Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TOX4
Ідентифікатори
Символи
TOX4 , C14orf92, KIAA0737, LCP1, MIG7, TOX high mobility group box family member 4
Зовнішні ІД
OMIM : 614032 MGI: 1915389 HomoloGene: 8889 GeneCards: TOX4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Хроматин • клітинне ядро • PTW/PP1 phosphatase complex
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 21.48 – 21.5 Mb
Хр. 14: 52.52 – 52.53 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TOX4 (англ. TOX high mobility group box family member 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот , а молекулярна маса — 66 195[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEFPGGNDNY LTITGPSHPF LSGAETFHTP SLGDEEFEIP PISLDSDPSL
AVSDVVGHFD DLADPSSSQD GSFSAQYGVQ TLDMPVGMTH GLMEQGGGLL
SGGLTMDLDH SIGTQYSANP PVTIDVPMTD MTSGLMGHSQ LTTIDQSELS
SQLGLSLGGG TILPPAQSPE DRLSTTPSPT SSLHEDGVED FRRQLPSQKT
VVVEAGKKQK APKKRKKKDP NEPQKPVSAY ALFFRDTQAA IKGQNPNATF
GEVSKIVASM WDSLGEEQKQ VYKRKTEAAK KEYLKALAAY KDNQECQATV
ETVELDPAPP SQTPSPPPMA TVDPASPAPA SIEPPALSPS IVVNSTLSSY
VANQASSGAG GQPNITKLII TKQMLPSSIT MSQGGMVTVI PATVVTSRGL
QLGQTSTATI QPSQQAQIVT RSVLQAAAAA AAAASMQLPP PRLQPPPLQQ
MPQPPTQQQV TILQQPPPLQ AMQQPPPQKV RINLQQQPPP LQIKSVPLPT
LKMQTTLVPP TVESSPERPM NNSPEAHTVE APSPETICEM ITDVVPEVES
PSQMDVELVS GSPVALSPQP RCVRSGCENP PIVSKDWDNE YCSNECVVKH
CRDVFLAWVA SRNSNTVVFV K
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Lee J.H., You J., Dobrota E., Skalnik D.G. (2010). Identification and characterization of a novel human PP1 phosphatase complex. J. Biol. Chem . 285 : 24466—24476. PMID 20516061 DOI :10.1074/jbc.M110.109801
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші