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    Ses08 Sem04 PRA Técnicas para El Análisis de Las Proteínas

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    Graciela Alvarez V.C
    Este documento presenta una sesión práctica sobre técnicas para el análisis de proteínas. Los resultados de aprendizaje son que los estudiantes conocerán las principales técnicas para el análisis de proteínas y aprenderán a utilizar herramientas bioinformáticas relacionadas a través de un taller. La sesión cubre temas como obtener muestras de proteínas, herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de aminoácidos, y ejemplos de uso de herramientas como

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    Ses08 Sem04 PRA Técnicas para El Análisis de Las Proteínas

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    Graciela Alvarez V.C
    9 vistas19 páginas
    Este documento presenta una sesión práctica sobre técnicas para el análisis de proteínas. Los resultados de aprendizaje son que los estudiantes conocerán las principales técnicas para el análisis de proteínas y aprenderán a utilizar herramientas bioinformáticas relacionadas a través de un taller. La sesión cubre temas como obtener muestras de proteínas, herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de aminoácidos, y ejemplos de uso de herramientas como

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    Ses08 Sem04 PRA Técnicas para el análisis de las proteínas

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    Este documento presenta una sesión práctica sobre técnicas para el análisis de proteínas. Los resultados de aprendizaje son que los estudiantes conocerán las principales técnicas para el análisis de proteínas y aprenderán a utilizar herramientas bioinformáticas relacionadas a través de un taller. La sesión cubre temas como obtener muestras de proteínas, herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de aminoácidos, y ejemplos de uso de herramientas como

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    Ses08 Sem04 PRA Técnicas para El Análisis de Las Proteínas

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    Graciela Alvarez V.C
    Este documento presenta una sesión práctica sobre técnicas para el análisis de proteínas. Los resultados de aprendizaje son que los estudiantes conocerán las principales técnicas para el análisis de proteínas y aprenderán a utilizar herramientas bioinformáticas relacionadas a través de un taller. La sesión cubre temas como obtener muestras de proteínas, herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de aminoácidos, y ejemplos de uso de herramientas como

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    de 19

    Sesión práctica:

    Técnicas para el análisis


    de las proteínas
    Semana 3
    Sesión 8
    Resultados de aprendizaje:
    Al término de la sesión, el estudiante conoce las principales
    técnicas para el análisis de las proteínas y aprenderá a utilizar
    herramientas bioinformáticas relacionadas, mediante un taller.
    SECCIÓN DE REFERENCIA

    REFLEXIÓN DESDE LA EXPERIENCIA


    ¿De dónde sacamos muestras de
    proteínas?
    Análisis de proteínas
    Herramientas
    bioinformáticas para el
    análisis de secuencias de
    aminoácidos
    Ejemplo: Gen de la
    RNAse en vaca
    Elegimos la opción Gene
    y digitamos, por ejemplo,
    “Rnase A Bos Taurus”

    Activamos esto
    Elegimos la primera opción
    Información sobre el gen
    Bajamos hasta la zona Secuencias
    de referencia y elegimos el mRNA
    Recuperamos la secuencia del ARNm
    del gen
    Secuencia del ARNm del gen en formato
    Fasta
    >NM_001014386.4 Bos taurus ribonuclease, RNase A family, 1
    (pancreatic) (RNASE1), mRNA
    GCAGAAACTGCCTTCTCTCTCTCAGACATCAAACTAGAGACCCAGGTTTCTCCAGGGGAGTGCGGTCATC
    ATGGCTCTGAAGTCCCTGGTCCTGTTGTCGCTGTTGGTCCTGGTGCTGCTGCTGGTGCGGGTCCAGCCTT
    CCCTGGGCAAGGAAACTGCAGCAGCCAAGTTTGAGCGGCAGCACATGGACTCCAGCACTTCCGCTGCCAG
    CAGCTCCAACTACTGTAACCAGATGATGAAGAGCCGGAACCTGACCAAAGATCGATGCAAGCCAGTGAAC
    ACCTTTGTGCACGAGTCCCTGGCTGATGTCCAGGCCGTGTGCTCCCAGAAAAATGTTGCCTGCAAGAATG
    GGCAGACCAATTGCTACCAGAGCTACTCCACCATGAGCATCACCGACTGCCGTGAGACCGGCAGCTCCAA
    GTACCCCAACTGTGCCTACAAGACCACCCAGGCGAATAAACACATCATTGTGGCTTGTGAGGGAAACCCG
    TACGTGCCAGTCCACTTTGATGCTTCAGTGTAGGTCTCTACCTAAGGCCAGAGCAGCAAGATGCACCACT
    TCATCACAAAGGCACCTGCCTCTCCCCTCATGTTTCCTTGTCCTGGGGGCAATAGCTCAAGTTAGTTAGG
    GCTCTTATCTCTGCGCACCTTACCAGAAACACACACACAGGATTCCCTGGCATGAAAGCAATAACTCAAG
    CTAGTTAAGTCTTCTATCCAACCCACACTTGCTCCCCTGGCCTGAGTCTTGCCCCTGGTGGTTTGGGGGG
    TGAGGAGTGGGTTGTGAGGTGGGACCTGTGTTAACCAAATCACTGCTTCTTTCAATAAACATACTTGCAA
    CCACCTGAAAAAAAAAAAAAAAA
    Expasy - Translate
    Tool
    • https://web.expasy.org/trans
    late/
    • Permite traducir una
    secuencia de nucleótidos a
    una secuencia de proteínas
    Pegamos la secuencia
    ProtParam: calcula el peso molecular, PI y
    composición de aminoácidos
    https://web.expasy.org/protparam/
    3. Resultados
    Tamaño en aa
    Peso molecular en Da
    PI

    Composición de
    aminoácidos
    1. Pegamos
    una secuencia
    de aminoácidos

    2. Damos clic
    en calcular
    parámetros
    PeptideCutter:
    https://web.expasy.org/peptide_cutter/

    1. Pegamos
    una secuencia
    de aminoácidos

    3. Clic en calcular

    2. Elegimos una enzima


    digestiva, por ejemplo, tripsina
    SECCIÓN DE REFERENCIA

    APLIQUEMOS LO APRENDIDO

    TALLER

    I. Use los genes trabajados en la sesión anterior para responder la


    siguientes preguntas:
    1. Obtenga la secuencia proteica usando el programa Translate
    2. Usando el programa ProtParam identifique el punto isoeléctrico teórico

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