Pohon Filogenik
Pohon Filogenik
Pohon Filogenik
Telah dilakukan analisis pohon filogenetik berdasarkan sekuen 16s rRNA pada 13 species
bakteri dari genus Microbulbifer menggunakan program Mega5. Pohon filogenetik berdasarkan
16S rRNA menunjukkan bahwa dari 13 species dari Genus Microbulbifer berdasarkan tingkat
evolusi dari ancestor dihasilkan ada 2 cabang yaitu cabang pertama terdiri dari M. chitinilyticus,
M. halophilus, M. thermotolerans, M. donghaiensis, M. okinawensi, M. maritimus, M. epialgicus
dan M. variabilis, sedangkan cabang kedua meliputi M. celer, M hidrolyticus, salipaludis, M.
agarilyticus dan M. elongatus. Species M. epialgicus memiliki jarak evolusi yang paling kecil
yaitu sebesar 0,008 dengan M. variabilis dan hasil ini berbeda dengan hasil taksonomi numerik
fenotipik yang menunjukkan bahwa M. epialgicus tidak termasuk Genus Microbulbifer karena
memiliki tingkat similaritas 0,37.
1. PENDAHULUAN
Klasifikasi filogenetik merupakan pengelompokan organisme berdasarkan
sejarah evolusinya. Hubungan filogenetik disajikan dalam bentuk dendogram
yang mengekspresikan hubungan evolusi antar organisme dan mencerminkan
perubahan yang ada sepanjang waktu (Davis, 1996). Pada saat ini, metode biologi
molekuler banyak digunakan untuk identifikasi. Teknik identifikasi yang
digunakakan adalah berdasarkan sekuen 16s rRNA. Teknik ini berkembang
setelah orang menciptakan mesin DNA sequencer. Pada prinsipnya identifikasi
dilakukan berdasarkan hasil analisis urutan atau sekuen DNA dari 16s rRNA dari
suatu genom organisme (Clarridge, 2004). Identifikasi berdasarkan 16s rRNA ini
menjadi dasar untuk penentuan taksonomi secara filogenetik. Identifikasi dengan
sekuen 16S rRNA terbukti lebih cepat, akurat dan obyektif dibandingkan dengan
metode konvensional yang menggunakan sifat fenotip sehingga dapat mencegah
adanya kekeliruan dalam identifikasi mikroorganisme (Petti et al., 2005) dan lebih
murah (Cook et. al., 2003)
Bakteri Genus Microbulbifer merupakan bakteri Gram negatif, termasuk
gammaproteobacteria dan bersifat sangat aerob.
tahun 2013, telah ada 18 species dari Genus Microbulbifer yaitu M. agarilyticus,
M. arenaceous, M. cystodytense, M. donghaiensis, M. celer, M. chitinilyticus, M.
elongatus, M. epialgicus, M. gwangyangensis, M. halophilus,M. hydrolyticus, M.
maritimus, M. pacificus, M. salipaludis, M. thermotolerans, M. variabilis, M.
mediterraneus, M. okinawensis.
Tujuan dari pembuatan makalah ini adalah untuk membuat taknomomi
filogenetik
sp.
(NCBI,
2013).
Dengan
banyaknya
penelitian
yang
menggunakan sekuen 16s rRNA sebagai dasar identifikasi maka masih banyak
M.
M.
elongatus
M.
donghaiesnsis
M.
okinawensis
M.
chitinilyticus
M.
epialgicus
M. epialigicus memiliki similaritas jauh dibawah 0,70 dengan species lain yaitu
sebesar 0.29-0.53. Berdasarkan nilai similaritas di atas 70%, terdapat 3 kelompok
dari Genus Microbulbifer. Kelompok pertama memiliki nilai similaritas sebesar
0.72 terdiri species M. celer, M. thermotolerans, M. variabilis dan M. halophilus,
M. agarilyticus. Kelompok kedua yang memiliki nilai nilai similaritas sebesar
0.74 terdiri dari M. salipaludis, M. hidrolyticus, M. maritimus dan M. elongatus.
Kelompok ketiga terdiri M. donghaiensis, M. okinawensis M.chitinilyticus dengan
nilai similaritas sebesar 0.72.
2.3 Metode Rekontruksi Pohon Filogenetik Menggunakan Mega5
The Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) merupakan peranti
lunak yang dikembangkan untuk analisis komparatif dari urutan DNA dan protein
yang ditujukan untuk menyimpulkan pola evolusi molekuler gen, genom, dan
spesies dari waktu ke waktu (Tamura et al., 2013).
Metode untuk rekontruksi pohon filogenetik pada MEGA5 meliputi
Unweighted Pair-Group Method with Arithmethic Mean (UPGMA), Neighbor
Joining (NJ), Minimum Evolution (ME), Maximum Parsimony (MP), dan
Maximum Likelihood (ML).
Metode tersebut dapat didasarkan pada jenis data dan metode rekonstruksi
pohon. Berdasarkan jenis data, metode UPGMA, NJ, dan ME menggunakan data
berupa matriks distance, sedangkan metode MP dan ML menggunakan data
character state. Berdasarkan metode rekonstruksi pohon metode UPGMA dan NJ
menggunakan pendekatan clustering algorithm yang menghasilkan satu pohon
final, sedangkan metode ME, MP, dan ML menggunakan pendekatan optimality
search criterion yang menekankan pada evaluasi seluruh kandidat pohon dalam
penentuan pohon terbaik menurut kriteria masing-masing metode (...,2013).
a. Unweighted Pair-Group Method with Arithmethic mean (UPGMA)
Metode ini mengasumsikan kesamaan laju evolusi antar sequence/OTU sehingga
metode ini mengestimasi nilai rerata (menyamaratakan) nilai distance untuk
menggabungkan pasangan OTU dan perhitungan branch length.
b. Neighbor Joining (NJ)
Metode ini menggunakan logika bahwa pohon terbaik adalah pohon yang
meminimalisir nilai tree length yang merupakan penjumlahan dari total branch
length. Kondisi ini dicapai dengan konstruksi kombinasi pasangan OTU yang
memberikan nilai branch length terkecil (neighbor) diantara seluruh kombinasi.
c. Minimum Evolution (ME)
Memiliki logika yang sama dengan metode NJ. Perbedaannya terletak pada
metode ME menggunakan optimality search criterion sehingga proses penentuan
tree length terkecil dilakukan dengan mengevaluasi seluruh kandidat pohon yang
mungkin dibuat untuk sejumlah OTU. Dengan demikian, maka metode NJ dapat
dipandang sebagai pendekatan heuristik (cepat namun tak menjamin) untuk
mendapatkan pohon ME.
d. Maximum Parsimony (MP)
Metode ini memiliki kesamaan konsep dengan metode ME. Namun demikian
penentuan pohon dengan tree length terkecil tidak dilakukan berdasarkan matriks
distance seperti pada ME. Perhitungan branch length dan tree length pada metode
MP didapatkan dari jumlah substitusi minimum antar character state setiap situs
pada sequence alignment.
e. Maximum Likelihood (ML)
Metode ini menggunakan perhitungan probabilitas kombinasi seluruh character
state ancestral yang dapat memberikan bentukan character state seperti pada
sequence alignment yang dimiliki saat ini untuk seluruh situs pada setiap OTU.
Metode MP dalam hal ini dapat dipandang sebagai pendekatan heuristik terhadap
metode ML karena hanya menggunakan kombinasi character state yang
memberikan jumlah substitusi minimum untuk menghasilkan character state
sequence yang ada pada saat ini.
3. METODE PENELITIAN
Metode penelitian meliputi koleksi data sekuen 16S rRNA dan analisis
pohon filogenetik menggunakan program Mega5
3.1 Koleksi data sekuen 16S rRNA
Koleksi data dilakukan dengan mendapatkan data urutan sekuen DNA
penyandi 16S rRNA dari 13 species Genus Microbulbifer sesuai dengan data
species yang telah dilakukan pembuatan taksonomi numerik dari NCBI
didownloud
melalui
internet.
Alamat
basis
www.ncbi.nlm.nih.gov.
Species
tersebut
meliputi
data
tersebut
adalah
M.chitinilyticus,
M.
procedure shotcut.
Buka Mega 5, masukkan data file yang sudah di-alignment dalam bentuk
microsoft access stored procedure shotcut, dipilih philogeny contruct by, dipilih
satu-persatu metode yaitu Unweighted Pair-Group Method with Arithmethic
Mean (UPGMA), Neighbor Joining (NJ), Minimum Evolution (ME), Maximum
Parsimony (MP), dan Maximum Likelihood (ML), dipilih compute dan selanjutnya
akan tampil gambar pohon filogeni dari masing-masing metode dan disimpan
dalam bentuk tree session file (*.mts).
1. HASIL
Jarak evolusi antar masing-masing species disajikan pada tabel 1. Data
panjang sekuen 16S rRNA dari genus Microbulbifer yaitu M. okinawensis 1456
bp, M. halophilus 1473 bp, M. donghaiensis 1416 bp, M hidrolyticus 1503 bp,
M. salipaludis 1492 bp, M. elongatus1514 bp, M. maritimus1490 bp,
M. agarilyticus1490 bp, M. thermotolerans1490 bp, M. celer 1491 bp,
M. variabilis 1492 bp, M. epialgicus 1485 bp, M. chitinilyticus 1458 bp dan 2
species
pembanding
di
luar
Genus
Microbulbifer
yaitu
Marinobacter
Tabel 1 menunjukkan perkiraan jarak evolusi dari sequen 16S rRNA dari
Genus Microbulbifer. Pada tabel tersebut bahwa jarak evolusi terkecil adalah
antara M. variabilis dan M. epialgicus yaitu sebesar 0,008, selanjutnya diikuti
oleh jarak evolusi antara M. donghaiensis dengan M. okinawensis sebesar 0,029.
Marinobacter hydrocarbonoclasticus dan
Pseudomonas aeruginosa
yang
M.chitinilyticus.
Pada cabang kedua, M. agarilyticus memiliki similaritas yang tinggi dengan
M. elongatus dan kedua species ini selanjutnya dekat kekerabatannya dengan
M. salipaludi.
Hal ini
menunjukkan bahwa sekuen yang digunakan sekuen utuh dari 16S rRNA.
Semakin utuh atau panjang sekuen DNA yang digunakan maka semakin spesifik
dan semakin akurat species yang diperoleh.
Pada metode analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa hasil yang
diperoleh Maximum Likelihood (ML) dan Neighbor Joining (NJ) menghasilkan
pola pohon filogenetik yang sama, walaupun dasar pembuatan pohon
filogenetiknya berbeda, ML menggunakan data character state sedangkan NJ
menggunakan data berupa matriks distance.
dan M. variabilis memiliki garis keturunan yang berbeda dengan cabang kedua
yang cabang kedua meliputi
M. celer, M hidrolyticus,
M. salipaludis, M.
M. thermotolerans,
M. donghaiensis, M.
Species M. epialgicus memiliki jarak evolusi yang paling kecil yaitu sebesar
0,008 dengan M. variabilis dan hasil ini berbeda dengan hasil taksonomi numerik
fenotipik yang menunjukkan bahwa M. epialgicus tidak termasuk Genus
Microbulbifer karena memiliki tingkat similaritas 0,37.
3. DAFTAR PUSTAKA
Arimurti, S. 2013. Taksonomi numerik anggota genus Microbulbifer berdasarkan
karakter fenotip.
filogeni:
Review.
Microbulbifer
chitinilyticus sp. nov. and mocrobulbifer okinawensis sp. nov., chitindegrading bacteria isolated from mangrove forests. Int J Syst Evol
Microbiol. 61:2215-2220. Doi 10.1099/ijs.0.024158-0
Barciszewski, M.Z., Maciej, S., Volker, A.E & Barciszewski, J. 2001. Structure
and functions of 5S rRNA. Acta Biochimica Polonica.Rev, 48 (1): 191198Lilburn T., Bell, J.A. and Garrity, G. M (eds). 2004. Taxonomic Outline
of the prokaryotes bergeys manual of sistematic bacteriology.
Second
Edition.
Clarridge, J. 2004. Impact of 16S rRNA Gene Sequence Analysis for
Identification of Bacteria on Clinical Microbiology and Infectious Diseases.
Clin. Microbiol. Rev, 17:840862.
Cook, V.J., Christine Y.T., Joyce, W., Ryan, P & Amin, K. 2003. Conventional
Methods versus 16S Ribosomal DNA Sequencing for Identification of
Nontuberculous Mycobacteria: Cost Analysis.
Journal of Clinical
Petti, C.A. Rolage, C.R. and Schrecken berger. 2005. The role of 16S rRNA gene
sequencing
in
identification
of
microorganisms
misidentified
by
12
LAMPIRAN
Lampiran 1. Data Species bakteri yang Digunakan untuk Pembuatan Taksonomi
Filogenetik Genus Microbulbifer
No
Nama Species
Kode Isolat
No accession
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
M.chitinilyticus
M. okinawensis
M. halophilus
M. donghaiensis
M hidrolyticus,
M. salipaludis,
M. elongatus,
M. maritimus,
M. agarilyticus
M. thermotolerans
M. celer
M. variabilis
M. epialgicus
M. hidrocarbonoclasticus
P. aeriginosa
ABABA212T
ABABA23 T
KCTC 12848 T
JCM 15145 T
DSM 11525 T
JCM 11542 T
DSM 6810 T
JCM 12187 T
JCM 14708 T
JSM 14709 T
KCTC 12973 T
ATCC700307 T
DSM 18651 T
ATCC49840
LMG1242
AB500894
AB500893
EF674853
EU365694
AJ608704
AF479688
NR025246
AY377986
AB158515
AB124836
EF486352
AB167354
AB266054
X67022
Z76651
Panjang sekuen
16S rRNA
1458 bp
1456 bp
1473 bp
1416 bp
1503 bp
1492 bp
1514 bp
1490 bp
1490 bp
1490 bp
1491 bp
1492 bp
1485 bp
1483 bp
1491 bp
Lampiran 2. Data sekuen 16s rRNA dari species bakteri dari genus Microbulbifer
dalam bentuk fasta
>AB500893_Microbulbifer_okinawensis_ABABA23
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGGTCTTCGGACTGAGTAGAGCGGC
GGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAACATTCGGAAACGGATGCTAATACC
GCATACGCCCTACGGGGGAAAGCGGGGGATCTTCGGACCTCGTGCTATTGGATATGCCCGCGTCGGATTA
GCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACAC
TGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCC
TGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAGGCC
CTAAGATTAATACTCTTGGGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCC
GCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTTAA
GCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAGAG
GGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACT
GCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC
ACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTTGTAGGGTCCCTTGAGGACTTTGTAACGCAGCTAACGCAATAAGTA
GACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA
GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGA
TGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
GGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTAGTTGCTAGCAGGTAATGCTGAGAACTCTAGGGA
GACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCTGGGCTA
CACACGTGCTACAATGGCTGGTACAGACGGTTGCGAATCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAAAAAACCAGT
CGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATG
TCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAG
TGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTG
>EU365694_Microbulbifer_donghaiensis_CN85
ACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGTTCCTTCGGGAATGAGTAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGG
GAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAACATTCGGAAACGGATGCTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAA
GCGGGGGATCTTCGGACCTCGTGCTATTGGATATGCCCGCGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGC
TCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAG
ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGT
13
GTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGCAGGGAGGAAGGCTTGTAGATTAATACTCTGCAAG
ATTGACGTTACCTGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAA
GCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTATTTAAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGG
CTTAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGATGGCTAGAGTACGAGAGAGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTA
GCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACTGCCTGGCTCGATACTGACGCT
GAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACT
AGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGCC
GCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGC
AACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCTCAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAAC
TGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGC
GCAACCCTTGTCCTTTGTTGCCAACACGTAATGGTGGGAACTCAAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGA
GGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGG
TACAGACGGTTGCGAATCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCAATCGTAGTCCGGATCGGAGTCTG
CAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGG
GCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGG
GGACGGTCACCACGGA
>AY377986_Microbulbifer_maritimus_TF17
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGTTCCTTCGGGAACAAGTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAACAACCGGAAACGGTTGCTAATA
CCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGCGGGGGATCTTCGGACCTCGTGCTATTGGATATGCCCGCGTCGGAT
TAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAG
CCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAGG
CCCTAAAGTTAATACCTTTGGGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCTCAGAACTTTGCAGA
GATGCATTGGTGCCTTCGGGAACTGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTAGTTGCCAGCACTTCGGGTGGGAACTCTAGGG
AGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGCT
ACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCAA
TCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAAT
GTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAA
GTGGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAG
GTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>AB167354_Microbulbifer_variabilis_Ni2088
ATAGAGTTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAG
TTCTTCGGAATGAGTAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAAC
ATTCGGAAACGGATGCTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGTGCTA
TTGGATATGCCCGCGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGG
TCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA
ATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCTCTAGGGTTGTAAAG
CACTTTCAGTAGGGAGGAAGGCCTTAAAGTTAATACCTTTGAGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCAC
CGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAA
AGCGCGCGTAGGCGGTTAGTTAAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAAC
TGGCTGGCTAGAGTACGAGAGAGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAG
GAACATCAGTGGCGAAGGCGACTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAAC
AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTG
TGACGCAGCTAACGCAATAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGA
CGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTG
ACATCCTCGGAAGTCTGCAGAGATGCGGATGTGCCTTCGGGAACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTC
GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCA
CGTAATGGTGGGAACTCTAGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCAT
CATGGGCCTTACGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGT
GGAGCTAATCCGAAAAAACCAATCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATC
GCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACC
ATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATG
14
ACTGGGGTGAAGTCGTAACAAG
>AB266054_Microbulbifer_epialgicus_F104
GAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGTTCT
TCGGAACGAGTAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAACATTC
GGAAACGGATGCTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGTGCTATTGG
ATATGCCCGCGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTCTG
AGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATAT
TGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCACT
TTCAGCAGGGAGGAAGGCCTTAAAGTTAATACCTTTGAGGATTGACGTTACCTGCAGAAGAAGCACCGGC
TAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCG
CGCGTAGGCGGTTAGTTAAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGC
TGGCTAGAGTACGAGAGAGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAAC
ATCAGTGGCGAAGGCGACTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGA
TTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGAC
GCAGCTAACGCAATAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGG
GGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACAT
CCTCGGAAGTCTGCAGAGATGCGGATGTGCCTTCGGGAACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCA
GCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCACTTC
GGGTGGGAACTCTAGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGG
CCCTTACGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGC
TAATCCGAAAAAACCAATCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAG
TAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGG
AGTGGGTTGCTCCAGAAGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGG
GGTGAAGTCGTAACA
>AB500894_Microbulbifer_chitinilyticus_ABABA212
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAACGGTCCTTCGGGACTTATTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTGCCTGGTAGTGGGGGACAACTCGGGGAAACTCGAGCTAATA
CCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGCGGGGGATCTTCGGACCTCGCGCTACCAGATGAGCCCGCGTCGGAT
TAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAAC
CCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGGGAGGAAGG
GGTGTTGGTTAATACCCAACATCATTGACGTTACCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGTCTCCTTGAGGGATTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGA
GATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTAGTTGCTAGCAGGTAAAGCTGAGAACTCTAGG
GAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGC
TACACACGTGCTACAATGGCTGGTACAGACGGTTGCGAATCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCA
GTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGA
AGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTG
>AB124836_Microbulbifer_thermotolerans_JAMBA94
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGTTCCTTCGGGAATAAGTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATTGCCCAGTAGTGGGGGACAACTCGGGGAAACTCGAGCTAATA
CCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGCGGGGGATCTTCGGACCTCGCGCTATTGGATATGCCCGCGTCGGAT
TAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAG
CCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGGGAGGAAGG
CCTAATGGTTAATACCCATTAGGATTGACGTTACCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGCTCCTTGAGGGCTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
15
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCTCGGAACTTTCCAGA
GATGGATTGGTGCCTTCGGGAACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTAGTTGCCAGCACTTTGGGTGGGAACTCTAGGG
AGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGCT
ACACACGTGCTACAATGGCTGGTACAGACGGTTGCGAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCAG
TCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGAAT
GTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAA
GTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAG
GTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>EF674853_Microbulbifer_halophilus_YIM91118
GAACGTGGGCGGCAGGGCTAACACATGCAGTCGAGCGCGAAAGCTCCTCCGGGAGTGAGTAGAGCGGCGG
ACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTGCCTGGTAGTGGGGGACAACTCGGGGAAACTCGAGCTAATACCGC
ATACGCCCTACGGGGGAAAGCGGGGGATCTTCGGACCTCGTGCTATCAGATGAGCCCACGTCGGATTAGC
TAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTG
GGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGCAACCCTG
ATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCATTCGGGAGGAAGGCCTG
TAGGTTAATAACCTGCAGGATTGACGTTACCGAAAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGC
GGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTTAAGC
TGGATGTGAAAGCCCAGGGCTCAACCTTGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAGAGGG
TAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACTGC
CTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCAC
GCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGCTCCTTGAGGGCTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAGTAGA
CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGC
ATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCTCGGAACTTTCCAGAGATG
GATTGGTGCCTTCGGGAACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG
GTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTAGTTGCCAGCACTTTGGGTGGGAACTCTAGGGAGAC
TGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGAGGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGCTACAC
ACGTGCTACAATGGCTGGTACAGACGGTGGCGAATCTGCGAAGTGGAGGTAATCCGACAAAACCAGTCGT
AGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCA
CGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTGG
CTAGTCTAACCTTCGGGGAGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGGAAGTCGAACAAGACCCAT
GCT
>EF486352_Microbulbifer_celer_ISL39
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAGAAATCTCCTTCGGGAGAGAGTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTGCCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACCCGGATTAATA
CCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGCGCTATTGGATGAGCCTATGTCGGAT
TAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCAGCGATCCGTAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAAC
CCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCATTCGGGAGGAAGG
CTTGTAGGTTAATACCCTGCAGGATTGACGTTACCGAAAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCAGGGCTCAACCTTGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCAGCGAACTTTCCAGA
GATGGATTGGTGCCTTCGGGAACGCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCTAGCAGGTAAAGCTGAGAACTCTAGG
GAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGC
TACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAAAAAACCA
ATCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGA
AGTGGCTAGTCTAACCTTTTGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAA
GGTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>AJ608704_Microbulbifer_hydrolyticus_DSM11525T
CCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAACGGTCCTTCGGGACT
TATTAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTGCCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACC
CGGATTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGCGCTATTGGATGAGCC
TATGTCGGATTAGCTTGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGAT
16
GATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAA
TGGGGGAAACCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTA
GGGAGGAAGGCCTGTAAGTTAATACCTTGCAGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCC
GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAG
GCGGTTAGTTAAGCTGGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAG
AGTACGAGAGAGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTG
GCGAAGGCGACTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATA
CCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTCCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTA
ACGCAATAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGC
ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCAGAGA
ACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTG
TCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTTGTTGCTAGCAGGTAATGCTGA
GAACTCAAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTA
CGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCC
GAAAAAACCAATCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCG
TGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGG
TTGCTCCAGAAGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAA
GTCGTAACAAGGTAGCCCTAGGGGAACCTGGGG
>AF479688_Microbulbifer_salipaludis_SM1
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAACGGTCCTTCGGGACTTATTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTGCCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACCCGGATTAATA
CCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGCGCTATTGGATGAGCCTATGTCGGAT
TAGCTTGTTGGTGGGGTAATGGCCCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAAC
CCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAGG
CCTGTAAGTTAATACCTTGCAGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCAGAGAACTTTCTAGA
GATAGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTTGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGAACTCAAAG
GAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGC
TACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAAAAAACCA
ATCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGA
AGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAAGTCGTAACA
AGGTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>AB158515_Microbulbifer_agarilyticus
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAAAGTTCTTCGGAACAAGTAGAGCGGC
GGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTGCCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACCCGGATTAATACC
GCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGTGCTACTGGATGAGCCTATGTCGGATTA
GCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACAC
TGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCC
TGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAGGCC
CTAAAGTTAATACCTTTAGGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCC
GCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTTAA
GCTGGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAGAG
GGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACT
GCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC
ACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAGTA
GACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA
GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCAGAGAACTTTCTAGAGA
TAGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
GGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTTGTTGCCAACACGTAATGGTGGGAACTCAAAGGA
GACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCTGGGCTA
CACACGTGCTACAATGGCAGGTACAGACGGTCGCTAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCTGT
CGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATG
17
TCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAG
TGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGGTGAAGTCGTAACAAG
GTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>NR_025246.1_Microbulbifer_elongatus
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCGAACGGTCCTTCGGGACTTATTAGAGCG
GCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTGCCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACCCGGATTAATA
CCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGACCTTGCGCTATTGGATGAGCCTATGTCGGAT
TAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAAC
CCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAGG
CCCTAAAGTTAATACCTTTGGGGATTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG
CCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTT
AAGCTGGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCAGAACTGGCTGGCTAGAGTACGAGAG
AGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGA
CTGCCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT
CCACGCCGTAAACGATGTCTACTAGTCGTAGGGTTCCTTGAGGACTTTGTGACGCAGCTAACGCAATAAG
TAGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG
GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCACCGCGAAGACCCTTACCAGGTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGA
GATGGATTGGTGCCTTCGGGAGCTCTGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTTGTTGCCAGCGAGTAATGTCGGGAACTCAAAG
GAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCTGGGC
TACACACGTGCTACAATGGCAGGTACAGACGGTTGCGAATCCGCGAGGTGGAGCTAATCCGAGAAAACCT
GTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGA
AGTGGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTCACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAA
GGTAGCCCTAGGGGAACCTGG
>X67022.1_M_hydrocarbonoclasticus_sequence
NAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
AACAGGGGAAGCTTGCTTCCGCTGACGAGCGGCGGACGGGTGAGNAATGCTTAGGAATCTGCCCAGTAGT
GGGGGATAGCCCGGGGAAACCCGGATTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGATCTTCGGA
CCTTGCGCTATTGGATGAGCCTAAGTCGGATTAGCTAGTTGGTGGGGNAAAGGCCTACCAAGGCGACGAT
CCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATCGGGACTGAGACACGGCCCGAATCTCCTACGGGAGGC
AGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCTTTC
GGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAAACCTTATGGCTAATACCCATGAGGCTTGACGTTACCTAC
AGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATT
ACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTTGGTAAGCGAGATGTGAAAGCCCCGGGCTTNACCTGGGAACG
GCATTTCGAACTGTCAGACTTGAGTGTGGTAGAGGGTAGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTA
GATATAGGAAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTACCTGGACCAACACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGT
GGGGAGCAAACAGGATTNGATACCCTGGTNGTCCACGCCGTAAACGATGTCNACTNGCCGTTGGGACTCT
TGAAGTCTTAGTGGCGCACGTAACGCACTNAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCNAGGTNAAAACTC
CAATGATNTGACGGGGGNCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAGCAACGCGAAGAACCTTA
CCTGGCCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTG
CATGGCCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCCTATCCCTG
GTTGCTAGCAGGTAATGCTGAGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGAC
GTCAGGTCATCATNGCCCTTACGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCGTACAGAGGGCTGCCAA
CTCGCGAGAGTGAGCCAATCCCTTAAAACGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCNACTCGACTCCGTGA
AGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCNGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGC
CCGTCACACCATGGGAGTGGATTGCACCAGAAGTAGTTAGTCTAACTTCGGGAGGACGATTACANCGGTG
TGGTNNANGACTG
>Z76651.1_Pseudomonas_aeruginosa_strain_LMG_1242T
ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGATGAAGGGAGCTTGCTCCTGGATTCAGC
GGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAATCTGCCTGGTAGTGGGGGATAACGTCCGGAAACGGGCGCTAAT
ACCGCATACGTCCTGAGGGAGAAAGTGGGGGATCTTCGGACCTCACGCTATCAGATGAGCCTAGGTCGGA
TTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCGTAACTGGTCTGAGAGGATGATCAGTCA
CACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAA
GCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGATTGTAGAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAG
GGCAGTAAGTTAATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCAACAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCA
GCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTCAG
CAAGTTGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCCAAAACTACTGAGCTAGAGTACGGTA
18
GAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACACCAGTGGCGAAGGCG
ACCACCTGGACTGATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAG
TCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGAGATCTTAGTGGCGCAGCTAACGCGATAA
GTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGT
GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGCCTTGACATGCTGAGAACTTTCCAG
AGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCAGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGAT
GTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTRCCAGCACCTCGGGTGGGCACTCTAAG
GAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGCCAGGGC
TACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTTGCCAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACCG
ATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGA
AGTAGCTAGTCTAACCGCAAGGGGGACGGTTACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAA
GGTAGCCGTAGGGGAACCTGC
19