Selenocystein er en aminosyre, og den dominerende selenforbindelsen i levende organismer hvor den fungerer som de 20 vanlig forekommende aminosyrene. Den bygges inn i de proteinene der den forekommer etter direktiv av kodonet UGA, et kodon som normalt fungerer som et stoppkodon (proteinsyntese, genetisk kode).
Selenocystein deltar i reduksjons-oksidasjons-funksjonen hos glutationperoksidase fra pattedyr, formiatdehydrogenase fra bakterier, og hos visse andre enzymer.
- Kjemisk formel: HSe-CH2CH(NH2)COOH