RPS18

RPS18 (англ. Ribosomal protein S18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 719.

RPS18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS18, D6S218E, HKE3, KE-3, KE3, S18, ribosomal protein S18
Зовнішні ІД	OMIM: 180473 MGI: 98146 HomoloGene: 88764 GeneCards: RPS18
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • structural constituent of ribosome • protein kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • внутрішньоклітинний • small ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • гіалоплазма • cytosolic small ribosomal subunit • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • синапс Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • Біосинтез білків • ribosome biogenesis • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6222	20084
Ensembl	ENSG00000226225 ENSG00000096150 ENSG00000231500 ENSG00000235650 ENSG00000223367 ENSG00000227794	ENSMUSG00000008668
UniProt	P62269	P62270
RefSeq (мРНК)	NM_022551	NM_011296 NM_138946
RefSeq (білок)	NP_072045	NP_035426
Локус (UCSC)	Хр. 6: 33.27 – 33.28 Mb	Хр. 17: 34.17 – 34.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLVIPEKFQ		HILRVLNTNI		DGRRKIAFAI		TAIKGVGRRY		AHVVLRKADI
DLTKRAGELT		EDEVERVITI		MQNPRQYKIP		DWFLNRQKDV		KDGKYSQVLA
NGLDNKLRED		LERLKKIRAH		RGLRHFWGLR		VRGQHTKTTG		RRGRTVGVSK
KK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Chassin D., Bellet D., Koman A. (1993). The human homolog of ribosomal protein S18. Nucleic Acids Res. 21: 745—745. PMID 8441687 DOI:10.1093/nar/21.3.745
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6