ChemSpider

ChemSpider
Konten
Deskripsi	Sebuah database struktur kimia yang menyediakan akses cepat ke lebih dari 50 juta struktur, sifat dan informasi terkait.
Kontak
Pusat penelitian	Raleigh, Carolina Utara, Amerika Serikat
Laboratorium	Antony J. Williams; Royal Society of Chemistry;
Akses
Situs web	www.chemspider.com
Perangkat
Perangkat lunak	https://itunes.apple.com/us/app/chemspider/id458878661
Lain-lain
Lisensi	Creative Commons Atribusi BerbagiSerupa

ChemSpider adalah sebuah database molekul kimia yang dimiliki oleh Royal Society of Chemistry.^[3]^[4]^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]

Database

Database berisi informasi terhadap lebih dari 50 juta molekul dari lebih dari 500 sumber data termasuk:

EPA DSSTox
Food and Drug Administration (FDA)
Human Metabolome Database
Journal of Heterocyclic Chemistry
KEGG
KUMGM
LeadScope
LipidMAPS
Marinlit
MDPI
MICAD
MLSMR
MMDB
MOLI
MTDP
Nanogen
Nature Chemical Biology
NCGC
NIAID
National Institutes of Health (NIH)
NINDS Approved Drug Screening Program
NIST
NIST Chemistry WebBook
NMMLSC
NMRShiftDB
PANACHE
PCMD
PDSP
Peptides
Prous Science Drugs of the Future
QSAR
R&D Chemicals
San Diego Center for Chemical Genomics
SGCOxCompounds, SGCStoCompounds
SMID
Specs
Structural Genomics Consortium
SureChem
Synthon-Lab
Thomson Pharma
Total TOSLab Building-Blocks
UM-BBD
UPCMLD
UsefulChem
Web of Science
xPharm
ZINC

Setiap molekul kimia diberikan pengenal unik, yang menjadi bagian dari URL yang merujuk pada molekul tersebut. Contohnya, aseton adalah 175, dan karenanya memiliki URL Acetone | C3H6O | ChemSpider

Sejarah

ChemSpider diakuisisi oleh Royal Society of Chemistry (RSC) pada bulan Mei 2009.^[14] Sebelum diakuisisi oleh RSC, ChemSpider dikendalikan oleh sebuah perusahaan swasta, ChemZoo Inc. Sistem ChemSpider pertama kali dibuat pada Maret 2007 dalam bentuk rilis beta dan bertransisi menjadi versi rilis pada Maret 2008. ChemSpider telah memperluas dukungan generik dari database kimia untuk menyertakan dukungan dari koleksi struktur kimia Wikipedia melalui pelaksanaan WiChempedia mereka.

Layanan

Sejumlah layanan dibuat tersedia secara daring. Hal ini meliputi konversi nama kimia untuk sejumlah struktur kimia, pembentukan string SMILES dan InChI begitu pula dengan prediksi terhadap banyak parameter fisika dan pengintegrasian pada layanan jaringan yang memungkinkan dilakukannya prediksi NMR.

SyntheticPages

SyntheticPages adalah sebuah database interaktif gratis mengenai prosedur kimia sintetik yang dioperasikan oleh Royal Society of Chemistry.^[15] Pengguna mengirimkan prosedur sintetik yang mereka telah lakukan sendiri untuk publikasi di situs tersebut. Prosedur tersebut mungkin berupa hasil karya orisinil, namun terkadang lebih sering didasarkan pada reaksi berdasarkan literatur. Kutipan dengan prosedur asli terpublikasi dibuat ketika tersedia. Prosedur tersebut diperiksa oleh editor ilmiah sebelum dikirimkan. Halaman tidak mengalami penelaahan sejawat formal seperti artikel jurnal ilmiah tetapi komentar dapat dibuat dengan pengguna mengakses halama tersebut. Komentar tersebut juga dimoderatori oleh editor ilmiah. Tujuannya adalah untuk untuk mengumpulkan pengalaman praktis bagaimana melakukan sintesis kimia yang berguna di laboratorium. Sementara metode eksperimental diterbitkan dalam jurnal akademik biasa terdaftar secara resmi dan ringkas, prosedur dalam ChemSpider SyntheticPages diberikan dengan detail yang lebih praktis. Informalitas dianjurkan. Komentar oleh pengirim disertakan juga. Publikasi lain dengan jumlah detail yang sebanding termasuk Organic Syntheses dan Inorganic Syntheses. Situs SyntheticPages pada awalnya dirancang oleh Profesor Kevin Booker-Milburn (Universitas Bristol), Stephen Caddick (University College London), Peter Scott (Universitas Warwick) dan Dr Max Hammond. Pada bulan Februari 2010 penggabungan diumumkan^[16] dengan mesin pencari struktur kimia milik Royal Society of Chemistry ChemSpider dan pembentukan ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP).

Open PHACTS

ChemSpider berperan sebagai repositori senyawa kimia sebagai bagian dari proyek Open PHACTS, sebuah Innovative Medicines Initiative. Open PHACTS akan mengerahkan sebuah pendekatan web semantik standar yang terbuka, akses terbuka untuk mengatasi hambatan dalam penemuan obat molekul kecil - sumber informasi yang berbeda, kurangnya standar dan informasi yang berlebihan.^[17]

Lihat pula

Referensi

^ Van Noorden, R. (2012). "Chemistry's web of data expands". Nature. 483 (7391): 524. doi:10.1038/483524a. PMID 22460877.
^ "ChemSpider Adopts Creative Commons Licenses". Diarsipkan dari versi asli tanggal 2015-04-02. Diakses tanggal 2017-01-08.
^ Chemical & Engineering News. 85 (24). J11 Juni 2007. Tidak memiliki atau tanpa |title= (bantuan)
^ Antony John Williams (Jan–Feb 2008). "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists". Chemistry International. 30 (1).
^ Williams, A. J. (2008). "Public chemical compound databases". Current opinion in drug discovery & development. 11 (3): 393–404. PMID 18428094.
^ Ekins, S; Iyer, M; Krasowski, M. D.; Kharasch, E. D. (2008). "Molecular characterization of CYP2B6 substrates". Current drug metabolism. 9 (5): 363–73. doi:10.2174/138920008784746346. PMC 2426921  . PMID 18537573.
^ Brumfiel, G. (2008). "Chemists spin a web of data". Nature. 453 (7192): 139. doi:10.1038/453139a. PMID 18464701.
^ E. Curry, A. Freitas, and S. O’Riáin, "The Role of Community-Driven Data Curation for Enterprises," in Linking Enterprise Data, D. Wood, Ed. Boston, MA: Springer US, 2010, pp. 25–47.
^ "translation missing: en.profile.myslideshows.guest.slideshows.page_title". www.slideshare.net.
^ "Accurate Mass Measurements: Identifying "Known Unknowns" Using ChemSpider". 22 Mei 2011.
^ Williams, A. J. (2011). "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases". Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research. hlm. 363. doi:10.1002/9781118026038.ch22. ISBN 9781118026038.
^ Pence, H. E.; Williams, A. (2010). "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource". Journal of Chemical Education. 87 (11): 1123. doi:10.1021/ed100697w.
^ Little, J. L.; Williams, A. J.; Pshenichnov, A.; Tkachenko, V. (2011). "Identification of "Known Unknowns" Utilizing Accurate Mass Data and Chem Spider". Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 23 (1): 179–85. doi:10.1007/s13361-011-0265-y. PMID 22069037.
^ "RSC acquires ChemSpider". Royal Society of Chemistry. 11 Mei 2009. Diakses tanggal 11 Mei 2009.
^ "ChemSpider SyntheticPages". ChemSpider SyntheticPages. Royal Society of Chemistry. Diakses tanggal 26 Juni 2012.
^ "ChemSpider and SyntheticPages support synthetic chemistry". RSC Publishing. Royal Society of Chemistry. 5 Februari 2010. Diarsipkan dari versi asli tanggal 26 Juli 2012. Diakses tanggal 26 Juni 2012.
^ Williams, A. J.; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S.; Chichester, C.; Willighagen, E. L.; Evelo, C. T.; Blomberg, N.; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery". Drug Discovery Today. 17 (21–22): 1188–1198. doi:10.1016/j.drudis.2012.05.016. PMID 22683805.

[1] Van Noorden, R. (2012). "Chemistry's web of data expands". Nature. 483 (7391): 524. doi:10.1038/483524a. PMID 22460877.

[2] "ChemSpider Adopts Creative Commons Licenses". Diarsipkan dari versi asli tanggal 2015-04-02. Diakses tanggal 2017-01-08.

[3] Chemical & Engineering News. 85 (24). J11 Juni 2007. Tidak memiliki atau tanpa |title= (bantuan)

[4] Antony John Williams (Jan–Feb 2008). "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists". Chemistry International. 30 (1).

[5] Williams, A. J. (2008). "Public chemical compound databases". Current opinion in drug discovery & development. 11 (3): 393–404. PMID 18428094.

[6] Ekins, S; Iyer, M; Krasowski, M. D.; Kharasch, E. D. (2008). "Molecular characterization of CYP2B6 substrates". Current drug metabolism. 9 (5): 363–73. doi:10.2174/138920008784746346. PMC 2426921  . PMID 18537573.

[7] Brumfiel, G. (2008). "Chemists spin a web of data". Nature. 453 (7192): 139. doi:10.1038/453139a. PMID 18464701.

[8] E. Curry, A. Freitas, and S. O’Riáin, "The Role of Community-Driven Data Curation for Enterprises," in Linking Enterprise Data, D. Wood, Ed. Boston, MA: Springer US, 2010, pp. 25–47.

[9] "translation missing: en.profile.myslideshows.guest.slideshows.page_title". www.slideshare.net.

[10] "Accurate Mass Measurements: Identifying "Known Unknowns" Using ChemSpider". 22 Mei 2011.

[11] Williams, A. J. (2011). "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases". Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research. hlm. 363. doi:10.1002/9781118026038.ch22. ISBN 9781118026038.

[12] Pence, H. E.; Williams, A. (2010). "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource". Journal of Chemical Education. 87 (11): 1123. doi:10.1021/ed100697w.

[13] Little, J. L.; Williams, A. J.; Pshenichnov, A.; Tkachenko, V. (2011). "Identification of "Known Unknowns" Utilizing Accurate Mass Data and Chem Spider". Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 23 (1): 179–85. doi:10.1007/s13361-011-0265-y. PMID 22069037.

[14] "RSC acquires ChemSpider". Royal Society of Chemistry. 11 Mei 2009. Diakses tanggal 11 Mei 2009.

[15] "ChemSpider SyntheticPages". ChemSpider SyntheticPages. Royal Society of Chemistry. Diakses tanggal 26 Juni 2012.

[16] "ChemSpider and SyntheticPages support synthetic chemistry". RSC Publishing. Royal Society of Chemistry. 5 Februari 2010. Diarsipkan dari versi asli tanggal 26 Juli 2012. Diakses tanggal 26 Juni 2012.

[17] Williams, A. J.; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S.; Chichester, C.; Willighagen, E. L.; Evelo, C. T.; Blomberg, N.; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery". Drug Discovery Today. 17 (21–22): 1188–1198. doi:10.1016/j.drudis.2012.05.016. PMID 22683805.

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[1]

[2]

[14]

[15]

[16]

[17]