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ISBN-13: 9781627036061

Book Title: Tiling Arrays

ISBN: 9781627036061

Subject Area: Science, Medical

Publication Name: Tiling Arrays : Methods and Protocols

Publisher: Humana Press

Item Length: 10 in

Subject: Life Sciences / Molecular Biology, Genetics, Life Sciences / Biology, Research & Methodology

Publication Year: 2013

Series: Methods in Molecular Biology Ser.

Type: Textbook

Format: Hardcover

Language: English

Author: Alfred Chun Shui Luk

Item Weight: 216.9 Oz

Item Width: 7 in

Number of Pages: Xi, 236 Pages

À propos de ce produit

Product Identifiers

Publisher

Humana Press

ISBN-10

1627036067

ISBN-13

9781627036061

eBay Product ID (ePID)

166265350

Product Key Features

Number of Pages

Xi, 236 Pages

Language

English

Publication Name

Tiling Arrays : Methods and Protocols

Subject

Life Sciences / Molecular Biology, Genetics, Life Sciences / Biology, Research & Methodology

Publication Year

2013

Type

Textbook

Subject Area

Science, Medical

Author

Alfred Chun Shui Luk

Series

Methods in Molecular Biology Ser.

Format

Hardcover

Dimensions

Item Weight

216.9 Oz

Item Length

10 in

Item Width

7 in

Additional Product Features

Intended Audience

Scholarly & Professional

LCCN

2013-946424

Dewey Edition

Series Volume Number

1067

CLASSIFICATION_METADATA

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Number of Volumes

1 vol.

Illustrated

Yes

Dewey Decimal

572.8/636

Table Of Content

A Brief Introduction to Tiling Microarrays: Principles, Concepts, and Applications.- Design of Tiling Arrays and their Application to Bacterial Transcriptome Analysis.- Transcript Profiling in Arabidopsis with Genome Tiling Microarrays .- Genome-wide Analysis of Transcription Factor Binding Sites in Skeletal Muscle Cells using ChIP-seq.- Analysis of Allele-Specific Gene Expression Using a Target-Oriented Tiling Microarray Assay .- Detection of Epigenetic Alterations Using Tiling Arrays.- Investigating Gene Promoter Methylation in a Mouse Model of Status Epilepticus .- Integrative Analysis of ChIP-chip and ChIP-seq Dataset.- HAT: A Novel Statistical Approach to Discover Functional Regions in the Genome .- Inference of Alternative Splicing from Tiling Array Data.- Analysis of in vivo Occupancy of Aebp1, a Transcription Factor, using High Resolution Tiling Array .- Application of the Simple and Efficient MPeak Modeling in Binding Peak Identification in CHIP-CHIP Studies .- Evaluation of MeDIP-chip in the Context of Whole Genome Bisulphite Sequencing (WGBS-seq) in Arabidopsis .- Mapping Genomic Features of Tiling Microarray Data by TileMapper.

Synopsis

This book details many of the methods that are now commonly used to study tiling microarrays in genomic discovery. It provides step-by-step detail essential for reproducible results and contains expert implementation advice., Part I: OverView 1. A Brief Introduction to Tiling Microarrays: Principles, Concepts, and Applications Christophe Lemetre and Zhengdong D. Zhang Part II: Transcriptional Regulation and Expression 2. Design of Tiling Arrays and their Application to Bacterial Transcriptome Analysis Takeshi Akama, Kazuaki Nakamura, Akito Tanoue, and Koichi Suzuki 3. Transcript Profiling in Arabidopsis with Genome Tiling Microarrays Diana Coman, Wilhelm Gruissem, and Lars Hennig 4. Genome-wide Analysis of Transcription Factor Binding Sites in Skeletal Muscle Cells using ChIP-seq Chung-Il An and Nobuko Hagiwara 5. Analysis of Allele-Specific Gene Expression Using a Target-Oriented Tiling Microarray Assay Huiyong Zhang, Xing-Wang Deng, and Lei Li Part III: Genetics and Epigenetics Regulation 6. Detection of Epigenetic Alterations Using Tiling Arrays Hoi-Hung Cheung and Owen M Rennert 7. Investigating Gene Promoter Methylation in a Mouse Model of Status Epilepticus Suzanne F. C. Miller-Delaney, Sudipto Das, Raymond L. Stallings, and David C. Henshall Part IV: Data Analysis 8. Integrative Analysis of ChIP-chip and ChIP-seq Dataset Lihua Julie Zhu 9. HAT: A Novel Statistical Approach to Discover Functional Regions in the Genome Erdogan Taskesen, Bas Wouters, and Ruud Delwel 10. Inference of Alternative Splicing from Tiling Array Data Johannes Eichner 11. Analysis of in vivo Occupancy of Aebp1, a Transcription Factor, using High Resolution Tiling Array Swati Sinha, Sainitin Donakonda, and Satyanarayana MR Rao 12. Application of the Simple and Efficient MPeak Modeling in Binding Peak Identification in CHIP-CHIP Studies Ming Zheng, Yunmin Li, and Yun-Fai Chris Lau 13. Evaluation of MeDIP-chip in the Context of Whole Genome Bisulphite Sequencing (WGBS-seq) in Arabidopsis René Wardenaar, Haiyin Liu, Vincent Colot, Maria Colomé-Tatché, Frank Johannes 14. Mapping Genomic Features of Tiling Microarray Data by TileMapper Hoi-Hung Cheung, Janek Claus, Sumeeta Singh, Chandan Sastry, Owen M Rennert, Wai-Yee Chan, Tin-Lap Lee, In Tiling Arrays: Methods and Protocols , expert researchers in the field detail many of the methods which are now commonly used to study tiling microarrays in genomic discovery . These include methods and applications for transcriptional regulation, expression, genetic and epigenetic regulation, as well as techniques and skills on tiling microarray data analysis. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and key tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Authoritative and practical, Tiling Arrays: Methods and Protocols seeks to provide scientists with a comprehensive and down to earth approach to maximize results.

LC Classification Number

RB155-155.8

2013

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Premier Books LLC

David Taylor

26C Trolley Sq

19806-3356 Wilmington, DE

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