .
Le caractère peut être morpho-anatomique ou moléculaire alors que l’état de caractère peut être plumes ou poils
par exemple pour le caractère morpho-anatomique correspondant ou la nature d’un acide aminé dans une
chaine paptidique pour le caractère moléculaire correspondant.
B. Lorsque l’on construit une phylogénie, on cherche à définir majoritairement des

groupes (entourer la ou les bonnes réponses) :
1. Monophylétiques
2. Polyphylétiques
3. Paraphylétiques
C. La définition de ces différents groupes est basée sur des caractères :
Monophylétique
1. présentant des états dérivés partagés : groupe ………………………………..…
Polyphilétique
2. présentant des états convergents : groupe …………………………………………
Paraphylétique
3. présentant des états ancestraux partagés : groupe ……………………………..
D. En amont des phylogénies moléculaires, il est primordial d’effectuer un alignement

correct des séquences. Pourquoi ?
Il est primordial d’effectuer un alignement correct des séquences afin de

déterminer les homolgies.
E. Quel élément utilise-t-on pour raciner un arbre ?
On utilise le groupe extérieur

F. Que permet cet élément ?
Le groupe extérieur permet d’étudier les groupes que l’on cherche

sans qu’il en fasse parti.
G. Le genre Drosophila comporte environ 400 espèces. Si nous nous intéressons à leur
phylogénie, parmi les espèces suivantes, quelle sera la plus utile pour raciner l'arbre que
nous souhaitons construire ? Entourer la bonne réponse.
- Escherichia coli (bactérie)

- Homo sapiens sapiens (homme)
- Drosophila melanogaster (diptère – Famille des Drosophilidae)
- Zaprionus tuberculatus (diptère – Famille des Drosophilidae)
- Saccharomyces cerevisiae (levure de boulangerie)
- Zea mays (maïs)
- Quercus robur (chêne pédonculé)
- Methanococcus maripaludis (Archées)
H. Un chercheur souhaite établir les relations phylogénétiques entre six espèces en

utilisant les séquences d’un gène. A cette fin, il a aligné les séquences des six espèces et il
a calculé les distances entre les séquences prises deux à deux. Il obtient la matrice
suivante (dont quelques données ont été effacées) :
A B C D E
B
C 0.3 0.3
D 0.3 0.3 0.1
E 0.2 0.2
F 0.3 0.3 0.2 0.2 0.1
Par ailleurs, il dispose pour les caractères I et II, des états de caractères pour les six
espèces étudiées. Ces états de caractères sont résumés dans le tableau suivant :
Caractère I II
A  +
B  -
Espèces C  -
D  +
E  +
F  -
Ensuite, il a construit l’arbre UPGMA correspondant. Cet arbre présente la topologie
suivante :
W= X= Y= Z=
Compléter la matrice des distances (cellules grisées), placer le nom de l’ensemble des
espèces sur cet arbre, et donner les valeurs des distances correspondant à W, X, Y et Z.
Enfin, placer les états de caractères pour les caractères I et II sur cet arbre. De quel
phénomène évolutif résulte la présence de l’état ‘ - ‘ pour le caractère II dans les espèces
B, C et F ?

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I – Histoire des idées

A. Attribuer un auteur à chacune des conceptions suivantes :

1. Nomenclature binaire des espèces :Carl von Linné

B. En termes d’évolution, pourquoi est-il important de distinguer les cellules de la lignée

Il est important de distinguer les cellules de la lignée somatique

C. Les trajectoires évolutives d’une structure homologue et d’une structure analogue

Argumentez : la structure homologue résulte d’un ancêtre commun alors que

A. Rappeler la différence entre un caractère et un état de caractère

B. Lorsque l’on construit une phylogénie, on cherche à définir majoritairement des

C. La définition de ces différents groupes est basée sur des caractères :

D. En amont des phylogénies moléculaires, il est primordial d’effectuer un alignement

Il est primordial d’effectuer un alignement correct des séquences afin de

E. Quel élément utilise-t-on pour raciner un arbre ?

On utilise le groupe extérieur

Le groupe extérieur permet d’étudier les groupes que l’on cherche

- Escherichia coli (bactérie)

H. Un chercheur souhaite établir les relations phylogénétiques entre six espèces en

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