Aplicación de La Secuenciación Masiva y La Bioinformática
Aplicación de La Secuenciación Masiva y La Bioinformática
Aplicación de La Secuenciación Masiva y La Bioinformática
2023
Universidad de Guayaquil
Aplicación deCiencias
Facultad de la secuenciación
Naturales mas
Carrera de Biología
Biotecnología
tAREA #8
ALICE NICOLE CORTEZ GAVILANES
Aplicación de la secuenciación masiva y la bioinformática
Una vez que los contigs han sido ordenados en un borrador de genoma más o
menos cerrado, se procede a la asignación de funciones, es decir, la anotación.
Este proceso incluye la búsqueda de posibles genes, la identificación de
operones y la anotación funcional.
Referencia
https://patricbrc.org/view/Taxonomy/234#view_tab=overview
El BV-BRC es un sistema creado para ayudar a los investigadores biomédicos
en su trabajo sobre enfermedades infecciosas bacterianas y virales. Integra
información esencial sobre patógenos con datos y herramientas para el
análisis. BV-BRC reúne a dos centros bien establecidos, PATRIC para
bacterias e IRD/ViPR para virus, y ofrece cientos de miles de genomas
bacterianos y más de un millón de genomas virales, así como datos sobre
estructura y función de proteínas, estudios clínicos, medicamentos objetivos y
resistencia, epidemiología y otras características. El sistema también
proporciona herramientas de código abierto para el análisis de datos y la
anotación genómica.
Esta pestaña proporciona una tabla de todos los "genes especiales" anotados
(factores de virulencia, genes de resistencia a antibióticos, dianas de fármacos,
homólogos humanos, transportadores y genes esenciales) correspondientes al
conjunto de genomas al nivel taxón definido por el usuario. Desde esta página,
al seleccionar un genoma se muestra toda la información útil del mismo
Figura 7 árbol filogenético