Bloque III

Bases moleculares del almacenamiento y expresión

de la información biológica

• Tema 11. Macromoléculas e información genética.

• Tema 12. Síntesis y procesamiento del RNA.
• Tema 13. Síntesis de proteínas.

1
 De ARNm a proteína (I)
Las dos primeras etapas de la transferencia de información
biológica, la replicación y la transcripción, se refieren a la síntesis de
ácidos nucleicos a partir de moldes de ácidos nucleicos.

El último paso en el flujo de la información genética es el proceso de

síntesis de proteínas denominado traducción. A través de este
proceso la información almacenada en los ácidos nucleicos
específicamente en el ARN mensajero permite la construcción de las
proteínas.
Las proteínas están compuestas por aminoácidos, por lo que la transferencia de información durante la
traducción es considerablemente más compleja que el emparejamiento de bases.

Para convertir la información del gen en proteína, es necesario traducir la información a otro idioma
expresado en símbolos muy diferentes. Dado que el ARNm tiene sólo cuatro nucleótidos diferentes y las
proteínas 22 tipos de aminoácidos, la traducción no se puede hacer emparejando directamente un
nucleótido de ARN con un aminoácido de la proteína.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Código genético
Para traducir los ácidos nucleicos en proteínas, se necesita un código real llamado código genético
que relaciona el molde del ácido nucleico con la secuencia de aminoácidos del producto proteico.

El código está formado por un grupo de tres bases nitrogenadas (o codones), cuya presencia en la
cadena polinucleotídica del ARNm codifica o da lugar a la presencia de un aminoácido en la cadena
polipeptídica.

En la molécula de ARNm la secuencia de nucleótidos se lee en grupos consecutivos de 3 elementos.

Como el ARN es un polímero lineal de 4 nucleótidos diferentes, habrá 4 x 4 x 4 → 64 combinaciones
posibles de 3 nucleótidos. Sin embargo, los aminoácidos de las proteínas son sólo 20 (+ 2).

64 – 22 = 42 restantes. ¿Que se hace con los 42 códigos restantes?

ACTGTACGTGTACGTGATCGATGCAT
Bloque III – Síntesis de proteínas
 Código genético (Standard)

Código genético es
redundancia

4 bases

(Lectura es de 3) HAY
EXCEPCIONES
Bacteria –
ATG, GTG y
64 “códigos” TTG pueden
ser START
codon.

20 +2 amino ácidos

UGA – selenocisteína (Sec, U). Multitud de enzimas. UAG - pirrolisina (Pyl, O). En Archaea.
Bloque III – Macromoleculas e información genética. 4
 Mutaciones (I)
22 amino ácidos

O – Encontrada en Archaea en 2002.

También en la bacteria Desulfitobacterium hafiense (Codon UAG → un stop codon en el resto de organismos)
Bloque III – Macromoleculas e información genética. 5
 Código genético (II)

Casi todos los aminoácidos corresponden a más de un codón, y los grupos de codones que codifican para el
mismo aminoácido tienen algunas propiedades recurrentes.

Los codones para el mismo aminoácido presentan los mismos nucleótidos en 1º y 2º posición,
variando sólo en tercera posición, en la mayoría de los casos.

Hay 3 codones que no especifican ningún aminoácido:

- (UAA, UAG, UGA) Sitios terminadores de codones (STOP codons) señalando el final de la secuencia
polipetidica.
- (AUG) Codón iniciador (START codon), señala el comienzo de una secuencia polipeptídica. En eucariota
y arquaeas, el amino acido es una metionina. En bacteria, mitocondria y cloroplastos, el amino acido
es la N- formilmetionina.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Marco abierto de Lectura (ORF)

Una secuencia de ARN puede ser

traducida en 3 marcos de lectura,
sin embargo, sólo una de las
posibles lecturas del ARNm codifica
para la proteína funcional.

ORF – Open Reading Frame

Normalmente de >100 amino ácidos

(= >300pb)

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Marco de Lectura (ORF) (II)
Una secuencia de ADN tiene 2
hebras.

Cuando se escanea un fragmento

de ADN por alguna secuencia
codificante de proteína, tenemos
que buscar entre 6 marcos de
lectura.

3 marcos de lectura por cada

hebra.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Código genético

Ejercicio – Traducir la siguiente secuencia de ARNm

usando el código genético standard (a mano).

5’-AUGACGGCACGUUGCUACUUGUUCUACCCUUAA-3’

Bloque III – Macromoleculas e información genética. 9

 Ejemplo

Base de datos biológico: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Herramienta de comparación con nucleótidos/proteínas: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
Herramientas bioinformáticas: https://www.expasy.org/

>ref|NZ_CP035433.1|:601747-603084 Streptococcus pyogenes strain emm65

chromosome, complete genome
GCTTGCTTTTAAGCTGGCCCAAACAGGCGATACTATCTTGCTTAGCCCAGCCAATGCTAGCTGGGATATG 1. Elegir el ORF mas apropiado que pueda albergar una
TATCCTAATTTTGAGGTTCGTGGGGATGAATTTTTGGCAACCTTTGATTGTTTAAGAGGAGATGCCTAAT
GCCTAAGAAGATTTTATTTACAGGTGGTGGAACTGTAGGTCATGTCACCTTGAACCTCATTCTCATACCA
AAATTTATCAAGGACGGTTGGGAAGTACATTATATTGGTGATAAAAATGGCATTGAACATACAGAAATTG
secuencia de proteínas: https://web.expasy.org/translate/
AAAAGTCAGGCCTTGACGTGACCTTTCATGCTATCGCGACAGGCAAGCTTAGACGCTATTTTTCATGGCA
AAATCTAGCTGATGTTTTTAAGGTTGCACTTGGCCTCCTACAGTCTCTCTTTATTGTTGCCAAGCTTCGC
CCTCAAGCCCTTTTTTCCAAAGGTGGTTTTGTCTCAGTACCGCCAGTTGTGGCTGCTAAATTGCTTGGTA
AACCAGTCTTTATTCATGAATCAGATCGGTCAATGGGACTAGCAAACAAGATTGCCTACAAATTTGCAAC 2. Comparar el ORF teórico con la base de datos de proteínas:
TACCATGTATACCACTTTTGAGCAGGAAGACCAGTTGTCTAAAGTTAAACACCTTGGAGCGGTGACAAAG
GTTTTCAAAGATGCCAACCAAATGCCTGAATCAACTCAGTTAGAGGCGGTGAAAGAGTATTTTAGTAGAG https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
ACCTAAAAACCCTCTTGTTTATTGGTGGTTCGGCAGGGGCGCATGTGTTTAATCAGTTTATTAGTGATCA
TCCAGAATTGAAGCAACGTTATAATATCATCAATATTACAGGAGACCCTCACCTTAATGAATTGAGTTCT
CATCTGTATCGAGTAGATTATGTTACCGATCTCTACCAACCTTTGATGGCGATGGCTGACCTTGTAGTGA
CAAGAGGGGGCTCTAATACACTTTTTGAGCTACTGGCAATGGCTAAGCTACACCTCATCGTTCCTCTTGG
TAAAGAAGCTAGCCGTGGCGATCAGTTAGAAAATGCCACTTATTTTGAGAAGAGGGGCTACGCTAAACAA
TTACAGGAACCTGATTTAACTTTGCATAATTTTGATCAGGCAATGGCTGATTTGTTTGAACATCAGGCTG
ATTATGAGGCTACTATGTTGGCAACTAAGGAGATTCAGTCACCGGACTTCTTTTATGACCTTTTGAGAGC
TGATATTAGCTCCGCGATTAAGGAGAAGTAAATGACAAAAGATAAAGAGAAACAAAGTGATGACAAGCTC
GTTTTGACAGAGTGGCAAAAGCGTAACATTGAATTTTTAAAGAAAAAGAAGCAGCAAGCTGAGGAAGAAA
AAAAACTC

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Resumen del código genético

Existen 64 codones de los que 61 (+2) codifican aminoácidos, 3 son señales para la terminación de la
transcripción, y un codón para la señalización del inicio de la transcripción.

• Los aminoácidos están codificados por más de un triplete → el código es degenerado

• Los codones que codifican el mismo aminoácido son denominados sinónimos. Normalmente, los
sinónimos comparten las dos primeras bases del triplete.
• Cada codón (o triplete) solo codifica un aminoácido, es decir, código no presenta ambigüedad en la misma
especie.
• El código tiene codones que no codifican aminoácidos. Estos codones tienen funciones especiales, uno de
ellos es el triplete de iniciación, AUG. Este codón no solo marca el inicio de la síntesis proteica, en
eucariotas y en procariotas, sino que también codifica metionina cuando está situado en el interior de la
secuencia polinucleotídica. En las procariotas, esta señal de iniciación marca el primer aminoácido que es
la formil metionina. Existen 3 codones de terminación, que son UAA UAG y UGA que marcan el final de la
síntesis de la cadena peptídica.
• El código es continuo los tripletes son traducidos uno tras otro de forma secuencial y continua.
• La dirección de lectura es fija del extremo 5’ del ARNm al extremo 3’. 5 → 3
• El código es prácticamente universal (solo las mitocondrias presentan un código ligeramente distinto)
Bloque III – Síntesis de proteínas
 Síntesis de proteínas (I)
La biosíntesis de proteínas requiere:

•ARNm (ARN mensajero): Actúa como molde. En el caso de eucariotas, ha de ser

transportado desde el núcleo hasta el citoplasma.

•Amino ácidos: Son utilizados en forma de aminoacil-ARNts. Es decir, cada

aminoácido se une a una molécula de ARNt específica de ese aminoácido.

•ARNt (ARN de transferencia): Transportan los aminoácidos y traducen la secuencia

nucleotídica del ARNm a la secuencia de aminoácidos de la proteína.

•aminoacil-tRNA-sintetazas: cargan el amino acido correcto al tRNA

•Ribosomas: Son estructuras que proporcionan el entorno adecuado para la síntesis.

Están formados por ARN y proteínas.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Síntesis de proteínas (II)

La biosíntesis de proteínas se divide en 3 fases:

1. Iniciación
2. Elongación de la cadena (y translocación)
3. Terminación

Fase preliminar
• Formación de un precursor activado Aminoacil
ARNt
• Maquinaria de síntesis compleja: ribosomas y
factores secundarios

Bloque III – Macromoleculas e información genética. 13

 Estructura de tRNA
Los codones de una molécula de ARNm no reconocen
directamente los aminoácidos a los que corresponden el
triplete de nucleótidos no se une directamente a su
aminoácido. La traducción del ARNm a la proteína depende
en cambio de moléculas adaptadoras que reconocen y se
unen tanto al codón como al aminoácido en diferentes sitios,
estos adaptadores se denominan ARN de transferencia
(ARNt) y tienen una longitud de unos 80 nucleótidos.

Dos regiones son cruciales:

a) Región anticodón, complementario al mRNA. a) Estructura convencional de hoja de trébol
b) Extremo aceptor, sección corta de una sola hebra en el b) Realidad: Brazos D y TψC están juntos
extremo 3’ donde se une al aminoácido correspondiente al
codón. Secuencia fija: 5’-CCA-3’

Los ARNt también contienen bases poco frecuentes, producidas por modificación química después de que
el ARNt ya ha sido sintetizado. Se derivan del uracilo y se indican con la letra griega ψ (pseudouridina) y D
(dihidrouridina).
Bloque III – Macromoleculas e información genética. 14
 Estructura tRNA(II)

El brazo del anticodón contiene la secuencia de tres bases complementaria y

antiparalela del codón. La interacción codón-anticodón se realiza por apareamiento
antiparalelo, mediante la formación de puentes de hidrógeno entre las bases
complementarias del ARNm y del ARNt.

Concepto de balanceo

El apareamiento entre el anticodón y el codón es mas

flexible en la 3ª base que en las otras dos. Esto
contribuye a la especificidad, pero al unirse mas
débilmente, facilita la rápida separación entre ambos
incrementando la velocidad de la síntesis proteica.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Reconocimiento, activación y carga de los tRNA

Aminoacido + ATP → aminoacil-AMP + P-P

Aminoacil-AMP + tRNA →amino acil-tRNA +AMP

Bloque III – Síntesis de proteínas

 El ribosoma (I)
Para traducir un ARNm a proteína de manera
rápida y precisa se requiere un gran aparato
molecular, que recorra la cadena de ARNm,
capture las moléculas de ARNt
complementarias y las posicione de manera
que los aminoácidos transportados puedan
combinarse covalentemente en una cadena
de proteínas. Esta operación la lleva a cabo el
ribosoma un gran complejo formado por más
de 50 moléculas de proteínas diferentes y
varios ARN llamados ARN ribosomales
(ARNr). Los ribosomas eucariotas y
procariotas tienen una arquitectura y una
función muy similares ambos están formados
por una subunidad más grande y otra más
pequeña que se combinan para formar un
ribosoma
completo de masa llamativa, varios millones
de dáltones.
Las dos subunidades del ribosoma (la
pequeña y la grande) permanecen separadas
Bloque III – Síntesis de proteínas
hasta que comienza la traducción
 El ribosoma (II)

Cada ribosoma contiene tres sitios de unión para las

moléculas de ARNt, conocidos como:

sitio A – Sitio de unión al aminoacil-ARNt

sitio P – Sitio de unión al peptidil-ARNt
sitio E - Salida (Exit)

Una molécula de ARNm solo está estrechamente

asociada con los sitios A y P si las bases de su anticodón
son complementarias a las del codón colocado en la
molécula de ARNm insertada en el ribosoma, y por lo
tanto, establecerá un vínculo bastante fuerte.

1-2-3: E-P-A

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Iniciación de la traducción – Ensamblaje del ribosoma
En las procariotas el ensamblaje del complejo del ribosoma y el comienzo de la traducción ocurre después del reconocimiento
de la secuencia sitio de unión al ribosoma (RBS – Ribosomal binding site).

RBS procariotas – Secuencia Shine Dalgarno en el ARNm. Una secuencia rica en purina (Consensus - AGGAGGU), ubicada
entre 3 y 10 nucleótidos aguas arriba del codón de inicio de la traducción. Es reconocido por la terminal 3’ de la molécula 16S
ARNr (unidad menor del ribosoma – 30S) con la secuencia UCCUCCA (anti Shine Dalgarno).
Tras este reconocimiento, el ribosoma complejo (la unidad mayor) se empareja al complejo anterior.

RBS eucariotas – No requiere de un emparejamiento entre el ARNm y ARNr.

- A partir del 5’CAP, el ribosoma busca una secuencia corta (secuencia de Kozak), reconocida por la
subunidad ribosómica menor de los eucariotas (la 40 S).
- El codón de inicio de la traducción es el primer codón AUG.

Video Link

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Elongación de la cadena polipeptídica

1 – Reconocimiento del codón en el sitio vacío A

2- Formación del enlace peptídico entre los amino ácidos

3. Translocación – el ribosoma se mueve un codón hacia el

extremo 3’ de la cadena ARNm.

4. El ciclo continua hasta encontrar un codón STOP.

Video Link

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Terminación de la cadena polipeptídica

• La presencia de codones de terminación,

también llamados codones de STOP marca el
final de la codificación del ARNm para la
proteína.

• No hay ARNt que reconozcan estos codones,

sino unas proteínas.

• Las proteínas conocidas como factores de

desprendimiento (release factor) están
asociadas con cualquier codón de parada que
llegue al sitio A del ribosoma.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Terminación de la cadena polipeptídica (II)
La unión de los factores de desprendimiento al
sitio A modifican la actividad peptídico
transferásica del ribosoma, haciendo que
catalice la adición de una molécula de agua al
péptido ARNt en lugar de una molécula de
aminoácido.

Esta reacción libera el terminal carboxilo del

polipéptido naciente de su unión a una
molécula de ARNt, la que normalmente
mantiene la cadena alargándose en el
ribosoma, induciendo inmediatamente su
desprendimiento.

El ribosoma también suelta el ARNm y se

disocia en las subunidades componentes, que
pueden recomponerse en otra molécula de
ARNm, iniciando otro ciclo de síntesis de
proteínas. Video Link
Bloque III – Síntesis de proteínas
 Poliribosomas
• La síntesis de una proteína suele tardar entre 20 segundos y varios minutos. En un lapso de tiempo tan corto en
cada molécula de ARNm hay múltiples fenómenos de inicio de manera que las moléculas de ARNm en traducción a
menudo asumen la apariencia de poliribosomas (o polisomas), que consisten en ribosomas dispuestos
por una sola molécula de ARNm a una distancia mínima de 80 nucleótidos entre sí.

• Tanto las células bacterianas como las eucariotas forman poliribosomas, pero las bacterias son capaces de acelerar
aún más la producción de proteínas, dado que el ARNm bacteriano no necesita ninguna modificación de
maduración y es físicamente accesible desde su transcripción, los ribosomas se unen a su extremo libre y
comienzan a traducirlo antes de que haya terminado de ser copiado, siguiendo la ARN polimerasa, que se mueve a
lo largo del ADN.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Chaperona molecular

Chaperona molecular – una molécula que ayuda en el plegamiento

correcto de algunas proteínas.

En E. coli – un complejo llamado GroEL/GroES

En eucariotas – el equivalente se denomina HSP60. Hay otra familia

denominada HSP70.

La energía requerida para doblar correctamente la proteína es

transferida por moléculas de ATP

Video Link

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Antibióticos que inhiben síntesis de proteínas

Muchos de los antibióticos más eficaces

que tenemos son compuestos que actúan
inhibiendo la síntesis de proteínas en las
bacterias y no en los eucariotas.

Algunas de estas drogas explotan pequeñas

diferencias de estructura y función entre
los
ribosomas eucariotas y procariotas, por lo
que interfieren preferentemente en la
proteosíntesis bacteriana.

La mitocondria y cloroplasto, se deducen que tuvieron origen bacteriano. Por ello, sus ribosomas se
asemejan a las de las bacterias. Por ello, algunos antibióticos son nocivos sobre la mitocondria humana.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 El control de la degradación de las proteínas
• La célula somete a cada proteína producida a numerosos controles.
• Por esta razón la célula regula la cantidad de cada proteína presente en cada momento controlando la demolición de
los aminoácidos que la componen.
• Las proteínas tienen un promedio de vida extremadamente variado - depende de su función y ubicación.
• Proteolisis - vías metabólicas especializadas en la demolición enzimática de las proteínas
• Proteasas - enzimas que degradan las proteínas. Hidrolizan los enlaces peptídicos entre los aminoácidos.
• Las vías proteolíticas tienen la función de degradar rápidamente las proteínas de:
- Vida corta
-Proteínas dañadas o mal conformadas estructuralmente
• La ubicación de la proteólisis ocurre en los citosoles (matriz citoplasmática), y en células eucariotas, además de que
ocurra en el citosol (en proteasomas) se encuentran en compartamentos conocidos como liposomas.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 El control de la degradación de las proteínas
En los eucariotas la demolición citosólica de las proteínas tiene lugar por medio de las
proteasomas.

Una proteasoma contiene un cilindro central formado por proteasas.

Por encima y por debajo, el cilindro tiene como opérculo (un gran complejo molecular
formado por al menos 10 tipos diferentes de subunidades de proteína) que controlan el acceso
al interior.

Las proteínas destinadas a su degradación, serán marcadas/etiquetadas con una ubiquitina

(proteína pequeña), y de esta forman, serán reconocidas por el opérculo.

Las proteínas de corta duración contienen una secuencia corta de amino acidos para ser
marcadas con ubiquitina, y ser degradado.

El sistema reconoce y degrada las proteínas desnaturalizadas o malformadas o las que

contienen aminoácidos oxidados o anormales.

Video Link Bloque III – Síntesis de proteínas

 Las modificaciones post-traduccionales
Las modificaciones post traduccionales son
modificaciones hechas a la proteína después de
haber sido traducida de la secuencia de ARNm.

Methylation, phosphorylation, glycosylation,

ubiquiylations, acetylation, etc

Estas modificaciones pueden incluir la adición de

grupos funcionales y cambios en el plegamiento de
la proteína.

Las alteraciones en las modificaciones post

traducción pueden llevar a proteínas mal dobladas
y causar enfermedades.

La adición de grupos funcionales más común es la

fosforilación.

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Enfermedad causada por un mal plegamiento proteico

E.g. Enfermedad causada por un prion (proteína infecciosa) - encefalopatía espongiforme bovina (vacas locas)

Bloque III – Síntesis de proteínas

 Secuencias señal

Secuencia señal

Bloque III – Macromoleculas e información genética. 31

Mutaciones que afectan a las proteínas

Bloque III – Síntesis de proteínas

Mutaciones por desfase en el Marco

Bloque III – Síntesis de proteínas. 33

 Tasa de mutación

Tasa de mutación https://avida-ed.msu.edu/app4/

Como afecta la tasa de mutacion a la
tasa de crecimiento?

Tamaño del genoma

Bloque III – Macromoleculas e información genética. 34
 Mutaciones (I)
La radiación solar ultravioleta también es perjudicial para el ADN promueve la
formación de enlaces covalentes entre dos bases de pirimidina adyacentes que
pueden asociarse formando dímeros de timina.

Bloque III – Macromoleculas e información genética. 35