Catálogo Ilustrado de Diatomeas Dulceacuícolas Mexicanas
Catálogo Ilustrado de Diatomeas Dulceacuícolas Mexicanas
Catálogo Ilustrado de Diatomeas Dulceacuícolas Mexicanas
DE MÉXICO
FACULTAD DE CIENCIAS
I. Familia NAVICULACEAE
REPORTE DE
INVESTIGACIÓN
QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE:
BIOLOGO
P R E S E N T A:
DIRECTORA DE TESIS:
2009
Hoja de Datos del Jurado
Formato
1.Datos del alumno
Canizal
Silahua
Ariel
55951959
Universidad Nacional Autonoma de Mexico
Facultad de Ciencias
Biología
077008422
Mi Madre
DEDICATORIAS
A mi padre
A la Doctora en Ciencias
A la Doctora
Muy especialmente a
A mi hermano y amigo
1. Resumen
2. Introducción
4. Antecedentes
4.2 Hábitat
5. Objetivos
6. Justificación
7. Métodos
8. Conclusiones y perspectivas
9. Anexos
I Familia Naviculaceae.”
RESUMEN
INTRODUCCIÓN
En las dos últimas décadas del siglo XX con el desarrollo del procesamiento
de imágenes digitales se favoreció este método al hacer posible el resaltar
características morfométricas de la microestructura de la célula. Algunos de los
trabajos más reconocidos aplicando diversas técnicas de análisis de imágenes
son:
Fig. 1. Diatomeas del orden (a) centrales (Actinocyclus normanii) y del orden (b) pennales
(Navicula radiosa).
HIPOVALVA
Fig. 2. Estructura básica de las valvas de una diatomea para formar el frústulo (tomado de ADIAC
2002).
EPIVALVA
EPITECA
EPICINGULO
HIPOCINGULO
HIPOTECA
HIPOVALVA
Fig. 3. Esquema de los elementos de unión de las valvas (Hans du Buf, 2002)
Dirección de
crecimiento
Fig. 5. Crecimiento del frústulo de Pinnularia acrosphaeria a partir de la zona de depósito del
sílice, dando lugar al nódulo central y el nódulo polar. (Tomado de Novelo, Tavera and Ibarra, 2004)
Fig. 7. Diferentes tipos de terminación de la rafe en el nódulo central vista desde el interior de
la valva. (Round, Crawford & Mann, 2000)
Otras estructuras que son básicas para la determinación y clasificación de
las diatomeas, son pequeños grupos o conjuntos de poros que adornan finamente
la superficie de las valvas formando bandas, llamadas estrías (Fig.8). La función
de los poros es permitir el intercambio de agua y solutos hacia dentro y fuera de la
célula, además de la secreción de polisacáridos y otras sustancias orgánicas que
producen el movimiento del organismo. Los poros se pueden presentar
individualmente y se denominan simplemente POROS y si se encuentran
contenidos como conjunto dentro de una cámara hexagonal se llaman LÓCULOS.
Fig. 8. Micrografía de estrías y poros, también se observa el nódulo central y la rafe. (Tomado de
Novelo et all., 2007)
HABITAT
PLANCTÓNICAS:
Son las diatomeas que por diferentes medios y estructuras, permanecen
suspendidas a la deriva y a expensas de las corrientes.
• Epilíticas. Son las diatomeas que han colonizado las rocas y las piedras y
los estratos rocosos del fondo, dominando la zona de oleaje y turbulencia.
Dentro de esta clasificación también existen especies que están
restringidas a la zona del litoral, en tanto que otras ocurren en aguas más
profundas donde la acción del oleaje es menos severo.
• Epifíticas. Estas especies de diatomeas se encuentran asociadas con
plantas sumergidas y emergidas. De acuerdo a los estudios de Hawes &
Schwars (1996) existe una correlación entre el tipo de planta hospedadora y
la biomasa y diversidad de diatomeas epífitas.
• Epipélicas y epizámicas. Son las algas que han colonizado los sedimentos
(epipélicas) y el substrato arenoso (epizámicas), principalmente en aguas
continentales. Esta clasificación ha permanecido confusa y es poco
utilizada, ya que ambos substratos se encuentran comúnmente mezclados
y debido a la acción del oleaje y de las corrientes es particularmente
inestable.
• Alcalífilas. Ocurren a valores entre 7.0 y 7.5 pero con una amplia
distribución y un desarrollo óptimo entre 7.9 y 8.2.
GRUPO Asimétricas
GÉNEROS
Gomphonema (Ehremberg)
Rhoicosphenia (Grunow)
Amphora (Ehremberg)
Encyonema (Kützing)
Encyonopsis (Krammer)
Cymbella (Agardh)
Cymbopleura (Krammer)
CARACTERÍSTICAS DISTINTIVAS DE LA CLASE BACILLARIOPHYCEAE
Asexual
Fig. 10. Secuencia de la división vegetativa de Amphora sp. en vista lateral (Tomado de
Round, Crawford & Mann, 1990)
Fig. 12. Ejemplo de la reducción del tamaño y las variaciones en forma y perfil del frústulo de
Fragilaria bicapitata. (Hans & Micha, 2002)
Sexual
- En la exploración de hidrocarburos.
Arquelogía
- Insecticidas naturales.
- Agentes purificadores.
- Filtros.
- Abrasivos.
- Alimento animal.
OBJETIVOS
Imágenes
Cada imagen fue analizada con el software Microsoft Picture Mannager para
determinar, y en caso de ser necesario, modificar los niveles de brillo, contraste y
tonos medios, así como la resolución. Aplicando el software Adobe Photoshop se
eliminó el fondo, sustituyéndolo por el tono de gris con código hexadecimal “#
192.192.192”, recomendado en Hans & Micha en Automatic Diatom Identification
and Clasification, 2002, esto con el fin de eliminar los elementos anexos de la
muestra y resaltar las características morfológicas de las células.
Desde este menú se invocan otras páginas que serán mostradas en los otros dos
marcos.
Fig. 16. Estructura del marco horizontal superior con sus opciones.
En el marco horizontal superior se muestra la información del Catálogo, así
como los datos del laboratorio; y las opciones que controlan a los otros dos
marcos (Fig. 16).
Esta página (Fig. 19) se diseñó con una tabla que muestra, en el marco
principal, un catálogo de imágenes reducidas (Thumbs) de todas las especies
registradas organizadas por género. Cada imagen contiene un enlace a la ficha
descriptiva de la especie.
Fig. 20. Diseño de la página de las opciones de géneros registrados en el marco vertical izquierdo, enlazada desde
el índice alfabético.
D) Opción de Contacto
Esta opción se diseñó con base en un formulario que requiere de datos del
usuario, como son el nombre completo, su dirección de correo electrónico y una
sección para comentarios (Fig. 21). El código del formulario está programado para
enviarlo sin formato a través de correo electrónico con el programa que el usuario
tiene predeterminado. El código lo envía directamente a la dirección de los
autores.
Este marco está codificado de manera que recibe los enlaces de las
opciones de otros marcos y del mismo principal cuando se presentan. El enlace
principal es el de las fichas descriptivas.
b) Un enlace “Ampliar imagen” que abre una nueva ventana mostrando la imagen
de la especie en tamaño original y con alta resolución. Se dejó la opción de abrirla
en una pantalla externa a la página, con el fin de poderla manipular sin necesidad
de navegar dentro de la página.
Actualmente se está trabajando en una base de datos con MySQL con el fin
de poner la base de datos a disposición de los usuarios de la página web;
paralelamente se está diseñando el código de un motor interno de búsqueda en
JavaScript para insertarlo en la misma página.
ANEXO 1
http://www.diatomwebfc@hp.fc.unam.mx
a)
c)
b)
Fig. 3. Estructura de la página en tres marcos. a) Marco horizontal superior, b) Marco vertical izquierdo
y c) Marco principal.
e) Contacto. (Fig. 11) Esta opción nos muestra los datos de los autores y el
responsable de la página. Ahí mismo aparece la opción de establecer
comunicación a través de un formulario de datos que solicita el nombre completo,
la dirección de correo electrónico y algún comentario respecto a la página o a la
información contenida en ella. Cuando se ha llenado el formulario se puede enviar
directamente al correo del autor de la página usando el software de correos
preestablecido por el usuario.
El marco vertical de la izquierda inicia con datos del laboratorio (Fig. 12a) y
en él aparecerá el listado de los géneros registrados (Fig. 12b), los cuáles se
seleccionan desde el índice alfabético superior.
a) b) c)
MARCO PRINCIPAL
ORGANIZACIÓN DE LA INFORMACIÓN
Fig. 13. Estructura en árbol de las carpetas y subcarpetas que conforman la página.
Dentro de la carpeta raíz llamada “DIATOMWEB” se almacenan:
<b>AQUÍ VA EL TEXTO</b>
AQUÍ VA EL TEXTO
Casi todas las etiquetas tienen una de inicio “<b>” y una de cierre de su
función “</b>” que le indica al sistema que hasta esa parte dejó de tener efecto.
Este manual no tiene como objetivo ser un curso de HTML, por lo que se
utilizarán los códigos ya existentes para crear nuevos códigos de otros géneros y
especies, y solamente se hará referencia a las etiquetas cuando se considere
necesario.
http://www.ldc.usb.ve/~vtheok/webmaestro/
Puntos clave
B) Para presentar la información en una tabla se utilizan tres etiquetas con sus
respectivos cierres: <table> y </table> que indican el inicio y el fin de una
tabla (ver la fig. 14); las etiquetas <tr> y </tr> que abren un renglón dentro
de la tabla y las etiquetas <td> y su respectiva </td> crean una celda
dentro del renglón y dentro de la tabla. Las etiquetas de renglón y de
columna se utilizarán tantas veces como celdas se requieran crear. Dentro
de las etiquetas <td> y </td> se anota la información que se desea
presentar en las celdas.
Estas son las propiedades de las etiquetas que deberán ser modificadas en el
código de una nueva especie que se esté registrando. Al final, el archivo se
deberá guardar en la subcarpeta de la especie con un nombre que haga referencia
al género y a la especie como se explicó anteriormente, y con la extensión *.html
(Fig. 15).
B) En esta línea del código se especifica el formato del texto “ESPECIES DEL
GÉNERO MASTOGLOIA” con las etiquetas <center> y su respectiva de
cierre </center>, que le indica al sistema que el texto deberá colocarse en
la parte central de la página y la etiqueta <font> y </font> explicadas
previamente. Al crear la nueva página aquí deberá ir el nombre del género.
C) En esta línea del código se manda llamar a un archivo, que en este caso es
el archivo de la ficha descriptiva de la especie creada anteriormente, con la
etiqueta
Estas son las propiedades de las etiquetas que deberán ser modificadas en
el código de una nueva carpeta del género que se esté registrando. Al final, el
archivo se deberá guardar directamente en la carpeta de diatomweb con el
nombre del género, como se explicó anteriormente, y con la extensión *.html (Fig.
17).
Fig. 17. Guardado del archivo HTML de géneros.
Fig. 18. Código HTML para el documento de géneros con una misma letra.
A) Nuevamente se observa el titulo de la página, que en este ejemplo
corresponde a los géneros registrados que comienzan con la letra “M”.
Para el caso de creación de una nueva página de géneros, aquí se
deberá cambiar la letra con la que inician los géneros que se van a
registrar.
B) <td><a href=”mastogloia.html>
<tr>
</tr>
Hasta este momento ya se deben tener creados todos los archivos que
participan en la ficha descriptiva de una especie. El último paso es activar el
enlace del índice alfabético hacia la página de letra. Aunque el código del índice
alfabético es el más complejo, solamente se introducirá la etiqueta que activa el
enlace, ya que el código completo ya existe.
Analicemos dos líneas, la de la letra “I” sin vínculo (A) y la letra “m” con
vínculo activado (B):
Se crea una celda con las etiquetas <td> y </td>; dentro de la celda se
especifican los atributos del texto como el color y el tamaño; finalmente se
anota el texto que activará el enlace a la página de la letra, que en este
caso es la letra “I”. Para esta letra aún no existe un enlace.
La presentación de las imágenes está diseñada con tablas para cada uno
de los géneros registrados, obsérvese que para el género Mastogloia se creó una
tabla con su respectiva etiqueta <table> en la segunda línea del programa. Al final
del registro de las imágenes se cierra la tabla </table> en la penúltima línea.
Las celdas abiertas con <td> mantienen la misma posición que las que se
abrieron en la línea anterior de imágenes, de manera que en la primera
celda creada se coloca el nombre de la especie “Mastogloia elliptica” y
en la segunda aparece la especie “Mastogloia smithii”.
Recordemos que cada etiqueta encerrada en las llaves < > puede presentar
atributos para dar un formato más específico a las imágenes, tablas, celdas
o textos. De manera que no pondremos mucha atención a los atributos de
la celda <td> y a los de <font> que ya se han explicado previamente.
b) Se crea otra línea y otra celda. Dentro de esta celda se abre un vínculo
Recordemos que la etiqueta <a href=> crea un vínculo, que en este caso es
a la página de la ficha descriptiva de la especie creada con anterioridad
llamada mastoelliptica.html, que se encuentra dentro de la subcarpeta
mastoellitpitca dentro de la carpeta mastogloia. El blanco (target) para la
presentación de esta página es la pantalla principal llamada “especie” y el
archivo que se desplegará es la ficha descriptiva de la especie.
c) Por último se establece el texto que servirá como activador el enlace, que
en este ejemplo es “Mastogloia elliptica”.
Link, linka y linkv. En este parámetro se debe indicar el color que tomarán
los enlaces disponibles, los enlaces activos y los enlaces
visitados, con el mismo código de color hexadecimal.
color=. Se especifica el color que se desea para los textos que han de
aparecer en la página bajo el código hexadecimal.
<i></i> Con esta etiqueta se indica que el texto contenido entre ellas deberá
presentarse en formato Script o Itálica.
<p> Esta etiqueta no tiene cierre y se utiliza para establecer un salto dejando un
renglón en blanco.
<br> Esta etiqueta marca un salto de renglón sin dejar líneas en blanco.
<hr> Esta etiqueta establece una línea divisoria dentro de la página. Sus
parámetros son:
<a href></a>Esta etiqueta establece un vínculo a otro archivo, el cual puede ser
una página, una imagen o cualquier otro documento. Sus
parámetros son:
<img src> Esta etiqueta manda descargar un archivo de imagen. Para cargar
una imagen se deberá indicar la ruta de acceso al archivo. En
caso de encontrarse en la misma carpeta que el código no
será necesario. Sus parámetros son:
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