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U6 Acidos Nucleicos

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ÁCIDOS NUCLEICOS

 Macromoléculas
 Monómero: nucleótidos (DNA, RNA) polares
 DNA: almacenamiento y transmisión de información genética en células, RNA:
funciones estructurales y catalíticas.

DNA RNA
2’-desoxi-D-ribosa D-Ribosa
C2’ H C2’ grupo OH
Timina Uracilo
G***C G***C
A=T A=U
Del lado 5’ hay grupo PO4 Del lado 5’ hay grupo PO4
Del lado 3’ grupo OH Del lado 3’ grupo OH
Bicatenario Monocatenario

NUCLEOTIDOS
- Pentosa (ribosa/ desoxirribosa)+base nitrogenada(purinas/pirimidinas)+PO4
- Nucleótidos sucesivos unidos por enlaces fosfodiéster
- Polares: extremo 5’ con grupo PO4 y extremo 3’ grupo OH
- Purinas dos anillos // pirimidinas un anillo
- Síntesis de cadena de 5’ a 3’ (polaridad +)
- PO4 en carbono 5’y base nitrogenada en carbono 1’
- Nucleósido: molécula de pentosa y base nitrogenada, sin el grupo PO4
- Combinación diferente de nucleótidos da lugar a diferentes genes y luego a
proteínas .

Nucleótido:”-ilato”
Nucleosido: “-idina”

PURINAS PIRIMIDINAS
Adenina (A) Citosina (C)
Guanina (G) Uracilo (U) (RNA)
Timina (T) (DNA)
grupo CH3

Bases secundarias
- Formas metiladas
- Formas hidroximetiladas (DNA vírico)
- Formas glicosiladas (DNA vírico)
- Regulación y protección del material genético
- Genes metilados están apagados por presencia de CH3 en DNA
- Célula inicial totipotencial casi todo está desmetilado, conforme los genes se van
especializando se van metilando

BASES PURINICAS Y PURIMIDINICAS SECUNDARIAS

POCO ABUNDANTES EN POCO ABUNDANTES EN


DNA RNA
5-metilcitidina Inosina
N6-metiladenosina Pseudouridina
N2-metilguanosina 7-metiñguanosina
5 hidroximetilcitidina 4-tiouridina

ESTRUCTURA DEL DNA


 Cadenas complementarias
 Doble hélice dextrógira
 Cadenas antiparalelas
 GC y AT
 Diámetro 20 Armstrong
 Cada giro mide 36 Armstrong
 Entre base y base 3.4 Armstrong de distancia
 10.5 pares de bases por vuelta
 DNA tipo A y Z
 No se forma de novo, se usa un “molde”
 Surco mayor y menos permite unión de proteínas durante replicación y
transcripción
 DNA parental: cadena de molde
 Cadena hija: cadena sintetizada por DNA polimerasa
a partir de DNA parental
 Palíndromos en DNA: misma secuencia si se lee de
5’ a 3’ y de 3’ a 5’// Repetición especular: Repetición
en espejo. Controlan la replicación, reparación del
DNA , recombinación y transcripción

FORMA A FORMA FORMA Z


B
DONDE ESTÁN In vitro. En soluciones Natural Regiones cortas del DNA
pobres en H2O de procariotas y
eucariotas
SENTIDO DE LA Dextrógiro Dextrógiro Levógiro
HÉLICE
DIÁMETRO 26 Å 20 Å 18 Å
PARES DE BASES 11 10.5 10
POR VUELTA DE
HÉLICE

Topoisomerasa=girasa
DNA SUPERENROLLADO
en bacterias
- Cuando un DNA se vuelve a retorcer y se vuelve a enrollar
- Enrollamiento – (desenrollado // tiene menos vueltas de lo normal)
- Superenrollado + (retorcido excesivamente)
- Durante replicación y transcripción e DNA se abre
- Topoisomerasas: enzimas que relajan el material genético aumentando o
disminuyendo el grado de subenrollamiento.
o Topoisomerasas tipo I y III: Rompen una cadena. Replicación y
transcripción.
o Topoisomerasas tipo II α y β: Rompen las dos. Desenreda las moléculas de
DNA antes que los cromosomas puedan separarse durante la mitosis.
o La rotura del enlace fosfodiéster se vuelve a reparar
o Doxorrubicina y etopósido: afectan la actividad de las topoisomerasas de
tipo II. Afecta la separación de las cadenas. Terapia contra el cáncer.
SECUENCIA DE NUCLEOTIDOS DE DNA
1. Secuencia repetida
a) Altamente repetida (1-10%)
o DNA satélite (5-500 pb. Forman grupos con mil millones de pb que
aparecen rápido en el transcurso de la evolución. En centrómero y
telómero)
o DNA minisatélite (10-100pb. Forman grupos de 1000-3000pd de
repeticiones. Son inestables y pueden aumentar o disminuir de
generación en generación. Pruebas de paternidad. Huella genómica.
Polimórfico e inestables por entrecruzamiento desigual)
o DNA microsatélite (1-9pb. Forman grupos de 100pb o menos copias
repetidas. Esparcidas de forma uniforme)
b) Moderadamente repetida
o DNA codificador Secuencias Tándem:
o DNA no codificador: DNA saltarín. Secuencias en grupos sin
 LINE: Secuencias largas interrupción.
 SINE: Secuencias cortas
2. Secuencias únicas (no repetidas): Región genómica que originan proteínas.
Mezcladas con intrones y exones. 1.5-2%
Perdida de la estructura: Desnaturalización del DNA (separación de cadenas a alta
temperatura)
Estructura correcta: Renaturalización del DNA (integración de las cadenas a bajas
temperaturas). Las secuencias altamente repetidas son la primeras en unirse por puentes de
H, liego las moderadamente repetidas y al final las o repetidas.

SECUENCIAS ALTAMENTE REPETIDAS Secuencia no traducidas del lado 5’ (no


codifica) y 3’ (codificante) es UTR
 DNA microsatélite
 Trinucleótidos repetidos CCG/ CAG
 Trastornos tipo I: Anomalías neurodegenerativas del Trinucleótidos CAG de las
porciones codificantes del gen
 Trastorno tipo II: Expansión de una variedad de Trinucleótidos CAG, CCG, CGG y
se presentan en una parte del gen que no codifica aa

TRASTORNO TIPO I

Agregado de huntingtina mutante y se agregan proteínas parecidas a la misma pero


que son parecidas y les quita su función
TRASTORNO TIPO II

Está en gen pero no se puede leer por la metilación


Produce una proteína llamada FMRP (fragile x mental retardation 1 protein) que
participa en el transporte del mRNA del núcleo a las dendritas
Regula la síntesis proteica en la sinapsis
SECUENCIAS MODERADAMENTE REPETIDAS
A) Secuencias codificadora
B) Secuencia no codificadora: DNA con movimiento (SINE -Alu- y LINE-L1-)
Gemeradas por los mecanismos de tranposición y retrotransposición
TRANSPOSONES
 DNA que se mueve desde un lugar del genoma a otro
 Codifican a una transposasa que divide un transposón desde un sitio del DNA
donante y su inserción en un sitio del DNA blanco
 Corta y pega
 2 transposasas. Una corta del lado 5’ y otra del 3’ e insertan otro lugar
 Ocurre más en bacterias
RETROTRANSPOSONES
 Copia e inserta
 En células eucariotas
 Transcripción de información genética en forma de RNA por una RNA polimersa
 De RNA pasa a ser DNA (retro-transcripción) por una transcriptasa inversa
SECUENCIAS NO REPETDIAS
 Contiene la mayor parte de la información genética
 Intrones: regiones que están en el DNA, pero no se traducen
 Exones: secuencias del DNA que si se traducen. Su unión da información para
codificar una proteina

CROMOSOMAS

 Interfase: Cromosoma interfásico. Dispersos


 Fase S: Duplicación y empaquetamiento del cromosoma.
 Fase M: Cromosomas mitóticos. Compactado

DNA LINEAL tiene 3 estructuras


Telómeros: Uno en cada extremo. Reloj biológico que define cuanto tiempo vive una
célula. Disminuyen de tamaño con la edad y cada vez que se replica. Embriones y Ca con
alta actividad telomerasa. Cuando se acorta completamente la célula muere. Protege al
DNA de ataques de nucleasas o desestabilizantes. Evita la fusión entre DNA’s. Telomerasa
hace que se mantenga largo. TTAGGG.
Centrómeros: Sitio de constricción. Unión de los mt para luego poder dividirlos. Sitio de
constricción. Secuencia en tándem de 171 pb (satélite a). Brazo largo (P) Brazo corto (Q).
Tiene histona H3 se llama CENP-A que empaqueta el DNA alfa y formar el cinetocoro
Orígenes de replicación: Empieza la transcripción
EMPAQUETAMIENTO DE CROMOSOMAS
 DNA humano mide 2m
 22 cromosomas y 1 cromosoma XY (2n) Par sexual 23
 1x1014 células
 Cromatina: Conjunto de proteínas que componen en DNA
 23 cromosomas diferentes en mujeres y 24 cromosomas diferentes en hombres
 Histonas (4 tipos: H2A, H2B, H3 activa la transcripción y H4) y proteínas no
histónicas (topoisomerasas, p. de andamiaje) empaquetan el DNA
 Histona H1 es histona de unión
 Histonas ricas en arginina y lisina
 Nucleosoma: nivel mínimo de organización cromosómica formado por histonas
 147 nucleótidos de DNA se unen al octámero de histonas

HETEROCROMATINA EUCROMATINA
Menos condensada Condensada
 Heterocromatina constitutiva: esta condensada Transcripcionalmente activa
todo el tiempo y no se puede leer
Frecuencias altamente repetidas
Bloquea los efectos de transposición
translocación
Evita que se disperse
 Heterocromatina facultativa: se puede
descondesar en algún momento y se va a poder
leer
Asegura que las células de hembras y machos
tengan el mismo numero de cromosomas X
activos (inactivación de 1 cromosoma X y pasa a
ser constitutiva)

HETEROCROMATINA
Modificación de las colas N-terminal d de las histonas
Epigenética: Modificaciones sobre el gen sin modificar el DNA. Modificación reversible de
las colas de histonas (cromatina).
Herencia genética: Cambio en la secuencia del DNA

- Acetilación (Lys)->activación genética. En histonas H3 (acetilación en Lys 9


hay una activación) o H4 (Lys 16 y 20 activación)
- Metilación (Arg o Lys)-> desactivación genética (no siempre)
- Fosforilación (Ser)

Des acetiltransferasas de histonas (HDAC): quitan acetilos


Acetiltransferasas de histonas (HAT): agregan acetilos
Desmetalizas de histonas: quitan metilos
Metiltransferasas (metilasas) de histonas: agregan metilos
Después de la metilación se agrega una proteína HP1 que hace que se compacte
completamente el gen y no se puede leer
La metilación de la Lys 9 de h3 tiene un papel clave en la formación de
heterocromatina facultativa (inactivación del cromosoma X)

ABERRACIONES CROMOSÓMICAS
Alteraciones mayores de los cromosomas que ocurren durante la divisó celular.
 Inversión: rotura de un cromosoma y los segmentos entre las roturas se unen en los
cromosomas en orientación inversa. Anafase meiótica.
 Translocación: Cuando todo o una parte de un cromosoma de une a otro.
Cromosoma 22 (Philadelphia) translocado en el cromosoma 9. Se cree que el
cromosoma humano 2 se formo a partir de la translocación de 2 cromosomas de un
orangután y un chimpancé.
 Deleción: Cuando se pierde un pedazo del cromosoma. Sx de cri-du-chat (sx del
maullido del gato).
 Duplicación: Cuando la porción de un cromosoma se repite. Puede ocurrir a
diferentes niveles, causado por un entrecruzamiento desigual. Durante meiosis
causando duplicación génica (puede inducir a la aparición de isoformas
adicionales). Pseudogenes: homologo un gen que ya tenemos, pero con el tiempo
tuvieron mutaciones que ya son inactivas, pero los ancestros si los usaron.

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