PRPF6
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
PRPF6 (англ. Pre-mRNA processing factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 106 925[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNKKKKPFLG | MPAPLGYVPG | LGRGATGFTT | RSDIGPARDA | NDPVDDRHAP | ||||
PGKRTVGDQM | KKNQAADDDD | EDLNDTNYDE | FNGYAGSLFS | SGPYEKDDEE | ||||
ADAIYAALDK | RMDERRKERR | EQREKEEIEK | YRMERPKIQQ | QFSDLKRKLA | ||||
EVTEEEWLSI | PEVGDARNKR | QRNPRYEKLT | PVPDSFFAKH | LQTGENHTSV | ||||
DPRQTQFGGL | NTPYPGGLNT | PYPGGMTPGL | MTPGTGELDM | RKIGQARNTL | ||||
MDMRLSQVSD | SVSGQTVVDP | KGYLTDLNSM | IPTHGGDIND | IKKARLLLKS | ||||
VRETNPHHPP | AWIASARLEE | VTGKLQVARN | LIMKGTEMCP | KSEDVWLEAA | ||||
RLQPGDTAKA | VVAQAVRHLP | QSVRIYIRAA | ELETDIRAKK | RVLRKALEHV | ||||
PNSVRLWKAA | VELEEPEDAR | IMLSRAVECC | PTSVELWLAL | ARLETYENAR | ||||
KVLNKARENI | PTDRHIWITA | AKLEEANGNT | QMVEKIIDRA | ITSLRANGVE | ||||
INREQWIQDA | EECDRAGSVA | TCQAVMRAVI | GIGIEEEDRK | HTWMEDADSC | ||||
VAHNALECAR | AIYAYALQVF | PSKKSVWLRA | AYFEKNHGTR | ESLEALLQRA | ||||
VAHCPKAEVL | WLMGAKSKWL | AGDVPAARSI | LALAFQANPN | SEEIWLAAVK | ||||
LESENDEYER | ARRLLAKARS | SAPTARVFMK | SVKLEWVQDN | IRAAQDLCEE | ||||
ALRHYEDFPK | LWMMKGQIEE | QKEMMEKARE | AYNQGLKKCP | HSTPLWLLLS | ||||
RLEEKIGQLT | RARAILEKSR | LKNPKNPGLW | LESVRLEYRA | GLKNIANTLM | ||||
AKALQECPNS | GILWSEAIFL | EARPQRRTKS | VDALKKCEHD | PHVLLAVAKL | ||||
FWSQRKITKA | REWFHRTVKI | DSDLGDAWAF | FYKFELQHGT | EEQQEEVRKR | ||||
CESAEPRHGE | LWCAVSKDIA | NWQKKIGDIL | RLVAGRIKNT | F |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
- Nishikimi A., Mukai J., Kioka N., Yamada M. (1999). A novel mammalian nuclear protein similar to Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p and Saccharomyces cerevisiae Prp6p pre-mRNA splicing factors. Biochim. Biophys. Acta. 1435: 147—152. PMID 10561546 DOI:10.1016/S0167-4838(99)00203-4
- Makarov E.M., Makarova O.V., Achsel T., Luehrmann R. (2000). The human homologue of the yeast splicing factor Prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions. J. Mol. Biol. 298: 567—575. PMID 10788320 DOI:10.1006/jmbi.2000.3685
- Yuryev A., Ono M., Goff S.A., Macaluso F., Wennogle L.P. (2000). Isoform-specific localization of A-RAF in mitochondria. Mol. Cell. Biol. 20: 4870—4878. PMID 10848612 DOI:10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRPF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15860 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O94906 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |