We are going to conduct the variant calling exercises in an interactive idev session just so you can get a feel for this mode of computing. Almost everything you see here can easily be bundled up into batch scripts and run in that mode. Introduction Variant calling, at first glance, is pretty simple: Map sequence reads to an appropriate reference, emitting BAM files; Generate pileups and look for
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soh3914 2012/11/14
FAQがなかなかいいと思う。- tutorial
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