Xpert Manual

Xpert ® MTB / RIF
GXMTB / RIF-US-10
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Diagnóstico in vitro de dispositivos médicos IVD 301-1404, Rev. B Febrero el año 2015
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Investigación de la fluorescencia de doble cadena tintes de unión de ácidos nucleicos, incluyendo específicamente, pero no limitado a, SYBR Green I, LCGreen ® I, o LCGreen ® Más.
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LA COMPRA DE ESTE PRODUCTO transmite al comprador el derecho no transferible para utilizar de acuerdo con el texto del envase. Ningún otro derecho
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se transmiten expresamente, tácitamente o por preclusión. Además, no se DERECHOS comerciales se reunió con la compra de este PRODUCTO.
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Copyright © Cepheid 2015. Todos los derechos reservados.

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Cepheid
904 Caribbean Drive Sunnyvale, CA
94089 hasta 1189 EE.UU.
Xpert ® MTB / RIF Ensayo
Sólo para uso diagnóstico in vitro.
Sólo Rx
1. Nombre de propiedad exclusiva
Xpert ® MTB / RIF
2. Nombre común o vulgar

Xpert MTB / RIF Ensayo
3. uso previsto
el Xpert ® MTB / RIF ensayo, realizado en el GeneXpert ® Instrument Systems, es una reacción cualitativa, anidada en tiempo real cadena de la polimerasa (PCR) in vitro prueba
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de diagnóstico para la detección de Tuberculosis micobacteriana ADN compleja en el esputo en bruto o sedimento de esputo concentrado preparado a partir de esputo inducido
la
o expectorado. En las muestras donde Tuberculosis micobacteriana
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compleja (MTB-complejo) se detecta, el MTB / RIF ensayo Xpert también detecta las mutaciones de la resistencia rifampicina-asociados de la
rpoB gene.
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El MTB / RIF ensayo Xpert está destinado para su uso con muestras de pacientes en los que existe la sospecha clínica de la tuberculosis (TB) y que no han recibido tratamiento
antituberculoso, o menos de tres días de tratamiento. Esta prueba está diseñada como una ayuda en el diagnóstico de tuberculosis pulmonar cuando se utiliza junto con los
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hallazgos clínicos y de laboratorio. Un resultado Xpert MTB / RIF ensayo de "NO MTB DETECTADO" de una o dos muestras de esputo es altamente predictivo de la ausencia de M.
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tuberculosis bacilos compleja serie de frotis de esputo ácido-alcohol resistentes fluorescentes de pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar activa y se puede utilizar
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como una ayuda en la decisión de si el aislamiento continuo infección por el aire (AII) se justifica en pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar. La determinación de si la
prueba de una o dos muestras de esputo es adecuada para las decisiones relativas a la eliminación de la AII debe basarse en las circunstancias clínicas específicas y directrices
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institucionales. Las decisiones clínicas en relación con la necesidad de mantener la AII siempre debe ocurrir en conjunto con otras evaluaciones clínicas y de laboratorio y los
resultados Xpert MTB / RIF ensayo no debe ser la única base para las prácticas de control de infecciones. El MTB / RIF ensayo Xpert siempre debe ser utilizado en conjunto con
es
cultivo de micobacterias para controlar el riesgo de falsos negativos y recuperar los organismos cuando MTB-complejo está presente para su posterior caracterización y pruebas
de sensibilidad a los medicamentos. Sin embargo, las decisiones relativas a la extracción de los pacientes de AII no necesitan esperar los resultados del cultivo. muestras de
o
esputo para cultivo de TB, la microscopía de frotis AFB, y la prueba Xpert MTB / RIF ensayo deben seguir las recomendaciones de los CDC con respecto a los métodos de
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recolección y el marco de tiempo entre la recolección de la muestra.

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El MTB / RIF ensayo Xpert no proporciona una confirmación de susceptibilidad rifampicina ya que pueden existir mecanismos de resistencia a la rifampicina aparte de los detectados
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por este dispositivo, que puede estar asociada con la falta de respuesta clínica al tratamiento. Las muestras que tienen ambas mutaciones del ADN y la rifampicina resistencia
fo
asociados MTB-complejo de la rpoB gen detectado por el ensayo de MTB Xpert / RIF debe haber resultados confirmados por un laboratorio de referencia. Si la presencia de
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rifampicina-resistencia a las mutaciones del asociado rpoB gen se confirma, las muestras también deben ser examinados para la presencia de mutaciones genéticas asociadas con la
resistencia a otros medicamentos.

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El MTB / RIF ensayo Xpert sólo debe realizarse en laboratorios que siguen las prácticas de seguridad de acuerdo con el CDC / NIH publicación Bioseguridad
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en laboratorios microbiológicos y biomédicos y las regulaciones estatales o locales aplicables.

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4. Resumen y explicación
A nivel mundial, alrededor de 2 mil millones de personas están infectadas con el MTB. 1 En 2010, 8,8 millones de personas desarrollan la enfermedad activa y 1,4 millones de personas perdieron la
vida a la enfermedad. 2 Había 9.951 nuevos casos de tuberculosis reportados en los Estados Unidos en 2012 (una tasa de
3,2 casos por 100.000). En 2011, 536 muertes en Estados Unidos se atribuyeron a las infecciones de tuberculosis. 3,4
Los regímenes de tratamiento estándar para la tuberculosis implican la administración prolongada de fármacos múltiples y suelen ser muy eficaz. Sin embargo, MTB-complejo de cepas
que son resistentes a uno o más de los fármacos de primera línea requieren un tratamiento individualizado. resistencia rifampicina es a menudo una indicación de la resistencia a múltiples
fármacos a la tuberculosis (MDR TB), que se define como la resistencia a al menos rifampicina (RIF) e isoniazida (INH). En los Estados Unidos la resistencia RIF general es de
aproximadamente 1,8%, con aproximadamente el 90% de estas cepas resistentes a al menos RIF e INH. 5
Xpert ® MTB / RIF 1

301-1404, Rev. B Febrero el año 2015
Xpert ® MTB / RIF
La tuberculosis pulmonar activa es una enfermedad altamente infecciosa en el aire. Todos los pacientes en centros de salud con sospecha de TB deben ser mantenidos en aislamiento
infección por el aire (AII) de acuerdo con las directrices de control de infecciones recomendadas. 6 La prueba de una o dos muestras de esputo por el MTB Ensayo Xpert / RIF puede servir
como una alternativa a los esputos manchados ácido-alcohol resistentes en serie como una ayuda en la decisión de si la continuación de las precauciones de control de infecciones están
garantizados en pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar.
muestras de esputo que son AFB cultivo de TB con baciloscopia negativa, pero posteriormente positivas tienen menores cargas organismo MTB-compleja que las muestras
que son AFB frotis positivo. Debido a la mayor sensibilidad del ensayo MTB Xpert / RIF para la detección de MTB-compleja que la de la microscopía de ácido-rápido,
MTB-complejo puede ser detectado por el MTB Ensayo Xpert / RIF en muestras negativas AFB frotis.
Los pacientes con infección por el VIH y la tuberculosis pulmonar se sabe que tienen menores cargas organismo de MTB-compleja en sus muestras de esputo en relación con los pacientes no
infectados por el VIH, a pesar de progresión de la enfermedad más rápido si no se trata. Como consecuencia de ello, las muestras de esputo de los pacientes infectados por VIH con tuberculosis
pulmonar tienden a ser AFB negativa a la tinción con más frecuencia que los pacientes no infectados por VIH. En general las tasas de detección de MTB-complejo con el MTB Xpert Ensayo / RIF
puede ser menor en entornos con un alto porcentaje de pacientes infectados por el VIH debido a que estos pacientes son más propensos a producir muestras con baciloscopia negativa AFB con
cargas bajas organismo.
5. Principio del Procedimiento
da
El MTB / RIF ensayo Xpert es una automatizado in vitro prueba de diagnóstico anidadas utilizando PCR en tiempo real para la detección cualitativa de la resistencia de MTB-compleja y
RIF. Los cebadores en esta prueba amplifican una porción de la rpoB gen que contiene la región del núcleo par 81 de base. Las sondas están diseñadas para diferenciar entre la secuencia
la
y las mutaciones de tipo salvaje conservadas en la región del núcleo que están asociados con la resistencia a RIF. Este ensayo se puede realizar en Cepheid GeneXpert ® Sistemas de
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instrumentos. GeneXpert Instrument Systems automatizar e integrar la purificación de la muestra, la amplificación de ácido nucleico, y la detección de la secuencia diana en tiempo real
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usando la transcriptasa inversa PCR (RT-PCR) y los ensayos de PCR en tiempo real. El sistema está compuesto de un instrumento, un ordenador personal y el software precargado para
co
la realización de pruebas y la visualización de los resultados. Los sistemas requieren el uso de cartuchos de un solo uso GeneXpert desechables que contienen los reactivos de RT-PCR y
PCR y alojan los procesos de RT-PCR y PCR. Debido a que los cartuchos son autónomos, la contaminación cruzada entre las muestras se reduce al mínimo. Para una descripción
a
completa de los sistemas, consulte la apropiada Manual del Operador del Sistema GeneXpert Dx o GeneXpert Infinito Manual del Operador del Sistema.
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El MTB / RIF Ensayo Xpert incluye reactivos para la detección de la resistencia MTB-complejo y RIF a partir de muestras de esputo primas y en los sedimentos de esputo concentradas. Un
un
control de procesamiento de la muestra (SPC) y una comprobación de sonda de control (PCC) también se incluyen en el cartucho. El SPC está presente para controlar para el
procesamiento adecuado de las bacterias diana y para controlar la presencia de los inhibidores en la reacción de PCR. La sonda Check Control (PCC) verifica la rehidratación del reactivo,
es
de llenado tubo de PCR en el cartucho, la sonda integridad, y teñir la estabilidad.

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El MTB / RIF ensayo detecta simultáneamente Xpert MTB-complejo de la resistencia y RIF mediante la amplificación de una secuencia específica de MTB-complejo de la rpoB gen,
que se sondeó con cinco balizas moleculares (sondas A - E) para las mutaciones dentro de la región determinante de la resistencia a rifampicina (RRDR). Cada baliza molecular
ón
se marca con un fluoróforo diferente. El umbral de validez máximo de ciclo (Ct) de 39,0 para las sondas A, B y C y 36,0 para las sondas D y E se fijan para el análisis de datos
de MTB / RIF.
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ac
• MTB DETECTADO se informa cuando al menos dos sondas resultan en los valores de Ct dentro del rango válido y un min delta Ct (la diferencia Ct más pequeño entre
rm
cualquier par de sondas) de menos de 2,0.
•
fo
La resistencia del Rif no se detecta se informa si el delta Ct máximo (la diferencia entre la sonda Ct adelantadas y más) es ≤4.0.
in
• Resistencia Rif DETECTADO se informa si el delta Ct máximo es> 4,0.

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• Resistencia Rif INDETERMINADO se informa cuando se cumplen las dos condiciones siguientes:
pa
1. el valor Ct de cualquier sonda excede el máximo válido Ct (o es cero, es decir, sin cruce de umbral); y
lo
2. el primer rpoB Ct valor es mayor que:

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[(Ct máximo válido de la sonda en la condición 1) - (delta Ct máximo de corte de 4.0)].
• MTB NO DETECTADO se informa cuando hay sólo una o ninguna sonda positiva.
Todos los ajustes de ensayo se incluyen como cálculos automáticos en el protocolo Xpert MTB / RIF y no pueden ser modificados por el usuario.
2 Xpert ® MTB / RIF

Xpert ® MTB / RIF
6. Los reactivos e instrumentos

6.1 Materiales suministrados
El kit Xpert MTB / RIF ensayo contiene suficientes reactivos para procesar 10 muestras o muestras de control de calidad. El kit contiene lo siguiente:
Cartuchos / RIF ensayo Xpert MTB con Tubos de reacción integrados 10
• 1 del talón (liofilizada) 2 de cada uno por cartucho
• polimerasa
• dNTP (trifosfatos de desoxinucleósido)
• Sonda
• BSA (albúmina de suero bovino)
• Talón 2 (liofilizada) 2 de cada uno por cartucho
• cebadores
• sondas
da
• BSA (albúmina de suero bovino)
la
• 3 del talón (liofilizada) 1 por cartucho
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• Control de procesamiento de la muestra (SPC) ~ 6000 no infecciosa
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B. globigii esporas
co
• Reactivo 1 4 ml por cartucho
• tampón Tris
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pi
• Los surfactantes
co
• EDTA (ácido etilendiaminotetraacético)
• Reactivo 2 4 ml por cartucho

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un
• tampón Tris
• Los surfactantes
es
• EDTA (ácido etilendiaminotetraacético)

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Reactivo Muestra 8 ml por botella

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• Hidróxido de sodio
ón
• isopropanol
12
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Pipetas de transferencia desechables

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discos compactos 1 por kit

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• Archivo ensayo de definición (ADF) - ADF para su uso tanto con el GeneXpert Dx e Infinity Sistemas
fo
• Instrucciones para importar ADF en el software GX

in
• Insertar paquete
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Nota Reactivo muestra (SR) puede ser incoloro a amarillo a ámbar. El color puede intensificarse con el tiempo, pero el color no tiene ningún efecto sobre el rendimiento.
lo
Nota Hojas de Datos de Seguridad (FDS) están disponibles en www.cepheid.com o bajo la www.cepheidinternational.com APOYO lengüeta.
Só
Nota La albúmina
origen ende
lossuero
Estados Unidos.
bovino Sinen
(BSA) proteínas dedentro
las perlas rumiantes o deproducto
de este otras proteínas animales
fue producido se alimentaron
y fabricado a los animales;
exclusivamente losde
a partir animales
plasmapasaron
bovino las pruebas ante mortem y post. Durante el
procesamiento, no había commingling del material con otros materiales de origen animal.
Nota Las pipetas de transferencia tienen una sola marca que representa el volumen mínimo de la muestra necesario para transferir el cartucho de GeneXpert.
Use solamente para este propósito. Todas las demás pipetas deben ser proporcionados por el laboratorio.

Xpert ® MTB / RIF
6.2 Almacenamiento y manipulación
+ 2+ 2
+ 28
• Almacenar el Xpert MTB / RIF cartuchos de ensayo y los reactivos a 2 - 28 ° C.
• No utilizar los reactivos o cartuchos que han superado la fecha de caducidad.
• El cartucho es estable hasta 6 semanas a 2-45 ° C, después de abrir la bolsa. No abra un cartucho hasta que esté listo para probar.
+ 45
+2
• Si se utiliza un instrumento GeneXpert Dx, iniciar la prueba dentro de las cuatro horas de la adición de la muestra Muestra tratadas con reactivo al cartucho.
• Si se utiliza un sistema GeneXpert Infinity, asegúrese de comenzar la prueba y poner el cartucho en el transportador dentro de los 30 minutos después de añadir la muestra
Muestra tratadas con reactivo al cartucho. Restante vida útil es rastreado por el sistema por el software Xpertise de manera que las pruebas se practican antes de la hora de
caducidad de cuatro a bordo.
• No utilice los reactivos que se han vuelto turbia o descolorida.
6.3 Materiales necesarios pero no suministrados

• Instrument System GeneXpert (número de catálogo varía según la configuración): 6 colores instrumento GeneXpert, ordenador con patentada Versión de software
GeneXpert 4.3 o superior, escáner de código de barras, y el manual del operador.
• Impresora: Si se requiere una impresora, póngase en contacto con Cepheid El soporte técnico para arreglar la compra de una impresora recomendada.
da
• A prueba de fugas,, contenedores de recogida de muestras estériles con tapón de rosca
la
• Guantes desechables, protección ocular, batas de laboratorio, y las etiquetas o marcador permanente
ro
• Estériles, pipetas de un solo uso con barrera de extremo seco enchufes para el procesamiento de muestras
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• Minutero
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6.4 Materiales disponibles pero no suministrados
a
MMQCI (Controles de Calidad de Maine Molecular, Inc.) INTROL ™ de control externo Run (# 04 TBNEG-catálogo) como control negativo, y MMQCI INTROL ™ arranque
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externo Controles (catálogo # TBWT-04 y nº de catálogo) como TBMDR1-04 RIF susceptibles y resistentes RIF controles positivos.
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7. Advertencias y precauciones
a
un
• Tratar todas las muestras biológicas, incluyendo los cartuchos usados, como si fueran capaces de transmitir agentes infecciosos. Porque a menudo es imposible saber
qué muestras pueden ser infecciosas, todas las muestras biológicas deben ser tratados con precauciones estándar. Directrices para la manipulación de muestras están
es
disponibles en los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades 7 y el (ex Comité Nacional de Normas de Laboratorio Clínico) Clinical and Laboratory
Standards Institute. 8
o
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• Use guantes protectores desechables, batas de laboratorio, y protección para los ojos al manipular muestras y reactivos. Lávese bien las manos después de manipular las muestras y
los reactivos de la prueba.
ón
• Siga los procedimientos de seguridad de su institución para trabajar con productos químicos y manejo de muestras biológicas.
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ac
• Preparación de los sedimentos de esputo digeridos, descontaminados y se concentró y Xpert MTB / RIF procedimientos deben realizarse mediante Bioseguridad Nivel 2
prácticas. 9
rm
• Utilizar sólo para la detección de los miembros de la M. tuberculosis complejos utilizando sedimentos prepararon siguiendo los procedimientos NALC-NaOH o NaOH recomendados por los
fo
Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC). 10 Esta prueba sólo se puede utilizar con muestras de esputo en bruto o sedimentos concentrados preparados a partir de
in
muestras de esputo inducido o expectorado.

ra
• Al procesar más de una muestra a la vez, abierto solo cartucho; añadir la muestra de muestra tratadas con reactivo y cerrar el cartucho antes de procesar la
siguiente muestra. Cambiar los guantes entre muestras.
pa
• No sustituya Xpert MTB / RIF reactivos de ensayo con otros reactivos.

lo
• No abra la tapa del cartucho Xpert MTB / RIF ensayo excepto cuando se añada la muestra tratada con el reactivo de la muestra.
Só
• No utilice un cartucho si aparece mojada o si la junta de la tapa parece haberse roto.
• No utilice un cartucho que se ha caído o se ha sacudido.
• No utilice un cartucho que tiene un tubo de reacción dañado.
2 • Cada cartucho de un solo uso Xpert MTB / RIF ensayo se usa para procesar una prueba. No vuelva a utilizar los cartuchos usados.
• Consulte al personal de la basura ambientales de su institución en relación con la disposición adecuada de los cartuchos usados y los reactivos no utilizados. Este material puede
contener Recovery Act (RCRA) y Conservación de Recursos federales EPA residuos peligrosos que requieren eliminación específica. Comprobar el estado y regulaciones locales, ya que
pueden diferir de las regulaciones federales de desecho. Las instituciones deben consultar los requisitos de eliminación de residuos peligrosos país.

Xpert ® MTB / RIF
• Reactivo muestra contiene hidróxido de sodio (pH> 12,5); (códigos internacionales peligro la seguridad química H303, H315, H318), que puede ser irritante para los ojos y la
piel y requiere protección para los ojos y la piel. reactivo de la muestra también contiene isopropanol (código de peligro de la seguridad química internacional H225), que es un
líquido inflamable.
• El / MTB coinfectados por el VIH población puede contener un mayor porcentaje de pacientes con muestras de frotis negativo con niveles de MTB-complejo por debajo del
nivel de detección del ensayo.
• , el estado y las regulaciones federales locales para la notificación de enfermedades de declaración obligatoria se actualizan continuamente y se compone de un número de
organismos de vigilancia y las investigaciones de brotes. 11,12 Además, los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC) recomiendan que cuando los agentes
patógenos de enfermedades de notificación son detectados por un cultivo de prueba de diagnóstico independiente (TCID), el laboratorio debe facilitar la obtención de los materiales
aislar o clínicos para su presentación al laboratorio de salud pública apropiada para ayudar del brote y las investigaciones epidemiológicas. Los laboratorios son responsables de
seguir sus regulaciones estatales y locales y deben consultar a sus laboratorios de salud pública estatales y locales para las pautas de presentación de la muestra aislar y clínicos.
8. Recogida de muestras, transporte y almacenamiento

8.1 Colección
Recoger el esputo en bruto o muestras de sedimento de esputo siguiendo los procedimientos estándar de su institución. El paciente debe estar sentado o de pie. Véase la Tabla 1 para
determinar el volumen de muestra adecuado.
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la
Tabla 1. Se requiere de muestras de volumen
ro
El volumen total mínimo de prueba y prueba - Vea la
nt
El volumen mínimo para
Tipo de muestra Una de las pruebas Sección 11.2, Procedimiento Retest
co
sedimento de esputo 0,5 ml 1 ml
esputo en bruto 1 ml a 2 ml
pi
co
8.2 Almacenamiento y Transporte

a
+8
sedimento de esputo: Tienda volvió a suspender los sedimentos a 2-8 ° C durante un máximo de siete días.
+ 2+ 2
un
+8
esputo prima: Las muestras de transportar y almacenar a 2-8 ° C antes de la transformación siempre que sea posible. Si es necesario, las muestras de esputo se pueden almacenar en un
+ 2+ 2
máximo de 35 ° C durante un máximo de tres días y luego a 2-8 ° C durante otros siete días.
es
9. Procedimiento de Ensayo (s)

o
9.1 Las muestras de sedimento de esputo concentrados

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Este procedimiento es para su uso con los sedimentos de esputo preparados a partir de muestras de esputo inducido o expectorado.
ón
Nota Rechazar las muestras con partículas de alimentos obvios u otras partículas sólidas.
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Requisitos de volumen: El / RIF ensayo MTB requiere al menos 0,5 ml de sedimento de esputo se volvió a suspender después de la digestión, la descontaminación y concentración.
rm
Utilice el método de Kent y Kubica 8 y volver a suspender el sedimento en una mM de fosfato / H 67 2 tampón O. Después de la resuspensión, mantener al menos 0,5 ml del sedimento se
fo
volvió a suspender para el Ensayo de MTB Xpert / RIF.

in
1. Use guantes desechables de protección.

ra
2. Etiqueta de cada cartucho de Xpert MTB / RIF ensayo junto con la identificación de la muestra.
pa
Nota Escribir en los lados del cartucho o pegue una etiqueta de identificación. No ponga la etiqueta de la tapa del cartucho o cubrir el código de barras existente sobre
lo
el cartucho.
Só
3. Transferencia de al menos 0,5 ml del sedimento resuspendido total de a un tubo cónico, con tapón de rosca para el MTB Ensayo Xpert / RIF utilizando una pipeta de
transferencia. Alternativamente, todo el sedimento se puede procesar en el tubo inicial.
+ 2+ 2
+8
Nota Tienda volvió a suspender los sedimentos a 2-8 ° C durante un máximo de siete días.

Xpert ® MTB / RIF
4. Usando una pipeta de transferencia, transferir 1,5 ml de reactivo de la muestra de 0,5 ml de sedimento resuspendido. Para grandes cantidades de sedimento, añadir el reactivo
de muestra igual a tres veces el volumen del sedimento resuspendido.
5. Vuelva a tapar el tubo y agitar vigorosamente 10 a 20 veces o vórtice durante al menos 10 segundos.
Nota Un movimiento hacia atrás y hacia adelante es una sola sacudida.
6. Incubar la muestra para un total de 15 minutos a 20-30 ° C.
7. Entre 5 y 10 minutos en el período de incubación, agite vigorosamente de 10 a 20 veces o vórtice durante al menos 10 segundos.
9.2 Las muestras de esputo primas
Nota Rechazar las muestras con partículas de alimentos obvios u otras partículas sólidas.
1. Use guantes desechables de protección.
2. Etiqueta de cada cartucho de Xpert MTB / RIF ensayo junto con la identificación de la muestra. Ver Figura 1.
Nota Escribir en los lados del cartucho o pegue una etiqueta de identificación. No ponga la etiqueta de la tapa del cartucho o cubrir el código de barras existente sobre
el cartucho.
da
la
ro
nt
co
a
pi
co
a
un
Figura 1. La escritura en el cartucho con un marcador permanente

es
3. abrir con cuidado la tapa del recipiente de recogida de esputos. Vea la Figura 2.
o
-N
i ón
ac
rm
Figura 2. La apertura del contenedor de muestras

fo
in
4. Verter o una pipeta (pipeta no incluido) aproximadamente 2 veces el volumen del reactivo de la muestra en el esputo (2: 1 dilución, el reactivo de la muestra: esputo). Tenga cuidado
de no permitir que el Reactivo de ejemplo para tocar la piel desnuda. Vea la Figura 3.
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Ejemplo 1
8 ml de reactivo de la muestra; 4 ml
de esputo
Ejemplo 2
2 ml de reactivo de la muestra; 1 ml de
esputo Nota: Desechar el reactivo
sobrante de la muestra y la botella en
da
un contenedor para desechos
químicos.
la
3 ml línea 1
ro
ml de esputo
nt

co
Figura 3. Ejemplos de 2: 1 diluciones
5. Vuelva a colocar y asegurar la tapa. a

pi
Agitar enérgicamente 10 a 20 veces o vortex durante al menos 10 segundos.
co
6.
a
Nota Un movimiento hacia atrás y hacia adelante es una sola sacudida.

un
7. Incubar la muestra para un total de 15 minutos a 20-30 ° C.

es
8. Ser entre 5 y en el período de incubación de 10 minutos, agitar vigorosamente 10 a 20 veces o vórtice durante al menos 10 segundos.
o
9.3 Preparación del cartucho

-N
Si se utiliza un instrumento GeneXpert Dx, iniciar la prueba dentro de las cuatro horas de la adición de la muestra Muestra tratadas con reactivo al cartucho. Si se
ón
utiliza un sistema GeneXpert Infinity, asegúrese de comenzar la prueba y poner el cartucho en el transportador dentro de los 30 minutos después de añadir la
Importante muestra Muestra tratadas con reactivo al cartucho. Restante vida útil es rastreado por el sistema por el software Xpertise de manera que las pruebas se practican
i
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antes de los cuatro situ hora de caducidad bordo.

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Nota Al procesar más de una muestra a la vez, abierto solo cartucho, añadir la muestra Muestra tratadas con reactivo y cerrar el
in
cartucho antes de pasar a la siguiente muestra. Cambiar los guantes entre muestras.
ra
Para añadir la muestra y los reactivos en el cartucho:

pa
1. Abra la tapa del cartucho, y luego abrir el recipiente de la muestra.

lo
2. El uso de la pipeta de transferencia previsto, aspirar la muestra licuada cerca de la línea de la pipeta. Vea la Figura 4. Si hay un volumen de muestra insuficiente,
Só
no proceda con la prueba.

Xpert ® MTB / RIF
Figura 4. aspiración a la línea de la pipeta
3. Dispensación de la muestra lentamente para minimizar el riesgo de formación de aerosol, transferir la muestra de muestra tratadas con reactivo en la cámara de muestra del
cartucho Xpert MTB / RIF. Ver Figura 5.
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Figura 5. Muestra de dispensación descontaminado licuado en la cámara de muestra del cartucho

a
un
4. Cierre la tapa del cartucho con firmeza. Restante de la muestra tratada con el reactivo de la muestra puede conservarse durante un máximo de cuatro horas a 2-8 ºC en caso de repetición de
pruebas se requiere.
es
9.4 A partir de la Prueba

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-N
Importante Antes de comenzar la prueba, asegúrese de que el sistema está funcionando Versión GeneXpert Software 4.3 o superior y
que el archivo de definición de ensayo Xpert MTB / RIF se importa en el software.
ón
En esta sección se enumeran los pasos básicos para el funcionamiento de la prueba. Para obtener instrucciones detalladas, consulte la Manual del Operador del Sistema GeneXpert Dx o el GeneXpert
i
ac
Infinito Manual del Operador del Sistema.

rm
Nota Los pasos que debe seguir pueden ser diferentes si el administrador del sistema ha cambiado el flujo de trabajo predeterminado del sistema.
fo
1. Encienda el sistema de instrumentos GeneXpert.

in
• Si se utiliza el instrumento GeneXpert Dx, primero encienda el instrumento GeneXpert Dx y vuelva a encender el ordenador. El software GeneXpert se iniciará
ra
automáticamente o puede requerir un doble clic en el icono de acceso directo del software GeneXpert Dx en el escritorio de Windows.
pa
o
lo
•
Só
Si se utiliza el instrumento GeneXpert Infinity, encienda el instrumento. En el escritorio de Windows, haga doble clic en el icono de acceso directo del software
Xpertise.
2. Iniciar sesión en el software de sistema de instrumento GeneXpert usando su nombre de usuario y contraseña.
3. En la ventana Sistema GeneXpert, haga clic Crear prueba ( GeneXpert Dx) o Pedidos y Prueba fin ( Infinito).
4. Escanear o escribir el ID del paciente (opcional). Si vas a escribir la identificación del paciente, asegúrese de que la identificación del paciente se ha escrito correctamente. La
identificación del paciente se asocia con los resultados de la prueba y se muestra en la ventana de vista de resultados.
5. Escanear o escribir el ID de la muestra. Si escribe el ID de la muestra, asegúrese de que el ID de la muestra se ha escrito correctamente. El ID de la muestra se asocia con los
resultados de la prueba y se muestra en la ventana de resultados y todos los informes aparece el cuadro de diálogo del cartucho de escaneo.

Xpert ® MTB / RIF
6. Escanear el código de barras en el cartucho Xpert MTB / RIF ensayo. Aparece la ventana Crear prueba. Utilizando la información del código de barras, el software rellena las
casillas de los siguientes campos: Seleccionar ensayo, Reactivo ID de lote, cartucho de SN, y fecha de vencimiento.
Nota Si el código de barras en el cartucho Xpert MTB / RIF ensayo no busque, a continuación, repita la prueba con un nuevo cartucho.
7. Haga clic en Iniciar la prueba ( GeneXpert Dx) o Enviar ( Infinito). Introduzca su contraseña si así lo solicita.
8. Para el Sistema de Infinity GeneXpert, coloque el cartucho en la cinta transportadora. El cartucho se carga automáticamente, la prueba se ejecutará y el cartucho
usado se coloca en el contenedor de residuos.
Para el Instrumento GeneXpert Dx:
A. Abra la puerta del módulo de instrumentos con la luz verde parpadeante y cargar el cartucho.
Cierre la puerta. La prueba se inicia y la luz parpadeante verde cambia a una luz verde fija. Una vez finalizada la prueba, la luz se apaga.
SEGUNDO.
C. Esperar hasta que el sistema libera la cerradura de la puerta antes de abrir la puerta del módulo y retirar el cartucho.
da
RE. Los cartuchos usados deben ser desechados de los contenedores de residuos de muestras adecuadas de acuerdo a las prácticas estándar de la institución.
la
9.5 Visualización y resultados de impresión
ro
En esta sección se enumeran los pasos básicos para visualizar e imprimir los resultados. Para obtener instrucciones más detalladas sobre cómo ver e imprimir los resultados, ver el Manual del
nt
Operador del Sistema GeneXpert Dx o el GeneXpert Infinito Manual del Operador del Sistema.
co
1. Haga clic en el Ver resultados icono para ver los resultados.
a
2. Al término de la prueba en aproximadamente dos horas, haga clic en el Informe botón de la pantalla Ver resultados para ver y / o
pi
generar un archivo de informe pdf.
co
10. Control de calidad

a
Cada prueba incluye un control de procesamiento de la muestra (SPC) y la comprobación de sonda de control (PCC).
un
Control de procesamiento de la muestra (SPC) - Asegura que la muestra se procesó correctamente. El SPC contiene esporas no infecciosas en forma de una torta de esporas en
es
seco que se incluye en cada cartucho para verificar el procesamiento adecuado de MTB. El SPC comprueba que se han producido las condiciones para la lisis de MTB si los organismos
están presentes y verifica que el procesamiento de la muestra es adecuada. Además, este control detecta la inhibición del espécimen asociados del tiempo real las reacciones de PCR y
o
actúa como un control positivo interno.

-N
El SPC debe ser positivo en una muestra de MTB-negativo y puede ser negativo o positivo en una muestra positiva. El SPC pasa si cumple con los criterios de aceptación
ón
validados. El resultado de la prueba será Inválido Si el SPC no se detecta en una muestra de MTB-negativo.
i
ac
Comprobación de sonda de control (PCC, CC1, CC2) - Antes del inicio de la primera y segunda reacciones del ensayo de PCR anidada, el sistema de instrumentos GeneXpert
mide la señal de fluorescencia de las sondas QC1 y QC2 (reacción 1) y la rpoB y sondas SPC (reacción 2) para monitorear la rehidratación del grano, el llenado de tubos de reacción,
rm
la sonda integridad y la estabilidad del tinte. El PCC pasa si cumple con los criterios de aceptación asignadas.
fo
in
Los controles externos
MMQCI (Controles de Calidad de Maine Molecular, Inc.) INTROL ™ Control de Marcha externa (catálogo # TBNEG-04) como control negativo y MMQCI INTROL ™ arranque externo
ra
Controles (catálogo # TBWT-04 y catálogo # TBMDR1-04) como RIF susceptibles y resistentes RIF controles positivos se pueden utilizar para el entrenamiento, pruebas de aptitud, y
pa
control de calidad externo. Los controles externos deben ser utilizados de acuerdo con las ordenanzas locales, estatales y federales de los requisitos de las organizaciones acreditadas
'según sea el caso.
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
11. Interpretación de resultados

El sistema de instrumento GeneXpert genera los resultados de las señales fluorescentes medidas y algoritmos de cálculo incrustados. Los resultados se pueden ver en la
ventana de vista de resultados. Vea la Figura 6, Figura 7, Figura 8 y Figura 9 para ejemplos específicos, y ver Tabla 2 para una lista de todos los resultados posibles.
Tabla 2. Xpert MTB / RIF ensayo Resultados e interpretaciones Resultado
Interpretación
MTB detectado; Resistencia Rif El objetivo de MTB se detecta dentro de la muestra:

DETECTADO • Una mutación en el rpoB gen ha sido detectado.
(Figura 6)
• SPC: NA (no aplicable). Una señal de CCP no es necesario porque la
amplificación MTB puede competir con este control.
• Comprobación de sonda (CC1 y CC2): PASS. Todos los resultados de la comprobación
de la sonda pasan.
MTB detectado;
da
El objetivo de MTB se detecta dentro de la muestra:
La resistencia del Rif no se detecta
• Una mutación en el rpoB gen no se ha detectado.
la
(Figura 7)
ro
nt
co
de la sonda pasan.
a
pi
MTB detectado; El objetivo de MTB se detecta dentro de la muestra:
co
Resistencia Rif INDETERMINADO • Una mutación en el rpoB gen no se pudo determinar debido a la detección de
(Figura 8) señal insuficiente.
a

un

es

o
de la sonda pasan.
-N
MTB NO DETECTADO El objetivo MTB no se detecta dentro de la muestra.

(Figura 9)
ón
• SPC: PASS. El SPC se reunió con los criterios de aceptación.

i
ac
de la sonda pasan.
rm
NO VÁLIDO ( La Figura 10) La presencia o ausencia de MTB no se puede determinar. El SPC no cumple con
los criterios de aceptación, la muestra no se ha procesado correctamente, o PCR
fo
fue inhibida. Repita la prueba . Vea la Sección 11.2, Procedimiento vuelva a

in
probar.
ra
• MTB VÁLIDO: La presencia o ausencia de ADN de MTB no se puede

determinar.
pa
• SPC: FALLO. El resultado objetivo de MTB es negativo, y el SPC Ct no está

lo
dentro del rango válido.

Só
de la sonda pasan.

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 2. Xpert MTB / RIF resultados del ensayo e Interpretaciones (Continuación)
Resultado Interpretación
ERROR La presencia o ausencia de MTB no se puede determinar.

Repita la prueba . Vea la Sección 11.2, Procedimiento vuelva a probar.
• MTB: Ningún resultado
• SPC: Ningún resultado
• Comprobación de sonda (CC1 y CC2): / FALLO. error de comprobación de sonda puede

ser la fuente de error, pero otros errores, como el fallo de un componente del sistema,
puede ocurrir incluso si pasa la verificación de sensores.
SIN RESULTADOS La presencia o ausencia de MTB no se puede determinar.

Repita la prueba . Vea la Sección 11.2, Procedimiento vuelva a probar.
RESULTADO NO indica que se recogieron datos insuficientes. Por ejemplo, el
operador detiene una prueba que estaba en curso.
da
• MTB: Ningún resultado
• SPC: Ningún resultado
la
• Comprobación de sonda (CC1 y CC2): NA (no aplicable).
ro
nt
co
a
pi
co
a
un
es
o
-N
i ón
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só
Figura 6. Un ejemplo de una MTB detectado; Resistencia Rif resultado detectado

Xpert ® MTB / RIF
da
la
ro
nt
co
a
pi
co
Figura 7. Ejemplo de una MTB detectado; Resultado Resistencia Rif NO DETECTADO

a
un
es
o
-N
i ón
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só
Figura 8. Un ejemplo de un MTB detectado; Resistencia Rif INDETERMINADO Resultado

Xpert ® MTB / RIF
da
la
ro
nt
co
a
pi
co
Figura 9. Un ejemplo de un resultado MTB NO DETECTADO

a
un
es
o
-N
ión
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só
Figura 10. Un ejemplo de un resultado no válido

Xpert ® MTB / RIF
11.1 Razones para repetir la prueba

Repita la prueba usando un cartucho nuevo, si se produce uno de los siguientes resultados de la prueba:
• Un INVÁLIDO resultado indica que el SPC no. La muestra no se ha procesado correctamente, o PCR se inhibió.
• Un ERROR resultado indica que el PCC (CC1 o CC2) ha fallado o se ha producido un fallo en el sistema, y el ensayo fue abortado. La causa de los errores son posiblemente
debido al tubo de reacción se llena de forma inadecuada, se ha detectado un problema de integridad de la sonda de reactivo, se excedieron los límites de presión máxima, o un
módulo GeneXpert fracasaron.
• UN SIN RESULTADOS indica que se recogieron datos insuficientes. Por ejemplo, el operador detiene una prueba que estaba en curso.
11.2 Procedimiento de reevaluación
Si ha reconstituido restos de sedimentos o esputo prima utilice siempre nuevo reactivo de muestra para tratar el esputo antes de empezar el ensayo. Vea la Sección 9.1, concentrados de
esputo de sedimentos muestras o la Sección 9.2, primas de esputo especímenes. Si usted tiene suficientes muestras tratadas con reactivo sobrante de la muestra y está dentro de las
cuatro horas de preparación de la muestra, se puede utilizar el ejemplo de sobra para preparar y procesar un nuevo cartucho de inmediato en el instrumento GeneXpert.
Nota Si un utilizando un instrumento del infinito, la segunda prueba debe iniciarse en los módulos que se designan como módulos STAT reservados.
Cuando una nueva prueba, utilice siempre un cartucho nuevo. Vea la Sección 9.3, Preparación del cartucho.
da
12. Limitaciones
la
ro
1. El rendimiento de la MTB Ensayo Xpert / RIF se evaluó usando esputos inducido o expectorado. Las pruebas de otras muestras clínicas (por ejemplo, sangre, líquido cefalorraquídeo,
aspirado gástrico, heces, tejidos, orina) no ha sido evaluada y puede alterar el rendimiento del ensayo.
nt
co
2. Los sedimentos de esputo concentrados usados durante la evaluación del rendimiento del ensayo MTB Xpert / RIF se prepararon siguiendo los procedimientos NALC-NaOH o
NaOH recomendados por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC). 8
El uso de otros métodos de preparación de sedimentos puede alterar el rendimiento de la prueba. a

pi
3. El MTB / RIF ensayo Xpert no está indicado para su uso con muestras de esputo de pacientes que están siendo tratados con fármacos antituberculosos, ya sea para determinar la
co
curación bacteriológica o para monitorizar la respuesta al tratamiento.

a
4. Un resultado negativo no excluye la posibilidad de aislar MTB-complejo a partir de la muestra de esputo. El MTB / RIF Ensayo Xpert debe ser utilizado en conjunción con
un
cultivo de micobacterias para controlar el riesgo de resultados negativos falsos y recuperar el organismo para una caracterización adicional y pruebas de sensibilidad.
es
5. Una prueba positiva no indica necesariamente la presencia de organismos viables.

o
6. El MTB / RIF ensayo Xpert no diferencia entre las especies del complejo MTB-(es decir, M. tuberculosis, M. bovis,
-N
M. africanum, M. canetti, M. microti, M. caprae, M. pinnipedi, M. mungi, y M. orygis). Además, la cultura también debe llevarse a cabo para determinar si las
micobacterias distintas de complejo tuberculosis (MOTT) está presente además de MTB-complejo.
ón
7. Debido a la baja prevalencia de la tuberculosis resistente a la rifampicina en los Estados Unidos y las implicaciones de la resistencia a la rifampicina para el tratamiento, todas las
i
cepas de MTB-complejo determinado para ser resistente rifampicina por el MTB Xpert Ensayo / RIF debe tener la presencia de mutaciones asociadas a resistencia rifampicina del rpoB
ac
gen confirmado por un laboratorio de referencia. Las pruebas adicionales para determinar la presencia de mutaciones asociadas con la resistencia a otros fármacos para el
rm
tratamiento de TB también debe ser realizada.

fo
in
8. Debido a la detección de MTB-complejo depende del número de organismos presentes en la muestra, resultados precisos dependen de la correcta recogida de muestras, manipulación
y almacenamiento. resultados erróneos de la prueba se pueden producir a partir de cobro indebido de muestras, el no seguir el procedimiento de recogida de muestra
ra
recomendado, manipulación o problemas de almacenamiento, error técnico, confusión de muestras, o una concentración insuficiente del material de partida. cumplimiento cuidado
pa
de las instrucciones de este inserto es necesario para evitar resultados erróneos.

lo
9. El rendimiento de la MTB Ensayo Xpert / RIF no ha sido evaluada con muestras de pacientes pediátricos.
Só
10. La realización de la prueba Xpert MTB / RIF depende de la competencia del operador y la adhesión a los procedimientos de ensayo. errores en el procedimiento de ensayo pueden causar
resultados positivos falsos o negativos falsos. Todos los operadores de dispositivos deben tener una formación de dispositivo adecuado.
11. Un profesional capacitado debe interpretar los resultados del ensayo conjuntamente con el historial médico del paciente, los signos clínicos y síntomas cuidado de la salud, y los
resultados de otras pruebas de diagnóstico.
12. interferencia en el ensayo se puede observar en presencia de lidocaína (> / v 20% v), mucina (> 1,5% w / v), etambutol (> 5 mg / ml), guaifenesina (> 2,5 mg / ml),
fenilefrina (> 25% v / v), o aceite de árbol de té (> 0.008% v / v).

Xpert ® MTB / RIF
13. Los estudios demostraron que M. scrofulaceum cuando se prueba a una concentración de 10 8 UFC / ml produjo un resultado falso positivo Xpert MTB / RIF ensayo.
13. Valores esperados de un Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado

La probabilidad de que un resultado positivo es un verdadero positivo variará en función de la prevalencia de la tuberculosis en la población que está siendo probado y si la
baciloscopia es positiva o negativa.
En dos evaluaciones clínicos prospectivos multicéntricos de rendimiento Xpert MTB / RIF ensayo en sujetos en los Estados Unidos con sospecha de TB activa, la prevalencia global de
la enfermedad confirmada por cultivo fue de 13,2%. De los sujetos con tuberculosis confirmada por cultivo, el 71,6% eran AFB frotis positivo.
13.1 Los valores predictivos de una Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado
estima que los valores predictivos positivos y negativos hipotéticos de detección de MTB para diferentes tasas de prevalencia para la detección de MTB con el MTB / RIF ensayo Xpert
se muestran en la Tabla 3. Estos cálculos se basan en la prevalencia hipotéticas y la sensibilidad y especificidad global (en comparación con la cultura) observaron en los estudios
clínicos multicéntricos. La sensibilidad del ensayo MTB Xpert / RIF para las muestras de frotis positivo AFB fue del 99,4% (479/482) y la sensibilidad de las muestras con baciloscopia
negativa AFB fue del 67,2% (135/201). especificidad global del ensayo Xpert MTB / RIF fue del 98,7% (1355/1373). La prevalencia de MTB fue del 11,8% en el primer estudio
prospectivo de Estados Unidos y el 14,2% en el segundo estudio prospectivo de Estados Unidos.
da
Tabla 3. Valores predictivos hipotéticos de una Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura
la
ro
Probabilidad de MTB
Probabilidad de MTB Cultura cultivo negativo
nt
Entre positivo Entre
co
Prevalencia de
MTB cultivo Xpert MTB / RIF Xpert MTB / RIF
positivo DETECTADO AFB a
DETECTADO AFB Xpert MTB / RIF NO
pi
Smear Pos. Smear Neg. DETECTADO
co
1% 89.69% 13.67% 99,90%

a
2% 94,61% 24,24% 99,80%

un
3% 96.38% 32,65% 99,70%

es
4% 97.29% 39.51% 99.59%
5% 97,84% 45.20% 99.48%

o
-N
10% 98.97% 63.52% 98.91%
11,8% 99,14% 67.71% 98.70%

ón
14,2% 99.30% 72.18% 98.39%

i
ac
20% 99.54% 79.67% 97.59%

rm
40% 99.83% 91,27% 93.82%

fo
50% 99,88% 94.00% 91.01%

in
13.2 Los valores predictivos basados en dos resultados Xpert MTB / RIF ensayo
ra
estima que los valores predictivos positivos y negativos hipotéticos de detección de MTB para diferentes tasas de prevalencia para la detección de MTB utilizando dos Xpert MTB /
pa
RIF Los resultados del ensayo se muestran en la Tabla 4. Estos cálculos se basan en la prevalencia hipotética y la sensibilidad y especificidad global (en comparación con la
cultura) observado en el segundo de los dos estudios multicéntricos, donde se realizaron dos Xpert MTB / RIF ensayos sobre cada tema. La sensibilidad de dos Xpert MTB Ensayo /
lo
RIF Resultados para especímenes de frotis positivo AFB fue del 100% (133/133) y la sensibilidad para las muestras con baciloscopia negativa AFB fue del 69,4% (59/85). La
Só
especificidad total de dos resultados Xpert MTB / RIF ensayo fue de 97,9% (746/762).

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 4. Los valores predictivos hipotéticos de dos Xpert MTB Ensayo / RIF Resultados vs MTB Cultura un
Probabilidad de MTB
Probabilidad de MTB Cultura cultivo negativo
Entre positivo Entre
Prevalencia de
MTB cultivo Dos Xpert MTB / RIF Dos Xpert MTB / RIF
positivo DETECTADO, AFB DETECTADO AFB Dos Xpert MTB / RIF NO
Smear Pos. Smear Neg. DETECTADO
1% 84.40% 9,19% 99,91%
2% 91,62% 16,98% 99,82%
3% 94.31% 23.66% 99.72%
4% 95.71% 29.46% 99.63%
5% 96.57% 34.54% 99.53%
10% 98.35% 52.69% 99.02%
da
11,8% 98.62% 57.28% 98.82%
la
14,2% 98.88% 62.39% 98.54%
ro
20% 99,26% 71.48% 97.81%
nt
40% 99.72% 86.98% 94.37%
co
50% 99.81% 90.93% 91.79%
a
pi
un Sensibilidad del 100% para dos Xpert MTB / RIF resultados de ensayo para los sujetos positivos de frotis AFB se consideró como
99,9% en esta tabla.

co
a
13.3 Los valores predictivos para el resultado MTB DETECTADO, Resistencia RIF DETECTADO Uno de Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado
un
Los valores predictivos estimados hipotéticos para el resultado Detectado MTB, Resistencia RIF DETECTADO para diferentes tasas de prevalencia de sujetos con cultivo positivo de MTB y
diferentes tasas de prevalencia de la resistencia a RIF entre los sujetos con cultivo positivo de MTB se muestran en la Tabla 5. Estos cálculos se basan en la prevalencia hipotéticas y la
es
sensibilidad y especificidad global (en comparación con las pruebas de sensibilidad fenotípica a fármacos (DST) ) observada durante la primera de dos estudios clínicos multicéntricos. La
sensibilidad del resultado de un Xpert MTB / RIF ensayo para la detección de la resistencia a RIF fue del 94,7% (18/19) y la especificidad fue del 99,0% (404/408). La prevalencia de la
o
tuberculosis en este estudio prospectivo de Estados Unidos fue del 11,8%. En la población de Estados Unidos con TB la prevalencia de la resistencia a la rifampicina es de aproximadamente
-N
1,8%. 5
i ón
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só
dieciséis Xpert ® MTB / RIF

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 5. Los valores predictivos hipotéticos de una Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs. DST Prevalencia de MTB
Cultura
La prevalencia de la Probabilidad de Porcentaje de Probabilidad de
resistencia a RIF Resistencia RIF entre resultados Xpert Resistencia RIF entre
Positivo Entre MTB cultivo Xpert resultados MTB DETECTADO RIF Xpert resultados
positivo MTB DETECTADO La resistencia MTB DETECTADO, RIF
Resistencia RIF detectada, Resistencia no se
DETECTADO en la población detecta
1,0% 48,4% 0,09% 0,04%
1,5% 58,6% 0,11% 0,06%
5% 2,0% 65,5% 0,13% 0,08%
10% 91,2% 0,47% 0,45%
50% 98,9% 2,17% 3,39%
1,0% 48,4% 0,21% 0,05%
da
1,5% 58,6% 0,26% 0,07%
la
11,8% 2,0% 65,5% 0,31% 0,10%
ro
10% 91,2% 1.11% 0,51%
nt
50% 98,9% 5.11% 4.16%
co
1,0% 48,4% 0,35% 0,05%
1,5% 58,6% a 0,44% 0,07%

pi
20% 2,0% 65,5% 0,52% 0,10%
co
10% 91,2% 1,88% 0,54%

a
50% 98,9% 8,66% 4,46%

un
Rendimiento 14. Características de rendimiento clínico

es
14.1 Estudio 1
o
Diseño del estudio 14.1.1

-N
Las características de rendimiento del ensayo Xpert MTB / RIF para la detección de ADN de MTB-complejo y para la detección de la resistencia a RIF en muestras de esputo en relación con
los resultados de la cultura (sólidos y / o líquidos), seguido de las pruebas de sensibilidad a los medicamentos (DST) se determinaron en un multi -center estudio (estudio 1) usando muestras
ón
de esputo prospectivos y archivados recogidos de ambas poblaciones estadounidenses y no estadounidenses. Un estándar de sobra única muestra de esputo o el cuidado sedimento
i
ac
concentrado preparado a partir de esputos inducidos o expectorado se ensayaron por el ensayo de MTB Xpert / RIF de los sujetos de estudio sospechosos de tuberculosis. Todos los frotis de
AFB se realizaron en sedimentos concentradas.

rm
fo
Muestras de sujetos mayores de 18 años eran elegibles para el estudio 1, si se sospechaba que la tuberculosis pulmonar, en ausencia de tratamiento TB o con menos de tres días de
in
tratamiento de la tuberculosis, tenía un volumen suficiente para las pruebas en el MTB Ensayo Xpert / RIF y tenía baciloscopia , MTB prueba la cultura y la sensibilidad a los
medicamentos fenotípica (DST) resultados. De las 1.126 muestras elegibles y probadas por el ensayo de MTB Xpert / RIF, 1.096 fueron utilizados en el análisis. Treinta muestras
ra
fueron excluidos del análisis; 13 especímenes debido a los resultados Xpert MTB / RIF ensayo no determinadas (es decir, no válida, un error o ningún resultado) y 17 especímenes
pa
debido a la contaminación del cultivo de MTB.

lo
Las muestras procedían de los sujetos del estudio que eran ≥ 18 años de edad, el 62% (n = 679) hombres, 36% mujeres (n = 396); el 1,9% (n = 21) de género era
Só
desconocido. Que eran de diversas regiones geográficamente: 49% (n = 542) fueron de los EE.UU. (California, Nueva York y Florida) y 51% (n = 554) eran de fuera de
los EE.UU. (Vietnam, Perú, Sudáfrica, México y Bangladesh ). De los 542
especímenes de Estados Unidos, 450 se recogen de forma prospectiva y 92 eran de un banco de muestras archivados; de los 554 especímenes que no son estadounidenses, 23 fueron recogidos
prospectivamente y 531 eran de un banco de muestras archivadas.

Xpert ® MTB / RIF
14.1.2 rendimiento de uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura
De uno a tres muestras de esputo fueron recogidos de cada sujeto de estudio para su uso en el estudio clínico (33,9% de los sujetos del estudio tenía 1 muestra de esputo
recogidos, el 44,2% tenía 2 muestras de esputo, y 22.0% tienen a 3 muestras de esputo). Si más de un espécimen fue recogido de un sujeto, la primera muestra con suficiente
volumen fue probado por el MTB Xpert Ensayo / RIF. Si el resultado del ensayo era de no determinado (Error, no válido o ningún resultado), el mismo espécimen fue analizado de
nuevo si había volumen suficiente. En general, el 1,2% de las muestras analizadas (13 / 1,126; IC del 95%: 0,7% a 2,0%) fueron no determinada. Entre 1.096 sujetos con los
resultados del cultivo de MTB, un resultado Xpert MTB / RIF ensayo se obtuvo con la primera muestra de 85,5% de los sujetos, con la segunda muestra el 11,2% de los sujetos, y
con la tercera muestra para 0,3% de los sujetos. estado de la baciloscopia para un sujeto fue determinado por el resultado baciloscopia de la muestra con un resultado Xpert MTB /
RIF ensayo correspondiente. El estado de la cultura en MTB para lograr un sujeto se definió en base al resultado del cultivo de MTB de todas las muestras de este tema.
El rendimiento del ensayo Xpert MTB / RIF para la detección de MTB en relación con la cultura de MTB, estratificado por baciloscopia se muestra en la Tabla 6 y en la Tabla 7. Los
resultados discordantes para la cultura de los resultados positivos y MTB Xpert MTB / RIF ensayo de MTB NO DETECTADO se evaluaron adicionalmente usando secuenciación
bidireccional de la rpoB región del genoma de MTB. Ningún análisis discordantes se realizó en muestras negativas de cultivo de MTB.
Tabla 6. rendimiento de uno Xpert MTB / IRF Ensayo Resultado vs MTB de la cultura para los sujetos AFB frotis positivo
da
Cultura
la
+ - Total
ro
MTB
350 351
nt
1 un
DETECTADO
co
Xpert MTB / RIF
MTB NO
Ensayo 1 segundo sesenta y cinco 66
DETECTADO
a
pi
Total 351 66 417
co
Sensibilidad = 99,7% (350/351) con IC del 95%: 98,4% - 99,9% Especificidad =

98,5% (65/66) con IC del 95%: 91,9% - 99,7%
a
un
un El MTB / RIF ensayo Xpert MTB detectado en una muestra que fue la cultura MTB negativo. El resultado del cultivo se basó en una
muestra de esputo para este tema.

es
segundo Una muestra positiva de cultivo de MTB no fue detectado por el ensayo de MTB Xpert / RIF. Esto se determinó aislado de cultivo para ser Mtb
mediante un análisis de secuenciación bidireccional.

o
-N
Tabla 7. Realización de un Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB de la cultura para los sujetos AFB frotis negativo
ón
Cultura
i
+ - Total
ac
MTB
rm
89 7 un 96
DETECTADO
Xpert MTB / RIF
fo
MTB NO
Ensayo 28 segundo 555 583
in
DETECTADO
ra
Total 117 562 679

pa
Sensibilidad = 76,1% (89/117) con IC del 95%: 67,6% - 82,9% Especificidad =

98,8% (555/562) con IC del 95%: 97,5% - 99,4%
lo
un El MTB / RIF ensayo Xpert MTB detectado en siete muestras que eran negativas cultura MTB. Los resultados de los cultivos se basan
Só
en una muestra de esputo por tres sujetos, dos muestras de esputo para dos sujetos, y tres muestras de esputo para dos sujetos.
segundo Veintiocho MTB cultivo de muestras positivas no fueron detectados por el ensayo de MTB Xpert / RIF. Estas muestras de cultivo se determinó
que eran Mtb mediante un análisis de secuenciación bidireccional.
La sensibilidad global depende del porcentaje de sujetos baciloscopia positiva entre los sujetos con la cultura MTB positivo. Para las muestras recogidas de forma prospectiva a partir
de las materias de los Estados Unidos de Estudio 1, este porcentaje era del 75,5% y la sensibilidad global fue
93,8%. La especificidad global fue del 98,7% (IC del 95%: 97,5% - 99,4%).

Xpert ® MTB / RIF
En el uso clínico sensibilidad total variará en función del porcentaje de pacientes con tuberculosis positiva AFB-frotis en la población que se está probando; sensibilidad global será
más bajo en una población sometida a prueba, donde la probabilidad de tener AFB-citología positiva de tuberculosis es inferior, por ejemplo, una población de pacientes con una
mayor prevalencia de la coinfección por el VIH.
14.1.3 rendimiento de uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura por el Método de Colección
El rendimiento de la Xpert MTB / RIF Ensayo para la detección de MTB se determinó en relación a la cultura MTB en muestras de esputo expectorado e inducidos. Los
resultados se muestran en la Tabla 8 y la Tabla 9. De los 1.096 muestras, 535 muestras fueron expectorado, 234 muestras inducidas, y 327 con el método de colección
desconocido.
Tabla 8. rendimiento de uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura (expectorado)
AFB frotis positivo AFB frotis negativo

Asignaturas Asignaturas
99,6% (271/272) 79,0% (75/95)

Sensibilidad
IC del 95%: 97,9% - 99,9% IC del 95%: 69,7% - 85,9%
97,6% (164/168)
especificidad
IC del 95%: 94,0% - 99,1%
da
la
Tabla 9. rendimiento de uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura (inducido)
ro
nt
co
100% IC (15/15) 95%: 40,0% (4/10)

Sensibilidad a
pi
79,6% - 100% IC del 95%: 16,8% - 68,7%
co
99,0% (207/209)
especificidad
IC del 95%: 96,6% - 99,7%
a
un
14.1.4 Realización de un ensayo Xpert MTB / RIF Resultado vs. Cultura por Tipo de muestra
es
El rendimiento de la Xpert MTB / RIF Ensayo para la detección de MTB se determinó en relación a la cultura MTB en el esputo cruda y muestras de esputo sedimento
concentrado. Los resultados se muestran en la Tabla 10 y la Tabla 11. Entre 1.096 muestras, hubo 606 muestras de esputo en bruto y 490 muestras de esputo
o
sedimento concentrado.
-N
Tabla 10. Rendimiento del Uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura (Raw esputo)
i ón

ac
rm
99,7% (285/286) 79,4% (77/97)

Sensibilidad
fo
IC del 95%: 98,0% - 99,9% IC del 95%: 70,3% - 86,2%

in
97,8% (218/223)
especificidad
IC del 95%: 94,9% -99,0%
ra
pa
lo
Tabla 11. Rendimiento del Uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs MTB Cultura (concentrado de sedimentos)
Só

100% CI (65/65) 95%: 60,0% (12/20)

Sensibilidad
94,4% - 100% IC del 95%: 38,7% - 78,1%
99,3% (402/405)
especificidad
IC del 95%: 97,8% - 99,7%

Xpert ® MTB / RIF
14.1.5 rendimiento de uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs Drogas Pruebas de Sensibilidad para RIF
cultura MTB aislados positivos se ensayaron para determinar la susceptibilidad de drogas (DST) a la rifampicina usando los métodos proporciones de agar con medio
Middlebrook o Lowenstein-Jensen o el BD BACTEC TM MGIT TM 960 SIRE ensayo. El rendimiento de la Xpert MTB / RIF Ensayo para la detección de mutaciones genéticas
asociadas con la resistencia a RIF se determinó en relación a los resultados de la PSD del MTB cultura aísla. De los 1.096 sujetos elegibles y probadas por el ensayo de MTB
Xpert / RIF, 1.082 fueron utilizados en el análisis. Catorce sujetos se excluyeron del análisis; seis sujetos tuvieron un resultado Xpert MTB / RIF ensayo de MTB DETECTADO, Resistencia
Rif INDETERMINADO y ocho sujetos con cultivos positivos de MTB no tenían resultados de la PSD. Resultados para la detección de mutaciones de resistencia asociado RIF son
reportados por el MTB Ensayo Xpert / RIF sólo cuando MTB- complejo fue detectado por el dispositivo. Los resultados discordantes fueron evaluados mediante secuenciación
bidireccional de la rpoB región del genoma de MTB. Los resultados globales se presentan en la Tabla 12.
Tabla 12. Rendimiento del Uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs el horario de verano
el horario de verano
El horario de verano no
RIF RIF se realiza de Cultura
da
Resistente Susceptible TB negativo Total
la
MTB DETECTADO, Rif
ro
Resistencia 18 4 un 0 22
DETECTADO
nt
co
MTB DETECTADO,
Xpert MTB / RIF
Resistencia Rif no se 1 segundo 404 7 412
Ensayo
detecta a
pi
MTB NO
co
DETECTADO do 2 26 620 648

a
Total 21 434 627 1.082

un
Sensibilidad: 94,7% (18/19) con IC del 95%: 75,4% -99,1% Especificidad:

99,0% (404/408) con IC del 95%: 97,5% -99,6%
es
un De las cuatro muestras discordantes determinó que RIF susceptibles por el horario de verano y resistencia a RIF DETECTADO por el MTB Ensayo Xpert / RIF, uno
o
ha demostrado ser susceptible RIF y tres eran resistentes RIF por secuenciación bidireccional.
-N
segundo Un espécimen discordantes determinados a ser resistentes RIF por el horario de verano y resistencia a RIF NO DETECTADO por el MTB / RIF Ensayo Xpert se determinó que
era resistente RIF por secuenciación bidireccional.

do MTB no se detectó y por lo tanto la detección de mutaciones de resistencia asociado RIF no se pudo determinar.
i ón
ac
Resistencia RIF INDETERMINADO Se presentaron los resultados de un 1,3% (6/447; IC del 95%: 0,6% - 2,9%) de las muestras detectadas-MTB Xpert MTB / RIF ensayo
rm
general; 0,28% (1/351; IC del 95%: 0,01% a 1,58%) de muestras positivas AFB-frotis y 5,21% (5/96; IC del 95%: 2,24% a 11,62%) de las muestras negativas AFB-frotis.
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
14.2 Estudio 2
Diseño del estudio 14.2.1
Un estudio prospectivo multicéntrico (estudio 2) se llevó a cabo en múltiples sitios en los Estados Unidos, así como en África del Sur y Brasil. Rendimiento del ensayo MTB / RIF se evaluó
como una alternativa a la microscopía fluorescente de colores AFB-citología como una ayuda en la determinación de la necesidad de mantener el aislamiento infección por el aire en los
pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar activa. Los resultados de la prueba Xpert MTB / RIF ensayo de dos muestras de esputo de serie en los sujetos de estudio con sospecha
de tuberculosis pulmonar activa se compararon con los resultados de frotis teñidos fluorescentes AFB de las mismas muestras; un subconjunto de los sujetos tenían una tercera muestra
de esputo AFB-probados por frotis pero no por el MTB Xpert Ensayo / RIF. Cada muestra se cultivó durante MTB-compleja utilizando medios de cultivo líquidos y sólidos, con crecimiento
de micobacterias confirmado por las pruebas de sensibilidad a los medicamentos complejo MTB y rifampicina realizado a través del método de agar Middlebrook proporción. Estudio 2
también fue diseñado para evaluar el rendimiento clínico del ensayo de MTB Xpert / RIF utilizando muestras de esputo recogidos prospectivamente en las poblaciones infectadas por el
VIH y no infectadas por VIH. Los sujetos de estudio mayores de 18 años eran elegibles para la inscripción si se sospechaba que la tuberculosis pulmonar, en ausencia de tratamiento o
tenían menos de 48 horas de tratamiento de la tuberculosis dentro de los 180 días anteriores a la toma de la primera muestra de esputo, y tenía la determinación y / o documentación del
estado del VIH . Los sujetos fueron incluidos en el análisis si se producen al menos dos muestras de esputo recogidas en un volumen suficiente para las pruebas de ensayo Xpert MTB /
RIF, baciloscopia y cultivo de MTB, y los resultados interpretables estaban disponibles para los tres métodos. Una tercera muestra para análisis se recogieron en algunos sitios basados
en el estándar de protocolos de atención. De 992 sujetos elegibles y probados, treinta y dos sujetos (3,2%) fueron excluidos del análisis: 7 debido a la ausencia de resultados de los
cultivos y 3 debido a la contaminación del cultivo de MTB. Veintidós pacientes (2,2%) fueron excluidos debido a la Xpert MTB / RIF Ensayo resultados no determinados (es decir, NO
VÁLIDA, ERROR, o SIN RESULTADOS). Por lo tanto, 960 sujetos fueron utilizados en el análisis basado en el primer resultado Xpert MTB / RIF ensayo. Veinte de los 22 sujetos excluidos
del análisis basado en el primer resultado Xpert MTB / RIF ensayo dieron resultados válidos para la segunda muestra de prueba Xpert MTB / RIF ensayo, por lo tanto, el análisis basado
da
en dos muestras de prueba Xpert MTB / RIF ensayo incluyó un total de 980 asignaturas.
la
ro
nt
co
Los sujetos del estudio fueron 62% hombres, 38% mujeres. El sesenta y cinco (65%) por ciento de los sujetos eran de los EE.UU., y el 35% eran de no
sitios de Estados Unidos. Cuarenta y cinco (45%) por ciento de los sujetos de estudio fueron infectados por el VIH y el 55% eran sujetos no infectados por VIH. Expectorado y esputos inducidos
a
representó el 59,6% y el 33,6% de las muestras, respectivamente; El 7% de las muestras de esputo fueron sin especificar. Veintiocho por ciento de las muestras de esputos eran prima y el 72% se
pi
concentra sedimentos de esputo.
co
14.2.2 Xpert MTB / RIF Ensayo de rendimiento como predictivo de los resultados de la serie fluorescentes manchadas frotis AFB
a
De 215 sujetos de estudio con confirmada por cultivo de MTB-complejo (14,2% [88/618] de los sujetos de los Estados Unidos y el 37,1% [127/342] de los sujetos no estadounidenses), el 99% de
un
los sujetos (97% de los sujetos de los Estados Unidos y el 100% de los sujetos no estadounidenses) con sospecha de tuberculosis pulmonar en MTB-complejo se detectó mediante microscopía
de ácido-alcohol resistentes de dos o tres muestras de esputo de serie también tenían MTB-compleja detectada por una prueba de un solo esputo por el MTB Xpert Ensayo / RIF. Los resultados
es
de la prueba de dos muestras de esputo de serie por el MTB Xpert Ensayo / RIF detectaron MTB-complejo en todas las materias AFB-frotis positivo (100% en los sujetos de los Estados Unidos y
el 100% en los sujetos no estadounidenses).

o
-N
Un resultado negativo sola Xpert MTB / RIF ensayo predice la ausencia de tuberculosis pulmonar frotis positivo AFB con un valor predictivo negativo global (VPN) del 99,7%
ón
(99,6% en los EE.UU. y el 100% en los no-EEUU). Dos negativos Xpert MTB / Resultados RIF ensayo de serie predijeron que la ausencia de tuberculosis pulmonar con
baciloscopia positiva AFB con un valor presente neto global del 100%.
i
ac
14.2.3 Una Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado como predictivo de los resultados de la serie fluorescentes manchadas frotis AFB
rm
Tabla 13 y la Tabla 14 se presentan los resultados globales de un ensayo de MTB Xpert / RIF de resultados en comparación con los resultados del cultivo de MTB, estratificados por resultado la
baciloscopia (Tabla 13). Tabla 14 es una comparación lado a lado de la actuación de uno de MTB / RIF ensayo Xpert resultado en comparación con el resultado compuesto de dos BAAR en los
fo
Estados Unidos y los sujetos no estadounidenses (N = 960). La sensibilidad global de una MTB Ensayo Xpert / RIF en sujetos con baciloscopia negativa con frotis positivos y AFB AFB (sobre la
in
base de dos frotis AFB) fue del 98,5% (IC del 95%: 94,6%, 99,6%) IC y el 54,8% (95%: 44,1 %, 65,0%), respectivamente, y la especificidad global fue del 98,7% (IC del 95%: 97,5%, 99,3%). Uno
ra
de los resultados Xpert MTB / RIF ensayo de "MTB No detectado" se asoció con una probabilidad de resultados de MTB con cultivo positivo / AFB frotis positivo del 0,4% para los sujetos de los
pa
Estados Unidos y 0,0% para los sujetos no estadounidenses.

lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 13. Rendimiento del Uno Xpert MTB Ensayo / RIF Resultado estratificado por dos frotis AFB relativa al MTB
Cultura en sujetos no estadounidenses Estados Unidos y
Cultura
Positivo Negativo
AFB Cultura Cultura

Smear general general
+ AFB Smear - + AFB Smear+ AFB Smear - - Total
Positivo 129 46 175 1 9 10 un 185

Xpert MTB / RIF
Negativo 2 38 40 17 718 735 775
Ensayo
Total 131 84 215 18 segundo 727 745 960
Rendimiento del Xpert MTB Ensayo / RIF para frotis positivo:

Sensibilidad: 98,5% (129/131); IC del 95%: 94,6%, 99,6%
Especificidad: 94,4% (17/18), 95% IC: 74,2%, 99,0%
da
la
Rendimiento del Xpert MTB Ensayo / RIF para frotis negativo:
ro
Sensibilidad: 54,8% (46/84); IC del 95%: 44,1%, 65,0% Especificidad:
nt
98,8% (718/727), 95% IC: 97,7%, 99,4% Prevalencia de MTB cultivo
co
positivo: 22,4% (215/960)
Prevalencia de MTB cultivo positivo en los sujetos de los Estados Unidos: 14,2% (88/618)
a
pi
Prevalencia de MTB cultivo positivo en sujetos no estadounidenses: 37,1% (127/342)
co
Por ciento de los sujetos baciloscopia positivas entre los sujetos con MTB cultivo positivo: 60,9% (131/215)
a
un
Probabilidad general de MTB cultivo positivo entre los sujetos con un Xpert MTB / RIF Resultado negativo: 5,2% (40 /
IC 775), 95%: 3,8%, 7,0%
es
Probabilidad de MTB cultivo positivo entre los sujetos con un resultado negativo Xpert MTB / RIF (sujetos estadounidenses):
o
2,4% (13/539); IC del 95%: 1,4%, 4,1%

-N
Probabilidad de MTB cultivo positivo entre los sujetos con un resultado negativo Xpert MTB / RIF (sujetos no estadounidenses): 11,4% (27/236);
ón
IC del 95%: 8,0%, 16,1%

i
ac
Probabilidad general de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con un resultado negativo Xpert MTB / RIF: 0,3%
rm
(2/775), IC del 95%: <0,1%, 0,9%

fo
Probabilidad de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con un resultado negativo Xpert MTB / RIF (sujetos US): 0,4%
in
(2/539); IC del 95%: 0,1%, 1,3%

ra
Probabilidad de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con un Xpert MTB / RIF Resultado Negativo no estadounidenses) sujetos:
pa
0,0% (0/236), IC del 95%: 0,0%, 1,6%

un De los especímenes 10 MTB con cultivo negativo que fueron positivos por el ensayo Xpert MTB / RIF, 5 crecieron micobacterias no tuberculosas (MNT). MTB-complejo fue
lo
aislado e identificado utilizando métodos estándar de cuidado de no asociados con el protocolo del estudio en 4 de las 5 muestras.
Só
segundo De los especímenes 18 MTB cultivo negativo / AFB frotis positivo, creció 14 NTM.
Una Xpert MTB / RIF ensayo se asoció con una sensibilidad del 81,4% (IC del 95%: 75,7%, 86,0%) para la identificación de los sujetos positivos MTB cultura-en comparación
con una sensibilidad del 60,9% (IC del 95%: 54,3%, 67,2%) durante dos BAAR.

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 14. Comparación de las prestaciones de un Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado vs Dos AFB frotis Cada Versus MTB
Cultura Cultura
Una Xpert MTB / RIF Dos AFB
resultado del ensayo Positivo negativo Total frotis Positivo Negativo Total
Positivo 175 10 185 Positivo 131 18 149
AFB Smear
Xpert
Negativo 40 735 775 Negativo 84 727 811
Total 215 745 960 Total 215 745 960
Sensibilidad: 81,4% (IC del 95%: 75,7, 86,0) Sensibilidad: 60,9% (IC del 95%: 54,1, 67,5)
Especificidad: 98,7% (IC del 95%: 97,5, 99,3) Especificidad: 97,6% (IC del 95%: 96,2, 98,6)
EE.UU. PPV 14,2% (IC del 95%: 11,7, 17,2) EE.UU. PPV 14,2% (IC del 95%: 11,7, 17,2)
da
prevalencia: 94,9% (IC del 95%: 87,7, 98,0) prevalencia: 77,2% (IC del 95%: 66,8, 85,1)
la
VAN: 97,6% (IC del 95%: 95,9, 98,6) VAN: 95,0% (IC del 95%: 92,8, 96,5)
ro
nt
No estadounidense prevalencia 37,1% (IC del 95%: 32,2, 42,4) No estadounidense Prevalencia: 37,1% (IC del 95%: 32,2, 42,4) 100%
co
VPP 94,3% (IC del 95%: 88,2, 97,4) VPP (IC del 95%: 94,8, 100)
VPN (IC del 95%: 83,9, 92,0) 88,6

a VPN 79,0% (IC del 95%: 73,8, 83,5)
pi
co
En los sujetos de los Estados Unidos, el VPN para el resultado de un MTB / RIF ensayo Xpert fue del 97,6% (IC del 95%: 95,9%, 98,6%), mientras que el VPN para obtener resultados dos BAAR
fue del 95,0% (IC del 95%: 92,8%, 96,5%) con una prevalencia de la tuberculosis en pacientes estadounidenses de 14,2%. La diferencia en los VPN fue del 2,6% con un IC del 95%: 1,2%, 4,2%.
a
un
14.2.4 Dos Xpert MTB / RIF Ensayo de Resultados como predictivo de los resultados de la serie fluorescentes manchadas frotis AFB
es
Tabla 15 y la Tabla se presentan los resultados globales de dos Xpert MTB / RIF Los resultados del ensayo en comparación con los resultados del cultivo de MTB, estratificados por resultado la
baciloscopia (Tabla 15). Tabla compara el rendimiento de los dos ensayos Xpert MTB / RIF en comparación con el resultado compuesto de dos BAAR en los Estados Unidos y los sujetos no
o
estadounidenses (N = 980).
-N
La sensibilidad global de dos Xpert MTB Ensayo / RIF se traduce en sujetos con baciloscopia negativa con frotis positivos y AFB AFB en base a dos frotis AFB fue 100,0% (IC del
95%: 97,2%, 100,0%) y 69,4% (IC del 95%: 59,0% , 78,2%), respectivamente, y la especificidad global fue del 97,9% (IC del 95%: 96,6%, 98,7%). No hay MTB cultivo positivo /
ón
AFB resultados frotis positivos fueron observados en sujetos con dos negativos RIF Ensayo de serie Xpert MTB / resultados.
i
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 15. Rendimiento de los dos Xpert MTB Ensayo / RIF resultados estratificados por dos frotis AFB relativa al MTB
Cultura
Positivo Negativo
AFB Cultura Cultura

Smear general general
+ AFB Smear - + AFB Smear+ AFB Smear - - Total
Positivo 133 59 192 1 15 dieciséis un 208

Xpert MTB / RIF
Negativo 0 26 26 17 729 746 772
Ensayo
Total 133 85 218 18 segundo 744 762 980
Rendimiento del Xpert MTB Ensayo / RIF para frotis positivo:
Sensibilidad: 100% (133/133); IC del 95%: 97,2%, 100%

Especificidad: 94,4% (17/18), 95% IC: 74,2%, 99,0%
da
Rendimiento del Xpert MTB Ensayo / RIF para frotis negativo:
la
ro
Sensibilidad: 69,4% (59/85); IC del 95%: 59,0%, 78,2% Especificidad:
nt
98,0% (729/744), 95% IC: 96,7%, 98,8%
co
Prevalencia de MTB cultivo positivo: 22,2% (218/980)
Prevalencia de MTB cultivo positivo en los sujetos de los Estados Unidos: a
14,4% (91/633)
pi
Prevalencia de MTB cultivo positivo en sujetos no estadounidenses: 36,6% (127/347)
co
Por ciento de los sujetos baciloscopia positiva entre los sujetos con un resultado de MTB cultivo positivo: 61,0% (133/218)
a
un
Probabilidad de MTB cultivo positivo entre los sujetos con Xpert MTB / RIF resultados negativos: 3,4% (26/772); IC del 95%: 2,3%, 4,9%
es
o
Probabilidad de MTB cultivo positivo entre los sujetos con Xpert MTB / RIF Resultados negativos (los sujetos de los Estados Unidos):
-N
1,5% (8/544), IC del 95%: 0,7%, 2,9%

Probabilidad de MTB cultivo positivo entre los sujetos con Xpert MTB / RIF resultados negativos (los sujetos no estadounidenses):
ón
7,9% (18/228); IC del 95%: 5,1%, 12,1%

i
ac
Probabilidad de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con Xpert MTB / RIF resultados negativos: 0,0% (0/772), IC del
95%: 0,0%, 0,5%
rm
Probabilidad de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con Xpert MTB / RIF Resultados negativos (sujetos US): 0,0%
fo
(0/544); IC del 95%: 0,0%, 0,7%

Probabilidad de MTB cultivo positivo y baciloscopia positiva entre los sujetos con Xpert MTB / RIF Resultados negativos (sujetos no
in
estadounidenses): 0,0% (0/228), IC del 95%: 0,0%, 1,7%

ra
un De las 16 muestras de MTB con cultivo negativo que fueron positivos por el ensayo Xpert MTB / RIF, 6 crecieron micobacterias no tuberculosas (MNT). MTB-complejo fue
pa
aislado e identificado utilizando métodos estándar de cuidado de no asociados con el protocolo del estudio en 4 de las 6 muestras.
lo
segundo De los especímenes 18 MTB cultivo negativo / AFB frotis positivo, creció 14 NTM.
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla compara el rendimiento de los dos resultados Xpert MTB / RIF ensayo y dos frotis AFB a MTB Cultura. Xpert MTB / RIF Los resultados del ensayo identificados 88,1% (IC del 95%:
83,1%, 91,7%) de los sujetos con cultivo positivo de MTB en comparación con el 61,0% (IC del 95%: 54,4%,
67,2%) dos frotis AFB.
Tabla 16. Comparación de las Prestaciones de dos Xpert MTB Ensayo / RIF Resultados vs Dos AFB frotis Cada Versus MTB
Cultura Cultura
Una Xpert MTB / RIF Dos AFB
resultado del ensayo Positivo negativo Total frotis Positivo Negativo Total
Positivo 192 dieciséis 208 Positivo 133 18 151
AFB Smear
Xpert
Negativo 26 746 772 Negativo 85 744 829
Total 218 762 980 Total 218 762 980
Sensibilidad: 88,1% (IC del 95%: 83,1, 91,7) Sensibilidad: 61,0% (IC del 95%: 54,4, 67,2)
da
Especificidad: 97,9% (IC del 95%: 96,6, 98,7) Especificidad: 97,6% (IC del 95%: 96,3, 98,5)
la
ro
EE.UU. PPV 14,4% (IC del 95%: 11,9, 17,3) EE.UU. PPV 14,4% (IC del 95%: 11,9, 17,3)
nt
prevalencia: 93,3% (IC del 95%: 86,1, 96,9) prevalencia: 77,8% (IC del 95%: 67,6, 85,5)
co
VAN: 98,5% (IC del 95%: 97,1, 99,3) VAN: 94,9% (IC del 95%: 92,8, 96,5)
a
pi
No estadounidense prevalencia 36,6% (IC del 95%: 31,7, 41,8) No estadounidense Prevalencia: 36,6% (IC del 95%: 31,7, 41,8) 100%
co
VPP 91,6% (IC del 95%: 85,2, 95,4) VPP (IC del 95%: 94,8, 100)
VPN (IC del 95%: 87,9, 94,9) 92,1 VPN 79,4% (IC del 95%: 74,3, 83,8)
a
un
En los sujetos de los Estados Unidos, el VAN de dos resultados Xpert MTB / RIF ensayo fue de 98,5% (IC del 95%: 97,1%, 99,3%), mientras que el VPN para obtener resultados dos BAAR fue del
es
94,9% (IC del 95%: 92,8%, 96,5%) cuando la prevalencia de la tuberculosis en los sujetos de los Estados Unidos fue del 14,4%. Información detallada de rendimiento Xpert MTB / RIF ensayo en
comparación con BAAR con respecto al tiempo entre la recogida de muestras de esputo en los sujetos de los Estados Unidos se presenta en la Tabla 17.
o
-N
ón
Tabla 17. Xpert MTB / RIF Ensayo Rendimiento frente a AFB Microscopía de esputo relativa a la Colección Tiempo entre
Las muestras de esputo
i
ac
resultados Xpert Resultados baciloscopia

rm
Una sensibilidad Xpert Resultado = Los datos no analizados por una baciloscopia
fo
85,2% (75/88)
in
Especificidad = 99,2% (526/530)

ra
Prevalencia = 14,2% (88/618) VAN =

97,6% (526/539)
pa
Probabilidad de sujetos positivos AFB MTB cultivo positivo frotis

lo
entre los resultados negativos RIF Xpert MTB / = 0,4% (2/539)

Só
Dos Xpert Resultados Sensibilidad = Dos AFB Smear Resultados
91,2% (83/91) Sensibilidad = 69,2% (63/91)

Especificidad = 98,9% (536/542) Especificidad = 96,7% (524/542)
Prevalencia = 14,4% (91/633) VAN = Prevalencia = 14,4% (91/633) VAN =
98,5% (536/544) 94,9% (524/552)
Probabilidad de cultivo positivo MTB / AFB frotis sujetos

positivos entre los resultados negativos Xpert MTB / RIF ensayo
= 0.0% (0/544)

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 17. Xpert MTB / RIF Ensayo Rendimiento frente a AFB Microscopía de esputo relativa a la Colección Tiempo entre
Las muestras de esputo (Continuación)
resultados Xpert Resultados baciloscopia
Dos Xpert Resultados con dos muestras de esputo Dos baciloscopia Los resultados con dos muestras recogidas = 8
recogidos = 8 horas de diferencia un horas de diferencia un
Sensibilidad = 92,5% (49/53) Sensibilidad = 71,7% (38/53)

98,9% (342/346) 95,8% (339/354)
Probabilidad de cultivo positivo MTB / AFB frotis sujetos

positivos entre los resultados negativos Xpert MTB / RIF ensayo
= 0,0%
Dos Resultados Xpert con dos muestras recogidas <8 horas Dos baciloscopia Los resultados con dos muestras recogidas <8 horas
de diferencia segundo de diferencia segundo
Sensibilidad = 89,5% (34/38) Sensibilidad = 65,8% (25/38)
da
la
98,0% (194/198) 93,4% (185/198)
ro
Probabilidad de cultivo positivo MTB / pacientes positivos con frotis
nt
AFB entre los resultados negativos Xpert MTB / RIF ensayo = 0,0%
co
Ninguno de los sujetos tenían tres muestras analizadas por el ensayo Tres AFB Smear Resultados
Xpert MTB / RIF a
pi
Sensibilidad = 60,4% (29/48)
co

93,7% (284/303)
a
un
Tres baciloscopia Los resultados con tres muestras

recogidas = 8 horas de diferencia do
es

o

-N

96,6% (112/116)
ón
Tres baciloscopia Los resultados con tres muestras

recogidas <8 horas de diferencia re
i
ac

rm

fo

92,0% (172/187)
in
un El marco de tiempo entre la recolección de la primera muestra de esputo y la segunda muestra de esputo es mayor que o igual a 8 horas. segundo El período
ra
de tiempo entre la extracción de la primera muestra de esputo y la segunda muestra de esputo es menos de 8 horas. do El marco de tiempo entre la recolección
pa
de la primera muestra de esputo y la segunda muestra de esputo fue mayor o igual a 8 horas, y el marco de tiempo entre la recogida de la segunda muestra de
esputo y la tercera muestra de esputo fue mayor o igual a 8 horas . re Tres frotis AFB con menos de 8 horas significa que al menos uno de los intervalos de
lo
tiempo entre la recogida de muestras era de menos de 8 horas de diferencia.

Só

Xpert ® MTB / RIF
14.3 Xpert MTB / RIF rendimiento del ensayo en una población VIH
Para comparar el rendimiento de la BTT Ensayo Xpert / RIF en los sujetos infectados por el VIH y no infectadas por el VIH, los datos del estudio 2 fueron analizados por el estado de
mancha de especímenes y el estado de VIH de la población. Tabla 18 y la Tabla 19 se comparan las sensibilidades y especificidades de un resultado Xpert MTB / RIF ensayo en
muestras obtenidas de sujetos infectados por el VIH y no infectadas por VIH estratificados por los resultados del frotis negativos frotis positivo y AFB AFB, respectivamente. Por tanto
los sujetos infectados por el VIH y no infectadas por VIH, la sensibilidad de la prueba Xpert MTB / RIF para la detección de MTB-complejo fue mayor en las muestras de frotis positivo
AFB (100,0% y 97,8%, respectivamente) que en las muestras con baciloscopia negativa AFB (52,1% y 58,3%, respectivamente). Estos datos se resumen en la Tabla 19.
Tabla 18. Comparación de la sensibilidad y especificidad del Uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado de infectados por el VIH y
Sólo los sujetos-AFB no infectadas por VIH frotis positivo
Diferencia (IC
Xpert MTB / RIF En general infectada por el VIH Sin VIH del 95%)
98,5% 100% 97,8% 2,2%

Sensibilidad
(129/131) (39/39) (90/92) (-0,8%, 5,2%)
94,4% 100% 90,9% 9,1%
da
especificidad
(17/18) (7/7) (10/11) (-7,9%, 26,1%)
la
ro
nt
Tabla 19. Comparación de la sensibilidad y especificidad del Uno Xpert MTB / RIF Ensayo Resultado de infectados por el VIH y
co
Sólo los sujetos-AFB no infectados por el VIH Negativo Smear
a Diferencia (IC
pi
Xpert MTB / RIF En general infectada por el VIH Sin VIH del 95%)
co
El 54,8% 52,1% 58,3% -6,3%

Sensibilidad
(46/84) (25/48) (21/36) (-27,7%, 15,2%)
a
un
98,8% 98,2% 99,2% -1,0%

especificidad
(718/721) (332/338) (386/389) (-2,7%, 0,7%)
es
Rendimiento 15. Características de rendimiento analítico-

o
-N
15.1 Reactividad analítica (Inclusividad)

La reactividad analítica del ensayo de MTB Xpert / RIF fue evaluada frente a 62 bien caracterizadas Tuberculosis micobacteriana
ón
aislamientos que representa la diversidad geográfica y fenotípica. Tabla 20 listas de 26 cepas sensibles a la rifampicina y 36 cepas resistentes a la rifampicina por pruebas de
susceptibilidad fenotípica a fármacos (DST). Xpert MTB / RIF ensayo de resultados MTB detectado; La resistencia del Rif no se detecta en comparación con el horario de verano fue de
i
ac
87% (67/77) precisa en las pruebas repetidas válidos utilizando 26 cepas sensibles a la rifampicina que se ensayaron por triplicado. Un replicado en 78 pruebas no era válida y no se
rm
repite. Tres de las cepas susceptibles de DST (véase la nota "C" en la Tabla 20) que puso a prueba la resistencia de MTB Xpert Ensayo / RIF rifampicina se encontró que tenían
mutaciones de resistencia a rifampicina según el análisis de secuencia de ADN. Uno de tres réplicas de la cepa de tipo salvaje TDR 33 se informó MTB detectado; Resistencia Rif
fo
indeterminado. Xpert MTB / RIF ensayo de resultados MTB detectado; Resistencia Rif DETECTADO en comparación con el horario de verano fue del 100% (107/107) precisa en las
in
pruebas repetidas válidos utilizando 36 cepas resistentes a la rifampicina que se ensayaron por triplicado. Una réplica en 108 pruebas no era válida y no se repite. Resultados por cepa se
ra
muestran en la Tabla 20.

pa
lo
Só
Tabla 20. Reactividad analítica (Inclusividad) Ensayo de la Xpert MTB / RIF
Susceptibilidad Susceptibilidad por

Xpert segundo
ID cepa Origen por el horario de verano un
TDR 116 Corea del Sur R R
TDR 21 RD Congo R R
TDR 28 do Bangladesh R R
TDR 191 do Perú R R

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 20. Reactividad analítica (Inclusividad) Ensayo de la MTB Xpert / RIF (Continuación)

Xpert segundo
TDR 125 Brasil R R
TDR 34 Bangladesh R R
TDR 73 Perú R R
TDR 190 do España R R
TDR 129 Brasil R R
TDR 186 do Marruecos R R
TDR 59 do Burundi R R
TDR 185 do Nigeria R R
da
la
TDR 19 Azerbaiyán R R
ro
TDR 148 Nepal R R
nt
TDR 13 do Bangladesh R R
co
H37Rv re cepa de laboratorio a S S

pi
TDR 22 RD Congo S S
co
TDR 29 Azerbaiyán S S
a
TDR 33 Bélgica S
un
CDC 1551 do Estados Unidos S S

es
TDR 146 do Nepal S S

o
TDR 78 do Corea del Sur S S

-N
TDR 54 do Bangladesh S S
ón
TDR 215 do Perú S S
TDR 158 do Perú S

i
S
ac
TDR 178 do Guinea S S

rm
TDR 64 do África del Sur S S

fo
97-05193 Perú R R
in
97-05201 Perú R R
ra
97-06877 Perú R R
pa
97-08341 Perú R R
lo
97-12004 Perú R R
Só
97-17582 Perú R R
97-18875 Perú R R
97-20784 Perú R R
97-20985 Perú R R
99-09120 Perú R R
99-R396 Perú R R
01-R0612 Beijing R R

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 20. Reactividad analítica (Inclusividad) Ensayo de la MTB Xpert / RIF (Continuación)

Xpert segundo
01-R1403 mi Perú S R
97-15246 mi Perú S R
98-R839 mi Perú S R
99-R460 Perú S S
99-R485 Perú S S
da
00-06461 NOS S S
la
00-R0222 Perú S S
ro
00-R0454 NOS S S
nt
00-R0460 Perú S S
co
01-10979 NOS S S
01-1118 Perú a S S
pi
02-02880 NOS S S
co
02-03222 Perú S S
a
02-R0040 Perú S
un
un R = RIF resistentes, S = b susceptibles RIF = mutaciones de resistencia a RIF R detectada, S = mutaciones de resistencia
es
a RIF no detectado c Se utilizó ADN; cepas cultivadas cuantificados no estaban disponibles. re La cepa H37Rv ATCC
referencia se ensayó como tanto las células y el ADN. mi Aislar rifampicina susceptibles por el horario de verano, pero
o
resistente a la rifampicina por la secuencia de ADN y Xpert MTB / RIF ensayo.

-N
i ón
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Un adicional de 5 Tuberculosis micobacteriana cepas del complejo, es decir, M. africanum ( taxid: 33.894), M. bovis ( taxid: 1765),
M. canetti ( taxid: 78.331), M. caprae ( taxid: 115862), y M. microti ( taxid: 1806), no estaban mojadas probados, pero que fueron evaluados in silico para evaluar la
reactividad analítica o inclusión. Los resultados de la in silico análisis predice una probabilidad muy alta de la amplificación y detección mediante el MTB / RIF ensayo Xpert.
Véase la Tabla 21.
Tabla 21. Alineaciones de cebadores y sondas para la rpoB secuencias de M. africanum, M. bovis, M. canetti, M. caprae
y M. microti
Sequence Alignment (número de residuos idénticos) del Xpert MTB / RIF ensayo Primer /
complejo MTB Sondar para los organismos MTB-complejos
organismo RpoB RpoB RpoB La sonda A RpoB La sonda C RpoB RpoB

RpoB un Probe B un RpoB un Sonda D un sonda E un
for1 For2 Rev
Mycobacterium 24/24 24/24 23/24 17/17 24/24 17/17 18/18 18/18

africanum
(Taxid: 33894) segundo
Mycobacterium bovis 24/24 24/24 23/24 17/17 24/24 17/17 18/18 18/18
da
la
canetti Mycobacterium 24/24 24/24 23/24 17/17 24/24 17/17 18/18 18/18
ro
nt
caprae Mycobacterium 24/24 24/24 23/24 17/17 24/24 17/17 18/18 18/18
co
Mycobacterium microti 24/24 24/24 23/24 17/17 24/24 17/17 18/18 18/18
(Taxid: 1806) segundo a
pi
un Secuencia de la alineación de las sondas hechas con ninguna secuencia madre.
co
segundo taxid - identificador único para un organismo en la base de datos NCBI taxonomía.
a
un
15.2 Especificidad (exclusividad)

Ciento treinta y dos (132) diferentes microorganismos, que representan patógenos respiratorios comunes potencialmente encontradas en el tracto bucal / respiratoria, se
es
ensayaron a una concentración de al menos 10 8 CFU / ml (o ADN en 1x10 7 copias / mL) para las bacterias y los hongos; una concentración de 10 5 TCID50 / ml (o ácido
nucleico en 2x10 9 copias / mL) en busca de virus; una concentración de 10 6 cuerpos elementales (EB) por ml de clamidia; y una concentración de 10 6 UFC / ml durante dos
o
micobacterias no tuberculosas. Véase la Tabla 22. La especificidad analítica del MTB Ensayo Xpert / RIF es 100% a una concentración de 10 8 CFU / ml (o ADN en 1x10 7 copias
-N
/
ml) para bacterias y hongos; una concentración de 10 5 TCID50 / ml (o ácido nucleico en 2x10 9 copias / mL) en busca de virus; y una concentración de 10 6 cuerpos elementales
ón
(EB) por ml de la clamidia. La especificidad analítica del MTB Ensayo Xpert / RIF es 100% a una concentración de 10 8 UFC / ml para 21 de 24 micobacterias no tuberculosas
i
(MNT) ensayados. La reactividad cruzada se observó en uno de tres repeticiones usando M. scrofulaceum A las 10 8 CFU / mL, sin embargo, no se observó reactividad cruzada a
ac
10 7 CFU / mL. Dos MNA ( M. genavense y M. smegmatis) No fueron probados por encima de 10 6 UFC / ml debido a la falta de crecimiento. La especificidad analítica del MTB
rm
Ensayo Xpert / RIF es 100% a una concentración de 10 6 CFU / ml para estos 2 organismos. Los controles positivos y negativos fueron incluidos en el estudio.
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 22. microorganismos ensayados para Especificidad analítica
Acinetobacter baumannii virus de la influenza humana B un lactamica Neisseria
Acinetobacter calcoaceticus metapneumovirus humano Neisseria meningitidis

Actinomyces israelii segundo Parainfluenza humana tipo 1 Neisseria mucosa
Actinomyces Odontolyticus Parainfluenza humana tipo 2 Neisseria sicca
adenovirus Parainfluenza humana tipo 3 Nocardia asteroides segundo
Aspergillus fumigatus do Respiratorio sincitial humano virus A un cyriacigeorgica Nocardia segundo
Bacillus cereus Human virusB sincitial respiratorio un Pasteurella multocida subsp.

tigris
Bacillus subtilis subsp. subtilis Kingella kingae pentosaceus segundo
Bacteroides fragilis Klebsiella oxytoca Peptostreptococcus anaerobius
da
Bordetella parapertussis segundo Klebsiella pneumoniae la producción de KPC-3 Porphyromonas
la
carbapenemase asaccharolytica
ro
Bordetella pertussis Klebsiella pneumoniae subsp. melaninogénica Prevotella
nt
pneumoniae
co
Burkholderia cepacia Lactobacillus acidophilus Propionibacterium acnes
Campylobacter jejuni subsp. Lactobacillus casei a Proteus mirabilis

pi
jejuni segundo
co
Candida albicans Legionella pneumophila subsp. Proteus vulgaris

a
pneumophila
un
Candida glabrata Leuconostoc mesenteroides subsp. Providencia stuartii

es
mesenteroides
Candida krusei Listeria monocytogenes aeruginosa Pseudomonas
o
-N
Candida parapsilosis Moraxella catarrhalis La cepa de rinovirus 1A
Candida tropicalis morganii Morganella subsp. Rhodococcus equi

ón
Morganella
i
ac
Chlamydia trachomatis Mycobacterium abscessus Salmonella enterica subsp.

enterica serovar Dublin
rm
Chlamydophila pneumoniae segundo asiaticum Mycobacterium Salmonella enterica subsp.

fo
enterica serovar typhimurium

in
Citrobacter freundii Mycobacterium avium subsp. avium Serratia marcescens subsp.

ra
marcescens
pa
Clostridium perfringens Mycobacterium celatum Shigella flexneri

lo
Corynebacterium diphtheriae segundo Mycobacterium chelonae Shigella sonnei

Só
jeikeium Corynebacterium flavescens Mycobacterium Staphylococcus aureus subsp.

aureus
pseudodiphtheriticum Mycobacterium fortuitum subsp. Staphylococcus capitis subsp.
Corynebacterium fortuitum capitis
Corynebacterium xerosis Mycobacterium gastri Staphylococcus epidermidis
Cryptococcus neoformans Mycobacterium genavense Staphylococcus haemolyticus

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 22. microorganismos ensayados para Especificidad (Continuación)
citomegalovirus Mycobacterium gordonae Staphylococcus hominis subsp.

hominis
Eikenella corrodens Mycobacterium haemophilum Staphylococcus lugdunensis
Enterobacter aerogenes Mycobacterium intracellulare estenotrofomona maltofila

Enterobacter cloacae subsp. Mycobacterium kansasii Streptococcus agalactiae
cloacae
Enterococcus avium Mycobacterium malmoense Streptococcus constellatus
subsp. constellatus
Enterococcus faecalis Mycobacterium marinum Streptococcus equi subsp. equi
Enterococcus faecium scrofulaceum Mycobacterium Streptococcus mitis
Tipo enterovirus 71 / NY simiae Mycobacterium Streptococcus mutans
Escherichia coli Mycobacterium smegmatis parasanguinis Streptococcus
da
Escherichia coli la producción de CTXM-15 Mycobacterium szulgai steotococos neumonia
la
BLEE
ro
Fusobacterium nucleatum subsp. Mycobacterium terrae Streptococcus pyogenes
nt
nucleatum
co
Haemophilus influenzae thermoresistibile Mycobacterium Streptococcus salivarius subsp.
a salivarius
pi
Haemophilus parahaemolyticus Mycobacterium triviale Streptococcus sanguinis
co
parainfluenzae Haemophilus vaccae Mycobacterium Streptococcus uberis

a
Virus herpes simplex tipo 1 un Mycobacterium xenopi parvula veillonellas

un
Virus herpes simplex tipo 2 un Mycoplasma pneumoniae segundo paramesenteroides Weissella

es
virus de la influenza humana A un Neisseria gonorrhoeae Yersinia enterocolitica subsp.

enterocolitica
o
-N
un El ADN genómico o ARN utilizado; concentraciones ensayadas variaban de 3,1 x 10 9 a 1,2 x 10 11 copias / mL. segundo El ADN genómico
utilizado; concentraciones ensayadas variaban de 1x10 7 a 1x10 10 copias / mL. do El ADN genómico utilizado; concentración ensayada en 3,2 x
ón
10 8 copias / mL.
i
ac
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
La reactividad cruzada potencial de 25 microorganismos que no puede ser probado en húmedo usando organismos enteros o ácido nucleico se evaluó in silico análisis. Veinte de
los 25 microorganismos ensayados no reveló potencial de reactividad cruzada. Véase la Tabla 23, Tabla 24 y Tabla 25.
Cinco cepas demostraron un ligero potencial de reactividad cruzada que puede resultar en falsos resultados positivos en el ensayo de MTB Xpert / RIF. Véase la Tabla
26.
Tabla 23. Microorganismos prevé que sea no reactivo en forma cruzada por in silico Análisis
(RpoB Para 1 + Sonda RpoB Rev)
Organismo Adhesión Max Score consulta Cov E Valor Identidad
oralis Kingella
GU561427.1 16.4 69% 20 100%
Taxid: 505
micdadei Legionella
NR_041791.1 18.3 34% 3.6 100%
Taxid: 451
brasiliensis Norcardia
JN215639.1 40.1 73% 0.000003 100%
Taxid: 37326
da
Streptomyces
la
anulatus AB431435.1 28.2 61% 0,026 100%
ro
Taxid 1892
nt
Histoplasma
co
capsulatum XM_001536322.1 28.2 28% 1.5 100%
Taxid: 339724
Blastomyces
a
pi
dermatitidis
co
(dermatitidis XM_002624017.1 28.2 48% 1.5 100%

Ajellomyces)
a
un
Taxid: 559298
Penicillium spp.
es
XM_002566094.1 30.2 38% 2 95%

Taxid: 500485
o
Rhizopus spp.
AY847625.1 22.3 28% 8.1 93%
-N
Taxid: 4847
Scedosporium spp. Taxid:

ón
HQ231813.1 18.3 57% 23 100%

563467
i
ac
virus de la rubéola
AB588191.1 24.3 97% 2.4 100%
taxid: 111041
rm
virus de la rubeola
JN635408.1 22.3 22% 36 100%
fo
taxid: 884098
in
virus Rubula
EU606317.1 22.3 22% 13 100%
taxid: 11161
ra
pa
Varicela Zoster Virus

taxid: 10335 JQ972914.1 22.3 89% 45 100%
lo
Só
franklinii
Mycobacterium HQ662080.1 22.3 83% 0.36 100%
Taxid: 948102
M. massiliense,
M. bolletii, M.
abscessus subsp. NC_018150.2 32.2 100% 0.21 95%
bolletii
Taxid: 319705

Xpert ® MTB / RIF
(RpoB Para 1 + Sonda RpoB Rev) (Continuación)
quimera
Mycobacterium AY943187.1 26.3 83% 0,016 90%
Taxid: 222805
Mycobacterium avium
subsp.
AF057479.1 36.2 85% 0,005 100%
paratuberculosis
Taxid: 1770
Mycobacterium avium
subsp. silvaticum AY544889.1 28.2 85% 0,004 94%
Taxid: 44282
Mycobacterium avium
subsp. hominissuis AP012555.1 30.2 100% 0.15 100%
da
Taxid: 439334
la
immunogenum
Mycobacterium 95%
ro
HM454251.1 32.2 48% 5E-04
Taxid: 83262
nt
co
a
pi
(Rev RpoB sonda RpoB For2 +)
co

a
oralis Kingella
un
GU561427.1 14.4 57% 79 100%

Taxid: 505
es
micdadei Legionella
X57520.1 18.3 55% 3.6 100%
Taxid: 451
o
-N
DQ085110.1 38.2 46% 0,00001 100%

Taxid: 37326
ón
Streptomyces
anulatus AB431435.1 28.2 71% 0,026 100%
i
ac
Taxid 1892
rm
Histoplasma
capsulatum XM_001536322.1 28.2 28% 1.5 100%
fo
Taxid: 339724
in
Blastomyces
ra
dermatitidis
(dermatitidis XM_002625196.1 100%
pa
30.2 30% 0.38

Ajellomyces)
lo
Taxid: 559298
Só
Penicillium spp.
XM_002565312.1 30.2 44% 2 91%
Taxid: 500485
Rhizopus spp.
HM130700.1 20.3 73% 32 100%
Taxid: 4847

AY625497.1 20.3 44% 5,7 100%
563467
AB588191.1 24.3 81% 2.4 100%
taxid: 111041

Xpert ® MTB / RIF
(RpoB For2 + RpoB Rev Probe) (Continuación)
virus de la rubeola
JN635410.1 24.3 38% 9.1 100%
taxid: 884098
virus Rubula
BK005918.1 24.3 85% 3.2 100%
taxid: 11161

taxid: 10335 JQ972914.1 20.3 91% 177 100%
franklinii
Taxid: 948102
M. massiliense,
M. bolletii, M.
da
abscessus subsp. NC_018150.2 32.2 100% 0.21 100%
bolletii
la
Taxid: 319705
ro
quimera
nt
Mycobacterium AY943187.1 40.1 91% 1E-06 96%
co
Taxid: 222805
Mycobacterium avium a
pi
subsp.
AF057479.1 36.2 59% 0,005 100%
co
paratuberculosis
Taxid: 1770
a
Mycobacterium avium
un
subsp. silvaticum AY544889.1 28.2 79% 0,004 94%

es
Taxid: 44282
Mycobacterium avium
o
subsp. hominissuis 100%

-N
AP012555.1 32.2 100% 0.38

Taxid: 439334
ón
immunogenum
i
ac
Taxid: 83262
rm
fo
(Todas las sondas RpoB con ninguna secuencia madre)

in
consulta
ra
Organismo Adhesión Max Score Cov E valor Identidad

pa
oralis Kingella
0 0 0% 0
Taxid: 505
lo
micdadei Legionella
Só
AF367743.1 33.7 72% 0.0001 72%

Taxid: 451
DQ085110.1 77 100% 4E-17 81%
Taxid: 37326
Streptomyces
anulatus U64692.1 26.5 27% 0.14 86%
Taxid 1892

Xpert ® MTB / RIF
(Todas las sondas RpoB con ninguna secuencia madre) (continuación)
consulta
Organismo Adhesión Max Score Cov E valor Identidad
Histoplasma
capsulatum XM_001538897.1 30.1 27% 0.63 91%
Taxid: 339724
Blastomyces
dermatitidis
(dermatitidis XM_002623914.1 28.3 18% 2.3 100%
Ajellomyces)
Taxid: 559298
Penicillium spp.
XM_002557696.1 30.1 20% 3.5 100%
Taxid: 500485
Rhizopus spp.
AY147870.1 22.9 15% 8.8 0
Taxid: 4847
da
la
0 0 0% 0
563467
ro
nt
0 0 0% 0
taxid: 111041
co
virus de la rubeola
0 0 0% 0
taxid: 884098 a
pi
virus Rubula
co
0 0 0% 0
taxid: 11161
a

un
taxid: 10335 0 0 0% 0
es
franklinii
Mycobacterium HQ662092.1 88% 100%
o
24.3 0.16
-N
Taxid: 948102
M. massiliense,
ón
M. bolletii, M.
abscessus subsp. DQ987717.1 75.8 75% 3E-14 92%
i
ac
bolletii
rm
Taxid: 319705
quimera
fo
Mycobacterium AY943187.1 91.7 100% 6E-22 90%

in
Taxid: 222805
ra
Mycobacterium avium
pa
subsp.
CP005928.1 83.8 100% 4E-17 89%
paratuberculosis
lo
Taxid: 1770
Só
Mycobacterium avium
subsp. silvaticum AY544889.1 107 100% 8E-27 90%
Taxid: 44282
Mycobacterium avium
subsp. hominissuis AP012555.1 107 100% 1E-24 90%
Taxid: 439334
immunogenum
Mycobacterium HM454251.1 95.1 97% 1E-22 87%
Taxid: 83262

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 26. Microorganismos prevé que sea potencialmente reactivo por Cruce in silico Análisis
Mycobacterium kumamontonense
Mycobacterium leprae Mycobacterium
mucogenicum Tsukamurella spp.
otitidiscaviarum Nocardia
15.3 Sensibilidad analítica (límite de detección)

Se llevaron a cabo estudios para determinar el límite de detección (LOD) de las cepas humanas de Tuberculosis micobacteriana y
Mycobacterium bovis BCG (Bacilo de Calmette-Guerin) diluido en el esputo humano y el sedimento de esputo humano. El límite de detección es la concentración más baja reportada
en UFC / ml que se puede distinguir de forma reproducible a partir de muestras negativas con una confianza del 95%. Repeticiones de 20 fueron evaluados en cinco a ocho
concentraciones y se determinó límite de detección utilizando el análisis probit con la excepción de las pruebas realizadas con M. tuberculosis mutantes resistentes a rifampicina
células cepa TDR125 en el sedimento de esputo, que se llevó a cabo en una sola concentración, en réplicas de 40. Véase la Tabla 27.
da
la
ro
Tabla 27. Análisis de Datos Probit y reivindicados LdD en UFC / ml
nt
Microorganismo (Cepa) Tipo de muestra Estimación LdD reclamado LdD
co
Esputo 486 525
M. bovis ( BCG)
El sedimento de esputo a 703 700
pi
Esputo 600
co
M. tuberculosis 414
(H37Rv) El sedimento de esputo 2,046 3.000

a
un
M. tuberculosis Esputo 872 1000

(TDR125) El sedimento de esputo DAKOTA DEL NORTE un 4.000
es
un No determinado (ND) por análisis probit.

o
-N
15.4 Las sustancias que interfieren Estudio
Rendimiento del MTB Ensayo Xpert / RIF se evaluó en presencia de 32 sustancias potencialmente interferentes. Potencialmente endógeno interferir sustancias pueden incluir,
ón
pero no se limitan, a la sangre, pus (células blancas de la sangre), las células de las vías respiratorias, mucina, el ADN humano, y el ácido gástrico desde el estómago. Otras
sustancias potencialmente interferentes pueden incluir anestésicos, antibióticos, antibacterianos, fármacos contra la tuberculosis, medicamentos antivirales, broncodilatadores
i
ac
inhalados, broncodilatadores, la vacuna antigripal intranasal, enjuague bucal germicida, la muestra de reactivos de procesamiento, P jiroveci neumocystis medicación,
rm
medicamentos homeopáticos de alivio de la alergia, corticosteroides nasales, geles nasales, aerosoles nasales, anestésicos orales, expectorantes orales, tampones neutralizantes,
y tabaco. Estas sustancias se enumeran en la Tabla 28 con ingredientes activos y concentraciones ensayadas muestran. Las muestras positivas y negativas se incluyeron en este
fo
estudio. Las muestras positivas fueron probados cerca del límite de detección analítica de utilizar una cepa inactivada H37Rv rifampicina, susceptible y inactivado cepa resistente a
in
rifampicina TDR6 (E mutante sonda). Ambas cepas fueron probados en réplicas de 8. Las muestras negativas, que constan de la sustancia en ausencia de la cepa de MTB, fueron
probados por sustancia en réplicas de 8 para determinar el efecto sobre el rendimiento del control de procesamiento de la muestra (SPC). La inhibición de la MTB Ensayo Xpert /
ra
RIF se observó en presencia de lidocaína al 30%; mucina al 5% y 2,5%; El etambutol a 50 mg / ml, 25 mg / ml, y 10 mg / ml; Guaifenesina a 5 mg / ml; Fenilefrina en 100% y 50%;
pa
y aceite de árbol de té en 0,5% a 0,015%, resultando en un resultado falso negativo MTB NO DETECTADO o una Resistencia Rif INDETERMINADO resultado.
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 28. Las sustancias potencialmente interferentes en Xpert MTB Ensayo / RIF
Sustancia Descripción / Ingrediente Activo concentración Probado
La sangre (humana) 5% (v / v)
Enjuague bucal germicida El gluconato de clorhexidina (0,12%), solución al 20% 20% (v / v)
Los reactivos de procesamiento de muestras cloruro de cetilpiridinio, 1% en 2% de NaCl 0,5% (v / v) en 1% de NaCl
Los reactivos de procesamiento de muestras cloruro de cetilpiridinio, 1% en 2% NALC (v / v) 0,5% en 1% NALC
Los reactivos de procesamiento de muestras cloruro de cetilpiridinio, 1% en 2% NALC más 25 mM 0,5% (v / v) en 1% NALC plus
de citrato Citrato 12,5 mM
Ácido gástrico pH 3-4 solución en agua, se neutralizó con 100% (v / v)

bicarbonato de sodio
ADN / células humanas HELA 229 10 6 células / mL
antimicótico; Antibiótico
da
suspensión oral de nistatina, 20% 20% (v / v)
Glóbulos blancos (humanos) CMB / matriz de Pus (30% de capa leucocitaria; 30% de plasma; 100% (v / v)
la
40% PBS)
ro
Anestésicos (intubación La lidocaína HCl 4% 20% a 30% (v / v)
nt
endotraqueal)
co
soluciones de nebulización NaCl 5% (w / v) 5% (w / v)
mucina La mucina 5% (w / v) a 1,5% a 5% (w / v)

pi
Antibacteriano, sistémico Levofloxacino 25 mg / mL 5 mg / mL
co
Los corticosteroides nasales Fluticasona 500 mcg / aerosoles 5 mg / ml

a
un
Los broncodilatadores inhalados Sulfato de Albuterol 2,5 mg / 3 ml 50 mg / ml; 100 mg / ml
anestésicos orales Orajel (20% de benzocaína) 5% (w / v)

es
Los fármacos antivirales Acyclovir, IV 50 mg / mL 50 mg / ml

o
Antibióticos, pomada nasal Neosporin (400U bacitracina, neomicina 3,5 5% (w / v)

-N
mg, 5000U polimixina B)
Tabaco Nicogel (40% extracto de tabaco) 0.5% (w / v)

ón
Los medicamentos contra la tuberculosis 1 mg de estreptomicina / ml 25 mg / ml

i
ac
Los medicamentos contra la tuberculosis El etambutol 1 mg / mL 5 mg / ml a 50 mg / ml

rm
Los medicamentos contra la tuberculosis Isoniazida 1 mg / mL 50 mg / ml

fo
expectorantes orales La guaifenesina (400 mg / comprimido) 2,5 mg / mL; 5 mg / mL

in
Los medicamentos contra la tuberculosis Pirazinamida 10 mg / mL 100 mg / ml

ra
gel nasal (homeopático) gel de Zicam 50% (w / v)

pa
Aerosol nasal Fenilefrina 0,5% 25% a 100% (v / v)
1 mg rifampicina / ml 25 mg / ml
lo
Los medicamentos contra la tuberculosis

Só
medicina alivio de la alergia aceite de árbol de té (<5% cineol,> 35% Terpinen- 4-01) 0,008% a 0,5% (v / v)
(homeopático)
vacuna contra el virus de la gripe intranasal vacuna contra el virus de la gripe en vivo 5% (v / v)
Pneumocystis carinii La pentamidina medicamentos 300 ng / mL
broncodilatador La epinefrina (formulación inyectable) 1 mg / mL
tampón de neutralización de XPR- más ™ neutralizante Buffer > Fosfato 67 mM

Xpert ® MTB / RIF
15.5 de transferencia Se Estudio de Contaminación
Se realizó un estudio para demostrar que el potencial de arrastre y la contaminación cruzada no se produce cuando se utilizan los de uso único, autónomo Xpert MTB / RIF
cartuchos de ensayo. El estudio consistió en una muestra negativa procesada en el mismo módulo GeneXpert inmediatamente después de una muestra positiva muy alta que
contiene M. bovis BCG a una concentración de aproximadamente 1x10 6 UFC / ml en tampón de pinchos TET. Este programa de ensayos se repitió 20 veces en dos módulos
GeneXpert para un total de 42 carreras con reducción del 20 positivas y 22 muestras negativas. Todas las 20 muestras positivas se reportaron como correctamente MTB
detectado; La resistencia del Rif no se detecta y todas las 22 muestras negativas se informaron correctamente como MTB NO DETECTADO.
15.6 RIF Estudio Resistencia

Debido a la baja prevalencia de la resistencia RIF, un estudio no clínico adicional se llevó a cabo para evaluar el rendimiento del ensayo Xpert MTB / RIF para la detección de
mutaciones genéticas asociadas con la resistencia a RIF en bien caracterizado RIF aislados clínicos susceptibles y resistentes se dispararon en una piscina de esputo negativo
conocida MTB. Cincuenta partes alícuotas de negativos de esputo humanos MTB-negativo reunidas se entremezclan al azar para la prueba entre la sensibilidad y la especificidad de
positives.The el Xpert MTB / RIF Ensayo para la detección de mutaciones asociadas con la resistencia RIF, con respecto a las pruebas de sensibilidad a los medicamentos utilizando
Middlebrook agar métodos proporciones, eran el 97,7% (85/87) con IC del 95%: 92,0% -99,4%; y el 90,8% (89/98) con IC del 95%:
83,5% -95,1%, respectivamente.
De las 11 muestras con resultados discordantes RIF, secuenciación bidireccional era concordante con el MTB Xpert Ensayo / RIF en 10 de los 11 especímenes y
discordante con 1 de los 11 especímenes.
da
16. La reproducibilidad
la
ro
Reproducibilidad del ensayo MTB Xpert / RIF se evaluó en tres sitios utilizando muestras compuesto por cepas cultivadas de
nt
M. tuberculosis clavado en una piscina de esputo humano MTB-negativo. Las muestras se prepararon a niveles de concentración que representan positivo bajo (~ 1X LD) y
co
positiva moderada (2-3x LOD) para ambas cepas susceptibles y resistentes RIF RIF. los miembros del panel negativos también fueron incluidos, y se componen de esputo
humano agrupado MTB-negativo. Un panel de cinco muestras fue probado en cinco días diferentes por dos operadores diferentes tres veces por día en tres sitios (30 pruebas
a
en cada sitio = 2 operadores x 5 días x 3 repeticiones por día). Un lote kit de reactivos de la MTB Ensayo Xpert / RIF se utilizó en el estudio. El porcentaje de concordancia para
pi
cada miembro del panel es presentada por el sitio en la Tabla 29.
co
a
un
Tabla 29. Resumen de los resultados de reproducibilidad - Acuerdo por el sitio de estudio / Instrumento
es
Acuerdo total
Sitio 1 Sitio 2 Sitio 3 por%
o
Muestra (Infinito-80) (GeneXpert Dx) (Infinito-48) Muestra

-N
MTB / RIF resistentes 2-3x 100,0% 100,0% 100,0% 100,0%

ón
LdD (30/30) (30/30) (30/30) (90/90)
95,6%
i
MTB / RIF resistentes 1X 93,3% 96,7% 96,7%

ac
LdD (28/30) (29/30) (29/30) (86/90)

rm
MTB / RIF sensibles 2-3x 100,0% 100,0% 100,0% 100,0%

LdD (30/30) (30/30) (30/30) (90/90)
fo
in
MTB / RIF sensibles 1X 96,7% 100,0% 100,0% 98,9%

LdD (29/30) (30/30) (30/30) (89/90)
ra
100,0% 100,0% 100,0% 100,0%

pa
Negativo (89/89) un
(30/30) (29/29) (30/30)
lo
un Una muestra fue no determinada después de la prueba inicial y de la nueva prueba.

Só
La reproducibilidad del ensayo MTB Xpert / RIF también fue evaluado en términos de la señal de fluorescencia se expresa en valores de ciclo umbral (Ct) para cada objetivo
detectado. La media, la desviación estándar (SD), y el coeficiente de variación (CV) entre-sitio, el día de entre-, entre operador y dentro de una serie de componentes para
cada miembro del panel se presentan en la Tabla 30. Una carrera se define como las tres muestras miembro por cada panel de prueba por un operador en un sitio en un día.

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 30. Resumen de la reproducibilidad de datos un
operador
Acuerdo
Objetivo Entre el sitio Entre el día entre- Intraserial Total
Sonda /Numero
MTB / Conc total La media CV CV CV CV CV
RIF (LD) (%) Ct Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%)
90/90
POS / R 2-3x 26.23 0.19 0,7 0.09 0,4 0.00 0.0 1.36 5.2 1.37 5.2
(100)
86/90
POS / R 1X 27.13 0.00 0.0 0,78 2.9 0.00 0.0 1.74 6.4 1.91 7.0
(95,6)
90/90
UN POS / S 2-3x 25.89 0.00 0.0 0.38 1.5 0.00 0.0 1.43 5.5 1.48 5,7
(100)
89/90
POS / S 1X 27.25 0.00 0.0 0.00 0.0 0.36 1.3 1.28 4.7 1.33 4.9
(89,9)
89/89
NEG NEG N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A
(100)
90/90
POS / R 2-3x 38.41 0.26 0,7 0,72 1.9 0.00 0.0 1.59 4.1 1.76 4.6
da
(100)
86/90
la
POS / R 1X 38.47 0.00 0.0 0.82 2.1 0.16 0,4 1.68 4.4 1.88 4.9
(95,6)
ro
90/90
segundo POS / S 2-3x 27.01 0.00 0.0 0.33 1.2 0.00 0.0 1.42 5.3 1.46 5.4
nt
(100)
co
89/90
POS / S 1X 28.21 0.03 0,1 0.00 0.0 0.34 1.2 1.25 4.4 1.29 4.6
(89,9)
NEG NEG
89/89
N/A N/A N/A N/A a N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A
pi
(100)
co
90/90
POS / R 2-3x 26.52 0.21 0,8 0.00 0.0 0.00 0.0 1.30 4.9 1.31 4.9
(100)
a
86/90
POS / R 1X 27.37 0.00 0.0 0,79 2.9 0.00 0.0 1.66 6.1 1.84 6,7
un
(95,6)
90/90
do POS / S 2-3x 26.13 0.00 0.0 0.36 1.4 0.00 0.0 1.44 5.5 1.49 5,7
es
(100)
89/90
POS / S 1X 27.44 0.00 0.0 0.00 0.0 0.35 1.3 1.25 4.6 1.30 4.7
o
(89,9)
-N
89/89
(100)
ón
90/90
POS / R 2-3x 27.65 0.18 0,6 0.00 0.0 0.00 0.0 1.33 4.8 1.35 4.9
(100)
i
ac
86/90
POS / R 1X 28.51 0.00 0.0 0,81 2.9 0.00 0.0 1.63 5,7 1.82 6.4
(95,6)
rm
90/90
re POS / S 2-3x 27.35 0.00 0.0 0.36 1.3 0.00 0.0 1.36 5.0 1.41 5.2
(100)
fo
89/90
in
POS / S 1X 28.62 0.00 0.0 0.00 0.0 0.26 0,9 1.16 4.1 1.19 4.2
(89,9)
ra
89/89
(100)
pa
90/90
POS / R 2-3x 27.77 0.27 1.0 0.13 0,5 0.00 0.0 1.50 5.4 1.53 5.5
(100)
lo
86/90
Só
POS / R 1X 28.72 0.22 0,8 0,79 2.8 0.00 0.0 1.84 6.4 2.01 7.0
(95,6)
90/90
mi POS / S 2-3x 27.47 0.23 0,8 0.34 1.2 0.00 0.0 1.52 5.5 1.57 5,7
(100)
89/90
POS / S 1X 28.86 0.00 0.0 0.00 0.0 0.51 1.8 1.37 4.8 1.46 5.1
(89,9)
89/89
(100)
un Conc = concentración, Ct = ciclo umbral, CV = coeficiente de variación, LD = límite de detección, N = número, N / A = No aplicable para las muestras negativas, SD = desviación estándar; R
= resistente RIF; S = RIF susceptibles

Xpert ® MTB / RIF
17. Sistema Instrumental de precisión

Una en la casa estudio de precisión se llevó a cabo para comparar el rendimiento de la GeneXpert Dx y el Infinity-80 y sistemas de instrumentos utilizando muestras compuesto
por cepas cultivadas de M. tuberculosis clavado en una piscina de esputo humano MTB-negativo. Las muestras se prepararon a niveles de concentración que representan positivo
bajo (~ 1X LD) y positiva moderada (2-3x LOD) para ambas cepas susceptibles y resistentes RIF RIF. los miembros del panel negativos también fueron incluidos y se componen
de esputo humano MTB-negativo. Un panel de cinco muestras se ensayó en 12 días diferentes por dos operadores. Cada operador realizó cuatro carreras de cada muestra de
paneles por día en cada uno de los dos sistemas de instrumentos (96 ensayos a cada instrumento = 4 ensayos días x 12 x 2 operadores). Un lote de kits de reactivos del ensayo
MTB Xpert / RIF se utilizó para el estudio. El porcentaje de concordancia para cada miembro del panel es presentado por instrumento en la Tabla 31.
Tabla 31. Resumen de los Resultados instrumento de precisión; Acuerdo por ciento
Acuerdo
GeneXpert total% de la
Muestra dx Infinity-80 muestra
MTB / RIF resistentes 2-3x 100,0% 99,0% 99,5%

LdD (94/94) (95/96) (189/190) a, b
da
MTB / RIF resistentes 1X 97,9% 99,0% 98,4%
la
(189/192) do
LdD (94/96) (95/96)
ro
MTB / RIF sensibles 2-3x 100,0% 100,0% 100,0%
nt
LdD (96/96) (96/96) (192/192)
co
MTB / RIF sensibles 1X 91,6% 86,5% 89,0%
LdD (87/95) a (83/96) (170/191) anuncio
pi
99,0% 97,9% 98,4%
co
Negativo (189/192) mi
(95/96) (94/96)
un 2 MTB / RIF resistentes pos moderados y 1 MTB / RIF especímenes pos sensibles bajas eran no determinada por ensayo Xpert
a
un
MTB / RIF en inicial y repita la prueba. segundo 1 espécimen MTB NO DETECTADO.
do 2 muestras MTB NO DETECTADO y 1 espécimen MTB detectado; Resistencia Rif indeterminado.

es
re 17 especímenes MTB NO DETECTADO y 4 muestras MTB detectado; Resistencia Rif indeterminado.

o
-N
mi 3 muestras MTB detectado; La resistencia del Rif no se detecta.

ón
La precisión del ensayo MTB Xpert / RIF también fue evaluado en términos de la señal de fluorescencia se expresa en valores de Ct para cada objetivo detectado. La media, la
i
ac
desviación estándar (SD), y el coeficiente de variación (CV) entre-instrumento, entre los días, entre el operador y los componentes para cada miembro del panel dentro de la corrida
se presentan en la Tabla 32. Una carrera se define como los cuatro muestras por cada miembro del panel de prueba por un operador en un instrumento en un solo día.
rm
fo
in
ra
pa
lo
Só

Xpert ® MTB / RIF
Tabla 32. Resumen de los datos del instrumento de precisión un
Instrumento Entre- Los operadores

Acuerdo/
Objetivo entre- Día entre- Intraserial Total
Sonda Numero
MTB / Conc total La media CV CV CV CV CV
RIF (LD) (%) Ct Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%) Dakota del Sur (%)
189/190
POS / R 2-3x 25.52 0.00 0.0 0.62 2.4 0.00 0.0 1.23 4.8 1.37 5.4
(99.5)
189/192
POS / R 1X 27.03 0.00 0.0 0.00 0.0 0.59 2.2 1.36 5.0 1.48 5.5
(98.4)
192/192
UN POS / S 2-3x 25.43 0.23 0,9 0.41 1.6 0.00 0.0 1.28 5.0 1.36 5.4
(100)
170/191
POS / S 1X 27.44 0.00 0.0 1.24 4.5 1.16 4.2 1.79 6.5 2.46 9.0
(89.0)
189/192
(98.4)
189/190
POS / R 2-3x 37.45 0.00 0.0 0.00 0.0 0.00 0.0 2.00 5.3 2.00 5.3
da
(99.5)
189/192
la
POS / R 1X 38.06 0.00 0.0 0.00 0.0 0.66 1.7 1.76 4.6 1.88 4.9
(98.4)
ro
192/192
segundo POS / S 2-3x 26.44 0.30 1.1 0.25 0,9 0.00 0.0 1.31 5.0 1.37 5.2
nt
(100)
co
170/191
POS / S 1X 28.16 0.00 0.0 0.96 3.4 1.01 3.6 1.79 6.4 2.26 8.0
(89.0)
NEG NEG
189/192
N/A N/A N/A N/Aa N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A
pi
(98.4)
co
189/190
POS / R 2-3x 25.77 0.00 0.0 0.62 2.4 0.00 0.0 1.19 4.6 1.34 5.2
(99.5)
a
189/192
POS / R 1X 27.27 0.00 0.0 0.00 0.0 0.54 2.0 1.32 4.8 1.42 5.2
un
(98.4)
192/192
do POS / S 2-3x 25.63 0.23 0,9 0.36 1.4 0.00 0.0 1.29 5.0 1.36 5.3
es
(100)
170/191
POS / S 1X 27.62 0.00 0.0 1.01 3.6 1.09 4.0 2.06 7.4 2.54 9.2
o
(89.0)
-N
189/192
(98.4)
ón
189/190
POS / R 2-3x 27.00 0.00 0.0 0.57 2.1 0.00 0.0 1.17 4.3 1.30 4.8
(99.5)
i
ac
189/192
POS / R 1X 28.44 0.10 0,3 0.00 0.0 0.53 1.9 1.31 4.6 1.42 5.0
(98.4)
rm
192/192
re POS / S 2-3x 26.98 0.24 0,9 0.34 1.3 0.00 0.0 1.26 4.7 1.33 4.9
(100)
fo
170/191
in
POS / S 1X 28.79 0.00 0.0 1.22 4.2 1.11 3.8 1.64 5,7 2.33 8.1
(89.0)
ra
189/192
(98.4)
pa
189/190
POS / R 2-3x 28.84 0.00 0.0 0.61 2.3 0.00 0.0 1.20 4.5 1.35 5.0
(99.5)
lo
189/192
Só
POS / R 1X 28.44 0.00 0.0 0.00 0.0 0.63 2.2 1.38 4.8 1.52 5.3
(98.4)
192/192
mi POS / S 2-3x 26.89 0.18 0,7 0.42 1.6 0.00 0.0 1.31 4.9 1.39 5.2
(100)
170/191
POS / S 1X 28.86 0.00 0.0 1.41 4.9 0,81 2.8 1.74 6.0 2.38 8.2
(89.0)
189/192
(98.4)
un Conc = concentración, Ct = ciclo umbral, CV = coeficiente de variación, LD = límite de detección, N = número, N / A = No aplicable para las
muestras negativas, SD = desviación estándar; R = resistente RIF; S = RIF susceptibles

Xpert ® MTB / RIF
18. Referencias
1. Informe de la OMS de 2008. La tuberculosis (TB). http://www.who.int/tb/publications/global_report/2008/en/index.html
2. Informe de la OMS de 2011. http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/.
3. Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades. Tendencias en Tuberculosis, 2012. estadísticas http://www.cdc.gov/tb/publications/factsheets/~~number=plural / Trends.pdf.
4. Hoyert DL, muerto Xu J.: Los datos preliminares para 2011. Vital Statistics Reports Nacional. 2012; 61 (6); p. dieciséis.
5. Informó tuberculosis en los Estados Unidos, 2011. Atlanta, GA: Departamento de Salud y Servicios Humanos, CDC, Octubre 2012 US.
6. Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. Directrices para la prevención de la transmisión de Tuberculosis micobacteriana en
centros de atención de la salud, 2005. MMWR 2005; (. Sin RR-17) 54.
7. Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. Bioseguridad en laboratorios microbiológicos y biomédicos. Richmond JY y McKinney RW (eds) (1993).
número de publicación HHS (CDC) 93-8395.
8. Clinical and Laboratory Standards Institute. Protección trabajadores de laboratorio de infecciones adquiridas en el trabajo; Directriz aprobada. Documento
M29 (consulte la última edición).
da
9. Departamento de Salud y Servicios Humanos, Centros de Servicio de Salud Pública de Estados Unidos para el Control y Prevención de Enfermedades, los Institutos Nacionales de
Salud. 2009. Bioseguridad en laboratorios microbiológicos y biomédicos, 5ª Edición HHS Publication No. (CDC) 21-1112. Disponible a partir de:
la
http://www.cdc.gov/biosafety/publications/bmbl5/BMBL.pdf. Consultado el 14 de diciembre
ro
2012.
nt
10. Kent, PT, Kubica, GP, 1985. micobacteriología la salud pública: una guía para el laboratorio de nivel III. Departamento de Estado de Salud Pública y Servicios Humanos,
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Atlanta, GA.
11. Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. Resumen de las enfermedades de declaración obligatoria. MMWR.
a
pi
http://www.cdc.gov/mmwr/PDF/wk/mm6153.pdf
co
12. Consejo para mejorar la respuesta del brote transmitidas por los alimentos. El análisis de las autoridades legales del Estado.
http://www.cifor.us/documents/CIFORAnalysisStateLegalAuthorities.pdf.
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19. Sede Cefeidas Ubicaciones
Sedes corporativas Sede europea
Cepheid Cepheid Europe SAS Vira

904 Caribbean Drive Sunnyvale, CA Solelh 81470 Maurens-Scopont
94089 hasta 1189 EE.UU. Francia
Teléfono: +1 408.541.4191 Teléfono: +33 563 825 300
Fax: +1 408.541.4192 Fax: +33 563 825 301
www.cepheid.com www.cepheidinternational.com
20. Asistencia Técnica

Antes de llamar al servicio técnico Cepheid, recopilar la siguiente información:
• Nombre del producto
da
• Numero de lote
la
• número de serie del instrumento
ro
• Los mensajes de error (si los hay)
nt
• versión del software y, en su caso, número de etiqueta de servicio del ordenador
co
Región Teléfono a Email
pi
+ 1 888.838.3222
co
NOS TechSupport@cepheid.com
Francia + 33 563 825 319 Support@cepheideurope.com

a
un
Alemania + 49 69 710 480 480 Support@cepheideurope.com
Reino Unido + 44 3303 332 533 Support@cepheideurope.com

es
Sudáfrica + 27 861 22 76 35 Support@cepheideurope.com

o
Otros países de Europa, Oriente Medio y + 33 563 825 319

-N
Support@cepheideurope.com
África + 971 4 253 3218
+ 61 1800 107 884 Support@cepheideurope.com

ón
Australia, Nueva Zelanda
Otros países no mencionados anteriormente + 1 408.400.8495 TechSupport@cepheid.com

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La información de contacto para otras oficinas Cefeidas está disponible en nuestro sitio web en www.cepheid.com o bajo la
www.cepheidinternational.com APOYO lengüeta. Selecciona el Contáctenos opción.
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21. Tabla de Símbolos
Símbolo Sentido
IVD Numero de catalogo
REF En sanitario para diagnóstico in vitro
2 No vuelva a utilizar
MUCHO Código de lote
Consulte las instrucciones de uso
Precaución
Fabricante
da
Contenido suficiente para <n> pruebas
la
ro
CONTROLAR Controlar
nt
co
Fecha de caducidad
limitación de la temperatura
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pi
co
Los riesgos biológicos

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Líquido inflamable y vapor

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Provoca quemaduras en la piel y lesiones oculares graves

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904 Caribbean Drive Sunnyvale, CA

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94089 hasta 1189 EE.UU.

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Teléfono: +1.408.541.4191
Fax: +1.408.541.4192
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Copyright © Cepheid 2015. Todos los derechos reservados.

Sólo para uso diagnóstico in vitro.

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2. Nombre común o vulgar

recolección y el marco de tiempo entre la recolección de la muestra.

resistencia a otros medicamentos.

en laboratorios microbiológicos y biomédicos y las regulaciones estatales o locales aplicables.

Xpert ® MTB / RIF 1

garantizados en pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar.

cargas bajas organismo.

5. Principio del Procedimiento

de llenado tubo de PCR en el cartucho, la sonda integridad, y teñir la estabilidad.

cualquier par de sondas) de menos de 2,0.

• Resistencia Rif DETECTADO se informa si el delta Ct máximo es> 4,0.

2. el primer rpoB Ct valor es mayor que:

[(Ct máximo válido de la sonda en la condición 1) - (delta Ct máximo de corte de 4.0)].

2 Xpert ® MTB / RIF

6. Los reactivos e instrumentos

Cartuchos / RIF ensayo Xpert MTB con Tubos de reacción integrados 10

• 1 del talón (liofilizada) 2 de cada uno por cartucho

• Talón 2 (liofilizada) 2 de cada uno por cartucho

• EDTA (ácido etilendiaminotetraacético)

• Reactivo 2 4 ml por cartucho

• EDTA (ácido etilendiaminotetraacético)

Reactivo Muestra 8 ml por botella

Pipetas de transferencia desechables

discos compactos 1 por kit

• Instrucciones para importar ADF en el software GX

Xpert ® MTB / RIF 3

6.2 Almacenamiento y manipulación

• No utilizar los reactivos o cartuchos que han superado la fecha de caducidad.

caducidad de cuatro a bordo.

• No utilice los reactivos que se han vuelto turbia o descolorida.

6.3 Materiales necesarios pero no suministrados

muestras de esputo inducido o expectorado.

• No sustituya Xpert MTB / RIF reactivos de ensayo con otros reactivos.

• No utilice un cartucho si aparece mojada o si la junta de la tapa parece haberse roto.

• No utilice un cartucho que se ha caído o se ha sacudido.

• No utilice un cartucho que tiene un tubo de reacción dañado.

4 Xpert ® MTB / RIF

8. Recogida de muestras, transporte y almacenamiento

8.2 Almacenamiento y Transporte

9. Procedimiento de Ensayo (s)

9.1 Las muestras de sedimento de esputo concentrados

volvió a suspender para el Ensayo de MTB Xpert / RIF.

1. Use guantes desechables de protección.

Xpert ® MTB / RIF 5

Nota Un movimiento hacia atrás y hacia adelante es una sola sacudida.

6. Incubar la muestra para un total de 15 minutos a 20-30 ° C.

9.2 Las muestras de esputo primas

1. Use guantes desechables de protección.

Figura 1. La escritura en el cartucho con un marcador permanente

Figura 2. La apertura del contenedor de muestras

6 Xpert ® MTB / RIF

5. Vuelva a colocar y asegurar la tapa. a

Nota Un movimiento hacia atrás y hacia adelante es una sola sacudida.

7. Incubar la muestra para un total de 15 minutos a 20-30 ° C.

9.3 Preparación del cartucho