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In-silico Research Platform in the Cloud - Performance and Scalability Analysis

Author(s):  
Milos Ivanovic ◽  
Andreja Zivic ◽  
Nikolaos Tachos ◽  
George Gois ◽  
Nenad Filipovic ◽  
...  
2020 ◽  
Vol 47 (6) ◽  
pp. 398-408
Author(s):  
Sonam Tulsyan ◽  
Showket Hussain ◽  
Balraj Mittal ◽  
Sundeep Singh Saluja ◽  
Pranay Tanwar ◽  
...  

Author(s):  
Nils Lachmann ◽  
Diana Stauch ◽  
Axel Pruß

ZusammenfassungDie Typisierung der humanen Leukozytenantigene (HLA) vor Organ- und hämatopoetischer Stammzelltransplantation zur Beurteilung der Kompatibilität von Spender und Empfänger wird heutzutage in der Regel molekulargenetisch mittels Amplifikation, Hybridisierung oder Sequenzierung durchgeführt. Durch die exponentiell steigende Anzahl an neu entdeckten HLA-Allelen treten vermehrt Mehrdeutigkeiten, sogenannte Ambiguitäten, in der HLA-Typisierung auf, die aufgelöst werden müssen, um zu einem eindeutigen Ergebnis zu gelangen. Mithilfe kategorisierter Allelfrequenzen (häufig, gut dokumentiert und selten) in Form von CWD-Allellisten (CWD: common and well-documented) ist die In-silico-Auflösung von Ambiguitäten durch den Ausschluss seltener Allele als mögliches Ergebnis realisierbar. Ausgehend von einer amerikanischen CWD-Liste existieren derzeit auch eine europäische, deutsche und chinesische CWD-Liste, die jeweils regionale Unterschiede in den Allelfrequenzen erkennbar werden lassen. Durch die Anwendung von CWD-Allelfiltern in der klinischen HLA-Typisierung können Zeit, Kosten und Arbeitskraft eingespart werden.


Planta Medica ◽  
2010 ◽  
Vol 76 (12) ◽  
Author(s):  
B Waltenberger ◽  
D Schuster ◽  
S Paramapojn ◽  
W Gritsanapan ◽  
G Wolber ◽  
...  

Pneumologie ◽  
2011 ◽  
Vol 65 (12) ◽  
Author(s):  
B Berschneider ◽  
D Ellwanger ◽  
C Thiel ◽  
V Stümpflen ◽  
M Königshoff

Author(s):  
D Fecher ◽  
A Stratmann ◽  
G Wangorsch ◽  
C Göttlich ◽  
H Walles ◽  
...  
Keyword(s):  

Planta Medica ◽  
2016 ◽  
Vol 81 (S 01) ◽  
pp. S1-S381 ◽  
Author(s):  
B Ovalle-Magallanes ◽  
A Madariaga-Mazón ◽  
A Navarrete ◽  
R Mata

2019 ◽  
Author(s):  
I. Farah ◽  
A. El-Mubark ◽  
M. Osman ◽  
A. Soliman ◽  
F. Ali ◽  
...  

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