Location via proxy:   [ UP ]  
[Report a bug]   [Manage cookies]                
Download as xls, pdf, or txt
Download as xls, pdf, or txt
You are on page 1of 28

Model #Param BIC AICc lnL Invariant

T92+G+I 105 7419.433182876 6568.756519059 -3178.923788317 0.6216379098


K2+G+I 104 7422.464514394 6579.881003414 -3185.494623629 0.623936898
T92+G 104 7433.354824287 6590.771313307 -3190.939778576 n/a
HKY+G+I 107 7437.486976139 6570.624500894 -3177.840345841 0.6219833906
T92+I 104 7439.084543346 6596.501032366 -3193.804638105 0.6455380753
K2+I 103 7439.979819788 6605.489626367 -3199.30744588 0.646185458
K2+G 103 7442.008276188 6607.518082766 -3200.32167408 n/a
TN93+G+I 108 7446.929693973 6571.974560179 -3177.506535204 0.6226171154
HKY+G 106 7456.709125561 6597.939473649 -3192.506590106 n/a
HKY+I 106 7457.509044483 6598.739392571 -3192.906549566 0.6456032229
TN93+G 107 7465.383061502 6598.520586258 -3191.788388522 n/a
TN93+I 107 7466.71228455 6599.849809305 -3192.453000046 0.6455375588
GTR+G+I 111 7469.084978189 6569.852857644 -3173.418668652 0.6220358516
GTR+I 110 7488.445541218 6597.305584753 -3188.15411972 0.6457304734
GTR+G 110 7490.446333233 6599.306376769 -3189.154515728 n/a
T92 103 8107.497755105 7273.007561684 -3533.066413538 n/a
K2 102 8111.910369997 7285.513658836 -3540.327890538 n/a
HKY 105 8131.384446177 7280.70778236 -3534.899419967 n/a
TN93 106 8131.828182428 7273.058530516 -3530.066118539 n/a
GTR 109 8163.723501105 7280.675873564 -3530.848269217 n/a
JC+G+I 103 8229.809031041 7395.31883762 -3594.222051506 0.62743466
JC+I 102 8236.607060112 7410.210348951 -3602.676235595 0.6439310828
JC+G 102 8240.419579166 7414.022868006 -3604.582495122 n/a
JC 101 8867.723651086 8049.420586868 -3923.289700636 n/a
Gamma R Freq A Freq T Freq C
2.4800291386 10.5927453483 0.2740689543 0.2740689543 0.2259310457
2.6061039291 10.525977103 0.25 0.25 0.25
0.1788291754 10.4573179159 0.2740689543 0.2740689543 0.2259310457
2.4747118101 10.7834584402 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 9.9024369738 0.2740689543 0.2740689543 0.2259310457
n/a 9.9209229941 0.25 0.25 0.25
0.1764450298 10.446350147 0.25 0.25 0.25
2.4827860253 10.6771613685 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
0.1809314855 10.6339491725 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 10.045302963 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
0.1812360953 10.5128099757 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 9.9889588824 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
2.5000513165 10.6548342291 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 9.9583992097 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
0.1780487933 10.5652145594 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 8.5612509703 0.2740689543 0.2740689543 0.2259310457
n/a 8.5535136424 0.25 0.25 0.25
n/a 8.5658504528 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 8.5640604163 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
n/a 8.5650874942 0.299154334 0.2489835746 0.2147097089
3.9394778679 0.5 0.25 0.25 0.25
n/a 0.5 0.25 0.25 0.25
0.1783845203 0.5 0.25 0.25 0.25
n/a 0.5 0.25 0.25 0.25
Freq G A=>T A=>C A=>G T=>A T=>C T=>G C=>A C=>T C=>G G=>A G=>T G=>C
0.2259310457 0.01 0.01 0.21 0.01 0.21 0.01 0.01 0.25 0.01 0.25 0.01 0.01
0.25 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01
0.2259310457 0.01 0.01 0.21 0.01 0.21 0.01 0.01 0.25 0.01 0.25 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.22 0.01 0.2 0.01 0.01 0.23 0.01 0.27 0.01 0.01
0.2259310457 0.01 0.01 0.21 0.01 0.21 0.01 0.01 0.25 0.01 0.25 0.01 0.01
0.25 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01
0.25 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01 0.23 0.01 0.23 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.21 0.01 0.21 0.01 0.01 0.24 0.01 0.26 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.22 0.01 0.2 0.01 0.01 0.23 0.01 0.27 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.22 0.01 0.2 0.01 0.01 0.23 0.01 0.27 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.2 0.01 0.21 0.01 0.01 0.25 0.01 0.25 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.21 0.01 0.21 0.01 0.01 0.24 0.01 0.26 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.02 0.21 0.01 0.21 0.01 0.02 0.24 0 0.26 0.01 0
0.2371523825 0.01 0.02 0.21 0.01 0.21 0.01 0.02 0.24 0 0.26 0.01 0
0.2371523825 0.01 0.02 0.2 0.01 0.21 0.01 0.03 0.25 0 0.25 0.01 0
0.2259310457 0.01 0.01 0.2 0.01 0.2 0.01 0.01 0.25 0.01 0.25 0.01 0.01
0.25 0.01 0.01 0.22 0.01 0.22 0.01 0.01 0.22 0.01 0.22 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.21 0.02 0.19 0.01 0.02 0.22 0.01 0.27 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.01 0.18 0.02 0.22 0.01 0.02 0.26 0.01 0.23 0.01 0.01
0.2371523825 0.01 0.02 0.18 0.01 0.22 0.01 0.02 0.26 0.01 0.23 0.01 0.01
0.25 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08
0.25 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08
0.25 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08
0.25 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08
models
Evolutionary analyses were conducted in MEGA7 [2].

Kimura 2-parameter; JC: Jukes-Cantor.

Phylogenetics. Oxford University Press, New York.


datasets.Molecular Biology and Evolution 33:1870-1874.
other warranties expressed or implied, including but not limited to the determination of
suitability of this caption text for a specific purpose, use, or application.
From\To A T C G
A - 0.0117205143 0.0096619045 0.2066072367
T 0.0117205143 - 0.2066072367 0.0096619045
C 0.0117205143 0.2506279257 - 0.0096619045
G 0.2506279257 0.0117205143 0.0096619045 -
From\To A T C G
A - 0.0108450675 0.0108450675 0.2283098649
T 0.0108450675 - 0.2283098649 0.0108450675
C 0.0108450675 0.2283098649 - 0.0108450675
G 0.2283098649 0.0108450675 0.0108450675 -
From\To A T C G
A - 0.011859165 0.0097762023 0.2063786411
T 0.011859165 - 0.2063786411 0.0097762023
C 0.011859165 0.2503506244 - 0.0097762023
G 0.2503506244 0.011859165 0.0097762023 -
From\To A T C G
A - 0.0105698946 0.0091148944 0.217017113
T 0.0126997525 - 0.1964799201 0.0100676348
C 0.0126997525 0.2278437853 - 0.0100676348
G 0.273754829 0.0105698946 0.0091148944 -
From\To A T C G
A - 0.0124632523 0.0102741867 0.2053826722
T 0.0124632523 - 0.2053826722 0.0102741867
C 0.0124632523 0.2491424498 - 0.0102741867
G 0.2491424498 0.0124632523 0.0102741867 -
From\To A T C G
A - 0.011445919 0.011445919 0.227108162
T 0.011445919 - 0.227108162 0.011445919
C 0.011445919 0.227108162 - 0.011445919
G 0.227108162 0.011445919 0.011445919 -
From\To A T C G
A - 0.0109205116 0.0109205116 0.2281589767
T 0.0109205116 - 0.2281589767 0.0109205116
C 0.0109205116 0.2281589767 - 0.0109205116
G 0.2281589767 0.0109205116 0.0109205116 -
From\To A T C G
A - 0.0106284683 0.0091654052 0.2054826218
T 0.012770129 - 0.2083403365 0.0101234252
C 0.012770129 0.2415974665 - 0.0101234252
G 0.2592047199 0.0106284683 0.0091654052 -
From\To A T C G
A - 0.0107057236 0.0092320259 0.2167583636
T 0.0128629514 - 0.1962456571 0.0101970095
C 0.0128629514 0.2275721273 - 0.0101970095
G 0.2734284312 0.0107057236 0.0092320259 -
From\To A T C G
A - 0.011276246 0.0097240129 0.2156715389
T 0.0135484354 - 0.195261683 0.0107404218
C 0.0135484354 0.2264310825 - 0.0107404218
G 0.2720574633 0.011276246 0.0097240129 -
From\To A T C G
A - 0.0107650062 0.0092831479 0.2006798145
T 0.0129341795 - 0.2128617224 0.010253475
C 0.0129341795 0.2468405961 - 0.010253475
G 0.2531462499 0.0107650062 0.0092831479 -
From\To A T C G
A - 0.0113002184 0.0097446854 0.2059607561
T 0.0135772382 - 0.2053411116 0.0107632551
C 0.0135772382 0.2381194788 - 0.0107632551
G 0.2598078593 0.0113002184 0.0097446854 -
From\To A T C G
A - 0.0080763229 0.0161506321 0.2056288532
T 0.0097037205 - 0.208418574 0.0106258927
C 0.0225026227 0.2416881929 - 0.0034953932
G 0.2593891825 0.0111560032 0.0031646102 -
From\To A T C G
A - 0.0090635054 0.0170890908 0.2063781193
T 0.0108898225 - 0.2051614077 0.0109393821
C 0.0238101743 0.237911089 - 0.0036412623
G 0.2603343394 0.0114851321 0.0032966752 -
From\To A T C G
A - 0.0078305216 0.0180556869 0.2003537664
T 0.0094083896 - 0.213927094 0.0119297014
C 0.0251569294 0.2480760318 - 1.08291378379E-06
G 0.2527349585 0.0125248571 9.80433343428E-07 -
From\To A T C G
A - 0.0142132074 0.0117167769 0.2024974918
T 0.0142132074 - 0.2024974918 0.0117167769
C 0.0142132074 0.2456425396 - 0.0117167769
G 0.2456425396 0.0142132074 0.0117167769 -
From\To A T C G
A - 0.0130841913 0.0130841913 0.2238316174
T 0.0130841913 - 0.2238316174 0.0130841913
C 0.0130841913 0.2238316174 - 0.0130841913
G 0.2238316174 0.0130841913 0.0130841913 -
From\To A T C G
A - 0.0130201349 0.0112278466 0.2123494932
T 0.0156437219 - 0.1922540157 0.0124014447
C 0.0156437219 0.2229433047 - 0.0124014447
G 0.2678668903 0.0130201349 0.0112278466 -
From\To A T C G
A - 0.0129093379 0.0111323014 0.1844146261
T 0.015510599 - 0.2219179639 0.0122959125
C 0.015510599 0.2573424751 - 0.0122959125
G 0.2326286334 0.0129093379 0.0111323014 -
From\To A T C G
A - 0.0105714375 0.0176949954 0.1845103381
T 0.0127016063 - 0.2220787781 0.0120768286
C 0.0246543791 0.2575289599 - 0.0066937186
G 0.2327493688 0.0126793243 0.0060602654 -
From\To A T C G
A - 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333
T 0.0833333333 - 0.0833333333 0.0833333333
C 0.0833333333 0.0833333333 - 0.0833333333
G 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333 -
From\To A T C G
A - 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333
T 0.0833333333 - 0.0833333333 0.0833333333
C 0.0833333333 0.0833333333 - 0.0833333333
G 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333 -
From\To A T C G
A - 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333
T 0.0833333333 - 0.0833333333 0.0833333333
C 0.0833333333 0.0833333333 - 0.0833333333
G 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333 -
From\To A T C G
A - 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333
T 0.0833333333 - 0.0833333333 0.0833333333
C 0.0833333333 0.0833333333 - 0.0833333333
G 0.0833333333 0.0833333333 0.0833333333 -

You might also like