Het seizoen 2009/10 van de KNVB Beker voor amateurs is de 30e editie in deze opzet van de Nederlandse voetbalcompetitie met als inzet de KNVB Beker voor amateurs en een plek in de Super Cup amateurs. Aan het toernooi doen zaterdag- en zondaghoofdklassers mee in hun eigen district. De districtkampioenen strijden in twee voorrondes, twee halve finales en de finale om de beker. Twee districtkampioenen hoeven geen voorronde te spelen: zij spelen in de halve finale een uitwedstrijd. Het toernooi wordt georganiseerd door de Koninklijke Nederlandse Voetbalbond (KNVB). De titelverdediger is Barendrecht, dat in Schelluinen in de finale van het seizoen 2008/2009LRC Leerdam met 3-1 versloeg. Dit seizoen werd Barendrecht uitgeschakeld in de kwartfinales van het district West II door Capelle.
De clubs die de halve finales in de districtbeker bereiken, plaatsen zich voor het "grote" KNVB Bekertoernooi van volgend seizoen.
In elk district werd er begonnen in een poule van vier clubs. De winnaar en de nummer twee gingen door naar de knock-outfase. Daarna werden in sommige districten tussenrondes gespeeld om het aantal clubs terug te brengen naar een macht van twee, om knock-outrondes te kunnen spelen (bijvoorbeeld 64 of 128). In andere districten werden enkele clubs vrijgeloot en gingen zo automatisch door naar de derde ronde.
Vanwege het grote aantal clubs in het westen en zuiden van Nederland, zijn er in beide regio's twee districten. Daardoor zijn er zes districten: Noord, Oost, West I, West II, Zuid I en Zuid II.
Van de zes districtswinnaars worden twee clubs vrijgeloot, vier clubs strijden om twee plaatsen in de halve finale, die ze op eigen terrein mogen spelen.