Über uns
Die Pflanzenforschung nutzt interdisziplinäre Ansätze, um die Mechanismen von Physiologie, Wachstum und Ertrag von Pflanzen zu verstehen. Dabei kommen Hochdurchsatz- und gezielte Methoden zum Einsatz, die große Datenmengen aus Genomik, Transkriptomik und anderen Bereichen erzeugen. Um diese Daten effektiv zu nutzen, sind ein Forschungsdatenmanagement (FDM) gemäß den FAIR-Prinzipien, der Datenaustausch und wissenschaftliche Zusammenarbeit entscheidend. DataPLANT unterstützt die Pflanzenforschung durch ein offenes Modell, das robuste und zugängliche FDM-Praktiken und Tools bereitstellt. Ein zentrales Element ist der Annotated Research Context (ARC), der relevante Forschungs- und Metadaten in FAIR-konforme digitale Objekte integriert. Zudem wird über die PLANTdataHUB Cloud-Plattform der Datenaustausch, die Veröffentlichung und kollaborative Datenverwaltung erleichtert.
DataPLANT fördert die Pflanzenforschungsdaten- Community durch Schulungsaktivitäten und die Bereitstellung eines Datenmanagementplan-Assistenten. Ziel ist es, eine breite Beteiligung an der zu erreichen, wobei die Interoperabilität und Integration bestehender Datenbestände im Fokus stehen. Zudem arbeitet DataPLANT mit anderen NFDI-Konsortien zusammen, um einheitliche Standards und bewährte Verfahren für die Datenverarbeitung und Qualitätskontrolle zu entwickeln. Durch Automatisierung und Community-Einbindung wird die Nachhaltigkeit der DataPLANT-Dienste gesichert und die Erstellung qualitativ hochwertiger Datenpublikationen unterstützt.
Ziele
DataPLANT arbeitet datenzentriert und baut auf bestehenden Strukturen auf. Ein grundlegendes Element zur Zielerreichung ist der Annotated Research Context (ARC), welcher als Einstiegspunkt fungiert und zukünftig die Struktur einer Datenpublikation im Fachgebiet definiert. Der ARC deckt den gesamten Forschungszyklus ab, vom Experiment über die rechnerischen Aspekte bis hin zu den eigentlichen Daten und Metadaten sowie die daraus resultierenden Publikationen. Er basiert auf bestehenden Formaten, Terminologien und Richtlinien, sodass die Integration bestehender Daten in bereits existierende Repositorien möglichst reibungslos erfolgen kann. Es stehen eine Reihe von Tools und Services zur Verfügung, um von Beginn an einen schnellen Einstieg in ein verbessertes Datenmanagement zu gewährleisten. Gleichzeitig wurde die technische Infrastruktur für die gemeinsame Nutzung und Versionierung von ARCs aufgebaut. Dementsprechend stellt DataPLANT in FDM-Belangen die zentrale Anlaufstelle für Forschende im Bereich der Pflanzen-Grundlagenforschung dar.
Aufgabenbereich
Dr. Dirk von Suchodoletz
Sprecher des Konsortiums
(Mit-)Antragstellende Institutionen und (Co-)Sprecher:innen:
- Professor Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
- Dr. Jens Krüger – Eberhard Karls Universität Tübingen
- Professor Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Antragsstellende Institution
Beteiligte Institutionen
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene InformationssystemeRheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
- Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
- Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
Dr. Dirk Suchodoletz
Sprecher des Konsortiums
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Antragsstellende Institution
(Mit-)Antragstellende Institutionen und (Co-)Sprecher:innen:
- Professor Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
- Dr. Jens Krüger – Eberhard Karls Universität Tübingen
- Professor Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
Beteiligte Institutionen
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene InformationssystemeRheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
- Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
- Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf