La società è nata nel 1948 con il nome di SG Glaucha dalle ceneri dell'Hallescher Fußball-Club Wacker fondato nel 1900. Il Wacker ha partecipato ai play-off nazionali nel 1921, 1928 e nel 1934.
Come era frequente nei club della Germania Est, la squadra di Halle cambiò nome diverse volte iniziando nel 1948 venendo rinominata SG Freiimfelde Halle. L'anno seguente vinse il campionato nazionale come ZSG Union Halle e si ripeté nel 1952.
Nei quindici anni seguenti la società andò incontro a diversi cambi di denominazione: BSG Turbine Halle (1953); SC Chemie Halle-Leuna (1957); SC Chemie Halle (1958); e FC Chemie Halle (1966). L'ultimo cambiamento di nome evidenzia la separazione delle squadre di calcio dalle società polisportive; questo avvenimento è dovuto al fatto che i vertici dello Stato volevano costruire una nazionale di calcio veramente competitiva.
La squadra vinse la sua prima coppa nazionale nel 1956 con il nome di BSG Turbine Halle; la seconda invece arrivò nel 1962 mentre la squadra aveva come nome SC Chemie Halle.
La stagione seguente (1962/63) partecipa alla Coppa delle Coppe dove viene eliminata al primo turno dall'OFK Belgrado.
Eccezion fatta per alcuni anni in seconda serie, il club per la maggior parte degli anni giocò in DDR-Oberliga, la massima divisione del calcio tedesco-orientale, come squadra di metà classifica. Il miglior risultato di questi anni fu un terzo posto conquistato alla fine della stagione 1970-71 che fece guadagnare alla squadra una qualificazione in Coppa Uefa.
Dopo la riunificazione tedesca e l'accorpamento delle due leghe il club, dopo essere stata rinominato con la denominazione attuale, si trovò in Zweite Bundesliga. La permanenza in seconda divisione fu assai breve e ben presto (1995-96) la squadra si trovò in Verbandsliga Sachsen-Anhalt (V). Attualmente la squadra milita in terza serie dopo aver raggiunto la promozione nella stagione 2011/12 ed ha conquistato due volte consecutivamente la Coppa Regionale (2014/15 e 2015/16) guadagnandosi l'accesso alla DFB Pokal.