Molekylformel er en kjemisk formel som forteller hvilke grunnstoffatomer et molekyl består av og hvor mange atomer det er av hvert grunnstoff.
Det finnes flere ulike typer molekylformler, som bruttoformel og strukturformel. En bruttoformel angir kun hvor mange atomer det er av hvert grunnstoff i molekylet. En strukturformel angir også hvordan de er bundet sammen i større eller mindre detalj.
Eksempel: Bruttoformelen for vann er H2O, noe som angir at det er to hydrogenatomer (H) og ett oksigenatom (O) i vannmolekylet. Den (kondenserte) strukturformelen HOH angir i tillegg at begge hydrogenatomene er bundet til oksygenatomet i midten.