Estructura y Función de Las Proteínas
Estructura y Función de Las Proteínas
Estructura y Función de Las Proteínas
α-hélice: Los grupos del N-H en la espina dorsal forman una ligazón de
hidrógeno con el grupo de C=O del aminoácido 4 residuos anterior en la hélice.
hoja β-plisada: Grupos del N-H en la espina dorsal de las ligazones de un del
cabo hidrógeno de la forma con los grupos de C=O en la espina dorsal de un
cabo completo extendido al lado de él.
Estructura terciaria
La estructura terciaria de proteínas refiere a la forma tridimensional total, después de
las acciones recíprocas secundarias. Éstos incluyen la influencia de los grupos
polares, no polares, ácidos, y básicos de R que existen en la proteína.
Proteína cuaternaria
La estructura cuaternaria de la proteína refiere a la orientación y a la ordenación de
subunidades en proteínas con las multi-subunidades. Esto es solamente relevante
para las proteínas con las cadenas múltiples del polipéptido.
Las proteínas se pliegan en formas específicas según la serie de aminoácidos en el
polímero, y la función de la proteína se relaciona directamente con la estructura
resultante 3D. Las proteínas pueden desarrollar las funciones que no eran posibles en
la proteína independiente, tal como realización de la réplica de la DNA y de la
transmisión de las señales de la célula.
Funciones de la proteína
Las proteínas desempeñan un papel importante en muchos procesos biológicos y
funciones cruciales. Son muy versátiles y tienen muchas diversas funciones en la
carrocería, según lo enlistado abajo:
Mioglobina
Es una proteína monomérica transportadora de oxígeno que se encuentra en el interior
de las células, más abundante en las células musculares (le confiere el color pardo
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rojizo al músculo), y su función es la de captar el oxígeno procedente de la sangre y
cedérselo a la mitocondria, donde es utilizado en la respiración celular.
La mioglobina es una proteína conjugada formada por una parte proteica, la globina, y
un grupo prostético, el grupo hemo.
La parte proteica está constituida por una única cadena peptídica con estructura
secundaria en hélice alfa, formada por 153 residuos de aminoácidos, que se disponen
en 8 segmentos de distinto tamaño, con entre 7 y 26 residuos de aminoácidos cada
uno. Estos segmentos están separados por “codos” formados por aminoácidos
incompatibles con la estructura en hélice alfa. Estos segmentos con estructura
secundaria en hélice alfa se pliegan a su vez en el espacio, dando origen a la
estructura terciaria de esta proteína, que es globular.
Como es habitual en las proteínas globulares, los aminoácidos con grupo R polar
están situados en la parte externa de la proteína, menos 2 restos de histidina que, por
ser necesarios para la actividad de esta proteína, están situados en el interior.
El grupo prostético está constituido por un grupo hemo, formado a su vez por una
parte orgánica, la protoporfirina IX, y una inorgánica, un átomo de hierro (Fe).
La protoporfirina IX: está formada por 4 anillos pirrólicos unidos entre sí por 4
puentes meténicos, originando un anillo tetrapirrólico o porfirina (anillo formado
por la unión de los 4 anillos pirrólicos). Esta estructura se caracteriza por la
presencia de dobles enlaces alternos. Este anillo tetrapirrólico posee 8 sitios de
sustitución a los que se unen 8 grupos funcionales que son: 4 grupos metilo (-
CH3 (1, 3, 5,8)); 2 grupos vinilo (-CH=CH 2 (2,4)) y 2 grupos propionato (-CH 2-
CH2-COO- (6,7)) formando la protoporfirina. Estos grupos se pueden disponer
en 15 configuraciones distintas, de las cuales la que se encuentra en el grupo
hemo es la protoporfirina IX.
El átomo de hierro, en su forma ferrosa, puede establecer 6 enlaces de
coordinación que se disponen en una distribución octaédrica, con los 6 enlaces
dirigidos hacia los 6 vértices del octaedro. El átomo de hierro se sitúa en el
centro del anillo complejo de la protoporfirina y establece 4 de esos enlaces
con los 4 nitrógenos centrales de los 4 anillos pirrólicos, dos covalentes y dos
coordinados. Los dos enlaces restantes están orientados verticalmente al plano
de la protoporfirina, cada uno de ellos a un lado. Uno de estos se establece con
un resto de histidina de la cadena peptídica, concretamente con la histidina F-8
(resto 8ª de la hélice-alfa F), y este va a ser el punto de anclaje del grupo hemo
a la cadena peptídica; esta histidina F-8 se llama también histidina proximal. El
otro enlace es el punto de unión para el oxígeno, y, por tanto, únicamente se
formará cuando el oxígeno se una al grupo hemo. Cerca de este enlace de
unión al oxígeno hay otro resto de histidina de la cadena peptídica, que no
forma enlace ni con el grupo hemo ni con el oxígeno, es la histidina E-7 ó
histidina distal, que por su proximidad genera un entorno molecular que hace
que la unión del oxígeno con el hierro sea una unión más débil y no
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permanente, que se puede formar y romper, lo cual permite a estas proteínas
transportar el oxígeno (lo captan y luego lo liberan).
El grupo hemo está situado en una hendidura de naturaleza hidrofóbica de la
estructura terciaria de la proteína.
Hemoglobina
La hemoglobina es una proteína oligomérica encargada del transporte de oxígeno
desde los pulmones hasta los diferentes tejidos a través de la sangre. Se encuentra en
el interior de unas células especializadas que son los eritrocitos (hematíes o glóbulos
rojos). Es una proteína de color rojo, y es precisamente la hemoglobina la que le da el
color a estas células y a la sangre. La hemoglobina es una proteína conjugada con
una parte proteica que es la globina y un grupo prostético que es el grupo hemo.
La parte proteica está formada por 4 cadenas peptídicas que no son iguales entre sí,
hay dos cadenas de tipo alfa (α) y dos cadenas de tipo beta (β), siendo, por tanto, una
proteína heterotetramérica (compuesta por 4 subunidades que no son iguales entre
sí). Las cadenas alfa están formadas por 141 restos de aminoácidos y las cadenas
beta por 146. La estructura secundaria y terciaria de estas cadenas es muy similar
entre ellas y parecida a la de la mioglobina. Además, la hemoglobina como proteína
oligomérica, tiene estructura cuaternaria.
El grupo prostético está formado por cuatro grupos hemo, que son iguales al de la
mioglobina, y que están situados y unidos a sus correspondientes cadenas peptídicas
de igual forma que en la mioglobina. La estructura cuaternaria de la hemoglobina
consiste en la ordenación espacial de las cuatro cadenas proteicas con sus
correspondientes grupos hemo. Las 4 subunidades adquieren una disposición
tetraédrica en el espacio, de manera que si unimos por líneas imaginarias los centros
de las 4 subunidades, la figura resultante formará un tetraedro. Podemos imaginarnos
algo similar si tomamos 4 esferas y colocamos dos de ellas abajo, una al lado de la
otra, y las otras dos esferas encima de estas, una delante de la otra.
En la estructura cuaternaria de la hemoglobina se forman dos bloques, cada uno de
ellos constituido por la unión de una subunidad alfa y una beta, que son el bloque
alfa1-beta1 y bloque alfa2-beta-2, los dos bloques son iguales entre sí. La unión entre
los dos bloques no es perfecta, de forma que queda un canal en el centro de la
molécula de hemoglobina que es importante para su función.
La unión entre las subunidades se hace principalmente mediante interacciones
hidrofóbicas y también por enlaces iónicos (salinos) entre grupos con cargas opuestas.
En esta estructura cuaternaria los grupos hemo de las 4 subunidades quedan
dispuestos también de forma simétrica y con el mayor alejamiento posible entre ellos.
Fijación del oxígeno a la mioglobina y hemoglobina.
Las dos son proteínas transportadoras de oxígeno, el cual se une al grupo hemo,
estando esta unión modulada por la proximidad molecular de una histidina distal. La
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principal diferencia es que la mioglobina es una proteína monomérica y la hemoglobina
es oligomérica, esto hace que su actividad biológica sea muy diferente.
Curva de saturación de oxígeno.
La curva de saturación de oxigeno de una proteína es la representación gráfica del
porcentaje de saturación de oxígeno de la proteína (%) en función de la presión parcial
de oxígeno (PPO2) presente en el medio (expresada en mm de Hg). El porcentaje de
saturación oscila entre el 0% y el 100% y representa la cantidad de oxígeno unido a
las moléculas de la proteína en función de la cantidad máxima de oxígeno que se le
puede unir (100%). La presión parcial de oxígeno (PPO 2) se mide en mm de Hg. En el
aire la presión es de 760 mm de Hg, pero el oxígeno constituye aproximadamente el
21% de la mezcla de gases que constituyen el aire, por lo que su presión parcial será
de, aproximadamente, 159 mm de Hg en el aire (760 · 21% = 159).
En los pulmones la PPO2 es más baja debido a que parte del oxígeno es captado por
los capilares de los alvéolos, y además, en los pulmones hay gran cantidad de vapor
de agua, por lo que la PPO2 en los pulmones es de, aproximadamente, 100 mm de Hg.
La PPO2 en los tejidos es de alrededor de 26 mm de Hg. Cuando aumenta la actividad
del tejido, aumenta el consumo de oxígeno y, por tanto, disminuye la PPO 2, mientras
que, por el contrario, la PPO2 aumenta en los periodos de mayor reposo.
Curva de saturación de oxígeno de la mioglobina: La mioglobina muestra una curva de
saturación hiperbólica, lo que indica que la mioglobina tiene una gran afinidad por
unirse al oxígeno, ya que bastan PPO 2 muy bajas para que la mioglobina alcance
importantes valores de saturación; por poco oxígeno que haya en el medio la
mioglobina lo capta, es decir, que tiene una gran tendencia a unirse al oxígeno. Basta
una PPO2 de 1-2 mm de Hg para que la mioglobina se sature en más del 50%.
En los tejidos, una PPO2 de 26 mm de Hg hace que la mioglobina se sature en más
del 98%. La gran afinidad por el oxígeno que muestra la mioglobina es importante para
su función biológica: captar para la célula el oxígeno que aporta la hemoglobina de la
sangre. Curva de saturación de oxígeno de la hemoglobina: La hemoglobina muestra
una curva de saturación sigmoidea (forma de s) lo que nos indica que la afinidad de la
hemoglobina por el oxígeno va variando conforme aumenta la PPO 2, y, por tanto, la
afinidad de la hemoglobina por el oxígeno depende de la PPO2 que haya en el medio
en cada momento.
En la primera zona de la curva, que corresponde a bajas PPO 2, la curva tiene una
pendiente muy baja, por lo que un aumento importante de la PPO 2 en esta zona
produce sólo un pequeño incremento en el porcentaje de saturación de la
hemoglobina. Es decir, para bajas PPO 2 la hemoglobina muestra poca afinidad por el
oxígeno. Al ir aumentando la PPO2 aumenta considerablemente la pendiente de la
curva y, por tanto, la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno. Este comportamiento
se debe a un fenómeno denominado cooperatividad positiva. La cooperatividad es
propia de un grupo de proteínas que son las proteínas alostéricas que son un grupo
especial de proteínas oligoméricas, entre las que se encuentra la hemoglobina.
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La cooperatividad positiva significa que cuando una molécula de oxígeno se une a una
subunidad de la hemoglobina transmite información a las otras subunidades y las otras
subunidades responden a esta información aumentando su afinidad por unirse al
oxígeno, aumentando así la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno conforme se
van uniendo a éste. La afinidad de unión por la 4ª molécula de oxígeno es de 300 a
500 veces superior a la afinidad por la 1ª molécula, y este comportamiento lo puede
hacer la hemoglobina por ser una proteína oligomérica y no lo puede tener la
mioglobina que posee una única cadena peptídica.
Transporte de oxígeno por la hemoglobina y la mioglobina.
En los pulmones hay una alta PPO2 (aprox. 100 mm de Hg), por lo que la
hemoglobina se satura en, aproximadamente, un 96%, y cuando llega a los tejidos,
donde la PPO2 es más baja (aprox. 26 mm de Hg de media, variando según el estado
de actividad del tejido), la hemoglobina sólo libera un tercio del oxígeno que lleva. Si la
hemoglobina se descargara totalmente en los tejidos, luego le costaría mucho volver a
cargarse debido a la baja afinidad que muestra por la primera molécula de oxígeno.
Por tanto, la cantidad de oxígeno que libera la hemoglobina depende de la PPO2 en
los tejidos. Los tejidos, en momentos de mayor actividad, consumen más oxígeno, lo
que provoca que localmente baje la PPO2, por lo que la cantidad de oxígeno liberado
por la hemoglobina en ese tejido debe ser mayor.
Los tejidos en reposo consumen menos oxígeno, por lo que su PPO 2 es mayor y, por
tanto, la hemoglobina libera menos oxígeno, porque detecta que ese tejido en ese
momento necesita menos oxígeno. Si la proteína de transporte de oxígeno en la
sangre fuese la mioglobina, al mostrar una curva hiperbólica de saturación, entre la
PPO2 de los pulmones y la de los tejidos sólo liberaría un 2-3% del oxígeno que
transporta, debido a que no muestra cooperatividad positiva y por tanto no sería nada
efectiva en esta función, sería necesaria que la PPO2 en los tejidos fuese
excesivamente baja, asfixia tisular, para que liberase una cantidad apreciable de
oxígeno. La función biológica de la mioglobina no es el transporte sanguíneo del
oxígeno, sino captar el oxígeno para las células, lo que esta facilitado por su alta
afinidad. Sea cual sea la PPO2 en los tejidos, la mioglobina lo capta de forma efectiva.
Importancia Biomédica
Las proteínas son macromoléculas complejas desde los puntos de vista físico y
funcional, que desempeñan múltiples funciones de importancia crucial. Por ejemplo,
una red de proteína interna, el citoesqueleto, mantiene la forma y la integridad física
celulares. Filamentos de actina y miosina forman la maquinaria contráctil del músculo.
La hemoglobina transporta oxígeno, mientras que los anticuerpos circulantes
defienden contra invasores extraños. Las enzimas catalizan reacciones que generan
energía, sintetizan biomoléculas y las degradan, replican genes y los transcriben,
procesan mRNA (ácido ribonucleico mensajero), entre otras funciones. Los receptores
permiten a las células detectar hormonas y otros indicios ambientales, así como
mostrar respuesta a los mismos. Las proteínas están sujetas a cambios físicos y
funcionales que reflejan el ciclo de vida de los organismos en los cuales residen. Una
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proteína típica “nace” en el momento de la traducción, madura a través de eventos de
procesamiento postraduccional, como proteólisis selectiva, alterna entre estados de
trabajo y de reposo por medio de la intervención de factores reguladores (capítulo 9),
envejece por oxidación, desamidación, etc., y muere cuando se degrada hacia los
aminoácidos que la componen. Un objetivo importante de la medicina molecular es la
identificación de biomarcadores como proteínas y la modificación de proteínas cuya
presencia, ausencia o deficiencia se relaciona con estados fisiológicos o
enfermedades específicos
En la Naturaleza, la forma sigue a la función. Para que un polipéptido recién
sintetizado madure hacia una proteína que sea funcional desde el punto de vista
biológico, capaz de catalizar una reacción metabólica, impulsar el movimiento celular,
o formar las varillas y los cables macromoleculares que proporcionan integridad
estructural a pelo, huesos, tendones y dientes, debe plegarse hacia una disposición
tridimensional específica, conocida como conformación. Además, durante la
maduración, las modificaciones postraduccionales pueden añadir nuevos grupos
químicos o eliminar segmentos peptídicos transitoriamente necesarios. Las
deficiencias genéticas o nutricionales que obstaculizan la maduración de proteínas son
nocivas para la salud. Algunos ejemplos de las primeras comprenden enfermedad de
Creutzfeldt-Jakob, encefalopatía espongiforme ovina (scrapie) y bovina (“enfermedad
de las vacas locas”) y enfermedad de Alzheimer. Algunos ejemplos de ello incluyen al
escorbuto (ácido ascórbico) y el síndrome de Menkes (Cu). La nueva generación de
agentes terapéuticos para hepatitis C y otras enfermedades virales busca bloquear la
maduración de las proteínas codificadas viralmente mediante inhibir la actividad de las
ciclofilinas —una familia de isomerasas peptidilproteínas cis-trans—.
La hemoglobina y la mioglobina ilustran tanto relaciones entre estructura y función de
proteína, como la base molecular de trastornos genéticos, como la enfermedad de
células falciformes y las talasemias. El cianuro y el monóxido de carbono matan
porque alteran la función fisiológica de las proteínas en citocromo oxidasa y
hemoglobina, respectivamente.
Bibliografía
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