TEMA 5

ELEMENTOS NO MEMBRANOSOS DEL CITOPLASMA: EL RIBOSOMA Y EL PROTEOSOMA

1. LOS RIBOSOMAS: CARACTERÍSTICAS GENERALES Y FUNCIÓN

● Son estructuras no membranosas.
Son ribonucleoproteínas→complejos supramoleculares formados por rRNA ribosomal
(monocatenario, el + abundante, no codificado, actividad catalítica) (65%) y proteínas (35%) que se
ensamblan en el nucleolo).
Son los componentes celulares más abundantes en el citoplasma de las células animales, vegetales,
hongos, bacterias, cloroplastos y mitocondrias.
● Estructura: Formados por una subunidad grande (L) y una subunidad pequeña (S)
● Función: apareamiento de los codones del mRNA con los anticodones de los tRNA y síntesis de las
cadenas polipeptídicas.
● Lugar de producción en la célula: Nucleolo (formaciones heterocromatina que se pueden observar
como puntos en el núcleo, presentes en la síntesis de ribosomas).
● Tamaño: 20 nm (200Å )
● Localización: Citoplasma, asociados al RE y dentro de mitocondrias y cloroplastos *Hay unas proteínas
que empiezan su síntesis en el citosol y acaban su formación en el retículo endoplasmático.

1.1. Los ribosomas o gránulos de Palade: centros de traducción/síntesis de proteínas

Maquinaria responsable de la traducción, se estudió cuando se desarrolló el microscopio
electrónico. Pueden estar asociados al retículo o mitorribosomas.
⚡️¿De qué depende que estén en el citosol o retículo?
Depende del tipo de proteína a sintetizar, cuando está en el retículo cuando sale de la
membrana y se forman vesículas para dar esta proteína a la membrana.
★ Diferencia Células procariotas y eucariotas: NO tiene orgánulos (en los ribosomas
bacterianos todos en citosol, NO mitocondria, se encuentran en citosol celular).

1.2. Los ribosomas pueden ser citoplasmáticos (libros o asociados al Retículo Endoplasmático) o
estar en mitocondrias o en los cloroplastos
Depende del tipo de proteína a sintetizar, se utilizan los
ribosomas libres citoplasmáticos o asociados al reti ́culo.
Las células procariotas no presentan retículos endoplasmáticos
ni mitocondrias, por lo que los ribosomas procariotas se
encuentran en el citosol celular.

1.3. Los ribosomas: sitio donde el RNA mensajero es decodificado

Los ribosomas son estructuras celulares muy pequeñas (32
nanómetros en células eucariotas) encargados de la
traducción del ARNm a proteínas.
Se trata de una maquinaria catalítica compleja formada
principalmente por varias moléculas de ARN ribosomal
(rRNAs) y más de 50 proteínas (ribosomal proteins).
Una célula eucariota normal contiene millones de ribosomas
en su citoplasma.
El ARN de transferencia, unido al ribosoma lee la secuencia
del ARN mensajero (ARNm) y, utilizando el código genético, traduce la secuencia de bases del
ARN a una secuencia de aminoácidos.
 ARN ribosomal (imagen): Ocupa el centro del ribosoma y es el responsable de actividad
catalítica ribosoma, por eso llamamos a los ribosomas (RIBOZYME) porque son enzimas
tienen actividad catalítica.

1.4. Donde se sintetiza el ribosoma?

El ribosoma se sintetiza en el nucléolo, una estructura esférica pequeña, densa situada
dentro del núcleo. Es una estructura transitoria que solo se ve cuando hay ensamblaje de
ribosomas. NO siempre podemos ver bien nucleolos, solo fase de síntesis ribosomas.
El nucléolo es la región heterocromática
más destacada del núcleo. Los nucléolos
están formados por proteínas (pasarán
por polos nucleares y formar ribosomas)
y ADN ribosomal (ADNr)----> formación
ARN ribosomal. El ADNr es un
componente fundamental ya que es
utilizado como molde para la
transcripción del ARN ribosómico
(ARNr), que será incorporado a nuevos
ribosomas.
El nucléolo es un enorme agregado de
macromoléculas (rRNA genes,
precursores de rRNA, rRNA maduros, proteínas ribosomales, y enzimas de procesamiento de
rRNA y a diferencia de la mayoría de orgánulos celulares no es delimitado por una
membrana.
*Estructuras enterocromatina, NO membrana.

1.5. Producción de los ribosomas en la célula

➢ ¿Dónde se sintetizan los rRNA?
En el nucleolo (formaciones de heterocromatina que se observan como puntos en el núcleo,
presenten en síntesis de ribosomas, es la heterocromatina)
El primer RNA a ser sintetizada es un precursor de 45 S (unidad de densidad), proteínas
entran nucleolo y junto RNA forman ribosoma. Se forman las pequeñas y grandes unidades y
salen hacia fuera. la unidad grande es la 60 S y la unidad pequeña 45 S.
➢ ¿Dónde se sintetizan las proteínas ribosomales?
➢ ¿Dónde se ensamblan las subunidades de los ribosomas?
2. ¿QUÉ ES EL ARN RIBOSOMAL?
El precursor de RNAr es modificado químicamente
(metilaciones) y procesado en 3 moléculas de ARNr
→18 s,5’8 s (subunidades grandes) y 28 s (subunidad
pequeña)
El ARN ribosomal es un ARN no codificante que forma
parte de los ribosomas y es esencial para la síntesis
proteica en todos los seres vivos
Es el material más predominante en el ribosoma, que
en peso consiste de aproximadamente un 60 % de
ARNr y un 40 % de proteína
El ARNr es el tipo de ARN más abundante en las células
y está formado por una sola cadena de nucleótidos,
aunque presenta regiones de doble hélice
intracatenaria.

3. COMPOSICIÓN DE LOS RIBOSOMAS PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS

3.1. 2 subunidades con rRNA y proteínas
S=Svedberg: unidad de medida de la velocidad de sedimentación. Aunque existen diferentes
tipos de ribosomas con diferentes composiciones, todos ellos presentan dos subunidades,
 una más pequeña que la otra. Estas subunidades las conocemos como “subunidad mayor” y
“subunidad menor”.
Grande y pequeña = 80 —> es proporcional a superficie ocupada
(eucariotas).

3.2. 2 subunidades que contienen

diferentes moléculas de rRNA y proteínas.
El elemento clave del ribosoma es el RNA ribosomal que está presente en los
diferentes dominios del ribosoma.
Las proteínas sólo complementan la acción del RNA ribosomal. Las proteínas ribosómicas son
conocidas con letra L o S seguidos por un número
La velocidad de sedimentación es proporcional a la superficie

4. EL RIBOSOMA ES UN RIBOZIMA
La estructura de los ribosomas se resolvió en el año 2000. Ahora se sabe que son las moléculas de
RNAr y no las proteínas responsables de la estructura del ribosoma, de su habilidad de posicionar los
tRNAs sobre los mRNA, y de la actividad catalítica formando enlaces peptídicos covalentes.
Los ribosomas contienen dos principales tipos de ARNr que forman dos subunidades: la subunidad
mayor (LSU, Large Sub Unit por sus siglas en inglés, que es una ribozima que cataliza la formación de
enlaces peptídicos), y la subunidad menor.
Ribozima→ (RNA actividad catalítica, captación enlaces peptídicos, subunidad menor).
Los 60 s forman los enlaces peptídicos.

5. EL RIBOSOMA ESTÁ FORMADO POR 2/3 DE RRNA Y 1/3 DE PROTEÍNAS

 El elemento clave y funcional del ribosoma es el RNA
ribosómico (o ribosomal) que forma los diferentes dominios
del ribosoma. Las proteínas aquí solo complementan la función
del RNAr.
El RNAr está plegado en una estructura compacta que ocupa el
centro del ribosoma, mientras que las proteínas están en la
periferia. La función principal de las proteínas ribosomales es
el ensamblaje de los rRNA. Además estabilizan el “RNA core” y
permitir cambios de conformación del rRNA que son
necesarias para que el rRNA catalice una síntesis eficiente de
proteínas. (papel de soporte que dan las proteínas).
6. FUNCIÓN DE LOS RIBOSOMAS
6.1. Síntesis de proteínas: diferencia principal entre

eucariotas y procariotas

Procariotas (Sin Núcleo)→ transcripción y traducción a la vez, no hay procesamiento

ARNm,es traducido directamente antes de la traducción.
 Eucariotas→ Sintetizan ADN y se pasa por procesamiento (añaden intrones), precursor DNA y
quitar intrones.

6.2. Traducción del RNA a proteínas

Un ARN de transferencia (ARNt) es un tipo especial de molécula de
ARN. Su función es hacer corresponder un codón del ARNm con el
aminoácido para el cual codifica. Hace de "puente" entre los
codón/aminoácido. Cada ARNt contiene un conjunto de tres
nucleótidos conocido como anticodón que se une a un codón
específico del ARNm. La molécula de ARNt también lleva un
aminoácido: concretamente, el que está codificado por los codones
a los cuales se une el ARNt. Extremo 3’ contiene aa.

6.3. Síntesis de proteínas. Sitios de unión al mRNA y a los tRNA en el

ribosoma
Los ribosomas son una parte de la fábrica de generación de proteínas en la célula.
Cada ribosoma tiene 3 hendiduras o sitios de unión para el RNA de transferencia (tRNA): los
sitios A, P y E y un sitio de unión para el ARNm
Los ribosomas de los eucariotas y los de los procariotas tienen estructuras y funciones
similares. La pequeña subunidad representa la
base sobre la cual los tRNA son perfectamente
emparejados con los codones del mRNA, mientras
que la subunidad grande cataliza la formación de
los enlaces peptídicos que unen los aminoácidos
en una cadena polipeptídica
7. RIBOSOMA
-Subunidad pequeña: Apareamiento de bases de los codones del mRNA con los
anticodones de los tRNA
-Subunidad grande: contiene el ribozima (rRNA de la subunidad grande que
cataliza la síntesis de las cadenas polipeptídicas (formación de enlaces peptídicos).
-Las subunidades grande y pequeña están separadas hasta que se ensamblan con
el mRNA
Velocidad de síntesis aproximada:
- Eucariotas: 2 aminoácidos por segundo
- Procariotas: 20 aminoácidos por segundo (es más rápido porque se
produce simultáneamente)
Formación enlace peptídico metionina y alanina (imagen).

7.1. Fases de traducción del ARNm: Iniciación, elongación y terminación

❖ Fase de iniciación:
- Los ribosomas tienen tres “hendiduras” clave en su interior: las
hendiduras A, P y E. Cada una de estas hendiduras juega un papel
importante en la traducción del RNA mensajero.
- La fase de iniciación de la traducción empieza a nivel del codón AUG (es
el codón que codifica para la metionina y funciona como el codón de
inicio “start codón” (codon - anticodon, se une a él, subunidad grande
unida a la pequeña, el RNAt ha ocupado el sitio P, el primer ARNt
empiezan con el P, los demás por el contrario empiezan con el A)) para
la mayoría de los mRNAs), cerca del extremo 5’ del RNAm.
- El RNA de transferencia unido a la metionina se une al sitio P, para
iniciar la síntesis de la cadena polipeptídica (todos los otros tRNA se
unen primero al sitio A).
❖ Fase de elongación: entrada de un aminoacyl-tRNA, formación del
enlace peptídico y translocación de un codón
- Hendidura A: Durante la traducción, esta es la primera hendidura que se
encuentra el ARNm al entrar en el ribosoma. En esta zona permite el
contacto de uno de los codones del ARNm con el anticodón de un ARN
de transferencia que se encuentra unido a un aminoácido (aminoacil-
ARNt). Cambio de conformación y se acercan RNAt, RNAr capta la unión
del ADN peptídico, entonces se une al siguiente aa.
- Hendidura P: Una vez han contactado el codón del ARNm con el anticodón del ARN de
transferencia en la hendidura A, ambos se mueven hasta la hendidura P. En esta zona se
forma, aminoácido a aminoácido, la proteína resultante de la traducción.
- Hendidura E: En esta hendidura, el ARNt que previamente ha cedido su aminoácido se separa
del codón del ARN mensajero. Gracias a estas tres zonas, los ribosomas son capaces de
traducir
 Elongación F2: ribosoma se 3 o un aa se desplaza el que estaba en el P pasa al E (EXIT) —>
como no lo necesitamos sale
❖ Fase de terminación:
La terminación de la traducción se lleva a cabo por dos tipos de factores de terminación: los
que reconocen los codones de terminación y los que promueven la hidrólisis del peptidil-
tRNA.
eRF: factores de liberación eucarióticos:
eRF1 promueve la hidrólisis de peptidil-tRNA dependiente del codón de parada, y eRF3
interactúa con eRF1 y estimula la actividad de eRF1 en presencia de GTP.
Durante la síntesis de proteínas, los codones STOP provocan la liberación de la nueva cadena
polipeptídica del ribosoma. Esto ocurre porque no hay tRNAs con anticodones
complementarios a los codones STOP.

8. LOS RNAr TIENEN ACTIVIDAD ENZIMÁTICA (RIBOZIMA) Y SON RESPONSABLES DE LA FORMACIÓN

DEL ENLACE PEPTÍDICO
Antes se pensaba que solo las proteínas presentan actividad
enzimática. Sin embargo, algunos RNAs tienen actividad catalítica.
Estos RNAs catalíticos son los ribozimas. Ribozima=Eles una
contracción de las palabras "ácido ribonucleico" y "enzima". Los
sustratos de las ribozimas son con frecuencia ARN. Los RNAr son
ribozimas responsables de la formación de los enlaces peptídicos
 9. RIBOSOMAS. SÍNTESIS DE
PROTEÍNAS
La proteína que nace queda
protegida de la acción de las
proteasas, ya que pasa por una
estructura en forma de túnel en la
unidad grande.

10. VARIOS RIBOSOMAS PUEDEN

TRADUCIR SIMULTÁNEAMENTE UNA MOLÉCULA DE ARN: AUMENTO DE LA EFICIENCIA DE SÍNTESIS
PROTEICA
La eficiencia de la síntesis de proteínas aumenta
mediante la traducción simultánea de un único
ARNm por múltiples ribosomas. En las células
eucariotas, la interacción mediada por proteínas
acerca los dos extremos de un polirribosoma, lo
que promueve el rápido reciclaje de las
subunidades ribosómicas, lo que aumenta aún más
la eficiencia de la síntesis de proteínas.

11. POLISOMAS O POLIRRIBOSOMAS: MÚLTIPLES

INICIACIONES EN CADA MOLÉCULA DE mRNA
Una molécula de mRNA normalmente es traducida de manera simultánea por diversos ribosomas
espaciados por 80 nucleótidos.
12. LOS POLIRRIBOSOMAS CIRCULARES SON RESPONSABLES DE LA SUPERPRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS

Los múltiples ribosomas

individuales pueden traducir
simultáneamente un ARNm
eucariótico, que se muestra aquí
en forma circular estabilizado
por interacciones entre
proteínas unidas en los
extremos 3' y 5'. Cuando un
ribosoma completa la
traducción y se disocia del
extremo 3', las subunidades
separadas pueden encontrar
rápidamente la tapa 5' cercana
e iniciar otra ronda de síntesis.

13. VARIOS ANTIBIÓTICOS TIENEN COMO DIANA DIFERENTES UNIDADES DE LOS RIBOSOMAS
BACTERIANOS: BLOQUEO DE LA TRADUCCIÓN

14. LAS CHAPERONAS EVITAN QUE LA CADENA EMPIECE A

PLEGARSE (AGREGACIÓN) ANTES DE QUE ACABE DE
SINTETIZARSE
In vitro (en ausencia de chaperonas) solo una pequeña
parte de las proteínas sintetizadas las células pueden
plegarse correctamente. Esto hace pensar que las
células no pueden gastar tanta energía en la síntesis
proteica si no tuvieran un sistema de plegamiento
eficiente. Este sistema de plegamiento está formado
por 2 familias de chaperonas :
 - Las chaperonas→ se unen y estabilizan las protei ́nas evitando su agregación : Hsp70 en el
citosol y en la mitocondria
- Las chaperoninas
Los chaperones son proteínas que se unen a
parches hidrófobos expuestos en proteínas mal
plegadas y, al hacerlo, desdobla las partes mal
plegadas de la proteína y después de que el
chaperón se libera de la proteína mal plegada,
permite que la proteína tenga otra oportunidad
de replegarse. partes lo que es más importante,
los chaperones no dirigen el plegamiento de la
proteína, sino que le dan a la proteína una
segunda oportunidad para replegarse
correctamente.
La maquinaria Hsp70 actúa temprano en la vida
de muchas proteínas (a menudo antes de que la
proteína abandone el ribosoma), y cada monómero de hsp70 se une a una cadena de 4-5 aminoácidos
hidrofóbicos.

15. PLEGAMIENTO ASISTIDO POR CHAPERONAS

Chaperonas Hsp70 (citosólicas, en las
mitocondrias)
- Son las más comunes. Son monómeros.
Actúan en las fases iniciales de la síntesis
proteica.
- Se unen de manera a los residuos hidrofóbicos
expuestos de sus sustratos
➢ El ATP favorece la unión hsp70-protei ́na:
Hsp70 unida a ATP presenta una conformación
abierta que expone su región hidrofóbica. Esta se une a la región hidrofóbica de las proteínas ( 4-5
aminoácidos), desplegando la parte mal plegada de la proteína.
➢ La hidrólisis del ATP: favorece una mejor unión a la proteína. La hidrólisis del ATP a ADP permite
desplegar la parte de la proteína mal plegada.
➢ Siguiente unión de hsp70a ATP: libera la proteína.

15.1. EL PLEGAMIENTO DE ALGUNAS PROTEÍNAS REQUIERE UNA INTERVENCIÓN SECUENCIAL DE

CHAPERONAS Y CHAPERONINAS
Las chaperoninas sirven como lugar de corrección de plegamiento: facilitan el plegamiento
de las protei ́nas (mal plegadas o parcialmente plegadas) en un proceso que depende de ATP.
 15.2. En cambio, las chaperoninas (isolation chambers) actúan sobre las proteínas
completamente sintetizadas
Las chaperoninas sirven como lugar de corrección de plegamiento. Son:
- Hsp60 en mitocondrias
- TCP1 en el citosol de las células de los vertebrados
- GroEL en bacterias
Hsp60: es un complejo de proteínas que solo funciona en proteínas completamente
sintetizadas. Hsp60 crea una cámara de aislamiento que es una estructura de barril grande.
Esta cámara de aislamiento hace estallar la proteína y permite que la proteína se pliegue de
forma aislada de todo lo demás que podría afectar el plegamiento adecuado.

16. EL PROTEASOMA: DEGRADACIÓN PROTEICA

El proteasoma: Es un complejo de proteasas ATP-dependiente que destruye las proteínas aberrantes.
Representa 1% de las protei ́nas celulares.
Aproximadamente1/3delasprotei ́nasdenuevasi ́ntesissondegradadas
El proteasoma es el encargado de la degradación de las protei ́nas endógenas (citosolicas y nucleares),
mientras que en los lisosomas se degradan components obsoletos (autofagia) y sustancias
internalizadas por endocitosis (fagocitosis)
El proteasoma está presente en varias copias
en el citoplasma, pero también el núcleo
El proteasoma degrada de una manera ATP-
dependiente las protei ́nas marcadas con una
señ al: la ubiquitina.
Solo las proteínas marcadas con ubiquitina
pueden ser degradadas por el proteasoma.
En el complejo regulador (19S), la proteína
marcada con ubiquitina se une a un receptor
de ubiquitina, y está desplegada gracias unas proteínas conocidas como AAA protei ́nas o “unfoldasas”
y la hidrolisi de ATP.
Las proteínas desplegadas progresan a través del complejo central (núcleo catali ́tico, core), donde
están expuestas a proteasas, que acaban digiriendo la proteína.

16.1. El proteasoma consume ATP (actividad ATPasa)

 Complejo multiproteico cilíndrico con múltiples proteasas en su interior
Puede romper las proteínas marcadas con ubiquitina en fragmentos
de 7-9 aminoácidos y moléculas intactas de ubiquitina

16.2. Las proteínas mal plegadas en el RE (proteínas de membrana,

proteínas secretadas) vuelven a pasar por el translocon hasta el citosol para ser
degradadas por el proteasoma
Las proteínas solubles mal plegadas en la luz del RE se reconocen y se dirigen a un complejo
translocador en la membrana del RE. Los primeros interactúan en la luz del RE con
chaperonas, disulfuro isomerasas y lectinas. Luego son exportados al citosol, son
ubiquitilados, desglicosilados y degradados en proteasomas. Las proteínas de membrana mal
plegadas siguen una ruta similar pero usan un translocador diferente.

⚡️¿El proteasoma
puede decidir qué proteínas
degradar?
El proteasoma no
puede escoger las
protei ́nas para
su futura
degradación.
Este proceso está regulado por una enzima, E3 ubiquitin ligase que conjuga los grupos ubiquitina a las
protei ́nas dianas.

17. UBIQUITINA
● Marca las proteínas celulares que se han de degradar
● Polipéptido de 76 aminoácidos, encontrado en numerosos tejidos y organismos (excepto en
bacterias), por lo que se llamó ubiquitina (lati ́n ubique: por todos lo sitios)
● Las proteínas marcadas son degradadas por el proteasoma.
17.1. La adición de la ubiquitina: proteína pequeña (cadena polipeptídica) formada por 76
aminoácidos
La vida media de una proteína depende en gran
parte de su susceptibilidad para estar degradada
por el proteasoma.
Las proteínas mal plegadas (proteínas citosólicas y
proteínas en el ER que son transportadas al
citosol) y las proteínas virales producidas por una
célula infectada son marcadas covalentemente
por la adición de unas cadenas de ubiquitina.
La adición de las pequeñas proteínas de ubiquitina
es repetido muchas veces, con cada ubiquitina
unida a la precedente.

17.2. Conjugación de la ubiquitina

La unión de la ubiquitina a los substratos la realizan una serie de enzimas:
- E1→enzima activador de la ubiquitina
- E2→ enzima conjugado a la ubiquitina
- E3→ ligasa de la ubiquitina
El sustrato para ser reconocido por el proteasoma ha de llevar unida una
cadena de ubiquitinas (mi ́nimo 4): cadena de poliubiquitina.

El sistema ubiquitina-proteosoma. (a) La ubiquitina se activa y se une a E1, (b) se conjuga a

E2. (c) el sustrato de proteína que se va a degradar es el objetivo de E3 y (d) la ubiquitina se
liga al sustrato. (e) La ligadura de ubiquitina se repite para dirigir el sustrato al proteasoma.
(f) El sustrato es reconocido por la tapa del proteasoma 19S y degradado al pasar al núcleo
20S.
 La ubiquitina ligasa (E3) transfiere la molécula
Ub unida en E2 a la cadena lateral -NH2 de un
residuo de lisina en una proteína objetivo.

⚡️¿Cómo la E3
ligasa reconoce las
proteínas a
degradar para marcarlas?
Las proteínas mal plegadas o agregadas despliegan una secuencia de
aminoácidos hidrofóbicos reconocidos por la E3 ligasa. Estas
secuencias no son desplegadas en las proteínas correctamente
plegadas, por lo que la E3 ubiquitina ligasa no las puede reconocer.

18. EL PROTEASOMA TIENE UN PAPEL CLAVE PARA LA PRESENTACIÓN DE ANTÍGENOS

Presentación del antígeno MHC clase I ruta. Las proteínas con etiquetas
de ubiquitina (esferas rojas) son degradadas por proteasomas y los
péptidos resultantes son transportados al retículo endoplásmico (ER)
por TAP. En la sala de emergencias, el péptido se carga en las moléculas
MHC de clase I por muchas chaperonas moleculares. El complejo
péptido-MHC de clase I se transporta luego a la superficie celular para
su presentación a las células T CD8.
TAP: transportador asociado con el procesamiento de antígenos.
18.1. El proteasoma tiene un papel clave para la presentació n de antigenos virales, producidos a
partir del mRNA (vacuna Covid-19, mRNA)
Captación,
procesamiento y
presentación de MHC de
clase I de proteínas
Spike codificadas por
una vacuna de ARNm.

18.2. Algunos virus inhiben

el proteasoma, evitando
así su degradación
Varios virus han logrado evitar la degradación por el proteasoma utilizando diferentes trucos.
El virus de Epstein-Barr EBNA-1 contiene, por ejemplo, una repetición interna compuesta
exclusivamente por glicinas y alaninas que inhibe la degradación proteasómica.