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Comunidades microbianas do solo na conversão floresta-pastagem: uma abordagem multi-ômica

Processo: 17/09643-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2017
Vigência (Término): 30 de junho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
Pesquisador responsável:Tsai Siu Mui
Beneficiário:Andressa Monteiro Venturini
Supervisor: Brendan James Marc Bohannan
Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Oregon (UO), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:15/13546-7 - Capacidade de resiliência de comunidades microbianas avaliada por metagenômica e metatranscriptômica em solos de floresta e pastagem da Amazônia, BP.DR
Assunto(s):Microbiologia do solo   Temperatura
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Eastern Amazon | High-throughput sequencing | Methane cycle | Quantitative Real-Time PCR | Soil moisture | temperature | Microbiologia do solo

Resumo

Em pesquisa anterior, desenvolvida no âmbito do projeto FAPESP 2015/13546-7, nós observamos que os solos de floresta e de pastagem têm diferentes potenciais de sequestro e emissão de metano, intensificados pela umidade do solo. Essas descobertas reforçam a necessidade de uma compreensão mais profunda dos parâmetros ambientais que modulam o ciclo microbiano do metano em solos tropicais. Entretanto, ainda pouco se sabe sobre o perfil taxonômico e funcional dos microrganismos que respondem aos principais fatores que determinam o fluxo de metano em solos: umidade e temperatura. Portanto, nessa proposta de estágio, proponho a utilização de uma abordagem multi-ômica (sequenciamento de amplicon, metagenômica e metatranscritômica) para caracterizar as comunidades microbianas que respondem às mudanças no uso da terra, umidade e temperatura em solos da Floresta Nacional do Tapajós e seus adjacentes, no Estado do Pará, na Amazônia Oriental. Esse objetivo será alcançado através da: (1) análise de bioinformática e estatística dos conjuntos de dados metagenômicos e metatranscritômicos previamente obtidos e (2) um experimento de microcosmos para determinar o efeito da seca, cheia e aumento da temperatura sobre a abundância e o perfil taxonômico e funcional das comunidades microbianas em solos submetidos à conversão floresta-pastagem. Essa proposta é uma colaboração entre o Laboratório de Biologia Celular e Molecular da Universidade de São Paulo (Brasil) e o Instituto de Ecologia e Evolução da Universidade de Oregon (Estados Unidos), sob a supervisão conjunta da Profa. Dra. Siu Mui Tsai e o Prof. Dr. Brendan J. M. Bohannan.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GONTIJO, JULIA B.; PAULA, FABIANA S.; VENTURINI, ANDRESSA M.; YOSHIURA, CAIO A.; BORGES, CLOVIS D.; MOURA, JOSE MAURO S.; BOHANNAN, BRENDAN J. M.; NUSSLEIN, KLAUS; MAZZA RODRIGUES, JORGE L.; TSAI, SIU M.. Not just a methane source: Amazonian floodplain sediments harbour a high diversity of methanotrophs with different metabolic capabilities. Molecular Ecology, v. 30, n. 11, p. 2560-2572, . (14/50320-4, 17/26138-0, 18/14974-0, 17/09643-2, 15/13546-7, 19/25931-3)
LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO; MANOHARAN, LOKESHWARAN; MENDES, LUCAS WILLIAM; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; PYLRO, VICTOR SATLER; TSAI, SIU MUI. Metagenome assembled-genomes reveal similar functional profiles ofCPR/Patescibacteria phyla in soils. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, v. 12, n. 6, p. 651-655, . (17/24037-1, 17/09643-2, 14/50320-4, 16/18215-1, 15/13546-7)
VENTURINI, ANDRESSA M.; DIAS, NAISSA M. S.; GONTIJO, JULIA B.; YOSHIURA, CAIO A.; PAULA, FABIANA S.; MEYER, KYLE M.; NAKAMURA, FERNANDA M.; DA FRANCA, ALINE G.; BORGES, CLOVIS D.; BARLOW, JOS; et al. Increased soil moisture intensifies the impacts of forest-to-pasture conversion on methane emissions and methane-cycling communities in the Eastern Amazon. Environmental Research, v. 212, p. 13-pg., . (14/50320-4, 15/13546-7, 15/08564-6, 19/25931-3, 17/09616-5, 17/26138-0, 15/19979-2, 16/11268-2, 17/09643-2, 17/09952-5, 15/12282-6, 18/14974-0)

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