DEDD

DEDD
Ідентифікатори
Символи	DEDD, CASP8IP1, DEDD1, DEFT, FLDED1, KE05, death effector domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 606841 MGI: 1333874 HomoloGene: 7980 GeneCards: DEDD
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • regulation of apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • Сперматогенез • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • decidualization • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9191	21945
Ensembl	ENSG00000158796	ENSMUSG00000013973
UniProt	O75618	Q9Z1L3
RefSeq (мРНК)	NM_001039711 NM_001039712 NM_004216 NM_032998 NM_001330765	NM_001128609 NM_011615 NM_001357550 NM_001357551 NM_001357552 NM_001357553
RefSeq (білок)	NP_001034800 NP_001034801 NP_001317694 NP_127491	NP_001122081 NP_035745 NP_001344479 NP_001344480 NP_001344481 NP_001344482
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161.12 – 161.13 Mb	Хр. 1: 171.16 – 171.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DEDD (англ. Death effector domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 318 амінокислот, а молекулярна маса — 36 794.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGLKRRASQ		VWPEEHGEQE		HGLYSLHRMF		DIVGTHLTHR		DVRVLSFLFV
DVIDDHERGL		IRNGRDFLLA		LERQGRCDES		NFRQVLQLLR		IITRHDLLPY
VTLKRRRAVC		PDLVDKYLEE		TSIRYVTPRA		LSDPEPRPPQ		PSKTVPPHYP
VVCCPTSGPQ		MCSKRPARGR		ATLGSQRKRR		KSVTPDPKEK		QTCDIRLRVR
AEYCQHETAL		QGNVFSNKQD		PLERQFERFN		QANTILKSRD		LGSIICDIKF
SELTYLDAFW		RDYINGSLLE		ALKGVFITDS		LKQAVGHEAI		KLLVNVDEED
YELGRQKLLR		NLMLQALP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Leo C.P., Hsu S.Y., McGee E.A., Salanova M., Hsueh A.J.W. (1998). DEFT, a novel death effector domain-containing molecule predominantly expressed in testicular germ cells. Endocrinology. 139: 4839—4848. PMID 9832420 DOI:10.1210/endo.139.12.6335
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhan Y., Hegde R., Srinivasula S.M., Fernandes-Alnemri T., Alnemri E.S. (2002). Death effector domain-containing proteins DEDD and FLAME-3 form nuclear complexes with the TFIIIC102 subunit of human transcription factor IIIC. Cell Death Differ. 9: 439—447. PMID 11965497 DOI:10.1038/sj.cdd.4401038
• Alcivar A., Hu S., Tang J., Yang X. (2003). DEDD and DEDD2 associate with caspase-8/10 and signal cell death. Oncogene. 22: 291—297. PMID 12527898 DOI:10.1038/sj.onc.1206099

Див. також

• Хромосома 1