6. Bd. 1846 Der rationalistische Christus. Ein Denkmal des Protestantism. (= Symbolik zum Leben Christi; 2) Google, Google = Internet Archive
7. Bd. 1846 Die jüdischen Christus oder die Pseudo-Messiase (= Symbolik zum Leben Christi; 3), Anhang Wissenschaftliche Evangelien-Critik, Unviersalregister Google, Google = Internet Archive
2. Auflage „Volksausgabe“, Regensburg 1865
3. Bd. 1865 Der Lehrwandel Christi. Vom ersten bis zum andern OsterfesteGoogle = Internet Archive
4. Bd. 1865 Der Lehrwandel Christi. Vom zweiten bis zum dritten OsterfesteGoogle = Internet Archive
5. Bd. 1865 Der Lehrwandel Christi. Vom dritten bis zum vierten OsterfesteGoogle = Internet Archive
6. Bd. 1865 Der Lehrwandel Christi. Viertes Osterfest oder Todespascha bis zur Geistessendung am PfingstfesteGoogle = Internet Archive
Joseph von Görres. Eine Skizze seines Lebens, Regensburg 1848 MDZ München = Google
Das Heidenthum und dessen Bedeutung für das Christenthum, Regensburg 1853 (3 Bde.)
1. Band: Kosmische Theologie. Die Naturreligion und der Polytheismus.MDZ München
2. Band: Der heidnische Opferdienst und die Mysterienlehre. System des Pantheismus.MDZ München
3. Band: Der Heroencult und die Messiaden der Völker. Dualismus.MDZ München
Beiträge zur Geschichte des bayerischen Oberlandes, Heft 1–4, Augsburg 1853–1854
1. Heft : Die Wenden im Isarthal, oder Über den Ursprung von Tölz, Scharnitz und Trausnitz, Augsburg 1853 MDZ München
2/3. Heft: Zur Naturgeschichte des Oberlandes, Augsburg 1854 MDZ München
4. Heft: Ueber die pelasgisch italiotische Urbevölkerung des Oberlandes und das bayerische Wälschland, Augsburg 1854 Google = Internet Archive
Wissenschaftliche Zurechtsetzung mit dem Verfasser der "Erinnerungen und Kritiken" über gewisse Controvers-Punkte im Leben Christi: ein Beitrag zur Würdigung der modernen Kritik, Regensburg 1858 MDZ München
Thaten und Lehren Jesu mit ihrer weltgeschichtlichen Beglaubigung. Unter eingehender Beziehung auf die jüngsten Werke von Renan und Strauß, Schaffhausen 1864 MDZ München
Geschichte der Apostel vom Tode Jesu bis zur Zerstörung Jerusalems. Mit einer Vorrede über die Theologie der Zukunft , 2. Auflage Schaffhausen 1866 MDZ München = Google-USA*
Neue architektonische Studien und historisch-topographische Forschungen in Palästina, Würzburg 1867 Google
Der neue Rathhausbau zu München. Beilage zur Augsburger Postzeitung, Januar 1868. Google
Ein Volk von zehn Millionen, oder der Bayernstamm, Herkunft und Ausbreitung über Östreich, Kärnthen, Steyermarck und Tyrol. Kampfschrift wider Czechen und Magyaren, München 1882 Google-USA* = Internet Archive
Der bayrische Bauernkrieg mit den Schlachten von Sendling und Aidenbach. München 1884 MDZ München
Leben und Thaten des Feldhauptmanns Kaspar von Winzer, Obersten der Landsknechte, Burggrafen von Dürnstein, Staatsmannes und Pflegers zu Tölz. Tölz 1887 Google, MDZ München
Festschrift anläßlich der Enthüllung des Denkmals für Kaspar Winzerer (III) in Bad Tölz, 1887
Die Religion der alten Deutschen. Ihr Fortbestand in Volkssagen, Aufzügen und Festbräuchen bis zur Gegenwart. Mit durchgreifener Religions-Vergleichung, München 1890 Google = Internet Archive = Internet Archive
Denkwürdigkeiten aus dem Bayeroberland, oder, 176 Geschichten vom Isarwinkel und der Nachbarschaft. München 1892 Internet Archive
Der Schmied von Kochel. Bühnenstücke in 5 Akten, 1898
Schmiedbalthes. Balthasar Maier im Türkenkriege und der Held in der Sendlinger Bauernschlacht. Gelegentlich der Errichtung seines Monumentes, 1900
Orient und Occident. Hundert Kapitel über die Nachtseite der Natur, Zauberwerk und Hexenwesen in alter und neuer Zeit, Berlin 1903 Internet Archive, Berlin 1908 Google-USA*
Festschrift zur zweiten Jahrhundertwende der Schlacht bei Sendling, München 1905 MDZ München
Dr. Joh. Nepomuk Sepp (1816-1909). Ein Bild seines Lebens nach seinen eigenen Aufzeichnungen, Regensburg 1917 (2 Bde.)