「構造解析は，生命現象を様々なスケールで直接観ることができる“最も高解像度なイメージングモダリティ”である」という視点から，このようなイノベーションがもたらした最新の研究成果と今後の展望をご紹介します． はじめに―構造生物学から構造生命科学，そして構造イメージング時代のトランススケール計測へ【田中啓二，若槻壮市】 第1章 近年の技術革新と解かれた構造 概論 近年の技術革新と解かれた構造【若槻壮市】 1. クライオ電顕によってとらえられたP4-ATPaseフリッパーゼの輸送サイクル【平泉将浩，西澤知宏】 2. クライオ電子顕微鏡によるクロマチンダイナミクス研究【鯨井智也，滝沢由政，胡桃坂仁志】 3. ミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体─クライオ電子顕微鏡による立体構造の解明【荒磯裕平，遠藤斗志也】 4. クライオ電子線トモグラフィーの現状と将来【福田善之】 5. 高速AFMの技術
近年様々な分野に対してDeep learningの応用が研究されてきています。 化学の分野でも物性値の予測モデルや、化合物の生成モデルの研究などが盛んになってきています。最近では、有機化合物の合成を行う際に必要な化学反応の予測をDeep learningで行うという試みが行われてきているのでその先行研究サーベイをしました。 サーベイ資料はこちらのSlideshareにアップロードしています。 問題設定：反応予測および逆合成経路探索 化学反応で、反応物 (reactant) AとBを触媒 (reagent) Cの下で反応させたときに 生成物 (product) D ができたようなプロセスは Reaction SMILES を用いると “A.B.C>>D” というように表すことができます。 ここで、 AとBとC から何ができるか？ （答えはD）を予測する問題を順方向の反応予測問題と呼び、Dを作
Research AlphaFold: Using AI for scientific discovery Published 15 January 2020 Authors Andrew Senior, John Jumper, Demis Hassabis, Pushmeet Kohli UPDATE: In July 2022, we released AlphaFold protein structure predictions for nearly all catalogued proteins known to science. Read the latest blog here. In our study published in Nature, we demonstrate how artificial intelligence research can drive and
お使いのInternet Explorerは古いバージョンのため、正しく表示されない可能性があります。最新のバージョンにアップデートするか、別のブラウザーからご利用ください。 Internet Explorerのアップデートについて シバニ・デイブ記者 BBCニュース 記憶の移植は長らく、典型的なSF（サイエンス・フィクション）のテーマだったが、最近の研究によってそれが現実味を帯びつつある。 米大学の研究者らはこのほど、海に住む軟体動物のジャンボアメフラシの個体から別の個体に、遺伝子のRNA（リボ核酸）を使い、記憶を移植することに成功した。 研究者らはまず、ジャンボアメフラシに刺激に対する防御反応を起こす訓練を行った。その個体から取り出したRNAを訓練を受けていない別の個体に移植すると、刺激に対して訓練された個体と同様の反応を示したという。 米科学誌「eNeuro」に掲載された研究結果は、
2011年に登場した学術論文の海賊版サイト「Sci-Hub」では、2018年2月時点で6450万件の論文が誰でも無料で読めるようになっており、科学コミュニティから称賛を受ける一方で出版社からは非難を浴びています。その渦中の人物であり、Sci-Hubの開発者でもあるAlexandra Elbakyan(アレクサンドラ・エルバキアン)氏はカザフスタンの研究者であり、メディアにあまり登場しないため、謎に包まれた人物です。そんな中、Ian Graber-Stiehl氏が「エルバキアン氏とはどういう人物なのか？」ということに、Sci-Hubの歴史をなぞりつつ迫っています。 Meet the pirate queen making academic papers free online - The Verge https://www.theverge.com/2018/2/8/16985666/ale
ゲノム編集技術、CRISPR/Cas9。今年のノーベル賞（化学賞あるいは医学生理学賞）受賞候補として大きく注目されているが、仮に今年の受賞が無くても、近い将来確実に受賞することだろう。今回は、この革命的テクノロジーの概要をできるだけ分かりやすく解説する。 ゲノム編集技術 バイオテクノロジーの中で今もっとも注目されているのがゲノム編集技術だ。ゲノムとは、ある生物におけるすべての遺伝子の情報をひっくるめたものをさす。今、このゲノムを意のままに改変することができるようになりつつある。この技術はさまざまな生物学現象のメカニズムを解明する上での重要なツールになるほか、有用な家畜や農作物の作出や、遺伝性疾患の治療などへの応用も期待されている。 従来、遺伝子組換え生物をつくる場合は、外来遺伝子をゲノムの中の特定の位置に入れることが難しかった。これらの遺伝子は運び屋のウィルスなどにもたせて細胞内に注入され
地球上で最古の生きた脊椎動物が見つかった。北大西洋と北極の冷たい海にひっそりと暮らしてきたニシオンデンザメの一種で、いちばん古い個体は512歳になる可能性もあると、英サイエンス誌は伝えている。 追加の画像を見る デンマークの海洋生物学者ジュリアス・ニールセンが率いる科学者チームによれば、ニシオンデンザメはまるで冬眠中のようにのろのろと生きており、1年に約1センチしか成長しない。つまり、科学者たちが発見した約5.5メートルのメスの個体は、すでに数百年生きてきたことになる。 ニールセンらは放射性炭素年代測定法を使い、ニシオンデンザメ28匹の水晶体を分析した。それによると、最も古いサメは392歳近い可能性が判明。放射性炭素年代測定法の確実性は95％、よってサメの本当の年齢は272～512歳と推定される。それが正しければ、このサメはガリレオ・ガリレイの時代から生きてきたことになる。コロンブスが新大
EUの競争力理事会 (Competitiveness Council)は、公的資金および官民共同の資金助成を受けているオンライン上のすべての研究論文に、2020年までに無料でアクセスできるようにすることを宣言しました。本理事会は、各国で国内市場、産業、宇宙、研究、イノベーションを担当する全EU加盟国の大臣らで構成され、EUの研究・科学・イノベーション担当委員であるカルロス・モエダス(Carlos Moedas)氏が議長を務めています。大臣らは、万人が研究にアクセスできるようにすることは「研究データの再利用において、考え得る最高の方法であり、オープンサイエンス・システムへの移行を加速させるものである」と述べています。 オープンアクセスとオープンサイエンスは、科学コミュニティが長年にわたって働きかけ続けているテーマです。理事会の現議長国であるオランダ政府がこの変化を強力に後押しし、学術界から称
遺伝の法則の「優性」「劣性」は使いません――。誤解や偏見につながりかねなかったり、分かりにくかったりする用語を、日本遺伝学会が改訂した。用語集としてまとめ、今月中旬、一般向けに発売する。 メンデルの遺伝学の訳語として使われてきた「優性」「劣性」は、遺伝子の特徴の現れやすさを示すにすぎないが、優れている、劣っているという語感があり、誤解されやすい。「劣性遺伝病」と診断された人はマイナスイメージを抱き、不安になりがちだ。日本人類遺伝学会とも協議して見直しを進め、「優性」は「顕性」、「劣性」は「潜性」と言い換える。 他にも、「バリエーション」の訳語の一つだった「変異」は「多様性」に。遺伝情報の多様性が一人一人違う特徴となるという基本的な考え方が伝わるようにする。色の見え方は人によって多様だという認識から「色覚異常」や「色盲」は「色覚多様性」とした。 学会長の小林武彦東京大教授は「改訂した用語の普
理化学研究所は特に有望な若手研究者を高待遇の研究チームリーダーとして雇用する新制度を始めた。博士号を持たなくても研究室の主宰者として年俸約１０００万円、任期は７年間とする。若手に力を発揮してもらい、革新的な研究成果に結びつける狙い。人文社会科学との境界領域を含め、飛び抜けた才能を持つ若手を世界から集める新手法と位置付けている。 開始した新制度は「理研白眉制度」。年数人選ぶ「理研白眉研究チームリーダー」は、国際公募で提案・採択された研究課題を基にチームを率いる。研究費は年１０００万―４０００万円で、研究スペースは約１５０平方メートル。人工知能（ＡＩ）や数理科学など境界領域に特に期待しているという。 チームには専門的な助言者を付けるほか、月１回程度の理事長面談や他の白眉研究チームリーダーとの交流による育成も行う。初年度の着任は２０１８年１月以降を予定する。 理研の松本紘理事長は、「日本の若手は
Quick, How Might the Alien Spacecraft Work? November 10, 2016 [This post is about the movie Arrival; there are no movie spoilers here.] Connecting with Hollywood “It’s an interesting script” said someone on our PR team. It’s pretty common for us to get requests from movie-makers about showing our graphics or posters or books in movies. But the request this time was different: could we urgently hel
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