| dbo:abstract
|
- العائلة البروتينية هي مجموعة من البروتينات المربطة تطوريا. في اغلب الحالات العائلة البروتينية لديها عائلة جينات تمثلها، حيث ان كل جين يترجم إلى أحد البروتينات بنسبة 1:1. المصطلح «العائلة البروتينية» يجب ان يميز عن مصطلح عائلة المستخدم في علم التصنيف. البروتينات في العائلة المنحدرة من أصل مشترك في العادة تشترك في الشكل ثلاثي الابعاد، والوظيفة، ولديها تشابه هام في تسلسل الأحماض الأمينية المكونة للبروتين. من أهم التشابهات هو التشابه في تسلسل الأحماض الأمينية لأنه مؤشر قاطع على التماثل وبالتالي مؤشر واضح على وجود أصل مشترك لهذه البروتينات. هنالك نظام عمل متطور بشكل جيد لتقييم التشابهات المهمة بين مجموعة من التسلسلات وذلك باستخدام تقنية ترتيب التسلسل (sequence alignment). البروتينات التي لا تمتلك أصلا مشتركا من المستبعد ان تظهر احصائيا تشابه في تسلسل أحماضهم الأمينية، وذلك يجعل تقنية ترتيب التسلسل أداة قوية في التعرف على أعضاء العائلة البروتينية. العائلات البروتينية أحيانا تكون مجتمعة في تحالف (clades) كبير يسمى العائلات الخارقة (superfamilies)، وتجتمع هذه العائلات بناءا على التشابهات التركيبية والتشابه في ميكانيكية عملها حتى وإن لم يكن هنالك تماثل يمكن التعرف عليه في تسلسل الأحماض الأمينية. حاليا تم التعرف على أكثر من 60000 عائلة بروتينية، مع ذلك فإنن الغموض المحيط بتعريف العائلة البروتينية قد قاد الباحثين إلى أرقام مختلفة بشكل مهول. (ar)
- Proteinfamilie bezeichnet eine Gruppe von strukturell ähnlichen Proteinen, die zueinander in evolutionärem Zusammenhang stehen und in entsprechenden Genfamilien codiert sind. Die Bezeichnungen Genfamilie und Proteinfamilie werden meist synonym verwendet, je nachdem ob die Homologie in Bezug auf Genom und DNA (Gene) oder auf der Ebene der Genexpression, Biosynthese und biologischen Funktion (Proteine) betrachtet wird. Eine Klassifizierung von Proteinen in Familien aufgrund ihrer Aminosäuresequenz und der Architektur der sequenzinternen Proteindomänen hilft beim theoretischen Verständnis der evolutionären Entstehung dieser Proteinfamilien und hat praktische Anwendungen in der Biotechnologie und Diagnostik. (de)
- Una familia de proteínas es un grupo de proteínas relacionadas evolutivamente, y con frecuencia es prácticamente un sinónimo de familia génica. El término no se debe confundir con familia usado en el sentido taxonómico. Las proteínas de una familia descienden de un antepasado común y típicamente poseen estructuras tridimensionales, funciones y secuencias similares. A pesar de que es difícil evaluar la significatividad de la similitud funcional o funcional, se ha desarrollado un marco aceptable para evaluar la significatividad de la similitud entre un grupo de secuencias empleando métodos de alineamiento de secuencias. Es muy improbable que las proteínas que no comparten un antepasado común muestren una similitud de secuencias estadísticamente significativa, lo que hace del alineamiento de secuencias una herramienta poderosa para identificar a los miembros de las familias de proteínas. Actualmente se han definido más de 60 000 familias de proteínas, aunque la ambigüedad en la definición de lo que es una "familia de proteínas" conduce a que los diferentes investigadores varíen ampliamente esta cifra. (es)
- A protein family is a group of evolutionarily related proteins. In many cases, a protein family has a corresponding gene family, in which each gene encodes a corresponding protein with a 1:1 relationship. The term "protein family" should not be confused with family as it is used in taxonomy. Proteins in a family descend from a common ancestor and typically have similar three-dimensional structures, functions, and significant sequence similarity. The most important of these is sequence similarity (usually amino-acid sequence), since it is the strictest indicator of homology and therefore the clearest indicator of common ancestry. A fairly well developed framework exists for evaluating the significance of similarity between a group of sequences using sequence alignment methods. Proteins that do not share a common ancestor are very unlikely to show statistically significant sequence similarity, making sequence alignment a powerful tool for identifying the members of protein families. Families are sometimes grouped together into larger clades called superfamilies based on structural and mechanistic similarity, even if no identifiable sequence homology is seen. Currently, over 60,000 protein families have been defined, although ambiguity in the definition of "protein family" leads different researchers to highly varying numbers. (en)
- Famili protein adalah kelompok protein yang berhubungan secara evolusi. Di banyak kasus, sebuah famili protein memiliki yang sesuai, dengan setiap gen mengodekan protein sesuai dengan relasi 1:1. Istilah famili protein tidak dapat disamakan dengan famili yang digunakan pada taksonomi. Protein pada turunan famili dari nenek moyang bersama (lihat homologi) secara khusus memiliki struktur tiga dimensi dan fungsi serupa, serta kesamaan urutan secara signifikan. Hal terpenting dari ketiga hal ini adalah kesamaan urutan (biasanya urutan asam amino) karena kesamaan urutan merupakan indikator homologi yang paling ketat dan karenanya merupakan indikator paling jelas dari nenek moyang bersama. Terdapat kerangka yang dikembangkan cukup baik untuk mengevaluasi signifikansi kesamaan di antara sekelompok urutan menggunakan metode . Protein yang tidak memiliki nenek moyang bersama sangat tidak mungkin menunjukkan kesamaan urutan yang signifikan secara statistik, membuat penyebarisan urutan merupakan alat yang kuat untuk mengidentifikasi anggota famili protein. Famili terkadang dikelompokkan bersama ke dalam klad lebih besar disebut yang didasarkan pada kesamaan struktural dan mekanistik, bahkan jika tidak terdapat homologi urutan teridentifikasi. Saat ini, lebih dari 60.000 famili protein telah terdefinisi, tetapi keambiguan pada definisi famili protein menyebabkan jumlah yang sangat bervariasi di antara peneliti berbeda. (in)
- Une famille de protéines est un ensemble de protéines généralement codées par une famille de gènes. Les familles de protéines regroupent des protéines ayant des caractéristiques proches en termes de structure, de fonction enzymatique et de fonction cellulaire. Le terme famille de protéines peut être employé pour décrire un groupe de protéines non apparentées mais partageant une fonction commune, par exemple, les protéines de choc thermique, la désignation correcte serait ici de parler de classe de protéines. (fr)
- タンパク質ファミリー（タンパクしつファミリー、英: protein family）とは、進化上の共通祖先に由来すると推定されるタンパク質をまとめたグループである。生物を進化系統により分類するように、タンパク質を進化の観点から分類する意味がある。同様の概念で遺伝子をまとめた「遺伝子ファミリー」（遺伝子族）もあるが、これもタンパク質ファミリーにほぼ対応する（タンパク質をコードしないncRNA遺伝子を除く）。 具体的には、一次構造の相同性が統計学的に有意に高いものを、共通祖先タンパク質に由来すると想定し、タンパク質ファミリーを設定している。タンパク質分子を構成する構造上の単位には、立体的および機能的単位であるドメインや、さらに小規模な構造的特徴であるモチーフがあるが、ドメインを一次構造に基づき分類したグループ（ドメインファミリー）がタンパク質ファミリーの基本となっている。類似構造を有しながら一次構造の配列類似性は非常に低いドメインあるいはタンパク質もあるが、このようなものは"収束進化"によると考えられ、一般には同じファミリーにまとめない。一般のタンパク質は複数のドメインからできており、タンパク質ファミリーはどのようなドメインファミリーからなるかによって決められる。 タンパク質をコードする遺伝子は進化の過程でを受け、これによって独立に進化しうる各ドメインが組み合わされてタンパク質分子を構成している。このため、1つのファミリーにまとめられるタンパク質でも、そのドメインの並び方は違う場合もある。例えば、ABC輸送体スーパーファミリーは知られている全生物種がそれぞれ多数を持つ巨大なグループであるが、構成ドメインの並び方は種類により異なり、さらにこれらが複数の分子（サブユニット）に分かれているものもある。 さらには1種類のタンパク質が部分的な特徴から複数のファミリーに分類されうることもある。例えば細胞外ドメインが免疫グロブリンスーパーファミリーに、細胞内ドメインがチロシンキナーゼファミリーに属す受容体（線維芽細胞増殖因子受容体）などが知られている。 ファミリーの定義は研究者により異なり、またファミリーの範囲も厳密に定義されるものではない。ファミリーより広い範囲をスーパーファミリー、より狭い範囲をサブファミリーとする分類も用いられるが、いずれも厳密に定義されるものではなく相対的な概念である。 タンパク質ファミリーおよび遺伝子ファミリーは2つの系列に分けることができる。1つは、種の分化とともに同じ祖先遺伝子が分化し、別の生物が互いに類似の遺伝子またはタンパク質を持つに至る場合で、オーソログという。これは一般に同じまたはよく類似した機能を持つ。他の1つは、遺伝子重複により、同じ種が互いに似た複数の遺伝子（タンパク質）を持つに至る場合で、パラログという。 元の1つの遺伝子が機能を保つか、あるいはその機能が不要になった場合には、パラログである他の遺伝子（または不要になった遺伝子）は機能的束縛から解放され、進化的に新しい機能を獲得することもある。一例を挙げれば、水晶体を形成しているα-クリスタリンは低分子量熱ショックタンパク質ファミリーに入れられる。つまり熱ショックタンパク質の一種が、機能的には一見異なる（ただし元来のシャペロン機能も保ち水晶体を透明化する役割を担うと考えられる）水晶体タンパク質に流用されたと考えられる。 (ja)
- 단백질 패밀리(영어: protein family)는 진화적으로 관련된 단백질 그룹이다. 대부분의 경우 단백질 패밀리에는 해당하는 가 있으며, 각 유전자는 1:1의 관계로 해당하는 단백질을 부호화한다. 단백질 패밀리라는 용어는 분류학에서 사용되는 과(科, family)와 혼동해서는 안된다. 같은 패밀리에 속하는 단백질들은 동일한 공통 조상으로부터 유래하였고, 일반적으로 유사한 3차원 구조, 기능, 중요한 서열 유사성을 가지고 있다. 이 중 가장 중요한 것은 서열 유사성(보통 아미노산 서열)인데, 이는 상동성의 가장 엄격한 지표이며, 따라서 동일한 공통 조상을 공유하는지에 대해 판단하기 위한 가장 명확한 지표이기 때문이다. 서열 정렬 방법을 사용하여 서열 그룹 간의 유사성의 중요성을 평가하기 위한 상당히 잘 개발된 프레임워크가 존재한다. 공통 조상을 공유하지 않는 단백질은 통계적으로 유의미한 서열 유사성을 보일 가능성이 매우 낮기 때문에 서열 정렬은 단백질 패밀리의 구성원들을 식별하기 위한 강력한 도구가 된다. (ko)
- Семейство белков — это группа эволюционно связанных белков, обладающих гомологичной аминокислотной последовательностью. Этот термин почти синонимичен термину «семейство генов», поскольку, если белки имеют гомологичные аминокислотные последовательности, то и кодирующие их гены также должны проявлять значительную степень гомологии в нуклеотидных последовательностях ДНК. Этот термин не следует путать с термином «семейство» в таксономии видов живых организмов. (ru)
- Uma família de proteínas é um grupo de proteínas relacionadas à evolução. Em muitos casos, uma família de proteínas possui uma família de genes correspondente, na qual cada gene codifica uma proteína correspondente com uma relação de 1: 1. O termo família de proteínas não deve ser confundido com família, pois é usado em taxonomia. As proteínas de uma família descendem de um ancestral comum e geralmente possuem estruturas tridimensionais semelhantes, funções e similaridade significativa de sequência. O mais importante deles é a similaridade de sequência (geralmente sequência de aminoácidos), pois é o indicador mais estrito da homologia e, portanto, o mais claro indicador de ancestralidade comum. É muito improvável que proteínas que não compartilhem um ancestral comum mostrem similaridade estatisticamente significativa da sequência, tornando o alinhamento de sequências uma ferramenta poderosa para identificar os membros das famílias de proteínas. (pt)
- 蛋白质家族（英語：Protein family）是一组与演化相关的蛋白质。在许多情况下，蛋白质家族具有相应的基因家族，其中每个基因编码具有1:1关系的相应蛋白质。 术语「蛋白质家族」的「家族」（Family）不应该与「科 (生物)」（英語：Family (biology)）混淆，因为「科 (生物)」用于生物分类学。 家族中的蛋白质来自共同的祖先（见同源），通常具有相似的三维结构，功能和显着的序列相似性。其中最重要的是序列相似性（通常是氨基酸序列），因为它是同源的最严格指标，因此是共同祖先的最清晰的指标。使用序列比对方法评估一组序列之间的相似性的重要性存在相当完善的框架。不共享共同祖先的蛋白质不太可能显示统计学上显着的序列相似性，使序列比对成为识别蛋白质家族成员的有力工具。 有时候，家族有时被分组成更大的演化支称为蛋白质超家族，基于结构和机械相似性，即使没有可识别的序列同源性。 目前，已经定义了超过60,000个蛋白质家族，尽管在“蛋白质家族”定义中的歧义导致不同的研究人员在得到的蛋白质家族总数上有数量的变化。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- Une famille de protéines est un ensemble de protéines généralement codées par une famille de gènes. Les familles de protéines regroupent des protéines ayant des caractéristiques proches en termes de structure, de fonction enzymatique et de fonction cellulaire. Le terme famille de protéines peut être employé pour décrire un groupe de protéines non apparentées mais partageant une fonction commune, par exemple, les protéines de choc thermique, la désignation correcte serait ici de parler de classe de protéines. (fr)
- 단백질 패밀리(영어: protein family)는 진화적으로 관련된 단백질 그룹이다. 대부분의 경우 단백질 패밀리에는 해당하는 가 있으며, 각 유전자는 1:1의 관계로 해당하는 단백질을 부호화한다. 단백질 패밀리라는 용어는 분류학에서 사용되는 과(科, family)와 혼동해서는 안된다. 같은 패밀리에 속하는 단백질들은 동일한 공통 조상으로부터 유래하였고, 일반적으로 유사한 3차원 구조, 기능, 중요한 서열 유사성을 가지고 있다. 이 중 가장 중요한 것은 서열 유사성(보통 아미노산 서열)인데, 이는 상동성의 가장 엄격한 지표이며, 따라서 동일한 공통 조상을 공유하는지에 대해 판단하기 위한 가장 명확한 지표이기 때문이다. 서열 정렬 방법을 사용하여 서열 그룹 간의 유사성의 중요성을 평가하기 위한 상당히 잘 개발된 프레임워크가 존재한다. 공통 조상을 공유하지 않는 단백질은 통계적으로 유의미한 서열 유사성을 보일 가능성이 매우 낮기 때문에 서열 정렬은 단백질 패밀리의 구성원들을 식별하기 위한 강력한 도구가 된다. (ko)
- Семейство белков — это группа эволюционно связанных белков, обладающих гомологичной аминокислотной последовательностью. Этот термин почти синонимичен термину «семейство генов», поскольку, если белки имеют гомологичные аминокислотные последовательности, то и кодирующие их гены также должны проявлять значительную степень гомологии в нуклеотидных последовательностях ДНК. Этот термин не следует путать с термином «семейство» в таксономии видов живых организмов. (ru)
- 蛋白质家族（英語：Protein family）是一组与演化相关的蛋白质。在许多情况下，蛋白质家族具有相应的基因家族，其中每个基因编码具有1:1关系的相应蛋白质。 术语「蛋白质家族」的「家族」（Family）不应该与「科 (生物)」（英語：Family (biology)）混淆，因为「科 (生物)」用于生物分类学。 家族中的蛋白质来自共同的祖先（见同源），通常具有相似的三维结构，功能和显着的序列相似性。其中最重要的是序列相似性（通常是氨基酸序列），因为它是同源的最严格指标，因此是共同祖先的最清晰的指标。使用序列比对方法评估一组序列之间的相似性的重要性存在相当完善的框架。不共享共同祖先的蛋白质不太可能显示统计学上显着的序列相似性，使序列比对成为识别蛋白质家族成员的有力工具。 有时候，家族有时被分组成更大的演化支称为蛋白质超家族，基于结构和机械相似性，即使没有可识别的序列同源性。 目前，已经定义了超过60,000个蛋白质家族，尽管在“蛋白质家族”定义中的歧义导致不同的研究人员在得到的蛋白质家族总数上有数量的变化。 (zh)
- العائلة البروتينية هي مجموعة من البروتينات المربطة تطوريا. في اغلب الحالات العائلة البروتينية لديها عائلة جينات تمثلها، حيث ان كل جين يترجم إلى أحد البروتينات بنسبة 1:1. المصطلح «العائلة البروتينية» يجب ان يميز عن مصطلح عائلة المستخدم في علم التصنيف. العائلات البروتينية أحيانا تكون مجتمعة في تحالف (clades) كبير يسمى العائلات الخارقة (superfamilies)، وتجتمع هذه العائلات بناءا على التشابهات التركيبية والتشابه في ميكانيكية عملها حتى وإن لم يكن هنالك تماثل يمكن التعرف عليه في تسلسل الأحماض الأمينية. (ar)
- Proteinfamilie bezeichnet eine Gruppe von strukturell ähnlichen Proteinen, die zueinander in evolutionärem Zusammenhang stehen und in entsprechenden Genfamilien codiert sind. Die Bezeichnungen Genfamilie und Proteinfamilie werden meist synonym verwendet, je nachdem ob die Homologie in Bezug auf Genom und DNA (Gene) oder auf der Ebene der Genexpression, Biosynthese und biologischen Funktion (Proteine) betrachtet wird. (de)
- Una familia de proteínas es un grupo de proteínas relacionadas evolutivamente, y con frecuencia es prácticamente un sinónimo de familia génica. El término no se debe confundir con familia usado en el sentido taxonómico. Actualmente se han definido más de 60 000 familias de proteínas, aunque la ambigüedad en la definición de lo que es una "familia de proteínas" conduce a que los diferentes investigadores varíen ampliamente esta cifra. (es)
- A protein family is a group of evolutionarily related proteins. In many cases, a protein family has a corresponding gene family, in which each gene encodes a corresponding protein with a 1:1 relationship. The term "protein family" should not be confused with family as it is used in taxonomy. Currently, over 60,000 protein families have been defined, although ambiguity in the definition of "protein family" leads different researchers to highly varying numbers. (en)
- Famili protein adalah kelompok protein yang berhubungan secara evolusi. Di banyak kasus, sebuah famili protein memiliki yang sesuai, dengan setiap gen mengodekan protein sesuai dengan relasi 1:1. Istilah famili protein tidak dapat disamakan dengan famili yang digunakan pada taksonomi. Famili terkadang dikelompokkan bersama ke dalam klad lebih besar disebut yang didasarkan pada kesamaan struktural dan mekanistik, bahkan jika tidak terdapat homologi urutan teridentifikasi. (in)
- タンパク質ファミリー（タンパクしつファミリー、英: protein family）とは、進化上の共通祖先に由来すると推定されるタンパク質をまとめたグループである。生物を進化系統により分類するように、タンパク質を進化の観点から分類する意味がある。同様の概念で遺伝子をまとめた「遺伝子ファミリー」（遺伝子族）もあるが、これもタンパク質ファミリーにほぼ対応する（タンパク質をコードしないncRNA遺伝子を除く）。 具体的には、一次構造の相同性が統計学的に有意に高いものを、共通祖先タンパク質に由来すると想定し、タンパク質ファミリーを設定している。タンパク質分子を構成する構造上の単位には、立体的および機能的単位であるドメインや、さらに小規模な構造的特徴であるモチーフがあるが、ドメインを一次構造に基づき分類したグループ（ドメインファミリー）がタンパク質ファミリーの基本となっている。類似構造を有しながら一次構造の配列類似性は非常に低いドメインあるいはタンパク質もあるが、このようなものは"収束進化"によると考えられ、一般には同じファミリーにまとめない。一般のタンパク質は複数のドメインからできており、タンパク質ファミリーはどのようなドメインファミリーからなるかによって決められる。 (ja)
- Uma família de proteínas é um grupo de proteínas relacionadas à evolução. Em muitos casos, uma família de proteínas possui uma família de genes correspondente, na qual cada gene codifica uma proteína correspondente com uma relação de 1: 1. O termo família de proteínas não deve ser confundido com família, pois é usado em taxonomia. É muito improvável que proteínas que não compartilhem um ancestral comum mostrem similaridade estatisticamente significativa da sequência, tornando o alinhamento de sequências uma ferramenta poderosa para identificar os membros das famílias de proteínas. (pt)
|
