EFNB3

EFNB3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BKF
Ідентифікатори
Символи	EFNB3, EFL6, EPLG8, LERK8, ephrin B3
Зовнішні ІД	OMIM: 602297 MGI: 109196 HomoloGene: 1076 GeneCards: EFNB3
Онтологія гена Молекулярна функція • ephrin receptor binding • transmembrane-ephrin receptor activity • virus receptor activity • protein tyrosine kinase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • glutamatergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • ephrin receptor signaling pathway • multicellular organism development • cell-cell signaling • viral entry into host cell • T cell costimulation • диференціація клітин • GO:0022415 viral process • axon choice point recognition • нейробіологія розвитку • adult walking behavior • axon guidance • peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of axonogenesis • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex, modulating synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1949	13643
Ensembl	ENSG00000108947	ENSMUSG00000003934
UniProt	Q15768	O35393
RefSeq (мРНК)	NM_001406	NM_007911
RefSeq (білок)	NP_001397	NP_031937
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.71 – 7.71 Mb	Хр. 11: 69.44 – 69.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFNB3 (англ. Ephrin B3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340 амінокислот, а молекулярна маса — 35 835.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPPHSGPGG		VRVGALLLLG		VLGLVSGLSL		EPVYWNSANK		RFQAEGGYVL
YPQIGDRLDL		LCPRARPPGP		HSSPNYEFYK		LYLVGGAQGR		RCEAPPAPNL
LLTCDRPDLD		LRFTIKFQEY		SPNLWGHEFR		SHHDYYIIAT		SDGTREGLES
LQGGVCLTRG		MKVLLRVGQS		PRGGAVPRKP		VSEMPMERDR		GAAHSLEPGK
ENLPGDPTSN		ATSRGAEGPL		PPPSMPAVAG		AAGGLALLLL		GVAGAGGAMC
WRRRRAKPSE		SRHPGPGSFG		RGGSLGLGGG		GGMGPREAEP		GELGIALRGG
GAADPPFCPH		YEKVSGDYGH		PVYIVQDGPP		QSPPNIYYKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у мембрані.

Література

• Tang X.X., Pleasure D.E., Ikegaki N. (1997). cDNA cloning, chromosomal localization, and expression pattern of EPLG8, a new member of the EPLG gene family encoding ligands of EPH-related protein-tyrosine kinase receptors. Genomics. 41: 17—24. PMID 9126477 DOI:10.1006/geno.1997.4615
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 17